為帶動我國有機農業持續成長，農委會已於106年5月發布「有機及友善環境耕作補貼要點」及「友善環境耕作推廣團體審認要點」，開辦有機及友善環境耕作補貼，只要農友通過有機、轉型期驗證、或經友善環境耕作推廣團體審認（以下簡稱友善耕作團體），經審查符合資格後，即可申請補貼。自去（106）年開辦以來，宜花東三縣已發放近千戶，農民領取補貼金額5仟餘萬元，本（107）年度於9月1日至9月15日開始申辦，符合資格的農友儘速向所屬驗證單位或友善審認團體提出申請，並鼓勵慣型農友轉型有機及友善環境耕作，除農委會農糧署有相關輔導措施協助外，亦可擴大農業對友善環境之效益。
農糧署東區分署說明，有機及友善環境耕作是農友基於生態平衡及養分循環原理，不施用化學肥料及化學農藥，不使用基因改造生物及其產品，進行農作、森林、水產、畜牧等農產品生產之農業，藉以生產自然安全的農產品，世界各國皆將其納入國家綠色產業政策，給予農民綠色補貼或農業環境給付。
我國已自106年起開辦有機及友善環境耕作補貼，申請農友需通過有機、轉型期驗證、或經農委會審查通過之友善環境耕作推廣團體登錄，經審查通過後，即可按通過驗證或審認通過之土地，給予每年每公頃之生態獎勵給付3萬元；倘為有機轉型期，除生態獎勵給付外，額外再給予收益減損補貼，依作物別不同，種植水稻與蔬菜每年每公頃3萬元，其他作物每年每公頃5萬元，合計可領到補貼6～8萬元。本（107）年申請補貼時間為9月1日至9月15日，為方便各地農友申請及簡化申請作業，可將申請文件送交所屬驗證機構或友善耕作團體，彙整後向農糧署各區分署提出申請。
此外，為鼓勵農民投入有機及友善農業行列，除環境耕作補貼外，農糧署另提供有機驗證與檢驗費、有機質肥料、農業機械及生產設施補助等，並輔導設置農民直銷站、農夫市集及量販通路有機專櫃等協助農產品行銷。
該分署強調，我國已於107年5月公布「有機農業促進法」，並將於1年後實施，法規內明訂各項有機農業輔導措施，希以公共資源支持農業轉型，對於有機及友善耕作之農友是一項大利多。
東部地區宜、花、東擁有潔淨的空氣、水源及土壤，加上當地優美的自然環境與田園景觀，給予有機農業有利的發展條件，至107年8月底我國有機驗證面積達到8,216公頃，友善環境耕作審認面積達到1,798公頃，而宜花東三縣有機驗證及友善耕作審認面積已達到3,368公頃（有機2,948公頃、友善420公頃），占全國有機驗證及友善耕作面積33.6％，其中花蓮縣有機驗證及友善耕作面積達2,052公頃（有機1,849公頃、友善203公頃），更為全國之冠，期待各界持續支持有機及友善環境耕作，創造東部農業永續發展。