De nouvelles espèces vivantes sont régulièrement définies chaque année.

L'apparition d'une nouvelle espèce dans la nomenclature peut se faire de trois manières principales :
découverte dans la nature d'une espèce totalement différente de ce qui est connu jusqu'alors,
nouvelle interprétation d'une espèce connue qui s'avère en réalité être composée de plusieurs espèces proches mais bien distinctes. Ce mode d'apparition d'espèce est en augmentation depuis qu'il est possible d'analyser très finement le génome par des méthodes d'étude et de comparaison des ADN, ces méthodes aboutissant par ailleurs à des remaniements de la classification par une meilleure compréhension de la parenté des taxons (phylogénie). Pour ce type de création de nouvelles espèces, deux circonstances sont possibles : soit une sous-espèce déjà définie est élevée au statut d'espèce, auquel cas le nom, l'auteur et la date sont conservés, soit il est nécessaire de donner un nouveau nom à une partie de la population de l'ancienne espèce,
découverte d'une nouvelle espèce par l'étude plus approfondie des spécimens conservés dans les musées et les collections.

Ces trois circonstances ont en commun d'être soumises au problème du nombre de spécialistes mondiaux compétents capables de reconnaître le caractère nouveau d'un spécimen. C'est une des raisons pour lesquelles le nombre d'espèces nouvelles chaque année, dans une catégorie taxinomique donnée, est à peu près constant. 

Pour bien préciser le nom complet d'une espèce, le (ou les) auteur(s) de la description doivent être indiqués à la suite du nom scientifique, ainsi que l'année de parution dans la publication scientifique. Le nom donné dans la description initiale d'une espèce est appelé le basionyme. Ce nom peut être amené à changer par la suite pour différentes raisons.

Dans la mesure du possible, ce sont les noms actuellement valides qui sont indiqués, ainsi que les découvreurs, les pays d'origine et les publications dans lesquelles les descriptions ont été faites.

1996

Espèces vivantes décrites en 1996

Lézards

Agamidés 
Bronchocela danieli Das, 1996
Agamidé découvert dans les îles Nicobar (Inde).

Gekkonidés 
Luperosaurus yasumai Ota, Sengoku & Hikida, 1996

Liolémidés 
Liolaemus thermarum Videla et Cei, 1996
Liolémidé découvert en Argentine

Scincidés 
Lygosoma carinatum, 1996
Scincidé découvert au Vietnam.

Serpents

Leptotyphlopidés 
Leptotyphlops borapeliotes, 1996
Leptotyphlops drewesi, 1996
Leptotyphlops macrops, 1996

Typhlopidés 
Typhlops fredparkeri Wallach, 1996
Serpent typhlopidé
Typhlops mcdowelli Wallach, 1999
Serpent typhlopidé

Nouvelles sous-espèces (1996) 
Emys orbicularis hispanica Fritz, Keller et Budde, 1996
Emydidé découvert en Espagne.
Mauremys caspica ventrimaculata Wischuf et Fritz, 1996
Géoémydidé.
Mauremys leprosa atlantica Schleich, 1996
Géoémydidé.
Mauremys leprosa erhardi Schleich, 1996
Géoémydidé.
Mauremys leprosa marokkensis Schleich, 1996
Géoémydidé.
Mauremys leprosa saharica Schleich, 1996
Géoémydidé.
Mauremys leprosa wernerkaestlei Schleich, 1996
Géoémydidé.
Mauremys mutica kami Yasukawa, Ota et Iverson, 1996
Géoémydidé découvert aux Ryukyu (Japon).
Iberolacerta cyreni castiliana (Arribas, 1996)
Lacertidé découvert dans la Sierra de Gredos en Espagne.

Espèces fossiles (1996)

Crocodiliens 
Kambara implexidens Salisbury et Willis, 1996
Mékosuchidé découvert en Australie.
Quinkana babarra Willis et Mackness, 1996
Mékosuchidé découvert en Australie.

Dinosaures 
Sinosauropteryx prima Ji (Q.) et Ji (S.), 1996
Dinosaure coeluridé. 
Ligabueino andesi Bonaparte, 1996
Dinosaure noasauridé découvert dans le Crétacé de Patagonie.
Gasparinisaura cincosaltensis Coria et Salgado, 1996
Dinosaure découvert dans le crétacé d'Argentine.
Deltadromeus agilis Sereno et al.
Dinosaure noasauridé découvert dans le Crétacé d'Afrique du sud.
Angaturama limai Kellner et Campos, 1996
Spinosauridé.

