Epigenetics of autoimmune disorders
অটোইমিউন ব্যাধিগুলির এপিজেনেটিক্স হল সেই ভূমিকা যা এপিজেনেটিক্স (বংশগত পরিবর্তন যা ডিএনএ অনুক্রমের পরিবর্তনের সাথে জড়িত নয়) অটোইমিউন রোগগুলিতে খেলে। অটোইমিউন ব্যাধি হল বিভিন্ন শ্রেণীর রোগ যা একটি সাধারণ উৎস ভাগ করে নেয়। এই রোগগুলি তখন উদ্ভূত হয় যখন ইমিউন সিস্টেম অনিয়ন্ত্রিত হয়ে যায় এবং ভুল করে বিদেশী আক্রমণকারীদের পরিবর্তে সুস্থ টিস্যুকে আক্রমণ করে। এই রোগগুলি একটি একক দেহ ব্যবস্থাকে প্রভাবিত করে কিনা বা তারা সিস্টেমিক ক্ষতি করে কিনা তার উপর ভিত্তি করে স্থানীয় বা সিস্টেমিক হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়। কেউ অটোইমিউন ব্যাধি বিকাশ করে কিনা তা জেনেটিক্সের পাশাপাশি পরিবেশগত কারণগুলির উপর নির্ভর করে। কিছু পরিবার এই অবস্থার জন্য জেনেটিক প্রবণতা দেখায়, তবে কেউ অটোইমিউন অবস্থার বিকাশ ঘটাবে কিনা তা ব্যাখ্যা করার জন্য একা জেনেটিক্স প্রায়শই যথেষ্ট নয়। ধূমপান, চাপ এবং খাদ্যাভ্যাস জিনোমে এপিজেনেটিক পরিবর্তন আনতে পারে যা ইমিউন সিস্টেম-নির্দিষ্ট জিনের নিয়ন্ত্রণকে পরিবর্তন করে যা এই অবস্থার সূত্রপাত ঘটায়। এপিজেনেটিক পরিবর্তনের প্রধান প্রক্রিয়াগুলি হল ডিএনএ মিথাইলেশন, হিস্টোন পরিবর্তন এবং নন-কোডিং আরএনএ দ্বারা নিয়ন্ত্রণ। এই এপিজেনেটিক পরিবর্তনগুলি ইমিউন সিস্টেমের সাথে জড়িত জিনগুলির অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে এবং তাই এই পরিবর্তনগুলি বিভিন্ন সিস্টেমিক এবং স্থানীয় অটোইমিউন রোগের সূত্রপাত এবং উপসর্গগুলিতে ভূমিকা পালন করে। এপিজেনেটিক প্রক্রিয়া ডিএনএ মিথাইলেশন একটি এপিজেনেটিক পরিবর্তন যা প্রতিলিপিতে হস্তক্ষেপ করে এবং জিন প্রকাশের মাত্রা হ্রাস করে। ডিএনএ নিউক্লিওটাইডগুলিতে মিথাইল গ্রুপের সংযোজন এমন একটি পৃষ্ঠ তৈরি করে প্রতিলিপি প্রতিরোধ করে যা প্রতিলিপির কারণগুলি বাঁধতে অক্ষম। উপরন্তু, ডিএনএ মিথাইলেশন মিথাইল-সিপিজি-বাইন্ডিং ডোমেন প্রোটিন নিয়োগ করে যা কো-রিপ্রেসার কমপ্লেক্স গঠনের জন্য সংকেত দেয় যা ক্রোমাটিন কাঠামো পরিবর্তন করে এবং ট্রান্সক্রিপশনকে আরও বাধা দেয়। একটি হাইপারমেথাইলেটেড ডিএনএ অবস্থা জিন সাইলেন্সিংয়ের সাথে যুক্ত, অন্যদিকে একটি হাইপোমেথাইলেটেড ডিএনএ অবস্থা ট্রান্সক্রিপশন এবং জিন অভিব্যক্তির বর্ধিত স্তরের সাথে যুক্ত। ডি. এন. এ মিথাইলেশন ডি. এন. এ মিথাইলট্রান্সফেরেজ (ডি. এন. এম. টি) দ্বারা সঞ্চালিত হয় যা একটি সাইটোসিন নিউক্লিওটাইডের 5ম অবস্থানে মিথাইল গোষ্ঠীগুলিকে সংযুক্ত করে। মেরুদণ্ডী প্রাণীদের মধ্যে, জিন অভিব্যক্তি বিশেষত সিপিজি দ্বীপ নামে পরিচিত জিনোমের একটি অঞ্চলের মধ্যে মিথাইলেশন দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়, একটি জিনের প্রবর্তকের কাছাকাছি একটি অঞ্চল যেখানে সাইটোসিন এবং গুয়ানিন নিউক্লিওটাইডের উচ্চ শতাংশ থাকে। ডিএনএ ডিমাইথাইলেশন টেন-ইলেভেন ট্রান্সলোকেশন (টিইটি) এনজাইম দ্বারা সঞ্চালিত হয় যা 5-মিথাইলসাইটোসিনকে (5 এমসি) হাইড্রোক্সিমিথাইলসাইটোসিনে (5 এইচএমসি) রূপান্তরিত করে, যার ফলে ডিএনএর সেই অংশের ডিমাইথাইলেশন হয় এবং জিন অভিব্যক্তি বৃদ্ধি পায়। টিইটি ইনহিবিটারগুলি অটোইমিউন রোগ, বিশেষত রিউম্যাটিক রোগের সম্ভাব্য চিকিৎসা হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে। হিস্টোন পরিবর্তন, যার ফলে প্রোটিন বাঁধাই সাইটগুলিতে গঠনমূলক পরিবর্তন হয়, অটোইমিউন ব্যাধিগুলির সাথে জড়িত। হিস্টোন অ্যাসিটাইলেশন জিন অভিব্যক্তি প্রচার করে ট্রান্সক্রিপশন বৃদ্ধি করে। প্রাথমিকভাবে, হিস্টোন অ্যাসিটিলেশন পার্শ্ববর্তী নিউক্লিওসোমগুলির মধ্যে আন্তঃসংযোগ হ্রাস করে জিন অভিব্যক্তি বাড়ায়। সংলগ্ন নিউক্লিওসোমগুলির মধ্যে এই মিথস্ক্রিয়া প্রতিরোধ করা ঘনীভবনের মূল চালক হিসাবে কাজ করে। উপরন্তু, হিস্টোন অ্যাসিটিলেশন হিস্টোন লেজের কিছু ধনাত্মক আধানকে নিরপেক্ষ করে ধনাত্মক আধানযুক্ত হিস্টোন এবং ঋণাত্মক আধানযুক্ত ডি. এন. এ-র মধ্যে তড়িৎস্থায়ী মিথস্ক্রিয়ায় হস্তক্ষেপ করে। এটি হিস্টোনগুলিকে ডি. এন. এ-তে তাদের গ্রিপ শিথিল করার মাধ্যমে জিন অভিব্যক্তি প্রচার করতে আরও সহায়তা করে। যদিও অ্যাসিটিলেশন প্রতিলিপির জন্য ডি. এন. এ-কে আরও সহজলভ্য করতে সহায়তা করে, হিস্টোন অ্যাসিটিলেশনের ক্রোমাটিন পুনর্নির্মাণের সম্ভাবনা তৈরি করার ক্ষমতা জিন অভিব্যক্তি পরিবর্তন করার ক্ষমতার একটি অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ অংশ। এই পুনর্নির্মাণ ঘনীভূত হেটেরোক্রোমাটিনকে আরও শিথিল ইউক্রোমাটিনে রূপান্তরিত করার অনুমতি দেয় যা উচ্চতর স্তরের জিন প্রতিলিপির সাথে যুক্ত। অ্যাসিটিলেশন ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর নিয়োগের একটি উপায় হিসাবেও কাজ করে যা জিন অভিব্যক্তি প্রচার করে। এই নিয়োগের একটি উপায় হল টিএএফ1 (টাটা-বক্স বাইন্ডিং প্রোটিন সম্পর্কিত ফ্যাক্টর 1)-এর ক্রিয়াকলাপের মাধ্যমে যা একটি ডাবল ব্রোমোডোমেইন