Alessandro comminò la scomunica e l'interdetto contro Manfredi e la sua fazione, ma ciò non servì a indebolirlo.
Tantomeno poté arruolare i re d'Inghilterra e di Norvegia in una crociata contro gli Hohenstaufen.
Una volta assicuratasi la fedeltà della colonia saracena, Manfredi, chiamato anche "Sultano di Lucera" , poté arruolare un ingente esercito e muovere guerra all'esercito pontificio, che sconfisse presso Foggia.
Nei primi anni 2000 si sono riaperte le ricerche per il ritrovamento della tomba del pontefice, con un progetto internazionale diretto dall'Istituto "Alessandro IV", una struttura creata da liberi ricercatori europei al fine di coordinare e dirigere progetti di ricerca scientifica.