In seguito il primo muro fu abbattuto e oggi è difficile riconoscere parti di quel muro.
Nel 1965 si diede inizio alla costruzione della terza generazione del muro che avrebbe soppiantato le precedenti.
Era composto da lastre di cemento armato collegate da montanti di acciaio e coperti da un tubo di cemento.
La prima persona a perdere la vita tentando la fuga fu Ida Siekmann, che il 22 agosto 1961 provò a raggiungere Berlino Ovest saltando dal suo appartamento nella Bernauer Straße.