Catalyzes the decarboxylation of ornithine (a product of the urea cycle) to form putrescine.
alternative name for urea cycle since ornithine is the carrier of the nitrogens. ornithine decarboxylase test. a means of identifying different members of the Enterobacteriaceae as well as other gram-negative bacteria. ornithine-δaminotransferase. deficiency see gyrate atrophy. an amino acid obtained from arginine by the action of the enzyme arginase which also splits off urea; it is an intermediate in urea biosynthesis. ornithine carbamoyl transferase (OCT), ornithine transcarbamoylase. see ornithine carbamoyl  We also add a single amino acid to each batch of decarboxylase broth. The three amino acids we test in our decarboxylase media are arginine, lysine, and ornithine. The decarboxylase test is useful for differentiating the Enterobacteriaceae. Decarboxylase broth contains nutrients, dextrose (a fermentable carbohydrate), pyridoxal (an enzyme cofactor for decarboxylase), and the pH indicators bromcresol purple and cresol red. Bromcresol purple turns purple at an alkaline pH and turns yellow at an acidic pH. The enzyme ornithine decarboxylase (ODC) catalyzes the decarboxylation of ornithine (a product of the urea cycle) to form putrescine. This reaction is the committed step in polyamine synthesis. In humans, this protein has 461 amino acids and forms a homodimer. The ornithine decarboxylation reaction catalyzed by ornithine decarboxylase is the first and committed step in the synthesis of polyamines, particularly putrescine, spermidine and spermine. Polyamines are important for stabilizing DNA structure, the DNA double strand-break repair pathway and as antioxidants The purpose is to see if the microbe can use the amino acid ornithine as a source of carbon and energy for growth. Use of ornithine is accomplished by the enzyme ornithine decarboxylase. An inoculum from a pure culture is transferred aseptically to a sterile tube of ornithine decarboxylase broth. The inoculated tube is incubated at 35-37 C for 24 hours and the preliminary results are determined. The microbe must first use the glucose present to cause the p H to drop. Each decarboxylase enzyme produced by an organism is specific to the amino acid on which it acts. Therefore, we test the ability of organisms to produce arginine decarboxylase, lysine decarboxylase, and ornithine decarboxylase using three different but very similar media. Decarboxylase broth contains nutrients, dextrose (a fermentable carbohydrate), pyridoxal (an enzyme cofactor for decarboxylase), and the pH indicators bromcresol purple and cresol red. Bromcresol purple turns purple at an alkaline pH and turns yellow at an acidic pH. The range of compounds used depends on the collection of enzymes a species of bacteria can make. Ornithine is an amino acid that some bacteria can use because of an enzyme called ornithine decarboxylase. Ornithine decarboxylase broth is thus used to determine whether the microbe can use the amino acid ornithine for carbon and energy. This is indicated by a change from purple to yellow during the first 24 hours of incubation. Once the medium has been acidified, the enzyme ornithine decarboxylase is activated. The culture is incubated an additional 24 hours at 35-37 C to allow the microbe to now use the ornithine. Once the medium has been acidified, the enzyme ornithine decarboxylase is activated. The culture is incubated an additional 24 hours at 35-37 C to allow the microbe to now use the ornithine. The final results are then obtained by observing the tube at 48 hours. An inoculum from a pure culture is transferred aseptically to a sterile tube of ornithine decarboxylase broth. The inoculated tube is incubated at 35-37 C for 24 hours and the preliminary results are determined. The microbe must first use the glucose present to cause the p H to drop. ornithine. an amino acid obtained from arginine by splitting of urea; it is an intermediate in urea biosynthesis. ornithine carbamoyltransferase (ornithine transcarbamylase) an enzyme that catalyzes a reaction occurring in the liver mitochondria as part of the urea cycle. an amino acid obtained from arginine by the action of the enzyme arginase which also splits off urea; it is an intermediate in urea biosynthesis. ornithine carbamoyl transferase (OCT), ornithine transcarbamoylase. see ornithine carbamoyl transferase.
