Multi-Omics Profiling Expression Database
মাল্টি-ওমিক্স প্রোফাইলিং এক্সপ্রেশন ডেটাবেস (এমওপিইডি) একটি প্রসারিত মাল্টি-ওমিক্স সম্পদ যা মডেল জীব এবং মানুষের উপর সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ গবেষণা থেকে ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্স এবং প্রোটিওমিক্স তথ্যের দ্রুত ব্রাউজিংকে সমর্থন করে। আজ অবধি (2021) এটি কার্যক্রম বন্ধ করে দিয়েছে এবং অনলাইনে অগ্রহণযোগ্য। সিস্টেমেটিক প্রোটিন ইনভেস্টিগেটিভ রিসার্চ এনভায়রনমেন্ট এমওপিইডি বৃহত্তর গবেষণা সম্প্রদায়ের জন্য তথ্যের তুলনা এবং ভাগ করে নেওয়ার সহজতর করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। এমওপিইডি অনন্যভাবে প্রোটিন স্তরের পরম এবং আপেক্ষিক অভিব্যক্তি তথ্য, মেটা-বিশ্লেষণ ক্ষমতা এবং পরিমাণগত তথ্য সরবরাহ করতে প্রমিত বিশ্লেষণ পাইপলাইন স্পায়ার নিয়োগ করে। জিন এক্সপ্রেশন অমনিবাস (জি. ই. ও) থেকে প্রক্রিয়াজাত আপেক্ষিক অভিব্যক্তি প্রতিলিপি সংক্রান্ত তথ্য পাওয়া গেছে। নির্দিষ্ট প্রোটিন এবং জিনের জন্য তথ্য অনুসন্ধান করা যেতে পারে, জীব, টিস্যু, স্থানীয়করণ এবং অবস্থার উপর ভিত্তি করে ব্রাউজ করা যেতে পারে এবং মিথ্যা আবিষ্কারের হার এবং অভিব্যক্তি দ্বারা সাজানো যেতে পারে। এমওপিইডি ব্যবহারকারীদের তাদের নিজস্ব অভিব্যক্তি ডেটা কল্পনা করতে এবং বিদ্যমান গবেষণার সাথে তুলনা করার ক্ষমতা দেয়। এছাড়াও, এমওপিইডি জিনকার্ড, প্যান্থার, এন্ট্রেজ, ইউনিপ্রোট, কেইজিজি, সিড এবং রিঅ্যাক্টম সহ বিভিন্ন প্রোটিন এবং পাথওয়ে ডেটা-বেসের সঙ্গে সংযোগ স্থাপন করে। প্রোটিন এবং জিন শনাক্তকারীগুলি জিনকার্ডস (এমওপিইডি-র সাথে ক্রস-রেফারেন্সযুক্ত), জেনব্যাঙ্ক, রেফসেক, ইউনিপ্রোট, ওয়ার্মবেস এবং স্যাকারোমাইসেস জিনোম ডাটাবেস (এসজিডি) থেকে সংহত করা হয়। এমওপিইডি-র বর্তমান সংস্করণে (এমওপিইডি 2.5,2014) প্রায় 5 মিলিয়ন মোট রেকর্ড রয়েছে যার মধ্যে ~ 260টি পরীক্ষা এবং ~ 390টি শর্ত রয়েছে। এমওপিইডি সিয়াটল চিলড্রেনস রিসার্চ ইনস্টিটিউটের কোলকার দল দ্বারা বিকশিত এবং সমর্থিত। মডেল অর্গানিজম প্রোটিন এক্সপ্রেশন ডেটাবেস এম. ও. পি. ই. ডি এর নাম পরিবর্তন করে মাল্টি-অমিকস প্রোফাইলিং এক্সপ্রেশন ডেটাবেস করার আগে মডেল অর্গানিজম প্রোটিন এক্সপ্রেশন ডেটাবেস নামে পরিচিত ছিল। তথ্যসূত্র আরও পড়া জৈবিক তথ্যভাণ্ডার প্রোটিওমিক্স ওমিক্স