SOS chromotest
এস. ও. এস ক্রোমোটেস্ট হল রাসায়নিক যৌগগুলির জিনোটক্সিক সম্ভাব্যতা মূল্যায়নের জন্য একটি জৈবিক পরীক্ষা। পরীক্ষাটি একটি কালারিমেট্রিক পরীক্ষা যা β-গ্যালাক্টোসিডেসের জন্য কাঠামোগত জিনের সাথে সংমিশ্রণের মাধ্যমে এসচেরিচিয়া কোলিতে জিনোটক্সিক এজেন্ট দ্বারা প্ররোচিত জিনের অভিব্যক্তি পরিমাপ করে। পরীক্ষার নমুনাগুলির ক্রমবর্ধমান ঘনত্ব সহ একটি 96-কূপের মাইক্রোপ্লেটের কলামে কয়েক ঘন্টা ধরে পরীক্ষাটি করা হয়। এই পরীক্ষাটি জিনোটক্সিসিটির জন্য ঐতিহ্যবাহী অ্যামেস পরীক্ষার একটি ব্যবহারিক পরিপূরক বা বিকল্প হিসাবে তৈরি করা হয়েছিল, যার মধ্যে আগর প্লেটে ক্রমবর্ধমান ব্যাকটেরিয়া এবং সম্ভাব্য মিউটেজেনিক যৌগ বা নমুনার সংস্পর্শে আসা ব্যাকটেরিয়ার মিউটেশনের হারের সাথে প্রাকৃতিক মিউটেশনের হারের তুলনা জড়িত। এস. ও. এস ক্রোমোটেস্ট সঠিকতা এবং সংবেদনশীলতার ক্ষেত্রে আমেস পরীক্ষার মতো প্রতিষ্ঠিত পদ্ধতির সাথে তুলনীয় এবং এটি জিনোটক্সিক যৌগগুলি পরীক্ষা করার জন্য একটি দরকারী সরঞ্জাম, যা মানুষের মধ্যে কার্সিনোজেনিক প্রমাণিত হতে পারে, যাতে আরও গভীর বিশ্লেষণের জন্য রাসায়নিকগুলি পৃথক করা যায়। অন্যান্য ব্যাকটেরিয়াল জেন্টক্সিসিটি এবং মিউটেজেনিসিটি অ্যাসেসের মতো, ক্রিয়াকলাপের জন্য বিপাকীয় সক্রিয়করণের প্রয়োজন এমন যৌগগুলি এস 9 মাইক্রোসোমাল ইঁদুরের লিভার নির্যাস যোগ করে তদন্ত করা যেতে পারে। প্রক্রিয়া এস. ও. এস প্রতিক্রিয়া জিনোটক্সিক যৌগগুলির প্রতি ই. কোলাই-এর প্রতিক্রিয়ায় একটি কেন্দ্রীয় ভূমিকা পালন করে কারণ এটি রাসায়নিক এজেন্টগুলির বিস্তৃত বিন্যাসে সাড়া দেয়। এই সিস্টেমের ট্রিগারিং ডিএনএ ক্ষতির প্রাথমিক লক্ষণ হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে এবং করা হয়েছে। এস. ও. এস প্রতিক্রিয়ায় দুটি জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করেঃ লেক্সএ সিস্টেমের সমস্ত জিনের জন্য একটি দমনকারীকে এনকোড করে এবং রিকএ একটি এস. ও. এস প্ররোচিত সংকেত দ্বারা সক্রিয় হওয়ার পরে লেক্সএ দমনকারীকে বিভক্ত করতে সক্ষম একটি প্রোটিনকে এনকোড করে (এই ক্ষেত্রে একটি জিনোটক্সিক যৌগের উপস্থিতি দ্বারা সৃষ্ট)। যদিও এস. ও. এস প্রতিক্রিয়ার সঠিক প্রক্রিয়াটি এখনও অজানা, ডি. এন. এ ক্ষতগুলি যখন ডি. এন. এ প্রতিলিপিতে ব্যাঘাত ঘটায় বা বন্ধ করে দেয় তখন এটি প্ররোচিত হয়। । বিভিন্ন শেষ বিন্দু হল এস. ও. এস সিস্টেমের ট্রিগারের সম্ভাব্য সূচক; আর. সি. এ প্রোটিনের সক্রিয়করণ, লেক্স এ রিপ্রেসারের বিভাজন, যে কোনও এস. ও. এস জিনের অভিব্যক্তি ইত্যাদি। সবচেয়ে সহজ মূল্যায়নগুলির মধ্যে একটি হল ল্যাকজেডের সাথে সংমিশ্রণের মাধ্যমে একটি এস. ও. এস জিনের অভিব্যক্তি পর্যবেক্ষণ করা, যা ই. কোলাই β-গ্যালাক্টোসিডেসের কাঠামোগত জিন। পদ্ধতি এস. ও. এস ক্রোমোটেস্ট পরীক্ষার জন্য রাসায়নিকের ক্রমবর্ধমান ঘনত্বের সাথে ই. কোলিকে ইনকিউবেট করে। প্রোটিন সংশ্লেষণের জন্য সময় দেওয়ার পরে, β-গ্যালাক্টোসিডেস ক্রিয়াকলাপ একটি সাধারণ কালারিমেট্রিক অ্যাসে ব্যবহার করে মূল্যায়ন করা হয়। একটি ল্যাকটোজ এনালগ অন্তর্ভুক্ত করে যা অবক্ষয়ের পরে একটি রঙিন যৌগ উৎপন্ন করে, রঙের একটি সহজেই