Including the role of enzymes (helicase, DNA polymerase, RNA primase and DNA ligase), Okazaki fragments and deoxynucleoside triphosphates. The explanation of Okazaki fragments in relation to the direction of DNA polymerase III action is required.
DNA polymerase III holoenzyme is the primary enzyme involved in DNA replication in E. coli and belongs to Family C polymerases. It consists of three assemblies: the pol III core, the beta sliding clamp processivity factor and the clamp-loading complex. Once a primer is assembled by primase, DNA polymerase III begins its work of adding nucleotides to the 3 prime end of the primer. It is important to note that replication proceeds in two directions, since a DNA replication bubble consists of two DNA templates. The second two activities of DNA Pol I are important for replication, but DNA Polymerase III (Pol III) is the enzyme that performs the 5'-3' polymerase function. 1  Primase-The requirement for a free 3' hydroxyl group is fulfilled by the RNA primers that are synthesized at the initiation sites by these enzymes. DNA polymerase III (not DNA polymerase) is an enzyme that works in association with other enzymes during the replication of a DNA molecule. DNA replication begins when the enz … yme, known as helicase unwinds a DNA strand. DNA polymerase III holoenzyme is the primary enzyme complex involved in prokaryotic DNA replication. It was discovered by Thomas Kornberg (son of Arthur Kornberg) and Malcolm Gefter in 1970. 7.2 .2 Explain the process of DNA replication in prokaryotes, including the role of enzymes (helicase, DNA polymerase, RNA primase and DNA ligase), Okazaki fragments and deoxynucleoside triphosphates. The explanation of Okazaki fragments in relation to the direction of DNA polymerase III action is required. In DNA replication in bacteria, the enzyme DNA polymerase III (abbreviated DNA pol III) adds nucleotides to a template strand of DNA. But DNA pol III cannot start a new strand from scratch. DNA polymerase III is the main replicative enzyme. DNA polymerase IV and V have large active sites that allow for more base misincorporation, and are therefore more error-prone. They also lack proofreading-exonuclease subunits to correct misincorporations (Nohmi 2006, and Hastings et al. 2010). The pol III HE is itself composed of 10 subunits (8). α, the catalytic polymerase subunit (9), ε, the 3′ → 5′ proofreading exonuclease (10), and θ, a subunit of unknown function, associate to form the polymerase core (11). α binds ε but not θ, whereas θ binds ε but not α (12), suggesting a linear array of αεθ.
https://en.wikipedia.org/wiki/DNAdependent_DNA_polymerase http://www.answers.com/Q/What_is_DNA_polymerase_III https://www.ndsu.edu/pubweb/~mcclean/plsc431/eukarychrom/eukaryo2.htm http://www.answers.com/Q/What_is_DNA_polymerase_III https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_polymerase_III_holoenzyme http://www.tokresource.org/tok_classes/biobiobio/biomenu/dna_replication/index.htm http://www.chegg.com/homework-help/questions-and-answers/dna-replication-bacteria-enzyme-dna-polymerase-iii-abbreviated-dna-pol-iii-adds-nucleotide-q3844347 http://www.worthington-biochem.com/DNAECI/default.html http://www.jbc.org/content/273/4/2452.full
