Endogenous retrovirus
অন্তঃসত্ত্বা রেট্রোভাইরাস (ই. আর. ভি) হল জিনোমের অন্তঃসত্ত্বা ভাইরাল উপাদান যা কাছাকাছি সাদৃশ্যপূর্ণ এবং রেট্রোভাইরাস থেকে উদ্ভূত হতে পারে। এগুলি চোয়ালযুক্ত মেরুদণ্ডী প্রাণীর জিনোমে প্রচুর পরিমাণে থাকে এবং এগুলি মানব জিনোমের 5-8% পর্যন্ত গঠিত (~ 1 শতাংশের কম অনুমান)। ই. আর. ভি হল একটি উল্লম্বভাবে উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত প্রোভাইরাল ক্রম এবং ট্রান্সপোসন নামক এক ধরনের জিনের একটি উপশ্রেণী, যা সাধারণত জিন অভিব্যক্তি এবং নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করার জন্য জিনোমের মধ্যে প্যাকেজ করা এবং সরানো যেতে পারে। তবে ইআরভিগুলির বেশিরভাগ ট্রান্সপোসন ফাংশনের অভাব রয়েছে, সাধারণত সংক্রামক নয় এবং প্রায়শই রেট্রোভাইরাল প্রতিলিপি চক্রের ত্রুটিযুক্ত জিনোমিক অবশিষ্টাংশ। পোষক কোষের পারমাণবিক জিনোমে তাদের সংহতকরণ এবং বিপরীত-প্রতিলিপির কারণে এগুলি জার্মলাইন প্রোভাইরাস রেট্রোলেমেন্ট হিসাবে আলাদা করা হয়। গবেষকরা পরামর্শ দিয়েছেন যে রেট্রোভাইরাসগুলি রেট্রোট্রান্সপোসন নামে এক ধরনের ট্রান্সপোসন থেকে বিবর্তিত হয়েছে, যা একটি প্রথম শ্রেণীর উপাদান; এই জিনগুলি পরিবর্তিত হতে পারে এবং জিনোমের অন্য কোনও স্থানে যাওয়ার পরিবর্তে তারা বহির্জাগতিক বা প্যাথোজেনিক হয়ে উঠতে পারে। এর মানে হল যে সমস্ত ইআরভি একটি রেট্রোভাইরাস দ্বারা সন্নিবেশ হিসাবে উদ্ভূত হতে পারে না তবে কিছু রেট্রোভাইরাসগুলিতে জেনেটিক তথ্যের উৎস হতে পারে যা তাদের অনুরূপ। জীবাণু-লাইনে যখন ভাইরাল ডি. এন. এ-র সংহতকরণ ঘটে, তখন এটি একটি ই. আর. ভি-র জন্ম দিতে পারে, যা পরে পোষক জনসংখ্যার জিন পুলে স্থির হয়ে যেতে পারে। গঠন একটি রেট্রোভাইরাসের প্রতিলিপি চক্র হোস্ট কোষের পারমাণবিক জিনোমে ভাইরাল জিনোমের একটি ডিএনএ অনুলিপি সন্নিবেশ ("ইন্টিগ্রেশন") জড়িত। বেশিরভাগ রেট্রোভাইরাস দৈহিক কোষকে সংক্রামিত করে, তবে মাঝে মাঝে জার্মলাইন কোষের (ডিম এবং শুক্রাণু উৎপাদনকারী কোষ) সংক্রমণও ঘটতে পারে। খুব কমই, একটি জার্মলাইন কোষে রেট্রোভাইরাল ইন্টিগ্রেশন ঘটতে পারে যা একটি কার্যকর জীব হিসাবে বিকশিত হয়। এই জীবটি তার নিজস্ব জিনোমের একটি অবিচ্ছেদ্য অংশ হিসাবে ঢোকানো রেট্রোভাইরাল জিনোম বহন করবে-একটি "অন্তঃসত্ত্বা" রেট্রোভাইরাস (ইআরভি) যা তার বংশধরদের দ্বারা একটি নতুন অ্যালিল হিসাবে উত্তরাধিকারসূত্রে পাওয়া যেতে পারে। অনেক ই. আর. ভি লক্ষ লক্ষ বছর ধরে তাদের পোষকের জিনোমে রয়ে গেছে। যাইহোক, এগুলির বেশিরভাগই হোস্ট ডিএনএ প্রতিলিপির সময় নিষ্ক্রিয়কারী মিউটেশন অর্জন করেছে এবং আর ভাইরাস তৈরি করতে সক্ষম নয়। রিকম্বিনেশনাল ডিলিশন নামে পরিচিত একটি প্রক্রিয়া দ্বারা ইআরভিগুলি জিনোম থেকে আংশিকভাবে নিষ্কাশিত করা যেতে পারে, যেখানে নতুন সমন্বিত রেট্রোভাইরাসগুলির পার্শ্ববর্তী অভিন্ন ক্রমগুলির মধ্যে পুনর্মিলনের ফলে ভাইরাল জিনোমের অভ্যন্তরীণ, প্রোটিন-কোডিং অঞ্চলগুলি মুছে ফেলা হয়। সাধারণ রেট্রোভাইরাস জিনোম তিনটি জিন নিয়ে গঠিত যা তার ভাইরাল জিনোমের আক্রমণ, প্রতিলিপি, পলায়ন এবং বিস্তারের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। এই তিনটি জিন হল গ্যাগ (ভাইরাল কোরের জন্য স্ট্রাকচারাল প্রোটিনের জন্য এনকোড), পোল (রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেস, ইন্টিগ্রেজ এবং প্রোটিজের জন্য এনকোড) এবং এনভি (ভাইরাসের বাইরের জন্য কোট প্রোটিনের জন্য এনকোড)। এই ভাইরাল প্রোটিনগুলি পলিপ্রোটিন হিসাবে এনকোড করা হয়। তাদের জীবনচক্র চালানোর জন্য, রেট্রোভাইরাস পোষক কোষের যন্ত্রপাতির উপর ব্যাপকভাবে নির্ভর করে। প্রোটিজ ভাইরাল পলিপ্রোটিনগুলির পেপটাইড বন্ধনকে হ্রাস করে, যা পৃথক প্রোটিনগুলিকে কার্যকরী করে তোলে। নিউক্লিয়াসে প্রবেশের আগে পোষক কোষের সাইটোপ্লাজমে ভাইরাল আরএনএ থেকে ভাইরাল ডিএনএ সংশ্লেষ করার জন্য বিপরীত ট্রান্সক্রিপ্টেস ফাংশন। ইন্টিগ্রেজ হোস্ট জিনোমে ভাইরাল ডি. এন. এ-র সংহতকরণকে নির্দেশ করে। সময়ের সাথে সাথে, ই. আর. ভি-র জিনোম শুধুমাত্র পয়েন্ট মিউটেশন অর্জন করে না, বরং অন্যান্য ই. আর. ভি-র সাথে রদবদল এবং পুনরায় মিলিত হয়। এনভি-র জন্য একটি ক্ষয়প্রাপ্ত ক্রম সহ ইআরভিগুলি প্রসারিত হওয়ার সম্ভাবনা বেশি হয়ে যায়। জিনোম বিবর্তনে ভূমিকা অন্তঃসত্ত্বা রেট্রোভাইরাস জিনোম গঠনে সক্রিয় ভূমিকা পালন করতে পারে। এই ক্ষেত্রে বেশিরভাগ গবেষণায় মানুষ এবং উচ্চতর প্রাইমেটদের জিনোমের উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করা হয়েছে, তবে অন্যান্য মেরুদণ্ডী প্রাণী যেমন ইঁদুর এবং ভেড়াও গভীরভাবে অধ্যয়ন করা হয়েছে। লং টার্মিনাল রিপিট (এল. টি. আর) সিকোয়েন্স যা ই. আর. ভি জিনোমের পাশে থাকে প্রায়শই বিকল্প প্রবর্তক এবং বর্ধক হিসাবে কাজ করে, প্রায়শই টিস্যু-নির্দিষ্ট রূপগুলি তৈরি করে ট্রান্সক্রিপ্টোমে অবদান রাখে। উপরন্তু, রেট্রোভাইরাল প্রোটিনগুলি বিশেষত প্রজনন এবং বিকাশে নতুন হোস্ট ফাংশনগুলি পরিবেশন করার জন্য কো-অপ্ট করা হয়েছে। হোমোলোগাস রেট্রোভাইরাল সিকোয়েন্সের মধ্যে পুনর্মিলন জিন অদলবদল এবং জেনেটিক বৈচিত্র্যের প্রজন্মের ক্ষেত্রেও অবদান রেখেছে। উপরন্তু, রেট্রোভাইরাল