Ebbe quindi inizio una battaglia tra le truppe italiane e le truppe tedesche, con la perdita da parte italiana di soldati e 65 tra ufficiali e sottufficiali.
Le truppe italiane, attaccate anche dal cielo dalla Luftwaffe e rimaste senza rifornimenti, dopo pochi giorni furono costrette alla resa.
L'epilogo fu la rappresaglia tedesca con la fucilazione di circa militari e di gran parte degli ufficiali italiani , in quello che è noto come l'eccidio di Cefalonia.
I pochi militari superstiti alla strage furono deportati prigionieri in Germania.