TMEM131
ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন 131 (টি. এম. ই. এম. 131) হল একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে টি. এম. ই. এম. 131 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। টি. এম. ই. এম. 131 প্রোটিনে অজানা ফাংশন 3651 (ডি. ইউ. এফ. 3651)-এর তিনটি ডোমেন এবং দুটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন রয়েছে। এই প্রোটিনকে টি কোষের কার্যকারিতা এবং বিকাশে ভূমিকা হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে। টি. এম. ই. এম. 131 একটি লোকাসে (<আই. ডি. 1>) থাকে যা মুছে ফেললে নিভারজেল্ট সিনড্রোমের সাথে যুক্ত হয়। টি সেল ফাংশনে ভূমিকা টি. এম. ই. এম 131 ডাউন সিনড্রোমে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে হাইপারমেথাইলেশন প্রদর্শন করতে দেখা গেছে। এই গবেষণার লেখকরা প্রস্তাব করেছেন যে, টি কোষের বিকাশ এবং কার্যকারিতায় টি. এম. ই. এম. 131-এর অনুমিত কার্যকারিতা দেওয়া হলে, এই হাইপারমেথাইলেশন ডাউন সিনড্রোমে আক্রান্ত রোগীদের দমনকৃত ইমিউন ফাংশনে ভূমিকা রাখতে পারে। টি. এম. ই. এম. 131 টি কোষের বিকাশ এবং পৃথকীকরণের সময়ও নিয়ন্ত্রিত হতে দেখা গেছে এবং অন্যান্য টিস্যু প্রকারের তুলনায় টি কোষে তুলনামূলকভাবে উচ্চ মাত্রার অভিব্যক্তি রয়েছে বলে দেখা গেছে। টি. এম. ই. এম. 131 ক্রোমোজোম 2-এর ঋণাত্মক ডি. এন. এ স্ট্র্যান্ডে (সেন্স দেখুন) <আই. ডি. 1>-<আই. ডি. 2> থেকে অবস্থিত। জিন পণ্যটি হল একটি 6,657 বেস পেয়ার এম. আর. এন. এ যা মানব জিনে 41টি ভবিষ্যদ্বাণীকৃত এক্সন সহ। এনসেম্বল দশটি বিকল্প স্প্লাইস ফর্মের পূর্বাভাস দিয়েছে, যার মধ্যে চারটি হল প্রোটিন কোডিং। জেনোম্যাটিক্স সফ্টওয়্যার পেজের মাধ্যমে এল ডোরাডো ব্যবহার করে প্রোমোটার ভবিষ্যদ্বাণী এবং বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। পূর্বাভাস দেওয়া প্রবর্তক অঞ্চলটি ক্রোমোজোম 2-এর মাইনাস স্ট্র্যান্ডে 98,611,892 থেকে 98,612,893 পর্যন্ত 1002 বেস জোড়া জুড়ে রয়েছে। প্রোগ্রামটি দুটি সম্ভাব্য প্রতিলিপিগত শুরুর অবস্থানের পূর্বাভাস দিয়েছিল। প্রথমটি 98,612,501 থেকে 98,612,716 পর্যন্ত 216টি বেস জোড়া জুড়ে রয়েছে। দ্বিতীয়টি 98,612,262 থেকে 98,612,443 পর্যন্ত 182টি বেস জোড়া জুড়ে রয়েছে। জিন নেবারহুড টি. এম. ই. এম. 131 ধনাত্মক ডি. এন. এ স্ট্র্যান্ডে সরাসরি জেড. এ. পি. 70 জিনের (<আই. ডি. 3>-<আই. ডি. 2>) পাশে অবস্থিত, পাশাপাশি <আই. ডি. 1> লোকাসে অসংখ্য সিউডোজিন রয়েছে। জিন (ভি. ডব্লিউ. এ. 3বি) ধারণকারী একটি ভন উইলব্র্যান্ড ফ্যাক্টর টি. এম. ই. এম. 131 থেকে ধনাত্মক স্ট্র্যান্ডে (<আই. ডি. 1>-<আই. ডি. 