facts:
Faits :
A.
A._ est propriétaire de la parcelle n° 2088 du registre foncier de la commune d'Yverdon-les-Bains, sur laquelle est sise un immeuble d'une surface de 118 m2, profond d'environ 19 m, composé d'un bâtiment principal de quatre étages sous un toit à deux pans donnant, sur une largeur d'un peu moins de 6 m, sur la rue de la Maison Rouge, où il est contigu aux immeubles voisins. A l'arrière de la parcelle, donnant sur le Canal Oriental, lui est accolée en contiguïté au sud, une annexe construite en 1980 sur une base de 1920 pour abriter l'atelier et le matériel d'une lignée de relieurs-encadreurs établie de longue date dans l'immeuble; la façade gouttereau de cette annexe comporte, sur un soubassement borgne aligné sur le canal, deux niveaux percés de trois fenêtres avec encadrements de couleur ocre. Depuis le pont de la Plaine, une rangée de fenêtres du dernier étage de la partie principale du bâtiment est visible par-dessus la toiture à deux pans de cette annexe.
Ce bien-fonds est sis en zone de la ville ancienne au sens des art. 9 ss du règlement du plan général d'affectation de la ville d'Yverdon-les-Bains. Le bâtiment a reçu la note 4 (correspondant à un "objet bien intégré") au recensement architectural du canton de Vaud, qui le décrit comme "maison bourgeoise". Cet immeuble fait partie des bâtiments C, qualifiés de "bien intégrés dans la ville ancienne" et "façonn[ant] la structure de l'ancienne ville" au sens des art. 32 à 33bis du règlement du plan général d'affectation de la ville d'Yverdon-les-Bains (RPGA).
B.
En juin 2014, la Municipalité d'Yverdon-les-Bains (ci-après: la Municipalité) a refusé un pré-projet de transformation de l'immeuble en question prévoyant de réunir les deux corps de bâtiments en un seul bâtiment de quatre étages avec une toiture unique.
A._ a ensuite déposé une demande de permis de construire sur la base de plans du 18 mars 2015. Selon les plans, l'annexe était conservée et un étage surmonté d'un toit-terrasse lui était ajouté; le faîte du toit du bâtiment principal était surélevé de 70 cm et des ouvertures étaient prévues dans la toiture. Par décision du 7 octobre 2015, la Municipalité a refusé le permis de construire sur la base des art. 3, 9, 28, 120 et 143 RPGA et du préavis négatif du Service immeubles, patrimoine et logistique du canton de Vaud (SIPAL, devenu la Direction générale des immeubles et du patrimoine).
Le 30 novembre 2016, A._ a déposé une nouvelle demande de permis de construire; selon les nouveaux plans du 23 novembre 2016, la partie annexe est surélevée d'un étage percé de trois fenêtres et son toit est aussi rehaussé; les combles de l'annexe deviennent habitables; le toit du bâtiment principal est légèrement rehaussé; les combles du bâtiment principal deviennent aussi habitables; les deux toitures sont reliées par un unique chéneau entre le pan sud-est du toit de l'annexe et le pan nord-ouest du toit du bâtiment principal; le pan nord-ouest du toit de l'annexe visible du côté du canal contient une rangée de trois velux; quant au toit du bâtiment principal, son pan situé du côté du canal est percé par trois velux (rectification d'office: <ref-law>) et celui du côté de la rue de la Maison Rouge par deux rangées de deux velux; l'agencement intérieur de l'immeuble est passablement modifié puisque la cage d'escalier située au centre du bâtiment est agrandie, distribuant désormais le bâtiment central et sa partie annexe, l'escalier qui desservait uniquement l'annexe est supprimé et les salles d'eau des appartements sont regroupées dans la partie centrale du bâtiment.
A la demande de la Municipalité, l'intéressé a complété sa demande de permis de construire le 15 mars 2017, en déposant notamment une demande d'autorisation adressée à l'Unité du logement du Département de l'intérieur, en vertu de la loi du 10 mai 2016 sur la préservation et la promotion du parc locatif (LPPPL; RS/VD 840.15). Selon la synthèse de la Centrale des autorisations CAMAC du canton de Vaud du 10 juillet 2017, le SIPAL a préavisé négativement la réalisation du projet, alors que le Service des communes et du logement a délivré son autorisation spéciale. Mis à l'enquête publique du 8 avril au 7 mai 2017, le projet n'a suscité aucune opposition.
Par décision du 19 juillet 2017, la Municipalité a refusé l'octroi du permis de construire sur la base des art. 3, 4, 9 et 28 al. 4 RPGA ainsi que du préavis négatif du SIPAL.
C.
A._ a formé recours auprès de la Cour de droit administratif et public du Tribunal cantonal du canton de Vaud (ci-après: le Tribunal cantonal) contre la décision municipale du 19 juillet 2017. Le 19 décembre 2018, la cour cantonale a tenu une audience avec inspection locale, en présence des parties. Par arrêt du 20 janvier 2020, elle a admis le recours, annulé la décision du 19 juillet 2017 et renvoyé la cause à la Municipalité pour qu'elle délivre le permis de construire litigieux. Elle a considéré en substance que la Municipalité avait abusé de son pouvoir d'appréciation en refusant le permis en question pour des motifs relatifs à l'esthétique et à l'intégration et en refusant d'accorder des dérogations aux art. 120 et 143 RPGA.
D.
Agissant par la voie du recours en matière de droit public, la Municipalité d'Yverdon-les-Bains demande principalement au Tribunal fédéral de réformer l'arrêt du 20 janvier 2020 en ce sens que le recours est rejeté. Elle conclut subsidiairement à l'annulation de l'arrêt du 20 janvier 2020 et au renvoi de la cause au Tribunal cantonal ou à la Municipalité pour nouvelle décision au sens des considérants.
Le Tribunal cantonal renonce à se déterminer et se réfère aux considérants de l'arrêt attaqué. La Division monuments et sites de la Direction générale des immeubles et du patrimoine du canton de Vaud renonce à déposer des observations. L'intimé conclut au rejet du recours. La recourante a répliqué par courrier du 25 mai 2020.
Par ordonnance du 13 mars 2020, le Président de la Ire Cour de droit public a admis la requête d'effet suspensif présentée par la recourante.

considerations:
Considérant en droit :
1.
Dirigé contre une décision finale (<ref-law>) prise en dernière instance cantonale (art. 86 al. 1 let. d LTF) dans le domaine du droit public de l'aménagement du territoire et des constructions (<ref-law>), le recours est en principe recevable comme recours en matière de droit public selon les <ref-law>, aucune des exceptions prévues à l'<ref-law> n'étant réalisée. La Municipalité, qui fait valoir une violation de l'autonomie dont elle bénéficie en matière d'aménagement du territoire et en droit des constructions, a qualité pour agir en vertu de l'art. 89 al. 2 let. c LTF. Les autres conditions de recevabilité du recours en matière de droit public sont réunies, si bien qu'il y a lieu d'entrer en matière sur le fond.
2.
La Municipalité reproche d'abord au Tribunal cantonal d'avoir considéré qu'elle avait abusé de son pouvoir d'appréciation en refusant d'octroyer le permis de transformer et d'agrandir le bâtiment protégé en question pour des motifs d'esthétique et d'intégration. Elle se plaint d'une violation de son autonomie communale (art. 50 Cst.). Elle fait aussi valoir une appréciation arbitraire des faits (<ref-law>).
2.1. Selon l'art. 50 al. 1 Cst., l'autonomie communale est garantie dans les limites fixées par le droit cantonal. En droit cantonal vaudois, les communes jouissent d'une autonomie consacrée lorsqu'elles définissent, par des plans, l'affectation de leur territoire, et lorsqu'elles appliquent le droit des constructions (art. 139 al. 1 let. d Cst./VD; cf. notamment <ref-ruling> consid. 3d p. 118 s.; arrêts 1C_365/2010 du 18 janvier 2011 consid. 2, in Pra 2011 n° 60 p. 428; 1C_424/2014 du 26 mai 2015 in RDAF 20015 I p. 474). Une commune reconnue autonome dans un domaine spécifique peut dénoncer tant les excès de compétence d'une autorité cantonale de recours que la violation par celle-ci des règles du droit fédéral, cantonal ou communal qui régissent la matière (<ref-ruling> consid. 7.2 p. 134).
2.2. Lorsque, statuant sur une demande d'autorisation de construire, l'autorité communale interprète son règlement en matière de constructions et apprécie les circonstances locales, elle bénéficie d'une liberté d'appréciation particulière, que l'instance cantonale de recours contrôle avec retenue (cf. art. 3 al. 2 LAT; arrêt 1C_279/2019 du 9 avril 2020 consid. 2.1.3). Une autorité de recours ne peut ainsi pas choisir entre plusieurs solutions disponibles et appropriées ou remplacer une appréciation adéquate de la commune par sa propre appréciation (AEMISEGGER/HAAG, in Commentaire pratique LAT: Autorisations de construire, protection juridique et procédure, 2020, n° 84 ad art. 33 LAT). Elle ne doit cependant pas seulement intervenir lorsque l'appréciation de l'instance précédente est insoutenable, auquel cas l'étendue de son pouvoir d'examen s'apparenterait à un contrôle limité à l'arbitraire, ce qui serait contraire à l'art. 33 al. 3 let. b LAT (<ref-ruling> consid. 3.6 p. 58). Conformément aux art. 46 et 49 Cst., l'autorité de recours doit en particulier sanctionner l'appréciation communale lorsque celle-ci contrevient au droit supérieur, viole les principes constitutionnels d'égalité de traitement et de proportionnalité ou encore apparaît objectivement insoutenable - et partant arbitraire (<ref-ruling> consid. 3.6 p. 59; <ref-ruling> consid. 1.4.3 p. 311; arrêts 1C_279/2019 du 9 avril 2020 consid. 2.1; 1C_450/2018 du 11 décembre 2019 consid. 3.1.3). Sur des éléments susceptibles de heurter le droit supérieur, il appartient à la commune de motiver soigneusement sa décision (arrêts 1C_540/2016 du 25 août 2017 consid. 2.2, in JdT 2017 I p. 303; 1C_450/2018 du 11 décembre 2019 consid. 3.1.3; 1C_641/2018 du 23 septembre 2019 consid. 3.1.3). Le contrôle de l'opportunité s'exerce donc avec retenue sur des points concernant principalement des intérêts locaux, tandis que, au contraire, la prise en considération adéquate d'intérêts d'ordre supérieur, dont la sauvegarde incombe au canton, doit être imposée par un contrôle strict. L'autorité intervient ainsi non seulement lorsque la mesure d'aménagement retenue par la commune est insoutenable, mais aussi lorsqu'elle paraît inappropriée à des intérêts qui dépassent la sphère communale (<ref-ruling> consid. 3.6 p. 58 s.; AEMISEGGER/HAAG, ibidem).
2.3. Le Tribunal fédéral revoit librement l'interprétation et l'application du droit fédéral et du droit constitutionnel cantonal (<ref-law>). Il examine en revanche sous l'angle restreint de l'arbitraire l'interprétation et l'application des autres règles du droit cantonal ou communal (cf. <ref-ruling> consid. 5.4 p. 43; <ref-ruling> consid. 3 p. 351). Il contrôle librement si l'autorité judiciaire a respecté la latitude du jugement découlant de l'autonomie communale (<ref-ruling> consid. 3.1 p. 56).
Lorsqu'il s'agit d'examiner l'application de clauses d'esthétique, le Tribunal fédéral fait preuve de retenue dans l'appréciation des circonstances locales. Dans ce domaine, les autorités locales disposent en effet d'un large pouvoir d'appréciation (cf. <ref-ruling> consid. 4.3 p. 416). C'est le cas notamment lorsqu'il s'agit de savoir si une construction ou une installation est de nature à compromettre l'aspect ou le caractère d'un site, d'une localité, d'un quartier ou d'une rue (<ref-ruling> consid. 3d p. 118; arrêt 1C_452/2016 du 7 juin 2017).
2.4. En droit vaudois, un projet de construction peut être interdit sur la base de l'art. 86 de la loi cantonale sur l'aménagement du territoire et des constructions du 4 décembre 1985 (LATC; RS/VD 700.11) quand bien même il satisferait à toutes les autres dispositions cantonales et communales en matière de police des constructions. En effet, à teneur de l'art. 86 al. 1 LATC, la Municipalité veille à ce que les constructions, quelle que soit leur destination, ainsi que les aménagements qui leur sont liés, présentent un aspect architectural satisfaisant et s'intègrent à l'environnement. Elle refuse le permis pour les constructions ou les démolitions susceptibles de compromettre l'aspect et le caractère d'un site, d'une localité, d'un quartier ou d'une rue, ou de nuire à l'aspect d'un édifice de valeur historique, artistique ou culturelle (art. 86 al. 2 LATC). L'alinéa 3 de cette disposition prévoit que les règlements communaux doivent contenir des dispositions en vue d'éviter l'enlaidissement des localités et de leurs abords.
Selon la jurisprudence, l'application d'une clause d'esthétique ne doit cependant pas aboutir à ce que, de façon générale, la réglementation sur les zones en vigueur soit vidée de sa substance. Une intervention des autorités dans le cas de la construction d'un immeuble réglementaire qui ne serait pas en harmonie avec les bâtiments existants, ne peut s'inscrire que dans la ligne tracée par la loi elle-même et par les règlements communaux, qui définissent en premier lieu l'orientation que doit suivre le développement des localités. Ainsi, lorsqu'un plan de zones prévoit que des constructions d'un certain volume peuvent être édifiées dans tel secteur du territoire, une interdiction de construire fondée sur l'art. 86 LATC ne peut se justifier que par un intérêt public prépondérant. Il faut que l'utilisation des possibilités de construire réglementaires apparaisse déraisonnable (<ref-ruling> consid. 3d p. 119; 363 consid. 3a p. 366/367; 370 consid. 5 p. 377; <ref-ruling> consid. 6c p. 222 s.).
2.5. Dans la commune d'Yverdon-les-Bains, l'art. 3 al. 1 RPGA prévoit que les dispositions qualitatives du plan général d'affectation (intégration de l'objet construit dans le site naturel ou bâti, recherche d'une architecture de valeur, prise en compte de facteurs favorisant l'urbanité et la sécurité, conservation et réalisation d'espaces extérieurs significatifs et prise en compte et maîtrise des nuisances sonores, visuelles et atmosphériques) priment les dispositions quantitatives (densité par les indices d'utilisation, d'occupation du sol et de masse, distances aux limites, périmètres d'implantation et hauteurs).
L'art. 4 al. 2 RPGA précise que toute intervention prend en considération la structure urbanistique, existante ou en devenir.
2.6. En l'occurrence, le Tribunal cantonal a retenu que les divers griefs esthétiques soulevés par la Municipalité (rupture indésirable avec l'aspect actuel du bâtiment, asymétrie saugrenue des deux pans du nouveau toit de l'annexe, impact défavorable de ce choix architectural sur la transition de la toiture avec le bâtiment principal, ouvertures en toiture en surnombre) ne permettaient pas de retenir un intérêt public prépondérant justifiant le refus de la surélévation. Il a jugé que, malgré la marge d'appréciation importante dont jouissait la Municipalité pour apprécier les questions d'esthétique et d'intégration, elle avait abusé de son pouvoir d'appréciation en refusant l'octroi du permis de construire pour de tels motifs.
Dans un premier temps, le Tribunal cantonal a considéré que le bâtiment litigieux devait être apprécié en regard du périmètre environnant VI de l'ISOS, protégeant le Canal Oriental avec un objectif de sauvegarde a (voir infra consid. 2.7). Il a ajouté que le bâtiment avait reçu la note 4 au recensement architectural du canton (selon la jurisprudence cantonale, la note 4 a un caractère purement indicatif et informatif; elle ne constitue pas une mesure de protection; elle est en revanche un élément d'appréciation important pour les autorités chargées de l'aménagement du territoire, notamment dans la procédure de permis de construire, lorsque ces autorités appliquent les règles concernant l'intégration et l'esthétique des constructions). L'instance précédente a encore souligné que le bâtiment en question était situé dans la "zone de la ville ancienne" qui autorise la surélévation d'un étage et permet de construire 4 niveaux. Elle a ensuite relevé que l'annexe apparaissait actuellement peu intégrée au reste du bâtiment (comme l'avait admis le SIPAL); elle était en effet accolée à la façade du bâtiment principal; ainsi une grande partie de la façade de celui-ci était actuellement masquée; du côté du canal, le bâtiment formait un ensemble plutôt disparate. Les juges cantonaux ont estimé que la surélévation de l'annexe permettrait une harmonisation de ce bâtiment par la création d'une façade unique alignée au bord du canal; les fenêtres du dernier étage du bâtiment principal, actuellement en retrait de l'annexe, seraient remplacées, dans l'étage ajouté aligné sur le canal, par les fenêtres de cet étage qui sont calquées sur celles des deux étages existants; le style du bâtiment serait conservé, en conformité avec l'art. 26 al. 1 RPGA. La cour cantonale a précisé que lors de son inspection locale elle avait constaté que le front d'habitation du côté est du canal se caractérisait par des bâtiments de hauteur variable que le projet litigieux permettait de conserver car la hauteur de l'annexe restait inférieure à celle des bâtiments voisins (Maison d'Ailleurs et les bâtiments ECA 348 et 344). Le Tribunal cantonal a ajouté qu'il paraissait difficile de considérer la configuration actuelle comme définitive d'un point de vue patrimonial et urbanistique, car les deux corps de bâtiment avaient été modifiés au fil du temps en fonction des besoins des propriétaires, sans trouver de forme définitive, en raison de la forme de la parcelle, étroite et en longueur, la rendant difficilement aménageable. Il a encore considéré que les critiques de la Municipalité relatives au surnombre d'ouvertures en toiture (voir infra consid. 2.8) ainsi qu'à l'asymétrie de la toiture (voir infra consid. 2.9) étaient exagérées.
