京都
京都は、桓武天皇が784年の長岡京に続いて、794年平安京に遷都したことに始まる千年の都である。京都に都が移された理由は諸説ある。例えば、長岡京の建設責任者であった藤原種継が暗殺されたことや、長岡京が桂川や小畑川氾濫によりしばしば水害に遭ったからとする説、長岡京での早良親王怨霊説などである。
明治
江戸の東京への改称後、8月27日に即位式を挙げた明治天皇が京都から東京に移った（9月20日京都出発、10月13日東京着）ことを始め、10月13日江戸城を皇居とし、東京城と改称した。天皇は12月8日に、東京を発って京都に帰ったが、同年11月、姫路藩主酒井忠邦が「藩の名称を改め、すべて府県と一般同軌にして、中興の盛業を遂げられたい」[注釈 5]という案を出してきた他、木戸孝充が此の案を取り上げた[6]。12月22日京都還幸（翌明治2年3月、再度東幸、事実上の東京遷都）。翌年1869年（明治2年）2月には政府の諸機関も東京に移された。これら一連の動きは当時<b data-parsoid='{"dsr":[7223,7232,3,3]}'>御一新</b>と呼ばれた。[注釈 6][7]