Чорний кокані або кунімасу, який колись вважався вимерлим, тепер вважається вимерлим у дикій природі
Цей список прісноводних риб, зареєстрованих у Японії, в основному базується на Червоному списку МСОП. Нараховують двісті шістдесять один вид, сімдесят три з яких є ендеміками Японії. З них один вважається вимерлим у дикій природі, сім — як такі, що перебувають під загрозою зникнення, двадцять як такі, що знаходяться під загрозою зникнення, дванадцять як вразливі, десять як такі, що знаходяться під загрозою зникнення, сто сімдесят дев'ять як такі, що викликають найменше занепокоєння, і про тридцять два недостатньо даних.

Ряд: Міногоподібні (Petromyzontiformes)
Далекосхідна струмкова мінога

* Родина: Petromyzontidae
** Рід: Entosphenus
*** Entosphenus tridentatus
** Рід: Lethenteron
*** Lethenteron camtschaticum LC
*** Lethenteron kessleri (MoE: NT)
*** Lethenteron reissneri LC

Ряд: Осетроподібні (Acipenseriformes)
Китайський осетер

* Родина: Осетрові (Acipenseridae) .
** Рід: Acipenser
*** Осетер зелений, Acipenser medirostris NT (МО: EX)
*** Осетер сахалінський, Acipenser mikadoi CR
*** Осетер китайський, Acipenser sinensis CR

Ряд: Вугроподібні (Anguilliformes)
 Вугор японський

* Родина: Вугрові (Anguillidae)
** Рід: Anguilla
*** Короткоперий вугор, Anguilla bicolor NT
*** Японський вугор, Anguilla japonica EN
*** Мармуровий вугор, Anguilla marmorata LC
* Родина: Муренощукові (Muraenesocidae)
** Рід: Muraenesox
*** Muraenesox cinereus LC
* Родина: Муренові (Muraenidae)
** Рід: Echidna
*** Echidna rhodochilus (МО: CR)
** Рід: Uropterygius
*** Uropterygius concolor LC (МО: CR)

Ряд: Атериноподібні (Atheriniformes)

* Родина: Атеринові (Atherinidae)
** Рід: Atherinomorus
*** Atherinomorus duodecimalis LC  (МОН: DD)
** Рід: Hypoatherina
*** Hypoatherina temminckii LC  (МОН: DD)
* Родина: Atherinopsidae
** Рід: Odontesthes
*** Odontesthes bonariensis (інтродукований)

Загін: Авлопоподібні (Aulopiformes)

* Родина: Ящероголові (Synodontidae)
** Рід: Saurida
*** Saurida nebulosa LC

Ряд: Сарганоподібні (Beloniformes)
 Медака японська

* Родина: Адріаніхтові (Adrianichthyidae)
** Рід: Oryzias
*** Медака японська, Oryzias latipes LC  (ендемік) (MoE: VU)
*** Oryzias sakaizumii LC  (ендемік) (MoE: VU)
* Родина: Hemiramphidae
** Рід: Hyporhamphus
*** Hyporhamphus intermedius (MoE: NT)
* Родина: Zenarchopteridae
** Рід: Zenarchopterus
*** Zenarhopterus dunckeri LC  (MoE: NT)

Ряд: Callionymiformes

* Родина: Піскаркові (Callionymidae)
** Рід: Pseudocalliurichthys
*** Pseudocalliurichthys ikedai (МОН: DD)

Загін: Оселедцеподібні (Clupeiformes)
 Coilia nasus

* Родина: Оселедцеві (Clupeidae)
** Рід: Clupea
*** Clupea pallasii DD
* Родина: Анчоусові (Engraulidae)
** Рід: Coilia
*** Coilia nasus EN (MoE: EN)
** Рід: Nematalosa
*** Nematalosa come LC
*** Nematalosa japonica LC  (MoE: EN)
*** Nematalosa nasus LC
** Рід: Thryssa
*** Thryssa baelama LC

