全民健保自77年開始著手規劃，到83年制定完成全民健康保險法，並自84年實施至今年3月1日，剛好屆滿20年。當初規劃仰仗蔡勳雄、吳凱勳、藍忠孚、楊志良及江東亮等諸多專家前瞻規劃第一代的全民健康保險，並由當時衛生署中央健保局負責執行。
全民健保開辦以來一直面臨諸多變革與挑戰，20年來，在歷任健保首長葉金川、賴美淑、張鴻仁、劉見祥、朱澤民、鄭守夏、戴桂英等人的共同努力下，從一開始推動全民納保、接著改善離島與山地民眾就醫不便問題、製發健保IC卡、軍人納保、發展多元支付制度及藥價政策，為維持健保財務平衡二次保險費率調整，以及100年著手全面檢討健保制度進行的二代健保修法，二代健保得以在102年順利上路，每個階段都期望能與時俱進，給予國人更完善的健保制度。
過去20年期間，臺灣也經歷921大地震、SARS疫情風暴及莫拉克颱風災害、高雄氣爆等重大事件，每一事件，都對臺灣帶來不同程度的衝擊，而唯一不變的全民健保，始終堅持以社會互助照顧弱勢的精神，並追求公平納保、平等就醫、醫療品質及行政效率為目標，持續不斷改革，守護國人健康。在國人滿意度方面，全民健保也從起初的滿意度不到4成，到目前持續維持在8成以上，實在是得來不易，這項成果除健保署同仁長期的努力之外，還要感謝特約醫事服務機構每一位醫療提供者的合作與協助，以及社會大眾、民意代表及媒體的監督與支持。
中央健康保險署為落實二代健保精神，致力於穩定健保財務、照顧弱勢、改革支付制度、提升醫療品質、資訊公開及擴大民眾參與；另為提升民眾用藥品質與安全，避免重複用藥，近年更結合雲端科技發展以病人為中心之「健保雲端藥歷系統」，提供特約醫事服務機構醫師於臨床處置、開立處方，及藥師用藥諮詢，並配合藥價調查政策及加強審查措施，促進醫療資源妥善利用，截至103年底，特約醫事服務機構啟動「健保雲端藥歷系統」查詢總計5,761家院所，總計查詢病人數796萬人，查詢次數1,949萬人次，查詢醫事人員數35,932人。
進一步分析103年第3季藥歷查詢病人群六類藥品用藥日數重疊率較去年同期已明顯降低。據統計103年第1季至第3季藥歷查詢病人群每人平均藥費與去年同期比較均呈現降低情形，顯示中央健康保險署透過藥價調查、加強審查、藥歷查詢等多重管控措施，已有效減少重複用藥，避免藥物交互作用，並提高病患用藥安全，增進醫病關係。
為慶祝健保20週年，中央健康保險署編印全民健保20週年叢書、健保紀實攝影集及影片，記錄健保與國人共同成長的點點滴滴，並自3月起規劃一系列健保20週年活動，舉辦國際研討會及全臺各分區業務組辦理路跑活動，展現臺灣健保與國際接軌之實力及護持全民健康的活力。未來健保仍將稟持維護國人健康信念，持續提供民眾更完善的醫療服務，實踐世界衛生組織（WHO）全民均健（Health for All）的理想。