Nello stesso periodo, la chiesa di Sant'Ippolisto ottenne una temporanea indipendenza dal clero avellinese.
Sei anni dopo cadde la tribuna della chiesa e di conseguenza la volta centrale dello "specus" cedette.
Nel 1728 fu aggiunta la cappella del Tesoro, che il barone Di Donato sfruttò per conservare gli scheletri dei martiri .
Alcuni studi portarono alla scoperta di un cimitero paleocristiano sito a pochi metri dalla chiesa.