Human: 구조 유전체학이란 무엇인가요? 

Assistant: 구조 유전체학은 특정 게놈에 의해 코딩된 모든 단백질의 3차원 구조를 설명하고자 합니다. 이 게놈 기반 접근법은 실험과 모델링 접근법의 조합을 통해 높은 처리량의 구조 결정 방법을 가능하게 합니다. 구조 유전체학과 기존의 구조 예측의 주요 차이점은 구조 유전체학은 특정 단백질 하나에 초점을 맞추지 않고 게놈에 의해 코딩된 모든 단백질의 구조를 결정하려고 시도한다는 점입니다. 전체 게놈 서열을 이용할 수 있으면 실험과 모델링 접근법을 조합하여 구조 예측을 더 빠르게 수행할 수 있으며, 특히 많은 수의 게놈 서열과 이전에 해결된 단백질 구조를 이용할 수 있기 때문에 과학자들은 이전에 해결된 동종 단백질의 구조를 바탕으로 단백질 구조를 모델링할 수 있습니다.

단백질 구조는 단백질 기능과 밀접하게 연관되어 있기 때문에 구조 유전체학은 단백질 기능에 대한 지식을 알려줄 수 있는 잠재력을 가지고 있습니다. 구조 유전체학은 단백질 기능을 규명하는 것 외에도 새로운 단백질 접힘과 신약 개발을 위한 잠재적 표적을 식별하는 데 사용될 수 있습니다. 구조 유전체학은 게놈 서열을 이용한 실험적 방법이나 알려진 구조의 단백질에 대한 서열 또는 구조적 상동성을 기반으로 한 모델링 기반 접근법, 또는 알려진 구조와 상동성이 없는 단백질에 대한 화학적 및 물리적 원리를 기반으로 한 접근법 등 구조 결정에 대한 다양한 접근법을 포함합니다.

전통적인 구조 생물학과는 달리, 구조 유전체학을 통한 단백질 구조의 결정은 단백질 기능에 대해 알려진 것보다 먼저 이루어지는 경우가 많습니다(항상 그런 것은 아니지만). 이는 3D 구조로부터 단백질 기능을 결정하는 구조 생물정보학에 새로운 과제를 제기합니다.

구조 유전체학은 단백질 구조의 높은 처리량 결정을 강조합니다. 이는 구조 유전체학 전용 센터에서 수행됩니다.

대부분의 구조 생물학자가 개별 단백질 또는 단백질 그룹의 구조를 연구하는 반면, 구조 유전체학 전문가는 게놈 전체 규모의 단백질 구조를 추구합니다. 이는 대규모 복제, 발현 및 정제를 의미합니다. 이 접근법의 주요 장점 중 하나는 규모의 경제입니다. 반면에 일부 결과 구조의 과학적 가치는 때때로 의문을 받기도 합니다. 2006년 1월에 발표된 사이언스(Science) 기사는 구조 유전체학 분야를 분석합니다.

단백질 구조 이니셔티브와 같은 구조 유전체학의 한 가지 장점은 과학계가 새로운 구조와 클론 및 단백질과 같은 시약에 즉각적으로 접근할 수 있다는 것입니다. 단점은 이러한 구조 중 상당수가 기능이 알려지지 않은 단백질이며 해당 논문이 없다는 것입니다. 따라서 이러한 구조 정보를 더 넓은 연구 커뮤니티에 전달할 수 있는 새로운 방법이 필요합니다. 구조 유전체학 공동연구센터(JCSG)의 생물정보학 코어는 최근 고처리량 구조 유전체학 센터에서 나오는 단백질 구조에 주석을 달기 위한 위키 기반 접근 방식, 즉 오픈 단백질 구조 주석 네트워크(TOPSAN)를 개발했습니다.</s>