METTL26
METTL26, পূর্বে মনোনীত C16orf13, মিথাইলট্রান্সফেরেজ লাইক 26-এর জন্য একটি প্রোটিন-কোডিং জিন, যা JFP2 নামেও পরিচিত। যদিও এই জিনের কার্যকারিতা অজানা, বিভিন্ন তথ্য প্রকাশ করেছে যে এটি বিভিন্ন ক্যান্সারযুক্ত টিস্যুতে উচ্চ মাত্রায় প্রকাশিত হয়। এই জিনের অপ্রকাশকেও মানুষের মধ্যে রোগের পরিণতির সঙ্গে যুক্ত করা হয়েছে। জিন এম. ই. টি. টি. এল. 26 মানুষের মধ্যে ক্রোমোজোম 16-এর ছোট বাহুতে, ত্রয়োদশ উন্মুক্ত পঠন ফ্রেমে অবস্থিত। এই জিনের পাঁচটি প্রতিলিপি রূপ রয়েছে, যার নাম 1,2,3,4 এবং 7। দীর্ঘতম সি. ডি. এন. এ প্রতিলিপিতে (প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1) 854টি বেস জোড়া রয়েছে। এই প্রতিলিপিটি ছয়টি এক্সন নিয়ে গঠিত, যার সবকটিই প্রোটিনের অন্তর্ভুক্ত প্রধান সুপারফ্যামিলিতে অবদান রাখে, মিথাইলট্রান্সফেরেজ সুপারফ্যামিলিতে। এই জিনের প্রাথমিক প্রতিলিপি 1,919 বেস জোড়া দীর্ঘ। প্রজাতির বন্টন ডটলেট প্রোগ্রাম ব্যবহার করে, মানব জিনের সাথে তার চিম্পাঞ্জি অর্থোলগের তুলনা করে একটি বিন্দু প্লট তৈরি করা হয়েছিল। প্লটটি জিনের শুরুতে এবং শেষে ক্রম সংরক্ষণের ইঙ্গিত দেয়, যা 5 'এবং 3' অনুবাদহীন অঞ্চলে সংরক্ষণ এবং সাদৃশ্যের পরামর্শ দেয়। 5 'ইউটিআর এবং 3' ইউটিআর-এর মধ্যে এই ক্রমের সাদৃশ্য অতীতের স্তন্যপায়ী প্রজাতির মধ্যে প্রসারিত হয় না এবং জেনোপাস ট্রপিকালিসের মতো দূরবর্তী সম্পর্কিত প্রজাতির সাথে মানব জিনের ডট প্লটের মধ্যে প্রায় কোনও মিল দেখায় না। এস. ডি. এস. সি বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চ ব্যবহার করে পরিচালিত একটি একাধিক ক্রম বিন্যাস জিনের উজান অঞ্চলের প্রাইমেটদের তুলনায় বেশি দূরবর্তী সম্পর্কিত প্রজাতির মধ্যে সামান্য ক্রমের মিল প্রকাশ করে। মানব C16orf13 জিনে প্রতিলিপি সাইটের সূচনার কাছাকাছি, প্রাইমেটদের মধ্যে উচ্চ সংরক্ষণ রয়েছে যেখানে আপস্ট্রিম ডেটা উপলব্ধ ছিল, বিশেষত মানব, ওরাঙ্গুটান এবং রিসাস বানর C16orf13 জিন অর্থোলগ। প্রোমোটার অঞ্চল, 5 'ইউটিআর এবং সি16ওআরএফ13 জিন জুড়ে প্রাইমেটদের মধ্যে উচ্চ ক্রমের মিল স্পষ্ট। নীচের গ্রাফটি C16orf13 প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1-এর জন্য নির্বাচিত জিন অর্থোলগ দেখায়। এই তথ্যগুলি এনসিবিআই ব্লাস্ট থেকে সংগ্রহ করা হয়েছে। টিস্যু বিতরণ এনসিবিআই ইউনিজিন থেকে প্রাপ্ত মানব অভিব্যক্তি প্রোফাইল থেকে জানা যায় যে এই জিনের শরীরের বিভিন্ন টিস্যুতে ব্যাপক অভিব্যক্তি রয়েছে। এই অভিব্যক্তি প্রোফাইল থেকে বোঝা যায় যে এই জিনটি একটি "হাউসকিপিং জিন", যা টিস্যু নির্বিশেষে সমস্ত কোষে গুরুত্বপূর্ণ প্রভাব ফেলে। অভিব্যক্তির সর্বোচ্চ মাত্রা অ্যাড্রিনাল গ্রন্থি, ফুসফুস এবং প্যারাথাইরয়েডে দেখা যায়। এই শীর্ষ তিনটি ছাড়াও অনেক অতিরিক্ত স্থান রয়েছে যেখানে জিনটি উচ্চ মাত্রায় প্রকাশ করা হয়। জিনটি প্রকাশ করা হয় না এমন কয়েকটি টিস্যুতে কোনও প্রকৃত মিল নেই বলে মনে হয়। এই অভিব্যক্তি তথ্যটি নির্দিষ্ট কার্যকারিতার কোনও সূত্র দেয় বলে মনে হয় না, কেবলমাত্র এটি নির্দেশ করে যে জিনটি প্রায় সমস্ত কোষের "গৃহপালনের" কাজে জড়িত। C16orf13 জিন ক্রোমোজোম 16-এর শেষের দিকে অবস্থিত, যা সম্ভবত মুছে ফেলার মিউটেশনের সাপেক্ষে। সি16ওআরএফ13 জিনের আশেপাশের জিনের মধ্যে রয়েছে ডানদিকে অনুমানমূলক প্রোটিন এলওসি100287175 এবং এলওসি100138285 এবং বামদিকে আরএবি40সি এবং ডব্লিউএফআইকেএন1। এই জিনটি এল. ও. সি. 