چندان شفاف نیست اما رویهم رفته پرتنش بوده‌است.
از سویی اسنادی از خصمانه بودن روابط حکومت ایران با این گروه منتشر شده‌است و از سوی دیگر گاه مقام‌های ایران را به دادن اجازهٔ رفت و آمد به اعضای این گروه یا حتی هم‌دستی با آن متهم کرده‌اند. اما ایران اعلام کرده‌است که القاعده را یک « » می‌داند و اعضای آن را دستگیر می‌کند. مثلاً دربارهٔ کیفیت حضور پسر بن لادن و فعال سابق القاعده، ، ، داماد بن لادن و یکی از دختران بن لادن و مادرش و در حصر بودن یا آزاد و فعال بودن آنها در ایران اختلاف نظر وجود داشته‌است.
 تحلیل‌گران عوامل منفی و مثبت مؤثر بر روابط ایران و القاعده را چنین می‌دانند: امکانی برای امتیاز گرفتن ایران از غرب، مخالفت اسلام‌گرایان افراطی و و القاعده با افزایش نفوذ ایران که است در منطقه، اختلاف نظر بر سر ، اما از سوی دیگر: در امان نگه داشتن ایران از حملهٔ احتمالی بخشی از افراد تشکیلات القاعده که ضدیت عمیقی با شیعیان دارند به وسیله پناه دادن به اعضای القاعده و عده‌ای از نزدیکان بن لادن که تحت تدابیر امنیتی شدید و اغلب در حبس خانگی به سر می‌برند، وجود دشمن مشترکی به نام آمریکا، امکان ضعیف حملهٔ کماندوهای آمریکایی به رهبران القاعده در خاک ایران که موجب راحتی پناه گرفتن اعضای القاعده در ایران می‌شود، تبادل دیپلمات‌های ربوده شده ایرانی با اسیران القاعده. 
 در اردیبهشت ۱۳۹۱ خبرگزاری روابط القاعده و ایران را پُرتنش توصیف کرد و به نقل از نوشت ایران احتمالاً برای این‌که القاعده را از اقدام نظامی علیه این کشور بازدارد، اعضای آن را بازداشت می‌کرده‌است. علاوه بر این، در گزارش آمده‌است که احتمالاً بعضی از این بازداشت‌ها با هدف چانه‌زنی با دولت ایالات‌متحده در مسائل مربوط به بوده باشد. 
 روز سه‌شنبه ۱۲ ژانویه ۲۰۲۱ مایک پمپئو ، ایران را متهم به گسترش روابطش با القاعده نمود که به عناصر ارشد این گروه تروریستی اجازه تشکیل مقرات جدید در خاک ایران می‌دهد. وی هشدار داد این شراکت «تهدید سنگینی» برای امنیت بین‌الملل و سلامت آمریکاییان در کشور ایجاد کرده‌است. وی گفت، «از سال۲۰۱۵ ایران هم‌چنین به رهبران القاعده بزرگترین آزادی عمل در داخل ایران تحت نظارت آنها داده‌است». وی با اشاره به رهبر فعلی القاعده افزود، «در نتیجه این مساعدت، القاعده رهبران خود را در داخل ایران متمرکز کرده‌است. معاونین ایمن الظواهری، هم‌اکنون در آنجا هستند و صراحتاً زندگی معمولی القاعده را دارند». 
 
 
 
 
 
 
 هرچند که تفسیر ایران و القاعده از اسلام با هم متفاوت است و اختلافات دینی دارند، و منافع استراتژیک متفاوتی دارند، آمریکا ایران را متهم کرده‌است که چون ایران مایل است نیروهای آمریکایی از عراق و افغانستان زودتر خارج شوند و نفوذ ایران در منطقه بیشتر و تثبیت شود، به قاچاق تسلیحات پیشرفته به عراق و افغانستان کمک می‌کند تا خروج نیروهای آمریکایی از عراق و افغانستان سریع‌تر شود. همچنین آمریکا رسماً اعلام کرد کمک ایران به القاعده با همین انگیزه انجام می‌شود. بسیاری از کارشناسان امور ایران به دلیل اختلافات فرقه‌ای میان ایران که است و القاعده که است با گزارش وزارت دارایی آمریکا با احتیاط برخورد کردند. به ریاست در گزارش خود اعلام کرده که عملیات حمایت مالی القاعده به رهبری (تبعه ) انجام می‌شود و او در ایران مستقر است و از سال ۲۰۰۵ با دولت ایران توافق کرده‌است که از خاک این کشور فعالیت کند و زندانیان القاعده در ایران را آزاد کند و به پاکستان برگرداند و کمک‌های مالی برای القاعده در پاکستان بفرستد. 
 
 
 
 
 در ۱۷ مرداد ۱۳۹۹، ملقب به ابومحمد المصری، فرد شمارهٔ دو ، و نیز عروس در منطقه پاسداران و در نزدیکی خانه ، به دست مأموران برون‌مرزی اسرائیل کشته شدند. گفته می‌شود المصری در انفجار سفارت آمریکا در نایروبی در سال ۱۹۹۸ مشارکت داشته‌است؛ سپاه پاسداران از او و خانواده‌اش محافظت می‌کرد.
{"title": "روابط ایران و القاعده", "link": "https://fa.wikipedia.org//w/index.php?title=%D8%B1%D9%88%D8%A7%D8%A8%D8%B7_%D8%A7%DB%8C%D8%B1%D8%A7%D9%86_%D9%88_%D8%A7%D9%84%D9%82%D8%A7%D8%B9%D8%AF%D9%87&oldid=33791284", "language": "fa"}