সিকোয়েন্সের সম্ভাব্য বিরোধী প্রভাবের উদাহরণে, দমনকারী জিনগুলি তাদের বিরুদ্ধে লড়াই করার জন্য সহ-বিকশিত হয়েছে। প্রায় 90 শতাংশ অন্তঃসত্ত্বা রেট্রোভাইরাস একক এল. টি. আর, যার সমস্ত উন্মুক্ত পঠন কাঠামোর (ও. আর. এফ) অভাব রয়েছে। সম্পূর্ণ রেট্রোভাইরাল সিকোয়েন্সের সাথে যুক্ত একক এল. টি. আর এবং এল. টি. আর হোস্ট জিনের উপর প্রতিলিপি উপাদান হিসাবে কাজ করে বলে দেখানো হয়েছে। তাদের ক্রিয়ার পরিসীমা মূলত প্রোটিন কোডিং জিনের 5 'ইউটিআর-এ সন্নিবেশের মাধ্যমে হয়; তবে, তারা 70-100 কেবি পর্যন্ত জিনের উপর কাজ করে বলে জানা গেছে। এই উপাদানগুলির বেশিরভাগই তাদের সংশ্লিষ্ট জিনের ইন্দ্রিয়ের দিকে ঢোকানো হয়, তবে এল. টি. আরগুলি অ্যান্টিসেন্সের দিকে এবং প্রতিবেশী জিনের জন্য দ্বিমুখী প্রবর্তক হিসাবে কাজ করার প্রমাণ পাওয়া গেছে। কয়েকটি ক্ষেত্রে, এল. টি. আর জিনের প্রধান প্রবর্তক হিসাবে কাজ করে। উদাহরণস্বরূপ, মানুষের মধ্যে এ. এম. ওয়াই1সি-র প্রবর্তক অঞ্চলে একটি সম্পূর্ণ ই. আর. ভি ক্রম রয়েছে; সংশ্লিষ্ট এল. টি. আর পাচক উৎসেচক অ্যামাইলেজ-এর লালা নির্দিষ্ট অভিব্যক্তি প্রদান করে। এছাড়াও, পিত্ত অ্যাসিড-কোএ-এর প্রাথমিক প্রবর্তকঃ অ্যামিনো অ্যাসিড এন-অ্যাসাইলট্রান্সফেরেজ (বিএএটি), যা পিত্ত বিপাকের অবিচ্ছেদ্য এনজাইমের জন্য কোড করে, এলটিআর উত্সের। একক ই. আর. ভি-9 এল. টি. আর-এর সন্নিবেশ একটি কার্যকরী উন্মুক্ত পঠন কাঠামো তৈরি করতে পারে, যার ফলে মানব অনাক্রম্যতা সম্পর্কিত জি. টি. পিজ জিনের (আই. আর. জি. এম) পুনর্জন্ম ঘটে। ইআরভি সন্নিবেশগুলি মানব লেপ্টিন হরমোন রিসেপ্টর হিসাবে জিনের সাথে সরাসরি সংহতকরণের মাধ্যমে বা ফসফোলিপেজ এ-2-এর মতো প্রোটিনের মতো উজানে এলটিআর-এর অভিব্যক্তি দ্বারা চালিত বিকল্প স্প্লাইস সাইট তৈরি করতেও দেখানো হয়েছে। বেশিরভাগ সময়, তবে, এলটিআর অনেক বিকল্প প্রবর্তকদের মধ্যে একটি হিসাবে কাজ করে, প্রায়শই প্রজনন এবং বিকাশ সম্পর্কিত টিস্যু-নির্দিষ্ট অভিব্যক্তি প্রদান করে। প্রকৃতপক্ষে, পরিচিত এল. টি. আর-প্রচারিত প্রতিলিপি রূপগুলির 64 শতাংশ প্রজনন টিস্যুতে প্রকাশিত হয়। উদাহরণস্বরূপ, জিন সিওয়াইপি19 এস্ট্রোজেন সংশ্লেষণের জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ এনজাইম অ্যারোমাটেজ পি450-এর জন্য কোড করে, যা সাধারণত বেশিরভাগ স্তন্যপায়ী প্রাণীর মস্তিষ্ক এবং প্রজনন অঙ্গগুলিতে প্রকাশিত হয়। যাইহোক, প্রাইমেটদের মধ্যে, একটি এলটিআর-প্রচারিত প্রতিলিপি বৈকল্পিক প্ল্যাসেন্টাকে অভিব্যক্তি প্রদান করে এবং গর্ভাবস্থায় ইস্ট্রোজেনের মাত্রা নিয়ন্ত্রণের জন্য দায়ী। উপরন্তু, নিউরোনাল অ্যাপোপটোসিস ইনহিবিটরি প্রোটিন (এনএআইপি), সাধারণত বিস্তৃত, এইচইআরভি-পি পরিবারের একটি এলটিআর একটি প্রবর্তক হিসাবে কাজ করে যা টেস্টিস এবং প্রস্টেটকে অভিব্যক্তি প্রদান করে। অন্যান্য প্রোটিন, যেমন নাইট্রিক অক্সাইড সিন্থেস 3 (এন. ও. এস 3), ইন্টারলিউকিন-2 রিসেপ্টর বি (আই. এল 2 আর. বি), এবং ইস্ট্রোজেন সংশ্লেষণের আরেকটি মধ্যস্থতাকারী, এইচ. এস. ডি 17 বি 1, বিকল্পভাবে এল. টি. আর দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয় যা প্ল্যাসেন্টাল এক্সপ্রেশন প্রদান করে, কিন্তু তাদের নির্দিষ্ট ফাংশন এখনও জানা যায় না। উচ্চ মাত্রার প্রজনন অভিব্যক্তিটি যে পদ্ধতিতে তাদের অন্তঃসত্ত্বা করা হয়েছিল তার একটি পরবর্তী প্রভাব বলে মনে করা হয়; তবে, এটি জীবাণু-লাইন টিস্যুতে ডিএনএ মিথাইলেশনের অভাবের কারণেও হতে পারে। প্ল্যাসেন্টাল প্রোটিন এক্সপ্রেশনের সর্বোত্তম বৈশিষ্ট্যযুক্ত উদাহরণটি বিকল্পভাবে প্রচারিত হোস্ট জিন থেকে নয় বরং একটি রেট্রোভাইরাল প্রোটিনের সম্পূর্ণ সহ-বিকল্প থেকে আসে। রেট্রোভাইরাল ফিউজোজেনিক এনভি প্রোটিন, যা পোষক কোষে ভিরিওনের প্রবেশের ক্ষেত্রে ভূমিকা পালন করে, স্তন্যপায়ী প্রাণীর গর্ভনালের বিকাশে গুরুত্বপূর্ণ প্রভাব ফেলেছে। স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে, সিনসাইটিন নামক অক্ষত এনভি প্রোটিনগুলি সিনসাইটিয়োট্রোফোব্লাস্ট গঠন এবং কার্যকারিতার জন্য দায়ী। এই বহুমাত্রিক কোষগুলি মূলত পুষ্টির বিনিময় বজায় রাখার জন্য এবং ভ্রূণকে মায়ের প্রতিরোধ ব্যবস্থা থেকে আলাদা করার জন্য দায়ী। এটি প্রস্তাব করা হয়েছে যে এই ফাংশনের জন্য এই প্রোটিনগুলির নির্বাচন এবং স্থিরকরণ জীববৈচিত্র্যের বিবর্তনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করেছে। উপরন্তু, ই. আর. ভি এবং তাদের নিজ নিজ এল. টি. আর-এর সন্নিবেশ আন্তঃ-ক্রোমোসোমাল লোকিতে ভাইরাল সিকোয়েন্সের মধ্যে পুনর্মিলনের কারণে ক্রোমোসোমাল পুনর্বিন্যাসকে প্ররোচিত করার সম্ভাবনা রয়েছে। এই পুনর্বিন্যাসগুলি জিন প্রতিলিপি এবং অপসারণকে প্ররোচিত করতে দেখানো হয়েছে যা মূলত জিনোম নমনীয়তায় অবদান রাখে এবং জিন ক্রিয়াকলাপের গতিশীলতাকে নাটকীয়ভাবে পরিবর্তন করে। উপরন্তু, সাধারণভাবে রেট্রোলেমেন্টগুলি দ্রুত বিবর্তিত, স্তন্যপায়ী-নির্দিষ্ট জিন পরিবারগুলিতে ব্যাপকভাবে প্রচলিত, যাদের কার্যকারিতা মূলত চাপ এবং বাহ্যিক উদ্দীপনার প্রতিক্রিয়ার সাথে সম্পর্কিত। বিশেষত, অন্যান্য বহু-লোকাস-জিন পরিবারের তুলনায় মানব শ্রেণীর প্রথম এবং