雲仙岳
最高峰の平成新山(1,483m)を中心に、周囲に、普賢岳(1,359m)、国見岳(1,347m)、妙見岳(1,333m)、野岳(1,142m)、九千部岳(1,062m)、矢岳(943m)が存在する。普賢岳や平成新山の溶岩は千々石カルデラ由来である。つまり、小浜温泉沖合いの橘湾地下のマグマだまりから供給されている[1]。主峰は普賢岳（ふげんだけ）だが、1990年（平成2年）から1995年（平成7年）にかけての火山活動で平成新山（へいせいしんざん）が出来、こちらの方が標高が高くなった。また平成新山は長崎県の最高峰でもある。
千々石川
雲仙岳の妙見岳（標高1,333m）・仁田峠（標高1,078m）・野岳（標高1,142m）の西側斜面を水源とする。水は雲仙温泉で知られる標高700-800mの雲仙盆地北側に集まる。雲仙盆地の北西端には昭和45年（1970年）に別所ダム（鴛鴦ノ池）が作られた。