নীলম নদীটি শহরের মাঝখান দিয়ে বয়ে গেছে, ঝিলম ও ডোমেল নদী যৌথভাবে গুরুত্বপূর্ন ভূমিকা পালন করে মুজাফফরের ছোট আবহাওয়াতে।
The Neelum river streams through the town, joins river Jhelum at Domel and plays a dominant role in the microclimate of Muzaffarabad.