Nhóm phát triển hoàn toàn hiểu rằng không phải ai cũng đồng ý ủy ban quốc phòng an ninh với quyết định thiết kế của họ, vì vậy nhóm đã để cho người dùng có thể tùy chỉnh Kali Linux dễ dàng hơn theo ý thích của họ.