ধারণ করে এবং হিস্টোন অ্যাসিটিলেশনের খুব কম মাত্রা সনাক্ত করতে পারে। টিএএফ1 অ্যাসিটিলেশন সনাক্ত করে এবং তারপর অ্যাসিটিলেটেড অঞ্চলে ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর নিয়োগ করে। অ্যাসিটাইলেশন প্রায়শই প্রবর্তক অঞ্চলের কাছাকাছি ঘটে এবং টিএএফ1 দ্বারা স্বীকৃত যা মূল প্রবর্তককে টিএফআইআইডি সনাক্ত করার এবং প্রতিলিপি শুরু করার সম্ভাবনা বাড়ানোর জন্য এই অঞ্চলে টিএফআইআইডি-কে সংযুক্ত করে। টিএএফ1 এইচএটি (হিস্টোন অ্যাসিটাইলট্রান্সফেরেজ) হিসাবেও আচরণ করে এবং বর্ধিত ফ্রিকোয়েন্সিতে নিকটবর্তী হিস্টোনগুলিকে অ্যাসিটিলেট করে। অ্যাসিটিলেশন ডি. এন. এ-তে দমনমূলক চিহ্ন যোগ করতেও বাধা দেয়। সাধারণত, হিস্টোন ডিঅ্যাসিটাইলেস (এইচ. ডি. এ. সি) হিস্টোনের লাইসিন অবশিষ্টাংশ থেকে অ্যাসিটিল গ্রুপগুলি অপসারণ করতে কাজ করে যার ফলে জিনের অভিব্যক্তি হ্রাস পায়। এইচডিএসি ক্রিয়াকলাপ অটোইমিউন রোগের প্যাথলজিতে জড়িত, যেমন রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিস যেখানে সাইনোভিয়াল টিস্যুতে এইচডিএসি ক্রিয়াকলাপ কম। হিস্টোন মিথাইলেশন অটোইমিউন ব্যাধিতেও জড়িত। এটি সিস্টেমিক স্ক্লেরোসিসের মতো হিস্টোন মিথাইলেশন প্রতিরোধের মাধ্যমে বা টাইপ 1 ডায়াবেটিসে নির্দিষ্ট জিন লোকিতে উচ্চতর হিস্টোন মিথাইলেশন দ্বারা হতে পারে। হিস্টোন পরিবর্তন রিউম্যাটিক, এন্ডোক্রিনোলজিকাল এবং গ্যাস্ট্রোইনটেস্টাইনাল অটোইমিউন ব্যাধিগুলির জন্ম দিতে পারে। হিস্টোন পরিবর্তনের ফলে ব্যাধিটির উপর নির্ভর করে জিন অভিব্যক্তি সক্রিয় বা দমন করা হয়। সুবেরানিলোহাইড্রক্সামিক অ্যাসিড (এসএএইচএ), যা ভোরিনোস্ট্যাট নামেও পরিচিত, এইচডিএসি-র ক্রিয়াকলাপকে বাধা দেয়। ভোরিনোস্ট্যাট ইমিউন সিস্টেম ডিসফাংশনের চিকিৎসা হিসাবে প্রতিশ্রুতি দেখিয়েছে। ভোরিনোস্ট্যাট, এইচ. ডি. এ. সি প্রতিরোধ করে, ত্বকের টি কোষের লিম্ফোমার চিকিৎসা করতে পারে। যদিও অটোইমিউন রিউম্যাটিক ব্যাধিগুলির জন্য এপিজেনেটিক্স-ভিত্তিক চিকিত্সা এখনও বিদ্যমান নেই, টি সেল লিম্ফোমার চিকিত্সার ক্ষেত্রে ভোরিনোস্ট্যাটের কার্যকারিতা অটোইমিউন রিউম্যাটিক ব্যাধিগুলির এপিজেনেটিক্স-ভিত্তিক চিকিত্সার পথের একটি ভিত্তি। নন-কোডিং আরএনএ মাইক্রো-আরএনএ (এমআইআরএনএ) মাইক্রো-আরএনএ (এমআইআরএনএ) হল ছোট আরএনএ টুকরো, দৈর্ঘ্যে 18-23 নিউক্লিওটাইড, যা প্রতিলিপি-পরবর্তী জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করতে কাজ করে। ইমিউন প্রতিক্রিয়া সংশোধন করতে এম. আই. আর. এন. এ একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে কারণ তারা নির্দিষ্ট ইমিউন সম্পর্কিত জিন থেকে প্রতিলিপি করা এম. আর. এন. এ প্রোটিনে রূপান্তরিত হবে কি না তা প্রভাবিত করে। বিভিন্ন এম. আই. আর. এন. এ স্তরের পরিবর্তন অটোইমিউন রোগ প্যাথোজেনেসিস এবং লক্ষণগুলির সাথে যুক্ত। ব্যাধিটির উপর নির্ভর করে, একটি নির্দিষ্ট ধরনের এম. আই. আর. এন. এ-র আপ-রেগুলেশন বা ডাউন-রেগুলেশন লক্ষ্য করা যেতে পারে। এম. আই. আর. এন. এগুলি 3 'অনুবাদহীন অঞ্চলের (3' ইউ. টি. আর) মধ্যে পরিপূরক এম. আর. এন. এ সিকোয়েন্সের সাথে আবদ্ধ হয়ে জিন অভিব্যক্তি নেতিবাচকভাবে নিয়ন্ত্রণ করে। এম. আই. আর. এন. এ ক্রিয়াকলাপের এই প্রক্রিয়াটি আর. এন. এ পলিমারেজ II দ্বারা নিউক্লিয়াসে প্রি-এম. আই. আর. এন. এ সংশ্লেষণের সাথে শুরু হয় যা পরে প্রাক-এম. আই. আর. এন. এ রূপান্তরিত হয়। এই প্রাক-এম. আই. আর. এন. এ নিউক্লিয়াস থেকে বেরিয়ে আসে এবং ডাইসার দ্বারা একটি ডাবল স্ট্রেন্ডেড আর. এন. এ-তে কাটা হয় যার মধ্যে একটি স্ট্র্যান্ড আর. আই. এস. সি কমপ্লেক্সের সাথে আবদ্ধ থাকে। এই বন্ধনটি এম. আই. আর. এন. এ-কে তার লক্ষ্য এম. আর. এন. এ ক্রমের সাথে সংযুক্ত করে এবং এম. আর. এন. এ-র অবক্ষয়কে উৎসাহিত করে বা এম. আর. এন. এ-র অনুবাদকে দমন করে, জিন অভিব্যক্তি হ্রাস করে। এম. আই. আর. এন. এ আর. এন. এ-ইনডিউসড ট্রান্সক্রিপশনাল সাইলেন্সিং (আর. আই. টি. এস) কমপ্লেক্সের বাঁধনের মাধ্যমে জিন অভিব্যক্তিকেও প্রভাবিত করতে পারে। আর. আই. টি. এস কমপ্লেক্সের সাথে এম. আই. আর. এন. এ-র বন্ধন মিথাইলেশনের মতো প্রতিলিপি-পরবর্তী হিস্টোন পরিবর্তনের জন্য জিন অভিব্যক্তি আরও পরিবর্তন করার অনুমতি দেয়। লং নন-কোডিং আরএনএ (এলএনসিআরএনএ) দীর্ঘ নন-কোডিং আরএনএও জিন অভিব্যক্তিতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে বলে চিহ্নিত করা হয়েছে। এই এলএনসিআরএনএগুলি হল আরএনএ যা দৈর্ঘ্যে 200 টিরও বেশি নিউক্লিওটাইড তবে কোনও কার্যকরী প্রোটিনে প্রতিলিপি করা হয় না। এগুলি ডিসকয়েড লুপাস এরিথেমাটোসাস এবং রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিসের মতো রোগের এপিজেনেটিক্সে ভূমিকা পালন করে বলে চিহ্নিত করা হয়েছে। একটি পদ্ধতি যার মাধ্যমে এলএনসিআরএনএ জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে তা হল এক্স নিষ্ক্রিয়করণ প্রক্রিয়া যা ডোজ ক্ষতিপূরণ প্রদানের উপায় হিসাবে