Danau Tanganyika
Danau ini berada di Western Rift di daerah Great Rift Valley dan dilingkupi oleh dinding pegunungan dari ngarai tersebut. Danau ini merupakan danau ngarai terbesar dan terdalam di Afrika atau nomor 2 terdalam di dunia serta menyimpan cadangan air tawar terbesar. Panjangnya membentang sekitar 673km pada arah Utara-Selatan dan lebar rata-rata 50km. Danau ini melingkupi area seluas 32,900 km², dengan panjang garis tepi sebesar 1,828km serta kedalaman rata-rata 570 m dengan kedalaman maksimum 1,470 m (di cekungan paling utara) menyimpan cadangan air dengan volume perkiraan sebesar 18,900 km³. Suhu di permukaannya sekitar 25°C dan mempunyai pH rata-rata 8.4.
Danau Memphremagog
Pada tahun 1994, sebuah Asosiasi Daerah Aliran Sungai Danau Memphremagog dibentuk untuk fokus pada pemecahan masalah danau dan sungai. Pengujian dilakukan pada tahun 2008 yang tidak dapat menentukan penyebab nitrogen dan fosfor yang berlebihan. Pada tahun 2010, sebuah studi mengungkapkan bahwa peternakan menyumbangkan beban nutrisi yang tidak proporsional. Meskipun peternakan memiliki 16% dari keseluruhan penggunaan lahan di daerah drainase, mereka menghasilkan 44% dari limpasan tersebut. Nutrisi maksimum pada suatu danau adalah 14 mikrogram fosfor per liter air. Sedangkan danau ini terukur pada 17 mikrogram, 18% di atas normal. Meskipun areal dikhususkan untuk pertanian telah menurun, tanah bekas pertanian tersebut paling sering dikembangkan sendiri yang merupakan sumber limpasan.