Successivamente l'Istria venne annessa al Regno longobardo sotto re Astolfo.
Quando nel 774 Carlo Magno divenne re dei Longobardi, dopo aver sconfitto re Desiderio, l'Istria restò autonoma fino a che non venne conquistata nel 788 da Pipino, figlio di Carlo.
Durante l'età carolingia la marca d'Istria, inclusa Pirano, fu parte del "Regnum Italiae", restando a lungo nell'orbita della marca di Verona.
Allorché Trieste divenne il porto principale dei domini degli Asburgo, il declino di Venezia segnò anche il regresso dell'industria salinaria e per Pirano iniziò una lenta parabola discendente, finché - dopo la caduta della Serenissima nel 1797 - passò all'Austria, salvo una breve parentesi napoleonica, durante la quale fu sottomessa al distretto di Capodistria.