Trovò le casse dello Stato vuote: il poco che i francesi avevano lasciato era stato sperperato dai napoletani.
In agosto nominò Ercole Consalvi, cui in gran parte doveva la tiara, cardinale diacono e Segretario di Stato.
Nella scelta del nuovo segretario, Pio VII non si fece influenzare dalle potenze straniere, specialmente dall'Impero austriaco, che voleva fosse nominato un prelato di proprio gradimento.
Il pontefice iniziò a occuparsi alacremente delle riforme amministrative, divenute ormai improrogabili.