La Stewart era amica del fondatore di ImClone, Samuel Waksal , il quale da quel momento si dichiarò colpevole per sei capi d'accusa relativi a "insider trading" precedenti l'annuncio.
Il 6 giugno 2002, lo U.S. House Energy and Commerce Committee, che già indagava sui dubbi affari di ImClone, annunciò che stava investigando sul capitale della Stewart.
Il 3 ottobre 2002 la Stewart si dimise dal consiglio d'amministrazione della Borsa di New York.
Nonostante tutte le indagini e l'accusa, la Stewart mantenne intatta la sua immagine pubblica, concentrandosi sul suo lavoro e ignorando il clamore per lo scandalo.