Lézards 
Palaeoscincosaurus middletoni Sullivan et Lucas, 1996
Scincidé découvert dans le Paléocène du Colorado.

1997

Espèces vivantes décrites en 1997

Lézards 
Varanus melinus Böhme et Ziegler, 1997
Varanidé.
Gonydactylus paradoxus Darevesky et Szczerbak, 1997
Gekkonidé découvert au Vietnam.
Calumma glawi  Avila Pires, 1997
Chamaeléonidé découvert à Madagascar.
Paralipinia rara, 1997
Scincidé découvert au Vietnam.

Serpents

Leptotyphlopidés 
Leptotyphlops broadleyi, 1997

Élapidés 
Elapsoidea broadleyi, 1997
Découvert en Somalie.

Vipéridés 
Bitis rubida, 1997
Trimeresurus karanshahi, 1997

Tortues 
Cyclemys atripons Iverson et McCord, 1997
Géoémydidé.
Cyclemys pulchristriata, 1997
Géoémydidae découvert au Vietnam.

Nouvelles sous-espèces (1997) 
Cyclemys atripons pulchristriata Fritz, Gaulke et Lehr, 1997
Géoémydidé.
Mauremys caspica siebenrocki Wischuf et Fritz, in Fritz et Wischuf, 1997
Géoémydidé.

Espèces fossiles (1997)

Crocodiliens 
Quinkana meboldi Willis, 1997
Mékosuchidé.

Dinosaures 
Gojirasaurus quayi Carpenter, 1997
Coelophysidé découvert au Nouveau Mexique (États-Unis).
Tenontosaurus dossi Winkler, Murray et Jacob, 1997
Dinosaure tenontosauridé découvert dans le Crétacé d'Amérique du nord.

Ptérosaures 
Tupandactylus imperator (Campos & Kellner, 1997)
Tapéjaridé découvert au Brésil. Décrit initialement sous le nom de Tupejara imperator.

1998

Espèces vivantes décrites en 1998

Lézards 
Varanus yuwonoi Harvey et Barker, 1998
Varanidé.
Tupinambis cerradensis Colli, Pères et da Cunha, 1998
Téiidé découvert au Brésil.
Bavayia exsuccida Bauer, Whitaker et Sadlier, 1998
Gekkonidé.
Bavayia pulchella Bauer, Whitaker et Sadlier, 1998
Gekkonidé.
Cnemaspis dringi Das et Bauer, 1998
Gekkonidé.
Hemidactylus granchii Nussbaum & Raxworthy, 1998
Gecko 
Tarentola albertschwartzi Sprackland et Swinney, 1998
Gekkonidé découvert à la Jamaïque.

Serpents 
Opisthotropis daovantieni, 1998
Colubridé découvert au Vietnam.
Pailsus pailsei Hoser, 1998
Élapidé découvert au Queensland.

Tortues 
Cuora picturata, 1998
Géoémydidé découvert au Vietnam.

Nouvelles sous-espèces (1998) 
Emys orbicularis eiselti Fritz, Baran, Budak et Amthauer, 1998
Emydidé. 
Cuora amboinensis lineata McCord et Philippen, 1998
Geoemydidé découvert au Myanmar. 
Mauremys leprosa vanmeerhaeghei Bour et Maran, 1998
Géoémydidé.

Espèces fossiles (1998)

Dinosaures 
Altirhinus kurzanovi Norman, 1998
Découvert en Mongolie.
Scipionyx samniticus del Sasso et Signore, 1998
Dinosaure coeluridé découvert dans le Crétacé d'Italie.
Nedcolbertia justinhoffmanii Kirkland et al., 1998
Dinosaure coelurosaure.
Megaraptor namunhuaiquii Novas, 1998
Dinosaure carnosaure découvert en Argentine.

