FAM83A
প্রোটিন এফএএম83এ (ক্রম সাদৃশ্য 83 সহ পরিবারের সদস্য) যা টিউমার অ্যান্টিজেন বিজে-টিএসএ-9 নামেও পরিচিত, এমন একটি প্রোটিন যা মানুষের মধ্যে এফএএম83এ জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। এই প্রোটিনে অজানা ফাংশন 1669 (ডিইউএফ1669)-এর একটি ডোমেন থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে, যা এই প্রোটিনকে পিএলডিসি _ সুপারফ্যামিলিতে স্থাপন করে। এটি ফুসফুস, প্রস্টেট এবং মূত্রাশয়ের ক্যান্সারে একটি সম্ভাব্য বায়োমার্কার হিসাবে যুক্ত করা হয়েছে। জিন এফএএম83এ ক্রোমোজোম 8, লোকাস q24.13-এ অবস্থিত এবং 27,566 বেস জোড়ায় বিস্তৃত। জেনোম্যাটিক্সের টুল এলডোরাডো দ্বারা পূর্বাভাস অনুযায়ী উজানে প্রায় 4,000 বেস জোড়া রয়েছে। এফএএম83এ জিন সহ ক্রোমোজোমের এই অংশে মুছে ফেলার ফলে প্রায়শই ল্যাঙ্গার-গিডিওন সিনড্রোম হয়। এম. আর. এন. এ এফ. এ. এম83এ এম. আর. এন. এ-র 10টি ভিন্ন ভিন্ন স্প্লাইস ফর্ম রয়েছে, যার প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1 এই নিবন্ধের বিষয়। এই এমআরএনএ প্রায় 2,900 বেস জোড়া নিয়ে গঠিত। এটিতে অজানা ফাংশন 1669 (ডিইউএফ1669)-এর একটি ডোমেন রয়েছে এবং এটি পিএলডিসি _ এসএফ সুপারফ্যামিলির সদস্য। এটি এফএএম83এ এবং অন্যান্য এন-টার্মিনাস ফসফোলিপেজ ডি-সদৃশ ডোমেনের মধ্যে অত্যন্ত অনুরূপ ক্রমের উপর ভিত্তি করে এই সুপারফ্যামিলিতে স্থাপন করা হয়েছে; তবে, এটি কার্যকরী হিস্টিডিনের অনুপস্থিত এবং তাই শুধুমাত্র একটি অনুরূপ কাঠামো থাকার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। চারটি এক্সন এই এমআরএনএ নিয়ে গঠিত। ভবিষ্যদ্বাণীগুলি এম. আর. এন. এ-র অনুবাদহীন অঞ্চলে বেশ কয়েকটি সম্ভাব্য আর. এন. এ স্টেম লুপ গঠন দেখায়। প্রোটিন এফ. এ. এম83এ জিন এফ. এ. এম83এ প্রোটিন আইসোফর্ম এ-এর জন্য এনকোড করে। এই প্রোটিনটির দৈর্ঘ্য 434 অ্যামিনো অ্যাসিড এবং ওজন প্রায় 45 কিলো ডাল্টন। যদিও কাঠামোটি নিশ্চিত করা হয়নি, জিওআর4 ব্যবহার করে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে যে চারটি আলফা হেলিসেস এবং পাঁচটি বিটা শীট রয়েছে, যার একটি আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট 8.964 সহ কোনও সংকেত পেপটাইড নেই বলে মনে হয় এবং এটি একটি ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন নয়। সিবিএলএএসটি ব্যবহার করে, এটি 3এইচ0জি প্রোটিনের সাথে একটি সাধারণ ক্রম ভাগ করে নিতে দেখা গেছে, তবে, এফএএম83এ-এর পূর্বাভাসকৃত কার্যকরী অঞ্চলে নয়। এটি এখনও এই প্রোটিনের সম্ভাব্য আংশিক কাঠামো সম্পর্কে মূল্যবান তথ্য প্রদান করতে পারে। অভিব্যক্তি FAM83A মানব দেহের বিভিন্ন ক্ষেত্রে এবং খুব ভিন্ন স্তরে প্রকাশ করা হয়। ই. এস. টি-র