Fauna Indonesia
Walaupun 45% daerah Indonesia masih belum berpenghuni dan ditutupi hutan tropis, pertumbuhan populasi Indonesia yang tinggi dengan industrialisasinya, secara perlahan memengaruhi keberadaan fauna di Indonesia. Ditambah lagi, perdagangan hewan ilegal semakin menambah parah kondisi fauna Indonesia, termasuk di antaranya badak, orangutan, harimau, dan beberapa spesies amfibia[5]. Hingga 95% hewan yang dijual di pasar diambil langsung dari hutan dan bukannya melalui konservasi; dan lebih dari 20% hewan ini meninggal dalam perjalanan.[12]. Pada tahun 2003, World Conservation Union mencatat 147 spesies mamalia, 114 burung, 91 ikan dan 2 invertebrata termasuk dalam hewan-hewan yang terancam punah[12].
Sarawak
Hutan hujan Sarawak memiliki salah satu konsentrasi tertinggi dari spesies per area unit di dunia. Negara bagian tersebut memiliki sekitar 185 spesies mamalia, 530 spesies burung, 166 spesies ular, 104 spesies kadal, dan 113 spesies amfibi. Negara bagian tersebut juga meliputi 19 persen mamalia, 6 persen burung, 20 persen ular dan 32 spesies kadal sebagai spesies endemik. Spesies-spesies tersebut kebanyakan ditemukan di Kawasan yang Dilindungi Penuh. Terdapat 2,000 spesies pohon, 1,000 spesies mawar, 757 spesies tumbuhan paku dan 260 spesies palem.[105] Negara bagian tersebut juga merupakan habitat hewan-hewan terancam, yang meliputi gajah kalimantan, bekantan, orangutan dan badak.[106][107][108][109][110] Pusat Kehidupan Liar Matang, Cagar Alam Semenggoh, dan Suaka Margasatwa Lanjak Entimau[111] dikenal karena program perlindungan orangutan mereka.[112][113] Taman Nasional Talang–Satang dikenal karena inisiatif konservasi penyu-nya.[114] Pengamatan burung adalah sebuah aktivitas umum di berbagai taman nasional seperti Taman Nasional Gunung Mulu, Taman Nasional Perbukitan Lambir,[115] dan Taman Nasional Similajau.[116] Taman Nasional Miri–Sibuti dikenal karena terumbu karangnya[117] dan Taman Nasional Gunung Gading dikenal karena bunga-bunga Rafflesia-nya.[118] Taman Nasional Bako, taman nasional tertua di Sarawak, dikenal karena 275 spesies bekantan-nya,[119] dan Taman Pemakan Serangga Padawan dikenal karena berbagai tumbuhan pemakan serangga karnivora-nya.[120] Pada 1854, Alfred Russel Wallace mengunjungi Sarawak. Setahun kemudian, ia merumuskan "Hukum Sarawak" yang membentuk dasar teori seleksi alam.[121]