ArrayTrack
ارے ٹریک ایک کثیر مقصدی بائیو انفارمیٹکس ٹول ہے جو بنیادی طور پر مائیکرو ارے ڈیٹا مینجمنٹ، تجزیہ اور تشریح کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ ارے ٹریک کو 2001 میں یو ایس فوڈ اینڈ ڈرگ ایڈمنسٹریشن کے لیے ان ہاؤس فلٹر ایرے ریسرچ کی حمایت کے لیے تیار کیا گیا تھا، اور اسے 2003 میں مائیکرو ارے کے لیے ایک مربوط تحقیقی ٹول کے طور پر عوام کے لیے آزادانہ طور پر دستیاب کیا گیا تھا۔ اس کے بعد سے، ارے ٹریک کے اوسطا ہر سال تقریبا 5,000 صارفین ہیں۔ اسے نیشنل سینٹر فار ٹاکسیکولوجیکل ریسرچ باقاعدگی سے اپ ڈیٹ کرتا ہے۔ خصوصیات ارے ٹریک تین بڑے اجزاء پر مشتمل ہے: اسٹڈی ڈیٹا بیس، ٹولز اور لائبریریاں، جو بالترتیب بنیادی طور پر ڈیٹا مینجمنٹ، تجزیہ اور تشریح کو سنبھالتی ہیں۔ ان اجزاء میں سے ہر ایک تک دوسرے دو سے براہ راست رسائی حاصل کی جا سکتی ہے، مثال کے طور پر، تجزیہ ٹولز کو اسٹڈی ڈیٹا بیس میں محفوظ تجرباتی ڈیٹا پر براہ راست استعمال کیا جا سکتا ہے، اور نتائج سے دریافت ہونے والے اہم جینوں سے لائبریریوں میں اضافی تشریحات اور متعلقہ پروٹین، راستے، جین آنٹولوجی کی اصطلاحات وغیرہ دیکھنے کے لیے پوچھ گچھ کی جا سکتی ہے۔ اسٹڈی ڈیٹا بیس: اسٹڈی ڈیٹا بیس میں صارف سے درآمد شدہ تجرباتی ڈیٹا ہوتا ہے، جس میں خام ڈیٹا اور اینوٹیشن ڈیٹا دونوں شامل ہوتے ہیں۔ یہ بنیادی طور پر مائیکرو ارے ڈیٹا کو منظم کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے، لیکن پروٹومکس اور میٹابولومکس ڈیٹا کو بھی سپورٹ کرتا ہے۔ درآمد شدہ ڈیٹا ابتدائی طور پر مالک کے لیے نجی ہوتا ہے لیکن دوسرے صارفین کے لیے دستیاب کیا جا سکتا ہے۔ اسٹڈی ڈیٹا بیس اہم جین کی فہرستیں بھی محفوظ کرتا ہے، جنہیں ارے ٹریک میں ڈیٹا تجزیہ کے نتائج سے براہ راست بنایا جا سکتا ہے۔ ٹولز: ایرے ٹریک میں تجزیہ اور تصور کے ٹولز کی ایک وسیع اقسام دستیاب ہیں، جن میں شامل ہیں لیکن ان تک محدود نہیں ہیں: شماریاتی تجزیہ کے ٹولز بشمول ٹی-ٹیسٹ، اے این او وی اے، اور ایس اے ایم-ٹیسٹ ؛ غیر نگرانی شدہ پیٹرن دریافت کے ٹولز بشمول درجہ بندی کلسٹرنگ تجزیہ اور پرنسپل جزو تجزیہ ؛ اور ماڈل پیشن گوئی کے ٹولز بشمول کے-قریب پڑوسیوں اور لکیری امتیازی تجزیہ۔ اگرچہ ارے ٹریک کے ٹولز درآمد شدہ ڈیٹا کو ایڈجسٹ کرنے کے لیے بنائے گئے ہیں، لیکن وہ بیرونی ڈیٹا کے ساتھ بھی مطابقت رکھتے ہیں۔ کتب خانے: ارے ٹریک کتب خانوں کے مجموعے کی میزبانی کرتا ہے جو مخصوص اینوٹیشن ڈیٹا کو محفوظ کرتا ہے، جسے متحرک اسپریڈشیٹ کی شکل میں دیکھا جا سکتا ہے۔ جین، پروٹین، راستے، جین آنٹولوجی کی اصطلاحات، کیمیائی مرکبات، ایس این پیز، کیو ٹی ایل، چپ کی اقسام، اور بہت کچھ کے لیے ایک مخصوص لائبریری ہے۔ ہر لائبریری ملٹی ان پٹ سرچ، چھانٹنا، فلٹر کرنا، کاپی پیسٹ کرنا اور برآمد کرنے کی حمایت کرتی ہے۔ ذخیرہ شدہ جین کی فہرستوں، تجزیہ کے نتائج اور دیگر کتب خانوں کے مطلوبہ مواد کے لیے کتب خانوں سے براہ راست پوچھ گچھ کی جا سکتی ہے۔ کسی بھی لائبریری میں ایک مخصوص اندراج کو اعداد و شمار کے اصل ذرائع سمیت بہت سے مقبول عوامی علم کے اڈوں میں مساوی اندراج سے جوڑا جا سکتا ہے۔ ارے ٹریک براہ راست مختلف قسم کے دیگر بائیو انفارمیٹکس سافٹ ویئر کے ساتھ مربوط ہے، جیسے کہ راستے کے تجزیے کے اوزار جینگو میٹا کور اور انجینیٹی پاتھ وے تجزیہ۔ رسائی ارے ٹریک عوام کے لیے آزادانہ طور پر دستیاب ہے اور اس تک آن لائن رسائی حاصل کی جا سکتی ہے۔ یہ کلائنٹ کے کمپیوٹر پر جاوا پر مبنی انٹرفیس کا استعمال کرتے ہوئے چلایا جاتا ہے جو ایف ڈی اے کے زیر اہتمام اوریکل ڈیٹا بیس سے منسلک ہوتا ہے۔ جاوا پر مبنی ایپلی کیشن کے طور پر، ارے ٹریک ونڈوز، میک اور لینکس مشینوں کے ساتھ مطابقت رکھتا ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط ارے ٹریک مرکزی صفحہ بائیو انفارمیٹکس سافٹ ویئر مائیکرواریز