Le directeur du centre est assisté d'un comité directeur pour les questions relevant de la stratégie et de l'administration du centre ainsi que pour les questions relatives à la pédagogie, aux études et aux actions de coopération. Instance d'orientation et de concertation, ce comité :
 ― détermine les orientations stratégiques ;
 ― détermine les catégories d'agents pouvant bénéficier des formations (fonctions exercées et compétences requises) ;
 ― approuve le programme annuel des formations et des entraînements, en prenant en compte leur adéquation aux référentiels des administrations et opérateurs concernés ;
 ― approuve le programme annuel des études, de la prospective et des actions de coopération ainsi que le règlement de scolarité.
 Les avis du comité directeur sont pris à la majorité des membres présents. En cas de partage égal des voix, celle du président est prépondérante.