Dans un deuxième temps, la cour cantonale a procédé à une pesée des intérêts. Elle a d'abord mis en avant l'existence d'un intérêt public à la protection du caractère des bâtiments protégés sis à proximité et de leur environnement (quatre bâtiments bénéficiant d'une note 4 au recensement architectural, un bâtiment d'une note 2, la Maison d'Ailleurs et un autre bâtiment d'une note 1 ainsi que le Château jouissant de la protection des monuments historiques du canton et de la Confédération).
Elle a ensuite considéré que la surélévation projetée s'intégrait aux alentours: la vue sur le Château depuis le Pont Haldimand ne serait sans doute pas entravée par la surélévation qui serait peu visible puisque dissimulée par le bâtiment ECA 5974 (soit un bâtiment moderne de 4 niveaux habitables) vu sa hauteur. La cour cantonale a aussi relevé s'agissant de la vue sur le Château depuis la passerelle en fer située à côté du bâtiment ECA 340 que la surélévation rendrait certes l'annexe plus visible, sans toutefois provoquer une gêne majeure par rapport à la situation actuelle puisque sa hauteur resterait inférieure à celle des bâtiments sis de chaque côté du pont de la Plaine; la tour nord-est du Château se distinguerait comme c'est le cas actuellement depuis les deux ponts précités, en arrière-fond des immeubles se trouvant de part et d'autre du Canal Oriental. Le Tribunal cantonal a ajouté que l'impact visuel de la surélévation projetée sur les deux bâtiments classés ayant obtenu la note 1, resterait limité puisque ces bâtiments continueraient à dominer par leur volume et leur hauteur; la différence de hauteur entre l'annexe et ces différents bâtiments serait moins marquée qu'actuellement, ce qui aurait tendance à rendre l'ensemble formé par ces quatre constructions plus harmonieux en termes de volume et de hauteur, selon le photomontage figurant au dossier. Il a souligné que l'organisation des ouvertures de la façade de l'annexe (trois rangées de trois fenêtres) rappelait le traitement de la façade sud-ouest de la Maison d'Ailleurs, disposant aussi de neuf ouvertures; le traitement de la façade de l'annexe était sobre et semblable à la situation actuelle.
Le Tribunal cantonal a enfin pris en compte dans sa pesée des intérêts l'intérêt public à exploiter au maximum les possibilités de construire (la surélévation permettait une meilleure exploitation des possibilités de construire avec la construction de quatre niveaux) ainsi que l'intérêt public à la surélévation permettant une amélioration quantitative et qualitative de l'offre d'habitation à Yverdon-les-Bains où sévit une pénurie de logement (augmentation du nombre de logement de 3 à 7, amélioration de l'habitabilité et du confort des appartements et mise aux normes des installations). L'instance précédente a enfin relevé l'intérêt privé du propriétaire à pouvoir améliorer habitabilité et la rentabilité de son bâtiment, actuellement vide.
2.7. La recourante ne répond pas à tous les points de l'argumentation approfondie et circonstanciée de la cour cantonale. Elle n'en conteste que certains. Ainsi, elle reproche d'abord au Tribunal cantonal d'avoir mal apprécié le degré de protection dont la parcelle en question jouit au regard de l'ISOS. Elle lui fait grief d'avoir jugé que le bâtiment litigieux était situé dans le périmètre environnant VI appartenant à la catégorie d'inventaire a avec un objectif de sauvegarde a (lequel préconise la sauvegarde de l'état existant en tant qu'espace agricole ou libre, la conservation de la végétation et des constructions anciennes essentielles pour l'image du site et la suppression des altérations). Elle soutient au contraire que ce bâtiment se trouve dans le périmètre 2 "Faubourg de la Plaine" avec un objectif de sauvegarde A (lequel préconise la sauvegarde de la substance, à savoir la conservation intégrale de toutes les constructions et composantes du site, de tous les espaces libres et la suppression des interventions parasites).
2.7.1. Après avoir relevé que la parcelle litigieuse se trouvait à un endroit où passent les limites de ces deux périmètres, le Tribunal cantonal a considéré que le plan de l'ISOS concernant Yverdon-les-Bains, établi au 1:5'000, était peu précis et ne permettait pas à sa seule lecture de trancher cette question. Se fondant sur l'inspection locale à laquelle il a procédé, il a jugé que c'était au regard du périmètre environnant VI, soit du Canal Oriental, que la situation devait être appréciée. La cour cantonale a relevé que pour l'observateur se trouvant sur le pont traversant le Canal Oriental, le bâtiment litigieux s'inscrivait dans la perspective du canal; il partageait les caractéristiques des bâtiments qui bordent ce canal (alignement d'habitations aux niveaux ajourés sur un soubassement borgne ou peu percé); le Boulevard de la Plaine, avec les caractéristiques décrites par l'ISOS (boulevard s'élargissant avec des habitations sur commerce) n'était pas perceptible depuis ce point de vue, ni depuis la Place des Droits de l'Homme; quant à la partie du bâtiment qui donne sur la rue étroite de la Maison Rouge, le projet litigieux laissait le bâtiment quasiment inchangé de ce côté.
La recourante reconnaît que les délimitations entre le périmètre 2 et le périmètre environnant VI sont imprécises sur le plan de l'ISOS. Elle estime cependant qu'il faut interpréter le plan en fonction des descriptifs des périmètres. Partant, elle ne démontre pas que les considérations factuelles retenues par le Tribunal cantonal, qui s'est rendu sur place, sont arbitraires. Peu importe au demeurant, puisque la question de savoir si l'immeuble en question se trouve dans le périmètre environnant VI ou dans le périmètre 2 n'est pas déterminante. En effet, le plan général d'affectation d'Yverdon-les-Bains qui a été modifié notamment en 2015 a pris en compte l'inventaire ISOS dans lequel la ville d'Yverdon-les-Bains a été insérée en 2009 (RO 2009 1015).
La recourante ne parvient ainsi pas à établir que le Tribunal cantonal a arbitrairement considéré que le bâtiment litigieux se trouvait dans le périmètre environnant VI.
2.8. La recourante reproche ensuite aux juges cantonaux d'avoir mal appréhendé les ouvertures en toiture et d'avoir appliqué arbitrairement l'art. 28 al. 4 RPGA.
Les ouvertures en question consistent en trois velux sur le toit de l'annexe du côté du canal, trois velux sur le toit du bâtiment principal du même côté et quatre velux sur le toit du bâtiment principal (deux rangées de deux) du côté de la rue de la Maison Rouge. Ces dix ouvertures sont de dimensions inférieures aux fenêtres des façades correspondantes.
2.8.1. A teneur de l'art. 28 al. 4 RPGA, l'utilisation des combles à des fins d'habitation ou d'activité est admise sur un seul niveau pour autant que les moyens d'éclairage ne défigurent ni le toit ni les pignons et n'altèrent pas l'aspect général de la ville.
L'alinéa 6 de cette disposition prévoit que les pleins dominent largement les vides. La disposition et la dimension des moyens d'éclairage sur un pan de toiture doivent être équilibrés par rapport à l'ordre des ouvertures de la façade correspondante (art. 28 al. 8 RPGA).
2.8.2. Le Tribunal cantonal a considéré que ces ouvertures ne défiguraient pas le toit au sens de l'art. 28 al. 4 RPGA. Il a d'abord relevé que les pleins dominaient nettement les vides sur tous les pans de toiture visibles depuis la rue de la Maison Rouge et du côté du canal, conformément à l'art. 28 al. 6 RPGA. Il a ajouté que toutes les ouvertures en toiture étaient de dimensions inférieures aux fenêtres des façades et qu'elles étaient alignées par rapport respectivement aux trois rangées de fenêtres de la façade de l'annexe et aux deux rangées de fenêtres de la façade du côté de la rue de la Maison Rouge; quant aux trois velux (rectification d'office; <ref-law>) situés sur le plan nord-ouest du toit du bâtiment principal, ils étaient disposés de manière harmonieuse par rapport aux autres ouvertures en contrebas. Il en a déduit que l'art. 28 al. 8 RPGA était aussi respecté.
La Municipalité tente de remettre en cause cette interprétation, en arguant que le Tribunal cantonal a mentionné par erreur que le pan de toit du corps principal du côté du canal était percé par deux velux, alors qu'il ressort des plans qu'il y en a trois. Elle estime que le triangle formé par ces trois ouvertures n'est pas positionné de manière cohérente avec la rangée de trois tabatières prévues dans le pan de toit ouest de l'annexe sis en dessous car les orientations de ces pans de toit divergent. Elle affirme que le caractère disparate de ces ouvertures est encore accru par leurs dimensions inégales ainsi que par l'exutoire de fumée pour la pompe à chaleur et les panneaux solaires posés entre les velux.
Cette argumentation, qui est l'expression d'une appréciation subjective du projet, ne suffit cependant pas à démontrer le caractère manifestement insoutenable de celle du Tribunal cantonal, ce d'autant moins que le Tribunal de céans s'impose une retenue dans l'appréciation de circonstances locales. Cela est d'autant plus vrai que la recourante ne conteste pas que l'architecture à pan des toitures est conservée, ni que le type de velux est uniforme par pan de toiture.
Le Tribunal cantonal pouvait ainsi, après avoir procédé lui-même à une vision locale, considérer sans arbitraire que la commune avait excédé son pouvoir d'appréciation en critiquant les ouvertures en toiture.
2.9. La Municipalité fait encore grief au Tribunal cantonal de ne pas avoir perçu l'ampleur réelle de la visibilité de la forme asymétrique des pans du toit de l'annexe depuis le domaine public, asymétrie qu'elle qualifie de saugrenue.
Le Tribunal cantonal a considéré que l'asymétrie de la toiture de l'annexe et sa jointure avec le toit du bâtiment principal étaient liées à la forme de la parcelle et concernaient le pan sud-est du toit de l'annexe se trouvant derrière le front de bâtiments longeant le canal; ces éléments n'étaient par ailleurs visibles ni depuis le Pont de la Plaine ni depuis la Place des Droits de l'Homme, comme cela avait été constaté lors de l'inspection locale. La cour cantonale a ajouté que le constructeur avait présenté deux projets de toitures différentes à la Municipalité avant le projet actuel, à savoir le pré-projet de mars 2014 qui prévoyait la transformation des deux corps de bâtiments en un seul bâtiment de quatre étages avec une toiture unique et le projet de mars 2015 qui prévoyait de conserver l'annexe et de lui ajouter un étage surmonté d'un toit-terrasse; or la Municipalité s'était opposée à ces deux projets en raison notamment de leur toiture.
A cet égard, la recourante se contente uniquement de faire valoir que l'asymétrie du toit de l'annexe serait visible depuis certains emplacements du domaine public et soutient qu'il ne ressortirait pas du procès-verbal de l'inspection locale qu'elle ne serait pas visible. Cette simple assertion ne suffit toutefois pas à rendre déraisonnable l'argumentation de l'instance précédente, ce d'autant moins que la recourante ne discute pas les autres arguments avancés par le Tribunal cantonal, qui s'est rendu sur place. Dans ces conditions, la solution retenue par l'instance précédente ne paraît pas insoutenable.
2.10. En définitive, l'immeuble en question ne fait l'objet d'aucune mesure de protection stricte, telle un classement ou une mise à l'inventaire. Il s'agit d'un bâtiment de type C au sens des art. 32 ss RPGA qui peut être transformé (art. 32bis et 33 RPGA). S'ajoute à cela que, selon le plan de la zone de la ville ancienne, il se trouve dans un périmètre qui autorise des bâtiments pouvant compter quatre niveaux (art. 11 al. 1 RPGA) et qui permet les surélévations d'un étage (art. 25 cum 33bis RPGA). Le projet est conforme aux dispositions réglementaires relatives à la hauteur et aux dimensions du bâtiment. Dès lors, une interdiction de la surélévation pour des motifs liés à l'esthétique doit être justifiée par des intérêts publics supérieurs (<ref-ruling> consid. 4.4 p. 63 et les arrêts cités). Or la recourante, qui n'a contesté en vain que certains des nombreux arguments retenus par le Tribunal cantonal, ne parvient pas à démontrer que le Tribunal cantonal a retenu de façon insoutenable que l'intérêt public à exploiter au maximum les possibilités de construire ainsi que l'intérêt public à la surélévation permettant une amélioration quantitative et qualitative de l'offre d'habitation à Yverdon-les-Bains l'emportaient sur l'intérêt public à la protection du caractère des bâtiments protégés sis à proximité et de leur environnement. L'exploitation maximale des possibilités de construire correspond en effet à un intérêt public car la politique suisse de l'aménagement du territoire vise à orienter le développement de l'urbanisation vers l'intérieur du bâti par une utilisation mesurée du sol (art. 1 al. 2 let. abis LAT) et à créer un milieu bâti compact (art. 1 al. 2 let. b LAT; <ref-ruling> consid 4.4 p. 63 et les arrêts cités).
Par conséquent, avec la retenue que s'impose le Tribunal fédéral dans l'examen des circonstances locales, il n'y a pas de raison de s'écarter de la pesée des intérêts opérée par l'instance précédente.
3.
La Municipalité fait encore grief au Tribunal cantonal d'avoir jugé qu'elle avait abusé du pouvoir d'appréciation que lui confère l'art. 149 RPGA en refusant d'accorder des dérogations quant aux espaces de rangement (art. 143 RPGA), aux places de stationnement pour deux-roues (art. 120 RPGA) et à l'esthétique de la toiture.
3.1. L'art. 143 RPGA prévoit que tout bâtiment comportant de l'habitation doit disposer pour chaque logement de 6,00 m2 au minimum de locaux de rangement situés soit dans les caves ou galetas, soit dans des pièces non éclairées à l'intérieur du logement.
A teneur de l'art. 120 al. 1 RPGA, le nombre de places de stationnement obligatoires et leur dimensionnement sont calculés au moyen de la norme VSS en vigueur.
La Municipalité peut accorder des dérogations de minime importance lorsque la topographie, la forme des parcelles, les accès, l'intégration ou la conception des constructions imposent des solutions particulières et s'il n'en résulte pas d'inconvénients majeurs (art. 149 al. 1 RPGA).
3.2. Selon la jurisprudence, les dispositions dérogatoires ne doivent pas nécessairement être interprétées de manière restrictive, mais selon les méthodes d'interprétation ordinaires. Une dérogation importante peut ainsi se révéler indispensable pour éviter les effets rigoureux de la réglementation ordinaire. En tous les cas, la dérogation doit servir la loi ou, à tout le moins, les objectifs recherchés par celle-ci: l'autorisation exceptionnelle doit permettre d'adopter une solution reflétant l'intention présumée du législateur s'il avait été confronté au cas particulier. L'octroi d'une dérogation suppose une situation exceptionnelle et ne saurait devenir la règle, à défaut de quoi l'autorité compétente pour délivrer des permis de construire se substituerait au législateur cantonal ou communal par le biais de sa pratique dérogatoire. Il implique une pesée entre les intérêts publics et privés de tiers au respect des dispositions dont il s'agirait de s'écarter et les intérêts du propriétaire privé à l'octroi d'une dérogation, étant précisé que des raisons purement économiques ou l'intention d'atteindre la meilleure solution architecturale, ou une utilisation optimale du terrain, ne suffisent pas à elles seules à justifier une dérogation (cf. arrêts 1C_603/2018 du 13 janvier 2020 consid. 4.3, 1C_279/2018 du 17 décembre 2018 consid. 4.1.3 et les références; 1C_458/2011 du 29 février 2012 consid. 4.4 et la référence à l'<ref-ruling> consid. 5 p. 53).
3.3. S'agissant des espaces de rangement, quatre appartements ne disposent pas des 6 m2 exigés, soit les quatre appartements de 1,5 pièces situés aux premier et deuxième étages.
Le Tribunal cantonal a considéré que la dérogation à accorder était de peu d'importance car, sur les quatre appartements ne disposant pas des 6 m2 d'espaces de rangement, deux appartements avaient tout de même un espace de rangement de 4,54 et 4,94 m2. L'instance précédente a ajouté que, du point de vue du principe de la proportionnalité, il se justifiait de tenir compte du fait que le règlement imposait un espace de rangement minimum sans égard à la taille des appartements.
La recourante tente de mettre en cause cette argumentation en relevant que les moindres armoires murales figurées sur les plans sont comptabilisées dans le calcul des surfaces de rangement; elle soutient que si l'on exclut les armoires, un cinquième appartement n'atteindrait pas le seuil de 6 m2, deux des quatre logement non règlementaires seraient carrément privés de tout local de rangement et deux appartements n'auraient qu'une surface de 2,84 et 3,24 m2. Ce nouveau calcul des surfaces de rangement, certes défendable, n'est toutefois pas de nature à démontrer le caractère manifestement insoutenable de l'argumentation du Tribunal cantonal. La Municipalité affirme encore que rien n'aurait empêché d'aménager un réduit dans certains appartements ou de consacrer une partie des combles à un grenier, ou de diminuer la surface habitable de certains logements ou d'excaver quelque peu le corps principal du bâtiment. Cette remarque ne suffit pas non plus à rendre déraisonnable l'argumentation de l'instance précédente. En effet, elle ne permet pas de conclure qu'il serait arbitraire au sens de la jurisprudence susmentionnée de faire prévaloir l'intérêt public à la création de sept logements au centre-ville.
