大学入試問題ネット投稿事件
2011年1月18日（センター試験直後）に「宮城県仙台市でいい精神科･心療内科を教えてください」という質問をしており、投稿者は逮捕前からネットでは東北地方に住む人間と予想されていた（実際に投稿者は仙台市に住む予備校生であった）。
2018年における医学部不正入試問題
2019年1月22日、大学の公式サイト上で2013年～2016年の入学試験で得点操作などにより不合格となった可能性のある女子や浪人生計109人対しては合否判定の基礎となる資料が欠如していること、入学試験実施当時から3年以上前の成績が現在の学力を示しているとみなせない等から、追加合格を行わないことを決定したと発表した。2018年10月17日、弁護士らによる第三者委員会の設置を発表。順天堂大学は2018年に文科省が医学部を置く全国81大学に実施した調査で、過去6年の男子と女子の合格率の格差が1.67倍と最も大きかった。2018年度入学試験では男子2372人、女子1779人が受験し、合格者は男子239人、女子93人であった。2018年12月3日、第三者委員会からの報告書が大学側に提出された。