緑膿菌
シュードモナス属に属する、0.7 x 2 µm程度の大きさのグラム陰性桿菌である。芽胞は形成せず、菌体の一端に1本の鞭毛（まれに2-3本）を持ち活発に運動する。また菌体の一端には線毛を有する。
藍藻
多くの藍色細菌のゲノム情報が決定されている。最初にゲノムが決定されたのは、 sp. PCC 6803である。これは、1996年に、かずさDNA研究所の田畑らのグループによって報告され、生物として4番目、酸素発生型光合成生物として初めてであった。この種は光合成の研究でもっともよく使われている典型的なモデル生物である。その後、田畑らのグループは、窒素固定をする sp. PCC 7120（2001年）、好熱性の BP-1（2002年）、チラコイド膜をもたない PCC 7421（2003年）と次々と代表的な種のゲノムを決定した。平行して、海洋性の"Prochlorococcus"や"Synechococcus"などが米や欧州の研究グループによって報告された（2003年以降）。さらに米・JGIや多くの機関で、モデル生物や生態学的に重要な種のゲノムが続々と決定されている。ゲノムサイズは小さいものは 類で180万塩基対、大きいものは でプラスミドを含めて900万塩基対を超える。これは7000個近くの遺伝子をもっており、真核生物の酵母や原始紅藻よりも多い。