3.4. Concernant le nombre de places de stationnement pour deux-roues nécessaire, il est de dix, alors que le projet litigieux n'en prévoit que trois.
Le Tribunal cantonal a estimé que le manque de sept places de stationnement pour deux-roues restait d'une ampleur acceptable, compte tenu du fait que l'on se trouvait au centre-ville à proximité de la gare. Il a considéré qu'il apparaissait disproportionné d'empêcher l'agrandissement prévu ou d'exiger de renoncer à la création d'un appartement en faveur de la création des places de stationnement manquantes, vu l'intérêt public à la création de logements. Il a encore relevé que la difficulté de construire les espaces de rangement et les places de stationnement pour deux-roues nécessaires était en grande partie due à la forme de la parcelle et au fait que le corps principal du bâtiment n'était pas excavé.
La recourante ne parvient pas à démontrer en quoi le raisonnement de l'instance précédente serait arbitraire. Elle se contente en effet de faire valoir que l'on aurait pu réduire la surface de logement en vue d'offrir aux parties communes un volume pour les deux-roues ou excaver un volume supplémentaire. Elle relève que le train ne constitue par une véritable alternative au vélo, utilisable à plus courte distance, le vélo étant davantage une alternative à la voiture qu'au train. Elle souligne que les places deux-roues sont importantes lorsque comme en l'espèce le projet n'offre pas les places de stationnement automobile prévues par le règlement. Ces griefs consistent en réalité en l'expression d'une appréciation subjective du projet, qui ne rend pas déraisonnable l'argumentation de l'instance précédente. De surcroît, il faut rappeler que, confronté à une décision cantonale fondée sur le droit cantonal et raisonnablement motivée, le Tribunal de céans s'impose une certaine retenue dans l'appréciation de circonstances locales dont les autorités cantonales ont une meilleure connaissance que lui (cf. <ref-ruling> consid. 6.4 p. 89; <ref-ruling> consid. 5.4.1 p. 163; <ref-ruling> consid. 3c p. 79).
3.5. Enfin, s'agissant de l'esthétique de la toiture, la recourante fait valoir qu'elle ne peut octroyer de dérogation compte tenu du fait que deux pans de toiture ne sont pas alignés (un pan comportant une rangée de trois tabatières et l'autre trois tabatières situées aléatoirement), que les velux sont de dimension différente, que deux rangées de deux velux se situent sur le pan est du côté de la rue de la Maison Rouge protégé par un objectif A selon l'ISOS et que l'on se trouve dans un environnement historique d'intérêt national. Ces griefs ont été traités dans le cadre de l'examen de l'esthétique et de l'intégration du projet litigieux (voir supra consid. 2, en particulier consid. 2.8). Il y a lieu d'y renvoyer.
4.
Il s'ensuit que le recours est rejeté.
Conformément à l'<ref-law>, il n'est pas perçu de frais judiciaires. L'intimé, assisté d'un avocat, a droit à des dépens, à la charge de la commune d'Yverdon-les-Bains (<ref-law>).

rulings:
Par ces motifs, le Tribunal fédéral prononce :
1.
Le recours est rejeté.
2.
Il n'est pas perçu de frais judiciaires.
3.
Une indemnité de 2'000 fr. est allouée à l'intimé à titre de dépens, à la charge de la commune d'Yverdon-les-Bains.
4.
Le présent arrêt est communiqué aux mandataires des parties, à la Direction générale des immeubles et du patrimoine et à la Cour de droit administratif et public Tribunal cantonal du canton de Vaud.
Lausanne, le 23 septembre 2020
Au nom de la Ire Cour de droit public
du Tribunal fédéral suisse
Le Président : Chaix
La Greffière : Tornay Schaller

origin_facts:
Vu les faits suivants:
A. A._ (ci-après: le recourant ou l'intéressé) est propriétaire de la parcelle n° 2088 de la Commune d'Yverdon-les-Bains, entièrement occupée par le bâtiment ECA n° 346. Cet immeuble, d'une surface de 118 m2, profond d'environ 19 m, est composé d'un bâtiment principal de quatre étages sous un toit à deux pans donnant, sur une largeur d'un peu moins de 6 m, sur la rue de ******, où il est contigu aux immeubles voisins. A l'arrière de la parcelle, donnant sur le Canal Oriental, lui est accolée, en contiguïté au sud, une annexe construite en 1980 sur une base de 1920 pour abriter l'atelier et le matériel d'une lignée de relieurs-encadreurs établie de longue date dans l'immeuble; la façade gouttereau de cette annexe comporte, sur un soubassement borgne aligné sur le canal, deux niveaux percés de trois fenêtres avec encadrements de couleur ocre. Depuis le pont de la Plaine, par-dessus la toiture à deux pans de cette annexe, est visible une rangée de fenêtre du dernier étage de la partie principale du bâtiment.
La parcelle n° 2088, figurée ci-dessus dans un extrait du guichet cartographique cantonal, se trouve dans la zone de la ville ancienne au sens des art. 9ss du Règlement du plan général d'affectation de la ville d'Yverdon-les-Bains (ci-après: RPGA). Cette zone fait l'objet du plan n° 2 du Plan général d'affectation de la ville d'Yverdon-les-Bains [ci-après: PGA]). Sur ce plan, un liseré orange délimite le long du Canal Oriental, depuis le pont de la Plaine proche du Château (en bas à gauche sur l'extrait) jusqu'à l'avenue Haldimand (en haut à droite), un périmètre "permettant 4 étages" (cf. art. 25 RPGA). La parcelle n° 2088 se trouve à l'intérieur de ce périmètre, dans sa partie sud la plus proche du Château. Selon l'art. 10 RPGA, la zone de la ville ancienne est destinée à diverses fonctions à savoir l'habitation, les activités de service, les équipements d'intérêt général qui assurent un service direct au profit de la population et d'autres activités compatibles avec la zone.
Selon le PGA, l'immeuble ECA n° 346 fait partie des bâtiments "C", au sens des art. 16 et 32 à 33bis RPGA. Il a reçu la note 4 (correspondant à un "objet bien intégré") au recensement architectural du Canton de Vaud, qui le décrit comme "maison bourgeoise".
L'Inventaire fédéral des sites construits d'importance nationale à protéger en Suisse (ci-après: ISOS) identifie Yverdon-les-Bains comme une ville d'intérêt national.
B. a) Le 26 mars 2014, A._ a soumis à la Municipalité d'Yverdon-les-Bains un pré-projet de transformation de l'immeuble ECA n° 346 prévoyant de réunir les deux corps de bâtiments en un seul bâtiment de quatre étages avec une toiture unique. Le 4 juin 2014, la Municipalité a refusé ce pré-projet, qui avait également été examiné par le Service immeubles, patrimoine et logistique (ci-après: le SIPAL), au motif qu'au vu des recommandations de l'ISOS, il était important de conserver les différences de hauteur caractérisant le faubourg de la Plaine, en contraste avec le château et les anciennes prisons se trouvant à proximité et qui étaient de tailles imposantes.
b) L'intéressé a déposé une demande de permis de construire sur la base de plans du 18 mars 2015 prévoyant cette fois-ci la "surélévation d'un étage et la rénovation d'un immeuble". Le projet prévoyait notamment de conserver l'annexe et de lui ajouter un étage surmonté d'un toit-terrasse. Il était également prévu de surélever légèrement le faîte du toit du bâtiment principal (soit de 70 cm) et d'ajouter des ouvertures dans la toiture. L'enquête publique a eu lieu du 6 juin au 5 juillet 2015.
Par décision du 7 octobre 2015, la municipalité a refusé le permis de construire sur la base des art. 3 RPGA (toiture plate, intégration de l'objet dans le site bâti), 9 RPGA (toiture plate, protection de l'ensemble urbanistique de la ville ancienne), 28 RPGA (altération de la toiture par des moyens d'éclairage), 120 RPGA (places de stationnement deux-roues), 143 RPGA (absence d'espaces de rangement), 27 RLATC (hauteur des locaux) et 28 RLATC (éclairage et ventilation naturels des pièces) et du préavis négatif du SIPAL. La municipalité précisait qu'au vu des difficultés d'intégration, de la typologie des appartements, constitués uniquement d'une pièce et demie, et de l'absence de locaux leur conférant une habitabilité satisfaisante (caves, local vélos), il ne se justifiait pas d'accorder les dérogations demandées.
c) Après des pourparlers avec la municipalité ayant débuté en janvier 2016, lors desquels cette dernière s'est montrée favorable au rehaussement de l'annexe d'un étage avec un toit non habitable (cf. courriers du 10 mai 2016 du service d'urbanisme d'Yverdon-les-Bains au bureau d'architecte B._ et du 26 juillet 2016 de la municipalité à Me Sulliger), A._ a déposé le 30 novembre 2016 une nouvelle demande de permis de construire portant sur la "surélévation d'un étage, rénovation de l'immeuble et pose de panneaux solaires", avec un courrier explicatif du même jour contenant notamment des images de synthèse du projet, et des plans du 23 novembre 2016. Selon ces plans, la partie annexe est surélevée d'un étage percé de trois fenêtres comme celles des étages inférieurs et son toit est également réhaussé; les combles de l'annexe deviennent habitables. Le toit du bâtiment principal est légèrement rehaussé; les combles du bâtiment principal deviennent également habitables. Les deux toitures sont reliées par un unique chéneau entre le pan sud-est du toit de l'annexe et le pan nord-ouest du toit du bâtiment principal. Le pan nord-ouest du toit de l'annexe visible du côté du canal contient une rangée de trois vélux. Quant au toit du bâtiment principal, son pan situé du côté du canal est perçé par deux vélux et celui du côté de la rue de *****, par deux rangées de deux vélux. L'agencement intérieur de l'immeuble est passablement modifié, puisque la cage d'escalier située au centre du bâtiment est agrandie, distribuant désormais le bâtiment central et sa partie annexe, l'escalier qui desservait uniquement l'annexe est supprimé et les salles d'eau des appartements sont regroupées dans la partie centrale du bâtiment.
A la demande de la municipalité, l'intéressé a complété sa demande de permis de construire le 15 mars 2017, en déposant notamment une demande d'autorisation adressée à l'Unité du logement du Département de l'intérieur en vertu de la loi du 4 mars 1985 concernant la démolition, la transformation et la rénovation de maisons d'habitation ainsi que l'utilisation de logements à d'autres fins que l'habitation (soit depuis le 1er janvier 2018, la loi du 10 mai 2016 sur la préservation et la promotion du parc locatif [LPPPL; BLV 840.15]). L'intéressé a indiqué que l'état locatif de son immeuble serait le suivant, avant et après travaux:
Etat locatif avant travaux:
Niveau Objet Surface Rez-de-chaussée Magasin avec bâtiment côté canal env. 100 m2 1er étage Bureau/dépôt env. 35 + 15 m2 2ème étage Studio + chambre env. 35 + 15 m2 3ème étage Appartement de 2 pièces env. 55 m2 Combles
Etat locatif après travaux:
Niveau Objet Surface Rez-de-chaussée Commerce (côté rue) Habitation 1,5 p.(côté canal) 30,3 m2 30,7 m2 1er étage Habitation 1,5 p.(côté rue) Habitation 1,5 p.(côté canal) 38,3 m2 38,5 m2 2ème étage Habitation 1,5 p.(côté rue) Habitation 1,5 p.(côté canal) 38,3 m2 38,5 m2 3ème étage Habitation traversante 2,5 p. 77,6 m2 Combles Habitation traversante 2,5 p. 54,6 m2
L'enquête publique a eu lieu du 8 avril au 7 mai 2017. Elle n'a pas suscité d'oppositions.
Dans une décision du 19 juillet 2017, la Municipalité d'Yverdon-les-Bains a refusé la délivrance du permis de construire. Elle a retenu que le projet comportait les dérogations suivantes: art. 3 RPGA (qualité prioritaire), art. 4 RPGA (structure urbanistique et formation globale du site), art. 9 RPGA (protection générale de la ville ancienne), art. 28 al. 4 RPGA (altération de la toiture par des moyens d'éclairage), art. 113 RPGA (places de stationnement), art. 120 RPGA (places de stationnement deux-roues), art. 143 RPGA (espace de rangement). Elle a précisé ce qui suit:
Sans s'opposer à une rénovation et une densification de l'immeuble, c'est le projet faisant l'objet de la présente enquête publique qui n'a pas convaincu la municipalité.
Plusieurs problèmes conséquents ont été relevés dans l'analyse du dossier; ils ont conduit à l'inscription de multiples dérogations dont vous avez été informés dans notre courrier du 16.01.2017. Le programme semble trop dense, passant de 3 à 7 logements, et la typologie des appartements constitués majoritairement de 1.5-2.5 pièces en comblant chaque surface disponible par du rangement péjore le confort des habitations. En effet, plus aucune surface n'est disponible pour des espaces de rangement ou de stationnement deux-roues, tels que prescrits aux art. 120 et 143 du RPGA. Au niveau architectural, la surélévation de la partie nord-ouest portera atteinte à la lisibilité du front côté canal. Les ouvertures en toiture sont pratiquées en surnombre et de manière inadéquate; c'est donc sur la base des art. 3, 4, 9 et 28.4 RPGA ainsi que du préavis négatif du SIPAL dans la synthèse CAMAC que la municipalité a conclu au refus du permis de construire sollicité.
La municipalité vous invite à déposer un projet de rénovation qui tiendra compte des remarques énoncées ci-dessus.
Le préavis négatif du SIPAL inclus dans la synthèse CAMAC du 10 juillet 2017 est libellé en ces termes:
Mesure de protection légale du bâtiment:
Le bâtiment ECA 346 se situe aux abords du bâtiment ECA 1, 307 (façades et toiture) et 308 (façades et toiture), classés monuments historiques au sens des art. 52 ss de la Loi sur la protection de la nature, des monuments et des sites (LPNMS) et des bâtiments ECA 307 (parties non classées), 308 (parties non classées) et 344, inscrits à l'inventaire cantonal des monuments historiques non classés au sens des art. 49 ss LPNMS. Selon l'art. 46 al. 2 LPNMS, les abords de ces objets sont également protégés.
Qualité de l'objet et du site:
Recensement architectural:
Lors du recensement architectural de la commune d'Yverdon-les-Bains, en 1992, le bâtiment ECA 346 a reçu la note 4 qui désigne un "objet bien intégré". Le bâtiment est bien intégré par son volume, sa composition et souvent encore sa fonction. Les objets de cette catégorie forment en général la majorité des bâtiments d'une localité. Ils sont donc déterminants pour l'image d'une localité et constitutifs du site. A ce titre, leur identité mérite d'être sauvegardée.
Le site de la vieille ville d'Yverdon et ses faubourg est ont reçu la note *1* lors du recensement. D'importance nationale, l'ensemble mérite d'être conservé. Des transformations peuvent être envisagées à condition qu'elles n'altèrent pas ses qualités spécifiques.
Inventaire des sites construits à protéger en Suisse (ISOS):
L'ISOS identifie Yverdon-les-Bains comme une ville d'intérêt national. Au sens de l'ISOS, le bâtiment susmentionné fait partie du périmètre 2: "Faubourg de la Plaine, att. dès 14e s., espace urbain s'élargissant toujours plus en direction du château, deux ruelles perpendiculaires, habitations sur commerces en ordre contigu; peu de bâtiments neufs, contrairement à la vieille ville" caractérisé par l'existence d'une substance et d'une structure d'origine et pour lequel un objectif de protection maximum a été émis (A). Au vu de sa valeur de site, de ses qualités spatiales et historico-architecturales, l'ISOS recommande la sauvegarde de la substance de ce périmètre.
Examen du projet:
Surélévation et rénovation de l'immeuble:

origin_considerations:
Considérant la partie sud-est sur la rue de ******, la Section relève la surélévation du toit augmentant ainsi l'espace au-dessus des fenêtres du deuxième étage, la mise en place d'une nouvelle charpente et la démolition de la lucarne existante.
Le maintien des niveaux actuels serait préférable à l'harmonie de la façade et à sa dialectique avec les façades adjacentes. De même, l'implantation d'une seconde lucarne satisferait à priori les besoins d'éclairage. L'appréciation est délicate attendu que les cotations sont incomplètes et que les dimensions des lucarnes ne sont pas mentionnées expressément sur les plans.
Les châssis rampants sont de façon générale en surnombre, sans compter l'impact de l'ouverture nécessaire en toiture pour la PAC.
Concernant la surélévation de la partie nord-ouest sur le canal, l'augmentation du volume de cette maison porte atteinte à sa bonne intégration. Cette zone du canal jouit d'une excellente situation en termes de visibilité et de fréquentation. Les bâtiments existant permettent actuellement une lecture claire de l'évolution du bâtiment ECA 346 et bien que l'adjonction est déjà peu intégrée, sa surélévation renforcerait cet état sur le plan patrimonial et urbanistique.
Conclusion:
Le SIPAL-MS constate que la réalisation de ce projet porterait atteinte aux abords du bâtiment protégé et au site protégé. Il préavise négativement à sa réalisation et à la délivrance des autorisations requises. La protection de ce patrimoine local relève cependant de la compétence et de la responsabilité de l'autorité communale".