কাজ করে। এক্স-নিষ্ক্রিয়করণে, জিস্ট (এক্স-নিষ্ক্রিয় নির্দিষ্ট প্রতিলিপি) এলএনসিআরএনএ প্রতিলিপি করা হয় এবং সি ক্রোমোজোমকে আবরণ করা হয় যা নিষ্ক্রিয় করা হবে, ক্রোমোজোম ঘনীভবন এবং সেই এক্স ক্রোমোজোমের উপর জিনের দমন প্রক্রিয়া শুরু করে। তবুও, জিন অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণের জন্য এই এলএনসিআরএনএগুলি যে প্রক্রিয়াগুলি ব্যবহার করে তা আরও বোঝার জন্য আরও গবেষণা প্রয়োজন। সিস্টেমিক অটোইমিউন রোগগুলি হল সেগুলি যা একক ধরনের টিস্যু বা অঙ্গ ব্যবস্থাকে লক্ষ্য করার পরিবর্তে একাধিক অঙ্গ ব্যবস্থাকে প্রভাবিত করে। রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিস (আর. এ.) রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিস হল একটি ডিজেনারেটিভ অটোইমিউন রোগ যা রোগীর জয়েন্টের ক্ষতি এবং প্রদাহ ঘটায়। গ্লোবাল ডিএনএ হাইপোমেথাইলেশন রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিসের একটি বৈশিষ্ট্য এবং এই রোগের প্রাথমিক পর্যায়ে দেখা যায়, যখন জয়েন্টের অবক্ষয় শুরু হয়। যারা আরএ-তে ভুগছেন তাদের স্বাভাবিক ইমিউন সিস্টেম এবং জয়েন্ট ফাংশন সহ অনেক ডিএনএ প্রোমোটার অঞ্চলে বিশ্বব্যাপী মিথাইলেশন হ্রাস পেয়েছে। হাইপোমেথাইলেশন থেকে এই অতিরিক্ত অভিব্যক্তি বিভিন্ন জিনে যেমন আই. টি. জি. এ. এল, সি. ডি. 40 এল. জি, পি. আর. এফ1 এবং আরও অনেক কিছুতে দেখা যায়। যারা আরএ-তে ভুগছেন তাদের দিকে ঘনিষ্ঠভাবে নজর দিলে দেখা যায় যে সাইনোভিয়াল কোষের মধ্যে হাইপোমেথাইলেশনের একটি স্তর রয়েছে যা সাইটোকাইনের অভিব্যক্তি এবং অতিরিক্ত উত্পাদন ঘটায় যা সাইনোভিয়াল তরলের মধ্যে প্রদাহ সৃষ্টি করে প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়া স্থায়ী করে, যা জয়েন্টগুলির মধ্যে বিদ্যমান তরল। সিডি40এলজি-র হাইপোমেথাইলেশন, যা ইমিউন প্রতিক্রিয়ার মধ্যে টি-কোষ তৈরি করবে, টি-কোষের অতিরিক্ত প্রকাশের দিকে পরিচালিত করতে পারে এবং প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়ার মধ্যে রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিস কীভাবে কাজ করে তার একটি অবদানকারী কারণ হয়ে ওঠে। আরএ-তে আক্রান্ত রোগীরা প্রায়শই অ্যান্টি-সাইক্লিক সিট্রুলিনেটেড পেপটাইড (অ্যান্টি-সিসিপি) অ্যান্টিবডি প্রদর্শন করে এবং রেট্রোট্রান্সপোসন জিন এল1-এর হাইপোমেথাইলেশন হয়, পাশাপাশি আইএল6 এবং ইআরএ প্রবর্তক-এ মিথাইলেশন হ্রাস পায়। টি. ই. টি প্রোটিন, আরও নির্দিষ্টভাবে টি কোষে টি. ই. টি 1-টি. ই. টি 3 এনজাইম এবং টি. ই. টি 2 ডি. এন. এ-কে ডিমাইথাইলেট করতে পারে যা আর. এ-এর প্রাথমিক পর্যায়গুলি নির্ধারণ এবং স্পষ্ট করতে সহায়তা করে। রোগীর মধ্যে হিস্টোনগুলির ডিমাইথাইলেশন থেকে আরএ বিকাশ উচ্চ মাত্রার আইএল-6 এর প্রকাশের দিকে পরিচালিত করতে পারে যা জয়েন্টগুলিতে ধ্বংসের কারণ হতে পারে। মিআরএনএ রিউমাটয়েড আর্থ্রাইটিসের বিকাশেও গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে, বিশেষ করে মিআরএনএ-246এ এবং মিআরএনএ-150-এর নিয়ন্ত্রণে। যদিও আরও গবেষণার প্রয়োজন, এই রোগে একটি ভূমিকা পালন করার জন্য এলএনসিআরএনএ-কে জড়িত করা হয়েছে কারণ এই ব্যাধিটির জন্য ব্যবহৃত বর্তমান চিকিৎসাগুলি টসিলিজুমাব এবং অ্যাডালিমুম্যাবের উপর আরএ রোগীদের মধ্যে 85টি বিভিন্ন এলএনসিআরএনএ-র পরিবর্তিত অভিব্যক্তি দেখায়। সিস্টেমিক লুপাস এরিথেম্যাটোসাস (এস. এল. ই) সিস্টেমিক লুপাস এরিথেম্যাটোসাস হল লুপাসের সবচেয়ে সাধারণ রূপ এবং এটি এমন একটি অবস্থা যেখানে ইমিউন সিস্টেম সুস্থ শারীরিক টিস্যুকে আক্রমণ করে যা অনেক অঙ্গ সিস্টেম জুড়ে বিস্তৃত প্রদাহ এবং টিস্যু ক্ষতি করে। সিস্টেমিক লুপাস আক্রান্তদের মধ্যে এপিজেনোম জুড়ে হাইপোমেথাইলেশন দেখা যায়। আইটিজিএএল, সিডি40এলজি এবং সিডি70 সহ অনেক জিনের প্রবর্তক অঞ্চলগুলি হাইপোমেথাইলেটেড হওয়ার পাশাপাশি 18এস এবং 28এস রাইবোসোমাল জিন প্রবর্তক হিসাবে দেখানো হয়েছে। বিশেষত, এই ডি. এন. এ হাইপোমেথাইলেশন টি কোষের ক্রোমাটিন কাঠামোকে পরিবর্তন করে বলে মনে করা হয় যা এই অবস্থার মধ্যে পর্যবেক্ষণ করা ইমিউন এবং প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়া বাড়ায়। জিনোম ব্যাপী এটি দেখানো হয়েছে যে অভিন্ন যমজ জুটির এপিজেনোমের তুলনা করার সময় যেখানে একটি যমজ এই অবস্থার দ্বারা আক্রান্ত হয় এবং একটি নয়, এই অবস্থার অধিকারী যমজ তাদের জিনোমের মিথাইলেশনে বিশ্বব্যাপী হ্রাস দেখায়। এই হাইপোমেথাইলেশন জিনগুলিকে, যা ঐতিহ্যগতভাবে মিথাইলেশন দ্বারা দমন করা হয়, বিশেষ করে সিডি4 + টি কোষে অতিরিক্তভাবে প্রকাশ পায়। এটি পরামর্শ দেওয়া হয়েছে যে ডি. এন. এম. টি. 