Этилмеркаптан токсичен, его относят к сильнодействующим ядовитым веществам — хотя он безвреден в небольших количествах, в которых присутствует в бытовом газе, в больших дозах он может вызвать тошноту, головную боль, а также поразить почки и печень.
Этилмеркоптан агулы, аны көчле агулы әйберләргә кертәләр бик зыянлы булмас ад әз күләмдә, күп күләмдә ул күңелне болгатырга мөмкин, аш авыртырга мөмкин, шулай ук бөер, бавырларны бозарга мөмкин.