警察犬
日本では1912年に警視庁がイギリスからコリーとラブラドールレトリバーの2頭を採用したのが始まりである（ただし防犯広報目的で採用）[1][3][4]。1940年（昭和15年）に警視庁は警察犬舎を設けて警察犬6頭を飼育したが戦争に伴い一時廃止[1]。1952年（昭和27年）には警察犬制度の採用が再度検討され、民間訓練士に12頭の犬を警察犬として嘱託する嘱託警察犬制度が創設された[1]。さらに1956年（昭和31年）には警視庁において本格的な直轄警察犬制度が発足した[1]。
琉球犬
弥生時代に入ると、日本列島の北海道と南西諸島を除く地域には、渡来人とともに縄文犬とは形質の異なる北方系の弥生犬が流入した。本州の日本犬にはそれらの犬の血が多く混じっている。その一方で、北海道と沖縄県では大陸系の犬の影響はわずかで縄文犬の血統が維持された。最近の研究で、北海道の北海道犬と琉球犬は遺伝子的に非常に近い関係にあることが証明されている。
琉球犬の畜犬団体には、以下のものがある。（1990年現在）