组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析
组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析
建立液相色谱-串联质谱测定组织中全基因组DNA甲基化水平的方法。采用苯酚氯仿提取组织DNA，提取的DNA用88%甲酸在140℃下裂解，DNA裂解液加入同位素胞嘧啶作内标，经N2吹干后，用甲醇溶解，以液相色谱-串联质谱检测胞嘧啶和5一甲基胞嘧啶的含量，并计算全基因组中DNA甲基化的水平。结果表明，胞嘧啶的线性范围为1～100 g·L^，相关系数为0.997 4，相对标准偏差为0.70%～4.09%；5-甲基胞嘧啶的线性范围为1～50 g·L^，相关系数为0.994 8，相对标准偏差为0.60%～4.81%。胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的检出限为1 pg……