Il ressort encore de la synthèse CAMAC que le Service des communes et du logement a délivré son autorisation spéciale, de rénover et transformer l'immeuble ECA n° 346. Après avoir relevé que la ville d'Yverdon-les-Bains figurait dans la liste des communes où sévit la pénurie de logements (précisant que cette pénurie était particulièrement aiguë tant dans le District du Nord Vaudois que dans la ville d'Yverdon-les-Bains, correspondant respectivement à 0.73% et 0.4% de logements vacants), de sorte que la rénovation et la transformation de maison d'habitation était soumise à autorisation, ce service a en effet considéré que la restructuration des appartements en cause permettaient une amélioration profitable de l'habitabilité et du confort des appartements et la mise aux normes indispensable de leurs installations, ainsi qu'une augmentation de la substance de logement, qui passerait de 90 m2 à 317 m2. Ledit service a considéré que le projet revêtait également un carctère d'intérêt général sous l'angle quantitatif, d'autant plus que les logements créés étaient destinés au marché de la location.
C. Par acte du 13 septembre 2017, A._, par son avocat, a recouru contre la décision du 19 juillet 2017, concluant à sa réforme dans le sens de l'octroi du permis de construire et produisant un lot de pièces. Il rappelle que l'art. 25 RPGA permet, pour les secteurs mentionnés sur le plan par un liseré orange, la construction d'immeubles de 4 niveaux sous la corniche. Il explique que la typologie des appartements prévue, soit uniquement des 1,5 et 2,5 pièces, est directement liée à la topographie de la parcelle; celle-ci est en effet tout en longueur (env. 19 m de long sur 5 m de large pour le bâtiment principal et 7 m de large pour le bâtiment annexe), ce qui implique une zone d'ombre centrale difficilement exploitable par d'autres éléments que la cage d'escalier et les sanitaires. Il fait valoir que que l'art. 143 RPGA (espaces de rangement) est respecté s'agissant des trois appartements nouvellement créés, les autres appartements bénéficiant selon lui de droits acquis. En outre, il explique qu'un espace de rangement pour les vélos a été aménagé sous la nouvelle cage d'escalier, malgré les contraintes techniques (le bâtiment ancien ne possédant pas de cave et une excavation semblant très difficilement réalisable), tout en admettant que leur nombre n'est pas conforme aux normes VSS. Il rappelle que le Service du logement a émis un préavis favorable au projet, considérant qu'il revêtait un caractère d'intérêt général. Concernant l'intégration du projet, le recourant est d'avis qu'une surélévation des bâtiments des parcelles 2088 et 2089 améliorerait la symétrie des bâtiments de part et d'autre du Canal Oriental, valorisant le pont reliant la vieille ville à son faubourg (pont de la Plaine). Du fait que le RPGA permet les constructions de 4 étages dans le périmètre en question, il estime que l'objectif visé est de permettre sa densification ainsi que l'obtention d'une symétrie de part et d'autre du Canal Oriental, sachant que la berge opposée est composée uniquement de bâtiments de 4 étages (à savoir la Maison d'Ailleurs ainsi qu'un bloc de bâtiments allant de la place des Droits de l'Homme à la rue Haldimand). Il est également d'avis que la surélévation de l'annexe et le déplacement du faîte de son toit en retrait du canal permettrait d'avoir une meilleure lecture de l'ensemble.
Dans sa réponse du 22 novembre 2017, la municipalité conclut au rejet du recours. Elle reproche au projet de prévoir deux étages habitables supplémentaires, dont un dans les combles, contrairement à la position exprimée dans le courriel du 17 février 2016 du service communal compétent, selon laquelle seul un étage habitable supplémentaire serait éventuellement envisageable; elle rappelle que le but de la mesure est d'éviter des ombres portées trop importantes sur le bâtiment voisin ECA 344 qui est inventorié au recensement architectural avec la note 2. Pour le surplus, elle se réfère au préavis négatif du SIPAL en particulier à l'opinion selon laquelle l'augmentation du volume de la partie annexe du bâtiment porterait atteinte à sa bonne intégration dans le site et à la situation des bâtiments protégés sis à proximité, ajoutant qu'elle ne peut accepter la rupture de l'harmonie de hauteur du front bâti du côté du Canal Oriental qu'induirait à son avis le projet litigieux. Elle rappelle que l'art. 3 ch. 1 RPGA lui impose de faire primer les dispositions qualitatives du règlement, comme celles qui ont trait à l'esthétique et à l'intégration, sur ses dispositions quantitatives. Elle déplore que le projet du recourant fasse disparaître la façade actuelle du bâtiment principal du côté du canal, ce qui causerait une rupture indésirable avec l'aspect et l'organisation actuels de ce bâtiment. D'un point de vue esthétique, la municipalité critique l'asymétrie "saugrenue" de la nouvelle toiture de l'annexe et sa transition avec le toit du bâtiment principal. Elle estime encore que le "criblage de la toiture par des ouvertures est totalement déplacé" dans le contexte historique du site et qu'il viole l'art. 28 ch. 4 RPGA (applicable par renvoi de l'art. 33bis RPGA), lequel exige que les moyens d'éclairage ne défigurent pas le toit des bâtiments C. Elle critique encore la nouvelle distribution des logements qui, selon elle, surexploite le potentiel habitable sans prévoir suffisamment d'espaces de rangement, puisque dans 4 des appartements projetés, la surface des espaces de rangement est inférieure à celle prévue par l'art. 143 RPGA (soit 6 m2 par logement). Dans sa réponse, la municipalité reproche encore au recourant de n'avoir prévu aucune place de stationnement et pas suffisamment de place de stationnement pour deux-roues, en violation de l'art. 120 RPGA. Elle refuse l'octroi de dérogations sur ces points au sens de l'art. 149 RPGA.
Dans une écriture du 13 décembre 2017, le SIPAL répète que considérant l'importance du site, la volumétrie actuelle du bâtiment devrait être conservée, afin de ne pas porter atteinte au site et à la bonne intégration des bâtiments alentours, plusieurs étant reconnus d'importance nationale. Il estime qu'il convient de maintenir des bâtiments de hauteur variable, car le tissu urbain d'origine est celui d'une ville médiévale. La préservation des toitures permettrait en outre de conserver la lecture des étapes de construction de la parcelle et du tissu urbain jouxtant le canal. Le SIPAL est encore d'avis que les modifications prévues rompent fortement les lignes de fuite et les perspective sur le canal et les bâtiments protégés au Nord-Est. Il estime que la surélévation crée un nouveau front de rue en bordure du canal aujourd'hui inexistant, qui est non souhaitable car cela augmenterait l'exiguïté du canal et dévaloriserait les bâtiments existants. Enfin la diminution de la largeur du canal serait contraire au concept urbanistique initial qui, comme le mentionne l'ISOS, viserait à élargir toujours plus l'espace urbain en direction du canal.
Avec sa réplique du 10 avril 2018, le recourant produit un nouveau lot de pièces. Il expose que la partie annexe de son immeuble a été modifiée au fil du temps en fonction des besoins des propriétaires, sans trouver de forme définitive, en raison de la forme de la parcelle, étroites et en longueur, ce qui la rend difficilement aménageable. On ne saurait donc selon lui évoquer, comme le fait le SIPAL, la préservation de la forme actuelle de la toiture afin de conserver la lecture des étapes de construction. Il défend encore le projet en expliquant que la surélévation de l'annexe permettrait une meilleure exploitation de la parcelle et de l'immeuble, dès lors qu'elle permettrait d'éviter une vue borgne sur la toiture de l'annexe depuis le bâtiment principal ainsi qu'une division des appartements de part et d'autre de l'ensemble bâti avec les zones de circulation et d'eau en son centre. Il rappelle encore que dans le périmètre orange, au bord du canal, ont été construits deux bâtiments modernes et imposants de quatre étages sous corniche, ce qui a impliqué le remaniement de la rue de ****** et la création d'une place. Ces bâtiments se trouvent à proximité de bâtiments classés 2 à l'inventaire, mais la commune n'a pas montré les mêmes réticences à leur construction que s'agissant de son immeuble. Le recourant est encore d'avis que la surélévation projetée ne porterait pas atteinte aux bâtiments historiques sis à proximité mentionnés par le SIPAL, à savoir le bâtiment ECA 1 (château), ECA 307 (restaurant du château), ECA 308 (Maison d'Ailleurs), tous trois classés comme monuments historiques, et ECA 344 (abritant la fondation Entre-Lacs, noté 2 et à l'inventaire), mais aurait plutôt tendance à améliorer l'équilibre et la symétrie des constructions de part et d'autre du canal notamment. En ce qui concerne l'ISOS, le recourant est d'avis que l'annexe ne fait pas partie du faubourg de la Plaine comme le soutient le SIPAL, mais du périmètre environnant VI de l'ISOS protégeant le Canal Oriental. Il estime que l'ISOS cherche ainsi à péserver essentiellement l'échappée sur le canal, dont "l'esprit" est celui d'une perspective longiligne et symétrique, qui serait appuyée par les constructions qui l'entourent. Ainsi, il est d'avis que vue depuis le pont de la Plaine, la surélévation et sa toiture valorise le canal en épousant parfaitement la ligne de fuite offerte par ce dernier. S'agissant des espaces de rangement, le recourant fait valoir que si l'on raisonne en termes de moyenne, il y a plus de 6 m2 de surface de rangement pour l'ensemble des appartements. Quoi qu'il en soit, il demande qu'une dérogation au sens de l'art. 149 RPGA lui soit accordée sur ce point. Le recourant répond encore aux critiques de la municipalité relatives à l'asymétrie de la toiture et aux ouvertures dans le toit.
Par courrier du 9 avril 2018 accompagnant la réplique, le conseil du recourant requiert que soit consultée la Commission cantonale consultative d'urbanisme et d'architecture.
Dans son écriture du 1er mai 2018, le SIPAL estime que la parcelle du recourant fait partie du périmètre 2 au sens de l'ISOS et non du périmètre environnant VI comme le soutient le recourant.
Par courrier du 3 mai 2018, la municipalité maintient la position exprimée dans sa réponse.
Une inspection locale a eu lieu le 19 décembre 2018. On extrait ce qui suit du procès-verbal:
La représentante du SIPAL explique que le projet remet en cause la distinction actuelle entre le bâtiment principal et l'annexe, faisant de cette dernière une partie intégrante de l'immeuble. En effet, le mur mitoyen qui sépare actuellement les deux est détruit. Il en résulte que la volumétrie de l'ensemble est augmentée. Elle précise que ce qui l'intéresse, c'est l'apparence de la façade, la toiture et la volumétrie du bâtiment. Elle explique que le SIPAL ne s'opposerait pas à une modification du bâtiment principal, mais que le projet va trop loin s'agissant de la modification de l'annexe. Elle rappelle que le tissu urbain d'origine est celui d'une ville médiévale, sans lignes continues et qu'il serait judicieux de maintenir des inégalités dans la hauteur des faîtes de toit, s'agissant du bâtiment principal.
Me Sulliger est d'avis que la note 4 au recensement architectural concerne le bâtiment principal et non l'annexe. La représentante du SIPAL estime quant à elle que la note 4 vaut pour l'ensemble. Elle relève en outre que l'annexe a été construite dans les années 20, puis modifiée dans les années 80.
Me Sulliger souligne que la manière de traiter la toiture de l'annexe dans le projet crée une ligne de fuite puisque le faîte du toit est parallèle au canal.
S'agissant du bâtiment se trouvant sur la parcelle 2089 (ECA 347), soit l'immeuble jouxtant celui du recourant au Sud, la municipalité indique qu'une demande de permis de construire a été déposée pour sa rénovation, mais qu'aucun réhaussement n'est prévu.
Sur question du président, la municipalité précise qu'en l'occurrence, elle trouve dommageable de créer de petits appartements exploitant les possibilités de construction au maximum, car cela engendre le non-respect des espaces de rangements minimum exigés par le RPGA. A cet égard, Me Sulliger invoque l'art. 80 al. 2 LATC et fait valoir que le respect des espaces de rangement concerne les logements neufs, ce qui n'est pas le cas en l'occurrence. Sur question du juge demandant s'il existe une pratique à cet égard, la municipalité précise que dès lors que des transformations sont prévues pour un immeuble, elle exige le respect des 6m2 d'espaces de rangement minimum par logement prévus par l'art. 143 RPGA. Elle précise encore que cet espace peut se trouver dans les caves ou les galetas.
En ce qui concerne les places de stationnement pour deux-roues, la municipalité expose qu'elle applique les normes VSS, comme le prévoit l'art. 120 RPGA. Me Bernel fait valoir qu'on peut exiger en l'espèce le respect des exigences réglementaires en vigueur, dès lors qu'il n'est pas question seulement de transformations, étant donné qu'une redistribution complète des volumes est prévue, de même que la disparition du mur séparant le bâtiment principal de l'annexe. On peut ainsi quasiment parler de reconstruction. Me Sulliger indique que le bâtiment n'est pas habitable en l'état.
Sur question du président, la représentante du SIPAL précise que les périmètres et les échappées répertoriés par l'ISOS sont délimités par les hauts des talus du Canal Oriental, ce qui ressort plus clairement des descriptions que du plan de l'ISOS qui n'est pas très précis. Le bâtiment litigieux se situe donc bien dans le périmètre 2 de l'ISOS.
L'audience se poursuit à l'extérieur sur le pont traversant le Canal Oriental.
Le recourant rejoint l'audience, accompagné de C._, architecte.
Les participants se placent le dos au Château, pour examiner le Canal oriental en direction du nord depuis le pont qui l'enjambe en reliant la rue de la Plaine à l'est à la place Pestalozzi à l'ouest.
Vu en direction du nord, le canal, rectiligne, coule dans un étroit chenal entouré sur ses deux côtés d'aménagements en maçonnerie: de part et d'autre du chenal, les berges sont en pente et surmontée d'un cheminement piétonnier qui court au pied des façades des immeubles riverains, tous implantés le long du cheminement piétonnier. Une parcelle [recte: une passerelle] en fer franchit le canal à quelque distance tandis qu'un autre pont est visible au loin.
Du côté Ouest du canal, les immeubles riverains (dont la Maison d'Ailleurs au premier plan) comportent tous, sur un soubassement borgne au niveau du cheminement piétonnier déjà décrit, trois niveaux ajourés sous un toit à pans. Tous sont contigus et leurs percements, leur corniche et leur faîte sont alignés. Au nord de la Maison d'ailleurs toutefois, le soubassement borgne soutient un espace non construit (place des Droits de l'homme) qui interrompt la rangée d'immeubles riverains.
Du côté Est du canal, l'immeuble au premier plan présente la même configuration (soubassement borgne sur la canal, trois niveaux ajourés, toit à pans) tandis que les suivants en direction du nord, tous dotés d'un soubassement aligné le long du cheminement piétonnier, se présentent de manière disparate.
Le deuxième immeuble comporte un unique premier étage ajouré sous un toit aménagé comme terrasse. Le recourant fait observer que ce premier étage est doté de vastes fenêtres panoramiques récemment aménagées (elles ne figurent pas sur les photographies présentes dans le dossier).
Le troisième immeuble est la construction litigieuse dont la façade gouttereau comporte, sur son soubassement borgne aligné sur le canal, deux niveaux percés de trois fenêtres avec encadrement de couleur ocre. Par-dessus la toiture à deux pans de cette construction est visible une rangée de fenêtre de la partie principale du bâtiment du recourant, couverte également d'une toiture à deux pans parallèle à la première décrite et surmontée au nord par la haute façade du bâtiment voisin.
Le bâtiment voisin, quatrième de la rangée, présente face au canal l'importante façade arrière de la maison bourgeoise de la rue de ******** (ECA n° 344). Sous une toiture à plusieurs pans, cette façade avec pignon secondaire en léger ressaut comporte cinq niveaux. Elle est implantée en retrait du canal tandis que le soubassement borgne de la construction, aligné sur le canal, soutient une cour occupée par les jeux de plein air colorés d'une garderie d'enfant.
Depuis le pont qui offre une vision sur le canal en direction du nord, le recourant souligne qu'à son avis ce qui importe, c'est qu'il y ait une ligne de fuite et que les constructions aux abords du canal ne viennent pas l'entraver. A cet égard, il estime que la surélévation projetée améliorerait la symétrie des constructions de part et d'autre du Canal Oriental, puisque les immeubles situés à l'Ouest de celui-ci sont imposants et comportent le même nombre de niveaux. Me Bernel rappelle quant à lui que la surélévation de l'annexe du bâtiment litigieux aurait pour conséquence la suppression des fenêtres de la façade du bâtiment historique du côté du canal.
Le recourant rappelle que son premier projet, qui prévoyait une annexe surmontée d'un toit-terrasse, a été refusé.
La Cour se déplace le long de la rue du Casino pour se rendre sur la place des Droits de l'Homme.
Cette place offre une vue perpendiculaire sur la rive Est du Canal Oriental et les immeubles qui le bordent à l'Est.
Le soubassement du cinquième bâtiment comporte trois baies partiellement obturées et une porte donnant sur le cheminement piétonnier. Le premier étage est aligné sur le canal et couvert d'un toit plat servant de terrasse tandis qu'à l'arrière, les deux étages suivants, en retrait, sont couverts d'une toiture dont la croupe fait face au canal.
De part et d'autre de la passerelle en fer, deux bâtiments d'habitation de trois niveaux (dont un mansardé sur l'un d'eux) donnent, par des fenêtres et des portes, de plein pied sur le cheminement piétonnier bordant le canal. Entre eux, dans le prolongement de la parcelle, on aperçoit la rue suivante [ruelle Dosson] sur laquelle donne leur côté opposé.
