Negli ultimi anni si è consumato il suo progressivo ritiro dalla vita pubblica, dovuto principalmente alle sue condizioni di salute.
Nel 2003 morì il marito Denis.
La Thatcher è apparsa poco in pubblico negli anni 2000, a causa di alcuni infarti e ictus che l'hanno colpita, nonché della malattia di Alzheimer di cui era sofferente da tempo.
I sondaggi di opinione nel settembre 1990 mostrarono che i Labour avevano raggiunto un vantaggio del 14% sui Tories e da novembre i Tories avevano trascinato i Labour per 18 mesi.