the role of dna polymerase iii
डीएनए पोलीमरेज़ III की भूमिका
एंजाइमों (हेलिकेज, डीएनए पोलीमरेज़, आरएनए प्राइमेज़ और डीएनए लिगेस), ओकाजाकी टुकड़े और डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड ट्राइफॉस्फेट की भूमिका सहित। डीएनए पोलीमरेज़ III कार्रवाई की दिशा के संबंध में ओकाजाकी टुकड़ों की व्याख्या की आवश्यकता है।
डीएनए पोलीमरेज़ III होलोनीजाइम ई कोलाई में डीएनए प्रतिकृति में शामिल प्राथमिक एंजाइम है और परिवार सी पोलीमरेज़ से संबंधित है। इसमें तीन असेंबली होती हैं: पोल III कोर, बीटा स्लाइडिंग क्लैंप प्रोसेसिविटी फैक्टर और क्लैंप-लोडिंग कॉम्प्लेक्स। एक बार प्राइमर को प्राइमेज़ द्वारा इकट्ठा करने के बाद, डीएनए पोलीमरेज़ III प्राइमर के 3 प्राइम एंड में न्यूक्लियोटाइड जोड़ने का काम शुरू करता है। यह ध्यान रखना महत्वपूर्ण है कि प्रतिकृति दो दिशाओं में आगे बढ़ती है, क्योंकि डीएनए प्रतिकृति बुलबुले में दो डीएनए टेम्पलेट होते हैं। डीएनए पोल I की दूसरी दो गतिविधियां प्रतिकृति के लिए महत्वपूर्ण हैं, लेकिन डीएनए पोलीमरेज़ III (पोल III) वह एंजाइम है जो 5'-3' पोलीमरेज़ फ़ंक्शन करता है। 1 प्राइमेस- एक मुक्त 3 'हाइड्रॉक्सिल समूह की आवश्यकता आरएनए प्राइमरों द्वारा पूरी की जाती है जो इन एंजाइमों द्वारा दीक्षा स्थलों पर संश्लेषित होती हैं। डीएनए पोलीमरेज़ III (डीएनए पोलीमरेज़ नहीं) एक एंजाइम है जो डीएनए अणु की प्रतिकृति के दौरान अन्य एंजाइमों के साथ मिलकर काम करता है। डीएनए प्रतिकृति तब शुरू होती है जब enz ... yme, जिसे हेलिकेज़ के रूप में जाना जाता है, एक डीएनए स्ट्रैंड को खोलता है। डीएनए पोलीमरेज़ III होलोनीजाइम प्रोकैरियोटिक डीएनए प्रतिकृति में शामिल प्राथमिक एंजाइम परिसर है। इसकी खोज थॉमस कॉर्नबर्ग (आर्थर कॉर्नबर्ग के बेटे) और मैल्कम गेफ्टर ने 1970 में की थी। 7.2 .2 प्रोकैरियोट्स में डीएनए प्रतिकृति की प्रक्रिया की व्याख्या करें, जिसमें एंजाइमों (हेलिकेज, डीएनए पोलीमरेज़, आरएनए प्राइमेज़ और डीएनए लिगेस), ओकाजाकी टुकड़े और डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड ट्राइफॉस्फेट की भूमिका शामिल है। डीएनए पोलीमरेज़ III कार्रवाई की दिशा के संबंध में ओकाजाकी टुकड़ों की व्याख्या की आवश्यकता है। बैक्टीरिया में डीएनए प्रतिकृति में, एंजाइम डीएनए पोलीमरेज़ III (संक्षिप्त डीएनए पोल III) डीएनए के एक टेम्पलेट स्ट्रैंड में न्यूक्लियोटाइड जोड़ता है। लेकिन डीएनए पोल III खरोंच से एक नया किनारा शुरू नहीं कर सकता है। डीएनए पोलीमरेज़ III मुख्य प्रतिकृति एंजाइम है। डीएनए पोलीमरेज़ IV और V में बड़ी सक्रिय साइटें हैं जो अधिक आधार गलत निगमन की अनुमति देती हैं, और इसलिए अधिक त्रुटि-प्रवण हैं। उनके पास गलत निगमन को ठीक करने के लिए प्रूफरीडिंग-एक्सोन्यूक्लिज़ सबयूनिट्स की भी कमी है (नोहमी 2006, और हेस्टिंग्स एट अल 2010)। पोल III HE स्वयं 10 सबयूनिट (8) से बना है। α, उत्प्रेरक पोलीमरेज़ सबयूनिट (9), ε, 3′ → 5′ प्रूफरीडिंग एक्सोन्यूक्लिज़ (10), और θ, अज्ञात फ़ंक्शन का एक सबयूनिट, पोलीमरेज़ कोर (11) बनाने के लिए सहयोगी है। α ε बांधता है लेकिन θ नहीं, जबकि θ ε बांधता है लेकिन α नहीं (12), αεθ की एक रैखिक सरणी का सुझाव देता है।