100138285 সহ মাইনাস স্ট্র্যান্ডে অবস্থিত। পার্শ্ববর্তী অন্যান্য জিনগুলি প্লাস স্ট্র্যান্ডে বিপরীত দিকে অবস্থিত। জিনের আশেপাশের অংশটি নীচের পরিকল্পনায় উপস্থাপন করা হয়েছে, মূলত এনসিবিআই জিন থেকে। প্রোটিন এই জিন যে প্রোটিনকে কোড করে তা ইউ. পি. এফ. 0585 নামে পরিচিত, যেখানে ইউ. পি. এফ অজানা প্রোটিন কার্যকারিতার সংকেত দেয়। এই প্রোটিনের পাঁচটি আইসোফর্ম রয়েছে, যা জিনের পাঁচটি স্প্লাইস রূপের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। আইসোফর্মগুলির নাম দেওয়া হয়েছে এ, বি, সি, ডি এবং জি যেমন উপরে উল্লেখ করা হয়েছে, এই অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সের ব্লাস্ট অনুসন্ধানে সংরক্ষিত ডোমেনটি একটি মিথাইলট্রান্সফেরেজ সুপারফ্যামিলি। সংরক্ষণ এস. ডি. এস. সি বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চে প্রোটিন সরঞ্জাম ব্যবহার করে পরিচালিত একটি একাধিক ক্রম বিন্যাস মিথাইলট্রান্সফেরেজ ডোমেনের জন্য কোড হিসাবে পরিচিত অঞ্চলে আর্কিয়া পর্যন্ত দূরবর্তী সম্পর্কিত প্রোটিন অর্থোলগের মধ্যে কিছু ক্রমের মিল প্রকাশ করে। প্রোটিনের মিথাইলট্রান্সফেরেজ সুপারফ্যামিলির অংশটি বিভিন্ন প্রজাতির আরও ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত অর্থোলোগাস প্রোটিনের মধ্যে আরও বেশি সংরক্ষিত বলে মনে হয়। প্রজাতির বন্টন C16orf13-এ অনেক প্রজাতির সমলিঙ্গ রয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে ছত্রাক এবং উদ্ভিদের দূরবর্তী অর্থোলগ। এই প্রোটিনের কোনও পরিচিত প্যারালগ নেই এই জিন এবং এর প্রোটিন প্রাইমেট এবং স্তন্যপায়ী প্রাণীদের মধ্যে, বিশেষত কার্যকরী মিথাইলট্রান্সফেরেজ ডোমেনে খুব বেশি সংরক্ষিত। নীচের গ্রাফটি C16orf13 প্রতিলিপি বৈকল্পিক 1-এর জন্য নির্বাচিত প্রোটিন অর্থোলগ দেখায়। এই তথ্যগুলি এনসিবিআই ব্লাস্ট থেকে সংগ্রহ করা হয়েছে। ভবিষ্যদ্বাণীকৃত বৈশিষ্ট্য প্রোটিনের মধ্যে আলফা হেলিস এবং বিটা শিটের ঘটনার পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য অ্যালগরিদম ব্যবহার করে প্রোটিনের গৌণ কাঠামোর পূর্বাভাস দেওয়া যেতে পারে। এস. ডি. এস. সি বায়োলজি ওয়ার্কবেঞ্চে চোফাস, জিওআর4 এবং পেলে অ্যালগরিদম ব্যবহার করে প্রোটিন কাঠামোর একটি বিশ্লেষণ পরিচালিত হয়েছিল। বিশ্লেষণগুলি একত্রিত করা হয়েছিল এবং সংলগ্ন রেখাচিত্রে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল। শুধুমাত্র এমন কাঠামো অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল যা একাধিক আউটপুটে উপস্থিত হয়েছিল। মিথস্ক্রিয়া এই প্রোটিনের জন্য খুব কম পরিচিত মিথস্ক্রিয়া রয়েছে। জিনকার্ড ডাটাবেসে বা এম. আই. এন. টি ডাটাবেসে কোনও মিথস্ক্রিয়া পাওয়া যায়নি। একটি স্ট্রিং অনুসন্ধানের ফলে দুটি জিন আউটপুট পাওয়া গেছে। এই দুটি জিন মিথস্ক্রিয়া, যদিও, উভয়ই জিন নেবারহুডের প্রমাণ বিভাগে রয়েছে, যা অগত্যা নির্দেশ করে না যে এই জিনগুলি কোনও অর্থবহ উপায়ে মিথস্ক্রিয়া করছে, বা এমনকি একই সময়ে প্রকাশিত হয়। এই প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়ার জন্য বর্তমানে কোনও শক্তিশালী প্রমাণ নেই। রোগ সংযোগ মাইক্রো অ্যারে পরীক্ষা-নিরীক্ষা থেকে প্রাপ্ত তথ্য এই জিনের অভিব্যক্তিকে বিভিন্ন টিস্যুতে, বিশেষত স্তন এবং গ্যাস্ট্রিক ক্যান্সারের সাথে যুক্ত করেছে। উপরন্তু, এই জিনের প্রকাশের অধীনে রোগ, বিশেষ করে সংযোগকারী টিস্যু রোগ, পুষ্টি এবং বিপাকীয় ব্যাধি এবং পরিপাক ব্যাধিগুলির সাথেও যুক্ত। ক্যানসার ওয়ার্কবেঞ্চ ডাটাবেস মাইক্রো অ্যারে ডেটা প্রকাশ করে যা সি16ওআরএফ13 জিনের অভিব্যক্তির সাথে বা তার অধীনে বিভিন্ন কার্সিনোমার সাথে যুক্ত হতে পারে।