Universitas Gadjah Mada
Pada saat didirikan, Universitas Gadjah Mada hanya memiliki enam fakultas, sekarang memiliki 18 Fakultas dan dua Sekolah yaitu Sekolah Vokasi dan Sekolah Pascasarjana (dahulu bernama Program Pascasarjana), dan lebih dari 100 Program Studi untuk S2, S3, dan Spesialis. Universitas Gadjah Mada berlokasi di Kampus Bulaksumur, Yogyakarta. Sebagian besar fakultas dalam lingkungan Universitas Gadjah Mada terdiri atas beberapa jurusan/bagian dan atau program studi. Kegiatan Universitas Gadjah Mada dituangkan dalam bentuk Tri Dharma Perguruan Tinggi yang terdiri atas pendidikan dan pengajaran, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat
Universitas Malahayati
Sebagai kiprah awal Universitas Malahayati, pada tahun ajaran 1994/1995 dibuka tiga fakultas pelopor dan satu akademi. Ketiga fakultas tersebut adalah (a). Fakultas Kedokteran (b). Fakultas Teknik dengan empat jurusan: Teknik Mesin, Teknik Sipil, Teknik Manajemen Industri, dan Teknik Lingkungan; dan (c). Fakultas Ekonomi dengan dua jurusan: Akuntansi dan Manajemen,sedangkan akademi dibuka pada tahun 2002 didirikan (d).Akademi Keperawatan. Pada tahun 2004 didirikan (e). Fakultas Kesehatan Masyarakat. Universitas Malahayati juga telah membuka (f).Program Studi Keperawatan Strata Satu (S1) yang ditempatkan di bawah Fakultas Kedokteran Universitas Malahayati.