1-এর প্রতিরোধ সিস্টেমিক লুপাস দ্বারা আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে মিথাইলেশন হ্রাসের সৃষ্টি করে। ডি. এন. এম. টি1 হল একটি ডি. এন. এ মিথাইলট্রান্সফেরেজ যা ডি. এন. এ প্রতিলিপি প্রক্রিয়া জুড়ে মিথাইলেশন প্যাটার্ন বজায় রাখে, এটি নিশ্চিত করে যে ডি. এন. এ-র নতুন অনুলিপিতে মূল প্যারেন্ট স্ট্র্যান্ডে পর্যবেক্ষণ করা মিথাইলেশন প্যাটার্ন রয়েছে। ডি. এন. এম. টি1-এর প্রতিরোধের ফলে প্রজন্মের পর প্রজন্ম ধরে মিথাইলেশন প্যাটার্ন হারিয়ে যায় এবং ফলস্বরূপ এপিজেনোম-ওয়াইড হাইপোমেথাইলেশন দেখা যায়। বিশেষ করে দেখা গেছে যে ইমিউন টি-কোষে ডি. এন. এম. টি1 এক্সপ্রেশন কম। সিস্টেমিক স্ক্লেরোসিস (এস. এস. সি) সিস্টেমিক স্ক্লেরোসিস (এস. এস. সি) একটি অটোইমিউন রোগ যা সিস্টেমের বিস্তৃত অত্যধিক কোলাজেন জমা দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। এটি রোগীর ত্বক এবং সংযোগকারী টিস্যুগুলিকে আঁটসাঁট এবং শক্ত করে তোলে কারণ জয়েন্টগুলিতে এবং বিভিন্ন অভ্যন্তরীণ অঙ্গ ব্যবস্থায় এক্সট্রাসেলুলার ম্যাট্রিক্স প্রোটিনগুলির অনিয়ন্ত্রিত সঞ্চয়ের কারণে যা রোগীদের অকাল মৃত্যুর কারণ হতে পারে। এফএলআই1 একটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর যা কোলাজেন উৎপাদনকে নেতিবাচকভাবে নিয়ন্ত্রণ করে যাতে এফএলআই জিন এক্সপ্রেশন যত বেশি হয়, তত কম কোলাজেন তৈরি হয়। এস. এস. সি রোগীদের মধ্যে, এফ. এল. আই. 1 প্রবর্তক অঞ্চলে সি. পি. জি দ্বীপপুঞ্জের হাইপারমেথাইলেশন লক্ষ্য করা যায়, যা এফ. এল. আই জিনের প্রতিলিপি প্রতিরোধ করে এবং স্বাভাবিক মাত্রার বাইরে কোলাজেন উৎপাদন বৃদ্ধি করে যার ফলে কোলাজেন তৈরি হয় এবং তন্তুযুক্ত সংযোগকারী টিস্যুর অতিরিক্ত উৎপাদন হয়। এর ফলে গাঁটের ক্ষতি, দাগ এবং ত্বক ঘন হয়ে যায়। এস. এস. সি-তে আক্রান্ত রোগীদের সিডি4 + টি কোষে ডি. এন. এ মিথাইলট্রান্সফেরেজ (ডি. এন. এম. টি)-এর মাত্রা হ্রাস পায় যা প্রতিরোধ ব্যবস্থায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এই হ্রাসকৃত মিথাইলেশন ইমিউন ডিসফাংশন এবং এস. এস. সি এবং এর প্রদাহজনক প্রভাবগুলির অগ্রগতির সাথে যুক্ত, তবে এই প্রভাবটি আরও বোঝার জন্য আরও গবেষণা প্রয়োজন। সিস্টেমিক স্ক্লেরোসিসের রোগীরা কোলাজেন জিন COL23A1 এবং COL4A2-এর হাইপোমেথাইলেশনও প্রদর্শন করে। এই কোলাজেন জিনের এই অতিরিক্ত প্রকাশের ফলে কোলাজেন বৈশিষ্ট্যের অতিরিক্ত উৎপাদন টিস্যু ফাইব্রোসিসের দিকে পরিচালিত করে। টি. জি. এফ-বিটা সিগন্যালিং পাথওয়ে এবং ডব্লিউ. এন. টি/বিটা-ক্যাটেনিন সিগন্যালিং পাথওয়েও এই রোগে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। টি. জি. এফ-বিটা সিগন্যালিং পাথওয়ে শরীরের ইমিউন প্রতিক্রিয়ার মধ্যে হোমিওস্ট্যাসিস নিয়ন্ত্রণের জন্য কোষের পার্থক্য এবং কোষ বিকাশের স্থানান্তর থেকে বেশ কয়েকটি সেলুলার প্রতিক্রিয়ার জন্য দায়ী। টি. জি. এফ-বিটা সংকেত পথ ফাইব্রোব্লাস্টের সেই সক্রিয়করণের সাথে জড়িত যা ফাইব্রোসিসের আগে হয়। জিন, আইটিজিএ9, যা আলফা ইন্টিগ্রিন 9-এর জন্য কোড করে এবং এই পথের সাথে জড়িত, এই অবস্থার সাথে যুক্ত ব্যক্তিদের মধ্যে হাইপোমেথাইলেটেড হয় যা ইন্টিগ্রিনগুলির অতিরিক্ত প্রকাশের দিকে পরিচালিত করে যা কূপ হিসাবে ফাইব্রোসিসের দিকে পরিচালিত করে এবং এই পথের ইতিবাচক প্রতিক্রিয়া প্রদান করে যা ফাইব্রোব্লাস্ট সক্রিয়করণকে আরও উৎসাহিত করে। ইন্টিগ্রিন হল এক ধরনের রিসেপ্টর যা একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন রিসেপ্টর যার অর্থ এটি কোষ থেকে কোষে যোগাযোগ করতে সক্ষম এবং কোষকে নিকটবর্তী কোষের সাথে সংযুক্ত এবং লেগে থাকতে সহায়তা করে। ডিসকয়েড লুপাস এরিথেমাটোসাস (ডি. এল. ই) ডিসকয়েড লুপাস এরিথেমাটোসাস একটি ত্বকের রোগ যা ইমিউন সিস্টেম দ্বারা সুস্থ এপিডার্মাল টিস্যুতে আক্রমণ দ্বারা চিহ্নিত করা হয় যার ফলে ত্বকে ক্ষত, প্রদাহ এবং ফুসকুড়ি হয়। এর ফলে রঞ্জক পদার্থের পরিবর্তন, ত্বকের দাগ এবং চুল পড়ার সম্ভাবনা দেখা দিতে পারে। জুয়ান এট আল-এর একটি গবেষণায় চিহ্নিত এলএনসিআরএনএ এবং সার্কআরএনএ-র পার্থক্যমূলক অভিব্যক্তি। , শ্লেষ্মা পরিবর্তন করুন, যা মুখ এবং নাকের অভ্যন্তরে এপিডার্মিসের অভ্যন্তরীণ আস্তরণ এবং আর্দ্র অংশ; ডি. এল. ই দ্বারা প্রভাবিত এই ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন এই টিস্যুকে মাঝে মাঝে স্ফীত এবং ক্রাস্টি করে তোলে। শ্লেষ্মা এই রোগের প্যাথলজিতে একটি মূল অংশ হিসাবে কাজ করে। এল. এন. সি. আর. এন. এ এবং সার্ক আর. এন. এ-র মতো প্রতিলিপি রয়েছে যা ডি. এল. ই রয়েছে তাদের প্রভাবিত টিস্যুতে প্রকাশ করা হয়েছে। এই প্রতিলিপিগুলি প্রভাবিত স্বাস্থ্যকর টিস্যু নিয়ন্ত্রণের তুলনায় ডি. এল. ই দ্বারা আক্রান্ত ব্যক্তিদের টিস্যুতে আরও বেশিভাবে প্রকাশ করা হয়েছিল। প্রকাশিত এল. এন. সি. আর. এন. এ এবং সার্ক আর. এন. এ-র প্যাটার্ন ডি. এল. ই-এর প্রভাবিত টিস্যু এবং সুস্থ অপ্রভাবিত টিস্যুগুলির বিরুদ্ধে বৈষম্য করতে সহায়তা করে যা রেফারেন্সের জন্য একটি ব্যবহারযোগ্য প্যাটার্ন প্রতিষ্ঠা করে। উপরন্তু, এলএনসিআরএনএ-র কার্যকারিতা এবং অভিব্যক্তি বিশ্লেষণের মাধ্যমে আবিষ্কৃত, এলএনসিআরএনএগুলি