পর্যবেক্ষণযোগ্য বা পরিমাণগত পরিবর্তন মেট্রিক হিসাবে ব্যবহৃত হয়। যেহেতু রাসায়নিক পরীক্ষা উচ্চ ঘনত্বে প্রোটিন সংশ্লেষণকে বাধা দিতে পারে, যা বি-গ্যালাক্টোসিডেস আনয়নকে অবমূল্যায়ন করতে পারে, তাই ক্ষারীয় ফসফেটেজকে β-গ্যালাক্টোসিডেসের সাথে একযোগে পরীক্ষা করা হয় যাতে কোষের বেঁচে থাকার জন্য তথ্য পরিমাপ করা যায়। পরীক্ষাটি সহজেই কয়েক ঘন্টার মধ্যে সম্পন্ন করা যেতে পারে। যদি মাইক্রো-প্লেট রিডার ব্যবহার করা হয়, তবে পরীক্ষাটি পরিমাণগত এবং ডোজ-প্রতিক্রিয়া বক্ররেখার একটি প্রাথমিক রৈখিক অঞ্চল থাকে। এই রৈখিক অঞ্চলের ঢাল প্রতিটি যৌগের একটি একক পরামিতি, এস. ও. এস-প্ররোচিত ক্ষমতা (এস. ও. এস. আই. পি)-এর সাথে দ্ব্যর্থহীন সংযোগের অনুমতি দেয়, যা যৌগের প্ররোচিত কার্যকলাপকে প্রতিফলিত করে। এই পরীক্ষাটি স্ক্রিনিংয়ের উদ্দেশ্যে গুণগত (রঙের গ্রেডিয়েন্টের দৃশ্যমান পর্যবেক্ষণ) বা সাধারণভাবে গৃহীত মেট্রিকগুলির গণনার জন্য পরিমাণগত পরিমাপ (স্পেকট্রোফোটোমেট্রি) উভয়ই সরবরাহ করে। পরিমাণগত পরীক্ষায়, একটি যৌগের ডোজ-প্রতিক্রিয়া (বিটা-গ্যালাক্টোসিডেস উৎপাদনের সাথে যুক্ত রঙ উৎপাদন) প্লট করা হয়, প্রাথমিক রৈখিক অঞ্চলের ঢাল সহ সর্বজনীন পরামিতি হিসাবে ব্যবহৃত হয়, এস. ও. এস-প্ররোচিত ক্ষমতা (এস. ও. এস. আই. পি), যা এস. ও. এস প্রতিক্রিয়া প্ররোচিত করার জন্য একটি যৌগের ক্ষমতাকে প্রতিফলিত করে (বিটা-গ্যালাক্টোসিডেস উৎপাদন এবং ল্যাকটোজ অ্যানালগের ভাঙ্গনের মাধ্যমে পরোক্ষভাবে পরিমাপ করা হয়)। সাধারণত, ল্যাকটোজ অ্যানালগ হল এক্স-গ্যাল, যা বিটা-গ্যালাক্টোসিডেস দ্বারা বিভক্ত হলে একটি নীল রঙ তৈরি করে। ডোজ প্রতিক্রিয়া কোষের বেঁচে থাকার দ্বারাও পরিমাপ করা হয়, ক্ষারীয় ফসফেটেসের (যা একটি হলুদ রঙ তৈরি করে) ভাঙ্গনের মাধ্যমে পরিমাপ করা হয়, যা এস. ও. এস. আই. পি গণনার অনুমতি দেয়। যদিও এস. ও. এস. আই. পি একটি ঘনত্ব-ভিত্তিক মেট্রিক, একই পদ্ধতি জটিল পরিবেশগত মিশ্রণের জন্য ব্যবহার করা যেতে পারে যেখানে ঘনত্ব বা এমনকি আগ্রহের যৌগগুলি অজানা। মধ্যবর্তী এস. ও. এস-ইনডাকশন ফ্যাক্টর (এস. ও. এস. আই. এফ) গণনার মাধ্যমে, যা আগে থেকে নমুনাগুলির বিশ্লেষণাত্মক পরিমাপ ছাড়াই ডোজ-প্রতিক্রিয়ার একটি চিত্র দেওয়ার জন্য একই পদ্ধতিতে দুর্বলকরণের বিরুদ্ধে প্লট করা যেতে পারে। এস. ও. এস ক্রোমোটেস্টকে জিনোটক্সিসিটির জন্য সবচেয়ে সহজ এবং দ্রুত স্বল্পমেয়াদী পরীক্ষা হিসাবে বিবেচনা করা হয়। এটি বেশ কয়েকটি কারণে ঐতিহ্যবাহী অ্যামেস পরীক্ষার একটি দরকারী এবং সাশ্রয়ী পরিপূরক হিসাবে কাজ করে। প্রথমত, এর সরলতা এবং দ্রুততার কারণে, এস. ও. এস ক্রোমোটেস্টকে বিপুল সংখ্যক সম্ভাব্য জিনোটক্সিক যৌগের স্ক্রিনিং পরীক্ষা হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে। দ্বিতীয়ত, এটি জিনোটক্সিক রাসায়নিকগুলি সনাক্ত করার অনুমতি দিতে পারে যা অ্যামেস পরীক্ষায় মিথ্যা নেতিবাচক ফলাফল দেয় (যেমন এস্ট্র্যাডিওল, ক্রমবর্ধমান উদ্বেগের একটি যৌগ)। তৃতীয়ত, এটি অ্যামেস পরীক্ষায় মিথ্যা ইতিবাচক ফলাফলের মধ্যে বৈষম্য করার একটি কার্যকর পদ্ধতি হিসাবে প্রমাণিত হতে পারে। তথ্যসূত্র জৈবিক কৌশল এবং সরঞ্জাম জেনেটিক্স পরীক্ষা