Ряд: Коропоподібні
 Parabotia curtus

* Родина: В'юнові (Cobitidae)
** Рід: Cobitis
*** Cobitis biwae
*** Cobitis delicata LC IUCN (ендемік) (MoE: VU (as Niwaella delicata))
*** Cobitis kaibarai VU IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Cobitis magnostriata EN IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Cobitis matsubarae LC IUCN (ендемік) (MoE: VU)
*** Cobitis melanoleuca LC IUCN
*** Cobitis minamorii NT IUCN (ендемік)
*** Cobitis sakahoko EN IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Cobitis shikokuensis VU IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Cobitis striata
*** Cobitis takatsuensis NT IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Cobitis takenoi CR IUCN (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Misgurnus
*** Misgurnus anguillicaudatus LC IUCN (MoE: NT)
** Рід: Parabotia
*** Parabotia curtus CR IUCN (ендемік) (MoE: CR)
* Родина: Коропові (Cyprinidae)
** Рід: Abbottina
*** Abbottina rivularis (ендемік) (MoE: EN)
** Рід: Acheilognathus
*** Acheilognathus cyanostigma EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
*** Acheilognathus longipinnis EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
*** Acheilognathus macropterus DD IUCN (інтродукований)
*** Acheilognathus melanogaster VU IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Acheilognathus rhombeus
*** Acheilognathus tabira NT IUCN (ендемік)
*** Acheilognathus typus VU IUCN (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Aphyocypris
*** Aphyocypris chinensis LC IUCN (MoE: CR)
** Рід: Biwia
*** Biwia yodoensis EN IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Biwia zezera LC IUCN (ендемік) (MoE: VU)
** Рід: Carassius
*** Карась китайський, Carassius auratus LC IUCN
*** Карась японський, Carassius cuvieri EN IUCN (MoE: EN)
*** Carassius langsdorfii
** Рід: Ctenopharyngodon
*** Амур білий, Ctenopharyngodon idella (інтродукований)
** Рід: Cyprinus
*** Короп звичайний, Cyprinus carpio VU IUCN
*** Cyprinus rubrofuscus LC IUCN (інтродукований)
** Рід: Danio
*** Danio albolineatus LC IUCN (інтродукований на острів Окінава)
*** Даніо-реріо, Danio rerio LC IUCN (інтродукований на острів Окінава)
** Рід: Gnathopogon
*** Gnathopogon caerulescens EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
*** Gnathopogon elongatus (ендемік)
** Рід: Hemibarbus
*** Hemibarbus barbus
*** Hemibarbus longirostris LC IUCN
** Рід: Hemiculter
*** Hemiculter leucisculus LC IUCN
** Рід: Hemigrammocypris
*** Hemigrammocypris neglectus LC IUCN (ендемік) (MoE: EN)
** Рід: Hypophthalmichthys
*** Товстолобик білий, Hypophthalmichthys molitrix NT IUCN (інтродукований)
*** Товстолобик строкатий, Hypophthalmichthys nobilis DD IUCN (інтродукований)
** Рід: Ischikauia
*** Ischikauia steenackeri EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Mylopharyngodon
*** Амур чорний, Mylopharyngodon piceus DD IUCN (інтродукований)
** Рід: Nipponocypris
*** Nipponocypris sieboldii
*** Nipponocypris temminckii
** Рід: Opsariichthys
*** Opsariichthys bidens LC IUCN
*** Opsariichthys uncirostris
** Рід: Paramisgurnus
*** Paramisgurnus dabryanus (інтродукований)
** Рід: Pseudogobio
*** Pseudogobio esocinus
** Рід: Pseudorasbora
*** Чебачок амурський, Pseudorasbora parva LC IUCN
*** Pseudorasbora pugnax VU IUCN (ендемік) (MoE: CR)
*** Pseudorasbora pumila EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Pungtungia
*** Pungtungia herzi
** Рід: Rhodeus
*** Rhodeus atremius NT IUCN (ендемік)
*** Rhodeus ocellatus DD IUCN
** Рід: Rhynchocypris
*** Rhynchocypris lagowskii
*** Rhynchocypris oxycephalus
*** Мересниця озерна, Rhynchocypris percnurus LC IUCN
*** Rhynchocypris sachalinensis LC IUCN
** Рід: Sarcocheilichthys
*** Sarcocheilichthys biwaensis EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
*** Sarcocheilichthys variegatus
** Рід: Squalidus
*** Squalidus chankaensis
*** Squalidus gracilis
*** Squalidus japonicus
** Рід: Tanakia
*** Tanakia lanceolata (MoE: NT)
*** Tanakia limbata LC IUCN (ендемік) (MoE: NT)
*** Tanakia tanago EN IUCN (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Tribolodon
*** Угай тихоокеанський, Tribolodon brandtii
*** Tribolodon hakonensis
*** Tribolodon nakamurai EN IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Tribolodon sachalinensis
** Рід: Zacco
*** Zacco platypus
* Родина: Nemacheilidae
** Рід: Barbatula
*** Barbatula oreas
*** Barbatula toni
** Рід: Lefua
*** Lefua echigonia LC IUCN (ендемік) (MoE: EN)
*** Lefua nikkonis LC IUCN (ендемік) (MoE: EN (як Lefua costata nikkonis))
*** Lefua tokaiensis (ендемік) (MoE: EN)
*** Lefua torrentis (ендемік) (MoE: EN)