আইএল19, সিএক্সসিএল1, সিএক্সসিএল11 এবং টিএনএফএসএফ15-এর অভিব্যক্তিগুলির সাথে সম্পর্কযুক্ত যা সমস্ত একটি ইমিউন প্রতিক্রিয়ার সাথে সম্পর্কিত যা পথ সনাক্ত করতে সহায়তা করে যেখানে ডিএলই ইনকর্এনএ-র অস্বাভাবিক অভিব্যক্তি দ্বারা এপিজেনেটিকভাবে প্রকাশিত হয়। জুয়ান এট আল দ্বারা সম্পাদিত গবেষণার আরেকটি মূল অংশ। ডি. এল. ই-তে জড়িত অনেক লক্ষ্য জিনের নিয়ন্ত্রণকে প্রভাবিত করার জন্য দায়ী একটি মূল প্রতিলিপি উপাদান হিসাবে স্ট্যাট 4-এর সনাক্তকরণ ছিল। স্ট্যাট4 একটি অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ প্রতিলিপি কারখানা কারণ এটি প্যাথোজেনেসিসের সাথে সম্পর্কযুক্ত এবং এটি ডি. এল. ই-এর অগ্রগতি, স্ট্যাট4 জিনের লক্ষ্যগুলির অনেকগুলি অগ্রগতির সাথে জড়িত বিভিন্ন কার্যকরী পথকে সমৃদ্ধ করতে কাজ করতে দেখা গেছে। সোরিয়াটিক আর্থ্রাইটিস (পি. এস. এ) সোরিয়াসিস হল একটি প্রদাহজনক ত্বকের অবস্থা যা টি-কোষ সক্রিয়করণ এবং ত্বকের কোষগুলির অতিরিক্ত উৎপাদনের কারণে ত্বকে স্কেলি লাল প্যাচগুলির বিকাশ দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। সোরিয়াসিস প্লাক সোরিয়াসিস এবং সোরিয়াটিক আর্থ্রাইটিসে বিভক্ত হতে পারে। সোরিয়াটিক আর্থ্রাইটিস প্লাক সোরিয়াসিস থেকে আলাদা কারণ সোরিয়াটিক ত্বকের ক্ষতগুলির সাথে প্রদাহ, জয়েন্টে ব্যথা এবং জয়েন্টে কঠোরতা থাকে যা সোরিয়াসিস দ্বারা উত্পাদিত ইমিউন সিস্টেমের জটিলতার জন্য দায়ী। সোরিয়াটিক আর্থ্রাইটিসের রোগীরা উচ্চ মাত্রার ইমিউন-নিয়ন্ত্রিত সাইটোকাইন এবং কেমোকাইন নিঃসরণ করে। এটি দেখানো হয়েছে যে এপিজেনেটিক্স পরিবর্তনগুলি এই অবস্থার লক্ষণ এবং প্যাথোজেনেসিসে একটি বিশিষ্ট ভূমিকা পালন করে। এম. আই. আর. এন. এ অভিব্যক্তি স্তরের পরিবর্তনগুলি এই রোগের সূত্রপাতের সাথে সম্পর্কিত অনেক এপিজেনেটিক পরিবর্তনের মধ্যে একটি। বিশেষত, সোরিয়াটিক আর্থ্রাইটিসে আক্রান্তদের মধ্যে এম. আই. আর. এন. এ-203 মাত্রা হ্রাস পায় এবং এটি সোরিয়াসিস প্যাথোজেনেসিসের সাথে যুক্ত করা হয়েছে। এম. আই. আর. এন. এ-203 সাইটোকাইন সিগন্যালিং 3 (এস. ও. সি 3)-এর দমনকারীদের লক্ষ্য করার জন্য দায়ী এবং নিশ্চিত করে যে ইমিউন প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে রাখা হয়েছে। যাইহোক, যখন এম. আই. আর. এন. এ-203 মাত্রা কম হয়, তখন সাইটোকাইন সিগন্যালিং একটি উচ্চ স্তরে ঘটে যা একটি উচ্চতর ইমিউন প্রতিক্রিয়ার দিকে পরিচালিত করে। এমন একটি চিকিৎসা তৈরি করা যা এম. আই. আর. এন. এ-203 মাত্রা বৃদ্ধি করতে পারে, এই অবস্থার রোগীদের মধ্যে দেখা প্রদাহজনক ইমিউন প্রতিক্রিয়া হ্রাস করার একটি উপায় হিসাবে জড়িত করা হয়েছে। সোরিয়াসিস রোগীদের মধ্যে এইচ. ডি. এ. সি এবং এইচ. এ. টি-র অস্বাভাবিক অভিব্যক্তিও দেখা গেছে। পেরিফেরাল রক্তের মনোনিউক্লিয়ার কোষ, যা ইমিউন সিস্টেম কোষের একটি সংগ্রহ, সোরিয়াসিস রোগীদের মধ্যে হিস্টোন 4-এর অ্যাসিটিলেশনে বিশ্বব্যাপী হ্রাসের পাশাপাশি এইচডিএসি-1 মাত্রা বৃদ্ধি করে। এইচ. ডি. এ. সি ইনহিবিটারগুলি সোরিয়াসিসের পাশাপাশি অন্যান্য অনেক প্রদাহজনক অটোইমিউন ব্যাধিগুলির সম্ভাব্য চিকিৎসা হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছে। স্জোগ্রেন্স সিন্ড্রোম একটি চর্মরোগ সংক্রান্ত অটোইমিউন ব্যাধি যা ল্যাক্রিমাল এবং লালা গ্রন্থিগুলিকে আক্রমণ করে যার ফলে অশ্রু এবং লালা নিঃসরণ হ্রাস পায়। এর ফলে প্রদাহ, চোখ শুষ্ক এবং মুখ শুষ্ক হয়ে যায়। এই অবস্থার রোগীরা লালা গ্রন্থিগুলিতে শ্বেত রক্ত কোষ গঠনের অভিজ্ঞতা অর্জন করে যা লিম্ফোসাইটিক অনুপ্রবেশ নামে পরিচিত। বর্তমান গবেষণা মূলত এই রোগের প্যাথোজেনেসিসে সহজাত ইমিউন সিস্টেমের ভূমিকার উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করে। জর্জেনের রোগীদের মধ্যে, এম. আই. আর. এন. এ-246এ পি. বি. এম. সি-তে নিয়ন্ত্রিত হয় এবং এই রোগের প্যাথোজেনেসিসের সাথে যুক্ত। টোল-লাইক রিসেপ্টর (টিএলআর) সিগন্যালিংকে নেতিবাচক প্রতিক্রিয়া প্রদান করে ইমিউন সিস্টেম নিয়ন্ত্রণে এমআইআরএনএ-246এ একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে যা সহজাত ইমিউন প্রতিক্রিয়াকে জড়িত করতে ব্যবহৃত হয়। যখন এম. আই. আর. এন. এ-246এ নিয়ন্ত্রিত হয়, তখন টি. এল. আর সিগন্যালিং-এ এই নেতিবাচক প্রতিক্রিয়া হ্রাস পায় যার ফলে প্রদাহ এবং একটি উচ্চতর প্রতিরোধ ক্ষমতা প্রতিক্রিয়া দেখা দেয় যা ল্যাক্রিমাল এবং লালা গ্রন্থির মতো সুস্থ কোষগুলিকে ক্ষতিগ্রস্থ করতে পারে। এম. আই. আর. এন. এ-150 এবং এম. আই. আর. এন. এ-149 জর্জেনে আক্রান্তদের লালা গ্রন্থি এবং লিম্ফোসাইটগুলিতেও নিয়ন্ত্রিত হয়। এই এম. আই. আর. এন. এ-গুলি এম. আর. এন. এ-কে লক্ষ্য করে তৈরি করা হয় যা ইমিউন ফাংশন এবং প্রো-ইনফ্ল্যামেটরি সাইটোকাইনের মাত্রা নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এই এম. আই. আর. এন. এ-গুলির অতিরিক্ত অভিব্যক্তি এইভাবে একটি উচ্চতর এবং অনিয়ন্ত্রিত