দ্বিতীয় শ্রেণীর এম. এইচ. সি জিনের এইচ. ই. আর. ভি উপাদানগুলির উচ্চ ঘনত্ব রয়েছে। এটি দেখানো হয়েছে যে এইচ. ই. আর. ভিগুলি ব্যাপকভাবে ডুপ্লিকেট ডুপ্লিকন ব্লক গঠনে অবদান রেখেছে যা এইচ. এল. এ ক্লাস 1 পরিবারের জিন তৈরি করে। আরও সুনির্দিষ্টভাবে, এইচ. ই. আর. ভি প্রাথমিকভাবে এই ব্লকগুলির মধ্যে বিরতি পয়েন্টগুলির মধ্যে এবং এর মধ্যে অঞ্চলগুলি দখল করে, যা পরামর্শ দেয় যে উল্লেখযোগ্য অনুলিপি এবং মুছে ফেলার ঘটনাগুলি, সাধারণত অসম ক্রসওভারের সাথে যুক্ত, তাদের গঠনকে সহজতর করে। ইমিউনোহ্যাপ্লোটাইপ হিসাবে উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত এই ব্লকগুলির প্রজন্ম, অ্যান্টিজেনের বিস্তৃত পরিসরের বিরুদ্ধে সুরক্ষামূলক পলিমরফিজম হিসাবে কাজ করে যা মানুষকে অন্যান্য প্রাইমেটের তুলনায় সুবিধা দিয়ে অনুপ্রাণিত করতে পারে। বিভিন্ন প্রজাতির মধ্যে খুব বিবর্তনীয় স্বতন্ত্র অঙ্গ হওয়ার বৈশিষ্ট্যটি ই. আর. ভি বর্ধকদের সহ-বিকল্পের ফলস্বরূপ বলে মনে করা হয়। হরমোন এবং বৃদ্ধির কারণগুলির জন্য এনকোড করা জিনের মিউটেশনের পরিবর্তে নিয়ন্ত্রক মিউটেশনগুলি প্ল্যাসেন্টাল অঙ্গসংস্থানের পরিচিত বিবর্তনকে সমর্থন করে, বিশেষত যেহেতু বেশিরভাগ হরমোন এবং বৃদ্ধির কারণ জিনগুলি গর্ভাবস্থার প্রতিক্রিয়ায় প্রকাশিত হয়, প্ল্যাসেন্টাল বিকাশের সময় নয়। গবেষকরা ইঁদুর এবং ইঁদুরের মধ্যে প্ল্যাসেন্টাল বিকাশের নিয়ন্ত্রক প্রাকৃতিক দৃশ্য অধ্যয়ন করেছেন, দুটি ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত প্রজাতি। এটি ইঁদুরের ট্রফোব্লাস্ট স্টেম সেলের (টি. এস. সি) সমস্ত নিয়ন্ত্রক উপাদানগুলির ম্যাপিং করে এবং মাউস টি. এস. সি-তে তাদের অর্থোলগের সাথে তুলনা করে করা হয়েছিল। টিএসসিগুলি পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল কারণ তারা ভ্রূণের প্লাসেন্টায় বিকশিত প্রাথমিক কোষগুলিকে প্রতিফলিত করে। তাদের বাস্তব সাদৃশ্য নির্বিশেষে, বর্ধনকারী এবং নিপীড়িত অঞ্চলগুলি বেশিরভাগ প্রজাতি-নির্দিষ্ট ছিল। তবে, বেশিরভাগ প্রবর্তক ক্রম মাউস এবং ইঁদুরের মধ্যে সংরক্ষিত ছিল। তাদের গবেষণার উপসংহারে, গবেষকরা প্রস্তাব করেছিলেন যে ইআরভিগুলি প্ল্যাসেন্টাল বৃদ্ধি, ইমিউনোসপ্রেশন এবং সেল ফিউশনের মধ্যস্থতার মাধ্যমে প্রজাতি-নির্দিষ্ট প্ল্যাসেন্টাল বিবর্তনকে প্রভাবিত করেছিল। ইআরভি কোষীয় প্রক্রিয়াকে কাজে লাগানোর আরেকটি উদাহরণ হল পি53, একটি টিউমার দমনকারী জিন (টিএসজি)। ডি. এন. এ ক্ষতি এবং কোষীয় চাপ পি53 পথকে প্ররোচিত করে, যার ফলে কোষ অ্যাপোপটোসিস হয়। ক্রমবিন্যাসের সাথে ক্রোমাটিন ইমিউনোপ্রেসিপিটেশন ব্যবহার করে, সমস্ত পি53-বাইন্ডিং সাইটের ত্রিশ শতাংশ কয়েকটি প্রাইমেট-নির্দিষ্ট ইআরভি পরিবারের অনুলিপির মধ্যে অবস্থিত ছিল। একটি গবেষণায় পরামর্শ দেওয়া হয়েছে যে এটি রেট্রোভাইরাসকে উপকৃত করে কারণ পি53-এর প্রক্রিয়াটি প্রতিলিপির একটি দ্রুত প্রবর্তন প্রদান করে, যা পোষক কোষ থেকে ভাইরাল আরএনএ-র প্রস্থান ঘটায়। পরিশেষে, পোষক ডি. এন. এ-র জিনগত অঞ্চলে ই. আর. ভি বা ই. আর. ভি উপাদানগুলির সন্নিবেশ, বা তাদের প্রতিলিপিগত রূপগুলির অতিরিক্ত অভিব্যক্তি, ইতিবাচকগুলির তুলনায় ক্ষতিকারক প্রভাব তৈরি করার অনেক বেশি সম্ভাবনা রয়েছে। জিনোমে তাদের উপস্থিতি একটি সহ-বিবর্তনীয় গতিশীল সৃষ্টি করেছে যা দমনকারী জিনের প্রতিলিপি এবং সম্প্রসারণকে প্রসারিত করেছে। এর সবচেয়ে স্পষ্ট উদাহরণ হল স্তন্যপায়ী জিনোমে ট্যান্ডেম দস্তা-আঙুল জিনের দ্রুত প্রতিলিপি এবং বিস্তার। জিঙ্ক-ফিঙ্গার জিনগুলি, বিশেষত যেগুলি একটি কে. আর. এ. বি ডোমেন অন্তর্ভুক্ত করে, মেরুদণ্ডী জিনোমে উচ্চ অনুলিপি সংখ্যায় বিদ্যমান এবং তাদের ক্রিয়াকলাপের পরিসীমা প্রতিলিপি ভূমিকার মধ্যে সীমাবদ্ধ। স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে এটি দেখানো হয়েছে যে, এই জিনগুলির বৈচিত্র্য নতুন রেট্রোভাইরাল সিকোয়েন্স বা তাদের প্রতিলিপি দমন করার জন্য তাদের অন্তঃসত্ত্বা অনুলিপিগুলির প্রতিক্রিয়ায় একাধিক অনুলিপি এবং স্থিরকরণ ঘটনার কারণে হয়েছিল। রোগে ভূমিকা মেরুদণ্ডী জিনোমে ঘটে যাওয়া বেশিরভাগ ই. আর. ভি প্রাচীন, রূপান্তর দ্বারা নিষ্ক্রিয় এবং তাদের পোষক প্রজাতির মধ্যে জিনগত স্থিরতায় পৌঁছেছে। এই কারণগুলির জন্য, অস্বাভাবিক পরিস্থিতি ব্যতীত তাদের আয়োজকদের উপর নেতিবাচক প্রভাব ফেলার সম্ভাবনা খুব কম। তবুও, ইঁদুর, বিড়াল এবং কোয়ালাস সহ পাখি এবং অ-মানব স্তন্যপায়ী প্রজাতির গবেষণা থেকে এটি স্পষ্ট যে, কম বয়সী (অর্থাৎ, আরও সম্প্রতি সমন্বিত) ইআরভি রোগের সাথে যুক্ত হতে পারে। স্তন্যপায়ী প্রাণীদের জিনোমে সক্রিয় ই. আর. ভি-র সংখ্যা তাদের দেহের আকারের সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কিত, যা ক্যান্সার প্যাথোজেনেসিসের মাধ্যমে পেটোর প্যারাডক্সে অবদানের পরামর্শ দেয়। এর ফলে গবেষকরা বিভিন্ন ধরনের মানব ক্যান্সার এবং অটোইমিউন রোগে ই. আর. ভি-র জন্য একটি ভূমিকা প্রস্তাব করেছেন, যদিও চূড়ান্ত প্রমাণের অভাব রয়েছে। স্নায়বিক ব্যাধি মানুষের মধ্যে, ইআরভিগুলি মাল্টিপল স্ক্লেরোসিস (এমএস)-এর সাথে জড়িত বলে প্রস্তাব করা হয়েছে। এমএস এবং ইআরভিডব্লিউই1, বা "সিনসাইটিন", জিনের মধ্যে একটি নির্দিষ্ট সম্পর্ক, যা একটি ইআরভি সন্নিবেশ থেকে উদ্ভূত, এই রোগে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে একটি "এমএস-সম্পর্কিত রেট্রোভাইরাস" (এমএসআরভি)-এর উপস্থিতি সহ রিপোর্ট করা হয়েছে। হিউম্যান ইআরভি (এইচইআরভি) এএলএস এবং আসক্তির সাথেও জড়িত। 