Gravemente danneggiata durante la grande guerra, fu nuovamente ricostruita, ma durante i lavori fu trafugata un"Apoteosi di san Marco" di Palma il Giovane.
Tra le opere ancora conservate, si ricordano alcune tele attribuite a Palma il Giovane e a Francesco Salviati, i quattro altari barocchi, una "Madonna" di Jacopo Bassano, una "Discesa agli Inferi" di Domenico Tintoretto, una "Trasfigurazione" di Cima da Conegliano e una lapide funeraria romana.
Nella chiesa fu assunto un atto di Ezzelino III da Romano con il quale egli rinunciava alle "advocatie episcopatus Belluni".
La chiesa ospitò in passato importante altare di Tommaso Allio che le valse il titolo di Monumento Nazionale, perduto con la parziale distruzione della chiesa e con il danneggiamento dell'altare.