2>) উজানে অবস্থিত। জিন এক্সপ্রেশন টি. এম. ই. এম. 131 শরীরের বেশিরভাগ অংশে নিম্ন থেকে মাঝারি মাত্রায় প্রকাশিত হয়, লিম্ফ নোড, জরায়ু এবং টি কোষে সামান্য বর্ধিত মাত্রা ঘটে। ফলের মাছি ভ্রূণের বিকাশে অভিব্যক্তির তথ্য বিডিজিপি থেকে সিটু হোমপেজে পাওয়া যায়। প্রোটিনের বৈশিষ্ট্য/বৈশিষ্ট্য টি. এম. ই. এম 131 প্রোটিনের প্রাথমিক কার্যকারিতা ভালভাবে বোঝা যায় না। মানবদেহে 1883 অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ রয়েছে, যার একটি আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু 8.74 এবং একটি আণবিক ভর 205,100 ডাল্টন। এটি অবশিষ্টাংশ 1,091-1,111 এবং 1,118-1,138 এ দুটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন ধারণ করে বলে দেখানো হয়েছে। তিনটি ডিইউএফ3651 অঞ্চল দুটি সংলগ্ন ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের এন-টার্মিনাল দিকে অবস্থিত। এগুলি অবশিষ্টাংশ 173-245,502-582 এবং 639-708-এ অবস্থিত। প্রোটিনের আন্তঃকোষীয় অবস্থান পরীক্ষামূলকভাবে নির্ধারণ করা হয়নি, তবে এটি প্লাজমা ঝিল্লি বা এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে থাকে বলে মনে করা হয়, ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলের এন-টার্মিনাল এবং সি-টার্মিনাল উভয় দিকেই প্রতিটি ডোমেন সাইটোসোলিক হয়। এতে অসংখ্য ফসফোরিলেশন সাইট রয়েছে যা পরীক্ষামূলক এবং জৈব-তথ্যমূলক সরঞ্জাম উভয়ই দিয়ে দেখানো হয়েছে। নেটফস টুল ব্যবহার করে প্রোটিনের বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ প্রোটিনের পুরো দৈর্ঘ্য জুড়ে 145টি সম্ভাব্য ফসফরিলেশন সাইটের পূর্বাভাস দিয়েছে। টি. এম. ই. এম 131-এর জন্য প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বিশ্লেষণ গণনামূলক সরঞ্জাম ব্যবহার করে করা হয়েছে। এম. আই. এন. টি ডাটাবেসের মাধ্যমে কোনও মিথস্ক্রিয়া চিহ্নিত করা যায়নি। একটি স্ট্রিং অনুসন্ধান টেক্সট মাইনিংয়ের মাধ্যমে দশটি সম্ভাব্য প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া প্রকাশ করেছে, যদিও এগুলির কোনওটিকেই প্রকৃত প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া হিসাবে বিবেচনা করা উচিত নয়। ফলাফলগুলির ঘনিষ্ঠ বিশ্লেষণ এই ভবিষ্যদ্বাণীগুলি বাস্তব হওয়ার সম্ভাবনা খুব কম দেখায়। ইন্টএক্ট সরঞ্জামটিও ব্যবহার করা হয়েছিল এবং এটি প্রকাশ করেছিল যে সুপারঅক্সাইড ডিসমুটেজ 2 (এস. ও. ডি 2)-এর সাথে একটি সম্ভাব্য মিথস্ক্রিয়া পাওয়া গেছে, যা একটি ইস্ট টু-হাইব্রিড স্ক্রিনিং গবেষণায় চিহ্নিত করা হয়েছিল। কনজারভেশন অর্থোলগস টি. এম. ই. এম. 131 এর সমস্ত অর্থোলগ জুড়ে সংরক্ষিত রয়েছে। পুরো প্রোটিনটি প্রাইমেট অর্থোলগে অত্যন্ত সংরক্ষিত থাকে, যেখানে আরও দূরবর্তী হোমোলগে ডিইউএফ3651 এবং ট্রান্সমেম্ব্রেন অঞ্চলের মধ্যে সংরক্ষণ বেশি থাকে। সান দিয়েগো সুপার কম্পিউটার বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চের মাধ্যমে ব্লাস্ট এবং এএলআইজিএন সরঞ্জাম ব্যবহার করে চোয়ানোফ্ল্যাজেলেট মনোসিগা ব্রেভিকোলিসের মতো মানুষের সাথে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত প্রজাতির মধ্যে অর্থোলগ পাওয়া গেছে। নিম্নলিখিত টেবিলটি টি. এম. ই. এম. 131-এর সমরূপতা সম্পর্কে তথ্য দেয়। প্যারালগ টিএমইএম131-এর একটি একক প্যারালগ রয়েছে, টিএমইএম131এল বা কেআইএএ0922। এই জিনটি টিএমইএম 131-এর সাথে খুব মিল, তবে এটি তিনটি ডিইউএফ3651 অঞ্চলের মধ্যে দ্বিতীয় দুটি অন্তর্ভুক্ত করে না। তথ্যসূত্র