Perang Ōnin
Perang antara Pasukan Timur dan Pasukan Barat makin sulit karena kelompok-kelompok militer dari kedua belah pihak, demi keuntungan sendiri, berulang kali membelot ke pihak musuh. Sebagian di antaranya kemudian kembali membelot ke pasukan asal. Dalam keadaan tersebut, hanya sedikit kelompok yang benar-benar berusaha memenangkan perang. Perang Pasukan Timur melawan Pasukan Barat berakhir dalam keadaan tidak ada pihak yang kalah atau menang. Jenderal Ashigaru Honekawa Dōken dari Pasukan Timur mencoba mencari nama dengan mengacau di garis belakang dengan taktik perang gerilya. Namun sebagian besar pasukannya adalah pelaku kriminal, termasuk kelompok perampok dan penjahat, sehingga perang tidak juga bisa diakhiri.
Pertempuran Okinawa
Pada beberapa pertempuran, seperti Pertempuran Iwo Jima, warga sipil tidak ada yang terlibat, tetapi Okinawa memiliki warga sipil penduduk asli Okinawa dalam jumlah besar. Menurut berbagai perkiraan, kira-kira antara sepersepuluh dan sepertiga dari warga asli Okinawa tewas selama pertempuran.[21] Kerugian warga sipil Okinawa dalam pertempuran ini diperkirakan antara 42.000 dan 150.000 tewas (lebih dari 100.000 warga tewas menurut Pemerintah Prefektur Okinawa).[33] Angka-angka statistik Angkatan Darat Amerika Serikat menunjukkan total 142.058 warga sipil tewas, termasuk warga yang dipaksa menjalani dinas militer oleh Angkatan Darat Kekaisaran Jepang.[21]