يحمل الجهاز نظاماً يدعى "نظام تشغيل البلاي ستيشن 3". يستطيع مستخدم البلاي ستيشن 3 أن يحمل الترقية الجديدة لبرنامج نظام البلاي ستيشن 3 مباشرة للجهاز من خلال شبكة البلاي ستيشن (بالإنجليزية: PlayStation Network) وأيضاً من خلال موقع البلاي ستيشن 3 نفسه ثم نقل الترقية الحديثة من خلال يو إس بي إلى نظام الجهاز. تقبل بعض إصدارات الجهاز تحميل أنظمة تشغيل أخرى عليها، مثل نظام تشغيل لينكس، لكن تم إيقاف هذه الميزة بشكل رسمي في أبريل من سنة 2010، أي حين أطلق الإصدار 3.21 من النظام.
ما سوف استعادة بشكل صحيح؟