官邸从1949年动工兴建,于1950年初完工落成。蒋介石来台后,先居于草山(阳明山)行馆,士林官邸落成后的1950年3月31日,蒋介石正式迁居士林官邸,直至1975年4月5日病逝,在官邸度过了整整26年的时光。因此,这里是蒋介石及其家人最具代表性的故居,并曾在此接待各国政要。由于总统居住在此,士林官邸、园艺管理所及附近地区,很早就被国防部划入大直要塞的军事管制区内,并严禁各种新建或改建,就连改变地形、地貌的各项工程亦在管制之列。
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