Kesultanan Mataram
Sutawijaya naik tahta setelah ia merebut wilayah Pajang sepeninggal Hadiwijaya dengan gelar Panembahan Senopati. Pada saat itu wilayahnya hanya di sekitar Jawa Tengah saat ini, mewarisi wilayah Kerajaan Pajang. Pusat pemerintahan berada di Mentaok, wilayah yang terletak kira-kira di timur Kota Yogyakarta dan selatan Bandar Udara Adisucipto sekarang. Lokasi keraton (tempat kedudukan raja) pada masa awal terletak di Banguntapan, kemudian dipindah ke Kotagede. Sesudah ia meninggal (dimakamkan di Kotagede) kekuasaan diteruskan putranya Mas Jolang yang setelah naik tahta bergelar Prabu Hanyokrowati.
Sutawijaya
Kanjeng Panembahan Senopati / Raden Sutawijaya (Sultan Mataram ke 1, pendiri, 1587-1601) menikah dengan 3 istri melahirkan putra-putri 14 orang: Gusti Kanjeng Ratu Pambayun / Retna Pembayun Pangeran Ronggo Samudra (Adipati Pati) Pangeran Puger / Raden Mas Kentol Kejuro (Adipati Demak) Pangeran Teposono Pangeran Purbaya / Raden Mas Damar Pangeran Rio Manggala Pangeran Adipati Jayaraga / (Raden Mas Barthotot) Panembahan Hadi Prabu Hanyokrowati/Panembahan Seda ing Krapyak (Sultan Mataram ke 2, 1601-1613) menikah dengan Ratu Tulung Ayu dan Dyah Banowati / Ratu Mas Hadi (Cicit dari Raden Joko Tingkir & Ratu Mas Cempaka), menurunkan putra-putri 12 orang: Sultan Agung / Raden Mas Djatmika (1593-1645), Sultan Mataram ke 3 (1613-1645) menikah dengan Permaisuri ke 1 Kanjeng Ratu Kulon / Ratu Mas Tinumpak (putri Panembahan Ratu Cirebon ke 4 setelah Sunan Gunung Jati), permaisuri ke 2 Kanjeng Ratu Batang / Ratu Ayu Wetan / Kanjeng Ratu Kulon mempunyai 9 orang putra-putri: Raden Mas Sahwawrat / Pangeran Temenggong Pajang Raden Mas Kasim / Pangeran Demang Tanpa Nangkil Pangeran Ronggo Kajiwan Gusti Ratu Ayu Winongan Pangeran Ngabehi Loring Pasar Pangeran Ngabehi Loring Pasar Sunan Prabu Amangkurat Agung / Amangkurat I / Raden Mas Sayidin (Sultan Mataram ke 4, 1646-1677) wafat 13 Juli 1677 di Banyumas. Sunan Prabu Mangkurat II / Sunan Amral / Raden Mas Rahmat (Sunan Kartasura ke 1, 1677-1703) Sunan Prabu Amangkurat III (Sunan Kartasura ke 2, 1703-1705) Susuhunan Pakubuwono I / Pangeran Puger / Raden Mas Drajat (Sunan Kartasura ke 3, 1704-1719) Raden Mas Sengkuk Prabu Amangkurat IV (Mangkurat Jawi) wafat 20 April 1726 Kanjeng Pangeran Arya Mangkunegara (Mangkunegara I, 1757-1795) Gusti Raden Ayu Suroloyo, di Brebes Gusti Raden Ayu Wiradigda Gusti Pangeran Hario Hangabehi Gusti Pangeran Hario Pamot Gusti Pangeran Hario Diponegoro Gusti Pangeran Hario Danupaya sri Susuhunan Pakubuwono II / Raden Mas Prabasuyasa (Sunan Surakarta ke 1, 1726-1742) Gusti Pangeran Hario Hadinagoro Gusti Kanjeng Ratu Maduretno, Garwa Pangeran Hindranata Gusti Raden Ajeng Kacihing, Dewasa Sedho Gusti Pangeran Hario Hadiwijoyo Gusti Raden Mas Subronto, Wafat Dalam Usia Dewasa Gusti Pangeran Hario Buminoto Pangeran Hario Mangkubumi Hamengku Buwono I (Sultan Yogyakarta Ke 1, 1717-1792) Sultan Dandunmatengsari Gusti Raden Ayu Megatsari Gusti Raden Ayu Purubaya Gusti Raden Ayu Pakuningrat di Sampang Gusti Pangeran Hario Cokronegoro Gusti Pangeran Hario Silarong Gusti Pangeran Hario Prangwadono Gusti Raden Ayu Suryawinata di Demak Gusti Pangeran Hario Panular Gusti Pangeran Hario Mangkukusumo Gusti Raden Mas Jaka Gusti Raden Ayu Sujonopuro Gusti Pangeran Hario Dipawinoto Gusti Raden Ayu Adipati Danureja I Pangeran Diposonto / Ki Ageng Notokusumo Raden Ayu Lembah Raden Ayu Himpun Raden Suryokusumo Pangeran Blitar Pangeran Dipanegara Madiun Pangeran Purbaya Kyai Adipati Nitiadiningrat I Raden Garudo (groedo) Raden Suryokusumo Tumenggung Honggowongso / Joko Sangrib (Kentol Surawijaya) Gusti Raden Ayu Pamot Pangeran Martosana Pangeran Singasari Pangeran Silarong Pangeran Notoprojo Pangeran Satoto Pangeran Hario Panular Gusti Raden Ayu Adip Sindurejo Raden Ayu Bendara Kaleting Kuning Gusti Raden Ayu Mangkuyudo Gusti Raden Ayu Adipati Mangkupraja Pangeran Hario Mataram Bandara Raden Ayu Danureja / Bra. Bendara Gusti Raden Ayu Wiromenggolo / R.Aj. Pusuh Gusti Raden Ayu Wiromantri Pangeran Danupoyo/Raden Mas Alit Pangeran Mangkubumi Pangeran Bumidirja Pangeran Arya Martapura / Raden Mas Wuryah (1605-1688) Ratu Mas Sekar / Ratu Pandansari Kanjeng Ratu Mas Sekar Pangeran Bhuminata Pangeran Notopuro Pangeran Pamenang Pangeran Sularong / Raden Mas Chakra (wafat Desember 1669) Gusti Ratu Wirokusumo Pangeran Pringgoloyo Gusti Raden Ayu Demang Tanpa Nangkil Gusti Raden Ayu Wiramantri Pangeran Adipati Pringgoloyo I (Bupati Madiun, 1595-1601) Ki Ageng Panembahan Djuminah/Pangeran Djuminah/Pangeran Blitar I (Bupati Madiun, 1601-1613) Pangeran Adipati Martoloyo / Raden Mas Kanitren (Bupati Madiun 1613-1645) Pangeran Tanpa Nangkil