ইমিউন প্রতিক্রিয়ার দিকে পরিচালিত করে। ইমিউন সিস্টেমে সিডি4 + টি-কোষের জিনের এপিজেনেটিক পরিবর্তনও এই অবস্থায় লক্ষ্য করা যায়। বিশেষত, গবেষণাটি সিডি 70, একটি টি-সেল কস্টিমুলেটরি জিনের হাইপোমেথাইলেশনকে সজোগ্রেনের সিনড্রোমের বিকাশের সাথে যুক্ত করেছে। এই সিডি4 + টি-কোষে এফওএক্সপি3 জিনের হ্রাসপ্রাপ্ত অভিব্যক্তিও দেখা যায়, যা ডিএনএ হাইপারমেথাইলেশনের দিকে পরিচালিত করে। এটি সিপিজি হাইপারমেথাইলেশন ঘটায় যার ফলে অনেক কোষের নিয়ন্ত্রণ হ্রাস পায় যা ইমিউন সিস্টেমকে নিয়ন্ত্রণে রাখার জন্য প্রয়োজনীয়। স্থানীয় অন্তঃস্রাবী অটোইমিউন ব্যাধি হাশিমোটোর থাইরয়েডিটিস হাশিমোটোর থাইরয়েডিটিস একটি অন্তঃস্রাবী রোগ যেখানে রোগীর প্রতিরোধ ব্যবস্থা তাদের থাইরয়েড গ্রন্থিকে আক্রমণ করে। হাশিমোটোর থাইরয়েডাইটিস সাধারণত হাইপোথাইরয়েডিজমের মাধ্যমে প্রকাশ পায়, যা থাইরয়েডে শ্বেত রক্তকণিকার গঠন এবং থাইরয়েড অটো অ্যান্টিবডিগুলির উৎপাদন দ্বারা চিহ্নিত করা হয়। গবেষণাটি হাশিমোটোর থাইরয়েডাইটিসের মতো অটোইমিউন থাইরয়েড রোগের পাশাপাশি হাশিমোটোর থাইরয়েডাইটিসের প্যাথলজিতে একটি এপিজেনেটিক ভূমিকার ক্ষেত্রে একটি শক্তিশালী জেনেটিক সংবেদনশীলতার পরামর্শ দেয়। থাইরোগ্লোবুলিন (টি. জি) জিন, থাইরয়েড হরমোন, থাইরক্সিন এবং ট্রাইয়োডোথাইরোনিনের সংশ্লেষণে জড়িত একটি জিন, হাশিমোটোর থাইরয়েডাইটিসের প্যাথোজেনেসিসে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। হাশিমোটো রোগে আক্রান্তদের মধ্যে, থাইরোগ্লোবুলিন (টিজি) প্রবর্তকের হিস্টোন মিথাইলেশন প্যাটার্নে একটি পরিবর্তন লক্ষ্য করা গেছে যার ফলে জিনের অভিব্যক্তি হ্রাস পেয়েছে এবং এইভাবে থাইরয়েড হরমোনের উৎপাদন হ্রাস পেয়েছে। আই. আর. এফ-1 হল টি. জি-র জন্য একটি প্রতিলিপি উপাদান যার বন্ধন হিস্টোন মিথাইলেশন প্যাটার্ন দ্বারা প্রভাবিত হয়। তির্যক এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়করণ অটোইমিউন থাইরয়েড রোগের সাথেও জড়িত। এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়তা এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে মহিলাদের মধ্যে দুটি এক্স ক্রোমোজোমের মধ্যে একটি প্রতিলিপিগতভাবে নিষ্ক্রিয় হেটেরোক্রোমাটিনে রূপান্তরিত হয়ে নীরব হয়ে যায়। তির্যক এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়তা হল নিষ্ক্রিয়তার পরিমাণের একটি ভারসাম্যহীনতা যা মাতৃ এবং পিতৃ এক্স ক্রোমোজোমের মধ্যে ঘটে যা অন্যটির উপর একটি এক্স ক্রোমোজোমের অভিব্যক্তির পক্ষে যায়। গ্রেভস এবং হাশিমোটোর রোগের গবেষণায়, একই টিস্যুতে একটি এক্স ক্রোমোজোমের উপর অন্যটির উপর এক্স ক্রোমোজোমের নিষ্ক্রিয়তার তির্যকতা গ্রেভস বা হাশিমোটোর রোগ ছাড়া নিয়ন্ত্রণের তুলনায় উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি; তবে, এটি স্পষ্ট নয় যে কেন একক এক্স ক্রোমোজোমের পছন্দসই অভিব্যক্তি এই রোগের ঝুঁকি বাড়ায়। একটি গবেষণায় তির্যক এক্স ক্রোমোজোম সক্রিয়করণ এটিকে একই টিস্যুতে একটি এক্স ক্রোমোজোমের উপর অন্যটির সক্রিয়করণের 80:20 অনুপাত হিসাবে সংজ্ঞায়িত করেছে। টার্নার সিন্ড্রোমে, একটি ক্রোমোসোমাল অস্বাভাবিকতা যেখানে একজন ব্যক্তি এক্স ক্রোমোজোম মনোসোমি প্রদর্শন করে, রোগীদের অটোইমিউন থাইরয়েড রোগের বিকাশের একটি বড় ঝুঁকি থাকে কারণ তাদের জিনোটাইপ এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়তার একটি চরম রূপ অনুকরণ করে কারণ শুধুমাত্র একটি এক্স ক্রোমোজোম রয়েছে যা প্রকাশ করা যেতে পারে। যদিও কোনও নির্দিষ্ট প্রক্রিয়া নেই যার দ্বারা তির্যক এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়তা অটোইমিউন থাইরয়েড রোগকে প্রভাবিত করে, একটি সম্ভাবনা অধ্যয়ন করা হচ্ছে যে থাইমাসে তির্যক এক্সসিআই থাইমিক এক্সপ্রেশনের অভাবের কারণ হতে পারে, যা শেষ পর্যন্ত অপর্যাপ্ত টি কোষ অপসারণের দিকে পরিচালিত করে। এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়তা একটি সাধারণ এবং ব্যাপকভাবে অধ্যয়ন করা এপিজেনেটিক ঘটনা। গ্রেভস 'ডিজিজ গ্রেভস' রোগ একটি অটোইমিউন রোগ যা থাইরোটক্সিকোসিসের সাথে জড়িত, যেখানে থাইরয়েড গ্রন্থিকে আক্রমণকারী ইমিউন সিস্টেমের ফলে থাইরয়েড হরমোনের অতিরিক্ত উৎপাদনের দ্বারা শরীর প্রভাবিত হয়। থাইরয়েড হরমোনের অতিরিক্ত উৎপাদনকে হাইপারথাইরয়েডিজম বলা হয়। থাইরোটক্সিকোসিস হাইপারথাইরয়েডিজম, থাইরয়েডাইটিস এবং অন্যান্য অবস্থার কারণে হতে পারে। এটি সাধারণত ইমিউনোগ্লোবুলিন অ্যান্টিবডিগুলির বৃদ্ধির কারণে হয় যা থাইরয়েড-উদ্দীপক হরমোন রিসেপ্টরকে সক্রিয় করে। হাশিমোটোর থাইরয়েডাইটিসের মতো, গ্রেভস রোগ একটি অটোইমিউন থাইরয়েড রোগ হিসাবে যোগ্য। হাশিমোটোর থাইরয়েডাইটিসের সাথে জড়িত এপিজেনেটিক প্রক্রিয়াগুলিও গ্রেভস রোগের সাথে জড়িত। অর্থাৎ, এগুলি হল টিজিতে হিস্টোন মিথাইলেশন এবং তির্যক এক্স ক্রোমোজোম নিষ্ক্রিয়করণের পরিবর্তন। গ্রেভস রোগের নির্দিষ্ট