恐竜
恐竜の二足歩行形態は、現在では子孫の鳥類へと受け継がれている。しかし、祖先と異なる点としては、尾が短縮したことで重心が前方へと移ったため、大腿骨がほぼ身体に対して水平に保持されていることである[28]。そのため、歩行は膝関節を中心としたものとなっている[29]。
アウロルニス・シュイ
このように主張が対立するのは、羽毛を持つ恐竜化石がどれも極めて原始的であるのと、解剖学的には極めて類似しているため、ある種が鳥類の系統なのか、それともデイノニコサウルス類の系統なのかを厳密に位置づける事が困難であることに由来する。ルイス・チアッペは、アウロルニス・シュイは鳥類の祖先に近いものの、始祖鳥と現生する鳥類の共通祖先により定義される鳥類には属さない可能性が残されていると主張している。したがって、アウロルニス・シュイが最初期の鳥類なのか、それとも鳥類とは異なるのかは確定しておらず、他の近縁種においても同等の立場にあると考えられている。しかし、このように多数の羽毛を持つ恐竜が発見されていること、その時代が約1億6000万年前から約1億5000万年前の間にあることから、鳥類が恐竜から進化したという主張そのものは疑いようのない状態となっており、複数存在するそれらのどれかが現生する鳥類に進化したのではないかと考えられている。