ルワンダ紛争
フツとツチは元々は同じ言語を使い、農耕民族であるか遊牧民族であるかという違いでしかなく、貧富の差がそれぞれの民族を形成するなど両者の境界は曖昧であった。遊牧業が主な生業であったツチは、牛を多数所有するなど比較的豊かであった[1]。
大統領特殊師団
1990年にはルブンバシ大学で民主化要求する学生の弾圧を行い、少なくとも数十人の学生を殺害した。また、ルワンダ愛国戦線が北部ルワンダへ侵攻し、ルワンダ紛争が始まると、モブツは数百人の大統領特殊師団員をジュベナール・ハビャリマナ政権側を支援するために送り込んでいる。1993年には、同紛争の影響を受けた北キヴ州の町マシシ（）を鎮圧するために大統領特殊師団を送り込んだが、土着のフンデ族（）とフツ族系住民の対立を煽る結果となった。