京都
京都は、桓武天皇が784年の長岡京に続いて、794年平安京に遷都したことに始まる千年の都である。京都に都が移された理由は諸説ある。例えば、長岡京の建設責任者であった藤原種継が暗殺されたことや、長岡京が桂川や小畑川氾濫によりしばしば水害に遭ったからとする説、長岡京での早良親王怨霊説などである。
京都所司代
織田信長が1568年（永禄11年）に足利義昭を擁して上洛し、京都を支配下に置いたとき、室町幕府の機構を踏襲し、家臣の村井貞勝を京都の治安維持のために置いた機関。貞勝は1582年（天正10年）6月2日、明智光秀が信長を殺した本能寺の変のとき、信長の嫡男・織田信忠と共に二条城で討死してしまった。信長の死後、豊臣秀吉が京都を支配下に置いたときは、桑原貞成、杉原家次、浅野長政（この3名は、いずれも1582年（天正10年）から1583年（天正11年）の短期間）、その後前田玄以が京都所司代を務めている。1595年（文禄4年）には石田三成・増田長盛両名が加わった（同年8月近衛信輔あて近衛前久書簡・陽明文庫所蔵）。これらは室町幕府の職名を踏襲したものである。侍所および所司代も参照のこと。