Francisco Flores se convirtió en el presidente más joven de El Salvador pero ello no fue obstáculo para tomar decisiones cruciales en el país. Un educador universitario, filósofo y politólogo, liberal y demócrata, originario de Santa Ana, formado en los Estados Unidos, estaría enfrentando muchos años después la destrucción de dos terremotos en El Salvador, un encontronazo con el presidente cubano Fidel Castro y una guerra contra las pandillas por medio de la operación Mano dura. Hijo del abogado y economista Ulises Flores y la etnógrafa María Leonor Pérez de Flores, nació el 17 de octubre de 1959, graduado de la Escuela Americana de El Salvador. Tomó estudios de sociología en el Hillyer College, de la Universidad de Harfort, en Connecticut, de ciencias políticas en el Amherst College en Massachusetts, de historia y literatura en el Trinity College de la Universidad de Oxford, Inglaterra, y obtuvo una maestría en filosofía en la universidad World University, en California, Estados Unidos. Fue en la Escuela Americana donde conoció a Lourdes María Rodríguez, quien se convertiría en su esposa y madre de sus hijos Gabriela y Juan Marco. Luego de sus estudios, Flores se dedicó a la docencia universitaria durante 15 años. Fue hasta 1991 cuando inició su carrera política como viceministro de Planificación cuando Mirna Liévano dirigía esa cartera de Estado durante la gestión presidencial de Alfredo Cristiani. Luego que guerrilleros del FMLN asesinaron a su suegro José Antonio Rodríguez Porth, secretario privado presidencial, Flores se convierte el viceministro de la Presidencia y asesor del presidente Cristiani, dirigiendo el plan de acción para ejecutar los Acuerdos de Paz de 1992. El 20 de marzo de 1994, fue elegido diputado para la Asamblea Legislativa, aunque el presidente Armando Calderón Sol lo nombró como secretario de Información de la Presidencia y se mantuvo ahí por un tiempo. Es reelecto en 1997, año en el cual ARENA pierde el control de la Asamblea Legislativa. Su fama de político conciliador y moderado le permitió ser elegido como presidente del órgano legislativo, luego de que el FMLN vetara a los dirigentes areneros más destacados en ese momento. Como presidente de la Asamblea, a Flores le tocó dirigir la interpelación a Roberto Orellana Milla, presidente del Banco Central de Reserva ( BCR ), en donde desempeñó