Ряд: Коропозубоподібні (Cyprinodontiformes)

* Родина: Пецилієві (Poeciliidae)
** Рід: Гамбузія
*** Гамбузія західна, Gambusia affinis LC  (інтродукований)
** Рід: Poecilia
*** Гупі, Poecilia reticulata LC  (введений)
*** Молінезія, Poecilia sphenops LC  (введений на Хоккайдо)
** Рід: Xiphophorus
*** Зелений мечоносець, Xiphophorus hellerii LC  (введено)
*** Xiphophorus maculatus DD (інтродукований на острові Окінава, але популяція, можливо, вимерла)

Ряд: Елопоподібні (Elopiformes)
Індо-тихоокеанський тарпон

* Родина: Елопові (Elopidae)
** Рід: Елопс
*** Elops machnata LC
* Родина: Megalopidae
** Рід: Megalops
*** Megalops cyprinoides DD

Ряд: Колючкоподібні (Gasterosteiformes)
 Колючка триголкова 

* Родина: Колючкові (Gasterosteidae)
** Рід: Gasterosteus
*** Колючка триголкова, Gasterosteus aculeatus LC
*** Gasterosteus microcephalus
*** Gasterosteus nipponicus
** Рід: Pungitius
*** Pungitius kaibarae (МО: EX)
*** Колючка дев'ятиголкова, Pungitius pungitius LC
*** Колючка амурська, Pungitius sinensis VU
*** Колючка сахалінська, Pungitius tymensis DD  (МОН: VU)

Ряд: Гоноринхоподібні (Gonorynchiformes)
 Молочна риба

* Родина: Chanidae
** Рід: Chanos
*** Молочна риба, Chanos chanos LC

Ряд: Кефалоподібні (Mugiliformes)
Квадратнохвоста кефаль

* Родина: Кефалеві (Mugilidae)
** Рід: Cestraeus
*** Cestraeus plicatilis DD  (МО: ЧР)
** Рід: Chelon
*** Chelon melinopterus LC
*** Chelon subviridis LC  (МОН: DD)
** Рід: Ellochelon
*** Ellochelon vaigiensis LC  (МОН: DD)
** Рід: Crenimugil
*** Crenimugil crenilabis LC
*** Crenimugil heterocheilos LC (MoE: EN)
*** Crenimugil pedaraki(MoE: DD (як Moolgarda pedaraki))
*** Crenimugil seheli LC
** Рід: Osteomugil
*** Osteomugil engeli LC  (MoE: DD (як Moolgarda engeli))
** Рід: Planiliza
*** Planiliza macrolepis LC
** Рід: Valamugil
*** Valamugil buchanani LC

