Assassin's Creed
Cerita dan periode waktu yang baru diperkenalkan di setiap entri, dan elemen dari cara bermain berkembang dari versi sebelumnya. Terdapat dua kumpulan cerita di dalam seri ini. Untuk lima permainan utama yang pertama, cerita berlatar pada tahun 2012 dan menampilkan tokoh utama Desmond Miles yang menggunakan mesin yang bernama Animus dan menghidupkan kembali memori pendahulunya untuk mencari cara untuk mencegah kemusnahan massal pada tahun 2012. Dalam permainan berikutnya, Assassin Initiative menghidupkan kembali rekaman memori genetik menggunakan perangkat lunak Helix, membantu para Assassin menemukan Piece of Eden yang baru di dunia modern.
Assassin's Creed (film)
Kembali Animus, Aguilar dan Maria yang dijadwalkan untuk dieksekusi, tetapi Aguilar berhasil membebaskan dirinya dan Maria, yang mengarah ke mengejar atap di mana mereka melakukan Leap of Faith, dan berhasil melarikan diri. Callum kemudian diekstrak dan ditempatkan kembali di penangkaran, di mana ia belajar dari Yusuf, yang juga hadir di gedung, yang dan Aguilar ini kenangan yang menggabungkan, memungkinkan Callum untuk memasuki kemampuan tempur Aguilar, dan bahwa ibu Callum adalah seorang pembunuh dan memilih untuk mati dengan tangan Joseph daripada dikenakan Animus oleh Templar. Sementara itu, Alan ditekan oleh atasannya Ellen Kaye untuk menutup Proyek Animus karena kurangnya hasil, yang mengarah Sophia menyadari Alan peduli tentang pemberantasan pembunuh daripada menggunakan Apple of Eden untuk membebaskan dunia dari kekerasan.