作品（成果物）の制作を依頼されて納品したのですが、その際に依頼者からモチーフの指示や要望があり、それを作品（成果物）に反映させました。それでも著作権は私にあるという認識でよいでしょうか。
原則として、著作権は著作物を創作した著作者に発生します（著作権法１７条１項）。依頼者がモチーフの指示や要望を述べたとしても、それだけでは抽象的なアイデアの提供にとどまり、著作物の創作行為と評価されることはないと考えられます。そのため、ご相談のような事案では、他に特別な事情が無い限り、作品（成果物）の制作者が著作権を有します。