プロテスタント
1517年以降、マルティン・ルターらによりカトリック教会の改革を求める宗教改革運動が起こされた。
伯爵戦争
宗教面では、マルティン・ルターが1517年に95ヶ条の論題を提出し宗教改革を実施したことから、プロテスタントの教えが北欧諸国にも及ぶようになった。カトリックの司教たちはプロテスタントの布教禁止をフレゼリク1世に要求し、フレゼリク1世は表面上、要求を呑んだが、息子のゴットープ公クリスチャン（後のクリスチャン3世、以下クリスチャン3世と表記）はプロテスタントであり、ハンス・タウセン () を庇護するなど、プロテスタントを容認していた。そして、1526年から1527年にかけてフレゼリク1世は、デンマーク国教会の実質上の成立ともいえる条件を司教たちに認めさせており、デンマーク国内では緩やかながらも宗教改革が進んでいった。