Federico permise a Monza anche il diritto, solitamente concesso solo alle città di "sede regia", di riscuotere tasse doganali.
Nel periodo delle lotte contro Milano e le altre città della Lega, Monza  era soprattutto un centro amministrativo per il Barbarossa.
Questo periodo della storia monzese dura fino al 1185 quando il Barbarossa conclude la pace di Costanza con i rappresentanti dei Comuni della Lega Lombarda.
L'epoca del Ducato di Milano cominciò con i Visconti.