Questo schema lo mise in conflitto con più di una corporazione privilegiata, ma in particolare con il suo stesso ordine, che contestò vigorosamente la sua pretesa di esercitare il diritto di ispezione nelle sue comunità.
La disputa si surriscaldò dal 1239 al 1245.
Venne condotta da ambo le parti con indecorosa violenza, e quelli che più avevano approvato lo scopo principale di Grossatesta, ritennero necessario avvertirlo dell'errore commesso nell'essere troppo zelante.
Ma almeno fino al 1247 si sottomise pazientemente alle interferenze papali, accontentandosi della protezione  della sua diocesi da chierici stranieri.