针对近期岛内新编高中教科书应使用“日治”、“日殖”或“日据”来描述该时期，引发外界诸多争议。马英九认为，现今是民主社会，大家应该包容不同声音，“我从小到大都用日据，但并不反对有人用日治”。他说，大家对历史有不同看法和记忆，确实可以容许有讨论空间，不宜硬性规定哪一个不准用，这样才能让不同看法出来。
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