Le zone di media altitudine sono caratterizzate da foreste miste decidue  e foreste di pino silvestre  e di pino nero .
Boscaglie relitte di ginepro , presenti in numerose aree della Spagna centrale e del Nordafrica, compaiono in poche aree dei Pirenei settentrionali.
Le foreste di alta montagna sono costituite soprattutto da boschetti misti di faggio  e abete bianco ; il pino uncinato  compare soprattutto nelle regioni interne caratterizzate da un clima più continentale.
I prati alpini che si trovano al di sopra della linea degli alberi ospitano molte specie endemiche e relitte.