気象庁
1887年に発足した内務省中央気象台を前身とする。文部省、運輸通信省への移管を経て1945年5月、運輸省の組織となった。1956年、 運輸省の外局に昇格するとともに現在の気象庁に改称した。2001年の中央省庁再編によって国土交通省の外局になった。
気象観測船
日本では1920年代から船舶による気象観測を行っており、1937年に最初の大型気象観測船「凌風丸」（初代）を建造、2010年8月現在も気象庁本庁が「凌風丸」（3代目）と「啓風丸」の2隻を運用している。凌風丸と啓風丸は赤道や東経165度線までに及ぶ北西太平洋の広い範囲を航海し、海上気象・海洋の観測を行う。以前はこの2隻のほか、3箇所の海洋気象台に、小型の気象観測船がそれぞれ1隻ずつ配備され日本近海の観測に当たっていたが、2010年3月に引退となった。また、これにともない啓風丸も神戸海洋気象台から本庁に移管された。