Salmonella
سالمونیلا اینٹروبیکٹیریاسی خاندان کے چھڑی کی شکل والے (بیسیلس) گرام منفی بیکٹیریا کی ایک جینس ہے۔ سالمونیلا کی دو معروف انواع سالمونیلا اینٹریکا اور سالمونیلا بونگوری ہیں۔ ایس۔ اینٹریکا اس قسم کی انواع ہے اور اسے مزید چھ ذیلی اقسام میں تقسیم کیا گیا ہے جن میں 2,600 سے زیادہ سیروٹائپ شامل ہیں۔ سالمونلا کا نام ڈینیل ایلمر سالمن (1850-1914) کے نام پر رکھا گیا تھا، جو ایک امریکی ویٹرنری سرجن تھا۔ سالمونیلا پرجاتیوں غیر بیج بنانے والے، بنیادی طور پر متحرک اینٹروبیکٹیریا ہوتے ہیں جن کا خلیہ قطر تقریبا 0.7 اور 1.5 مائیکرو میٹر کے درمیان ہوتا ہے، لمبائی 2 سے 5 مائیکرو میٹر تک ہوتی ہے، اور پیریٹریچس فلیجیلا (خلیے کے جسم کے ارد گرد، انہیں حرکت کرنے کی اجازت دیتا ہے)۔ وہ کیموٹروفس ہیں، جو نامیاتی ذرائع کا استعمال کرتے ہوئے آکسیکرن اور تخفیف کے رد عمل سے اپنی توانائی حاصل کرتے ہیں۔ وہ فیکلٹیٹو اینیروبس بھی ہوتے ہیں، جو دستیاب ہونے پر آکسیجن ("ایروبکلی") کے ساتھ اڈینوسین ٹرائی فاسفیٹ پیدا کرنے کے قابل ہوتے ہیں، یا جب آکسیجن دستیاب نہ ہو تو دوسرے الیکٹران قبولیت یا خمیر ("اینیروبکلی") کا استعمال کرتے ہیں۔ سالمونیلا پرجاتیوں انٹرا سیلولر پیتھوجینز ہیں، جن میں سے بعض سیروٹائپ بیماری کا سبب بنتے ہیں۔ زیادہ تر انفیکشن فضلے سے آلودہ کھانے کے کھانے کی وجہ سے ہوتے ہیں۔ ٹائیفائیڈل سالمونیلا سیرٹائپز صرف انسانوں کے درمیان منتقل کیے جا سکتے ہیں اور کھانے سے پیدا ہونے والی بیماری کے ساتھ ساتھ ٹائیفائیڈ اور پیراٹائیفائیڈ بخار کا سبب بن سکتے ہیں۔ ٹائیفائیڈ بخار ٹائیفائیڈل سالمونیلا کے خون کے بہاؤ پر حملہ کرنے کے ساتھ ساتھ پورے جسم میں پھیلنے، اعضاء پر حملہ کرنے اور اینڈوٹاکسن (سیپٹک شکل) کے اخراج کی وجہ سے ہوتا ہے۔ یہ جان لیوا ہائپووولیمک شاک اور سیپٹک شاک کا باعث بن سکتا ہے، اور اینٹی بائیوٹکس سمیت انتہائی نگہداشت کی ضرورت ہوتی ہے۔ نان ٹائیفائیڈل سالمونیلا سیرٹائپز زونوٹک ہیں اور انہیں جانوروں سے اور انسانوں کے درمیان منتقل کیا جا سکتا ہے۔ وہ عام طور پر صرف معدے کی نالی پر حملہ کرتے ہیں اور سالمونیلوسس کا سبب بنتے ہیں، جن کی علامات کو اینٹی بائیوٹکس کے بغیر حل کیا جا سکتا ہے۔ تاہم، سب صحارا افریقہ میں، نان ٹائیفائیڈل سالمونیلا ناگوار ہو سکتا ہے اور پیراٹائیفائیڈ بخار کا سبب بن سکتا ہے، جس کے لیے فوری اینٹی بائیوٹک علاج کی ضرورت ہوتی ہے۔ درجہ بندی جینس سالمونیلا اینٹروبیکٹیریاسی کے خاندان کا حصہ ہے۔ اس کی درجہ بندی میں ترمیم کی گئی ہے اور اس میں الجھن پیدا کرنے کی صلاحیت ہے۔ جینس دو پرجاتیوں پر مشتمل ہے، ایس بونگوری اور ایس اینٹریکا، جن میں سے مؤخر الذکر چھ ذیلی اقسام میں تقسیم ہے: ایس ای اینٹریکا، ایس ای سلامے، ایس ای اریزونی، ایس ای ڈائرزونی، ایس ای ہوٹینے، اور ایس ای انڈیکا۔ ٹیکسونومک گروپ 2500 سے زیادہ سیروٹائپز (سیروور بھی) پر مشتمل ہے جس کی وضاحت سومیٹک او (لیپوپولیسیکرائڈ) اور فلیگیلر ایچ اینٹیجنز (کافمین-وائٹ درجہ بندی) کی بنیاد پر کی گئی ہے۔ سیرٹائپ کا پورا نام اس طرح دیا گیا ہے، مثال کے طور پر، سالمونلا اینٹریکا سب ایس پی۔ اینٹریکا سیرٹائپ ٹائیفیموریم، لیکن اسے مختصر طور پر سالمونلا ٹائیفیموریم کہا جا سکتا ہے۔ طبی اور وبائی امراض کی تحقیقات میں مدد کے لیے تناؤ کی مزید تفریق اینٹی بائیوٹک حساسیت کی جانچ اور دیگر سالماتی حیاتیات کی تکنیکوں جیسے پلسڈ فیلڈ جیل الیکٹروفورسس، ملٹی لوکس سیکوینس ٹائپنگ، اور تیزی سے پورے جینوم کی ترتیب کے ذریعے حاصل کی جا سکتی ہے۔ تاریخی طور پر، انسانوں میں میزبان کی ترجیح اور بیماری کے اظہار کی بنیاد پر سالمونیلے کو طبی لحاظ سے ناگوار (ٹائیفائیڈل) یا غیر ناگوار (نان ٹائیفائیڈل سالمونیلے) کے طور پر درجہ بند کیا گیا ہے۔ سالمونلا کو پہلی بار 1880 میں کارل ایبرتھ نے ٹائیفائیڈ کے مریضوں کے پیئر کے پیچ اور اسپلن میں دیکھا تھا۔ چار سال بعد، جارج تھیوڈور گیفکی خالص کلچر میں پیتھوجین کو اگانے میں کامیاب ہوئے۔ اس کے ایک سال بعد، طبی تحقیقی سائنسدان تھیوبالڈ اسمتھ نے دریافت کیا جسے بعد میں سالمونیلا اینٹریکا (ور) کے نام سے جانا جائے گا۔ کولریسوئس)۔ اس وقت، سمتھ ریاستہائے متحدہ کے محکمہ زراعت کے ویٹرنری ڈویژن میں ریسرچ لیبارٹری اسسٹنٹ کے طور پر کام کر رہے تھے۔ یہ ڈویژن ڈینیل ایلمر سالمون کے زیر انتظام تھا، جو ایک ویٹرنری پیتھولوجسٹ تھا۔ ابتدائی طور پر، سالمونلا کولریسوئس کو ہاگ ہیضے کا محرک سمجھا جاتا تھا، اس لیے سالمن اور اسمتھ نے اسے "ہاگ-ہیضے کا بیسلس" کا نام دیا۔ نام سلمنیلا 1900 تک استعمال نہیں کیا گیا تھا، جب جوزف لیون لگنئیرس نے تجویز پیش کی کہ سالمون کے گروپ کے ذریعہ دریافت کردہ پیتھوجین کو ان کے اعزاز میں سلمنیلا کہا جائے۔ 1930 کی دہائی کے آخر میں، آسٹریلیائی بیکٹیریولوجسٹ نینسی اٹکنسن نے حکومت جنوبی آسٹریلیا کی لیبارٹری آف پیتھولوجی اینڈ بیکٹیریاولوجی ایڈیلیڈ (بعد میں انسٹی ٹیوٹ آف میڈیکل اینڈ ویٹرنری سائنس) میں سالمنیلا ٹائپنگ لیبارٹری قائم کی-جو اس وقت دنیا میں صرف تین میں سے ایک تھی۔ یہیں پر اٹکنسن نے سالمونلا کے متعدد نئے تناؤ بیان کیے، جن میں سالمونلا ایڈیلیڈ بھی شامل ہے، جسے 1943 میں الگ کیا گیا تھا۔ اٹکنسن نے 1957 میں سالمونیلس پر اپنا کام شائع کیا۔ سیرٹائپنگ سیرٹائپنگ کسی خاص اینٹیجن کے لیے خلیوں کو اینٹی باڈیز کے ساتھ ملا کر کی جاتی ہے۔ یہ خطرے کے بارے میں کچھ اندازہ دے سکتا ہے۔ 2014 کے ایک مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ نوجوان ترکی کے نمونوں میں ایس ریڈنگ بہت عام ہے، لیکن یہ انسانی سالمونیلوسس میں اہم معاون نہیں ہے۔ سیرٹائپنگ انفیکشن کے مشتبہ ماخذ میں سیرٹائپ والے لوگوں میں سیرٹائپز کا ملاپ کرکے آلودگی کے منبع کی شناخت میں مدد کر سکتی ہے۔ سیرٹائپ کے معروف اینٹی بائیوٹک مزاحمت سے مناسب حفاظتی علاج کی شناخت کی جا سکتی ہے۔ مکمل جینوم سیکوینسنگ کے ذریعے روایتی سیروٹائپنگ اور ڈسکارڈنس ریزولوشن کے ساتھ ایکس ایم اے پی سالمونلا سیروٹائپنگ اسیسے کے موازنہ کو دیکھتے ہوئے، مطالعہ سے پتہ چلتا ہے کہ سالمونلا سیروٹائپنگ کے لیے سالمونلا سیروٹائپنگ ایک تیز رفتار طریقہ کے طور پر امید افزا ہے۔ ٹائیفائیڈل اور نان ٹائیفائیڈل سالمونیلا کی تفریق کے لیے ریئل ٹائم پی سی آر جانچ بھی دستیاب ہے۔ پتہ لگانے، کلچر اور نشوونما کے حالات سالمونیلا کی زیادہ تر ذیلی نسلیں ہائیڈروجن سلفایڈ پیدا کرتی ہیں، جن کا آسانی سے پتہ انہیں فیرس سلفیٹ پر مشتمل میڈیا پر اگانے سے لگایا جا سکتا ہے، جیسے کہ ٹرپل شوگر آئرن ٹیسٹ میں استعمال ہوتا ہے۔ زیادہ تر الگ تھلگ دو مراحل میں موجود ہیں، ایک متحرک مرحلہ اور ایک غیر متحرک مرحلہ۔ بنیادی کلچر پر غیر متحرک ثقافتوں کو کریگی ٹیوب یا ڈچ پلیٹ کا استعمال کرتے ہوئے متحرک مرحلے میں تبدیل کیا جا سکتا ہے۔ آر وی ایس شوربے کو طبی نمونے میں پتہ لگانے کے لیے سالمنیلا پرجاتیوں کو افزودہ کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ سالمونلا کا پتہ لگایا جا سکتا ہے اور نکالے گئے سالمونلا ڈی این اے سے ملٹی پلیکس یا ریئل ٹائم پولیمریز چین ری ایکشن (کیو پی سی آر) کا استعمال کرتے ہوئے ذیلی ٹائپ کیا جا سکتا ہے۔ مرغی، سور کا گوشت، ٹماٹر اور خربوزوں کے لیے سالمونیلا گروتھ کینیٹکس کے ریاضیاتی ماڈل تیار کیے گئے ہیں۔ سالمونیلا 40 منٹ کے سیل ڈویژن وقفے کے ساتھ غیر جنسی طور پر دوبارہ پیدا ہوتا ہے۔ سالمونیلا کی انواع بنیادی طور پر میزبان سے وابستہ طرز زندگی کی قیادت کرتی ہیں، لیکن یہ بیکٹیریا آلودگی کے بعد ہفتوں تک باتھ روم کی ترتیب میں برقرار رہنے کے قابل پائے گئے، اور اکثر پانی کے ذرائع سے الگ تھلگ رہتے ہیں، جو بیکٹیریل ذخائر کے طور پر کام کرتے ہیں اور میزبانوں کے درمیان منتقلی کو آسان بنانے میں مدد کر سکتے ہیں۔ سالمونیلا خشک ہونے سے بچنے کی صلاحیت کے لیے بدنام ہے اور خشک ماحول اور کھانوں میں برسوں تک برقرار رہ سکتا ہے۔ بیکٹیریا منجمد ہونے سے تباہ نہیں ہوتے ہیں، لیکن یو وی روشنی اور گرمی ان کی تباہی کو تیز کرتی ہے۔ وہ 90 منٹ، یا 12 منٹ تک گرم ہونے کے بعد ختم ہو جاتے ہیں، حالانکہ اگر زیادہ چربی، زیادہ مائع مادے جیسے مونگ پھلی کے مکھن میں ٹیکہ لگایا جائے تو وہ گرمی کی مزاحمت حاصل کرتے ہیں اور 30 منٹ تک زندہ رہ سکتے ہیں۔ سالمونیلا انفیکشن سے بچانے کے لیے، کھانے کو اندرونی درجہ حرارت پر گرم کرنے کی سفارش کی جاتی ہے۔ سالمونیلا کی انواع انسانوں اور جانوروں، خاص طور پر رینگنے والے جانوروں کے ہاضمے کے راستوں میں پائی جا سکتی ہیں۔ رینگنے والے جانوروں یا آبی حیات کی جلد پر سالمونیلا ان لوگوں کو منتقل کیا جا سکتا ہے جو جانوروں کو سنبھالتے ہیں۔ خوراک اور پانی بھی بیکٹیریا سے آلودہ ہو سکتے ہیں اگر وہ متاثرہ لوگوں یا جانوروں کے پاخانہ کے ساتھ رابطے میں آتے ہیں۔ ابتدائی طور پر، ہر سالمونلا "پرجاتیوں" کا نام طبی غور و فکر کے مطابق رکھا گیا تھا، مثال کے طور پر سالمونلا ٹائیفی-موریم (ماؤس ٹائیفائیڈ بخار)، ایس۔ ہیضے-سوئس۔ میزبان کی مخصوصیت کے بہت سی انواع کے لیے موجود نہ ہونے کی شناخت کے بعد، نئے تناؤ کو اس مقام کے مطابق انواع کے نام موصول ہوئے جہاں نئے تناؤ کو الگ کیا گیا تھا۔ 1987 میں، لی مائنر اور پوپوف نے سالماتی نتائج کا استعمال کرتے ہوئے یہ دلیل دی کہ سالمنیلا صرف ایک نوع، ایس اینٹریکا پر مشتمل ہے، جس نے سابقہ "پرجاتیوں" کے ناموں کو سیرٹائپ میں تبدیل کر دیا۔ 1989 میں، ریوز اور دیگر۔ اس نے تجویز پیش کی کہ سیروٹائپ V کو اپنی ہی نوع بن کر رہنا چاہیے، جس نے نام ایس بونگوری کو دوبارہ زندہ کیا۔ موجودہ (2005 تک) ناموں نے اس طرح شکل اختیار کر لی ہے، جس میں ایس۔ اینٹریکا کے تحت چھ تسلیم شدہ ذیلی اقسام ہیں: اینٹریکا (سیروٹائپ I)، سلامے (سیروٹائپ II)، اریزونی (IIIa)، ڈائرزونی (IIIb)، ہوٹین (IV)، اور انڈیکا (VI)۔ چونکہ متعدی بیماری کے ماہرین نئے نام سے واقف نہیں ہیں، اس لیے روایتی نام عام ہے۔ سیروٹائپ یا سیروور سامونیلا کی ایک درجہ بندی ہے جو ان اینٹیجنز پر مبنی ہے جو جاندار پیش کرتے ہیں۔ کافمین-وائٹ درجہ بندی اسکیم سیرولوجیکل اقسام کو ایک دوسرے سے الگ کرتی ہے۔ سیرٹائپ کو عام طور پر جینس اور پرجاتیوں کے بعد ذیلی اقسام کے گروپوں میں رکھا جاتا ہے، جس میں سیرٹائپ/سیروور بڑے ہوتے ہیں، لیکن اٹالیسائز نہیں ہوتے ہیں: اس کی ایک مثال سالمونلا اینٹریکا سیروور ٹائیفیموریم ہے۔ ٹائپنگ اور سب ٹائپنگ کے لیے زیادہ جدید طریقوں میں ڈی این اے پر مبنی طریقے شامل ہیں جیسے پلسڈ فیلڈ جیل الیکٹروفورسس، ملٹیپل لوسی وی این ٹی آر تجزیہ، ملٹی لوکس سیکوینس ٹائپنگ، اور ملٹی پلیکس-پی سی آر پر مبنی طریقے۔ 2005 میں، ایک تیسری نسل، سالمونیلا سبٹرانیہ، تجویز کی گئی تھی، لیکن عالمی ادارہ صحت کے مطابق، بتایا گیا جراثیم سالمونیلا جینس سے تعلق نہیں رکھتا ہے۔ 2016 میں، ایس سبٹرانیہ کو اٹلانٹیبیکٹر سبٹرانیہ کو تفویض کرنے کی تجویز پیش کی گئی تھی، لیکن ایل پی ایس این نے اسے غلط اشاعت کے طور پر مسترد کر دیا، کیونکہ یہ آئی جے ایس بی اور آئی جے ایس ای ایم سے باہر بنایا گیا تھا۔ جی ٹی ڈی بی اور این سی بی آئی 2016 کی دوبارہ تفویض سے متفق ہیں۔ جی ٹی ڈی بی آر ایس 202 رپورٹ کرتا ہے کہ ایس اریزونی، ایس ڈائرزونی، اور ایس ہوٹینے ان کی اپنی انواع ہونی چاہئیں۔ پیتھوجینسیٹی سالمونیلا انواع فیکلٹیٹو انٹرا سیلولر پیتھوجینز ہیں۔ سالمونیلا مختلف قسم کے خلیوں پر حملہ کر سکتا ہے، بشمول ایپیٹیلیل خلیات، ایم خلیات، میکروفیجز، اور ڈینڈریٹک خلیات۔ فیکلٹیٹو اینیروبک حیاتیات کے طور پر، سالمونیلا ایروبک ماحول (یعنی جب آکسیجن دستیاب ہو) میں اڈینوسین ٹرائی فاسفیٹ (اے ٹی پی) بنانے کے لیے آکسیجن کا استعمال کرتا ہے۔ تاہم، اینیروبک ماحول میں (یعنی جب آکسیجن دستیاب نہیں ہوتی ہے) سالمونیلا خمیر کے ذریعے اے ٹی پی پیدا کرتا ہے ؛ الیکٹران ٹرانسپورٹ چین کے آخر میں آکسیجن سے کم موثر چار الیکٹران قبولیتوں میں سے ایک یا زیادہ کو تبدیل کرکے: سلفیٹ، نائٹریٹ، سلفر، یا فیومریٹ۔ زیادہ تر انفیکشن جانوروں کے پاخانہ سے آلودہ کھانے کے کھانے کی وجہ سے، یا انسانی پاخانہ کی وجہ سے ہوتے ہیں، جیسے کہ تجارتی کھانے کی جگہ پر فوڈ سروس ورکر کے ذریعے۔ سالمونیلا سیرٹائپ کو دو اہم گروہوں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے-ٹائیفائیڈل اور نان ٹائیفائیڈل۔ ٹائیفائیڈل سیرٹائپز میں سالمونلا ٹائیفی اور سالمونلا پیراٹائیفی اے شامل ہیں، جو انسانوں کے لیے ڈھال لیے جاتے ہیں اور دوسرے جانوروں میں نہیں پائے جاتے۔ نان ٹائیفائیڈل سیرٹائپز زیادہ عام ہیں، اور عام طور پر خود کو محدود کرنے والی معدے کی بیماری کا سبب بنتی ہیں۔ وہ جانوروں کی ایک رینج کو متاثر کر سکتے ہیں، اور زونوٹک ہیں، یعنی انہیں انسانوں اور دوسرے جانوروں کے درمیان منتقل کیا جا سکتا ہے۔ پچھلے سالوں میں سالمنیلا پیتھوجینسیٹی اور میزبان تعامل کا بڑے پیمانے پر مطالعہ کیا گیا ہے۔ سالمونیلا کے زیادہ تر اہم وائرل جین پانچ پیتھوجینسیٹی جزائر، نام نہاد سالمونیلا پیتھوجینسیٹی جزائر (ایس پی آئی) میں انکوڈ کیے گئے ہیں۔ یہ کروموسومل انکوڈ ہوتے ہیں اور بیکٹیریل-میزبان تعامل میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ مزید خصلتیں جیسے پلازمیڈز، فلیجیلا یا بائیو فلم سے متعلق پروٹین انفیکشن میں حصہ ڈال سکتے ہیں۔ ایس پی آئی کی خصوصیت یہ ہے کہ وہ پیچیدہ اور ٹھیک ٹیونڈ ریگولیٹری نیٹ ورکس کے ذریعے ریگولیٹ کیے جاتے ہیں جو صرف صحیح ماحولیاتی تناؤ کی موجودگی میں جین کے اظہار کی اجازت دیتے ہیں۔ سالمونلا ٹائیفموریم پیتھوجینسیٹی کے لیے ایک پوٹیٹو کورم سینسر، سالمونلا ٹائیفموریم پیتھوجینسیٹی کا مالیکیولر ماڈلنگ اور ایس ڈی آئی اے ہومولوگ کا فعال سائٹ تجزیہ اے ایچ ایل ٹرانسکرپشنل ریگولیٹرز کے مخصوص بائنڈنگ پیٹرن کو ظاہر کرتا ہے۔ یہ بھی معلوم ہے کہ سالمونیلا پلازمیڈ وائرولنس جین ایس پی وی بی آٹوفیجی کو روک کر بیکٹیریل وائرولنس کو بڑھاتا ہے۔ ٹائیفائیڈل سالمونیلا ٹائیفائیڈ بخار سالمونیلا سیرٹائپز کی وجہ سے ہوتا ہے جو انسانوں یا اعلی پریمیٹس کے لیے سختی سے ڈھال لیا جاتا ہے-ان میں سالمونیلا ٹائیفی، پیراٹائیفی اے، پیراٹائیفی بی، اور پیراٹائیفی سی شامل ہیں۔ بیماری کی نظامی شکل میں، سالمونیلی آنتوں کے لمفیٹک نظام سے گزر کر مریضوں کے خون (ٹائیفائیڈ کی شکل) میں داخل ہوتا ہے اور ثانوی فوکی (سیپٹک شکل) بنانے کے لیے مختلف اعضاء (جگر، تلی، گردے) میں لے جایا جاتا ہے۔ اینڈوٹاکسن سب سے پہلے ویسکولر اور اعصابی آلات پر عمل کرتے ہیں، جس کے نتیجے میں پارگمیتا میں اضافہ ہوتا ہے اور شریانوں کا لہجہ کم ہوتا ہے، تھرمل ریگولیشن خراب ہوتا ہے، اور الٹی اور اسہال ہوتا ہے۔ بیماری کی شدید شکلوں میں، پانی نمک کی میٹابولزم کو خراب کرنے، گردش کرنے والے خون کے حجم اور شریانوں کے دباؤ کو کم کرنے، اور ہائپووولیمک شاک کا سبب بننے کے لیے کافی مائع اور الیکٹرولائٹس ختم ہو جاتے ہیں۔ سیپٹک شاک بھی پیدا ہو سکتا ہے۔ شدید سالمونیلوسس میں مخلوط کردار کا جھٹکا (ہائپووولیمک اور سیپٹک شاک دونوں کی علامات کے ساتھ) زیادہ عام ہے۔ اولیگوریا اور ازوٹیمیا شدید صورتوں میں ہائپوکسیا اور ٹاکسیمیا کی وجہ سے گردوں کی شمولیت کے نتیجے میں پیدا ہو سکتے ہیں۔ سالمونلا کے نان ٹائیفائیڈل سیروٹائپ کے ساتھ نان ٹائیفائیڈل سالمونلا نان انویسیو انفیکشن عام طور پر فوڈ پوائزننگ کا باعث بنتا ہے۔ انفیکشن عام طور پر اس وقت ہوتا ہے جب کوئی شخص ایسی غذا کھاتا ہے جس میں بیکٹیریا کی زیادہ مقدار ہوتی ہے۔ شیرخوار اور چھوٹے بچے انفیکشن کے لیے بہت زیادہ حساس ہوتے ہیں، جو آسانی سے بیکٹیریا کی ایک چھوٹی سی تعداد کو کھا کر حاصل کیے جا سکتے ہیں۔ نوزائیدہ بچوں میں، بیکٹیریا سے بھری ہوئی دھول کے سانس لینے سے انفیکشن ممکن ہے۔ یہ جاندار ہاضمہ کے راستے سے داخل ہوتے ہیں اور صحت مند بالغوں میں بیماری کا سبب بننے کے لیے انہیں بڑی تعداد میں کھایا جانا چاہیے۔ انفیکشن صرف زندہ سالمونیلا (نہ صرف سالمونیلا سے پیدا ہونے والے زہریلے مادے) کے معدے تک پہنچنے کے بعد شروع ہو سکتا ہے۔ کچھ خرد حیاتیات معدے میں مر جاتے ہیں، جبکہ زندہ بچ جانے والے چھوٹی آنت میں داخل ہوتے ہیں اور بافتوں میں کئی گنا بڑھ جاتے ہیں۔ گیسٹرک تیزابیت نگلنے والے بیکٹیریا کی اکثریت کی تباہی کا ذمہ دار ہے، لیکن سالمونیلا نے تیزابیت والے ماحول کے لیے ایک حد تک رواداری پیدا کی ہے جو نگلنے والے بیکٹیریا کے ذیلی سیٹ کو زندہ رہنے کی اجازت دیتی ہے۔ غذائی نالی میں پیدا ہونے والے میوکس میں بیکٹیریل کالونیاں بھی پھنس سکتی ہیں۔ انکیوبیشن کی مدت کے اختتام تک، قریبی میزبان خلیات مردہ سالمونیل سے خارج ہونے والے اینڈوٹاکسن کے ذریعے زہر آلود ہو جاتے ہیں۔ اینٹوٹاکسن کا مقامی ردعمل اینٹرائٹس اور معدے کی خرابی ہے۔ غیر ٹائیفائیڈل سالمونیلا کے تقریبا 2,000 سیرٹائپ معلوم ہیں، جو ہر سال ریاستہائے متحدہ میں 14 لاکھ تک بیماریوں کے لیے ذمہ دار ہو سکتے ہیں۔ جن لوگوں کو شدید بیماری کا خطرہ ہوتا ہے ان میں شیر خوار بچے، بوڑھے، اعضاء کی پیوند کاری کے وصول کنندگان، اور مدافعتی طور پر کمزور افراد شامل ہیں۔ حملہ آور جبکہ ترقی یافتہ ممالک میں، غیر ٹائیفائیڈل سیروٹائپ زیادہ تر معدے کی بیماری کے طور پر پیش کرتے ہیں، سب صحارا افریقہ میں، یہ سیروٹائپ خون کے بہاؤ کے انفیکشن میں ایک بڑا مسئلہ پیدا کر سکتے ہیں، اور بخار میں مبتلا افراد کے خون سے سب سے زیادہ الگ تھلگ بیکٹیریا ہیں۔ افریقہ میں غیر ٹائیفائیڈل سالمونیل کی وجہ سے خون کے بہاؤ میں ہونے والے انفیکشن کی اطلاع 2012 میں ملی تھی جس میں کیس کی شرح اموات 20-25% تھی۔ ناگوار نان ٹائیفائیڈل سالمونیلا انفیکشن (آئی این ٹی ایس) کے زیادہ تر معاملات سالمونیلا اینٹریکا ٹائیفیموریم یا سالمونیلا اینٹریکا اینٹریٹیڈس کی وجہ سے ہوتے ہیں۔ سالمونلا ٹائیفیموریم (ایس ٹی 313) کی ایک نئی شکل 75 سال قبل افریقی براعظم کے جنوب مشرق میں ابھری، اس کے بعد دوسری لہر جو 18 سال بعد وسطی افریقہ سے نکلی۔ آئی این ٹی ایس کی یہ دوسری لہر ممکنہ طور پر کانگو بیسن میں شروع ہوئی، اور اس واقعے کے اوائل میں ایک جین سامنے آیا جس نے اسے اینٹی بائیوٹک کلورامفینکول کے خلاف مزاحم بنا دیا۔ اس سے افریقہ کے ان علاقوں میں مہنگی اینٹی مائکروبیل دوائیں استعمال کرنے کی ضرورت پیدا ہوئی جو بہت غریب تھے، جس سے علاج مشکل ہو گیا۔ دوسرے خطوں کے مقابلے میں سب صحارا افریقہ میں آئی این ٹی ایس کا بڑھتا ہوا پھیلاؤ افریقی آبادی کے بڑے تناسب کی وجہ سے سمجھا جاتا ہے جس میں ایچ آئی وی، ملیریا اور غذائیت کے بوجھ کی وجہ سے کچھ حد تک مدافعتی دباؤ یا خرابی ہے، خاص طور پر بچوں میں۔ آئی این ٹی ایس کا جینیاتی میک اپ زیادہ ٹائیفائیڈ جیسے جراثیم میں تبدیل ہو رہا ہے، جو انسانی جسم کے ارد گرد مؤثر طریقے سے پھیل سکتا ہے۔ علامات متنوع ہونے کی اطلاع دی گئی ہے، بشمول بخار، ہیپاٹوسپلینومیگلی، اور سانس کی علامات، اکثر معدے کی علامات کی عدم موجودگی کے ساتھ۔ ایپیڈیمولوجی چھٹپٹ سمجھے جانے کی وجہ سے، 60 ٪ سے 80 ٪ کے درمیان سالمنیلا انفیکشن کے معاملات کی تشخیص نہیں ہوتی ہے۔ مارچ 2010 میں، اعداد و شمار کا تجزیہ 1140 فی 100,000 افراد سال کے واقعات کی شرح کا تخمینہ لگانے کے لیے مکمل کیا گیا تھا۔ اسی تجزیے میں، گیسٹرو اینٹرائٹس کے 93.8 ملین کیس سالمنیلا انفیکشن کی وجہ سے تھے۔ 5 ویں فیصد پر تخمینہ شدہ رقم 61.8 ملین کیسز تھی اور 95 ویں فیصد پر تخمینہ شدہ رقم 131.6 ملین کیسز تھی۔ سالمنیلا کی وجہ سے ہونے والی اموات کی تخمینہ تعداد تقریبا 155,000 تھی۔ 2014 میں، بلغاریہ اور پرتگال جیسے ممالک میں، 4 سال سے کم عمر کے بچوں میں سالمنیلا انفیکشن ہونے کا امکان بالترتیب 32 اور 82 گنا زیادہ تھا۔ جو لوگ انفیکشن کا سب سے زیادہ شکار ہوتے ہیں وہ ہیں: بچے، حاملہ خواتین، بزرگ افراد، اور وہ لوگ جن میں مدافعتی نظام کی کمی ہے۔ سالمونیلا انفیکشن کے خطرے کے عوامل میں مختلف قسم کے کھانے شامل ہیں۔ گوشت جیسے مرغی اور سور کا گوشت آلودہ ہونے کا امکان رکھتا ہے۔ مختلف قسم کی سبزیوں اور انکریوں میں بھی سالمنیلا ہو سکتا ہے۔ آخر میں، مختلف قسم کے پروسسڈ فوڈز جیسے چکن نگٹس اور پاٹ پائیز میں بھی یہ بیکٹیریا ہو سکتا ہے۔ روک تھام کی کامیاب شکلیں موجودہ اداروں جیسے ایف ڈی اے، ریاستہائے متحدہ کے محکمہ زراعت، اور فوڈ سیفٹی اینڈ انسپیکشن سروس سے آتی ہیں۔ یہ تمام تنظیمیں امریکہ میں عوامی تحفظ کو یقینی بنانے کے لیے معیارات اور معائنہ کرتی ہیں۔ مثال کے طور پر، یو ایس ڈی اے کے ساتھ کام کرنے والی ایف ایس آئی ایس ایجنسی کے پاس سالمنیلا ایکشن پلان موجود ہے۔ حال ہی میں اسے فروری 2016 میں دو سالہ منصوبے کی تازہ کاری موصول ہوئی۔ سالمونلا انفیکشن کو کم کرنے کے لیے ان کی کامیابیاں اور حکمت عملی منصوبوں میں پیش کی گئی ہیں۔ بیماریوں کے کنٹرول اور روک تھام کے مراکز بھی روک تھام کی دیکھ بھال کے بارے میں قیمتی معلومات فراہم کرتے ہیں، جیسے کہ خام کھانوں کو محفوظ طریقے سے سنبھالنے کا طریقہ، اور ان مصنوعات کو ذخیرہ کرنے کا صحیح طریقہ۔ یورپی یونین میں، یورپی فوڈ سیفٹی اتھارٹی نے رسک مینجمنٹ اور رسک اسسمنٹ کے ذریعے حفاظتی اقدامات بنائے۔ 2005 سے 2009 تک، ای ایف ایس اے نے سالمونیلا کی نمائش کو کم کرنے کے لیے ایک نقطہ نظر پیش کیا۔ ان کے نقطہ نظر میں پولٹری کے خطرے کی تشخیص اور خطرے کا انتظام شامل تھا، جس کے نتیجے میں انفیکشن کے معاملات میں نصف کمی واقع ہوئی۔ لاطینی امریکہ میں ڈاکٹر شیری لیٹن کی تیار کردہ پولٹری میں سالمونیلا کے لیے زبانی طور پر دی جانے والی ویکسین متعارف کرائی گئی ہے جو بیکٹیریا کو پرندوں کو آلودہ کرنے سے روکتی ہے۔ حالیہ سالمونلا ٹائیفیموریم کی وبا کو چاکلیٹ سے جوڑا گیا ہے۔ عالمی نگرانی جرمنی میں، خوراک سے پیدا ہونے والے انفیکشن کی اطلاع دی جانی چاہیے۔ 1990 سے 2016 تک، سرکاری طور پر درج شدہ کیسوں کی تعداد تقریبا 200,000 سے کم ہو کر تقریبا 13,000 ہو گئی۔ ریاستہائے متحدہ میں، سالمونیلا انفیکشن کے تقریبا 1,200,000 معاملات ہر سال ہونے کا تخمینہ لگایا جاتا ہے۔ عالمی ادارہ صحت کے ایک مطالعے میں اندازہ لگایا گیا ہے کہ 2000 میں ٹائیفائیڈ بخار کے 21,650,974 کیس سامنے آئے، جن میں سے 216,510 موت کا باعث بنے، ساتھ ہی 5,412,744 پیراٹائیفائیڈ بخار کے کیس بھی۔ انفیکشن کے مالیکیولر میکانزم جسم میں ان کے مختلف اہداف اور ان کی وجہ سے پیدا ہونے والی مختلف علامات کی وجہ سے انفیکشن کے میکانزم ٹائیفائیڈل اور نان ٹائیفائیڈل سیروٹائپ کے درمیان مختلف ہوتے ہیں۔ دونوں گروپوں کو آنتوں کی خلیے کی دیوار سے پیدا ہونے والی رکاوٹ کو عبور کر کے داخل ہونا چاہیے، لیکن ایک بار جب وہ اس رکاوٹ کو عبور کر لیتے ہیں، تو وہ انفیکشن کا سبب بننے کے لیے مختلف حکمت عملی استعمال کرتے ہیں۔ معدے کی نالی میں اپنے ہدف ٹشو کی طرف سفر کرتے وقت، سالمونیلا کو معدے کے تیزاب، آنتوں میں پت کی ڈٹرجنٹ جیسی سرگرمی، آکسیجن کی فراہمی میں کمی، مسابقتی عام آنتوں کے پودوں، اور آخر میں آنتوں کی دیوار کو پرت کرنے والے خلیوں کی سطح پر موجود اینٹی مائکروبیل پیپٹائڈز کا سامنا کرنا پڑتا ہے۔ یہ تمام شکلیں اس بات پر زور دیتی ہیں کہ سالمونیلا محسوس کر سکتی ہے اور اس کے خلاف رد عمل ظاہر کر سکتی ہے، اور وہ وائرس کے عوامل بناتی ہیں اور اس طرح آنتوں میں ان کی معمول کی نشوونما سے وائرس میں تبدیلی کو منظم کرتی ہیں۔ وائرولنس میں تبدیلی میزبان (جیسے انسان) کے اندر نقل کے مقام تک رسائی فراہم کرتی ہے، اور اس کا خلاصہ کئی مراحل میں کیا جا سکتا ہے: نقطہ نظر، جس میں وہ آنتوں کے پیریسٹالسس کے ذریعے میزبان خلیے کی طرف سفر کرتے ہیں اور فلیجیلا کے ذریعے فعال تیراکی کے ذریعے، میوکس رکاوٹ میں گھس جاتے ہیں، اور خود کو آنتوں کی پرت والے اپیتھیلیم کے قریب پاتے ہیں، چپکنا، جس میں وہ بیکٹیریل چپکنے اور ٹائپ III کے سراو کے نظام کا استعمال کرتے ہوئے میزبان خلیے پر قائم رہتے ہیں، حملہ، جس میں سالمونیلا میزبان خلیے میں داخل ہوتا ہے (نیچے مختلف میکانزم دیکھیں)، نقل، جس میں بیکٹیریا میزبان خلیے کے اندر دوبارہ پیدا ہو سکتا ہے، پھیلاؤ، جس میں بیکٹیریا خلیوں کے ذریعے دوسرے اعضاء میں پھیل سکتا ہے۔ متبادل طور پر، بیکٹیریا آنتوں کی طرف واپس جا سکتے ہیں، آنتوں کی آبادی کو دوبارہ بیج دے سکتے ہیں۔ دوبارہ حملہ (ایک ثانوی انفیکشن، اگر اب کسی نظامی جگہ پر ہے) اور مزید نقل۔ داخلے کے طریقہ کار نان ٹائیفائیڈل سیرٹائپ ترجیحی طور پر بیکٹیریل ثالثی والے اینڈوسیٹوسس کے ذریعے آنتوں کی دیوار پر ایم خلیوں میں داخل ہوتے ہیں، یہ عمل آنتوں کی سوزش اور اسہال سے وابستہ ہے۔ وہ آنتوں کی دیوار کے خلیوں کے درمیان تنگ جنکشن میں خلل ڈالنے کے قابل بھی ہوتے ہیں، جس سے خلیوں کی آنتوں میں آئنوں، پانی اور مدافعتی خلیوں کے بہاؤ کو روکنے کی صلاحیت خراب ہو جاتی ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ بیکٹیریل ثالثی والے اینڈوسیٹوسس کی وجہ سے ہونے والی سوزش کا امتزاج اور تنگ جنکشن میں خلل اسہال کو شامل کرنے میں نمایاں کردار ادا کرتا ہے۔ سالمونیلا سی ڈی 18 مثبت مدافعتی خلیوں کے ذریعے فیگوسیٹوسس اور اسمگلنگ کے ذریعے آنتوں کی رکاوٹ کو توڑنے کے قابل بھی ہوتے ہیں، جو ٹائیفائیڈل سالمونیلا انفیکشن کا ایک طریقہ کار ہو سکتا ہے۔ یہ آنتوں کی رکاوٹ کو عبور کرنے کا ایک زیادہ خفیہ طریقہ سمجھا جاتا ہے، اور اس وجہ سے، اس حقیقت میں حصہ ڈال سکتا ہے کہ غیر ٹائیفائیڈل سالمونیلا کے مقابلے میں انفیکشن کے لیے ٹائیفائیڈل سالمونیلا کی کم تعداد درکار ہوتی ہے۔ سالمونیلا خلیات میکروپینوسیٹوسس کے ذریعے میکروفیجز میں داخل ہونے کے قابل ہوتے ہیں۔ ٹائیفائیڈل سیرٹائپز اس کا استعمال مونو نیوکلیئر فگوسیٹ سسٹم کے ذریعے پورے جسم میں پھیلاؤ حاصل کرنے کے لیے کر سکتے ہیں، کنیکٹو ٹشو کا ایک نیٹ ورک جس میں مدافعتی خلیات ہوتے ہیں، اور پورے جسم میں مدافعتی نظام سے وابستہ ٹشو کو گھیرے ہوئے ہوتے ہیں۔ انفیکشن کا سبب بننے میں سالمونیلا کی زیادہ تر کامیابی دو قسم کے III سراو کے نظام (T3SS) سے منسوب ہے جو انفیکشن کے دوران مختلف اوقات میں ظاہر ہوتے ہیں۔ T3SS-1 میزبان سائٹوسول کے اندر بیکٹیریل ایفیکٹرز کے انجیکشن کو قابل بناتا ہے۔ یہ T3SS-1 ایفیکٹر جھلی کے رفل کی تشکیل کو متحرک کرتے ہیں جس سے غیر فیگوسیٹک خلیوں کے ذریعہ سالمونلا کو جذب کرنے کی اجازت ملتی ہے۔ سالمونیلا مزید جھلی سے جڑے ڈبے کے اندر رہتا ہے جسے سالمونیلا پر مشتمل ویکیوول (ایس سی وی) کہا جاتا ہے۔ ایس سی وی کی تیزابیت T3SS-2 کے اظہار کی طرف لے جاتی ہے۔ میزبان سائٹوسول میں اس کی موثر بقا اور نظامی بیماری کے قیام کے لیے سالمونیلا کے ذریعے T3SS-2 ایفیکٹرز کا سراو ضروری ہے۔ اس کے علاوہ، T3SS دونوں آنتوں کی نوآبادیات، آنتوں کے سوزش کے ردعمل اور اسہال کو شامل کرنے میں شامل ہیں۔ ان نظاموں میں بہت سے جین ہوتے ہیں جنہیں انفیکشن حاصل کرنے کے لیے باہمی تعاون سے کام کرنا پڑتا ہے۔ ایس۔ ٹائیفموریم کے ایس پی آئی 1 ٹائپ III سراو کے نظام کے ذریعے انجکشن کیا گیا اے وی آر اے ٹاکسن اس کی سیرائن/تھریونین ایکٹیل ٹرانسفرس سرگرمی کی وجہ سے پیدائشی مدافعتی نظام کو روکنے کا کام کرتا ہے، اور یوکرائیوٹک ٹارگٹ سیل فائٹک ایسڈ (آئی پی 6) کے پابند ہونے کی ضرورت ہوتی ہے۔ یہ میزبان کو انفیکشن کے لیے زیادہ حساس بنا دیتا ہے۔ طبی علامات سالمونیلوسس کمر کے درد یا اسپونڈیلوسس کا سبب بننے کے قابل ہونے کے لیے جانا جاتا ہے۔ یہ پانچ طبی نمونوں کے طور پر ظاہر ہو سکتا ہے: معدے کی نالی کا انفیکشن، اندرونی بخار، بیکٹیریمیا، مقامی انفیکشن، اور دائمی ذخائر کی حالت۔ ابتدائی علامات غیر مخصوص بخار، کمزوری، اور دیگر کے درمیان دل کا دورہ پڑنا ہیں۔ بیکٹیریمیا کی حالت میں، یہ جسم کے کسی بھی حصے میں پھیل سکتا ہے اور اس سے مقامی انفیکشن ہوتا ہے یا یہ پھوڑے بناتا ہے۔ مقامی سلمنیلا انفیکشن کی شکلیں گٹھیا، پیشاب کی نالی کا انفیکشن، مرکزی اعصابی نظام کا انفیکشن، ہڈیوں کا انفیکشن، نرم بافتوں کا انفیکشن وغیرہ ہیں۔ انفیکشن ایک طویل عرصے تک پوشیدہ شکل کے طور پر رہ سکتا ہے، اور جب ریٹیکولر اینڈوتھیلیل خلیوں کا کام خراب ہو جاتا ہے، تو یہ فعال ہو سکتا ہے اور اس کے نتیجے میں، یہ ثانوی طور پر شدید سالمونیلوسس کے کئی ماہ یا کئی سال بعد ہڈی میں انفیکشن پھیلانے کا سبب بن سکتا ہے۔ 2018 کے امپیریل کالج لندن کے مطالعے سے یہ بھی پتہ چلتا ہے کہ کس طرح سالمنیلا مدافعتی نظام کے مخصوص بازوؤں میں خلل ڈالتا ہے (جیسے۔ 5 میں سے 3 این ایف-کپا بی پروٹین) زنک میٹالوپروٹینز ایفیکٹرز کے خاندان کا استعمال کرتے ہوئے، دوسروں کو اچھوتا چھوڑتے ہیں۔ سالمونیلا تائیرائڈ پھوڑے کی بھی اطلاع ملی ہے۔ آکسیڈیٹیو پھٹنے کے خلاف مزاحمت سالمونیلا پیتھوجینسیس کی ایک پہچان بیکٹیریا کی فیگوسائٹس کے اندر زندہ رہنے اور پھیلنے کی صلاحیت ہے۔ پیتھوجینز کے خلاف دفاع کے طور پر فگوسیٹس ڈی این اے کو نقصان پہنچانے والے ایجنٹ جیسے نائٹرک آکسائڈ اور آکسیجن ریڈیکلز تیار کرتے ہیں۔ اس طرح، سالمونیلا پرجاتیوں کو ان مالیکیولز کے حملے کا سامنا کرنا پڑتا ہے جو جینوم کی سالمیت کو چیلنج کرتے ہیں۔ بکمیئر اور دیگر۔ اس سے پتہ چلتا ہے کہ ایس۔ اینٹریکا کے میوٹینٹس جن میں ریکا یا ریک بی سی پروٹین فنکشن کی کمی ہوتی ہے وہ میکروفیجز کے ذریعے ترکیب شدہ آکسیڈیٹیو مرکبات کے لیے انتہائی حساس ہوتے ہیں، اور مزید یہ نتائج اس بات کی نشاندہی کرتے ہیں کہ ایس۔ اینٹریکا کے ذریعے کامیاب نظامی انفیکشن کے لیے ریکا-اور ریک بی سی کی ثالثی سے ڈی این اے کے نقصان کی ریکومبنیشنل مرمت کی ضرورت ہوتی ہے۔ میزبان موافقت ایس اینٹریکا، اس کے کچھ سیرٹائپز جیسے ٹائیفیموریم اور اینٹریٹیڈس کے ذریعے، کئی مختلف ممالیہ میزبان پرجاتیوں کو متاثر کرنے کی صلاحیت کے آثار دکھاتا ہے، جبکہ ٹائیفی جیسے دیگر سیرٹائپز صرف چند میزبانوں تک محدود دکھائی دیتے ہیں۔ سالمنیلا سیرٹائپز نے اپنے میزبانوں کے مطابق ڈھالنے کے کچھ طریقوں میں جینیاتی مواد کا نقصان اور تغیر شامل ہیں۔ زیادہ پیچیدہ ممالیہ پرجاتیوں میں، مدافعتی نظام، جس میں پیتھوجین کے مخصوص مدافعتی ردعمل شامل ہیں، فلیگلا جیسے ڈھانچوں سے اینٹی باڈیز کے پابند ہونے کے ذریعے سالمونیلا کے سیروور کو نشانہ بناتے ہیں۔ جینیاتی مواد کے نقصان کے ذریعے جو فلیگیلم کی تشکیل کے لیے کوڈ کرتا ہے، سالمونیلا میزبان کے مدافعتی نظام سے بچ سکتا ہے۔ بیکٹیریا وائرولنس جین (ایم جی ٹی سی بی آر اوپیرون) سے ایم جی ٹی سی لیڈر آر این اے ایف ایل جے بی جین انکوڈنگ فلیگیلن کے ایم آر این ایز کے ساتھ براہ راست بیس جوڑی بنا کر انفیکشن کے دوران فلیگیلن کی پیداوار کو کم کرتا ہے اور انحطاط کو فروغ دیتا ہے۔ کسلا اور دیگر کے مطالعے میں، ایس اینٹریکا کے زیادہ پیتھوجینک سیرووروں میں عام طور پر کچھ چپکنے والے پائے گئے جو متغیر ارتقاء سے تیار ہوئے ہیں۔ اس کا مطلب یہ ہے کہ، چونکہ سالمونیلا کے ان تناؤ کو مدافعتی نظام جیسے اسی طرح کے حالات کا سامنا کرنا پڑا ہے، اسی طرح کے ڈھانچے میزبانوں میں ان اسی طرح کے، زیادہ جدید دفاع کو مسترد کرنے کے لیے الگ سے تیار ہوئے ہیں۔ پھر بھی، اس بارے میں بہت سے سوالات باقی ہیں کہ سالمونیلا کس طرح بہت سی مختلف اقسام میں تیار ہوا ہے، لیکن سالمونیلا کئی مراحل میں تیار ہوا ہوگا۔ جیسا کہ بوملر اور دیگر۔ انہوں نے تجویز کیا ہے کہ سالمونیلا ممکنہ طور پر افقی جین کی منتقلی، اضافی پیتھوجینسیٹی جزائر کی وجہ سے نئے سیروور کی تشکیل اور اس کے نسب کے تخمینے کے ذریعے تیار ہوا۔ لہذا، سالمنیلا مختلف پیتھوجینک بیکٹیریا سے جینیاتی معلومات حاصل کرکے اپنے بہت سے مختلف سیرٹائپ میں تبدیل ہو سکتا تھا۔ مختلف سیروٹائپ کے جینوم میں کئی پیتھوجینسیٹی جزائر کی موجودگی نے اس نظریہ کو تقویت دی ہے۔ سالمونیلا ایس وی۔ نیوپورٹ میں پودوں کی نوآبادیاتی طرز زندگی کے مطابق موافقت کے آثار ہیں، جو پیداوار سے منسلک کھانے سے پیدا ہونے والی بیماری کے ساتھ اس کی غیر متناسب وابستگی میں کردار ادا کر سکتے ہیں۔ ایس وی کے دوران منتخب کردہ مختلف قسم کے افعال۔ ٹماٹر میں نیوپورٹ کی استقامت ایس وی میں منتخب کردہ لوگوں سے ملتی جلتی بتائی گئی ہے۔ جانوروں کے میزبانوں سے ٹائیفموریم۔ پی پی اے جین، جو ایس وی کے لیے منفرد ہے۔ نیوپورٹ، ٹماٹر میں تناؤ کی فٹنس میں حصہ ڈالتا ہے، اور دوسرے اینٹروبیکٹیریا کے جینومز میں ہومولوگ ہوتے ہیں جو پودوں اور جانوروں کے میزبانوں کو آباد کرنے کے قابل ہوتے ہیں۔ تحقیق پیتھوجینز کے طور پر ان کی اہمیت کے علاوہ، نان ٹائیفائیڈل سالمونلا پرجاتیوں جیسے ایس۔ اینٹریکا سیروور ٹائیفموریم کو عام طور پر ٹائیفائیڈ پرجاتیوں کے ہم جنس پرستوں کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے۔ بہت سے نتائج قابل منتقلی ہوتے ہیں اور یہ آلودگی کی صورت میں محقق کے لیے خطرے کو کم کرتا ہے، لیکن یہ محدود بھی ہوتا ہے۔ مثال کے طور پر، اس ماڈل کا استعمال کرتے ہوئے مخصوص ٹائیفائیڈل ٹاکسن کا مطالعہ کرنا ممکن نہیں ہے۔ تاہم، مضبوط تحقیقی ٹولز جیسے کہ عام طور پر استعمال ہونے والا ماؤس آنتوں کا گیسٹرو اینٹرائٹس ماڈل سالمونیلا ٹائیفیموریم کے استعمال پر مبنی ہے۔ جینیات کے لیے، ایس۔ ٹائیفیموریم جینیاتی آلات کی ترقی میں اہم کردار ادا کرتا رہا ہے جس کی وجہ سے بنیادی بیکٹیریل فزیولوجی کی تفہیم ہوتی ہے۔ یہ پیش رفت ایس۔ ٹائیفموریم میں پہلے عمومی ٹرانسڈیوسنگ فیج پی 22 کی دریافت سے ممکن ہوئی، جس نے فوری اور آسان جینیاتی ترمیم کی اجازت دی۔ بدلے میں، اس نے عمدہ ساخت کے جینیاتی تجزیے کو ممکن بنایا۔ متغیرات کی بڑی تعداد بیکٹیریا کے جینیاتی نام پر نظر ثانی کا باعث بنی۔ جینیاتی آلات کے طور پر ٹرانسپوسن کے بہت سے استعمال، بشمول ٹرانسپوسن کی ترسیل، میوٹیجینیسیس، اور کروموسوم کی دوبارہ ترتیب کی تعمیر، ایس ٹائیفیموریم میں بھی تیار کیے گئے تھے۔ یہ جینیاتی اوزار کارسنوجینز کے لیے ایک سادہ ٹیسٹ، ایمس ٹیسٹ کا باعث بھی بنے۔ روایتی اینٹی مائکروبیلز کے قدرتی متبادل کے طور پر، فیجز کو سالمونیلا اور دیگر کھانے سے پیدا ہونے والے بیکٹیریا کے لیے انتہائی موثر کنٹرول ایجنٹوں کے طور پر تسلیم کیا جا رہا ہے۔ قدیم ڈی این اے ایس اینٹریکا جینومز کو مغربی یوریشیا میں 6,500 سال پرانی انسانی باقیات سے دوبارہ تعمیر کیا گیا ہے، جو قبل از تاریخ کے دوران نظامی ایس اینٹریکا کے ساتھ جغرافیائی وسیع پیمانے پر انفیکشن کا ثبوت فراہم کرتا ہے، اور میزبان موافقت کے ارتقاء میں نیوولیتھائزیشن کے عمل کا ممکنہ کردار ہے۔ نوآبادیاتی میکسیکو سے اضافی دوبارہ تعمیر شدہ جینوم ایس اینٹریکا کو کوکولزٹلی کی وجہ بتاتے ہیں، جو 16 ویں صدی کے نیو اسپین میں ایک وبا ہے۔ یہ بھی دیکھیں 1984 رجنیشی بائیوٹرر اٹیک دی گریٹ ہارمل ڈیزاسٹر آف '98 2008 یونائیٹڈ سٹیٹس سالمونیلوسس پھیلنا امریکن پبلک ہیلتھ ایسوسی ایشن بمقابلہ بٹز بسمتھ سلفایٹ اگر فوڈ ٹیسٹنگ سٹرپس میزبان-پیتھوجین انٹرفیس فہرست کھانے سے پیدا ہونے والی بیماری کے پھیلنے کی فہرست 2008-2009 مونگ پھلی سے پیدا ہونے والی سالمونیلوسس رائٹ کاؤنٹی انڈے XLD اگر حوالہ جات بیرونی لنکس ریاستہائے متحدہ کے محکمہ زراعت کی فوڈ سیفٹی اینڈ انسپیکشن سروس سے سالمونلا پر پس منظر سالمونلا جینومز اور پی اے ٹی آر آئی سی میں متعلقہ معلومات، این آئی اے آئی ڈی کے ذریعہ مالی اعانت فراہم کردہ بائیو انفارمیٹکس ریسورس سینٹر تجارتی اور ادارہ جاتی سینیٹائزنگ کے طریقوں سالمونلا کے بارے میں سوالات اور جوابات سالمونلا کو سالمونلا کے نام پر آئی ایف اے ایس نوٹس سے ابھرتے ہوئے پیتھوجین کے طور پر