Ряд: Корюшкоподібні (Осмеріподібні)
Аю солодка рибка

* Родина: Корюшкові (Osmeridae)
** Рід: Hypomesus
*** Hypomesus nipponensis LC
*** Hypomesus olidus LC  (MoE: NT)
** Рід: Osmerus
*** Osmerus dentex LC
* Родина: Plecoglossidae
** Рід: Plecoglossus
*** Plecoglossus altivelis DD
** Рід: Spirinchus
*** Spirinchus lanceolatus
* Родина: Саланксові
** Рід: Neosalanx
*** Neosalanx reganius EN (ендемічний) (МО: ЧР)
** Рід: Salanx
*** Salanx ariakensis (МО: ЧР)

Ряд: Окунеподібні (Perciformes)
Японський окунь

* Родина: Ambassidae
** Рід: Ambassis
*** Ambassis dussumieri 
*** Ambassis interrupta  (MoE: DD)
*** Ambassis macracanthus  (MoE: DD)
*** Ambassis miops 
*** Ambassis urotaenia 
*** Ambassis vachellii 
** Рід: Pseudambassis
*** Pseudambassis ranga  (інтродукований on Okinawa Island)
* Родина: Apogonidae
** Рід: Apogon
*** Apogon amboinensis 
** Рід: Ostorhinchus
*** Ostorhinchus lateralis  (MoE: DD (як Fibramia lateralis))
** Рід: Pseudamia
*** Pseudamia amblyuroptera (MoE: DD)
** Рід: Yarica
*** Yarica hyalosoma  (MoE: CR)
* Родина: Blenniidae
** Рід: Omobranchus
*** Omobranchus elongatus  (MoE: DD)
*** Omobranchus ferox  (MoE: CR)
** Рід: Omox
*** Omox biporos  (MoE: CR)
* Родина: Carangidae
** Рід: Caranx
*** Caranx sexfasciatus 
* Родина: Centrarchidae
** Рід: Lepomis
*** Lepomis macrochirus  (інтродукований )
** Рід: Micropterus
*** Micropterus dolomieu  (інтродукований )
*** Micropterus salmoides  (інтродукований )
* Родина: Channidae
** Рід: Channa
*** Channa argus (інтродукований )
*** Channa asiatica  (інтродукований )
*** Channa maculata  (інтродукований )
* Родина: Cichlidae
** Рід: Amatitlania
*** Amatitlania nigrofasciata  (інтродукований )
** Рід: Oreochromis
*** Oreochromis mossambicus  (інтродукований )
*** Oreochromis niloticus  (інтродукований )
** Рід: Otopharynx
*** Otopharynx lithobates  (інтродукований on Okinawa Island)
** Рід: Tilapia
*** Tilapia zillii  (інтродукований )
* Родина: Eleotridae
** Рід: Belobranchus
*** Belobranchus belobranchus  (MoE: DD)
** Рід: Bostrychus
*** Bostrychus sinensis  (MoE: EN)
** Рід: Bunaka
*** Bunaka gyrinoides  (MoE: NT)
** Рід: Butis
*** Butis amboinensis  (MoE: CR)
*** Butis butis 
** Рід: Eleotris
*** Eleotris acanthopomus 
*** Eleotris fusca 
*** Eleotris melanosoma 
*** Eleotris oxycephala 
** Рід: Eugnathogobius
*** Eugnathogobius mindora  (MoE: NT)
** Рід: Hypseleotris
*** Hypseleotris cyprinoides  (MoE: EN)
** Рід: Ophiocara
*** Ophiocara porocephala  (MoE: VU)
* Родина: Epinephelidae
** Рід: Epinephelus
*** Epinephelus bontoides  (MoE: DD)
* Родина: Gerreidae
** Рід: Gerres
*** Gerres filamentosus 
* Родина: Gobiidae
** Рід: Acanthogobius
*** Acanthogobius flavimanus 
*** Acanthogobius hasta (ендемік) (MoE: VU)
*** Acanthogobius insularis  (ендемік) (MoE: VU)
** Рід: Acentrogobius
*** Acentrogobius audax  (MoE: NT)
*** Acentrogobius caninus  (MoE: NT)
*** Acentrogobius janthinopterus 
*** Acentrogobius suluensis (MoE: NT)
*** Acentrogobius viridipunctatus   (MoE: VU)
** Рід: Amblygobius
*** Amblygobius linki  (MoE: NT)
** Рід: Apocryptodon
*** Apocryptodon punctatus  (ендемік) (MoE: VU)
** Рід: Awaous
*** Awaous grammepomus 
*** Awaous melanocephalus
*** Awaous ocellaris
** Рід: Bathygobius
*** Bathygobius fuscus 
** Рід: Boleophthalmus
*** Boleophthalmus pectinirostris (MoE: EN)
** Рід: Caragobius
*** Caragobius urolepis  (MoE: VU)
** Рід: Chaenogobius
*** Chaenogobius annularis 
** Рід: Cristatogobius
