Influenza A segment 7 splice site
ইনফ্লুয়েঞ্জা এ ভাইরাস বিভাগের 3 'স্প্লাইস সাইট 7 প্রাক-এমআরএনএ দুটি ভিন্ন ধরনের আরএনএ কাঠামো গ্রহণ করতে পারেঃ একটি সিউডোকনট এবং একটি হেয়ারপিন। এই গঠনমূলক পরিবর্তনটি আর. এন. এ বিকল্প স্প্লাইসিং-এ একটি ভূমিকা পালন করার প্রস্তাব দেওয়া হয়েছে এবং এই প্রাক-এম. আর. এন. এ-র স্প্লাইসিং দ্বারা উত্পাদিত এম1 এবং এম2 প্রোটিনের উৎপাদনকে প্রভাবিত করতে পারে। এই কাঠামোগত অঞ্চলটি প্রথম তাপগতিবিদ্যার ভাঁজ মুক্ত শক্তি এবং অ্যামিনো অ্যাসিড কোডন দমনের উপর ভিত্তি করে ইনফ্লুয়েঞ্জা এ-এর একটি বায়োইনফরম্যাটিক্স সমীক্ষায় আবিষ্কৃত হয়েছিল। গৌণ কাঠামোর প্রাথমিক মডেলগুলি নিউক্লিক অ্যাসিড কাঠামোর পূর্বাভাসের জন্য গণনামূলক পদ্ধতির উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছিল। আরএনএ ক্যালিফোল্ড ব্যবহার করে হেয়ারপিন গঠনের পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল, অন্যদিকে সিউডোকনট ডটনোট দিয়ে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। সেগমেন্ট 7 এম1 প্রোটিন এবং ছোট এম2 প্রোটন চ্যানেল প্রোটিনকে এনকোড করে, যা আরএনএ স্প্লাইসিং দ্বারা উত্পাদিত হয়। এম2 প্রোটিন ভাইরাসের জন্য গুরুত্বপূর্ণঃ এটি আয়ন চ্যানেল গঠন করে যা আন-কোটিং-এ উদ্দীপিত হওয়া ভিরিওনের অ্যাসিডিফিকেশন ঘটায়। এম2 উৎপাদনের জন্য ব্যবহৃত 3 'স্প্লাইস সাইট অঞ্চলটি কাঠামো-সংবেদনশীল রাসায়নিক এবং এনজাইম দিয়ে পরীক্ষামূলকভাবে পরীক্ষা করা হয়েছিল এবং দ্রবণে হেয়ারপিন এবং সিউডোকনট গঠন উভয়ই গ্রহণ করতে দেখা গেছে। প্রতিটি গঠন বিভিন্ন কাঠামোগত পরিবেশে গুরুত্বপূর্ণ স্প্লাইসিং নিয়ন্ত্রক সাইট স্থাপন করে, যা 7 নং অংশের প্রতিলিপির স্প্লাইসিংয়ের মড্যুলেশনের জন্য প্রভাব ফেলে। উদাহরণস্বরূপ, স্প্লাইস সাইট, পলিপাইরিমিডিন ট্র্যাক্ট, শাখা পয়েন্ট এবং এ. এস. এফ/এস. এফ 2 এক্সোনিক বর্ধক বাঁধাই সাইটগুলি হেয়ারপিন গঠনে আরও বেশি অ্যাক্সেসযোগ্য এবং সিউডোকনটে কম অ্যাক্সেসযোগ্য হবে বলে আশা করা হচ্ছে (চিত্র 1)। সিউডোকনট এবং হেয়ারপিনের মধ্যে ভারসাম্য পরিবর্তন করে যথাক্রমে এম2 স্প্লাইসিং হ্রাস বা বৃদ্ধি করা সম্ভব হতে পারে। সম্ভাব্যভাবে ভাগ করা প্রক্রিয়া এই অনুমানমূলক প্রক্রিয়াটিও এমন একটি হতে পারে যা স্প্লাইসড ইনফ্লুয়েঞ্জা প্রতিলিপির ক্ষেত্রে সাধারণ। একইভাবে স্থাপন করা, কিন্তু কাঠামোগতভাবে স্বতন্ত্র, ইনফ্লুয়েঞ্জা ভাইরাস সিউডোকনট/হেয়ারপিনকেও 8 নম্বর অংশের প্রতিলিপির 3 'স্প্লাইস সাইটে বর্ণনা করা হয়েছিল, যা এনপি-কে এনকোড করে এবং এনইপি প্রোটিনগুলিকে স্প্লাইস করে। এই কাঠামোগুলি ইনফ্লুয়েঞ্জা এ এবং ইনফ্লুয়েঞ্জা বি হোস্ট প্রজাতির নির্দিষ্ট কাঠামোগত স্থিতিশীলতার মধ্যে ভাগ করা কাঠামোগত আরএনএগুলির একটি পরিবার গঠন করে ইনফ্লুয়েঞ্জা এ বিভাগে 3 'স্প্লাইস সাইট কাঠামো কাঠামোগত স্থিতিশীলতায় হোস্ট-প্রজাতির নির্দিষ্ট প্রবণতা দেখায়। কাঠামোগতভাবে স্থিতিশীল মিউটেশনের সর্বাধিক সংখ্যা পাখির নির্দিষ্ট স্ট্রেনে ঘটে, যেখানে সবচেয়ে কাঠামোগতভাবে অস্থিতিশীল মিউটেশন মানুষের স্ট্রেনে ঘটেঃ শূকর মাঝখানে পড়ে। স্থিতিশীলতার এই সাধারণ প্রবণতাঃ পাখি, শূকর, মানুষ, মোটামুটিভাবে প্রতিটি পোষক প্রজাতির মধ্যে ইনফ্লুয়েঞ্জা ভাইরাস যে তাপমাত্রায় পুনরুত্পাদন করে তা অনুসরণ করে। পাখির অন্ত্র এবং শূকর এবং মানুষের ফুসফুসের তাপমাত্রা যথাক্রমে 42,37 এবং 34 ডিগ্রি সেলসিয়াস। এই পর্যবেক্ষণটি ইনফ্লুয়েঞ্জা এ কোডিং সিকোয়েন্সের বিশ্বব্যাপী প্রবণতার একটি স্থানীয় উদাহরণ, যেখানে এভিয়ান, শূকর এবং মানুষের স্ট্রেনগুলি বিভিন্ন স্থিতিশীলতা দেখায়। কার্যকরী কাঠামো বা গুরুত্বপূর্ণ কাঠামোগত ভারসাম্য সংরক্ষণের জন্য যেখানে প্রতিলিপি তাপমাত্রা বেশি থাকে সেখানে আরএনএ কাঠামো আরও স্থিতিশীল হতে পারে। আরও দেখুন সিউডোকনট নন-কোডিং আরএনএ নিউক্লিক অ্যাসিড সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক সিউডোবেস + +-আরএনএ সিউডোকনট সেকেন্ডারি স্ট্রাকচারের ডাটাবেস টার্নার ল্যাব সিস-রেগুলেটরি আরএনএ উপাদান আণবিক জেনেটিক্স ইনফ্লুয়েঞ্জা