Ashikaga Takauji
Selanjutnya, pihak Istana Selatan yang dipimpin Pangeran Muneyoshi, Nitta Yoshioki, Nitta Yoshimune, serta Hōjō Tokiyuki menyerang pasukan Takauji. Setelah sempat mundur hingga ke Provinsi Musashi, lewat serangan balasan terhadap kekuatan Istana Selatan di daerah Kanto, Takauji melakukan akhirnya merebut kembali Kyoto. Sesudah itu, Tadafuyu menyerang Kyoto, namun gagal dan terpaksa mundur ke Kyushu. Pada tahun 1354, pihak Istana Selatan untuk sementara berhasil menduduki Kyoto untuk direbut kembali oleh Istana Utara pada tahun berikutnya. Takauji secara pribadi masih memiliki rencana untuk membunuh Tadafuyu, namun penyakit bisul (radang di bawah kulit) lebih dulu merenggut nyawanya. Ashikaga Takauji, 54 tahun, meninggal dunia di rumah kediamannya di daerah Nijō, Kyoto pada tahun 1358.
Naruto Shippuden
Di sebuah gua yang gelap Sasuke terbangun dari pingsannya dan tampak kebingungan, saat itu tiba-tiba terdengar suara dari kegelapan gua. Suara tersebut berasal dari Tobi, Tobi pun mulai memperkenalkan diri dengan membuka topeng yang menjadi misteri selama ini. Walau belum terbuka sepenuhnya sudah terlihat Sharingan milik Tobi yang membuat Sasuke sangat terkejut melihatnya. Dalam keadaan terkejut, tanpa sengaja Sasuke mengeluarkan Amaterasu, Amaterasu itu pun langsung mengenai tangan kanan Tobi kemudian membakar seluruh tubuh Tobi tanpa sisa, anehnya beberapa saat kemudian dari dalam kegelapan gua, Tobi kembali muncul tanpa luka sedikitpun. Sasuke yang merasa aneh dengan apa yang telah dilakukannya terhadap Tobi, bertanya kepada Tobi dan Tobi pun menjelaskan kepada Sasuke mengapa dia dapat mengeluarkan Amaterasu. Tobi menjelaskan bahwa Sasuke mendapatkan jurus tersebut karena sesaat sebelum kematian Itachi, Itachi memberikan seluruh jurusnya kepada Sasuke. Akhirnya Tobi pun menceritakan kisah masa lalunya tentang berdirinya desa Konohagakure, kisah kekalahannya dengan hokage pertama dan alasan mengapa Itachi membunuh semua anggota Klan Uchiha. Sebenarnya, Konohagakure adalah desa hasil pergabungan dan gencatan senjata antara Klan Uchiha dan klan Senju. Setelah terbentuknya Konohagakure, Madara Uchiha ingin melakukan pemberontakan terhadap Klan Senju yang saat itu menguasai pemerintahan. Ia mengajak sesama klan untuk melakukan pemberontakan, tetapi mereka lebih cinta perdamaian dan menolak ajakan Madara. Madara pun pergi dan melawan hokage pertama sendirian, tetapi, ia kalah. Itachi membunuh Klan Uchiha karena diberi misi oleh Konoha. Itachi dihadapkan oleh pilihan-pilihan mengerikan, pada saat itulah Itachi akhirnya memilih membantai seluruh Klan Uchiha. Tapi, ia tidak bisa membunuh adiknya sendiri. Sasuke pun mengenang masa lalunya bersama Itachi. Di Konoha, Naruto pun mengetahui bahwa Jiraiya sudah tewas. Fukasaku, guru dari Jiraiya meminta agar Naruto mempelajari teknik Sage melebihi dirinya dan mengalahkan Pain. Akhirnya Naruto memutuskan berangkat ke Myobokuzan bersama Fukasaku. di tempat lain Sasuke memburu Hachibi. Hachibi sangat kuat sehingga merepotkan tim Taka tetapi bisa dikalahkan oleh Sasuke dengan jurus Amaterasu. Disisi lain, Raikage keempat (A), kakak Killer Bee (Jinchuuriki dari Hachibi) memberi izin penangkapan Sasuke ke Konoha. Pada saat penyegelan, Hachibi yang disegel Akatsuki ternyata palsu. Sementara itu keadaan Konoha mulai terdesak setelah Pain memulai serangan.