Pochi mesi dopo, nei Ducati, ha fine il dominio nobiliare.
Dopo la partenza in esilio del duca Francesco V, viene nominato regio commissario di Modena.
L'incarico doveva essere provvisorio, ma Farini riesce a convincere il governo piemontese a rimanere.
Il 24 marzo viene ricompensato per i suoi servigi con la nomina a ministro dell'Interno del terzo governo Cavour.