डीएनए पोलीमरेझ III ची भूमिका
डीएनए पॉलिमरेज III होलोएन्झाइम हे ई. कोलाईमधील डीएनए प्रतिकृतीमध्ये गुंतलेले प्राथमिक सजीवांच्या शरीरात निर्मार्ण होणारे द्रव्य आहे आणि फॅमिली सी पॉलिमरेजशी संबंधित आहे. यात तीन असेंब्ली असतात: पोल III कोर, बीटा स्लाइडिंग क्लॅम्प प्रोसेसिव्हिटी फॅक्टर आणि क्लॅम्प-लोडिंग कॉम्प्लेक्स. एकदा प्राइमरला प्राइमेजद्वारे एकत्र केले की, डीएनए पोलीमरेझ III प्राइमरच्या 3 मुख्य टोकाला न्यूक्लियोटाइड जोडण्याचे कार्य सुरू करते. हे लक्षात घेणे महत्वाचे आहे की प्रतिकृती दोन दिशांनी पुढे जाते, कारण डीएनए प्रतिकृती बबलमध्ये दोन डीएनए टेम्पलेट्स असतात. डीएनए पोल 1 च्या दुसर्या दोन क्रिया प्रतिकृतीसाठी महत्त्वपूर्ण आहेत, परंतु डीएनए पोलीमरेझ III (पोल III) हे सजीवांच्या शरीरात निर्मार्ण होणारे द्रव्य आहे जे 5'-3' पॉलिमरेज फंक्शन करते. १ प्राईमेज-फ्री ३' हायड्रॉक्सिल गटाची गरज या एंजाइम्सद्वारे दीक्षा स्थळांवर संश्लेषित केलेल्या आरएनए प्राइमरद्वारे पूर्ण केली जाते. डीएनए पॉलिमरेज III (डीएनए पॉलिमरेज नव्हे) एक सजीवांच्या शरीरात निर्मार्ण होणारे द्रव्य आहे जे डीएनए रेणूच्या प्रतिकृतीदरम्यान इतर एंजाइमांच्या सहकार्याने कार्य करते. डीएनए प्रतिकृती सुरू होते जेव्हा एन्झ ... हेलिकेस म्हणून ओळखले जाणारे वायएमई डीएनए स्ट्रँड उघडते. डीएनए पॉलिमरेज III होलोएन्झाइम हे प्रोकॅरियोटिक डीएनए प्रतिकृतीमध्ये गुंतलेले प्राथमिक एंजाइम कॉम्प्लेक्स आहे. थॉमस कॉर्नबर्ग (आर्थर कॉर्नबर्गचा मुलगा) आणि माल्कम गेफ्टर यांनी १९७० मध्ये याचा शोध लावला. 7.2.2 प्रोकॅरियोट्समधील डीएनए प्रतिकृतीची प्रक्रिया स्पष्ट करा, ज्यात एंजाइम (हेलिकेस, डीएनए पोलीमरेझ, आरएनए प्राइमेज आणि डीएनए लिगेज), ओकाझाकी तुकडे आणि डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड ट्रायफॉस्फेट्सची भूमिका समाविष्ट आहे. डीएनए पोलीमरेझ III क्रियेच्या दिशेच्या संदर्भात ओकाझाकी तुकड्यांचे स्पष्टीकरण आवश्यक आहे. जीवाणूंमधील डीएनए प्रतिकृतीमध्ये, एंझाइम डीएनए पोलीमरेझ III (संक्षिप्त डीएनए पोल III) डीएनएच्या टेम्पलेट स्ट्रँडमध्ये न्यूक्लियोटाइड जोडते. परंतु डीएनए पोल तिसरा शून्यापासून नवीन स्ट्रँड सुरू करू शकत नाही. डीएनए पोलीमरेझ III हे मुख्य प्रतिकृती सजीवांच्या शरीरात निर्मार्ण होणारे द्रव्य आहे. डीएनए पॉलिमरेज आयव्ही आणि व्ही मध्ये मोठ्या सक्रिय साइट्स आहेत ज्या अधिक बेस मिसइन्कॉर्पोरेशनची परवानगी देतात आणि म्हणूनच अधिक त्रुटी-प्रवण असतात. त्यांच्याकडे चुकीच्या गोष्टी दुरुस्त करण्यासाठी प्रूफरीडिंग-एक्सोन्यूक्लियस सबयुनिट्सचा देखील अभाव आहे (नोहमी 2006, आणि हेस्टिंग्ज एट अल. 2010). पोल तिसरा एचई स्वत: 10 सबयुनिट्सपासून बनलेला आहे (8). α, उत्प्रेरक पोलीमरेझ सबयुनिट (9), ε, 3' → 5' प्रूफरीडिंग एक्सोन्यूक्लियस (10) आणि θ, अज्ञात फंक्शनचे सबयुनिट, पॉलिमरेज कोर तयार करण्यासाठी जोडले जातात (11). α ε बांधतो परंतु θ नाही, तर θ ε बांधतो परंतु α नाही (12), αεθ ची रेखीय सरणी सुचवते.
एंजाइम (हेलिकेस, डीएनए पोलीमरेझ, आरएनए प्राइमेज आणि डीएनए लिगेज), ओकाझाकी तुकडे आणि डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड ट्रायफॉस्फेट्सच्या भूमिकेचा समावेश आहे. डीएनए पोलीमरेझ III क्रियेच्या दिशेच्या संदर्भात ओकाझाकी तुकड्यांचे स्पष्टीकरण आवश्यक आहे.