Concretizava-se o sonho iniciado por volta de 1985, quando a comunidade científica do Distrito Federal iniciou a articulação da criação de uma instituição dedicada ao fomento e incentivo da ciência e tecnologia da região. Desde o início, a FAPDF foi acolhida por Brasília. O ex-reitor da Universidade de Brasília, Lauro Morhy, em artigo publicado em dezembro de 1994, no primeiro material de divulgação impresso pela instituição afirmou: “A FAPDF é fruto de uma sábia decisão e, hoje, uma realidade que precisa ser consolidada e sempre aprimorada. É preciso assegurar a continuidade do apoio à pesquisa, para se alcançar uma ciência forte. Os países mais avançados em ciência e tecnologia hoje colhem bons frutos nessa área, não porque se encontram acima do equador, em clima frio, ou seja, habitados por seres superiores, mas, porque apoiaram e administraram melhor e continuadamente a sua ciência. Não há ciência onde prevalece o imediatismo e a improvisação”.