吉田郡山城
慶長20年（1615年）に江戸幕府が出した一国一城令により吉田郡山城も取り壊され、寛永14年（1637年）に島原の乱が起きると、キリシタンの決起を恐れた幕府によって、石垣や堀なども破却・撤去された[3]。幕末には広島藩の支藩として広島新田藩が成立し、文久3年（1863年）に吉田郡山城の麓部分に陣屋が置かれた（吉田陣屋）[1]。明治2年（1869年）に廃藩となり、陣屋の建物は廃され、もしくは移築された。
小山田信茂
なお、岩殿城は小山田氏の詰城とされているが、小山田氏の本拠である谷村（都留市谷村）からは距離があることから、岩殿城を小山田氏の城とするか武田氏の城とするかで議論がある。なお、天正9年3月20日に岩殿城へ勝頼が在番衆を派遣している事実も注目されている。