吉田郡山城
慶長20年（1615年）に江戸幕府が出した一国一城令により吉田郡山城も取り壊され、寛永14年（1637年）に島原の乱が起きると、キリシタンの決起を恐れた幕府によって、石垣や堀なども破却・撤去された[3]。幕末には広島藩の支藩として広島新田藩が成立し、文久3年（1863年）に吉田郡山城の麓部分に陣屋が置かれた（吉田陣屋）[1]。明治2年（1869年）に廃藩となり、陣屋の建物は廃され、もしくは移築された。
福山 (城下町)
元和5年（1619年）、備後国を治めていた福島正則が改易され水野勝成 が入封すると神辺城に代わる新たな城が築かれることになり、深津郡野上村の常興寺山（常興寺周辺）一帯が選定された。新たな城の築城に平行し周囲は城下町が整備されることになり、ここに城下町「福山」が誕生した。城下町の大部分は新開地であったこともあり、前述の通り以前は荒涼とした湿地帯を切り開いて形成されたと考えられていたが、平成19年（2007年）の発掘調査で城下南部（現在の福山駅前）の位置から稲作の痕跡が検出されるなど、近年はある程度開発が進んでいた可能性が高いと考えられるようになった。築城は元和6年（1620年）に芦田川の流れを城の北側にある吉津川に分流しようとする工事が大水害により中断されるなど困難を極めたといわれ、福山城は築城開始から3年近くの歳月を要した元和8年（1622年）に完成した（藩の詳細な歴史については「備後福山藩」を参照のこと）。