El director del Instituto de Derechos Humanos de la Universidad Centroamericana José Simeón Cañas ( IDHUCA ), José María Tojeira, señaló al abogado - ahora diputado del PDC - Rodolfo Parker de encubrir a autores intelectuales de la masacre de los sacerdotes jesuitas, ocurrida el 16 de noviembre de 1989, en plena Ofensiva Final. Tojeira rindió su declaración como testigo en el juicio que desarrolla la Audiencia Nacional Española, en contra del excoronel Inocente Montano, por la masacre de los sacerdotes jesuitas y de la cocinera y su hija. En el contrainterrogatorio, una de las partes cuestionó al padre Tojeira sobre el papel de Parker, luego de haber dicho que este fue parte de la Comisión de Honor, que el entonces Presidente de la República, Alfredo Cristiani, conformó para investigar a la Fuerza Armada sobre la masacre. " Era el único civil, el abogado Parker, de apellido Parker, Rodolfo Parker ", dijo Tojeira a la Audiencia Nacional Española. Sobre el papel de Parker en la investigación, Tojeira dijo : " ( El ) licenciado Parker, él llegó a mi despacho en la rectoría de la universidad ( UCA ), cuando yo ya era rector de la universidad y me dijo que él no había encubierto, me dio unas razones que a mi me confirmaron en que sí había encubierto. Lo que me dijo fue que un teniente le había dicho al final de un interrogatorio en privado, que el coronel Benavides le había dicho que había luz verde del Estado Mayor, entonces él se asustó, no tenía acceso al presidente Cristiani y llamó a un cuñado del presidente Cristiani, Roberto Jack para consultarle, y este señor Roberto Jack le dijo mañana voy a desayunar con el presidente Cristiani, vengase conmigo y le cuenta ", relató Tojeira. Y agregó : " Me dijo Parker que fue y le contó al presidente Cristiani que un militar le había dicho que Benavides decía, que ( había ) luz verde del Estado Mayor para matar a Ellacuría y que Cristiani le dijo : Cuénteselo a la Comisión de Honor. Me dijo Parker que se lo había dicho a la Comisión de Honor, pero que la Comisión de Honor había decidido no mencionar esa