Anche il motore del gioco fu progettato per essere più adatto alla visualizzazione delle mappe 3D e alle arene di battaglia.
Takahashi desiderava creare il gioco interamente in 3D, ma le capacità della PlayStation impedivano di gestirlo, richiedendo pertanto di utilizzare sprite bidimensionali su sfondi 3D.
I temi e la storia furono fortemente influenzati dalle opere e dalla filosofia di Friedrich Nietzsche, Sigmund Freud e Carl Jung.
Square Enix ha pubblicato "Xenogears" sul PlayStation Network giapponese il 25 giugno 2008 e in Nord America il 22 febbraio 2011..