Le analisi includeranno la mappatura di Plutone e di Caronte a lungo raggio a di risoluzione, che avverrà 3,2 giorni dopo il sorvolo degli oggetti.
Durante le osservazioni, sfruttando la rotazione dei due corpi, si potrà ottenere una mappa priva di zone d'ombra.
È previsto che l'avvicinamento a Plutone avvenga a fino ad una distanza di , mentre quello di Caronte avverrà a ; questi parametri possono tuttavia subire modifiche durante la missione.
Durante il sorvolo le strumentazioni riprenderanno le immagini con una risoluzione massima di /pixel, a quattro colori, una mappa globale con risoluzione di , nella banda dell'infrarosso una mappa da /pixel globalmente o localmente di , per poter definire l'atmosfera dei pianeti.