II caso Mortara passò attraverso queste contraddizioni dottrinali e in questa situazione il papa pronunciò il suo "non possumus" .
Essendo il battesimo religiosamente valido, da un punto di vista cattolico era dovere del Papa garantire al bambino un'educazione cristiana, non considerando né la non consapevolezza del bimbo quando ricevette il battesimo né il desiderio e la religiosità della sua famiglia d'origine.
Si cercò inizialmente un compromesso con i Mortara: si provò a convincerli a far entrare il ragazzo in un collegio di Bologna: così sarebbe rimasto a contatto con la famiglia e a 17 anni avrebbe deciso il suo futuro, liberamente.
In Francia Edgardo venne ordinato prete all'età di ventitré anni e adottò il nome di Pio.