觀音菩薩在極樂世界看見此種情景，便懇請阿彌陀佛救度此等眾生。阿彌陀佛的舌頭立時射出一道紅光往丹那湖中的一蓮花，蓮花立時綻開，從彌陀心中再射出一直立金剛杵內有一個施(HRI)字，立於蓮花上，在彩虹光芒中化為一個八歲小童端坐於蓮花上，四週繞著空行母。如是，由最具慈悲的佛心所化生之蓮花生大士，便降臨這世間救度眾生。
蓮花生大士擁有世間的權力和物質受用，但他了解世間的虛妄和煩惱，更欲放棄王位離眾，便對父王說：「世間生命短暫，輪迴不息，生離死別是不可避免的，我等應精進修行，以求解脫。」不久，蓮花生大士被指控殺死一位大巨的妻子及其兒子而負罪，被判流放他鄉，從而得離開皇宮，開始過著瑜珈士的生活。
蓮花生大士在印度八個著名墓地專心一意的修行，其中在菩提伽耶附近的檀香木墳場，大士以屍體為座，進入甚深三摩地。修行五年當中，空行母常來為他灌頂及說法，大士以祭品為食，裹屍布為衣，在每處墓地他都跟隨忿怒本尊和大成就者修法，同時，更超越空間到各處尋求深奧的教義。經過不斷精進修持，他終於克服了所有逆境，而得諸成就，取名為忿怒金剛。