Enfin, les deux bâtiments suivants le long du canal sont d'importantes constructions modernes qui s'allongent le long du canal et présentent un soubassement noir surmonté de quatre niveaux d'habitation, les trois premiers en blanc et dotés de balcons avec barrières en verre, le quatrième étant aménagé dans la toiture de couleur noire.
Le recourant relève que son projet permettrait d'avoir des bâtiments de hauteurs similaires de part et d'autre de l'immeuble ECA 344 (avec une note 2 au recensement architectural). Me Bernel relève quant à lui que le toit asymétrique de l'annexe prévu, raccordé au toit du bâtiment principal, constitue une architecture peu traditionnelle.
Le recourant expose qu'à son sens, ce qui est protégé par l'ISOS, c'est essentiellement la vision sur le canal, avec ses lignes de fuite. Selon lui, le pont situé au niveau de la rue de la Plaine offre une meilleure lecture du front du canal. Il est d'avis que c'est l'échappée sur l'environnement qui est protégée et ce qui compte c'est l'existence d'une symétrie de part et d'autre du canal. Pour lui, il fait sens d'aligner les habitations le long de ce dernier - qui a d'ailleurs été construit postérieurement à plusieurs habitations qui le longent - comme cela se fait dans d'autres villes. Il estime que cela n'est pas le faubourg de la Plaine qui est protégé, mais bien le Canal Oriental. Le SIPAL ne partage pas cette opinion et relève qu'à la lecture du descriptif du périmètre 2 de l'ISOS, les bâtiments sont également protégés. En particulier, le front bâti le long du canal ne devrait pas être modifié, car l'ISOS recommande le maintien de la substance de ce périmètre.
Le recourant souligne que son but est de construire des logements de qualité dans son immeuble, malgré une parcelle en longueur difficilement exploitable. Il a de plus veillé à une construction de qualité d'un point de vue énergétique, en prévoyant notamment la pose de panneaux solaires. S'agissant du problème de l'ombre portée sur le bâtiment ECA 344, il relève que celle-ci provient surtout du château et que la surélévation de l'annexe de son immeuble n'y changerait pas grand-chose. Il relève encore qu'actuellement son immeuble est inoccupé.
Sur question, le recourant explique que son projet respecte l'exigence de 6m2 de rangement par appartement d'un point de vue global. A la remarque de la municipalité qui précise que selon le RPGA, c'est chaque appartement qui doit disposer d'une surface de rangement de 6 m2 au minimum, le recourant répond que cela est réalisable. Il informe la Cour qu'il lui fera parvenir un plan des espaces de rangement avec leurs dimensions.
En ce qui concerne les places de stationnement pour deux-roues, le recourant expose avoir fait de son mieux pour en prévoir vu l'espace à disposition, mais que les exigences posées par les normes VSS n'ont pas pu être atteintes.
Par écriture du 19 décembre 2018, le recourant fait valoir que les trois appartements nouvellement créés, à savoir selon lui les deux appartements de 2,5 pièces dans les combles et au 3ème étage ainsi que l'appartement de 1,5 pièces au 2ème étage du côté du canal, possèdent tous plus de 6 m2 de surface de rangement. Il produit en outre un jeu de plans mettant en évidence les espaces de rangements pour chacun des logements de l'immeuble, que l'on peut résumer comme suit:
Appartement Surface totale de rangement pour l'appartement Emplacement(s) des rangements 1.5 pièces rez-de-chaussée (RDC) 6.3 m2 Sous-sol (local de rangement) 1.5 pièces R+1 côté canal 4.94 m2 - Espaces non éclairés à l'intérieur du logement A: 1.44 m2 B: 1.8 m2 - Réduit au RDC : 1.7 m2 1.5 pièces R+1 côté rue 2.12 m2 - Espaces non éclairés à l'intérieur du logement : A: 0.36 m2 B: 0.72 m2 C: 0.36 m2 D: 0.32 m2 E: 0.36 m2 1.5 pièces R+2 côté canal (nouveau selon rec.) 4.54 m2 - Espaces non éclairés à l'intérieur du logement A: 1.44 m2 B: 1.4 m2 - Réduit au RDC : 1.7 m2 1.5 pièces R+2 côté rue 1.1 m2 - Espace non éclairé à l'intérieur du logement 2.5 pièces R+3 (nouveau selon rec.) 8.72 m2 - Espaces non éclairés à l'intérieur du logement : A: 6 m2 B: 2 m2 C: 0.72 m2 2.5 pièces combles (nouveau selon rec.) 6.62 m2 - Espaces non éclairés à l'intérieur du logement : A: 1.6 m2 B: 3 m2 C: 0.72 m2 D: 1.3 m2
Dans ses déterminations du 17 janvier 2019, la municipalité fait valoir que contrairement à ce que soutient le recourant, dès lors que l'on se trouve en présence d'une réorganisation complète de l'immeuble, les dispositions du RPGA, en particulier celles relatives aux espaces de rangement, s'appliquent à tous les nouveaux volumes. Elle conteste également que les armoires murales puissent être considérées comme des espaces de rangement au sens de l'art. 143 RPGA.
Dans son écriture du 15 février 2019, le recourant confirme sa position.
D. La Cour a statué par voie de circulation.
Considérant en droit:
1. Le recours a été déposé en temps utile (cf. art. 95 de la loi vaudoise du 28 octobre 2008 sur la procédure administrative [LPA-VD; BLV 173.36]) devant l'autorité compétente (art. 92 al. 1 LPA-VD). Il respecte au surplus les conditions formelles de recevabilité (art. 79 al. 1 LPA-VD notamment), de sorte qu'il y a lieu d'entrer en matière au fond.
2. Le litige porte sur le point de savoir si c'est à juste titre que la municipalité a refusé la délivrance du permis de construire au recourant, la demande portant sur la surélévation du bâtiment ECA 346, en particulier de sa partie annexe située en bordure du Canal Oriental. D'une part, la municipalité s'oppose au projet pour des motifs liés à l'esthétique et à l'intégration, notamment en faisant siennes les conclusions du SIPAL (cf. infra consid. 3 à 5). D'autre part, elle estime que le projet viole les dispositions du RPGA relatives aux espaces de rangement, de stationnement, et de stationnement pour deux-roues (infra consid. 6 et 7).
3. a) A teneur de l’art. 86 de la loi du 4 décembre 1985 sur l'aménagement du territoire et les constructions (LATC; BLV 700.11), la municipalité veille à ce que les constructions, quelle que soit leur destination, ainsi que les aménagements qui leur sont liés, présentent un aspect architectural satisfaisant et s'intègrent à l'environnement (al. 1). Elle refuse le permis pour les constructions ou les démolitions susceptibles de compromettre l'aspect et le caractère d'un site, d'une localité, d'un quartier ou d'une rue, ou de nuire à l'aspect d'un édifice de valeur historique, artistique ou culturelle (al. 2). Les règlements communaux doivent contenir des dispositions en vue d'éviter l'enlaidissement des localités et de leurs abords (al. 3).
Ainsi, en droit vaudois, un projet de construction peut être interdit sur la base de l'art. 86 LATC quand bien même il satisferait à toutes les autres dispositions cantonales et communales en matière de police des constructions. Selon la jurisprudence, l'application d'une clause d'esthétique ne doit cependant pas aboutir à ce que, de façon générale, la réglementation sur les zones en vigueur soit vidée de sa substance. Une intervention des autorités dans le cas de la construction d'un immeuble réglementaire qui ne serait pas en harmonie avec les bâtiments existants, ne peut s'inscrire que dans la ligne tracée par la loi elle-même et par les règlements communaux, qui définissent en premier lieu l'orientation que doit suivre le développement des localités. Ainsi, lorsqu'un plan de zones prévoit que des constructions d'un certain volume peuvent être édifiées dans tel secteur du territoire, une interdiction de construire fondée sur l'art. 86 LATC ne peut se justifier que par un intérêt public prépondérant (cf. TF 1C_452/2016 du 7 juin 2017 consid. 3.1.3 TF 1C_493/2016 du 30 mai 2017 consid. 2.3), comme par exemple en présence de bâtiments ou d'ensembles protégés en tant que monuments (ATF 101 IA 213 consid. 6c; TF 1C_358/2017 du 5 septembre 2018 consid. 4.4; 1C_8/2017 du 12 juillet 2017 consid. 2.1.2; 1C_340/2015 du 16 mars 2016 consid. 6.1.1 et les arrêts cités).
L'intégration d'une construction ou d'une installation à l'environnement bâti doit être examinée sur la base de critères objectifs et systématiques, tels que les dimensions, l'effet urbanistique et le traitement architectural du projet, sans sacrifier à un goût ou à un sens esthétique particulièrement aigu, de manière que le poids de la subjectivité, inévitable dans toute appréciation, n'influe que dans les limites de principes éprouvés et par référence à des notions communément admises (cf. CDAP AC.2015.0182 du 26 avril 2016 consid. 6b; AC.2013.0478 du 3 septembre 2014 consid. 1a/cc). En tous les cas, l'autorité compétente doit indiquer les raisons pour lesquelles elle considère qu'une construction ou une installation serait de nature à enlaidir le site (ATF 115 Ia 363 consid. 3b; 114 Ia 343 consid. 4b; TF 1C_465/2010 du 31 mai 2011).
Dans un arrêt récent (TF 1C_358/2017 du 5 septembre 2018 consid. 4.4, publié aux ATF 145 I 52), le Tribunal fédéral a rappelé que l'exploitation maximale des possibilités de construire correspond à un intérêt public, car la politique suisse de l'aménagement du territoire vise à orienter le développement de l'urbanisation vers l'intérieur du milieu bâti par une utilisation mesurée du sol et à créer un milieu bâti compact (cf. art. 1 al. 2 let. abis et b de la loi fédérale du 22 juin 1979 sur l'aménagement du territoire et des constructions [LAT; RS 700]; ATF 142 II 100 consid. 4.6; TF 1C_233/2016 du 20 janvier 2017 consid. 5.3).
Selon l'art. 50 al. 1 de la Constitution fédérale du 18 avril 1999 (Cst; RS 101), l'autonomie communale est garantie dans les limites fixées par le droit cantonal. Une commune bénéficie de la protection de son autonomie dans les domaines que le droit cantonal ne règle pas de façon exhaustive, mais qu'il laisse en tout ou partie dans la sphère communale, conférant par là aux autorités municipales une liberté de décision relativement importante (ATF 139 I 169 consid. 6.1 p. 172-173; 138 I 242 consid. 5.2 p. 244; 138 I 131 consid. 7.1 p. 142). En droit cantonal vaudois, les communes jouissent d'une autonomie maintes fois reconnue lorsqu'elles définissent, par des plans, l'affectation de leur territoire et lorsqu'elles appliquent le droit des constructions (art. 139 al. 1 let. d Cst./VD et 2 al. 2 LATC; cf. notamment ATF 115 Ia 114 consid. 3d; TF 1C_499/2017 du 19 avril 2018 consid. 3.1.1; 1C_424/2014 du 26 mai 2015 consid. 4.1.1; 1C_365/2010 du 18 janvier 2011 consid. 2).
Il s'ensuit que, lorsqu'une autorité communale interprète son règlement en matière de police des constructions et apprécie les circonstances locales, dans le cadre de l'octroi d'une autorisation de construire, elle bénéficie d'une liberté d'appréciation particulière, que l'autorité de recours contrôle avec retenue (cf. art. 3 al. 2 LAT; arrêt 1C_92/2015 du 18 novembre 2015 consid. 3.2.2). Dans la mesure où la décision communale repose sur une appréciation soutenable des circonstances pertinentes et que celle-ci est dûment motivée (cf. arrêt 1C_53/2013 du 7 mai 2013 consid. 5.4), la juridiction de recours doit la respecter. En dépit de son pouvoir d'examen complet, elle ne peut intervenir et, le cas échéant, substituer sa propre appréciation à celle des autorités communales que si celle-ci n'est objectivement pas soutenable ou contrevient au droit supérieur (TF 1C_499/2017 du 19 avril 2018 consid. 3.1.12 arrêts 1C_150/2014 du 6 janvier 2015 consid. 2.2; 1C_629/2013 du 5 mai 2014 consid. 7.1. Pour autant, la jurisprudence fédérale a récemment précisé que le pouvoir d'examen restreint de l'autorité de recours lors du contrôle de l'appréciation de l'esthétique par les autorités locales ne doit pas se limiter à un contrôle de l'arbitraire car une telle restriction serait incompatible avec la garantie de l'accès au juge (art. 29a Cst) et avec le libre pouvoir d'examen de l'autorité de recours exigé par l'art. 33 al. 3 let. b LAT (TF 1C_358/2017 précité consid. 3.6). L'autorité de recours doit annuler la décision de l'autorité communale lorsque celle-ci a outrepassé son pouvoir d'appréciation garanti par l'autonomie communale: il en va ainsi non seulement lorsque la décision prise est arbitraire (soit lorsqu'elle ne repose sur aucun motif objectif), mais aussi lorsque l'autorité communale a utilisé son pouvoir d'appréciation en s'écartant du sens et du but de la loi, en contrevenant à l'égalité de traitement, au principe de la proportionnalité ou en s'écartant du droit supérieur (cf. ATF 138 I 305 consid. 1.4.3 et 1.4.5; TF 1C_358/2017 précité consid. 3.6 et les références citées). Le principe de la proportionnalité exige que les mesures mises en oeuvre soient propres à atteindre le but visé (règle de l'aptitude) et que celui-ci ne puisse être atteint par une mesure moins contraignante (règle de la nécessité); il doit en outre y avoir un rapport raisonnable entre ce but et les intérêts compromis (principe de la proportionnalité au sens étroit, impliquant une pesée des intérêts) (ATF 140 I 168 consid. 4.2.1; 135 I 233 consid. 3.1). Dans la pesée des intérêts, il faut mettre en balance les intérêts esthétiques locaux d'un côté et, de l'autre, les intérêts privés et les intérêts publics supérieurs à ceux de la commune à la réalisation de la construction prévue (ATF 115 Ia 370; TF 1C_358/2017 précité consid. 3.6). A ce dernier égard, on rappelle qu'il faut en particulier tenir compte de l'intérêt public à la réalisation des buts du droit fédéral de l'aménagement du territoire. C'est pourquoi l'autorité de recours ne viole pas l'autonomie communale lorsqu'elle annule une décision qui ne tient pas ou pas suffisamment compte de ces intérêts publics (TF 1C_358/2017 précité consid. 3.6 et les références).
b) A Yverdon-les-Bains, le RPGA comporte en matière d'esthétique et d'intégration les art. 3 et 4 ainsi libellés:
Art. 3 – La qualité est prioritaire
1. Les dispositions qualitatives du plan général d'affectation priment les dispositions quantitatives.
2. Les dispositions qualitatives ont trait à:
 L'intégration de l'objet construit dans le site naturel ou bâti;
 La recherche d'une architecture de valeur;
 La prise en compte de facteurs favorisant l'urbanité et la sécurité;
 La conservation et la réalisation d'espaces extérieurs significatifs;
 La prise en compte et la maîtrise des nuisances sonores, visuelles et atmosphériques.
3. Les dispositions quantitatives traitent entre autres:
 de la densité par les indices d'utilisation, d'occupation du sol et de masse;
 des distances aux limites;
 des périmètres d'implantation;
 des hauteurs
Art. 4 - Structure urbanistique et formation globale du site
1. Par le plan général d'affectation, les éléments construits et naturels du site ordonnent le territoire de la ville en tant qu'ensemble.
2. Toute intervention prend en considération la structure urbanistique, existante ou devenir.
Il résulte de la jurisprudence du Tribunal cantonal que les art. 3 et 4 RPGA, ont, comme l'art. 86 LATC, la fonction d'assurer l'intégration des constructions dans l'environnement naturel ou bâti mais ils sont formulés de manière différente, en étendant le champ d'application à la conservation des espaces extérieurs et à la maîtrise des nuisances sonores, visuelles et atmosphériques; ils posent également des exigences plus larges en ce qui concerne la recherche d'une architecture de valeur. Ils ont cependant une portée comparable à celle de l'art. 86 LATC en ce sens qu'un projet de construction qui serait conforme à toutes les dispositions constructives de la zone selon l'art. 3 al. 3 RPGA (densité, hauteurs, distances) pourrait être refusé si l'intégration de l'objet construit dans le site naturel ou bâti n'était pas assurée, si l'exigence de la recherche d'une architecture de valeur n'était pas respectée, si les espaces extérieurs significatifs n'étaient pas conservés (art. 3 al. 2 RPGA), ou si le projet ne prenait pas en compte la structure urbanistique existante ou en devenir (art. 4 al. 2 RPGA). La municipalité pourrait aussi sur la base de l'art. 3 al. 1 et 2 et de l'art. 4 RPGA fixer les conditions nécessaires au respect de ces dispositions, même s'il en résultait une réduction des possibilités de construire (cf. CDAP AC.2015.0016 du 9 septembre 2015 consid. 2a/bb; AC.2011.0285 du 9 août 2012 consid. 3b et c; AC.2008.0230 du 18 septembre 2009 consid. 2). Relevant qu'une interdiction de construire, ou une réduction des possibilités de construire, fondée sur les art. 3 et 4 RPGA entraîne une restriction importante du droit de propriété, le Tribunal cantonal a encore souligné dans les arrêts précités qu'une intervention de l'autorité municipale fondée sur ces dispositions implique une utilisation déraisonnable des possibilités de construire, qui dans une situation particulière ou dans le contexte urbanistique donné, irait à l'encontre des buts même de la zone et porterait une grave atteinte au site ou mettrait en péril des éléments bâtis de valeur que la réglementation a précisément pour objectif de sauvegarder (AC.2015.0016 précité consid. 2a/bb). En définitive, l'art. 3 n'implique rien d'autre qu'une pesée d'intérêt entre les objectifs de protection qu'il énumère au ch. 2 et les droits à bâtir que confèrent les dispositions qualifiées de quantitatives au ch. 3 (AC.2016.0043 du 22 mars 2017, consid. 8a).
c) aa) On rappelle qu'Yverdon-les-Bains est inscrite en tant que ville d'intérêt national à l'ISOS, établi sur la base de l'art. 5 de la loi fédérale du 1er juillet 1966 sur la protection de la nature et du paysage (LPN; RS 451). Cette disposition prévoit que le Conseil fédéral établit, après avoir pris l'avis des cantons, des inventaires d'objets d'importance nationale. Dans le secteur où se trouve la parcelle du recourant, se succèdent deux périmètres protégés par l'ISOS, à savoir le périmètre 2 et le périmètre environnant VI. Le premier correspond au "Faubourg de la Plaine" ainsi décrit:
Att. dès 14e s., espace urbain s'élargissant toujours plus en direction du château, deux ruelles perpendiculaires, habitations sur commerces en ordre contigu; peu de bâtiments neufs, contrairement à la vieille ville.