Ilokelesia aguadagrandensis Coria et Salgado, 1998
Dinosaure découvert en 1991 dans le Crétacé d'Argentine. Le nom du genre provient du mapuche ilo ("viande") et kelesio ("lézard") ; l'épithète spécifique rappelle la localité où l'espèce a été découverte, Aguada Grande.
Ozraptor subotaii Long et Molnar, 1998
Dinosaure abelisauroïde découvert dans le Jurassique d'Australie .
Zuniceratops christopheri Wolfe et Kirkland, 1998
Cératopsidé découvert en 1996 au Nouveau-Mexique (États-Unis) par le jeune Christopher James Wolfe à qui l'épithète spécifique est dédiée.
Gargoyleosaurus parkpinorum Carpenter, Miles et Cloward, 1998
Ankylosaure découvert dans le Jurassique du Wyoming.

Ptérosaures 
Normannognathus wellnhoferi Buffetaut, Lepage (J.-J.) et Lepage (G.), 1998
Germanodactylidé (?) découvert à Octeville-sur-Mer (Seine-Maritime, France), dans l'argile d'Ecqueville (Kimméridgien de Normandie) .

Tortues 
Santanachelys gaffneyi Hirayama, 1998
Protostégidé découvert dans la formation de Santana au Brésil.

Serpents 
Hoffstetterella brasiliensis Rage, 1998
Aniliidé découvert dans le Paléocène du Brésil.
Madtsoia camposi Rage, 1998
Madtsoiidé découvert dans le Paléocène du Brésil.

1999

Espèces vivantes décrites en 1999

Lézards 
Varanus cerambonensis Philipp, Böhme et Ziegler, 1999
Varanidé.
Varanus caerulivirens Ziegler, Böhme et Philipp, 1999
Varanidé.
Varanus auffenbergi Sprackland, 1999
Varanidé.
Sigaloseps ruficauda Sadlier et Bauer, 1999
Scincidé découvert en Nouvelle-Calédonie.
Description initiale : Records of the Australian Museum 51 : 83-91
Furcifer nicosiai Jesu, Mattioli et Schimenti, 1999
Chamaeléonidé découvert à Madagascar.
Typhlops meszoelyi Wallach, 1999
Serpent typhlopidé découvert en Inde.
Goniurosaurus araneus Grismer, Viets et Boyle, 1999
Gecko découvert au Vietnam
Hemidactylus dracaenacolus Rössler et Wranik, 1999
Gecko découvert dans l'île de Socotra au Yémen.
Pristurus obsti Rösler et Wranik, 1999
Gekkonidé découvert au Yémen.
Pristurus samhaensis Rösler et Wranik, 1999
Gekkonidé découvert au Yémen.
Acanthodactylus beershebensis Moravec, Baha el Din, Seligman, Sivan et Werner, 1999
Lacertidé découvert en Israël et dans les Territoires occupés.
Acanthodactylus mechriguensis Nouira et Blanc, 1999
Lacertidé découvert en Tunisie, où il est endémique.
Gallotia intermedia Barbadillo, Lacomba, Pêrez-Mellado, Sancho et Lopez-Jurado, 1999
Lacertidé Découvert à Téneriffe (Canaries) en 1996.

Serpents 
Typhlops meszoelyi Wallach, 1999
Typhlopidé découvert au Bengale occidental (Inde). L'épithète spécifique honore le Dr. Charles A. M. Meszoely, du Centre pour l'Étude de Vertébrés de la Northwestern University de Boston (Massachusetts) .  
Tropidophis spiritus Hedges et Garrido, 1999
Serpent tropidophiidé découvert à Cuba.
Elapsoidea trapei Mane, 1999
Élapidé découvert au Sénégal.

Espèces fossiles (1999)

Crocodiliens 
Mariliasuchus amarali Carvalho & Bertini, 1999
Comahuesuchidé découvert au Brésil. L'épithète spécifique honore le naturaliste brésilien Sérgio Estanislaw do Amaral.

Tortues 
Arabemys crassiscutata Tong, Buffetaut, Thomas, Roger, Halawani, Memesh et Lebret, 1999
Dermochelyidé découvert dans le Paléocène d'Arabie saoudite.

