緑膿菌
緑膿菌（りょくのうきん、学名、Pseudomonas aeruginosa）は、細菌に分類される、グラム陰性で好気性の桿菌の1種であり、地球上の環境中に広く分布している代表的な常在菌の1つでもある。ヒトに対しても病原性を持つものの、仮に健常者に感染しても発病させることはほとんど無い。対して、免疫力の低下した者に感染すると、日和見感染症の1つとして数えられる<b data-parsoid='{"dsr":[935,947,3,3]}'>緑膿菌感染症</b>の原因となる。
アオカビ
医学的にアオカビは、病原菌としてよりむしろペニシリンの発見につながったことから重要視されている。ペニシリンはアレクサンダー・フレミングが1928年に発見した世界初の抗生物質である。一説には、他の細菌を培養するための培地にたまたまアオカビ(当時の"P. notatum"、現在は"P. chrysogenum")が混入した際、そのアオカビのコロニー周辺に細菌が生育しない領域（阻止円）が出来ることを見つけたことがその発見につながったと言われる。アオカビにとってペニシリンは、他の生物（特に細菌）との生存競争を有利に進めるために産生するアロモンであると考えられている。その全合成方法が開発されるまでの間、ペニシリンを製造するためアオカビの大量培養が行われた。ペニシリン以外の抗生物質を産生する菌として、グリセオフルビンを産生する"P. griseofluvum"が見つかっている。