Those ideas, along with his aversion to the Roman Catholic Church, brought upon Lucaris the hatred and persecution of the Jesuits and those in the Orthodox Church who favored a union with the Catholics.
דעות אלו, לצד סלידתו מן הכנסייה הקתולית, המיטו עליו שנאה ורדיפות מצד הישועים וחוגי הכנסייה האורתודוקסית שרצו להתאחד עם הקתולים.