*** Cristatogobius aurimaculatus (MoE: CR)
*** Cristatogobius lophius (MoE: EN)
*** Cristatogobius nonatoae (MoE: CR)
** Рід: Eutaeniichthys
*** Eutaeniichthys gilli (MoE: NT)
** Рід: Eviota
*** Eviota ocellifer  (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Exyrias
*** Exyrias puntang 
** Рід: Favonigobius
*** Favonigobius reichei 
** Рід: Glossogobius
*** Glossogobius aureus  (MoE: CR)
*** Glossogobius bicirrhosus  (MoE: CR)
*** Glossogobius circumspectus  (MoE: NT)
*** Glossogobius giuris 
*** Glossogobius illimis 
*** Glossogobius olivaceus 
** Рід: Gobiodon
*** Gobiodon rivulatus 
** Рід: Gymnogobius
*** Gymnogobius breunigii 
*** Gymnogobius castaneus  (MoE: NT)
*** Gymnogobius cylindricus  (ендемік) (MoE: EN)
*** Gymnogobius isaza  (ендемік) (MoE: CR)
*** Gymnogobius macrognathos (MoE: VU)
*** Gymnogobius mororanus (MoE: DD)
*** Gymnogobius nakamurae (MoE: CR)
*** Gymnogobius petschiliensis
*** Gymnogobius scrobiculatus  (ендемік) (MoE: EN)
*** Gymnogobius taranetzi  (MoE: VU)
*** Gymnogobius uchidai  (ендемік) (MoE: VU)
*** Gymnogobius opperiens
*** Gymnogobius urotaenia
** Рід: Gobitrichinotus
*** Gobitrichinotus radiocularis  (MoE: NT)
** Рід: Istigobius
*** Istigobius ornatus 
** Рід: Lentipes
***  Lentipes armatus (MoE: CR)
** Рід: Leucopsarion
*** Leucopsarion petersii (MoE: VU)
** Рід: Luciogobius
*** Luciogobius albus  (ендемік) (MoE: CR)
*** Luciogobius dormitoris  (ендемік) (MoE: DD)
*** Luciogobius fluvialis  (ендемік) (MoE: NT)
*** Luciogobius fonticola  (ендемік) (MoE: NT)
*** Luciogobius guttatus
*** Luciogobius pallidus  (ендемік) (MoE: NT)
*** Luciogobius ryukyuensis  (ендемік) (MoE: VU)
** Рід: Mangarinus
*** Mangarinus waterousi 
** Рід: Mugilogobius
*** Mugilogobius cavifrons  (MoE: EN)
*** Mugilogobius chulae 
*** Mugilogobius fuscus  (MoE: DD)
*** Mugilogobius mertoni  (MoE: VU)
** Рід: Odontamblyopus
*** Odontamblyopus lacepedii (MoE: VU)
** Рід: Oligolepis
*** Oligolepis acutipennis 
*** Oligolepis stomias 
** Рід: Oxyurichthys
*** Oxyurichthys takagi  (MoE: CR)
** Рід: Pandaka
*** Pandaka lidwilli (MoE: VU)
** Рід: Parkraemeria
*** Parkraemeria saltator  (ендемік) (MoE: VU)
** Рід: Periophthalmus
*** Periophthalmus argentilineatus 
*** Periophthalmus modestus (MoE: NT)
** Рід: Psammogobius
*** Psammogobius biocellatus 
** Рід: Pseudapocryptes
*** Pseudapocryptes elongatus 
** Рід: Pseudogobius
*** Pseudogobius masago (MoE: VU)
*** Pseudogobius melanosticta  (MoE: DD (як Pseudogobius gastrospilos))
*** Pseudogobius poicilosoma 
** Рід: Redigobius
*** Redigobius balteatus  (ендемік) (MoE: DD)
*** Redigobius bikolanus 
** Рід: Rhinogobius
*** Rhinogobius biwaensis  (ендемік) (MoE: DD)
*** Rhinogobius brunneus 
*** Rhinogobius flumineus
*** Rhinogobius fluviatilis
*** Rhinogobius giurinus 
*** Rhinogobius kurodai
*** Rhinogobius mizunoi
*** Rhinogobius nagoyae
*** Rhinogobius ogasawaraensis  (ендемік) (MoE: EN)
*** Rhinogobius telma (MoE: NT)
*** Rhinogobius tyoni (MoE: NT)
** Рід: Scartelaos
*** Scartelaos histophorus  (MoE: CR)
** Рід: Schismatogobius
*** Schismatogobius ampluvinculus  (MoE: EN)
*** Schismatogobius marmoratus 
*** Schismatogobius roxasi  (MoE: EN)
** Рід: Sicyopterus
*** Sicyopterus japonicus
*** Sicyopterus lagocephalus  (MoE: VU)
*** Sicyopterus macrostetholepis
** Рід: Sicyopus
*** Sicyopus auxilimentus  (MoE: DD)
*** Sicyopus zosterophorus  (MoE: CR)
** Рід: Silhouettea
*** Silhouettea dotui  (ендемік) (MoE: NT)
** Рід: Smilosicyopus
*** Smilosicyopus leprurus  (ендемік) (MoE: CR)
** Рід: Stenogobius
*** Stenogobius ophthalmoporus  (MoE: DD)
** Рід: Stiphodon
*** Stiphodon alcedo (MoE: CR)
*** Stiphodon atropurpureus  (MoE: CR)
*** Stiphodon imperiorientis  (ендемік) (MoE: CR)
*** Stiphodon multisquamus  (MoE: DD)
*** Stiphodon niraikanaiensis (MoE: DD)
*** Stiphodon percnopterygionus 
*** Stiphodon surrufus  (MoE: DD)
** Рід: Taenioides
*** Taenioides anguillaris 
*** Taenioides cirratus  (MoE: EN)
** Рід: Tridentiger
*** Tridentiger barbatus
*** Tridentiger brevispinis
*** Tridentiger bifasciatus 
*** Tridentiger kuroiwae  (ендемік)
*** Tridentiger nudicervicus (MoE: NT)
*** Tridentiger obscurus
*** Tridentiger trigonocephalus 
** Рід: Trypauchen
*** Trypauchen vagina 
** Рід: Trypauchenopsis
*** Trypauchenopsis intermedia  (MoE: VU)
** Рід: Yongeichthys
*** Yongeichthys nebulosus 
* Родина: Haemulidae
** Рід: Plectorhinchus
*** Plectorhinchus albovittatus (MoE: DD)
*** Plectorhinchus gibbosus 
* Родина: Kraemeriidae
** Рід: Kraemeria
*** Kraemeria tongaensis  (MoE: DD)
* Родина: Kuhliidae
** Рід: Kuhlia
*** Kuhlia marginata 
*** Kuhlia mugil 
*** Kuhlia munda  (MoE: EN)
*** Kuhlia rupestris 
* Родина: Lateolabracidae
** Рід: Lateolabrax
*** Lateolabrax japonicus
* Родина: Latidae
** Рід: Lates
*** Lates calcarifer 
*** Lates japonicus  (ендемік) (MoE: EN)
* Родина: Leiognathidae
** Рід: Aurigequula
*** Aurigequula fasciata 
** Рід: Equulites
*** Equulites leuciscus 
** Рід: Eubleekeria
*** Eubleekeria splendens 
** Рід: Gazza
*** Gazza minuta 
** Рід: Leiognathus
*** Leiognathus equulus 
* Родина: Lutjanidae
** Рід: Lutjanus
*** Lutjanus ehrenbergii 
*** Lutjanus fulvus 
*** Lutjanus goldiei (MoE: CR)
* Родина: Microdesmidae
** Рід: Parioglossus
*** Parioglossus caeruleolineatus  (ендемік) (MoE: DD)
*** Parioglossus formosus 
*** Parioglossus lineatus  (MoE: DD)
*** Parioglossus interruptus (MoE: CR)
*** Parioglossus palustris  (MoE: VU)
*** Parioglossus rainfordi  (MoE: EN)
*** Parioglossus raoi 
*** Parioglossus taeniatus  (MoE: CR)
* Родина: Monodactylidae
** Рід: Monodactylus
*** Monodactylus argenteus 
* Родина: Odontobutidae
** Рід: Micropercops
*** Micropercops swinhonis 
** Рід: Odontobutis
*** Odontobutis hikimius  (ендемік) (MoE: VU)
*** Odontobutis obscura
* Родина: Osphronemidae
** Рід: Macropodus
*** Macropodus ocellatus (інтродукований )
*** Macropodus opercularis  (інтродукований ?) (MoE: CR)
* Родина: Pomacentridae
** Рід: Pomacentrus
*** Pomacentrus taeniometopon 
* Родина: Rhyacichthyidae
** Рід: Rhyacichthys
*** Rhyacichthys aspro  (MoE: CR)
* Родина: Scatophagidae
** Рід: Scatophagus
*** Scatophagus argus 
* Родина: Scombridae
** Рід: Scomberomorus
*** Scomberomorus sinensis 
* Родина: Sillaginidae
** Рід: Sillaginops
*** Sillaginops macrolepis (MoE: EN)
** Рід: Sillago
*** Sillago parvisquamis  (MoE: CR)
* Родина: Sinipercidae
** Рід: Coreoperca
*** Coreoperca kawamebari (MoE: EN)
* Родина: Sparidae
** Рід: Acanthopagrus
*** Acanthopagrus latus 
*** Acanthopagrus pacificus  (MoE: VU)
*** Acanthopagrus sivicolus 
* Родина: Terapontidae
** Рід: Mesopristes
*** Mesopristes argenteus  (MoE: CR)
*** Mesopristes cancellatus  (MoE: CR)
*** Mesopristes iravi  (MoE: CR)
** Рід: Terapon
*** Terapon jarbua 
* Родина: Toxotidae
** Рід: Toxotes
*** Toxotes jaculatrix  (MoE: CR)
* Родина: Tripterygiidae
** Рід: Enneapterygius
*** Enneapterygius cheni  (MoE: CR)

