Ciò che i programmatori di Quality Computers si trovarono di fronte fu invece un codice sorgente pieno di errori, documentato in maniera incompleta e che non era compilabile nella sua forma originale ma solo rimuovendo alcune sue parti e modificandone altre.
Anche così i file che AppleWorks GS salvava non erano identici a quelli generati dalla versione 1.1 della suite che era stata rilasciata in precedenza da Claris.
Essi giunsero quindi alla conclusione che la suite era stata compilata una parte alla volta e che poi i risultanti file binari fossero stati unificati per creare l'eseguibile finale.
Con la versione 3.0 di ClarisWorks vennero aggiunti gli assistenti, che erano delle componenti simili alle Wizard di Microsoft Office.