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グラシリクテス門がグラム陰性菌、フィルミカテス（ファーミキューテス）門がグラム陽性菌（バシラス、クロストリジウム、放線菌、デイノコッカス−サーマスなど）、テネリカテス門が無細胞壁細菌類（マイコプラズマ類）、メンドシクテス門が古細菌にほぼ相当する。
グラシリクテス門がグラム陰性菌、フィルミクテス（ファーミキューテス）門がグラム陽性菌（バシラス、クロストリジウム、放線菌、デイノコッカス−サーマスなど）、テネリクテス門が無細胞壁細菌類（マイコプラズマ類）、メンドシクテス門が古細菌にほぼ相当する。