ক্ষেত্রে, আবিষ্কারগুলি নির্দিষ্ট সিপিজি সাইটে অস্বাভাবিক ডিএনএ মিথাইলেশনের জড়িততা দেখায়। এই অস্বাভাবিক ডিএনএ মিথাইলেশন গ্রেভস রোগের ক্ষেত্রে ইন্টারফেরন সিগন্যালিং এবং অন্যান্য অনিয়ন্ত্রিত ইমিউন সিস্টেম-সম্পর্কিত প্রক্রিয়াগুলির দিকে পরিচালিত করে। ইমিউন কোষে প্রকাশিত অনেক জিনের সিপিজি প্রবর্তক অঞ্চলগুলি গ্রেভস রোগের রোগীদের এপিজেনেটিক বিশ্লেষণে হাইপোমেথাইলেটেড হিসাবে দেখানো হয়েছে, যার অর্থ এই জিনগুলি এই ইমিউন কোষে অতিরিক্তভাবে প্রকাশিত হয়। উদাহরণস্বরূপ, সম্প্রতি গ্রেভস রোগে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে সিডি40এল প্রোটিনের মাত্রা বেশি দেখা যায়। এটি দেখানো হয়েছে যে সিডি40এল জিনে হাইপোমেথাইলেশন লক্ষ্য করা যায়। এই জিনটি সিডি40 লিগ্যান্ড প্রোটিনের জন্য কোড করে যা সিডি40 রিসেপ্টরকে আবদ্ধ করে এবং এই বন্ধন একটি ইমিউন প্রতিক্রিয়া সক্রিয় করে। এই জিনের অতিরিক্ত অভিব্যক্তি এইভাবে অটোইমিউন-মধ্যস্থ হাইপারথাইরয়েডিজমের সূচনার জন্য দায়ী করা হয়েছে। উপরন্তু, পেরিফেরাল রক্তের মনোনিউক্লিয়ার কোষে হিস্টোন মিথাইলেশন গ্রেভস রোগে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে অস্বাভাবিক। এই অস্বাভাবিকতা, যা হাইপারমেথাইলেশন হিসাবে প্রকাশিত হয়, সিডি3 জিন পরিবারের মতো এপিজেনেটিক সংশোধনকারী জিনে দেখা যায় যা টি কোষের আচরণের পাশাপাশি অন্যান্য ইমিউন ফাংশন জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। এর ফলে গ্রেভস রোগে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে সিডি3 জিন পরিবারের সদস্যদের অভিব্যক্তি হ্রাস পায়। উপরন্তু, কিছু নন-কোডিং আরএনএ-র ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন সম্প্রতি গ্রেভস রোগের বিকাশে জড়িত হয়েছে, তবে আরও গবেষণার প্রয়োজন। এই নন-কোডিং আরএনএগুলি আরও গবেষণার পরে গ্রেভসের রোগ নির্ণয়ের জন্য বায়োমার্কার হিসাবে কাজ করতে পারে। টাইপ 1 ডায়াবেটিস টাইপ 1 ডায়াবেটিস একটি অন্তঃস্রাবী রোগ যেখানে ইমিউন সিস্টেমের টি কোষগুলি অগ্ন্যাশয়ের বিটা কোষগুলিকে আক্রমণ করে, ইনসুলিনের উৎপাদন ব্যাহত করে। যদিও টাইপ 1 ডায়াবেটিসের প্যাথলজি এখনও অধ্যয়ন করা হচ্ছে, কিছু এপিজেনেটিক প্রক্রিয়া টাইপ 1 ডায়াবেটিসে জড়িত করা হয়েছে। প্রথম প্রকারের ডায়াবেটিস বিশ্বব্যাপী হাইপারমেথাইলেশন দ্বারা চিহ্নিত করা হয় যা হোমোসিস্টাইন বিপাকের পরিবর্তনের ফলে উদ্ভূত হয়। প্রোমোটার অঞ্চলগুলির বর্ধিত মিথাইলেশন জিন অভিব্যক্তিকে এমন উপায়ে পরিবর্তন করে বলে মনে করা হয় যা ইমিউন কোষের কর্মহীনতা সৃষ্টি করে। হোমোসিস্টাইন বিপাক দুটি পথের মাধ্যমে ঘটে। একটি পথ হোমোসিস্টাইনকে মেথিওনিনে এবং এস-অ্যাডেনোসিলমেথুয়োনিনে (এসএএম) ভেঙে দেয়। আরেকটি পথ, ট্রান্সসালফিউশন পথ, অসংখ্য ধাপের মধ্য দিয়ে হোমোসিস্টিনকে গ্লুটাথিওনিনে ভেঙে দেয়। টাইপ 1 ডায়াবেটিস রোগীরা ইনসুলিনের অপর্যাপ্ততা প্রদর্শন করে এবং ইনসুলিনের মাত্রায় এই হ্রাস হোমোসিস্টিন ভাঙ্গনের দুটি পথের মধ্যে একটির জন্য প্রয়োজনীয় ট্রান্সসালফিউশনকে বাধা দেয়। ফলস্বরূপ, হোমোসিস্টিনের মাত্রা বৃদ্ধি পায় এবং হোমোসিস্টিনের রূপান্তরকারী পথ-> মেথিওনিন-> এসএএম হোমোসিস্টিনের ভাঙনের প্রাথমিক পদ্ধতিতে পরিণত হয়। এটি সামঞ্জস্য করার জন্য, এস-অ্যাডেনোমেথিওনিনের ডি. এন. এম. টিগুলি মেথিওনিনের ভাঙ্গনকে অনুঘটক করে এবং ডি. এন. এম. টি ক্রিয়াকলাপকে উন্নত করে যা বিশ্বব্যাপী হাইপারমেথাইলেশনের দিকে পরিচালিত করে যা জিন অভিব্যক্তিতে ব্যাপক পরিবর্তন ঘটায়। এইচওএক্সএ9 ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের জন্য জিনে ডিএনএ ডিমাইথাইলেশন পর্যবেক্ষণ করা হয় এবং এফওএক্সপি3 ইমিউন রেসপন্স জিন প্রবর্তক অঞ্চলে ডিএনএ হাইপারমেথাইলেশন পর্যবেক্ষণ করা হয়। হেমাটোপোয়েটিক স্টেম সেল উৎপাদনের সাথে জড়িত একটি প্রোটিনের জন্য এইচওএক্সএ9 কোড এবং টাইপ 1 ডায়াবেটিসের ক্ষেত্রে হাইপোমেথাইলেটেড হয়। সম্প্রতি, ভিন্নভাবে পরিবর্তনশীল সি. পি. জি অবস্থানের একটি সমৃদ্ধি চিহ্নিত করা হয়েছে, যা টাইপ 1 ডায়াবেটিস প্যাথোজেনেসিসে পরিবর্তিত ডি. এন. এ মিথাইলেশন স্তরের জড়িত থাকার ইঙ্গিত দেয়। এই বিষয়ে আরও গবেষণা প্রয়োজন। টাইপ 1 ডায়াবেটিসে ইমিউন এফেক্টার কোষে ডিএনএ মিথাইলেশন পরিবর্তনশীলতা বৃদ্ধিও টাইপ 1 ডায়াবেটিসের প্যাথোজেনেসিস সম্পর্কিত অন্যান্য প্রক্রিয়াগুলিতে ডিএনএ মিথাইলেশন জড়িত থাকার বিষয়টি প্রদর্শন করেছে। স্থানীয় গ্যাস্ট্রোইনটেস্টাইনাল অটোইমিউন ব্যাধি সেলিয়াক ডিজিজ হল এমন একটি রোগ যেখানে ছোট অন্ত্র ক্ষতিগ্রস্ত হয় তাদের মধ্যে যাদের শরীর গ্লুটেন প্রক্রিয়া করতে অক্ষম কারণ একটি টি কোষ প্রতিক্রিয়া সক্রিয় হয় যখন গ্লুটেন, গম বা রাইয়ের মতো খাবার থেকে, অন্ত্রে উপস্থিত থাকে। সেলিয়াক রোগে বেশ কয়েকটি এপিজেনেটিক প্রক্রিয়া জড়িত, যেমন ডিএনএ মিথাইলেশন, হিস্টোন পরিবর্তন এবং নন-কোডিং আরএনএ। এই