이렇게 변형 된 핵산 염기 를 갖 는 PNA 는 향상 된 세포 투과성 외 에 상보 적 인 핵산 에 대한 결합력 이 매우 강하 다 . 상보 적 인 DNA 와 듀플렉스 ( duplex ) 를 형성 할 때 4 ~ 5 개 의 변형 된 핵산 염기 가 도입 된 11 ~ 13 머 ( 11 ~ 13 - mer ) 의 PNA 는 변형 되 지 않 은 PNA 에 비해 20 oC 이상 높 은 Tm 값 을 보인다 . 또한 , 이렇게 변형 된 핵산 염기 를 갖 는 PNA 는 한 개 의 염기 부정합 에 도 ( mismatch ) 매우 민감 한 데 , 변형 된 염기 의 종류 나 PNA 의 순서 에 따라 다르 지만 약 11 ~ 22 oC 의 낮 은 Tm 값 을 보인다 .