Probalign
புரோபலைன் என்பது ஒரு வரிசை சீரமைப்பு கருவியாகும், இது பகிர்வு செயல்பாட்டின் பின்புற நிகழ்தகவுகளைப் பயன்படுத்தி அதிகபட்சமாக எதிர்பார்க்கப்படும் துல்லியமான சீரமைப்பைக் கணக்கிடுகிறது. போல்ட்ஸ்மேன் விநியோகத்தைப் போன்ற ஒரு மதிப்பீட்டைப் பயன்படுத்தி அடிப்படை ஜோடி நிகழ்தகவுகள் மதிப்பிடப்படுகின்றன. பகிர்வு செயல்பாடு ஒரு மாறும் நிரலாக்க அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி கணக்கிடப்படுகிறது. அடிப்படை ஜோடி நிகழ்தகவுகளை தீர்மானிக்க புரோபலைன் பயன்படுத்தும் வழிமுறையை பின்வருபவை விவரிக்கின்றன. சீரமைப்பு மதிப்பெண் இரண்டு வரிசைகளின் சீரமைப்பைப் பெற இரண்டு விஷயங்கள் தேவைப்படுகின்றனஃ ஒரு ஒற்றுமை செயல்பாடு (எ. கா. PAM, BLOSUM,.) அஃபைன் கேப் பெனால்டிஃ ஒரு சீரமைப்பின் ஸ்கோர் a பின்வருமாறு வரையறுக்கப்படுகிறதுஃ இப்போது ஒரு சீரமைப்பின் போல்ட்ஸ்மேன் எடையுள்ள ஸ்கோர் a: ஒரு அளவிடுதல் காரணி எங்கே. போல்ட்ஸ்மேன் விநியோகத்தை அனுமானிக்கும் ஒரு சீரமைப்பின் நிகழ்தகவு பகிர்வு செயல்பாடு எங்கே, அதாவது. அனைத்து சீரமைப்புகளின் போல்ட்ஸ்மேன் எடைகளின் கூட்டுத்தொகை. டைனமிக் புரோகிராமிங் முன்னொட்டுகள் மற்றும் பகிர்வு செயல்பாட்டைக் குறிக்கலாம். மூன்று வெவ்வேறு நிகழ்வுகள் கருதப்படுகின்றனஃ ஒரு போட்டியில் முடிவடையும் இரண்டு முன்னொட்டுகளின் அனைத்து சீரமைப்புகளின் பகிர்வு செயல்பாடு. ஒரு செருகலில் முடிவடையும் இரண்டு முன்னொட்டுகளின் அனைத்து சீரமைப்புகளின் பகிர்வு செயல்பாடு. நீக்குதலில் முடிவடையும் இரண்டு முன்னொட்டுகளின் அனைத்து சீரமைப்புகளின் பகிர்வு செயல்பாடு. பின்னர் நம்மிடம் உள்ளதுஃ துவக்கம் மேட்ரிக்ஸ்கள் பின்வருமாறு துவக்கப்படுகின்றனஃ இரண்டு வரிசைகளின் சீரமைப்புகளுக்கான பகிர்வு செயல்பாடு மற்றும் இதன் மூலம் வழங்கப்படுகிறது, இது மீண்டும் கணக்கிடப்படலாம்ஃ ஒத்த அடிப்படை ஜோடி நிகழ்தகவு இறுதியாக நிலைகள் மற்றும் ஒரு அடிப்படை ஜோடியை உருவாக்கும் நிகழ்தகவு பின்வருமாறு வழங்கப்படுகிறதுஃ தலைகீழ் அடிப்படை ஜோடி சரங்களுடன் மறுபரிசீலனை செய்வதற்கான அந்தந்த மதிப்புகள். புரோப்கான்ஸ் பல வரிசை சீரமைப்பு குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் புரோபலைன் வெப்சர்விஸ் வரிசை சீரமைப்பு வழிமுறைகளையும் பார்க்கவும்