یا (به : Microbiome) به معنای کلی و فراگیر (میکروارگانیسم‌ها)، همهٔ و تودهٔ با در نظر نگرفتن و آن‌ها، مستقر در یک بخش ویژه را گویند. میکروبیوم، رابطهٔ با جانور میزبان دارند. این به این معنی است که این هم می‌توانند باشند، هم . مثلاً به تمامی ، و دیگر انواع میکروب‌هایی که به‌طور بومی در پوست انسان زندگی می‌کنند، میکروبیوم پوست می‌گویند. بزرگترین میکروبیوم بدن انسان، میکروبیوم دستگاه گوارش تحتانی و به‌طور خاص می‌باشد. این اصطلاح گرچه بیشتر در بکار رفته است، ولی در دیگر شاخه‌های علم نیز معتبر است. مثلاً میکروبیوم خاک ، یا میکروبیوم شهری .
 میکروبیوم بدن بر روی پوست، مخاطها و دستگاه گوارش قرار دارد و بر دو نوع است:
 ۱-فلور مستقر یا ساکن: شامل انواع تقریباً ثابتی از میکروارگانیسمها در محل خاص خود می‌باشند که در صورت آسیب دیدن قادر به بازسازی خود می‌باشند.
 ۲-فلور موقت یا گذرا: شامل میکروارگانیسمهای بیماری‌زا یا آنهایی که بالقوه بیماری‌زا هستند می‌شود که به مدت زمان کوتاهی در پوست یا مخاط جایگزین می‌شود. منشأ اینها از محیط بوده و در صورت آسیب دیدگی قادر به بازسازی کامل خود نمی‌باشند. نکته مهم اینجاست که فلور موقت در صورت وجود فلور ساکن نمی‌تواند بیماری‌زا باشد اما در حالت وجود زیادتر و رشد بیش از حد فلور ساکن بیماری ایجاد می‌گردد.
 وجود فلور نرمال مانع رشد باکتریهای پاتوژن یا بیماری‌زا در بدن می‌گردد و منجر به پدیده ای بنام تداخل باکتریایی می‌شود. این باکتریها گاه فواید دیگری نیز دارند به عنوان مثال برخی باکتریهای روده در بدن می‌سازند با وجود این اعمال مفید، باکتریهای فلور نرمال می‌توانند در بیمارانی که ضعف سیستم ایمنی دارند حالت تهاجمی پیدا کرده و از محل اصلی و محدوده خود گسترش بیشتری پیدا کنند.
 پوست: ارگانیسم اصلی آن (مانند و ) می‌باشد. و ارگانیسمهای بی هوازی مانند پروپیونی باکتریوم آکنه نیز دیده می‌شوند.
 دستگاه تنفسی: طیف وسیعی از ارگانیسم‌ها (اغلب هوازی) در دستگاه تنفسی، دهان، بینی و حلق ایجاد کلونی می‌نمایند. معمولاً قسمتهای تحتانی دستگاه تنفس و باکتری ندارد. استافیلوکوک‌ها و استرپتوکوک‌ها (مانند و ) در بخش‌های ابتدایی دستگاه تنفسی و دهان مشاهده می‌شوند. گاه گونه‌های هموفیلوس نیز موجودند.
 دستگاه گوارش: به‌طور معمول در معده به دلیل اسیدی بودن محیط تعداد بسیار کمی باکتری وجود دارد. در روده باریک نیز باکتریها کم است (در نواحی انتهایی ایلئوم تعدادی یافت می‌شود). کولون (روده بزرگ) محل اصلی باکتری‌ها در بدن می‌باشد به‌طوری که ۲۰٪ مدفوع انسان حاوی باکتری‌ها می‌باشد. باکتریهای گرم منفی مانند ، پروتئوس، پسودوموناس و باکتریهای بی‌هوازی مانند باکتروئیدها (نظیر )، کلستریدیوم‌ها، فوزوباکتریومها و انترکوک‌ها (نظیر ) از این جمله‌اند.
 دستگاه تناسلی-ادراری: فلور واژن در خانم‌های بالغ حاوی باکتری تخمیرکننده ای بنام است و با تولید اسید محیط واژن را اسیدی نگه می‌دارد و از رشد باکتری‌های عفونت زا جلوگیری می‌کند.
{"title": "میکروبیوم‌ها", "link": "https://fa.wikipedia.org//w/index.php?title=%D9%85%DB%8C%DA%A9%D8%B1%D9%88%D8%A8%DB%8C%D9%88%D9%85%E2%80%8C%D9%87%D8%A7&oldid=34827790", "language": "fa"}