Acriflavine resistance protein family
এসচেরিচিয়া কোলাই অ্যাক্রিফ্লাভিন প্রতিরোধ (এসিআরএ এবং এসিআরবি জিন) একটি মাল্টি-ড্রাগ এফ্লাক্স সিস্টেমকে এনকোড করে যা ব্যাকটেরিয়াকে হাইড্রোফোবিক ইনহিবিটার থেকে রক্ষা করে বলে মনে করা হয়। ই. কোলাই অ্যাক্রবি প্রোটিন একটি পরিবাহক যা প্রোটন-মোটিভ বল দ্বারা শক্তিশালী হয় এবং যা বর্তমানে ব্যবহৃত বেশিরভাগ অ্যান্টিবায়োটিক, জীবাণুনাশক, রঞ্জক এবং ডিটারজেন্ট থেকে শুরু করে সাধারণ দ্রাবক পর্যন্ত সমস্ত পরিচিত মাল্টিড্রাগ পাম্পের মধ্যে বিস্তৃত স্তরের নির্দিষ্টতা দেখায়। লিগ্যান্ড-মুক্ত এক্রিবি-র কাঠামো দেখায় যে এটি প্রতি সাবইউনিটে 110 কেডিএ-র একটি হোমোট্রিমার। প্রতিটি সাবইউনিটে 12টি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিসেস এবং দুটি বড় পেরিপ্লাজমিক ডোমেন (প্রতিটি 300 অবশিষ্টাংশ অতিক্রম করে) হেলিসেস 1 এবং 2 এবং হেলিসেস 7 এবং 8-এর মধ্যে থাকে। অতিরিক্তভাবে প্রকাশিত অ্যাক্রবি প্রোটিনের এক্স-রে বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে তিনটি পেরিপ্লাজমিক ক্ষেত্র কেন্দ্রে একটি ফানেলের মতো কাঠামো এবং একটি সংযুক্ত সংকীর্ণ (বা বন্ধ) ছিদ্র গঠন করে। সাবইউনিট ইন্টারফেসে অবস্থিত তিনটি ভেস্টিবিউলের মাধ্যমে ছিদ্রটি পেরিপ্লাজমের জন্য খোলা হয়। এই ভেস্টিবিউলগুলি পেরিপ্লাজমের পাশাপাশি সাইটোপ্লাজমিক ঝিল্লির বাইরের লিফলেট থেকে ওষুধের সরাসরি প্রবেশাধিকারের প্রস্তাব দেওয়া হয়েছিল। অ্যাক্রবি প্রোটোমারের তিনটি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন একটি বড়, 30এ-প্রশস্ত কেন্দ্রীয় গহ্বর গঠন করে যা সাইটোপ্লাজমিক ঝিল্লি জুড়ে থাকে এবং চারটি কাঠামোগতভাবে বৈচিত্র্যময় লিগ্যান্ড সহ ই. কোলাই থেকে ট্রাইমেরিক অ্যাক্রবি পাম্পের সাইটোপ্লাজম এক্স-রে ক্রিস্টালোগ্রাফিক কাঠামো পর্যন্ত প্রসারিত হয় যা দেখায় যে লিগ্যান্ডের তিনটি অণু প্রাথমিকভাবে হাইড্রোফোবিক, সুগন্ধযুক্ত স্ট্যাকিং এবং ভ্যান ডার ওয়াল মিথস্ক্রিয়া দ্বারা 5000 কিউবিক অ্যাঙ্গস্ট্রমের অত্যন্ত বড় কেন্দ্রীয় গহ্বরের সাথে একযোগে আবদ্ধ হয়। প্রতিটি লিগ্যান্ড বাঁধাইয়ের জন্য এক্রিবি অবশিষ্টাংশের সামান্য ভিন্ন উপসেট ব্যবহার করে। আবদ্ধ লিগ্যান্ড অণুগুলি প্রায়শই একে অপরের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে, বন্ধনকে স্থিতিশীল করে। তথ্যসূত্র বাইরের লিঙ্ক প্রোটিন পরিবার ট্রান্সমেম্ব্রেন পরিবাহক