I Sabaudi, con l'aiuto degli Spagnoli, tentano più volte di rimpadronirsene, invano, e compiono diversi massacri.
In uno degli ultimi attacchi la città di Gex è incendiata due volte, il 23 e 30 luglio 1590, lasciando indenni solo poche case.
Le mura che proteggevano la cittadina dal 1550 sono state distrutte in questi anni.
Nel 1923 è morto a Gex sulla strada nazionale 05, il pilota automobilistico italiano Evasio Lampiano.