L'altra teoria, più puntata verso l'inizio dell'alto Medioevo, coinvolge un frammento di scultura e il capitello della bifora presenti in facciata.
In ogni caso secondo questa teoria la parte più antica sarebbe del X o XI secolo e non esclude che prima di questa chiesa ce ne fosse un'altra.
L'edificio viene citato per la prima volta nel XII secolo come "Sancti Petri in Monasterio", anche se non si sa se si tratti effettivamente del Céson, in una bolla del 1146 di Papa Eugenio III diretta al vescovo di Verona Tebaldo II.
C'è inoltre un'ulteriore teoria, che riporterebbe l'origine al IX secolo, secondo la quale la presenza della chiesa viene citata già nell'807 sotto il nome di San Pietro di Moratica, in una possibile dipendenza signorile di San Pietro in Valle rispetto a Moratica, località 5 km più a nord, ereditata o costituita dalla fiscalità carolingia.