新疆上个世纪70年代末80年代初,曾凭借出色的防守跻身全国甲级联赛。2005年,新疆男足首次杀入全运会U19男足决赛阶段比赛。之后,多次参加中乙联赛让新疆男足水平进一步提升。2013年,9月新疆男足再一次取得了历史性突破,获得全运会U20男足比赛的第四名。近年来,新疆陆续有十余名球员成为职业球员,巴力、木热合买提江、吾提库尔、叶尔杰提等球员先后入选了国奥队。目前,中超赛场新疆籍的肖开提在广州恒大效力、巴力在江苏舜天效力、木热合买提江刚从山东鲁能转会河南建业,叶尔杰提目前在荷兰接受训练,如无意外今年将加盟中超球队。
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