Ряд: Камбалоподібні (Pleuronectiformes)
Зірчаста камбала

* Родина: Камбалові (Pleuronectidae
** Рід: Platichthys
*** Камбала зірчаста, Platichthys stellatus LC
* Родина: Язикові (Soleidae)
** Рід: Brachirus
*** Brachirus orientalis LC

Ряд: Лососеподібні
Сахалінський таймень

* Родина: Лососеві
** Рід: Hucho
*** Сахалінський таймень, Hucho perryi CR (MoE: EN)
** Рід: Oncorhynchus
*** Горбуша, Oncorhynchus gorbuscha
*** Oncorhynchus iwame DD (ендемічний)
*** Oncorhynchus kawamurae EW (ендемічний) (МНС: EW)
*** Кета, Oncorhynchus keta
*** Сима, Oncorhynchus masou
*** Райдужна форель, Oncorhynchus mykiss (введено)
*** Нерка, Oncorhynchus nerka LC (МО: ЧР)
*** Форель Біва, Oncorhynchus rhodurus
** Рід: Salmo
*** Струмкова форель, Salmo trutta LC (введено)
** Рід: Salvelinus
*** Палія американська, Salvelinus fontinalis (введено)
*** Salvelinus japonicus EN (ендемічний)
*** Salvelinus leucomaenis
*** Мальма, Salvelinus malma
*** Salvelinus namaycush (введено)

