台北市長柯文哲啟程東南亞考察之旅後，本來在國內絕口不提此次與中央新南向間的關係，但出了國門後，卻有意無意多次在公開場合稱「這次新南向」等，呼應中央政策。但此次柯文哲出訪一波三折，在馬來西亞兩度安排與當地政要見面，大馬奧會主席、吉隆坡市長等，都臨時變卦取消；甚至到了印度，舉辦產業論壇時也因為北德里市長遲到而延後舉行。柯文哲此行不只處處受到中國打壓，「台灣」這個招牌能否得到尊重，也是此行順遂與否的關鍵。
對於新南向政策，不少台商認為，龐大的大陸市場或許可以透過結合東南亞許多國家來抗?，但最重要的一點在於，中國的「大」，是建立在單一體制下，台商西進中國只需要設計一套標準、遵守一套規定；但南進東南亞各國，有多少國家就必須要設計多少套法規。更不用提還有價值觀、生活習慣以及語言等各種差異，複雜程度相當高，嚴重影響了台商南進的意願。
而新南向在東南亞各國可能會因為地鄰關係，被中國直接影響，但遠到印度，要面對的卻是另一種壓力。中印關係之間的緊張早已不是新聞，此次北市府在新德里舉行產業論壇，有不少台商匿名出席，為了就是不要打壞在中國的投資，政治因素成了跨國企業必須要考量的因素。再加上新南向政策方向不明確，因此有不少業者持觀望態度，等其他業者先行後再作打算。
對於台商認為新南向政策幫助有限，柯文哲認為，企業都是希望政府有更多的協助，但政府的資源也是有限，如何用有限的資源做最大的發揮，這也是我們要思考的」；至於台商低調出席論壇，柯文哲也不諱言中國確實是很大的一個因素之一，台灣必須要想辦法克服。