ワジリスタン紛争
2004年3月16日、の中心地にアルカーイダの幹部アイマン・ザワーヒリーが潜伏している情報を察知したパキスタン軍はワナを攻撃し、ターリバーンの間で激しい戦闘が起こった（ワナの戦い）。
キルギスの国際関係
キルギスとタジキスタンの間では緊張関係が続いている。タジキスタンの難民や反政府組織は数回に渡りキルギスに渡航しており、人質に取ることさえしている。キルギスは1992年10月にタジキスタン軍と反政府勢力の間の仲介を行おうと試みたが失敗に終わった。アスカル・アカエフは後に、反乱軍に対しタジキスタン大統領のエモマリ・ラフモンをサポートするため、ウズベキスタン大統領のイスラム・カリモフやカザフスタン大統領のヌルスルタン・ナザルバエフと協力して調停軍を送ることで合意したが、キルギス議会は1993年春まで数ヶ月に渡り些事に振り回されて実行することができなかった。1995年半ば、キルギス軍はパンジ付近にあるタジキスタン国境の一部領域を封鎖してタジキスタン反政府勢力を国外に出さない任務を遂行した。