Favaro ne fu il curatore, con la collaborazione di Isidoro Del Lungo e Umberto Marchesini.
Il primo volume fu pubblicato a Firenze dalla tipografia Barbera nel 1890; il completamento del progetto richiese quasi vent'anni e fu portato a termine, con l'uscita del ventesimo volume, nel 1909.
Il criterio ispiratore fu quello di raccogliere e riprodurre nel modo più completo, fedele e accurato possibile tutti gli scritti di Galileo, presentati in ordine strettamente cronologico, e di includere anche scritti di altri autori coevi  che ebbero legami con lui, nonché reperti d'archivio, per documentare anche il contesto storico e culturale.
Tuttavia l'ampiezza e la qualità della sua opera di ricostruzione documentaria costituirono un contributo di grande importanza per la comprensione dell'opera di Galileo e dell'ambiente in cui si sviluppò.