雲仙岳
最高峰の平成新山(1,483m)を中心に、周囲に、普賢岳(1,359m)、国見岳(1,347m)、妙見岳(1,333m)、野岳(1,142m)、九千部岳(1,062m)、矢岳(943m)が存在する。普賢岳や平成新山の溶岩は千々石カルデラ由来である。つまり、小浜温泉沖合いの橘湾地下のマグマだまりから供給されている[1]。主峰は普賢岳（ふげんだけ）だが、1990年（平成2年）から1995年（平成7年）にかけての火山活動で平成新山（へいせいしんざん）が出来、こちらの方が標高が高くなった。また平成新山は長崎県の最高峰でもある。
雲仙岳
古くは『肥前国風土記』で「高来峰」と呼ばれているのがこの山であり、温泉についての記述がある。雲仙はもとは「温泉」の表記で「うんぜん」と読んでいたが、国立公園指定の際に現在の表記に改められた。大乗院満明寺は行基が大宝元年（701年）に開いたと伝えられている。この満明寺の号が「温泉（うんぜん）山」である。以後、雲仙では霊山として山岳信仰（修験道）が栄えた。また、行基は同時に四面宮（温泉神社）を開いたといわれている。祭神は、『古事記』にて筑紫島をあらわす一身四面の神である。この神社は上古には温泉神社、中古には四面宮と称されていたが、1869年（明治2年）の神社改正により筑紫国魂神社と改称され、1915年（大正4年）の県社昇格に際して温泉神社に戻した。島原半島中に10数の分社がある。