El requerimiento fiscal señala que la masacre de los seis sacerdotes jesuitas y dos de sus colaboradoras no fue un hecho común de la delincuencia que operaba en el país, sino de quienes ostentaban el aparato organizado de poder en El Salvador en noviembre de 1989. Según la acusación, los antes mencionados, si bien no estuvieron presentes en el momento de los hechos, dieron la orden para el delito y debido a la posición militar que tenían, les permitía hacer uso de equipo, armas y recursos que generan temor, con esto buscan probar la autoría. El elemento definitorio de la autoría es el dominio del hecho. Quien tiene el dominio del hecho, tiene el dominio de la situación delictiva, indica la acusación. La mayoría de los antes mencionados conformaban el alto mando de la Fuerza Armada de El Salvador y de Ayer, la fiscalía planteó sus alegatos en la audiencia inicial en el Juzgado Tercero de Paz de San Salvador donde relataron lo sucedido hace 32 años. Según Fiscalía, los hechos que acabaron con la vida de los sacerdotes jesuitas y dos de sus colaboradoras fueron precedidos por dos reuniones supuestamente del alto mando de la Fuerza Armada los días 13 y 15 de noviembre de 1989. En la primera se planteó hacer un cateo en la UCA, porque en apariencia, en sus instalaciones se escondían guerrilleros del FMLN y además se localizaba un arsenal, sin embargo, Fiscalía aseguró que todo fue para ubicar los dormitorios de las víctimas y luego regresar por ellos. La segunda reunión se realizó la noche del 15 de noviembre en la que el alto mando de la Fuerza Armada aparentemente giró la directriz de asesinar al sacerdote Ignacio Ellacuría con la salvedad que no debían dejar testigos. Hemos solicitado que los delitos de actos de terrorismo, proposición y conspiración para cometer actos de terrorismo sean subsumidos en el delito de asesinato ; hemos pedido la prescripción de los delitos que no son de lesa humanidad : hurto calificado, fraude procesal y el encubrimiento, afirmó el abogado. Quintanilla también pidió que el general Francisco Elena Fuentes fuera sobreseído definitivamente tras presentar la partida de