大蔵省
1868年（明治元年）旧1月、朝廷に政府運営のための資金調達の機関として、金穀出納所</b>が設置された。名称が何回か変更されて、太政官制が導入された時に<b data-parsoid='{"dsr":[663,672,3,3]}'>会計官</b>と名を改めた。この時期に太政官札が発行された。出納、秩禄、造幣、営繕を管轄する事を目的に、1869年（明治2年）旧8月、二官六省制になった事を機に、大蔵省</b>と改名された。旧9月、民部省と合併し、過去に例のない大型官庁となった。初代大蔵卿には松平慶永が就任した。
教部省
明治5年3月14日（1872年4月21日）に神祇省を改組し、民部省社寺掛を併合する形で設置。神祇官内に設置された宣教使の神道と儒教を基本とした国民教導が失敗したことを受け、当時最大の宗教勢力であった仏教、特に浄土真宗の要請によって神・儒・仏の合同布教体制が敷かれた。キリスト教の（半ば黙認という形での）禁制解除、社寺に於ける女人結界の解除など近代宗教政策を実施する一方で、神祇官が為し得なかった国民教化を実現する為に教導職制度を設け、三条教則による国民教化・大教宣布運動を行った。