Le périmètre 2 appartient à la catégorie d'inventaire A (ce qui indique l'existence d'une substance d'origine; la plupart des bâtiments et des espaces présentent les caractéristiques propres à une même époque ou à une même région), avec un objectif de sauvegarde A (lequel préconise la sauvegarde de la substance, à savoir la conservation intégrale de toutes les constructions et composantes du site, de tous les espaces libres et la suppression des interventions parasites).
Quant au périmètre environnant VI, il est décrit de la manière suivante:
Canal Oriental, correspondant au canal de la Thielle, bordé en alternance par des talus murés ou verdoyants, espace plus ou moins large accessible au public.
Il appartient à la catégorie d'inventaire a (lequel indique qu'il s'agit d'une partie indispensable du site construit, libre de constructions ou dont les constructions participent à l'état d'origine de l'environnement), avec un objectif de sauvegarde a (qui préconise la sauvegarde de l'état existant en tant qu'espace agricole ou libre; conservation de la végétation et des constructions anciennes essentielles pour l'image du site; suppression des altérations).
L'inscription d'un objet d'importance nationale dans un inventaire fédéral indique que cet objet mérite spécialement d'être conservé intact ou en tout cas d'être ménagé le plus possible, y compris au moyen de mesures de reconstitution ou de remplacement adéquates (art. 6 al. 1 LPN). Lorsqu'il s'agit de l'accomplissement d'une tâche de la Confédération, la règle selon laquelle un objet doit être conservé intact dans les conditions fixées par l'inventaire ne souffre d'exception que si des intérêts équivalents ou supérieurs, d'importance nationale également, s'opposent à cette conservation (art. 6 al. 2 LPN). Cette règle ne s'applique que si une tâche de la Confédération est en cause, comme l'al. 2 l'indique clairement. En cas de tâches cantonales ou communales, la protection des sites construits est assurée par le droit cantonal ou communal pertinent, notamment par le plan directeur et les plans d'affectation communaux. Les cantons et les communes ont ainsi l'obligation de prendre en compte les objectifs de protection poursuivis par l'ISOS lors de l'adoption d'un nouveau plan d'affectation (TF 1C_188/2007 du 1er avril 2009, in DEP 2009 p. 509). Ainsi, les objectifs de l'ISOS ne sont pas directement applicables ni contraignants lorsque, comme en l’espèce, le litige concerne l’octroi d’un permis de construire. Le Tribunal fédéral a toutefois aussi pris en considération l'inventaire ISOS, en tant que manifestation d'un intérêt fédéral, dans la pesée des intérêts de chaque cas d'espèce - y compris lors de l'accomplissement de tâches purement cantonales et communales -, et notamment lors d'un litige sur l'octroi de permis de démolition et de construction, quand bien même l'ISOS n'avait pas encore été transcrit dans les normes correspondantes (cf. TF 1C_308/2017 du 4 juillet 2018 consid. 3.2.2; 1C_226/2016 du 28 juin 2017 consid. 4.3; cf. aussi TF 1C_353/2014 du 10 mars 2015 consid. 5.2). Les inventaires fédéraux interviennent dans les pesées d'intérêts et influencent l'interprétation des principes juridiques indéterminés du droit des constructions (cf. TF 1C_488/2015 précité, consid. 4.3 in fine et les réf. cit., notamment ATF 135 II 209 consid. 2.1 in fine), notamment celles relatives à la clause d’esthétique. L'évaluation de la valeur d'un objet dans le cadre des procédures d'établissement des inventaires fédéraux et cantonaux constitue en effet un élément d'appréciation à disposition de l'autorité communale pour statuer sur l'application de la clause d'esthétique (TF 1C_452/2016 du 7 juin 2017 consid. 3.3; arrêts AC.2015.0089 du 11 novembre 2015 consid. 3a/dd; AC.2014.0166 du 17 mars 2015 consid. 2a/bb).
bb) En l'espèce, il convient de déterminer si le bâtiment du recourant, en particulier sa partie annexe longeant le Canal Oriental fait partie du périmètre 2 de l'ISOS bénéficiant d'un objectif de sauvegarde A, comme le soutiennent la municipalité et le SIPAL ou s'il appartient au périmètre environnant VI, protégeant le Canal Oriental, selon l'avis du recourant. En effet, ainsi que l'a expliqué le SIPAL dans son écriture du 1er mai 2018 notamment, la parcelle du recourant se trouve à un endroit où passent les limites de ces deux périmètres, mais le plan de l'ISOS concernant Yverdon-les-Bains, établi au 1:5'000, est peu précis et ne permet pas à sa seule lecture de trancher cette question.
L'inspection locale à laquelle a procédé le tribunal, dont le résultat est transcrit dans le procès-verbal reproduit plus haut, a permis de constater que pour l'observateur qui se trouve sur le pont traversant le Canal Oriental, le bâtiment litigieux s'inscrit dans la perspective du Canal Oriental. Il partage les caractéristiques des bâtiments qui bordent ce canal (alignement d'habitations aux niveaux ajourés sur un soubassement borgne ou peu percé). Le Boulevard de la Plaine, avec les caractéristiques décrites par l'ISOS (boulevard s'élargissant avec des habitations sur commerce), n'est pas perceptible depuis ce point de vue. Cette conclusion s'impose encore plus depuis le point de vue qu'offre la Place des Droits de l'Homme, qui occupe une partie du soubassement borgne et donne sur les constructions et aménagements alignés de l'autre côté du canal. Que le bâtiment traversant du recourant donne à son autre extrémité sur l'étroite rue de ******** n'y change rien. De toute manière, le projet litigieux laisserait le bâtiment quasiment inchangé de ce côté-là. En définitive, c'est bien en regard du périmètre environnant VI, soit du Canal Oriental, que la situation doit être appréciée.
d) aa) La loi vaudoise sur la protection de la nature et des monuments et des sites du 10 décembre 1969 (LPNMS; BLV 450.11) fait partie des "autres mesures" réservées par l'art. 17 al. 2 de la loi fédérale du 22 juin 1979 sur l'aménagement du territoire (LAT; RS 100). Elle instaure une protection générale de la nature et des sites englobant tous les objets immobiliers, tous les territoires, paysages, sites, localités, immeubles qui méritent d'être sauvegardés en raison de l'intérêt général, notamment esthétique, historique, scientifique ou éducatif qu'ils présentent (art. 4 al. 1 LPNMS), en ce sens qu'aucune atteinte ne peut leur être portée qui en altère le caractère (art. 4 al. 2 LPNMS). La LPNMS instaure aussi une protection générale des monuments historiques et des antiquités, en particulier des monuments de la préhistoire, de l'histoire de l'art et de l'architecture ainsi que les antiquités immobilières trouvées dans le canton et qui présentent un intérêt archéologique, historique, artistique, scientifique ou éducatif (art. 46 al. 1 LPNMS); sont également protégés les terrains contenant ces objets et leurs abords (al. 2); aucune atteinte ne peut leur être portée qui en altère le caractère (al. 3). La LPNMS prévoit par ailleurs deux types de mesures de protection spéciales: l'inventaire des monuments naturels et des sites (art. 12 à 19 LPNMS), respectivement l'inventaire des monuments historiques et des antiquités (art. 49 à 51 LPNMS), et le classement comme site, monument ou antiquité (art. 20 à 28 et 52 à 54 LPNMS).
L'art. 49 al. 1 LPNMS prévoit ainsi qu'un inventaire sera dressé de tous les monuments de la préhistoire, de l'histoire, de l'art et de l'architecture ainsi que des antiquités immobilières situés dans le canton, qui méritent d'être conservés en raison de l'intérêt archéologique, historique, artistique, scientifique ou éducatif qu'ils présentent. L'inventaire comprend en particulier la désignation de l'objet inscrit, le cas échéant de ses abords, de l'intérêt qu'il présente et des dangers qui le menacent (art. 50 al. 1 let. a LPNMS). Il oblige le propriétaire à annoncer les travaux qu'il envisage au département, qui peut soit autoriser les travaux annoncés, soit ouvrir une enquête en vue du classement de l'objet (art. 16 et 17 LPNMS, par renvoi de l'art. 51 LPNMS). Le classement quant à lui définit en particulier l'objet classé, le cas échéant ses abords et l'intérêt qu'il présente (art. 53 al. 1 let. a LPNMS). Il a pour effet qu'aucune atteinte ne peut être portée à l'objet classé sans autorisation préalable du département cantonal compétent (art. 23 et 54 LPNMS). Le fait qu'un bâtiment classé ou mis à l'inventaire se trouve à proximité d'un projet de construction n'implique toutefois aucune exigence particulière au regard de la LPNMS, si, compte tenu du classement ou de l'inventaire, la protection du bâtiment en cause ne s'étend pas au-delà de ce dernier (cf. arrêts AC.2016.0349 consid. 8a; AC.2010.0077 du 18 janvier 2012 consid. 2a; AC.2008.0328 du 27 novembre 2009 consid. 4c et 4d).
Ainsi que cela résulte de la jurisprudence, la protection générale des monuments historiques et des antiquités résultant de l’art. 46 LPNMS consiste dans la possibilité de prendre des mesures conservatoires (art. 47 LPNMS) en faveur d'objets répondant à la définition de l'art. 46 al. 1 LPNMS et que l'on aurait omis de mettre à l'inventaire (art. 49 LPNMS) ou de classer (art. 52 LPNMS). A contrario, un objet qui n'est ni classé ni porté à l'inventaire et pour lequel le département compétent a renoncé à prendre des mesures conservatoires n'est pas protégé par la LPNMS (cf. notamment arrêts AC.2017.0017 du 19 octobre 2017 consid. 6c/bb; AC.2016.0253 du 9 mai 2017 consid. 3d; AC.2016.0055 du 6 décembre 2016 consid. 3b; AC.2015.0153 du 15 septembre 2016 consid. 2c). En bref, les objets qui présentent de l'intérêt au sens de l'art. 46 LPNMS ne rentrent dans la catégorie de ceux qui "méritent d'être conservés" (comme le dit l'art. 49 LPNMS) que s'ils sont mis à l'inventaire prévu par cette dernière disposition (cf. arrêts AC.2017.0017 du 19 octobre 2017 consid. 6c/bb; AC.2016.0253 du 9 mai 2017 consid. 3d). A défaut de réglementation communale assurant une meilleure protection, la décision des autorités relative à un objet bénéficiant uniquement de la protection générale de l'art. 46 LPNMS ne pourra se fonder que sur l'art. 86 LATC (cf. arrêts AC.2017.0017 du 19 octobre 2017 consid. 6c/bb; AC.2016.0253 du 9 mai 2017 consid. 3d). "Les objets placés sous la protection générale demeurent sous la surveillance du département sans aucune contrainte juridique pour le propriétaire" ("Recensement architectural du canton de Vaud", plaquette éditée par la Section des Monuments historiques et archéologie du Service des bâtiments, novembre 1995, rééditée en mai 2002, p. 22; voir http://www.patrimoine.vd.ch/fileadmin/groups/60/pdf/MS_Brochure_Recensement_mai2002.pdf).
Le recensement architectural n'est quant à lui pas prévu par la LPNMS, mais par l'art. 30 de son règlement d'application du 22 mars 1989 (RLPNMS; BLV 450.11.1), qui dispose que le département "établit le recensement architectural des constructions en collaboration avec les communes concernées, selon les directives publiées à cet effet". Le recensement architectural, dont le processus est décrit dans la plaquette susmentionnée, est une mesure qui tend à repérer et à mettre en évidence des bâtiments dignes d'intérêt, de manière à permettre à l'autorité de prendre, le cas échéant, les mesures de protection prévues par la loi. Il comporte l'attribution de notes qui sont les suivantes: "1": Monument d'importance nationale; "2": Monument d'importance régionale; "3": Objet intéressant au niveau local; "4": Objet bien intégré; "5": Objet présentant des qualités et des défauts; "6": Objet sans intérêt; "7": Objet altérant le site (v. détails sur les notes de recensement dans la plaquette, pp. 14ss). Le recensement architectural couvre en principe tous les bâtiments (voir pour les détails la plaquette précitée, p. 6) et n'entraîne pas en soi de mesures de protection spéciale au sens des art. 16 et 17 LPNMS (objets à l'inventaire) ou des art. 23 et 54 LPNMS (objets classés).
A l'exception des notes "1" et "2" (qui impliquent une mise à l'inventaire, voire un classement), les notes attribuées ont un caractère purement indicatif et informatif; elles ne constituent pas une mesure de protection (CDAP AC.2009.0209 du 26 mai 2010 consid. 2a; AC.2000.0026 du 4 juillet 2000; AC.2003.0216 du 23 juillet 2004 consid. 2b). Elles sont en revanche un élément d'appréciation important pour les autorités chargées de l'aménagement du territoire, notamment lors de l'adoption des zones à protéger prévues par l'art. 17 al. 1 LAT ou, dans la procédure de permis de construire, lorsque ces autorités appliquent les règles concernant l'intégration et l'esthétique des constructions ou statuent sur une autorisation cantonale spéciale (CDAP AC.2017.0093 du 23 novembre 2018 consid. 2c; AC.2017.0035 du 25 octobre 2017 consid. 2c; AC 2009.0209 précité consid. 2a ; AC.2008.0328 du 27 novembre 2009 consid. 4b et les arrêts cités).
bb) Le bâtiment ECA 346 a reçu la note 4 au recensement architectural du Canton de Vaud, ce qui correspond à un "objet bien intégré". Dans la fiche du recensement, il est décrit comme "maison bourgeoise". Selon la plaquette précitée, un objet est bien intégré par son volume, sa composition et souvent sa fonction. Les objets de cette catégorie forment en général la majorité des bâtiments d'une localité et sont donc déterminants pour son image et constitutifs du site. A ce titre, leur identité mérite d'être sauvegardée (plaquette, p. 17).
e) En outre, le bâtiment du recourant est situé dans la "zone de la ville ancienne" et appartient aux bâtiments "C", au sens du PGA (cf. plan 2). Le RPGA prévoit les dispositions suivantes en matière de protection du patrimoine, pour la zone de la ville ancienne (art. 9 RPGA) et pour les bâtiments A, B et C qui la constituent (respectivement art. 17, 22 et 32 RPGA):
La Zone de la ville ancienne
Art. 9 - Protection générale
1. La zone de la ville ancienne est un ensemble urbanistique de grande valeur, elle est protégée.
2. Toute intervention doit tenir compte du caractère des éléments qui la composent : bâtiments, ouvrages d'art, rues, monuments, places, espaces extérieurs, cours d'eau, configuration générale du sol etc.
Bâtiments A
Art. 17 – Protection
1. La valeur architecturale des bâtiments "A" est remarquable. Ils présentent un intérêt régional voire national. Ils sont les constituants de la qualité exceptionnelle de la ville ancienne d'Yverdon-les-Bains.
2. Ils sont protégés et maintenus.
Bâtiments B
Art. 22 - Qualification et protection
1. Les bâtiments "B" constituent des éléments d'intérêt pour la ville. Ils sont les témoins d'une époque et sont les garants de l'authenticité de la substance de la ville ancienne.
2. Ils sont protégés et maintenus.
Bâtiments C
Art. 32 – Qualification et protection
1. Les bâtiments "C" sont bien intégrés dans la ville ancienne. Ils façonnent la structure de la ville ancienne.
2. Leur maintien est recommandé. Ils peuvent être démolis dans la mesure où leur remplacement est assuré.
Art. 32 bis Transformations
1. Les bâtiments "C" peuvent être transformés dans les limites des présentes règles selon un mode traditionnel ou contemporain.
Par ailleurs, les art. 25, 26 et 28 RPGA applicables aux bâtiments "C" par renvoi de l'art. 33bis RPGA prévoient notamment ce qui suit:
Art. 25 – Surélévations
1. Les surélévations d'un étage sont autorisées, toutefois le nombre total de niveaux sous la corniche ne dépassera pas trois. Dans les secteurs mentionnés sur le plan par un liséré orange, il ne dépassera pas quatre.
2. [...]
