Yeastract
YEASTRACT (டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ரெகுலேட்டர்கள் மற்றும் ஒருமித்த கண்காணிப்புக்கான ஈஸ்ட் தேடல்) என்பது 1200 க்கும் மேற்பட்ட நூலியல் குறிப்புகளின் அடிப்படையில், டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் (TF) மற்றும் Saccharomyces cerevisiae இல் இலக்கு மரபணுக்களுக்கு இடையிலான 48,000 க்கும் மேற்பட்ட ஒழுங்குமுறை சங்கங்களின் தொகுக்கப்பட்ட களஞ்சியமாகும். நூற்றுக்கும் மேற்பட்ட வகைப்படுத்தப்பட்ட டிஎஃப்களுக்கான சுமார் 300 குறிப்பிட்ட டிஎன்ஏ பிணைப்பு தளங்களின் விளக்கமும் இதில் அடங்கும். ஒவ்வொரு ஈஸ்ட் மரபணுவையும் பற்றிய கூடுதல் தகவல்கள் சாக்கரோமைசஸ் மரபணு தரவுத்தளத்திலிருந்து (எஸ். ஜி. டி) பிரித்தெடுக்கப்பட்டுள்ளன. ஒவ்வொரு மரபணுவிற்கும் தொடர்புடைய மரபணு ஆன்டாலஜி (ஜி. ஓ.) விதிமுறைகள் மற்றும் ஜி. ஓ. வில் அவற்றின் படிநிலை ஆகியவை ஜி. ஓ. கூட்டமைப்பிலிருந்து பெறப்பட்டன. தற்போது, YEASTRACT கோ-விலிருந்து 7100 க்கும் மேற்பட்ட விதிமுறைகளை பராமரிக்கிறது. ஈஸ்ட் மரபணுக்களுக்கான ஊக்குவிப்பாளர் மற்றும் குறியீட்டு பகுதிகளின் நியூக்ளியோடைடு வரிசைகள் ஒழுங்குமுறை வரிசை பகுப்பாய்வு கருவிகளிலிருந்து (ஆர்எஸ்ஏடி) பெறப்பட்டன. YEASTRACT இல் உள்ள அனைத்து தகவல்களும் SGD, GO கூட்டமைப்பு, RSA கருவிகள் மற்றும் ஈஸ்ட் ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகள் குறித்த சமீபத்திய இலக்கியங்களின் சமீபத்திய தரவுகளுடன் பொருந்துவதற்காக தவறாமல் புதுப்பிக்கப்படுகின்றன. YEASTRACT என்பது டிஸ்கோவர் என்ற கருவிகளின் தொகுப்பை உள்ளடக்கியது, இது இணை ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட மரபணுக்களின் ஊக்குவிப்பு பகுதிகளில் அதிகமாக பிரதிநிதித்துவப்படுத்தப்படுவதாகக் கண்டறியப்பட்ட சிக்கலான மையக்கருத்துக்களை அடையாளம் காண பயன்படுத்தப்படலாம். டிஸ்கோவர் என்பது முசா வழிமுறையை அடிப்படையாகக் கொண்டது. இந்த வழிமுறைகள் மரபணுக்களின் பட்டியலை உள்ளீடாக எடுத்து, அதிகமாக பிரதிநிதித்துவப்படுத்தப்பட்ட மையக்கருத்துக்களை அடையாளம் காண்கின்றன, பின்னர் அவை YEASTRACT தரவுத்தளத்தில் விவரிக்கப்பட்டுள்ள டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி பிணைப்பு தளங்களுடன் ஒப்பிடப்படலாம். பயிற்சியில் எடுத்துக்காட்டப்பட்டபடி, பல உயிரியல் கேள்விகளைத் தீர்க்கும் போது சேகரிக்கப்பட்ட தரவைப் பயன்படுத்துவதற்கான வசதிகளும் வழங்கப்படுகின்றன. YEASTRACT ஒரு குறிப்பிட்ட மரபணுவின் ஆவணப்படுத்தப்பட்ட அல்லது சாத்தியமான டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ரெகுலேட்டர்கள் மற்றும் ஒவ்வொரு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிக்கும் ஆவணப்படுத்தப்பட்ட அல்லது சாத்தியமான ரெகுலேட்டர்களை அடையாளம் காண அனுமதிக்கிறது. இலக்கியத்தில் விவரிக்கப்பட்டுள்ள டிஎன்ஏ மையக்கருத்துக்கள் மற்றும் படியெடுத்தல் காரணி பிணைப்பு தளங்களுக்கு இடையிலான ஒப்பீட்டையும் இது சாத்தியமாக்குகிறது. அறியப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளுடன் அவற்றின் ஒழுங்குமுறை தொடர்புகளின் அடிப்படையில் மரபணுக்களின் பட்டியலை (எடுத்துக்காட்டாக மைக்ரோஅரே பகுப்பாய்வால் வெளிப்படுத்தப்பட்ட ஒத்த வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களைக் கொண்ட மரபணுக்களின் தொகுப்பு) தொகுப்பதற்கான ஒரு பயனுள்ள பொறிமுறையையும் இந்த அமைப்பு வழங்குகிறது. YEASTRACT சேகரிக்கப்பட்ட தரவுகளிலிருந்து முக்கியமான உயிரியல் தகவல்களைத் தேடுவதற்கும் மீட்டெடுப்பதற்கும் மற்றும் மரபணு-மூலம்-மரபணு பகுப்பாய்வு அல்லது உலகளாவிய அணுகுமுறைகளிலிருந்து வெளிவரும் தரவுகளிலிருந்து ஈஸ்டில் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளைக் கணிப்பதற்கும் கேள்விகளின் தொகுப்பை வழங்குகிறது. மேலும் காண்க டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் http://www.yeastract.com உயிரியல் தரவுத்தளங்கள் Saccharomycetes மரபணு வெளிப்பாடு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள்