Pertanto è condannato il 4 ottobre 2011 a quattro anni di prigione.
Durante il suo mandato, Flosse sviluppa anche un servizio di sicurezza  di diverse centinaia di agenti, e un servizio di re-insegnamento .
È stato condannato in appello il 28 ottobre 2010 per aver intrapreso "una sistematica impresa di distruzione" dei documenti del SED.
È inoltre oggetto di diverse altre condanne per appropriazione indebita di fondi pubblici, alcune delle quali ancora in corso nel 2012.