医学部
医学科 医学科は医師を養成するための6年制の学科である。医学科は「歯学」を除く医学（内科学、外科学、放射線医学など）を履修する課程であり、歯学科とは異なる。 健康科学・看護学科 東京大学医学部保健学科が1992年に学科名を変更して設置された。看護学コースと健康科学コースを有し、必ずしも看護師となるわけではない。保健医療の学際的アプローチを目指している。4年制。 看護学科 以前は附属看護専門学校として多かった看護学科は看護師や保健師を養成するための4年制の学科である。 保健学科 診療放射線技師、臨床検査技師、作業療法士、理学療法士等を養成するための4年制の学科である。これらに加え、看護師や保健師の養成課程を持つところもある。 医科栄養学科 管理栄養士を養成するための4年制学科である。2017年4月現在、徳島大学にのみ設置されている（2014年4月までは「栄養学科」だった）。 総合薬学科 薬剤師を養成するための6年制の学科である。薬学科は当初医学部に設置されていたが、ほとんどが学部として独立し、唯一最後までこの形態で残っていた広島大学も薬学教育6年制移行を機に薬学部として独立した。 生命科学科 医学の基礎知識を習得した生命科学者を養成するための4年制の学科で、1990年鳥取大学に設置され、2007年には九州大学にも新設された。
磯部検蔵
長門国（現在の山口県）に生まれる。長谷川泰の創立した済生学舎に学び、医術開業試験に合格し医師となる。1903年、長谷川が済生学舎の大学昇格を文部省によって拒絶されたことに憤慨し済生学舎を閉校した際、残された学生・教員と共に翌年、日本医学校を創立する。校長には山根正次を就任させ、磯部は学監として日本医学校の基礎を築いた。
日本医学校は、専門学校令による日本医学専門学校、1906年、大学令による旧制日本医科大学、1949年の新制日本医科大学となり、慶應義塾大学医学部、東京慈恵会医科大学と共に、「私立医大御三家」と称されるまでになり、私立医大の名門として日本医学界に学閥を形成している。済生学舎卒業生の吉岡弥生によって東京女子医科大学が、日本医学専門学校を退学した学生によって東京医科大学が、日本医科大学卒業生の丸木清美によって埼玉医科大学がそれぞれ創立されていることから、北里柴三郎が創立に尽力した慶應義塾大学医学部、薩摩閥の海軍軍医総監を歴任した高木兼寛の東京慈恵会医科大学と共に長谷川泰の済生学舎の流れをくむ日本医科大学は、私立医科大学の歴史における三大潮流である。