L'inizio della stagione fu analogo alla precedente, con Alonso in grado di ottenere risultati positivi con grande costanza e Fisichella meno costante, anche se a volte abbastanza veloce da risultare vincente.
Il romano vinse il Gran Premio della Malesia, mentre il compagno di squadra vinse sei delle prime 9 gare, ottenendo il secondo posto nelle tre gare che non vinse.
A metà stagione il vantaggio di Alonso su Schumacher era di 25 punti.
Dopo la pubblicazione dell'ultimo libro la Rowling ha rivelato di aver preso in considerazione l'idea di farlo morire, sostenendo però che ciò era dovuto allo star affrontando un brutto periodo e di essersi pentita di aver fatto sposare lui, invece di Harry, con Hermione.