julio del año 2015, el capitán de ingenieros Rafael Cañas Abarca, fue condenado a dos años de prisión, mientras que al teniente de infantería Jairo Orlando Baires Salinas, el juez le impuso un año. Penalmente, los imputados ya habían sido condenados por el tribunal de Santa Tecla en abril del 2017. Los oficiales Rafael Cañas Abarca y Jairo Baires Salinas fueron condenados a 25 años de cárcel y los excadetes, Manuel Navas Contreras, Jaime Lemus Martínez y Giovani Rosales Grijalba a 23 años, por haber participado en el homicidio de Zelaya. Pero una resolución de la Cámara de lo Penal de la Cuarta Sección del Centro de Santa Tecla ordenó anular la sentencia definitiva donde habían sido condenados debido a que la condena no estaba en firme y los acusados ya habían pasado dos años en detención provisional, la Cámara avaló dejarlos en libertad bajo medidas : todos rindieron una fianza de $ 2, 000.