2004 সালে জানা যায় যে সিজোফ্রেনিয়ায় আক্রান্ত ব্যক্তিদের সেরাতে এইচ. ই. আর. ভি-র অ্যান্টিবডি বেশি পাওয়া গেছে। উপরন্তু, সাম্প্রতিক শুরু হওয়া সিজোফ্রেনিয়ায় আক্রান্ত ব্যক্তিদের সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইডে একটি রেট্রোভাইরাল মার্কার, রিভার্স ট্রান্সক্রিপ্টেসের মাত্রা থাকে, যা নিয়ন্ত্রিত বিষয়গুলির চেয়ে চারগুণ বেশি। গবেষকরা এইচ. ই. আর. ভি এবং সিজোফ্রেনিয়ার মধ্যে একটি সম্ভাব্য যোগসূত্রের দিকে নজর রাখছেন, যার মধ্যে সিজোফ্রেনিয়াকে প্ররোচিত করে সংক্রমণের অতিরিক্ত সম্ভাবনা রয়েছে। ইমিউনিটি ইআরভি শুধুমাত্র রোগ সৃষ্টিকারী সম্পর্কের মাধ্যমেই নয়, ইমিউনিটির মাধ্যমেও রোগের সাথে যুক্ত বলে দেখা গেছে। দীর্ঘ টার্মিনাল পুনরাবৃত্তিতে (এল. টি. আর) ই. আর. ভি-র ফ্রিকোয়েন্সি সম্ভবত ভাইরাল প্রতিলিপি এবং প্রতিলিপিকে উৎসাহিত করে এমন ইমিউনিটি সিগন্যালিং পথের সুবিধা নিতে ভাইরাল অভিযোজনের সাথে সম্পর্কিত। 2016 সালে করা একটি গবেষণায় অন্তর্নিহিত অনাক্রম্যতার একটি শাখা ইন্টারফেরন দ্বারা প্ররোচিত জিন নিয়ন্ত্রণ নেটওয়ার্কের মাধ্যমে একটি হোস্টের মধ্যে একীভূত প্রাচীন ভাইরাল ডিএনএর উপকারিতা তদন্ত করা হয়েছিল। এই সাইটোকাইনগুলি প্রথম ভাইরাল সংক্রমণে সাড়া দেয় এবং ম্যালিগন্যান্ট কোষগুলির জন্য ইমিউনোসার্ভিলেন্সের ক্ষেত্রেও গুরুত্বপূর্ণ। ইআরভিগুলি সিস-নিয়ন্ত্রক উপাদান হিসাবে কাজ করবে বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে, তবে নির্দিষ্ট শারীরবৃত্তীয় ক্রিয়াকলাপের জন্য এর বেশিরভাগ অভিযোজিত পরিণতি এখনও অজানা। এমন তথ্য রয়েছে যা মানব ইন্টারফেরন প্রতিক্রিয়া, বিশেষত ইন্টারফেরন-গামা (আইএফএনজি) নিয়ন্ত্রণে ইআরভি-র সাধারণ ভূমিকাকে সমর্থন করে। উদাহরণস্বরূপ, ইন্টারফেরন-উদ্দীপিত জিনগুলি সিডি14 + ম্যাক্রোফেজগুলিতে সিগন্যাল ট্রান্সডিউসার এবং ট্রান্সক্রিপশন 1 (এসটিএটি1) এবং/অথবা ইন্টারফেরন রেগুলেটরি ফ্যাক্টর (আইআরএফ1)-এর অ্যাক্টিভেটর দ্বারা আবদ্ধ ইআরভি-র সাথে ব্যাপকভাবে সমৃদ্ধ হতে দেখা গেছে। এইচ. ই. আর. ভি মানুষের সহজাত অনাক্রম্যতা প্রতিক্রিয়াকে রূপ দেওয়ার ক্ষেত্রেও বিভিন্ন ভূমিকা পালন করে, কিছু ক্রম সিস্টেমকে সক্রিয় করে এবং অন্যরা এটিকে দমন করে। এগুলি বহির্জাগতিক রেট্রোভাইরাল সংক্রমণ থেকেও রক্ষা করতে পারেঃ ভাইরাসের মতো প্রতিলিপিগুলি প্যাটার্ন স্বীকৃতি রিসেপ্টরগুলিকে সক্রিয় করতে পারে এবং প্রোটিনগুলি সক্রিয় রেট্রোভাইরাসগুলিতে হস্তক্ষেপ করতে পারে। এইচ. ই. আর. ভি-কে (এইচ. এম. এল. 2) থেকে একটি গ্যাগ প্রোটিন এইচ. আই. ভি গ্যাগের সাথে মিশে যায়, যার ফলে এইচ. আই. ভি ক্যাপসিড গঠনে ব্যাঘাত ঘটে। জিন নিয়ন্ত্রণ আরেকটি প্রস্তাবিত ধারণা ছিল যে একই পরিবারের ই. আর. ভি একই নিয়ন্ত্রণের নেটওয়ার্কে একাধিক জিন নিয়োগের ক্ষেত্রে ভূমিকা পালন করে। দেখা গেছে যে, এম. ই. আর. 41 উপাদানগুলি এস. টি. এ. টি. 1 বাইন্ডিং সাইটের কাছাকাছি অবস্থিত জিনগুলিতে অতিরিক্ত অপ্রয়োজনীয় নিয়ন্ত্রক বর্ধন প্রদান করে। চিকিৎসায় পোর্সিন এন্ডোজেনস রেট্রোভাইরাসের ভূমিকা মানুষের জন্য, পোর্সিন এন্ডোজেনস রেট্রোভাইরাস (পি. ই. আর. ভি) একটি উদ্বেগের বিষয় হয়ে দাঁড়ায় যখন পোর্সিন টিস্যু এবং অঙ্গগুলি জেনোট্রান্সপ্লান্টনে ব্যবহার করা হয়, একটি প্রজাতির জীব থেকে বিভিন্ন প্রজাতির জীবের মধ্যে জীবন্ত কোষ, টিস্যু এবং অঙ্গ প্রতিস্থাপন করা হয়। যদিও ব্যবহারিক, আর্থিক, নিরাপত্তা এবং নৈতিক কারণে শূকরগুলি সাধারণত মানব অঙ্গের রোগের চিকিত্সার জন্য সবচেয়ে উপযুক্ত দাতা, তবে পি. ই. আর. ভিগুলি আগে শূকর থেকে অপসারণ করা যায়নি, কারণ তাদের হোস্ট জিনোমে একীভূত হওয়ার এবং সন্তানদের মধ্যে প্রেরণ করার ভাইরাল ক্ষমতার কারণে, 2017 সাল পর্যন্ত, যখন একটি ল্যাব, সি. আর. আই. এস. পি. আর-সি. এ. এস 9 ব্যবহার করে, শূকর জিনোম থেকে সমস্ত 62 টি রেট্রোভাইরাস সরিয়ে দেয়। ক্রস-প্রজাতি সংক্রমণের পরিণতিগুলি অনাবিষ্কৃত রয়ে গেছে এবং এর বিপজ্জনক সম্ভাবনা রয়েছে। গবেষকরা ইঙ্গিত দিয়েছেন যে পি. ই. আর. ভি দ্বারা মানুষের টিস্যুতে সংক্রমণ খুব সম্ভব, বিশেষ করে ইমিউনোসপ্রেসড ব্যক্তিদের মধ্যে। একটি ইমিউনোসপ্রেসড অবস্থা সম্ভাব্যভাবে ভাইরাল ডিএনএর আরও দ্রুত এবং দৃঢ় প্রতিলিপির অনুমতি দিতে পারে এবং পরে মানুষের থেকে মানুষের সংক্রমণের সাথে খাপ খাইয়ে নিতে কম অসুবিধা হবে। যদিও দাতার অঙ্গ/টিস্যুতে উপস্থিত পরিচিত সংক্রামক প্যাথোজেনগুলি প্যাথোজেন-মুক্ত পালের প্রজনন দ্বারা নির্মূল করা যেতে পারে, তবে দাতার মধ্যে অজানা রেট্রোভাইরাস উপস্থিত থাকতে পারে। এই রেট্রোভাইরাসগুলি প্রায়শই দাতার মধ্যে সুপ্ত এবং উপসর্গহীন হয়, তবে প্রাপকের মধ্যে সক্রিয় হতে পারে। অন্তঃসত্ত্বা ভাইরাসগুলির কিছু উদাহরণ যা মানব কোষে সংক্রামিত এবং বহুগুণিত হতে পারে সেগুলি হল বাবুন (বি. এ. ই. ভি), বিড়াল (আর. ডি. 