HYPHY (software)
হাইফাই (HYPHY) একটি মুক্ত মাল্টিপ্ল্যাটফর্ম (ম্যাক, উইন্ডোজ এবং ইউনিক্স) গণনামূলক ফাইলোজেনেটিক্স সফ্টওয়্যার প্যাকেজ যা জেনেটিক সিকোয়েন্স ডেটার সর্বাধিক সম্ভাব্যতা বিশ্লেষণ করার উদ্দেশ্যে এবং বিভিন্ন পরিসংখ্যানগত অনুমান পরীক্ষা করার সরঞ্জাম দিয়ে সজ্জিত। হাইফাই নামটি "পি. এইচ. ওয়াইলোজেনি ব্যবহার করে হাইপোথিসিস টেস্টিং"-এর একটি সংক্ষিপ্ত রূপ। মার্চ 2018 পর্যন্ত, প্রায় 2,000 পিয়ার-পর্যালোচিত বৈজ্ঞানিক জার্নাল নিবন্ধ হাইফি উদ্ধৃত করে। প্রধান বৈশিষ্ট্যগুলি পূর্বনির্ধারিত স্ট্যান্ডার্ড মডেল বা বিবর্তনের ব্যবহারকারী-সংজ্ঞায়িত মডেল ব্যবহার করে নিউক্লিওটাইড, প্রোটিন এবং কোডন সিকোয়েন্সের বিশ্লেষণকে সমর্থন করে। প্যাকেজটি একটি গ্রাফিকাল ইউজার ইন্টারফেসের পাশাপাশি একটি ব্যাচ ভাষার মাধ্যমে মিথস্ক্রিয়াকে সমর্থন করে যাতে বড় এবং জটিল বিশ্লেষণগুলি সেট আপ করা যায় এবং ফলাফলগুলি প্রক্রিয়া করা যায়। নিলসেন-ইয়াং পিএএমএল এবং সুজুকি-গোজোবোরি পদ্ধতির সাধারণীকরণ এবং অন্যান্য অনেকগুলি সহ পৃথক অ্যামিনো-অ্যাসিড সাইট এবং/অথবা বংশে অভিযোজিত বিবর্তন সনাক্ত করার জন্য হাইফাই একটি বহুমুখী পদ্ধতি অন্তর্ভুক্ত করে। হাইফাই-এর বিকাশ 1997 সালে শুরু হয়েছিল, 2000 সালে প্রথম প্রকাশ্য প্রকাশ এবং 2020 সালের ডিসেম্বর পর্যন্ত সবচেয়ে সাম্প্রতিক সংস্করণ ছিল 2.5। সফ্টওয়্যার/কোডের প্রাপ্যতা এবং লাইসেন্স হাইফাই এমআইটি লাইসেন্সের অধীনে প্রকাশিত সোর্স কোড সহ ফ্রিওয়্যার হিসাবে বিতরণ করা হয়। ম্যাক ওএস এক্স এবং উইন্ডোজের জন্য সংকলিত বাইনারিগুলি ডাউনলোডের জন্য উপলব্ধ। সোর্স কোডটি উপলব্ধ যাতে ব্যবহারকারীরা পজিক্স সিস্টেমে হাইফাই অ্যাপ্লিকেশনটি সংকলন করতে পারেন। অভিযোজিত বিবর্তন সনাক্ত করার জন্য হাইফাই পদ্ধতির একটি উপসেটও ডেটামঙ্কি ক্লাস্টারে টেম্পল বিশ্ববিদ্যালয়ের হাইফাই দল দ্বারা উপলব্ধ করা হয়েছে। নোটস এক্সটার্নাল লিঙ্কঃ হাইফাই হোম পেজঃ ডাটামঙ্কি সার্ভার, যা বিভিন্ন হাইফাই সরঞ্জাম (বিনা মূল্যে) সমর্থন করে। : হাইফি/ডাটামঙ্কি ফাইলোজেনেটিক্স সফ্টওয়্যার সমর্থন করে।