এপিজেনেটিক প্রক্রিয়াগুলি সেলিয়াক রোগের প্যাথোজেনেসিসের সাথে জড়িত এবং সেইসাথে সেলিয়াক রোগের প্রবণতাযুক্ত ব্যক্তিদের মধ্যে পরিবর্তিত হয়। উপরন্তু, মূল এন. এফ-কে. বি পথের সাথে জড়িত জিনের অস্বাভাবিক মিথাইলেশন, যা সহজাত অনাক্রম্যতার একটি নিয়ন্ত্রক, সেলিয়াক রোগের প্যাথোজেনেসিসে জড়িত। সিপিজির ডিএনএ মিথাইলেশনের একটি উচ্চ হার সেলিয়াক রোগে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে ছোট অন্ত্রের অ্যাডেনোকার্সিনোমার বিকাশে অবদান রাখে, যা ম্যালিগন্যান্ট টিউমার। এই সিপিজি হাইপারমেথাইলেশন এমএলএইচ-1 জিনের অভিব্যক্তি হ্রাসের সাথে সম্পর্কযুক্ত, যা ডিএনএ মেরামতের সাথে জড়িত। উপরন্তু, এপিসি জিনের হাইপারমেথাইলেশন, একটি টিউমার দমনকারী জিন, সেলিয়াক রোগে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে অসামঞ্জস্যপূর্ণ মেরামত পদ্ধতিতে ত্রুটি সৃষ্টি করতে দেখা গেছে। হিস্টোন অ্যাসিটাইলেশন বৃদ্ধি, বিশেষ করে এইচ3কে27এসি, সেলিয়াক রোগের বায়োপসিতেও পাওয়া গেছে। সেলিয়াক বায়োপসিতে সাইটোটক্সিক টি লিম্ফোসাইটের প্রতিক্রিয়ায় তিনটি ভিন্ন সাইটোকাইনের জিনের তুলনা করার সময়, প্রবর্তক এবং বর্ধক অঞ্চলে এইচ3কে27এসি-র বৃদ্ধি সাইটোকাইন আইএনএফ জিনের মধ্যে পাওয়া গেছে। সেলিয়াক রোগ ছাড়া ব্যক্তিদের তুলনায় সেলিয়াক রোগে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে নির্দিষ্ট মাইক্রোআরএনএ-র নিয়ন্ত্রণ উল্লেখযোগ্যভাবে পৃথক হয়। এই পার্থক্যগুলি কিছু মাইক্রোআরএনএ-র ডাউনরেগুলেশন এবং অন্যদের আপরেগুলেশন আকারে আসতে দেখা গেছে। এই ডিফারেনশিয়াল রেগুলেশন সম্ভবত অন্ত্রের বাধা ফাংশনকে সংশোধন করার সাথে জড়িত মাইক্রোআরএনএ-র ক্ষেত্রে ঘটে, যদিও সেলিয়াক রোগের জন্য আরও গবেষণা প্রয়োজন। স্থানীয় স্নায়বিক অটোইমিউন ব্যাধি মাল্টিপল স্ক্লেরোসিস (এম. এস) মাল্টিপল স্ক্লেরোসিস একটি স্নায়বিক রোগ যা প্রতিরোধ ব্যবস্থা দ্বারা চিহ্নিত করা হয় যা স্নায়ুর তন্তুগুলিকে আবরণ করে এমন মায়েলিন ম্যানকে আক্রমণ করে এবং ধ্বংস করে। এই আবরণগুলির ধ্বংসের ফলে স্নায়ু কোষ জুড়ে বার্তাগুলির বৈদ্যুতিক সংক্রমণ ধীর বা হ্রাস পায় এবং ফলস্বরূপ, রোগীরা দুর্বলতা, ব্যথা এবং দৃষ্টিশক্তি হ্রাস অনুভব করে। এটি দেখানো হয়েছে যে ভিটামিন ডি-এর ঘাটতি এপিজেনেটিক মার্কার এবং এমএস প্যাথোজেনেসিসের পরিবর্তনের সাথে যুক্ত। ভিটামিন ডি অটোইমিউনিটি এবং বিশেষ করে টিএইচ17 অটোইমিউনিটি দমন করতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। টি 17 হল টি হেল্পার কোষের একটি উপসেট যা প্রো-ইনফ্ল্যামেটরি ইন্টারলিউকিন (আইএল)-17 নিঃসরণ করে। ঐতিহ্যগতভাবে ভিটামিন ডি আইএল17এ প্রবর্তকের কাছে এইচডিএসি2 নিয়োগের মাধ্যমে আইএল17-এর প্রতিলিপি দমন করে, তবে ভিটামিন ডি-এর ঘাটতির ক্ষেত্রে আইএল17 প্রতিলিপি বৃদ্ধি পায় যার ফলে প্রদাহজনক প্রতিরোধ ক্ষমতা বৃদ্ধি পায়। পি. বি. এম. সি কোষে এম. আই. আর. এন. এ-326-এর বর্ধিত অভিব্যক্তি এমএস আক্রান্তদের মধ্যেও প্রচলিত এবং টি. এইচ. 17 কোষের পার্থক্যকে উৎসাহিত করার জন্য পরিচিত। হিস্টোন এইচ3 সিট্রুলিনেশন, যা আর্জিনাইনের অবশিষ্টাংশের মিথাইলেশনকে পরিবর্তন করে এবং ফলস্বরূপ ক্রোমাটিন কাঠামো এবং জিন অভিব্যক্তি, এমএস রোগীদের মস্তিষ্কেও বৃদ্ধি পেয়েছে বলে দেখা গেছে। যদিও হিস্টোন এইচ3 সিট্রুলিনেশন কীভাবে ডিমাইলিনেশনে অবদান রাখে তার প্রক্রিয়াটি বোঝার জন্য আরও গবেষণার প্রয়োজন, গবেষণা দেখায় যে এই সিট্রুলিনেশনের সাথে জড়িত এনজাইমগুলির প্রতিরোধকগুলি এই রোগের দৃষ্টিভঙ্গি এবং অগ্রগতির উন্নতি করে। মায়াস্থেনিয়া গ্রাভিস (এমজি) মায়াস্থেনিয়া গ্রাভিস একটি অটোইমিউন রোগ যা রোগীর কঙ্কালের পেশীগুলির দুর্বলতা এবং কর্মহীনতা সৃষ্টি করে যা স্নায়ু এবং পেশীগুলির মধ্যে যোগাযোগকে ধ্বংস করে দেয়। দেখা গেছে যে মায়াস্থেনিয়া গ্র্যাভিস আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে উচ্চ মাত্রার অ্যাসিটাইলকোলিন রিসেপ্টর অ্যান্টিবডি, এ. সি. আর-এ. বি থাকে, যা স্নায়ুতন্ত্রের সংযোগস্থলে উপস্থিত এ. সি. এইচ রিসেপ্টরগুলিকে ধ্বংস করার জন্য ইমিউন সিস্টেমকে নিয়োগ করে। সি. টি. এল. এ-4 অঞ্চলে নিয়ন্ত্রণের তুলনায় এম. জি রোগীদের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে উচ্চ মাত্রার মিথাইলেশন লক্ষ্য করা যায়। সিটিএলএ-4 জিন অভিব্যক্তি টি-রেগ কোষের নেতিবাচক নিয়ন্ত্রক হিসাবে কাজ করে এবং ইমিউন প্রতিক্রিয়া দমন করে। যখন সিটিএলএ-4 অঞ্চলের অভিব্যক্তি অবরোধ করা হয়, যেমনটি এমজি আক্রান্তদের মধ্যে দেখা যায়, তখন টি-সেল সক্রিয়করণ বৃদ্ধি পায় এবং একটি উচ্চতর ইমিউন প্রতিক্রিয়া লক্ষ্য করা যায়। সি. টি. এল. এ-4 উৎপন্নকারী সাইটোকাইনের অভিব্যক্তি যা এ. চি. আর-এ. বি অটো অ্যান্টিবডিগুলিকে নিয়ন্ত্রণ করে তাদের ক্রিয়ার প্রক্রিয়াটি আরও ভালভাবে বোঝার জন্য আরও অনুসন্ধানের প্রয়োজন। তথ্যসূত্র অটোইমিউন রোগ এপিজেনেটিক্স