Le contrôleur budgétaire et comptable ministériel du ministère chargé de l'écologie, du développement durable, des transports et du logement est désigné pour exercer le contrôle financier des établissements publics à caractère administratif suivants : 
Agence de financement des infrastructures de transport de France (AFITF) ; 
Agence des aires marines protégées et parcs naturels marins (AAMP) ; 
Agence nationale pour la garantie des droits des mineurs (ANGDM) ; 
Agence nationale pour l'amélioration de l'habitat (ANAH) ; 
Caisse de garantie du logement locatif social (CGLLS) ; 
Chambre nationale de la batellerie artisanale (CNBA) ; 
Etablissement public Météo-France ; 
Etablissement public Parcs nationaux de France ; 
Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux (IFSTTAR) ; 
Office national de la chasse et de la faune sauvage (ONCFS).