Il figlio divenne poi presbitero nel 1825 ed ebbe, come primo incarico, quello di "vicar"" "di Saint Clement, una parrocchia facente parte di Oxford.
Nel corso di questi anni, il giovane studente evangelico cominciò ad osservare il pluralismo intellettuale vigente nell'ateneo, entrando lentamente in contatto con il gruppo dei teologi liberali, detti "noetics", che cercavano di spiegare razionalmente i dogmi e la fede cristiana.
Tra questi spiccavano come figure Edward Hawkins e Richard Whately, che istruirono lentamente Newman nel valore della "Chiesa visibile", nel valore dei sacramenti, in special modo la successione apostolica.
Quando fu ordinato sacerdote, Newman conosceva già da tre anni Whately, e aveva cominciato a maturare quei primi dubbi dottrinali impartitegli da Mayers ad Ealing.