Le conseil scientifique, composé de vingt-quatre à trente membres, comprend : 
1° Des membres de droit : 
A. ― Le directeur général de l'ENSAM, président. 
B. ― Le directeur général adjoint chargé de la recherche, vice-président. 
C. ― Les directeurs des centres d'enseignement et de recherche. 
D. ― Le président de la Fondation arts et métiers. 
2° Des personnalités extérieures qualifiées, françaises ou étrangères, désignées par le directeur général en raison de leurs compétences scientifiques. 
3° De représentants d'institutions partenaires, choisis par le directeur général après avis des autres membres du conseil scientifique. 
4° D'au minimum un tiers de représentants élus des personnels d'enseignement et de recherche, des ingénieurs et personnels techniques de recherche, des usagers dont une majorité inscrite en formation doctorale à l'ENSAM. Les représentants des professeurs des universités et personnels assimilés au sens de          l' article D. 719-4 du code de l'éducation  constituent au moins un quart des représentants élus. Il en est de même pour les représentants élus des autres enseignants-chercheurs.