Dinosaures 
Achillobator giganteus Perle, Norell et Clark, 1999
Découvert en Mongolie.
Agustinia ligabuei Bonaparte, 1999
Découvert en Patagonie.
Guaibasaurus candelariensis Bonaparte, Ferigolo et Ribeiro, 1999
Découvert dans le Trias supérieur du Brésil. 
Teyuwasu barbarenai Kischlat, 1999
Découvert dans le Trias du Brésil. 
Lurdusaurus arenatus Taquet et Russell, 1999
Dinosaure iguanodontidae découvert dans le Crétacé du Niger.
Santanaraptor placidus Kellner, 1999
Dinosaure coelurosaure découvert au Brésil.
Dinheirosaurus lourinhanensis Bonaparte et Mateus, 1999
Dinosaure diplodocidé découvert dans le Jurassique du Portugal.
Animantarx ramaljonesi Carpenter, Kirkland, Burge et Bird, 1999
Nodosauridé.

Ptérosaures 
Dendrorhynchoides curvidentatus Ji, Ji & Padian, 1999
Anurognathidé découvert en Chine en 1995.

2000

Espèces décrites en 2000

Lézards

Gekkonidés 
Luperosaurus iskandari Brown, Supriatna & Ota, 2000
Phelsuma malamakibo Nussbaum, Raxworthy, Raselimanana et Ramanamanjato, 2000
Gekkonidé découvert à Madagascar. 
Cnemaspis assamensis Das et Sengupta, 2000
Gekkonidé découvert en Inde. 
Cyrtodactylus tiomanensis
Bavayia robusta Wright, Bauer et Sadlier, 2000
Gekkonidé.
Bavayia madjo Bauer, Jones et Sadlier, 2000
Gekkonidé découvert en Nouvelle-Calédonie.
Bavayia geitaina Wright, Bauer et Sadlier, 2000
Gekkonidé découvert en Nouvelle-Calédonie .

Scincidés 
Marmorosphax montana Sadlier et Bauer, 2000
Scincidé découvert en Nouvelle-Calédonie.

Serpents

Boidés 
Morelia clastolepis Harvey, Barker, Ammerman et Chippindale, 2000
Boidé
Morelia nauta Harvey, Barker, Ammerman et Chippindale, 2000
Boidé
Morelia tracyae Harvey, Barker, Ammerman et Chippindale, 2000
Boidé

Élapidés 
Micrurus pachecogili Campbell, 2000
Élapidé découvert au Mexique.
Naja mandalayensis Slowinski & Wüster, 2000

Vipéridés 
Triceratolepidophis sieversorum Ziegler, Herrmann, David, Orlov et Pauwels, 2000
Vipéridé découvert au Vietnam.

Accession au statut d'espèce (2000) 
Morelia kinghorni
Source : Harvey, Barker, Ammerman et Chippindale, 2000

Nouvelles sous-espèces (2000) 
Tiliqua gigas evanescens Shea, 2000 
Tiliqua rugosa palarra Shea, 2000 
Tiliqua scincoides chimaerea Shea, 2000

Espèces fossiles(2000)

Diapsides 
Karamuru vorax Kischlat, 2000
Prestosuchidé.

Dinosaures 
Nqwebasaurus thwazi de Klerk et al., 2000
Dinosaure coeluridé découvert dans le Jurassique d'Afrique du sud.
Jeholosaurus shangyuanensis Xu, Wang et You, 2000
Dinosaure découvert dans le crétacé de Chine.
Fukuiraptor kitadaniensis Azuma et Currie, 2000
Dinosaure carnosaure découvert dans le Crétacé du Japon.
Bambiraptor feinbergi Burnham et al., 2000
Dinosaure découvert en 1995 dans le Montana.
Byronosaurus jaffei Norell, Makovicky et Clark, 2000
Dinosaure troodontidé découvert en 1993 dans le désert de Gobi, en Mongolie.

Ptérosaures 
Anhanguera cuvieri Unwin & al., 2000
Découvert au Brésil.
Domeykodactylus ceciliae Martill & al., 2000
Dsungariptéridé découvert au Chili.

Tortues 
Hesperotestudo bermudae Maylan & Starrer, 2000
Testudinidé découvert dans le Pléistocène des Bermudes.
Testudo bulgarica Amiranashvili & Chkhikvadze, 2000
Testudinidé.

Voir aussi 
Nouvelles espèces de reptiles : 1986-1990, 1991-1995, 2001-2005, 2006-2010, 
 Nouvelles espèces biologiques

Références 

Nouvelle espèce de reptiles
Liste en rapport avec la paléontologie