114) এবং ইঁদুর। পি. ই. আর. ভি-এর তিনটি ভিন্ন শ্রেণী রয়েছে, পি. ই. আর. ভি-এ, পি. ই. আর. ভি-বি এবং পি. ই. আর. ভি-সি। পি. ই. আর. ভি-এ এবং পি. ই. আর. ভি-বি পলিট্রপিক এবং মানব কোষকে ইন ভিট্রোতে সংক্রামিত করতে পারে, যেখানে পি. ই. আর. ভি-সি ইকোট্রোপিক এবং মানব কোষে প্রতিলিপি তৈরি করে না। শ্রেণীর মধ্যে প্রধান পার্থক্য হল এনভি প্রোটিনের রিসেপ্টর বাইন্ডিং ডোমেইন এবং লং টার্মিনাল রিপিটস (এলটিআর) যা প্রতিটি শ্রেণীর প্রতিলিপিকে প্রভাবিত করে। PERV-A এবং PERV-B প্রদর্শন LTR যা U3 অঞ্চলে পুনরাবৃত্তি করেছে। তবে, পি. ই. আর. ভি-এ এবং পি. ই. আর. ভি-সি রিপিটলেস এল. টি. আর দেখায়। গবেষকরা দেখেছেন যে সংস্কৃতির ক্ষেত্রে পিইআরভিগুলি সক্রিয়ভাবে তাদের এলটিআর-এর পুনরাবৃত্ত কাঠামোর সাথে খাপ খাইয়ে নেয় যাতে একটি পোষক কোষ সম্পাদন করতে পারে এমন সেরা প্রতিলিপি কর্মক্ষমতার সাথে মেলে। গবেষণার শেষে গবেষকরা এই সিদ্ধান্তে উপনীত হন যে, পুনরাবৃত্তিমূলক পি. ই. আর. ভি এল. টি. আর পুনরাবৃত্তিমূলক এল. টি. আর থেকে বিবর্তিত হয়েছে। এটি সম্ভবত সন্নিবেশমূলক রূপান্তর থেকে ঘটেছে এবং এল. টি. আর এবং এন. ভি/এন. ভি-তে তথ্য ব্যবহারের মাধ্যমে প্রমাণিত হয়েছিল। মনে করা হয় যে পুনরাবৃত্তহীন এল. টি. আর-এর উৎপাদন ভাইরাসের একটি অভিযোজন প্রক্রিয়ার প্রতিফলন হতে পারে, যা একটি বহিরাগত থেকে একটি অন্তঃসত্ত্বা জীবনযাত্রায় পরিবর্তিত হতে পারে। 1999 সালে পরিচালিত একটি ক্লিনিকাল ট্রায়াল স্টাডিতে 160 জন রোগীর নমুনা নেওয়া হয়েছিল যাদের বিভিন্ন জীবিত শূকরের টিস্যু দিয়ে চিকিৎসা করা হয়েছিল এবং 97 শতাংশ রোগীর মধ্যে স্থায়ী পি. ই. আর. ভি সংক্রমণের কোনও প্রমাণ পাওয়া যায়নি যাদের জন্য পি. সি. আর-এর জন্য পি. ই. আর. ভি সিকোয়েন্স সম্প্রসারণের জন্য পর্যাপ্ত পরিমাণে ডি. এন. এ উপলব্ধ ছিল। এই গবেষণায় বলা হয়েছে যে পূর্ববর্তী অধ্যয়নগুলি সংক্রমণের প্রকৃত ঘটনা বা সম্পর্কিত ক্লিনিকাল লক্ষণগুলি খুঁজে বের করার জন্য সীমাবদ্ধ। এটি নিবিড়ভাবে পর্যবেক্ষণ করা সম্ভাব্য পরীক্ষাগুলি ব্যবহার করার পরামর্শ দেয়, যা সম্ভাব্য ক্রস-প্রজাতি পিইআরভি সংক্রমণ এবং পিইআরভির তুলনা সম্পর্কে আরও সম্পূর্ণ এবং বিস্তারিত মূল্যায়ন প্রদান করবে। হিউম্যান এন্ডোজেনস রেট্রোভাইরাস হিউম্যান এন্ডোজেনস রেট্রোভাইরাস (এইচইআরভি) মানব জিনোমের একটি উল্লেখযোগ্য অংশ নিয়ে গঠিত, যার মধ্যে প্রায় 98,000 ইআরভি উপাদান এবং টুকরো 5-8% তৈরি করে। 2005 সালে প্রকাশিত একটি গবেষণা অনুসারে, প্রতিলিপি তৈরি করতে সক্ষম কোনও এইচ. ই. আর. ভি সনাক্ত করা যায়নি; সবগুলিই ত্রুটিপূর্ণ বলে মনে হয়েছিল, যার মধ্যে বড় মুছে ফেলা বা বাজে মিউটেশন রয়েছে (এইচ. ই. আর. ভি-কে-এর ক্ষেত্রে সত্য নয়)। এর কারণ হল বেশিরভাগ এইচ. ই. আর. ভি কেবল মূল ভাইরাসের চিহ্ন, যা লক্ষ লক্ষ বছর আগে প্রথম সংহত হয়েছিল। 100, 000 জিনোম প্রকল্পের অংশ হিসাবে এইচ. ই. আর. ভি একীকরণের একটি বিশ্লেষণ চলছে। 2023 সালের একটি গবেষণায় দেখা গেছে যে এইচ. ই. আর. ভি সুপ্ত অবস্থা থেকে জেগে উঠতে পারে এবং বার্ধক্যে অবদান রাখতে পারে যা অ্যান্টিবডিগুলিকে নিরপেক্ষ করে অবরুদ্ধ করা যেতে পারে। হিউম্যান এন্ডোজেনাস রেট্রোভাইরাসগুলি মূলত আবিষ্কৃত হয়েছিল যখন মানুষের জিনোমিক লাইব্রেরিগুলি প্রাণী রেট্রোভাইরাস থেকে প্রোব ব্যবহার করে বা ভাইরাস সিকোয়েন্সের সাথে সাদৃশ্য সহ অলিগোনিউক্লিওটাইড ব্যবহার করে নিম্ন-কঠোর অবস্থার অধীনে পরীক্ষা করা হয়েছিল। এইচ. ই. আর. ভি-গুলির শ্রেণিবিন্যাস প্রাণী রেট্রোভাইরাসগুলির সমতুল্যতার উপর ভিত্তি করে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়। প্রথম শ্রেণীর পরিবারগুলি স্তন্যপায়ী গামারেট্রোভাইরাস (টাইপ সি) এবং ইপসিলোনরেট্রোভাইরাস (টাইপ ই)-এর অনুরূপ। দ্বিতীয় শ্রেণীর পরিবারগুলি স্তন্যপায়ী বেটারেট্রোভাইরাস (টাইপ বি) এবং ডেল্টারেট্রোভাইরাস (টাইপ ডি)-এর সমরূপতা দেখায়। তৃতীয় শ্রেণীর পরিবারগুলি ফেনা ভাইরাসগুলির অনুরূপ। সমস্ত শ্রেণীর জন্য, যদি হোমোলজিগুলি গ্যাগ, পোল এবং এনভি জিনে ভালভাবে সংরক্ষিত দেখা যায়, তবে তাদের একটি সুপারফ্যামিলিতে গোষ্ঠীভুক্ত করা হয়। আরও প্রথম শ্রেণীর পরিবার রয়েছে বলে জানা যায়। একটি বহিরাগত রেট্রোভাইরাস, প্রাইমিং টিআরএনএ (এইচইআরভি-ডাব্লু, এইচইআরভি-কে), বা কিছু প্রতিবেশী জিন (এইচইআরভি-এডিপি), ক্লোন নম্বর (এইচইআরভি-এস 71), বা কিছু অ্যামিনো অ্যাসিড মোটিফ (এইচইআরভি-এফআরডি) এর উপর ভিত্তি করে নামকরণের মিশ্রণ সহ পরিবারগুলি নিজেরাই কম অভিন্ন পদ্ধতিতে নামকরণ করা হয়। একটি প্রস্তাবিত নামকরণের লক্ষ্য কখনও কখনও প্যারাফাইলেটিক মানগুলি পরিষ্কার করা। মানব বিবর্তনের সময় কখনও কখনও, এইচ. ই. আর. ভি-র বহির্জাগতিক প্রজনকরা জীবাণু লাইনের কোষে নিজেদের প্রবেশ করান এবং তারপর পোষকের কোষীয় প্রক্রিয়াগুলি ব্যবহার ও কাজে লাগিয়ে পোষকের জিনের সাথে প্রতিলিপি তৈরি করেন। তাদের স্বতন্ত্র জিনোমিক কাঠামোর কারণে, এইচ. ই. আর. ভিগুলি বহুবার পরিবর্ধন এবং স্থানান্তরের শিকার হয়েছিল, যা রেট্রোভাইরাল ডি. এন. এ-র আরও ব্যাপক বিতরণের দিকে পরিচালিত করে। তা সত্ত্বেও, মানুষ এবং শিম্পাঞ্জির