现在基因测序的瓶颈主要在哪里？精度？速度？
一代的Sanger测序的读长比较长（可以有七八百），而且比较方便测简单样品。缺点是单位价格高，而且样品必须是单一的。如果不是，你就得通过克隆文库一类的手段把样品弄成单一的。这成本和人力就高了去了。 二代里面，454前几个月死掉了。illumina用的较多，现在可以双端150或者牺牲通量达到双端250，已经快达到了454的长度。现在illumina用得最多，在基因组、转录组等领域都有用。缺点是有的时候单个样品的测序通量嫌高，barcode不够用，不能用更多样品分摊通量。 三代里面，我们用过PacBio的，测序长度非常长，拼结核杆菌可以一次拼成一两个碎片（illumina测MTB通常只能拼成上百个碎片）。但缺点是单条read的错误率非常高，现在使用多条read相互抵消错误，但这样就很难做定量的SNP分析或者转录组分析什么的。