对中枢神经系统隐球菌病作出早期正确诊断时，应注意：凡未确诊的脑膜炎、脑炎及脑占位病变，在脑脊液检查时应常规进行真菌检查；结核性脑膜脑炎，抗结核治疗无效应时应怀疑本病；血液性疾病、肿瘤、系统性红斑狼疮、器官移植等，在病程中突然出现头痛、恶心、呕吐应怀疑中枢神经系统隐球菌感染。
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