তথ্য থেকে জানা যায় যে এই জিনটি প্রাথমিকভাবে প্রাপ্তবয়স্কদের মধ্যে প্রকাশিত হয়। এটি মুখ এবং স্বরযন্ত্রের উল্লেখযোগ্য মাত্রা দেখায়, প্রস্টেট, ফুসফুস এবং অন্ননালীতে অন্যান্য উত্থিত অভিব্যক্তি সহ। মাথা এবং ঘাড়ের টিউমার, ফুসফুসের টিউমার, প্রস্টেট ক্যান্সার এবং মূত্রাশয়ের কার্সিনোমাতে এই স্বাভাবিক মাত্রা আরও বেশি হয়। মাইক্রো অ্যারে এক্সপ্রেশন ডেটা বিভিন্ন পরিবেশগত পরিস্থিতিও দেখায়, বিশেষ করে উত্তেজক। এই ধরনের উত্তেজক সিগারেটের ধোঁয়া হতে পারে, যেখানে 24 ঘন্টা এক্সপোজারের পরে এফ. এ. এম83এ এক্সপ্রেশন বৃদ্ধি করতে দেখা গেছে, এবং শ্বাসনালীর এপিথেলিয়াল কোষে বাড়ির ধুলো মাইট এক্সট্র্যাক্ট, যেখানে এক্সপোজারের পরে এফ. এ. এম83এ এক্সপ্রেশনও বৃদ্ধি পায়। ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর 2 (এটিএফ 2) সক্রিয় করার সময় এফএএম83এ হ্রাসপ্রাপ্ত অভিব্যক্তি দেখায়। যেহেতু এটিএফ2-এর প্রবর্তক অঞ্চলে আবদ্ধ হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়নি, তাই এটি ইঙ্গিত দেয় যে এফএএম83এ এবং এটিএফ2-এর মধ্যে একটি পরোক্ষ সম্পর্ক রয়েছে। এটিএফ2-এর সাথে পরোক্ষ সম্পর্কের পাশাপাশি উত্তেজক এবং অ্যালার্জেনের বর্ধিত অভিব্যক্তির সাথে, এটি পরামর্শ দেয় যে এফএএম83এ একটি সংকেত পথে থাকতে পারে। একাধিক গবেষণা রয়েছে যা ফুসফুস, প্রস্টেট এবং মূত্রাশয়ের ক্যান্সারের সাথে এফ. এ. এম83এ-এর অতিরিক্ত অভিব্যক্তিকে যুক্ত করে। গবেষকরা বিশ্বাস করেন যে এই জিনটি এই ক্যান্সারগুলি, বিশেষত ফুসফুসের ক্যান্সারের প্রাথমিক সনাক্তকরণের জন্য একটি ভাল প্রার্থী হতে পারে। এটি অজানা যে কেন বা কীভাবে এফ. এ. এম83এ নিয়ন্ত্রিত হয়। গবেষণায় দেখা গেছে যে আর্সেনিক নিয়ন্ত্রককে অ্যাসিটিলেট করতে পারে যার ফলে নিয়ন্ত্রণ বৃদ্ধি পায়, যা পরামর্শ দেয় যে এই জিনটি কীভাবে ক্যান্সারে অনিয়ন্ত্রিত হয়ে যায় তার অনুরূপ প্রক্রিয়া হতে পারে। প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া এফএএম83এ স্ট্রিং টুলের মাধ্যমে তালু, ফুসফুস এবং অনুনাসিক এপিথেলিয়াম কার্সিনোমা সম্পর্কিত প্রোটিন (পিএলইউএনসি)-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে দেখা গেছে। সংগৃহীত এই তথ্য ক্যান্সারের সাথে সম্পর্কিত টেক্সট মাইনিং তথ্য থেকে এসেছে। হোমোলজি এফএএম83এ একটি তুলনামূলকভাবে নতুন জিন বলে মনে হয়, যেখানে ব্লাস্ট এবং ব্ল্যাট শুধুমাত্র হাড়ের মাছের মাধ্যমে অর্থোলজি দেখায়। এটি তার আত্মীয়দের মাধ্যমে অত্যন্ত সংরক্ষিত DUF1669 ডোমেনটি প্রোটিনের সর্বাধিক সংরক্ষিত অঞ্চল, এর বাইরের অঞ্চলগুলি আরও পরিবর্তনশীল। নীচে অর্থোলগের একটি টেবিল রয়েছে, যা উল্লেখ করে যে এটি একটি বিস্তৃত তালিকা নয়ঃ রেফারেন্স