Ряд: Скорпеноподібні
Скульптор з грубої шкіри

* Родина: Бабцеві (Cottidae)
** Рід: Cottus
*** Cottus amblystomopsis LC
*** Cottus czerskii LC
*** Cottus hangiongensis
*** Cottus kazika LC  (ендемічний) (MoE: VU)
*** Cottus nozawae LC
*** Cottus pollux LC  (ендемічний) (MoE: NT)
*** Cottus reinii LC  (ендемічний) (MoE: EN)
** Рід: Trachidermus
*** Trachidermus fasciatus (MoE: EN)
* Родина: Tetrarogidae
** Рід: Тетрароге
*** Tetraroge barbata LC  (МО: CR)
*** Tetraroge nigra LC  (МО: CR)
* Родина: Триглові (Triglidae)
** Рід: Chelidonichthys
*** Chelidonichthys kumu LC

Ряд: Сомоподібні (Siluriformes)
Амурський сом

* Родина: Amblycipitidae
** Рід: Liobagrus
*** Liobagrus reinii LC  (ендемічний) (MoE: VU)
* Родина: Bagridae
** Рід: Leiocassis
*** Leiocassis longirostris DD
** Рід: Tachysurus
*** Tachysurus aurantiacus NT  (ендемічний) (MoE: VU)
*** Tachysurus fulvidraco LC  (введено)
*** Tachysurus ichikawai VU  (ендемічний) (MoE: EN)
*** Tachysurus nudiceps
*** Tachysurus tokiensis LC (ендемічний) (MoE: VU)
* Родина: Clariidae
** Рід: Clarias
*** Кларій ходячий, Clarias batrachus LC  (введено)
*** Clarias fuscus LC  (введено)
* Родина: Ictaluridae
** Рід: Ictalurus
*** Канальний сом, Ictalurus punctatus LC  (введено)
* Родина: Loricariidae
** Рід: Pterygoplichthys
*** Pterygoplichthys disjunctivus (інтродукований на острові Окінава)
* Родина: Siluridae
** Рід: Silurus
*** Сом амурський, Silurus asotus LC
*** Сом озера Біва, Silurus biwaensis
*** Silurus lithophilus VU  (ендемічний) (MoE: NT)

Ряд: Цілозябровикоподібні (Synbranchiformes)
 Вугор рисовий

* Родина: Synbranchidae
** Рід: Monopterus
*** Вугор рисовий, Monopterus albus LC
*** Monopterus javanensis LC

Загін: Іглицеподібні (Syngnathiformes)
Сітчаста прісноводна риба трубочка

* Родина: Іглицеві (Syngnathidae)
** Рід: Hippichthys
*** Hippichthys cyanospilos LC
*** Hippichthys heptagonus LC  (MoE: EN)
*** Hippichthys penicillus LC
*** Hippichthys spicifer LC
** Рід: Microphis
*** Microphis argulus LC  (МО: ЧР)
*** Microphis brachyurus LC
*** Microphis jagorii DD  (МО: ЧР)
*** Microphis leiaspis LC  
*** Microphis retzii LC  (МО: ЧР)
** Рід: Syngnathus
*** Тихоокеанська іглиця, Syngnathus schlegeli LC

Ряд: Скелезубоподібні (Tetraodontiformes)
 Аротрон колючий

* Родина: Скелезубові (Tetraodontidae)
** Рід: Arothron
*** Аротрон колючий, Arothron hispidus LC
*** Arothron immaculatus LC
** Рід: Chelonodon
*** Chelonodon patoca LC
** Рід: Lagocephalus
*** Lagocephalus sceleratus LC
** Рід: Takifugu
*** Takifugu alboplumbeus LC
*** Takifugu ocellatus NT
*** Takifugu obscurus LC
*** Takifugu poecilonotus LC

Примітки


Посилання

*  Invasive Species of Japan: Fishes
*  Eschmeyer's Catalog of Fishes
* (in Japanese)  List of Japan's All Fish Species


Я