سازمانی است که با هدف نیل به استقلال علمی و فرهنگی و توسعه علوم و فنون پزشکی و تقویت روح پژوهش و ارتقای سطح علوم پزشکی کشور و دستیابی به آخرین یافته‌ها و نوآوری‌ها در عرصه دانش پزشکی از طریق فعالیت‌های جمعی و جذب حمایت از دانشمندان و محققان برجسته و تشویق آنان، در ۱۳۶۶ به تصویب رسید و سه روز بعد (با تصویب در ) آغاز به کار نمود.
 تشکیل فرهنگستان ابتدا در (۱۵ دی ۱۳۶۶) و سپس در (۱۸ دی ۱۳۶۶) به تصویب رسید. اساسنامه فرهنگستان دوبار در سالهای ۱۳۷۴ و ۱۳۷۹ توسط شورای عالی انقلاب فرهنگی مورد بازنگری قرار گرفته است. یکی از مهمترین تغییرات اساسنامه تصویب هیأت امناء مشترک فرهنگستان‌ها بوده است.
 ارکان فرهنگستان عبارت است از:
 
 
 
 
 
 
 گروه‌های علمی فرهنگستان علوم پزشکی عبارتند از:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 ریاست فرهنگستان علوم پزشکی جمهوری اسلامی از ابتدای کار با بود تا در ۱۸ آذر ۱۳۸۸ به پیشنهاد و تصویب شورای عالی انقلاب فرهنگی این منصب به سپرده شد.
 فرهنگستان دارای اعضای "پیوسته"، "وابسته" و "افتخاری" (ایرانیان داخل و خارج کشور) است که با پیشنهاد رئیس فرهنگستان یا حداقل پنج تن از اعضای مجمع و با تصویب مجمع عمومی، با حکم رئیس فرهنگستان، به عضویت فرهنگستان پذیرفته می‌شوند. عضویت اعضای پیوسته و افتخاری مادام‌العمر است.
 دانشمندان برجستهٔ بین‌المللی که به عضویت افتخاری فرهنگستان پذیرفته می‌شوند، وظیفه‌ای در فرهنگستان ندارند و انتخاب ایشان به احترام مقام علمی‌شان است. عضویت اعضای وابسته برای مدت چهار سال خواهد بود.
 در حال حاضر فرهنگستان علوم پزشکی دارای ۷۴ عضو پیوسته و ۹۱ عضو وابسته می‌باشد (برای اطلاع از اسامی اعضا به بخش پیوند به بیرون مراجعه کنید)
 فرهنگستان علاوه بر انتشار کتاب های مختلف، از سال ۱۹۹۸ میلادی یک نشریه با نام "Archive of Iranian Medicine (AIM)" به منتشر می کند که در ISI، pubmed و scopus نمایه می شود
 
 
 
 
 که در بیست سال اول تاسیس فرهنگستان، گاهگاهی برگزار می‌شد و جوایزی به پژوهشگران و دانشمندان برجستهٔ رشته‌های علوم پزشکی اهدا می‌کرد از سال ۱۳۸۶ به طور سالانه برگزار می شود و در چهار بخش برگزیدگان را انتخاب می کند:
{"title": "فرهنگستان علوم پزشکی", "link": "https://fa.wikipedia.org//w/index.php?title=%D9%81%D8%B1%D9%87%D9%86%DA%AF%D8%B3%D8%AA%D8%A7%D9%86_%D8%B9%D9%84%D9%88%D9%85_%D9%BE%D8%B2%D8%B4%DA%A9%DB%8C&oldid=33983562", "language": "fa"}