Lentamente ma progressivamente, spostò gli interessi della Toscana lontano dall'egemonia asburgica sposando la prima candidata moglie non asburgica dall'epoca di Alessandro de Medici, Cristina di Lorena, nipote di Caterina de Medici, regina di Francia.
La reazione spagnola  fu la costruzione di una cittadella fortificata sull'isola d'Elba.
Per rafforzare questo nuovo orientamento della diplomazia della Toscana, fece sposare la figlia minore del defunto Francesco, Maria, col re Enrico IV di Francia.
Enrico, dal canto suo, esplicitò la sua intenzione di difendere la Toscana ad ogni costo, in particolare dalle possibili aggressioni della Spagna.