Art. 26 – Façades
1. Les transformations conformes au style du bâtiment sont autorisées.
2. Sur les façades côtés rue, les balcons, oriels, bow-windows, etc. sont interdits.
3. Toute transformation de façade doit également s'harmoniser avec les façades des bâtiments voisins.
Art. 28 Toitures
1. L'architecture des toitures à pan doit ête conservée.
2. Les croupes, la saillie, et la forme des avants-toits existantes sont maintenues.
3. En cas d'ouvertures, la continuité de l'avant-toit est maintenue.
4. L'utilisation des combles à des fins d'habitation ou d'activité est admise sur un seul niveau pour autant que les moyens d'éclairage ne défigurent ni le toit ni les pignons et n'altèrent pas l'aspect général de la ville.
5. [...]
6. Les pleins dominent largement les vides.
7. L'éclairage des surcombles sera limité au minimum. Il est effectué par des tabatières d'une surface inférieure à 0,30 m2
8. La disposition et la dimension des moyens d'éclairage sur un pan de toiture doivent être équilibrées par rapport à l'ordre des ouvertures de la façade correspondante.
4. En l'espèce, l'art. 25 RPGA, applicable au bâtiment litigieux par renvoi de l'art. 33bis RPGA, prévoit que les surélévations d'un étage sont autorisées, le nombre total de niveaux sous la corniche ne devant pas dépasser 4 dans le secteur indiqué sur le plan n° 2 par un liseré orange. Dès lors, le projet en cause qui ajoute un étage à l'annexe, faisant passer le nombre total de niveaux sous la corniche de 3 à 4 (en comptant le sous-bassement borgne au niveau du canal), respecte cette disposition. En outre, le projet rend les combles habitables tant du côté de l'annexe que du côté de la rue de ********, ce qui est conforme à l'art. 11 al. 2 RPGA lequel prévoit que dans la zone de la ville ancienne les combles sont principalement destinées à l'habitat. Pour le surplus, la municipalité ne soutient pas que le projet serait contraire aux dispositions réglementaires relatives au volume, à la hauteur ou de manière plus générale aux dimensions du bâtiment. Dès lors, une interdiction de la surélévation pour des motifs liés à l'esthétique et à l'intégration doit répondre à un intérêt public prépondérant (cf. TF 1C_358/2017 précité consid. 4.4 et les arrêts cités supra consid. 3a/aa).
5. a) aa) En l'occurrence, la municipalité est opposée à la surélévation de l'annexe du bâtiment ECA 346, d'une part en raison de l'esthétique même du projet. Elle estime en effet que la disparition de la façade du bâtiment principal côté canal causerait une rupture indésirable avec l'aspect et l'organisation actuels de ce bâtiment et, partageant l'avis du SIPAL, ne permettrait plus une lecture claire de son évolution comme c'est le cas actuellement. La municipalité déplore en outre "l'asymétrie saugrenue des deux pans du nouveau toit projetée pour la partie nord-ouest du bâtiment côté canal et l'impact défavorable de ce choix architectural sur la transition de la toiture avec la partie principale du bâtiment, sous la forme d'un point bas disgrâcieux". Par ailleurs, elle estime que les ouvertures en toiture sont pratiquées en surnombre et de manière inadéquate, reprochant au projet "un criblage de la toiture par des moyens d'éclairage (art. 28 al. 4 RPGA)" qui "défigure le toit", et qui est "complètement déplacé dans le contexte historique". Dans le même sens, le SIPAL est d'avis que les châssis rampants sont prévus en surnombre.
bb) Certes la surélévation de l'annexe impliquerait la disparition des fenêtres du dernier étage du bâtiment principal visibles au-dessus du toit de l'annexe. Cela étant, l'intérêt public à la conservation de cette rangée de fenêtres sur un bâtiment qui a reçu la note 4 au recensement architectural doit être nuancé. En effet, d'une part, l'art. 32bis RPGA permet la transformation des bâtiments C dans les limites du RPGA selon un mode traditionnel ou contemporain. Or cette disposition est directement applicable dans le cas d'espèce, au contraire de l'ISOS et de la note 4 du recensement architectural qui ne valent qu'en tant qu'éléments d'appréciation dans l'intérprétation de la clause d'esthétique. D'autre part, l'annexe apparaît actuellement peu intégrée au reste du bâtiment, comme l'a admis le SIPAL. Elle est en effet accolée à la façade du bâtiment principal. Ainsi une grande partie de la façade de celui-ci est actuellement masquée. En définitive, du côté du Canal Oriental, le bâtiment ECA n° 346 forme un ensemble plutôt disparate. Or, la surélévation de l'annexe permettrait une harmonisation de ce bâtiment par la création d'une façade unique alignée au bord du canal. En somme, les fenêtres du dernier étage du bâtiment principal, actuellement en retrait de l'annexe, seraient remplacées, dans l'étage ajouté aligné sur le canal, par les fenêtres de cet étage qui sont calquées sur celles des deux étages existants (cf. le montage photo avant-après du projet, pièce 44). Le style du bâtiment serait conservé, en conformité avec l'art. 26 al. 1 RPGA.
L'importance de la conservation du bâtiment ECA n° 346 dans sa forme actuelle du côté du Canal Oriental, en ce qu'elle permet selon le SIPAL une meilleure lecture des étapes de la construction de la parcelle du recourant, doit être relativisée pour les mêmes raisons. En outre, il apparaît difficile de considérer la configuration actuelle comme définitive d'un point de vue patrimonial et urbanistique, car comme cela ressort des explications du recourant, les deux corps du bâtiment ECA n° 346 ont été modifiés au fil du temps en fonction des besoins des propriétaires, sans trouver de forme définitive, en raison de la forme de la parcelle, étroite et en longueur, la rendant difficilement aménageable.
Par ailleurs, les critiques de la municipalité et du SIPAL relatives au surnombre d'ouvertures en toiture et à leur caractère inadéquat par rapport au contexte historique, apparaissent exagérées. En effet, vu les plans, les pleins dominent nettement les vides sur tous les pans de toiture visibles depuis la rue de ******** et du côté du canal, conformément à l'art. 28 al. 6 RPGA. On ne saurait donc parler d'un "criblage de la toiture par des moyens d'éclairage" ou d'une défiguration du toit. De plus, en l'occurrence, l'art. 28 al. 8 RPGA selon lequel "la disposition et la dimension des moyens d'éclairage sur un pan de toiture doivent être équilibrées par rapport à l'ordre des ouvertures de la façade correspondante" est lui aussi respecté: du côté du canal, les trois châssis rampants du pan nord-ouest du toit de l'annexe sont alignés par rapport aux trois rangées de trois fenêtres de la façade de l'annexe et paraissent de dimensions inférieures ou tout au plus égales à ces dernières; toujours du côté du canal, les deux chassis rampants du pan nord-ouest du toit du bâtiment principal ont des dimensions inférieures et sont disposées de manière harmonieuse par rapport aux autres ouvertures en contrebas; enfin du côté de la rue de ********, les deux rangées de deux chassis rampants sur le pan sud-est du toit du bâtiment principal sont alignées et de dimensions inférieures aux fenêtres de la façade correspondante.
Enfin, l'asymétrie de la nouvelle toiture de l'annexe et sa jointure avec le toit du bâtiment principal, qui sont liées à la forme de la parcelle selon les explications du recourant, concernent le pan sud-est du toit de l'annexe se trouvant derrière le front de bâtiments longeant le canal. Ces éléments ne seraient donc pas visibles, ni depuis le pont de la Plaine, ni depuis la Place des Droits de l'Homme, comme cela été constaté lors de la vision locale du 19 décembre 2018. Cette partie de la toiture serait uniquement et éventuellement visible depuis les derniers étages des bâtiments voisins ECA 344 et ECA 348, à condition de se pencher en avant et de côté, ainsi que depuis les combles du bâtiment voisin ECA 347. On ne saurait donc interdire la surélévation en raison de la forme particulière de la toiture qui serait non apparente depuis le domaine public. Il faut également relever que le recourant a présenté deux projets de toitures différentes à la municipalité avant le projet actuel, à savoir le pré-projet du 26 mars 2014 qui prévoyait la transformation des deux corps de bâtiments en un seul bâtiment de quatre étages avec une toiture unique et le projet du 18 mars 2015 qui prévoyait de conserver l'annexe et de lui ajouter un étage surmonté d'un toit-terrasse. Or la municipalité s'est opposée à ces deux projets en raison notamment de leur toiture.
b) aa) D'autre part, la municipalité s'oppose au projet de surélévation pour des motifs d'intégration. Elle considère que la surélévation de la partie nord-ouest porterait atteinte à la lisibilité du front côté canal, et, en se référant au préavis négatif du SIPAL du 10 juillet 2017, que l'augmentation du volume de la partie annexe du bâtiment du côté du canal nuirait à sa bonne intégration dans le site, ainsi qu'à la situation des bâtiments protégés sis à proximité, étant rappelé que la zone du canal concernée jouit d'une excellente situation en termes de visibilité et de fréquentation. Dans sa réponse du 22 novembre 2017, la municipalité ajoute que la surélévation romprait avec l'harmonie de hauteurs du front bâti du côté du Canal Oriental, ce qu'elle ne peut accepter. Elle précise qu'il s'agit encore d'éviter des ombres portées trop importantes sur le bâtiment voisin ECA 344, lequel est inventorié au recensement architectural avec la note 2.
Dans son écriture du 13 décembre 2017, le SIPAL est d'avis que la volumétrie actuelle du bâtiment litigieux devrait être conservée car le tissu urbain d'origine est celui d'une ville médiévale, soit composée de bâtiments de hauteurs variables et qu'il convient de maintenir cette hétérogénéité. Il critique le fait que les modifications prévues rompraient fortement les lignes de fuite et perspectives sur le canal et les bâtiments protégés qui se situent au Nord-Est. Le SIPAL reproche en outre au projet de surélévation de créer un nouveau front de rue en bordure du canal, front qu'il considère comme inexistant à l'heure actuelle, et qui est non souhaitable car cela augmenterait l'exiguïté du canal et dévaloriserait les bâtiments existants. Enfin la diminution de la largeur du canal serait contraire au contexte au concept urbanistique initial qui, comme le mentionne l'ISOS, vise à élargir toujours plus l'espace urbain en direction du canal.
Pour le recourant, la partie nord-ouest de son bâtiment donnant sur le Canal Oriental fait partie du périmètre environnant VI, protégeant le Canal Oriental, à savoir selon lui essentiellement la vision sur le canal, avec ses lignes de fuite. Pour le recourant, c'est l'échappée sur l'environnement vue depuis le pont de la Plaine qui est protégée et ce qui compte c'est l'existence d'une symétrie de part et d'autre du canal. Pour lui, il fait sens d'aligner les habitations le long de ce dernier - qui a d'ailleurs été construit postérieurement à plusieurs habitations qui le longent - comme cela se fait dans d'autres villes.
bb) Compte tenu des griefs du SIPAL et de la municipalité selon lesquelles la surélévation de l'immeuble du recourant nuirait à sa bonne intégration dans le site, ainsi qu'à la situation des bâtiments protégés sis à proximité, il convient de circonscrire l'intérêt public poursuivi par le refus de la municipalité de délivrer le permis de construire litigieux.
Le projet est prévu dans un site et à proximité de bâtiments qui font l'objet de protection à plusieurs égards. En effet, du même côté du canal que l'immeuble du recourant, à la tête de la rue de ********, se trouve le bâtiment ECA 348 qui a reçu la note 4 au recensement architectural et qui est classé comme bâtiment "B" au sens de l'art. 22 RPGA; vient ensuite le bâtiment ECA 347, qui, comme l'immeuble du recourant a obtenu la note 4 et est classé comme bâtiment "C" au sens de l'art. 32 RPGA; le bâtiment suivant est celui du recourant; le bâtiment ECA 344 qui suit, est décrit comme "maison bourgeoise", est répertorié comme bâtiment "A" au sens de l'art. 17 RPGA, soit un bâtiment dont la valeur architecturale est remarquable, a obtenu la note 2 au recensement architectural, et a en conséquence été mis à l'inventaire (la protection valant "sur l'ensemble") au sens de l'art. 49 LPNMS; les deux bâtiments suivants ECA 340 et 341 ont obtenu la note 4 et sont classés en "C" au sens du RPGA. Du côté ouest du canal, en face de l'immeuble du recourant, se trouve la Maison d'Ailleurs (ECA 308), qui a obtenu la note 1 au recensement architectural et qui est classée comme monument historique pour les façades et la toiture, les parties non classées étant mise à l'inventaire; ce bâtiment est également classé comme monument historique de la Confédération et figure à l'inventaire de la protection des biens culturels (catégorie B). En face de la Maison d'Ailleurs, de l'autre côté de la rue du Casino se trouve le bâtiment ECA 307 (abritant le restaurant du Château), qui a reçu la note 1 au recensement architectural, est classé comme monument historique pour les façades et la toiture, les parties non classées étant mise à l'inventaire, et figure également à l'inventaire de la protection des biens culturels (catégorie B). Quant au Château, il se trouve à proximité, de l'autre côté du pont de la Plaine et jouit de la protection des monuments historiques du Canton et de la Confédération. Par ailleurs, ainsi qu'on l'a constaté ci-dessus, l'immeuble du recourant ainsi que les bâtiments situés sur le côté est du canal sont situés dans le périmètre 2 ainsi qu'aux abords immédiats du périmètre environnant VI de l'ISOS, ces deux périmètres bénéficiant d'un objectif de sauvegarde maximum. Enfin, l'ensemble de ces bâtiments se trouve dans la zone de la ville ancienne au sens des art. 9ss RPGA, qui est protégée au titre d'ensemble urbanistique de grande valeur (art. 9 al. 1 RPGA).
Il est donc indéniable que la transformation de l'immeuble du recourant est destinée à prendre place dans un environnement et à proximité de bâtiments et de monuments très sensibles du point de vue de la protection des monuments et des sites. Il existe par conséquent sans conteste, à l'aune de l'art. 86 LATC, ainsi que des art. 3, 4 et 9 RPGA, un intérêt public à la protection du caractère de ces bâtiments et de leur environnement construit.
cc) Pour autant, on ne saurait déduire de ce qui précède que la surélévation projetée ne s'intégrerait pas à ses alentours. En ce qui concerne plus particulièrement la vue sur le Château depuis le Pont Haldimand, elle ne serait sans doute pas entravée par la surélévation qui serait peu visible, puisque dissimulée par le bâtiment ECA 5974 (soit le bâtiment moderne de 4 niveaux habitables sur un soubassement noir) vu la hauteur de ce dernier. S'agissant de la vue sur le Château depuis la passerelle en fer située à côté du bâtiment ECA 340, la surélévation rendrait certes l'annexe plus visible, sans toutefois provoquer une gêne majeure par rapport à la situation actuelle, puisque sa hauteur resterait inférieure à celle des bâtiments ECA 348 et 308 sis de chaque côté du pont de la Plaine. En tous les cas, la tour nord-est du château se distinguerait comme c'est le cas actuellement depuis les deux ponts susmentionnés, en arrière-fond des immeubles se trouvant de part et d'autre du Canal Oriental. S'agissant de l'impact visuel de la surélévation sur les bâtiments classés ECA 307 et 308 (Maison d'Ailleurs), ainsi que le bâtiment ECA 348, il resterait limité, puisque ces bâtiments continueraient de dominer par leur volume et leur hauteur; par ailleurs, la différence de hauteur entre l'annexe et ces différents bâtiments serait moins marquée qu'actuellement, ce qui aurait tendance à rendre l'ensemble formé par ces quatre constructions plus harmonieux en termes de volume et de hauteur (cf. photo-montage, pièce 44). En outre, l'organisation des ouvertures de la façade de l'annexe (trois rangées de trois fenêtres superposées), rappelle le traitement de la façade sud-ouest de la Maison d'Ailleurs, disposant également d'une façade avec neuf ouvertures (cf. ledit photo-montage). Enfin, le traitement de la façade de l'annexe est sobre, semblable à la situation actuelle. Vu ce qui précède, il n'apparaît pas que le projet de surélévation dévaloriserait les immeubles protégés susmentionnés.
Concernant le bâtiment ECA 344, ainsi que l'a relevé la municipalité, la surélévation augmenterait les ombres portées sur le bâtiment, en particulier durant l'été. Toutefois, le droit à la vue n'est pas protégé en droit public, si ce n'est indirectement par les règles de police des constructions fixant les distances et hauteurs à respecter (CDAP AC.2017.0093 du 23 novembre 2018 consid. 6c/aa; AC.2016.0349 du 14 décembre 2017 consid. 5b et les références citées; cf. également TF 1C_3/2018 du 23 octobre 2018 consid. 3.3). Or, ainsi qu'on l'a vu, de ce point de vue, le projet n'est pas critiquable (supra consid. 4). On rappellera par ailleurs qu'il n'existe pas de base légale qui permettrait à une municipalité d'une commune vaudoise, dans le cadre d'une procédure relative à un permis de construire, d'exiger la diminution du volume d'un bâtiment ou une modification de son implantation afin de garantir le respect d'un ensoleillement minimum pour les habitants d'une parcelle voisine (AC.2018.0414 du 16 juillet 2019, consid. 2c).
dd) En définitive, le recourant fait valoir à juste titre qu'il fait sens d'aligner les habitations le long du canal. Il faut bien voir que le législateur communal à délimité expressément, sur toute la longueur concernée du Canal Oriental, un périmètre "permettant 4 étages" englobant la rangée de parcelles qui s'étendent entre ce canal et la rue de ********. Les divers griefs soulevés par l'administration communale à l'encontre du projet ne permettent pas de retenir qu'un intérêt public prépondérant imposerait de refuser la surélévation d'un étage du bâtiment litigieux. il faut aussi prendre en considération, d'une part, que la surélévation permettrait une meilleure exploitation des possibilités de construire, puisque dans le secteur où se trouve la parcelle du recourant, des constructions de quatre niveaux sous la corniche sont autorisées (cf. art. 25 RPGA); or selon la jurisprudence, il existe un intérêt public à exploiter au maximum les possibilités de construire, car la politique suisse de l'aménagement du territoire vise à orienter le développement de l'urbanisation vers l'intérieur du milieu bâti en maintenant une qualité de l'habitat appropriée et à créer un milieu bâti compact (cf. supra consid. 3a). D'autre part, comme l'a relevé le Service du logement qui a donné son aval au projet, il existe un intérêt public à la surélévation, car elle permettrait une amélioration quantitative et qualitative de l'offre d'habitation à Yverdon-les-Bains où sévit la pénurie du logement. Le projet permettrait en effet d'augmenter le nombre de logements de 3 à 7, d'améliorer l'habitabilité et le confort des appartements et de mettre aux normes leurs installations. Enfin, le recourant a un intérêt privé à pouvoir améliorer l'habitabilité et la rentabilité de son bâtiment, actuellement vide.
