SecDF protein-export membrane protein
এস. ই. সি. ডি এবং এস. ই. সি. এফ হল প্রোক্যারিওটিক প্রোটিন রপ্তানি ঝিল্লি প্রোটিন। এগুলি এসইসিএ, ডি, ই, এফ, জি, ওয়াই এবং ইয়াজসি সমন্বিত বৃহত্তর মাল্টিমেরিক প্রোটিন রপ্তানি কমপ্লেক্সের একটি অংশ। প্রোটন মোটিভ ফোর্স বজায় রাখার জন্য এস. ই. সি. ডি এবং এস. ই. সি. এফ প্রয়োজন। কিছু গ্রাম-নেগেটিভ ব্যাকটেরিয়ার অভ্যন্তরীণ ঝিল্লি জুড়ে স্রাব প্রিপ্রোটিন ট্রান্সলোকেজ পথের মাধ্যমে ঘটে। প্রোটিনগুলি অগ্রদূত হিসাবে সাইটোপ্লাজমে উত্পাদিত হয় এবং এগুলিকে ট্রান্সলোকেস উপাদানের দিকে পরিচালিত করার জন্য একটি চ্যাপেরোন সাবইউনিটের প্রয়োজন হয়। সেখান থেকে, পরিপক্ক প্রোটিনগুলি হয় বাইরের ঝিল্লিতে লক্ষ্য করা হয়, অথবা পেরিপ্লাজমিক প্রোটিন হিসাবে থেকে যায়। ট্রান্সলোকেজ প্রোটিন সাবইউনিটগুলি ব্যাকটেরিয়াল ক্রোমোজোমের উপর এনকোড করা থাকে। ট্রান্সলোকেস নিজেই 7টি প্রোটিন নিয়ে গঠিত, যার মধ্যে একটি চ্যাপেরোন প্রোটিন (এসইসিবি), একটি এটিপিজ (এসইসিএ), একটি অবিচ্ছেদ্য ঝিল্লি জটিল (এসইসিওয়াই, এসইসিই এবং এসইসিজি) এবং দুটি অতিরিক্ত ঝিল্লি প্রোটিন রয়েছে যা পরিপক্ক পেপটাইডকে পেরিপ্লাজমে (এসইসিডি এবং এসইসিএফ) মুক্ত করতে সহায়তা করে। চ্যাপেরোন প্রোটিন এস. ই. সি. বি একটি অত্যন্ত অম্লীয় হোমোটেট্রামেরিক প্রোটিন যা ব্যাকটেরিয়াল সাইটোপ্লাজমে "ডাইমার অফ ডাইমার" হিসাবে বিদ্যমান। এস. ই. সি. বি অনুবাদের পরে প্রিপ্রোটিনগুলিকে একটি উন্মুক্ত অবস্থায় বজায় রাখে এবং এগুলিকে স্রাবের জন্য পেরিফেরাল মেমব্রেন প্রোটিন এ. টি. পি. এস. ই. সি. এ-তে লক্ষ্য করে। এসইসি এবং এসইসিজির সাথে, এসইসি একটি মাল্টিমেরিক চ্যানেল গঠন করে যার মাধ্যমে প্রোটন মোটিভ ফোর্স এবং এটিপি-চালিত নিঃসরণ উভয়ই ব্যবহার করে প্রিপ্রোটিনগুলি স্থানান্তরিত হয়। পরেরটি এসইসিএ দ্বারা মধ্যস্থতা করা হয়। এসচেরিচিয়া কোলাই সেকওয়াইইজি সমাবেশের কাঠামোটি দুটি ঝিল্লির একটি স্যান্ডউইচ প্রকাশ করে যা বিস্তৃত সাইটোপ্লাজমিক ডোমেনের মাধ্যমে মিথস্ক্রিয়া করে। প্রতিটি ঝিল্লি সেকেওয়াইইজি-র ডাইমার দ্বারা গঠিত। মনোমেরিক কমপ্লেক্সে 15টি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিস রয়েছে। এই পরিবারটি বিভিন্ন প্রোক্যারিওটিক এস. ই. সি. ডি এবং এস. ই. সি. এফ প্রোটিন রপ্তানি ঝিল্লি প্রোটিন নিয়ে গঠিত। গ্রাম-পজিটিভ ব্যাকটেরিয়াম ব্যাসিলাস সাবটিলিসের এস. ই. সি. ডি এবং এস. ই. সি. এফ সমতুল্যগুলি যৌথভাবে একটি পলিপেপটাইডে উপস্থিত থাকে, যা এস. ই. সি. ডি. এফ হিসাবে চিহ্নিত, যা প্রোটিন নিঃসরণের জন্য একটি উচ্চ ক্ষমতা বজায় রাখার জন্য প্রয়োজন। ই. কোলাই-এর প্রাক-প্রোটিন ট্রান্সলোকেজের এস. ই. সি. ডি সাবইউনিটের বিপরীতে, ঝিল্লি থেকে একটি পরিপক্ক সিক্রেটরি প্রোটিন মুক্ত করার জন্য বি. সাবটিলিসের এস. ই. সি. ডি. এফ-এর প্রয়োজন ছিল না, যা ইঙ্গিত করে যে এস. ই. সি. ডি. এফ পূর্ববর্তী স্থানান্তর পদক্ষেপে জড়িত। অন্যান্য জীবের এস. ই. সি. ডি এবং এস. ই. সি. এফ প্রোটিনের সাথে তুলনা করলে এস. ই. সি. ডি. এফ-এ 10টি সংরক্ষিত অঞ্চলের উপস্থিতি পাওয়া যায়, যার মধ্যে কয়েকটি এস. ই. সি. ডি. এফ-এর কার্যকারিতার জন্য গুরুত্বপূর্ণ বলে মনে হয়। বি. সাবটিলিসের এস. ই. সি. ডি. এফ প্রোটিনের 12টি অনুমানমূলক ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন রয়েছে। সুতরাং, এস. ই. সি. ডি. এফ শুধুমাত্র ক্রমের সাদৃশ্যই দেখায় না, তবে গৌণ দ্রবণ পরিবহনের সাথে কাঠামোগত সাদৃশ্যও দেখায়। তথ্যসূত্র প্রোটিন পরিবার স্রাব