加盟連鎖體制，有著降低進入技術成本與資金住宿評價英文門檻，快速擴大經營規模的優點，不過稅捐實務觀察上，加盟總部與各加盟店事業主們往往會便宜行事，過度輕忽稅務問題，讓良好的經營模式變了調。以下簡單介紹開始進入加盟連鎖業之前，尤須特別留意的營業稅問題：
各別加盟店實際營運銷售時，應以加盟總部╱總部分公司的名義？或各別加盟店以自身名義，自行向消費者開立統一發票？應視連鎖加盟的法律關係而定，如果各加盟店有向加盟總部進貨且擁有商品所有權的話，應由加盟業者自行開立發票。如果是加盟總部以類似「直營」的方式，一手包辦裝潢、進貨物流、帳款訂房折扣碼金流，加盟業者扮演的角色類似單純提供場地的出租人或派遣提供勞務而已，則應由加盟總部以自己名義開立發票予消費者。