Yeastract
YEASTRACT (ٹرانسکرپشنل ریگولیٹرز اور اتفاق رائے سے باخبر رہنے کے لیے خمیر کی تلاش) 1200 سے زیادہ کتابی حوالہ جات پر مبنی Saccharomyces cerevisiae میں ٹرانسکرپشن فیکٹرز (TF) اور ٹارگٹ جینز کے درمیان 48000 سے زیادہ ریگولیٹری ایسوسی ایشنز کا ایک کیوریٹڈ ذخیرہ ہے۔ اس میں سو سے زیادہ مخصوص ٹی ایف کے لیے تقریبا 300 مخصوص ڈی این اے بائنڈنگ سائٹس کی تفصیل بھی شامل ہے۔ ہر خمیر جین کے بارے میں مزید معلومات Saccharomyces جینوم ڈیٹا بیس (SGD) سے نکالی گئی ہیں۔ ہر جین کے لیے متعلقہ جین آنٹولوجی (جی او) اصطلاحات اور جی او میں ان کی درجہ بندی جی او کنسورشیم سے حاصل کی گئی تھی۔ فی الحال، YEASTRACT گو سے 7100 سے زیادہ شرائط کو برقرار رکھتا ہے۔ خمیر جینوں کے لیے پروموٹر اور کوڈنگ علاقوں کے نیوکلیوٹائڈ کے سلسلے ریگولیٹری سیکوینس اینالیسس ٹولز (آر ایس اے ٹی) سے حاصل کیے گئے تھے۔ YEASTRACT میں موجود تمام معلومات کو باقاعدگی سے اپ ڈیٹ کیا جاتا ہے تاکہ ایس جی ڈی، جی او کنسورشیم، آر ایس اے ٹولز اور خمیر ریگولیٹری نیٹ ورکس پر حالیہ ادب کے تازہ ترین اعداد و شمار سے میل کھایا جا سکے۔ YEASTRACT میں ڈسکوورر شامل ہے، جو ٹولز کا ایک مجموعہ ہے جسے مربوط جینوں کے پروموٹر علاقوں میں زیادہ نمائندگی کرنے والے پیچیدہ نقشوں کی شناخت کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ ڈسکوورر ایم یو ایس اے الگورتھم پر مبنی ہے۔ یہ الگورتھم ان پٹ کے طور پر جینوں کی ایک فہرست لیتے ہیں اور زیادہ نمائندگی والے نقشوں کی نشاندہی کرتے ہیں، جن کا موازنہ YEASTRACT ڈیٹا بیس میں بیان کردہ ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹس سے کیا جا سکتا ہے۔ متعدد حیاتیاتی سوالات کو حل کرتے وقت جمع کردہ ڈیٹا کے استحصال کو قابل بنانے کے لیے سہولیات بھی فراہم کی جاتی ہیں، جیسا کہ ٹیوٹوریل میں مثال دی گئی ہے۔ YEASTRACT کسی دیئے گئے جین کے دستاویزی یا ممکنہ ٹرانسکرپشن ریگولیٹرز اور ہر ٹرانسکرپشن عنصر کے لیے دستاویزی یا ممکنہ ریگولیٹرز کی شناخت کی اجازت دیتا ہے۔ یہ ادب میں بیان کردہ ڈی این اے موفٹس اور ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹس کے درمیان موازنہ کو بھی ممکن بناتا ہے۔ یہ نظام جینوں کی فہرست کو گروپ کرنے کے لیے ایک مفید طریقہ کار بھی فراہم کرتا ہے (مثال کے طور پر اسی طرح کے اظہار پروفائلز کے ساتھ جینوں کا ایک مجموعہ جیسا کہ مائیکرو ارے تجزیہ سے ظاہر ہوتا ہے) معروف نقل کے عوامل کے ساتھ ان کی ریگولیٹری ایسوسی ایشن کی بنیاد پر۔ YEASTRACT جمع کردہ ڈیٹا سے اہم حیاتیاتی معلومات کو تلاش کرنے اور بازیافت کرنے اور جین بہ جین تجزیہ یا عالمی طریقوں سے ابھرتے ہوئے ڈیٹا سے خمیر میں ٹرانسکرپشن ریگولیشن نیٹ ورکس کی پیش گوئی کرنے کے لیے سوالات کا ایک مجموعہ فراہم کرتا ہے۔ نقل کے عوامل بھی دیکھیں حوالہ جات بیرونی لنکس http://www.yeastract.com حیاتیاتی ڈیٹا بیس Saccharomycetes جین اظہار نقل کے عوامل