Ma pian piano, le meraviglie dovevano lasciare spazio ai dubbi su come fosse stato descritto il mondo nella Bibbia e nei testi classici.
Aldovandri vedeva la necessità di cambiare e di ricomporre il sapere.
Il suo primo lavoro è stato dividere i suoi 18.000 esemplari in Naturalia e in Artificialia, quindi cose fatte dalla natura e cose fatte dall'uomo.
Ed eccoci subito arrivati agli ultimi 200 anni, quelli moderni, quelli cosiddetti illuminati, dove troviamo... musica, Haydn!