El Sistema nacional de Protección Civil decretó alerta roja para 42 municipios que se verán mayormente afectados por las lluvias causadas por la tormenta tropical Bonnie. Protección Civil pidió activar los Centros de Operaciones de Emergencia Departamental y las Comisiones Técnicas Sectoriales de : Albergues, Seguridad, Salud, Servicios de Emergencias e Infraestructura de e Morazán, Cabañas, Cuscatlán, San Salvador, Chalatenango y Santa Ana. Por su parte el Ministerio de Educación suspendió las clases en el sector público y privado, así como en las universidades para este lunes 4 de julio, además de otras actividades como la entrega de Tablet y computadoras para los estudiantes a nivel nacional. La Tormenta Tropical Bonnie mantendrá su influencia sobre El Salvador durante el lunes y en su pasó por el país ya ocasionó inundaciones en diferentes comunidades de San Salvador, sobre todo durante el sábado.