বিচ্যুতির পর থেকে ভাইরাসের একটি পরিবার সক্রিয় রয়েছে। এই পরিবার, যাকে এইচ. ই. আর. ভি-কে (এইচ. এম. এল. 2) বলা হয়, এইচ. ই. আর. ভি উপাদানগুলির 1 শতাংশেরও কম গঠন করে তবে এটি সর্বাধিক অধ্যয়নরতগুলির মধ্যে একটি। এমনকি গত কয়েক লক্ষ বছর ধরে এটি সক্রিয় থাকার ইঙ্গিত রয়েছে, যেমন, কিছু মানুষ অন্যদের তুলনায় এইচ. এম. এল2-এর বেশি অনুলিপি বহন করে। ঐতিহ্যগতভাবে, এইচ. ই. আর. ভি-র বয়সের অনুমান একটি এইচ. ই. আর. ভি-র 5 'এবং 3' এল. টি. আর-এর তুলনা করে করা হয়; তবে, এই পদ্ধতিটি শুধুমাত্র পূর্ণ দৈর্ঘ্যের এইচ. ই. আর. ভি-র জন্য প্রাসঙ্গিক। একটি সাম্প্রতিক পদ্ধতি, যাকে ক্রস-সেকশনাল ডেটিং বলা হয়, এইচইআরভি সন্নিবেশের বয়স অনুমান করতে একক এলটিআর-এর মধ্যে বৈচিত্র্য ব্যবহার করে। এই পদ্ধতিটি এইচ. ই. আর. ভি-র বয়স অনুমান করার ক্ষেত্রে আরও সুনির্দিষ্ট এবং যে কোনও এইচ. ই. আর. ভি সন্নিবেশের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে। ক্রস-সেকশনাল ডেটিং ব্যবহার করে বলা হয়েছে যে, এইচইআরভি-কে (এইচএমএল2)-এর দুই সদস্য, এইচইআরভি-কে106 এবং এইচইআরভি-কে116, গত 800,000 বছরে সক্রিয় ছিল এবং এইচইআরভি-কে106 150,000 বছর আগে আধুনিক মানুষকে সংক্রামিত করতে পারে। তবে, এইচ. ই. আর. ভি-কে (এইচ. এম. এল. 2) পরিবারের পরিচিত সংক্রামক সদস্যদের অনুপস্থিতি এবং প্রকাশিত মানব জিনোম অনুক্রমের মধ্যে সম্পূর্ণ কোডিং সম্ভাবনা সহ উপাদানগুলির অভাব থেকে জানা যায় যে এই পরিবারটি বর্তমানে সক্রিয় হওয়ার সম্ভাবনা কম। 2006 এবং 2007 সালে, ফ্রান্স এবং মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রে স্বাধীনভাবে কাজ করা গবেষকরা এইচইআরভি-কে (এইচএমএল2)-এর কার্যকরী সংস্করণগুলি পুনরায় তৈরি করেছিলেন। এইচ. ই. আর. ভি প্রোটিনের অভিব্যক্তি এইচ. ই. আর. ভি-র একটি জৈবিকভাবে সক্রিয় পরিবার, এইচ. ই. আর. ভি-কে-এর অভিব্যক্তি, প্ল্যাসেন্টায় পাওয়া প্রোটিন তৈরি করে। উপরন্তু, এইচ. ই. আর. ভি-ডব্লিউ (ই. আর. ভি. ডব্লিউ-1) এবং এইচ. ই. আর. ভি-এফ. আর. ডি (ই. আর. ভি. এফ. আর. ডি-1)-এর খামের জিনের অভিব্যক্তি সিনসাইটিন তৈরি করে যা কোষ-কোষ সংমিশ্রণকে প্ররোচিত করে প্ল্যাসেন্টোজেনেসিসের সময় সিনসাইটিয়োট্রোফোব্লাস্ট কোষ স্তর তৈরির জন্য গুরুত্বপূর্ণ। হিউগো জিন নামকরণ কমিটি (এইচ. জি. এন. সি) প্রতিলিপি করা মানব ই. আর. ভি-র জন্য জিন প্রতীক অনুমোদন করে। কার্যকরী প্রভাব MER41.AIM2 একটি এইচইআরভি যা এআইএম2 (মেলানোমা 2-এ অনুপস্থিত)-এর প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ করে যা বিদেশী সাইটোসোলিক ডিএনএর একটি সেন্সরের জন্য এনকোড করে। এটি এ. আই. এম 2-এর জন্য একটি বাঁধাই সাইট হিসাবে কাজ করে, যার অর্থ এটি এ. আই. এম 2-এর প্রতিলিপির জন্য প্রয়োজনীয়। গবেষকরা CRISPR/Cas9 ব্যবহার করে হেলা কোষে MER41.AIM2 মুছে দিয়ে এটি দেখিয়েছেন, যার ফলে পরিবর্তিত হেলা কোষে AIM2-এর একটি সনাক্তযোগ্য প্রতিলিপি স্তর তৈরি হয়েছে। নিয়ন্ত্রণ কোষগুলি, যা এখনও MER41.AIM2 ERV ধারণ করে, স্বাভাবিক পরিমাণে AIM2 প্রতিলিপি সহ পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল। অনাক্রম্যতার ক্ষেত্রে, গবেষকরা এই সিদ্ধান্তে পৌঁছেছেন যে সংক্রমণের প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়ার জন্য MER41.AIM2 প্রয়োজনীয়। বহির্জাগতিক ভাইরাস দ্বারা সক্রিয়তা উল্লেখযোগ্য প্রমাণ ইঙ্গিত দেয় যে এইচ. ই. আর. ভি ভাইরাল সংক্রমণ দ্বারা পুনরায় সক্রিয় হতে পারে, যেমনঃ 1) রেট্রোভাইরাস-হিউম্যান ইমিউনোডেফিসিয়েন্সি ভাইরাস টাইপ-1 (এইচ. আই. ভি-1), হিউম্যান টি-লিম্ফোট্রপিক ভাইরাস 1 (এইচ. টি. এল. ভি-1); 2) আর. এন. এ ভাইরাস-ইনফ্লুয়েঞ্জা এ ভাইরাস, হেপাটাইটিস সি ভাইরাস (এইচ. সি. ভি), সিভিয়র অ্যাকিউট রেসপিরেটরি সিন্ড্রোম করোনভাইরাস-2 (এস. এ. আর. এস. সি. ও. ভি-2); 3) ডি. এন. এ ভাইরাস-হারপিস সিম্প্লেক্স ভাইরাস টাইপ-1 (এইচ. এস. ভি-1), এপস্টাইন-বার ভাইরাস (ই. বি. ভি), হিউম্যান সাইটোমেগালোভাইরাস (সি. এম. ভি আরও গবেষণায় দেখা গেছে যে ট্রান্সঅ্যাকটিভেশন প্রক্রিয়া প্রধান ইবিভি লেট জিন ট্রান্সঅ্যাকটিভেটর, ইবিএনএ-2-এর অভিব্যক্তির উপর নির্ভর করে। গভীর বিশ্লেষণ এইচ. ই. আর. ভি-কে18 সক্রিয়করণের জন্য একটি শক্তিশালী প্রার্থী হিসাবে ই. বি. ভি সুপ্ত ঝিল্লি প্রোটিন এল. এম. পি-2এ-কে চিহ্নিত করার চিত্রটি সম্পন্ন করেছে। এইচ. ই. আর. ভি-কে18-এরও সুপার অ্যান্টিজেন কার্যকলাপ রয়েছে বলে জানা গেছে। পলিক্লোনাল টি এবং বি কোষ সক্রিয়করণ তাদের অ্যান্টিজেন রিসেপ্টর নির্দিষ্টতা নির্বিশেষে)। এটিও দেখানো হয়েছে যে ইবিভি জিপি 350 প্রোটিনের ইন ভিট্রো বাইন্ডিং বি-কোষ, মনোসাইট, ম্যাক্রোফেজ এবং অ্যাস্ট্রোসাইট-কোষগুলিতে এমএসআরভেনভি এবং সিনসাইটিন-1-এর সক্রিয়করণ ঘটায় যা মাল্টিপল স্ক্লেরোসিসের প্যাথোজেনেসিসের সাথে জড়িত। মনোসাইটগুলি, বিশেষত ম্যাক্রোফেজে তাদের পৃথকীকরণের পরে, ই. বি. ভি. জি. পি 350-এর প্রতি সবচেয়ে বেশি প্রতিক্রিয়াশীল বলে মনে হয়েছিল, যা বি <আই. ডি1>-এর তুলনায় এইচ. ই. আর. ভি-ওয়েনভের উচ্চতর মাত্রা প্রকাশ করে, যা অন্য একটি গবেষণার সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ, যা