El juez de instrucción de San Francisco Gotera, en Morazán, Jorge Guzmán, enfrenta un segundo escrito para ser separado del proceso judicial por la masacre de El Mozote y sitios aledaños, ocurrida en diciembre de 1981. Los defensores de los procesados Roberto Antonio Garay Saravia y Rafael Santiago del Cid Aguirre han señalado que " El juez Jorge Alberto Guzmán, en su trabajo de graduación, ha expresado su opinión clara y precisa sobre los hechos ocurridos en el cantón El Mozote, a partir del día 11 de diciembre de 1981, y de manera escrita, en su trabajo de graduación, que contiene valoraciones de carácter eminentemente político, altamente discutibles, específicamente sobre el punto que va a decidirse, y atribuye totalmente la responsabilidad a los miembros de la Fuerza Armada, sin dar oportunidad a las diferentes tesis de El Mozote, como escenario de guerra y como cementerio clandestino de la guerrilla insurgente ", dice la petición de recusación. Los defensores creen que sus valoraciones hechas en la tesis, explican su actuación en el juicio y consideran que " sobrepasa los límites de la ética profesional y de la moralidad, que deja ser, cuando conociéndose la existencia de un prejuicio y condición de aceptar juzgar, conscientes de faltar al principio de imparcialidad, regulado en la ley ". A principios de marzo, los fiscales del caso pidieron separar al juez, pero la Fiscalía General de la República abrió una auditoría para investigar esta actuación.