Penduduk asli Taiwan
Meskipun Pusat Informasi pemerintah Republik Tiongkok secara resmi mengangkat 14 kelompok utama sebagai "suku", konsensus beberapa sarjana menyatakan bahwa 14 kelompok tersebut tidak menunjukan entitas sosial apapun, kolektivitasan politik, atau aliansi pengidentifikasian diri yang berasal dari Taiwan pada masa pra-modern.[20] Catatan-catatan terawal yang mendetail, yang berasal dari kedatangan Belanda pada 1624, menyatakan bahwa penduduk-penduduk asli tinggal di desa-desa terpisah dengan berbagai ukuran. Antara desa-desa tersebut, terjadi perdagangan, pernikahan silang, peperangan dan aliansi melawan musuh besar. Menggunakan kriteria etnografi dan linguistik kontemporer, desa-desa tersebut diklasifikasikan dalam lebih dari 20 kelompok etnis (dan sebagian besar diperdebatkan),[21][22] yang tak pernah disatukan di bawah negara, kerajaan atau "suku" umum.[23]
Suku Atayal
Taiwan adalah rumah dari sejumlah kelompok pribumi Austronesia sejak dari sebelum 4.000 SM. Namun, analisis genetika menunjukkan bahwa suku yang berbeda mungkin memiliki populasi nenek moyang asal yang berbeda yang berasal dari daratan Asia, dan berkembang secara terpisah satu sama lain. Suku Atayal diyakini telah bermigrasi ke Taiwan dari Tiongkok Selatan atau Asia Tenggara. Penelitian genetika juga menemukan kesamaan antara suku Atayal dengan suku lain di Filipina dan Thailand, dan pada tingkat kesamaan yang lebih rendah dengan Tiongkok Selatan dan Vietnam. Suku Atayal secara genetik berbeda dari suku Amis yang merupakan kelompok penduduk pribumi terbesar di Taiwan dan berasal dari suku Han, menunjukkan kedua suku ini sedikit berbaur. Penelitian mengenai polimorfisme DNA mitokondria (mtDNA) menunjukkan migrasi kuno dua garis keturunan dari berbagai suku ke Taiwan terjadi sekitar 11.000-26.000 tahun yang lalu. Meski begitu, orang modern sangat akrab dengan imigran Han Tiongkok.