দেখায় যে সংক্রামক মনোনিউক্লিওসিসের সময় ই. বি. ভি অন্যান্য রক্ত কোষের তুলনায় মনোসাইটগুলিতে এইচ. ই. আর. ভি-ডব্লিউ/এম. এস. আর. ভি অভিব্যক্তির সবচেয়ে শক্তিশালী সক্রিয়করণকে উন্নীত করে। লক্ষ লক্ষ বছর ধরে মেরুদণ্ডী প্রাণীর জিনোমে একীভূত হওয়া সত্ত্বেও, ইআরভিগুলি বহির্জাগতিক ভাইরাস এবং পোষক জিনোমের মধ্যে একটি মধ্যবর্তী পর্যায়ের প্রতিনিধিত্ব করে; এটি পরামর্শ দেওয়া হয় যে থাইমাস এবং অস্থি মজ্জায় এইচইআরভি-র এপিজেনেটিক সাইলেন্সিংয়ের কারণে এইচইআরভি-উদ্ভূত প্রোটিন এবং পেপটাইডের প্রতি ইমিউনোলজিকাল সহনশীলতা অসম্পূর্ণ, যা সমস্ত এইচইআরভি-নির্দিষ্ট টি এবং বি কোষ মুছে ফেলা রোধ করে। এর প্রমাণ হিসাবে, ইআরভি-উদ্ভূত অ্যান্টিজেন সহ অ-মানব প্রাইমেটদের টিকাদান শক্তিশালী পলিফাংশানাল সাইটোটক্সিক টি কোষ প্রতিক্রিয়ার পাশাপাশি উচ্চ অ্যান্টিবডি টাইটার্স মাউন্ট করে। ফাইলোজেনেটিক গবেষণা অনুসারে, মানব জিনোমে বিদ্যমান 30টি এইচ. ই. আর. ভি পরিবারের মধ্যে, এইচ. ই. আর. ভি-কে (এইচ. এম. এল-2) উপাদান যা সাম্প্রতিককালে সংহত হয়েছে তা সবচেয়ে অক্ষত এবং জৈবিকভাবে সক্রিয় রূপ। এইচ. ই. আর. ভি-কে. এন. ভি এবং এইচ. ই. আর. ভি-এইচ. এন. ভি, যা টিউমার-সম্পর্কিত অ্যান্টিজেনের একটি নতুন শ্রেণী হিসাবে বিবেচিত হয়, বিভিন্ন ধরনের ক্যান্সারে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে শক্তিশালী সাইটোটক্সিক টি-সেল প্রতিক্রিয়া প্রচার করতে দেখা গেছে। নিউক্লিক অ্যাসিডের সহজাত ইমিউন সেন্সিং-এর একটি স্তরে, এন্ডোজেনস রেট্রোভাইরাস থেকে প্রাপ্ত একক-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ (এসএসআরএনএ) এবং ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড আরএনএ (ডিএসআরএনএ) প্যাটার্ন রিকগনিশন রিসেপ্টর (পিআরআর) দ্বারা স্বীকৃত হয়। এস. এস. আর. এন. এ টোল-সদৃশ রিসেপ্টর টি. এল. আর-7 এবং টি. এল. আর-8 দ্বারা অনুধাবন করা যেতে পারে, যার ফলে উদ্দীপিত ডেনড্রাইটিক কোষ (ডিসি) এবং ম্যাক্রোফেজ দ্বারা আই. এফ. এন-α নিঃসরণ হয়, যা এইচ. আই. ভি-1 থেকে প্রাপ্ত এস. এস. আর. এন. এ-র জন্য পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল। ডিএসআরএনএগুলি সবচেয়ে ইমিউনোজেনিক নিউক্লিক অ্যাসিড প্যাথোজেন-সম্পর্কিত আণবিক নিদর্শনগুলির (পিএএমপি) মধ্যে একটি হতে পারে, কারণ এগুলি স্বাভাবিক অবস্থায় কোষে পাওয়া যায় না। এইচ. ই. আর. ভি-উদ্ভূত ডি. এস. আর. এন. এ টি. এল. আর-3, আর. আই. জি-1 এবং এম. ডি. এ-5 দ্বারা স্বীকৃত হতে পারে; আর. আই. জি-1 এবং এম. ডি. এ-5 একটি টাইপ 1 আই. এফ. এন প্রতিক্রিয়া প্ররোচিত করতে পরিচিত। যখন ডি. এন. এ-তে পুনরায় প্রতিলিপি করা হয়, তখন ইন্টারফেরন জিনের (সি. জি. এ. এস-এস. টি. আই. এন. জি) পথের চক্রাকার জি. এম. পি-এ. এম. পি সিন্থেস-উদ্দীপক দ্বারা রেট্রোভাইরাসগুলি অনুধাবন করা যায়, যার ফলে নিউক্লিয়ার ফ্যাক্টর-কাপ্পা বি (এন. এফ-কে. বি) এবং আই. এফ. এন নিয়ন্ত্রক ফ্যাক্টর 3 (আই. আর. এফ 3) সক্রিয় হয়, যা এক প্রকার আই. এফ. এন প্রতিক্রিয়াকে ট্রিগার করে। ডি. এস. ডি. এন. এ আই. এফ. এন-রেগুলেটরি ফ্যাক্টর (ডি. এ. আই)-এর ডি. এন. এ-নির্ভর সক্রিয়কারী দ্বারাও অনুধাবন করা যেতে পারে; ডি. এন. এঃ আর. এন. এ সংকরগুলি টি. এল. আর-9 দ্বারা শনাক্ত করা যেতে পারে। পি. আর. আর-এর মাধ্যমে নিউক্লিক অ্যাসিডের স্বীকৃতি ভাইরাল সংক্রমণের বিরুদ্ধে লড়াই করার জন্য একটি অত্যন্ত কার্যকর কৌশল প্রদান করে, একই সাথে হোস্টকে স্ব-নিউক্লিক অ্যাসিড সনাক্তকরণ এবং অটোইমিউনিটির প্রচারের সম্ভাবনার কারণে ঝুঁকির মুখে ফেলে। আশ্চর্যের বিষয় নয় যে, এইচ. ই. আর. ভি-গুলি একাধিক স্ক্লেরোসিস, অ্যামায়োট্রফিক ল্যাটেরাল স্ক্লেরোসিস (এ. এল. এস), সিস্টেমিক লুপাস এরিথেমাটোসাস (এস. এল. ই), রিউম্যাথয়েড আর্থ্রাইটিস (আর. এ), সজোগ্রেন সিনড্রোম (এস. এস)-এর মতো বিভিন্ন অটোইমিউন এবং প্রদাহজনক রোগের সঙ্গে যুক্ত বলে দেখা গেছে। প্রোটিন স্তরে, টিএলআর এবং নির্দিষ্ট এইচইআরভি প্রোটিনের মধ্যে একটি সরাসরি মিথস্ক্রিয়া দেখানো হয়েছে। উদাহরণস্বরূপ, এইচ. ই. আর. ভি-ডব্লিউ এন. ভি-এর পৃষ্ঠীয় একক (মাল্টিপল স্ক্লেরোসিস-সম্পর্কিত রেট্রোভাইরাল উপাদান (এম. এস. আর. ভি) এন. ভি নামেও পরিচিত) টি. এল. আর 4 এবং সি. ডি 14-এর সাথে আবদ্ধ হতে দেখা গেছে, যা আই. এল-1 বিটা, আই. এল-6 এবং টি. এন. এফ. এ সহ প্রো-ইনফ্ল্যামেটরি সাইটোকাইনের উৎপাদনকে উদ্দীপিত করে। এইচ. ই. আর. ভি-ডব্লিউ এন. ভি মানুষের ডেনড্রাইটিক কোষে একটি পরিপক্কতা প্রক্রিয়া শুরু করতে পারে, যা তাদের টি. এইচ-1-এর মতো টি. এইচ কোষের পার্থক্যকে সমর্থন করার ক্ষমতা প্রদান করে। ইমিউনোলজিক্যাল গবেষণায় এইচ. আই. ভি সংক্রমিত ব্যক্তিদের মধ্যে এইচ. ই. আর. ভি-র বিরুদ্ধে টি কোষের ইমিউন প্রতিক্রিয়ার কিছু প্রমাণ পাওয়া গেছে। এই অনুমান যে এইচআইভি এইচআইভি-সংক্রমিত কোষে এইচইআরভি অভিব্যক্তি প্ররোচিত করে, এই প্রস্তাবের দিকে পরিচালিত করে যে এইচইআরভি অ্যান্টিজেনগুলিকে লক্ষ্য করে একটি টিকা বিশেষভাবে এইচআইভি-সংক্রমিত কোষগুলিকে নির্মূল করতে পারে। এই অভিনব পদ্ধতির সম্ভাব্য সুবিধা হল, এইচ. আই. ভি-সংক্রমিত