أقرب تاريخ مسجل في المنطقة يعود إلى حوالي سنة 500 قبل الميلاد عندما كان أغلب -إن لم يكن كلها- طاجيكستان الحديثة جزءا من الإمبراطورية الأخمينية. 
وقد اقترح بعض الكتاب أيضا أنه في القرن السادس والسابع قبل الميلاد أجزاء من طاجيكستان الحديثة، بما في ذلك الأراضي في وادي زرافشان تشكل جزءا من كامبوجاز (قبيلة من العصر الحديدي الهندي) قبل أن تصبح جزءا من الإمبراطورية الأخمينية. بعد غزو المنطقة من قبل الإسكندر الأكبر أصبحت جزءا من المملكة الإغريقية البخترية الدولة التي ورثت امبراطورية الاسكندر.شمال طاجيكستان (المدن خوجاند وبنجكنت) كانت جزءا من سوقديانا، مجموعة من الدويلات التي سيطر عليها القبائل البدوية السكوثيون واليوتشي حوالي 150 قبل الميلاد.مر طريق الحرير عبر المنطقة، وبعد غزوة المستكشف الصيني تشانغ تشيان في عهد الإمبراطور وو (141-87 قبل الميلاد) وازدهرت العلاقات التجارية بين مملكة هان الصينية وسوقديانا.
حكمت ألكسندرا العظمى على أي مملكة؟