http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/ornithine+decarboxylase+test http://www.austincc.edu/microbugz/decarboxylation_test.php https://en.wikipedia.org/wiki/Ornithine_decarboxylase http://www.vumicro.com/vumie/help/VUMICRO/Ornithine_decarboxylase_Test.htm http://www.austincc.edu/microbugz/decarboxylation_test.php http://www.vumicro.com/vumie/help/VUMICRO/Ornithine_decarboxylase_Broth.htm http://www.vumicro.com/vumie/help/VUMICRO/Ornithine_decarboxylase_Test.htm http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/ornithine+decarboxylase+test
what does ornithine decarboxylase do
ऑर्निथिन डीकार्बोक्सिलेस क्या करता है
पुट्रेसीन बनाने के लिए ऑर्निथिन (यूरिया चक्र का एक उत्पाद) के डीकार्बोक्सिलेशन को उत्प्रेरित करता है।
यूरिया चक्र का वैकल्पिक नाम क्योंकि ऑर्निथिन नाइट्रोजन का वाहक है। ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेस टेस्ट। एंटरोबैक्टीरियासी के विभिन्न सदस्यों के साथ-साथ अन्य ग्राम-नकारात्मक बैक्टीरिया की पहचान करने का एक साधन। ऑर्निथिन-δaminotransferase। कमी देखें गाइरेट शोष। एंजाइम आर्जिनेस की क्रिया द्वारा आर्जिनिन से प्राप्त एक एमिनो एसिड जो यूरिया को भी विभाजित करता है; यह यूरिया जैवसंश्लेषण में एक मध्यवर्ती है। ornithine carbamoyl transferase (OCT), ornithine transcarbamoylase। ऑर्निथिन कार्बामॉयल देखें  हम decarboxylase शोरबा के प्रत्येक बैच में एक एकल अमीनो एसिड भी जोड़ते हैं। हमारे डिकार्बोक्सिलेस मीडिया में हम जिन तीन अमीनो एसिड का परीक्षण करते हैं, वे हैं आर्जिनिन, लाइसिन और ऑर्निथिन। डिकार्बोक्सिलेज परीक्षण एंटरोबैक्टीरिया को अलग करने के लिए उपयोगी है। Decarboxylase शोरबा पोषक तत्व, डेक्सट्रोज (एक किण्वित कार्बोहाइड्रेट), पाइरिडोक्सल (decarboxylase के लिए एक एंजाइम कोफ़ेक्टर), और पीएच संकेतक bromcresol बैंगनी और cresol लाल होते हैं। ब्रोमक्रेसोल बैंगनी एक क्षारीय पीएच पर बैंगनी हो जाता है और एक अम्लीय पीएच पर पीला हो जाता है। एंजाइम ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेस (ओडीसी) पुट्रेसीन बनाने के लिए ऑर्निथिन (यूरिया चक्र का एक उत्पाद) के डीकार्बोक्सिलेशन को उत्प्रेरित करता है। यह प्रतिक्रिया पॉलीमाइन संश्लेषण में प्रतिबद्ध कदम है। मनुष्यों में, इस प्रोटीन में 461 अमीनो एसिड होते हैं और एक होमोडीमर बनाते हैं। ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेज द्वारा उत्प्रेरित ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेशन प्रतिक्रिया पॉलीमाइन, विशेष रूप से पुट्रेसिन, स्पर्मिडाइन और शुक्राणु के संश्लेषण में पहला और प्रतिबद्ध कदम है। डीएनए संरचना को स्थिर करने के लिए पॉलीमाइन महत्वपूर्ण हैं, डीएनए डबल स्ट्रैंड-ब्रेक मरम्मत मार्ग और एंटीऑक्सिडेंट के रूप में इसका उद्देश्य यह देखना है कि क्या सूक्ष्म जीव विकास के लिए कार्बन और ऊर्जा के स्रोत के रूप में अमीनो एसिड ऑर्निथिन का उपयोग कर सकता है। ऑर्निथिन का उपयोग एंजाइम ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेस द्वारा पूरा किया जाता है। एक शुद्ध संस्कृति से एक इनोकुलम को एसेप्टिक रूप से ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेस शोरबा की एक बाँझ ट्यूब में स्थानांतरित किया जाता है। टीका ट्यूब 24 घंटे के लिए 35-37 सी पर ऊष्मायन किया जाता है और प्रारंभिक परिणाम निर्धारित किए जाते हैं। सूक्ष्म जीव को पहले मौजूद ग्लूकोज का उपयोग करना चाहिए जिससे पी एच गिर जाए। एक जीव द्वारा उत्पादित प्रत्येक डिकार्बोक्सिलेस एंजाइम अमीनो एसिड के लिए विशिष्ट होता है जिस पर यह कार्य करता है। इसलिए, हम तीन अलग-अलग लेकिन बहुत समान मीडिया का उपयोग करके आर्जिनिन डिकारबॉक्साइलेज, लाइसिन डिकारबॉक्साइलेज़ और ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेज़ का उत्पादन करने के लिए जीवों की क्षमता का परीक्षण करते हैं। Decarboxylase शोरबा पोषक तत्व, डेक्सट्रोज (एक किण्वित कार्बोहाइड्रेट), पाइरिडोक्सल (decarboxylase के लिए एक एंजाइम कोफ़ेक्टर), और पीएच संकेतक bromcresol बैंगनी और cresol लाल होते हैं। ब्रोमक्रेसोल बैंगनी एक क्षारीय पीएच पर बैंगनी हो जाता है और एक अम्लीय पीएच पर पीला हो जाता है। उपयोग किए जाने वाले यौगिकों की सीमा एंजाइमों के संग्रह पर निर्भर करती है जो बैक्टीरिया की एक प्रजाति बना सकती है। ऑर्निथिन एक एमिनो एसिड है जिसका उपयोग कुछ बैक्टीरिया ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेस नामक एंजाइम के कारण कर सकते हैं। इस प्रकार ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेस शोरबा का उपयोग यह निर्धारित करने के लिए किया जाता है कि क्या सूक्ष्म जीव कार्बन और ऊर्जा के लिए अमीनो एसिड ऑर्निथिन का उपयोग कर सकता है। यह इनक्यूबेशन के पहले 24 घंटों के दौरान बैंगनी से पीले रंग में परिवर्तन द्वारा इंगित किया गया है। एक बार माध्यम अम्लीकृत हो जाने के बाद, एंजाइम ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेस सक्रिय हो जाता है। संस्कृति को 35-37 सी पर अतिरिक्त 24 घंटे इनक्यूबेट किया जाता है ताकि सूक्ष्म जीव अब ऑर्निथिन का उपयोग कर सके। एक बार माध्यम अम्लीकृत हो जाने के बाद, एंजाइम ऑर्निथिन डिकारबॉक्साइलेस सक्रिय हो जाता है। संस्कृति को 35-37 सी पर अतिरिक्त 24 घंटे इनक्यूबेट किया जाता है ताकि सूक्ष्म जीव अब ऑर्निथिन का उपयोग कर सके। अंतिम परिणाम तब 48 घंटों में ट्यूब को देखकर प्राप्त किए जाते हैं। एक शुद्ध संस्कृति से एक इनोकुलम को एसेप्टिक रूप से ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेस शोरबा की एक बाँझ ट्यूब में स्थानांतरित किया जाता है। टीका ट्यूब 24 घंटे के लिए 35-37 सी पर ऊष्मायन किया जाता है और प्रारंभिक परिणाम निर्धारित किए जाते हैं। सूक्ष्म जीव को पहले मौजूद ग्लूकोज का उपयोग करना चाहिए जिससे पी एच गिर जाए। ऑर्निथिन। यूरिया के विभाजन द्वारा आर्जिनिन से प्राप्त एक एमिनो एसिड; यह यूरिया जैवसंश्लेषण में एक मध्यवर्ती है। ऑर्निथिन कार्बामॉयलट्रांसफेरेज़ (ऑर्निथिन ट्रांसकार्बामाइलेज़) एक एंजाइम है जो यूरिया चक्र के हिस्से के रूप में यकृत माइटोकॉन्ड्रिया में होने वाली प्रतिक्रिया को उत्प्रेरित करता है। एंजाइम आर्जिनेस की क्रिया द्वारा आर्जिनिन से प्राप्त एक एमिनो एसिड जो यूरिया को भी विभाजित करता है; यह यूरिया जैवसंश्लेषण में एक मध्यवर्ती है। ornithine carbamoyl transferase (OCT), ornithine transcarbamoylase। ऑर्निथिन कार्बामॉयल ट्रांसफरेज़ देखें।