কোষের সারোগেট চিহ্নিতকারী হিসাবে এইচ. ই. আর. ভি অ্যান্টিজেন ব্যবহার করে, এটি কুখ্যাত বৈচিত্র্যময় এবং দ্রুত পরিবর্তিত এইচ. আই. ভি অ্যান্টিজেনগুলিকে সরাসরি লক্ষ্য করার অন্তর্নিহিত অসুবিধাকে এড়াতে পারে। ই. আর. ভি-র সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং-এর বৈশিষ্ট্য নির্ধারণের কৌশল উদাহরণস্বরূপঃ চীনা বংশোদ্ভূত একটি পোরসিন ই. আর. ভি (পি. ই. আর. ভি) মিনিপিগ আইসোলেট, পি. ই. আর. ভি-এ-বি. এম-এর জিনগত বৈচিত্র্য এবং বিবর্তন বোঝার জন্য বিভিন্ন প্রজাতি এবং কোষের লাইনগুলির সাথে সম্পূর্ণরূপে সিকোয়েন্স করা হয়েছিল। নিউক্লিওটাইড প্রতিস্থাপনের পর্যবেক্ষিত সংখ্যা এবং বিভিন্ন জিনোম সিকোয়েন্সের মধ্যে গবেষকদের একটি আনুমানিক বয়স নির্ধারণ করতে সহায়তা করেছিল যে পিইআরভি-এ-বিএম তার হোস্ট জিনোমে একীভূত হয়েছিল, যা ইউরোপীয় বংশোদ্ভূত শূকরের বিচ্ছিন্ন হওয়ার আগে বিবর্তনীয় বয়সের বলে মনে করা হয়েছিল। ক্রোমাটিন ইমিউনোপ্রিসিপিটেশন উইথ সিকোয়েন্সিং (চি. আই. পি-এস. ই. কিউ) এই কৌশলটি ডি. এন. এ প্রোটিন এবং দমনকৃত অঞ্চল এবং ট্রাইমিথাইলেশনের জন্য বাইন্ডিং সাইটগুলি প্রবর্তক এবং বর্ধকদের নির্দেশক হিস্টোন চিহ্নগুলি খুঁজে বের করতে ব্যবহৃত হয়। ডি. এন. এ মিথাইলেশন ইঁদুরের দৈহিক কোষে ই. আর. ভি-র নীরবতা বজায় রাখার জন্য অত্যাবশ্যক বলে প্রমাণিত হয়েছে, অন্যদিকে হিস্টোন চিহ্নগুলি ভ্রূণের স্টেম সেল (ই. এস. সি) এবং প্রাথমিক ভ্রূণজনন ক্ষেত্রে একই উদ্দেশ্যে অত্যাবশ্যক। যেহেতু বেশিরভাগ এইচ. ই. আর. ভি-র কোনও কার্যকারিতা নেই, নির্বাচিতভাবে নিরপেক্ষ এবং প্রাইমেট জিনোমে প্রচুর পরিমাণে রয়েছে, তাই এগুলি সহজেই সংযোগ বিশ্লেষণের জন্য ফাইলোজেনেটিক চিহ্নিতকারী হিসাবে কাজ করে। ইন্টিগ্রেশন সাইট পলিমরফিজম বা অর্থোলগের বিবর্তিত, প্রোভাইরাল, নিউক্লিওটাইড ক্রমের তুলনা করে এগুলি কাজে লাগানো যেতে পারে। সংহতকরণ কখন ঘটেছিল তা অনুমান করার জন্য, গবেষকরা প্রতিটি নির্দিষ্ট স্থানে আণবিক বিবর্তনের হার খুঁজে বের করতে প্রতিটি ফাইলোজেনেটিক গাছ থেকে দূরত্ব ব্যবহার করেছিলেন। এটিও দরকারী যে ইআরভিগুলি অনেক প্রজাতির জিনোমে সমৃদ্ধ (অর্থাৎ। উদ্ভিদ, পোকামাকড়, মোলাস্ক, মাছ, ইঁদুর, গৃহপালিত পোষা প্রাণী এবং গবাদি পশু) কারণ এর প্রয়োগ বিভিন্ন ফাইলোজেনেটিক প্রশ্নের উত্তর দিতে ব্যবহার করা যেতে পারে। প্রোভাইরাসের বয়স এবং প্রজাতি পৃথকীকরণের ঘটনাগুলির সময় বিন্দু নির্ধারণ করা এটি বিভিন্ন বিবর্তনীয় সময়কাল থেকে বিভিন্ন এইচ. ই. আর. ভি-র তুলনা করে সম্পন্ন করা হয়। উদাহরণস্বরূপ, এই গবেষণাটি বিভিন্ন হোমিনয়েডের জন্য করা হয়েছিল, যা মানুষ থেকে বানর এবং বানর পর্যন্ত ছিল। উপস্থিত বিশাল বৈচিত্র্যের কারণে পি. ই. আর. ভি-র ক্ষেত্রে এটি করা কঠিন। আরও গবেষণা এপিজেনেটিক পরিবর্তনশীলতা গবেষকরা এপিজেনেটিক রিলিজের মাধ্যমে সুপ্ত ট্রান্সপোজেবল উপাদানগুলির পুনরায় সক্রিয়করণ এবং মানব রোগের সাথে তাদের সম্ভাব্য সম্পর্ক এবং জিন নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলির সুনির্দিষ্ট বিষয়গুলি অন্বেষণ করার জন্য পৃথক এপিজেনোম এবং ট্রান্সক্রিপ্টোমগুলি বিশ্লেষণ করতে পারেন। জেনোট্রান্সপ্লান্টেশনের ইমিউনোলজিক্যাল সমস্যাগুলি হাইপারএক্যুট রিজেকশন (এইচ. এ. আর) কাটিয়ে ওঠার একটি কার্যকর উপায় সম্পর্কে সামান্যই জানা যায়, যা দাতা এপিথেলিয়ামে গ্যালাক্টোসিল-আলফা1-3গ্যালাটোসিল (আলফা-গ্যাল) অ্যান্টিজেনগুলি সনাক্তকারী জেনোরেক্টিভ অ্যান্টিবডি দ্বারা শুরু করা পরিপূরক সক্রিয়করণ অনুসরণ করে। জিন থেরাপিতে এইচ. ই. আর. ভি-র ঝুঁকির কারণগুলি যেহেতু রেট্রোভাইরাসগুলি একে অপরের সাথে এবং অন্যান্য অন্তঃসত্ত্বা ডি. এন. এ সিকোয়েন্সের সাথে পুনরায় মিলিত হতে সক্ষম, তাই জিন থেরাপির জন্য এইচ. ই. আর. ভি-র সম্ভাব্য ঝুঁকিগুলি অন্বেষণ করা উপকারী হবে, যদি থাকে। এছাড়াও, রেট্রোভাইরাল ভেক্টরগুলিতে এইচ. ই. আর. ভি সিকোয়েন্সগুলি অন্তর্ভুক্ত করে সাইট-নির্দেশিত ইন্টিগ্রেশনের জন্য এইচ. ই. আর. ভি-র পুনরায় একত্রিত হওয়ার এই ক্ষমতাকে পরিচালনা করা যেতে পারে। এইচ. ই. আর. ভি জিন অভিব্যক্তি গবেষকরা বিশ্বাস করেন যে এইচ. ই. আর. ভি জিন দ্বারা এনকোড করা আর. এন. এ এবং প্রোটিনগুলি কোষের শারীরবৃত্তীয় এবং প্যাথোলজিকাল পরিস্থিতিতে অনুমানমূলক কার্যকারিতার জন্য অনুসন্ধান করা চালিয়ে যাওয়া উচিত। সংশ্লেষিত প্রোটিনের জৈবিক তাৎপর্য আরও গভীরভাবে সংজ্ঞায়িত করার জন্য এটি পরীক্ষা করা যুক্তিসঙ্গত হবে। আরও দেখুন এভিয়ান সারকোমা লিউকোসিস ভাইরাস (এ. এস. এল. ভি) অন্তঃসত্ত্বা ভাইরাল উপাদান এন্ডোজেনি (জীববিজ্ঞান) ই. আর. ভি. 3 এইচ. ই. আর. ভি-এফ. আর. ডি অনুভূমিক জিন স্থানান্তর জাগসিয়েক্টে ভেড়া রেট্রোভাইরাস (জে. এস. আর. ভি) কোয়াল রেট্রোভাইরাস (কে. ও. আর. ভি) মাউস ম্যামারি টিউমার ভাইরাস (এম. এম. টি. ভি) মুরিন লিউকেমিয়া ভাইরাস (এম. এল. ভি) এবং জেনোট্রপিক মুরিন লিউকেমিয়া ভাইরাস-সম্পর্কিত ভাইরাস (এক্স. এম. আর. ভি) প্যালিওভাইরোলজি রেফারেন্স আরও পড়ার বাহ্যিক লিঙ্ক এইচ. ই. আর. ভি. ডি-হিউম্যান এন্ডোজেনাস রেট্রোভাইরাস ডাটাবেস আণবিক জীববিজ্ঞান সোয়াইন রোগ নন-কোডিং ডি. এন. এ