Vu ce qui précède, la Cour de céans retient qu'il n'existe pas d'intérêt public prépondérant justifiant le refus de la surélévation.
dd) Les autres arguments de la municipalité et du SIPAL visant à interdire la surélévation pour défaut d'intégration ne conduisent pas à une autre conclusion.
A bien les suivre, la municipalité et le SIPAL considèrent que la transformation prévue serait contraire à l'ISOS. Or, le simple fait qu'une construction se trouve dans un périmètre protégé par l'ISOS ne signifie pas encore que toute transformation dans ce périmètre serait interdite ou non intégrée. En effet, comme on l'a rappelé, l'ISOS n'est pas directement applicable lorsque le litige porte sur l'octroi d'un permis de construire (cf. supra consid. 3c/aa; cf. également CDAP AC.2017.0093 du 23 novembre 2018 consid. 3b et 6b).
Par ailleurs, dans le cas présent, il convient de tenir compte, pour trancher la question de l'intégration, de la situation géographique particulière de la parcelle du recourant, dont la partie nord-ouest où se situe l'annexe donne uniquement sur le Canal Oriental, soit le périmètre environnant VI au sens de l'ISOS, et non sur la rue de ******** faisant partie du Faubourg de la Plaine (protégé par le périmètre 2 de l'ISOS) (cf. supra consid. 3c/bb). En d'autres termes, la question de l'intégration du bâtiment et en particulier de sa partie arrière doit être examinée à la lumière de la protection du Canal Oriental.
Compte tenu de cette situation particulière, on ne saurait suivre le SIPAL lorsqu'il déplore que la surélévation créerait un nouveau front de rue en bordure du canal aujourd'hui inexistant et non souhaitable car il augmenterait l'exiguïté du canal, ce qui serait contraire au contexte au concept urbanistique initial lequel, comme le mentionne l'ISOS, viserait à élargir toujours plus l'espace urbain en direction du Château. En effet, d'une part, le front de rue est déjà largement existant du côté est du Canal Oriental, puisque la majorité des immeubles sont alignés le long du chemin piétonnier bordant le canal, les seuls qui sont en retrait étant les immeubles ECA 344 et ECA 348, ce dernier l'étant très légèrement. De plus, la plupart de ces immeubles alignés au canal sont de hauteur relativement importante puisqu'ils comportent entre trois et quatre niveaux habitables sur des soubassements situés à hauteur du canal (voir les descriptions des bâtiments 1, 5, 6, 7, 8 et 9 dans le procès-verbal d'inspection locale du 19 décembre 2018). D'autre part, il ressort clairement de la lecture de l'ISOS que le concept de "l'espace urbain s'élargissant toujours plus en direction du château" (cf. descriptif du périmètre 2, p. 29 de l'ISOS) concerne l'évasement des constructions de part et d'autre de la rue de la Plaine à mesure que l'on s'approche du Château (la largeur importante de la rue de la Plaine à la hauteur de ce dernier, laissant voir l'entier du côté est du carré savoyard avec une tour dans chaque coin, avait historiquement pour but d'assurer une meilleure défense du château, cf. ISOS p. 41), et non les bâtiments situés de part et d'autre du Canal Oriental. Il n'y a donc pas lieu de considérer que l'augmentation – relative – de l'exiguïté du canal en raison de la surélévation de l'annexe litigieuse serait contraire aux objectifs de protection de l'ISOS. Il n'y a pas non plus lieu de retenir, comme le prétend le SIPAL, que les modifications prévues rompraient fortement les lignes de fuite et perspectives sur le Canal Oriental, en particulier celles visibles depuis le pont de la Plaine, dès lors que la façade de l'annexe serait alignée au chemin piétonnier longeant le canal, comme la majorité des constructions le bordant, et que la nouvelle toiture de l'annexe serait parallèle à ce dernier, comme c'est déjà le cas actuellement.
Enfin, les critiques de la municipalité selon lesquelles la surélévation porterait atteinte à la lisibilité du front d'habitation du côté est du canal ou romprait avec l'harmonie de hauteurs du front bâti du côté du Canal Oriental, n'apparaissent pas fondées. En effet, ainsi que l'a relevé le SIPAL et comme la Cour de céans a pu constater lors de la vision locale du 19 décembre 2018, ce front se caractérise au contraire par des bâtiments de hauteur variable (cf. procès-verbal, description des bâtiments 1 à 9 sis du côté est du Canal Oriental), hétérogénéité que le SIPAL reproche justement au projet de mettre en péril. Or, cette analyse ne peut pas être suivie non plus dès lors que le projet de surélévation permettrait de conserver des différences de hauteur nettement perceptibles dans la zone des constructions proches du pont de la Plaine, puisque la hauteur de l'annexe resterait inférieure à celle des bâtiments ECA 348, ECA 308 (Maison d'Ailleurs) et ECA 344.
En définitive, malgré la marge d'appréciation importante dont jouit la municipalité pour apprécier les questions d'esthétique et d'intégration, elle a en l'occurrence abusé de son pouvoir d'appréciation en refusant l'octroi du permis de construire pour de tels motifs.
6. La municipalité critique encore le nombre et la typologie des appartements, reprochant au projet de créer de petits appartements, soit des 1,5 ou 2,5 pièces. Elle considère qu'en exploitant les possibilités de construire au maximum, le recourant a engendré le non-respect des règles du RPGA relatives au nombre de places de stationnement pour deux-roues (art. 120 RPGA) et aux espaces de rangement (art. 143 RPGA). S'agissant des espaces de rangements, elle relève que dans 4 des appartements projetés, leur surface est inférieure aux 6 m2 prévus par l'art. 143 RPGA; or selon elle, tous les appartements sont soumis à cette disposition ainsi qu'à l'art. 120 RPGA, dès lors que l'on se trouverait en présence d'une réorganisation complète de l'immeuble et non de simples transformations, vu la redistribution complète des volumes prévue et la disparition du mur séparant le bâtiment principal de l'annexe. Le recourant pour sa part estime l'art. que 143 RPGA ne s'applique qu'aux nouveaux appartements créés vu que l'on se trouverait en présence de transformations au sens de l'art. 80 al. 2 LATC. Il fait encore valoir que si l'on raisonne en termes de moyenne, il y a plus de 6 m2 d'espace de rangement par appartement. S'agissant des places de stationnement pour deux-roues, la municipalité reproche au projet de n'en prévoir que trois alors que les normes VSS en prescriraient 10, soit une par pièce habitable plus une pour le commerce. Le recourant fait valoir pour sa part que malgré les contraintes techniques (le bâtiment ancien ne possédant pas de cave et une excavation semblant très difficilement réalisable), un espace a été aménagé sous la nouvelle cage d'escalier, permettant de ranger environ 3 vélos, tout en admettant que les exigences posées par les normes VSS n'ont pas pu être atteintes. Quoi qu'il en soit, le recourant demande que des dérogations au sens de l'art. 149 RPGA lui soient accordées s'agissant du respect des art. 120 et 143 RPGA, ce que la municipalité refuse.
a) L'art. 24 LATC prévoit notamment ce qui suit:
Art. 24 Contenu
1 Les plans d'affectation comprennent un plan et un règlement. Ils fixent les prescriptions relatives :
a. à l'affectation du sol ;
b. au degré de sensibilité au bruit ;
c. à la mesure de l'utilisation du sol.
2 Ils contiennent toute autre disposition exigée par la présente loi, le plan directeur cantonal, ou les législations spéciales.
3 Ils peuvent également contenir d'autres dispositions en matière d'aménagement du territoire et de restriction du droit à la propriété, pour autant qu'elles ne soient pas contraires à la loi et au plan directeur cantonal. Ils prévoient en particulier des références aux normes professionnelles en matière de stationnement. Ils prévoient, notamment, des places de sport, de jeu ou de loisirs suffisantes, en particulier pour les enfants.
L' art. 32 RLATC est libellé en ces termes :
Art. 32 Equipements collectifs
1 Les immeubles destinés à l'habitation collective doivent être pourvus d'équipements collectifs, tels que local pour voitures d'enfants, buanderie, séchoir et caves en relation avec leur importance. Les locaux communs doivent être convenablement aérés.
1bis Les immeubles destinés à l'habitation collective ou à une activité doivent être pourvus de garage pour deux-roues légers motorisés ainsi que d'un local ou d'un couvert adapté aux deux-roues légers non motorisés.
2 Lors de travaux de transformation, les dispositions des alinéas 1 et 1bis sont applicables dans la mesure où la structure et l'organisation intérieure du bâtiment le permettent sans frais disproportionnés.
A Yverdon-les-Bains, les art. 120 et 143 RPGA consacrés aux espaces de rangement et aux places de stationnement pour deux-roues précisent ce qui suit :
Art. 143 RPGA Espaces de rangements
1 Tout bâtiment comportant de l'habitation doit disposer pour chaque logement de 6,00 m2 au minimum de locaux de rangement situés soit dans les caves ou galetas, soit dans des pièces non éclairées à l'intérieur du logement.
Art. 120 RPGA Places de stationnement pour deux-roues
1 Le nombre de places de stationnement obligatoires et leur dimensionnement sont calculés au moyen de la norme VSS en vigueur.
2 Abrogé
3 Afin d'en garantir l'attractivité, les places seront aisément accessibles.
Selon la norme VSS 640 065, la valeur indicative en nombre de places de stationnement pour vélos (P-vélos) pour les habitations (habitants et visiteurs inclus) est de 1 P-vélo par pièce (ch. 15, tab. 1). Pour les locaux commerciaux, en particulier les "autres commerces", qui ne sont ni des magasins d'articles de consommation courante, ni des centres commerciaux, le nombre de P-vélo pour le personnel est de 2 pour 10 places de travail et pour la clientèle, de 0,5 à 1 place par 100 m2 de surface de vente.
b) En premier lieu, on constate qu'aucune disposition du RPGA ne règle les questions du nombre de pièces ou de la typologie des appartements. En l'absence de base légale sur ces points, les griefs par lesquels la municipalité reproche au recourant de créer de petits appartements de 1,5 ou 2,5 pièces sont infondés.
c) En l'occurrence, en vertu de l'art. 32 al. 2 RLATC, les art. 143 et 120 RPGA sont applicables en cas de transformation. En l'occurrence, le projet prévoit des transformations pour l'ensemble des appartements dont les volumes sont par ailleurs augmentés, de sorte qu'ils sont tous soumis aux dispositions précitées, comme l'a retenu la municipalité.
S'agissant des espaces de rangement, on relève d'abord que selon le texte clair de l'art. 143 RPGA, chaque logement doit comporter 6 m2 de rangement au minimum sans égard à sa taille. Le recourant ne peut donc être suivi lorsqu'il fait valoir que le projet respecterait cette disposition car en termes de moyenne (à savoir en additionnant tous les espaces de rangement puis en divisant le total par le nombre d'appartement), le projet prévoirait plus de 6 m2 d'espaces de rangement par appartement.
Selon le jeu de plans produits par le recourant le 19 décembre 2018 (cf. ci-avant), 4 appartements ne disposent pas des 6 m2 d'espaces de rangement exigés, à savoir les 4 appartements de 1,5 pièces situés aux premier et deuxième étages.
S'agissant du nombre de places de stationnement pour deux-roues nécessaire, il est de 10, comme l'a retenu la municipalité (à savoir 1 P-vélo pour chacun des 1,5 pièces, 2 P-vélo pour les 2,5 pièces et 1 P-vélo pour le local commercial). Or le projet ne prévoit la création que de 3 places pour vélos.
d) Prenant appui sur l'art. 149 RPGA, le recourant demande que des dérogations lui soit accordées pour l'insuffisance d'espaces de rangement et de places pour vélos.
L'art. 149 al. 1 RPGA prévoit ce qui suit :
Art. 149 - Dérogations
1 La Municipalité peut accorder des dérogations de minime importance lorsque la topographie, la forme des parcelles, les accès, l’intégration ou la conception des constructions imposent des solutions particulières et s’il n’en résulte pas d’inconvénients majeurs.
En l'espèce, les dérogations à accorder seraient de peu d'importance étant donné que sur les quatre appartements ne disposant pas des 6 m2 d'espaces de rangement, deux appartements ont tout de même un espace de rangement de 4,54 et 4,94 m2. En outre du point de vue du principe de la proportionnalité, il se justifie de tenir compte du fait que le règlement impose un espace de rangement minimum sans égard à la taille des appartements. Quant aux nombre de places de stationnement pour deux-roues manquant, il reste d'une ampleur acceptable, compte tenu du fait que l'on se trouve au centre ville à proximité de la gare. En définitive, il apparaîtrait disproportionné d'empêcher l'agrandissement prévu, ou d'exiger de renoncer à la création d'un appartement en faveur de la création des places de stationnement manquantes, vu l'intérêt public à la création de logements mis en l'évidence en l'espèce. Par ailleurs, la difficulté de construire les espaces de rangement et les places de stationnements pour deux-roues nécessaires est en grande partie due à la forme de la parcelle et au fait que le corps principal du bâtiment n'est pas excavé. La municipalité a donc abusé de son pouvoir d'appréciation conféré par l'art. 149 RPGA en refusant d'accorder des dérogations aux art. 120 et 143 RPGA.
7. La municipalité reproche enfin au recourant de n'avoir pas prévu la construction de places de stationnement pour véhicule à moteur.
a) Les art. 113, 114 et 119 RPGA prévoient ce qui suit:
Article 113 - Obligation d’aménager des places de stationnement
1 L’aménagement de places de stationnement est obligatoire dans les cas suivants:
- lors de constructions nouvelles;
- lors de l’agrandissement d’un bâtiment existant;
- lorsque la modification de l’affectation d’une construction existante entraîne un besoin plus élevé en places de stationnement.
Article 114 - Base de calcul
1 Le nombre de places de stationnement obligatoires est calculé sur la base des besoins limites, déterminés au moyen de la norme VSS en vigueur.
Article 119 - Contribution de remplacement
1 La Municipalité peut dispenser un propriétaire de son obligation d’aménager tout ou partie des places de stationnement requises lorsqu’il ne peut:
- ni les réaliser sur son propre fonds;
- ni participer à une installation commune.
2 Dans ce cas le propriétaire versera une contribution compensatoire de Fr. 5000 par place manquante. Le montant de cette taxe peut être révisé tous les 5 ans.
3 Cette contribution est exigible lors de la délivrance du permis de construire. Si le permis n’est pas utilisé, le montant versé ne sera restitué que lorsque ledit permis sera périmé ou sur renonciation écrite du bénéficiaire.
4 La contribution sera affectée à la construction par la Commune de places de stationnement accessibles au public et ne crée aucune prétention à leur utilisation.
5 Cette contribution sera versée au «fonds pour l’aménagement de places de parc pour véhicules» dont la comptabilité est tenue spécialement.
b) En l'occurrence, la construction de places de parc sur la parcelle 2088 n'apparaît pas réalisable vu que cette dernière est entièrement occupée par le bâtiment ECA 346 non excavé et qu'elle se situe dans une zone d'habitations contiguës. D'ailleurs il apparaît qu'aucune des parcelles voisines de celle du recourant accessibles uniquement par la rue de ******** (parcelles 2085 à 2087 et 2098 à 2090) ne dispose de places de stationnement pour véhicule à moteur, vraisemblablement en raison de leur forme. La municipalité a par conséquent abusé de son pouvoir d'appréciation en refusant de dispenser le recourant de l'obligation d'aménager des places de stationnement. Il lui appartiendra donc d'accorder une telle dispense et de statuer sur la contribution de remplacement au sens de l'art. 119 RPGA.
8. Vu ce qui précède, le recours est admis, ce qui entraîne l'annulation de la décision attaquée.
Les frais judiciaires sont fixés à 3'000 fr. vu l'importance de la cause et mis à la charge de la municipalité qui succombe (art. 49 al. 1 LPA-VD et art. 4 al. 1 du tarif du 28 avril 2015 des frais judiciaires et des dépens en matière administrative [TFJDA; BLV 173.36.5.1]).
Le recourant qui obtient gain de cause a droit à des dépens à hauteur de 2'500 fr. TVA et débours compris, à la charge de la municipalité (art. 55 LPA-VD et art. 11 TFJDA).