2004年，王永慶曾寫給兒女一封信，這封信于近日在台灣《聯合報》刊出。王永慶的信，不僅對其子女有教育意義，也透露了他創造財富和積累財富的經驗。我 們需要創造財富和積累財富的本領，更重要的是，讓財富對社會做出應有的貢獻。財富不能帶走，但財富可以造福社會。王永慶雖然結束了一段傳奇的人生，但他的 精神將永留人間，並將一直被人們懷念。
2008年10月11日因擔憂美國金融風暴對台灣產生的衝擊，偕同三房夫人李寶珠與女兒王瑞華前往美國視察公司生產線，在美東時間10月15日早上王永慶在紐澤西短丘市（Short Hills）的家裡被發現在睡眠中安詳辭世，送往附近聖巴拿伯醫院搶救無效，院方於上午9時38分宣布死亡。
隨著王永慶逐漸邁向高齡，接班問題一直是台塑集團最大的隱憂。1995年發生呂安妮事件，王文洋因婚外情打亂了王永慶接班部署，王文洋選擇離開台塑集團。在王永慶的接班佈局中，他很低調地進行接班作業。2001年 為確保台塑企業的永續經營，王永慶開始進行退休交棒計畫。以5年的時間，默默進行交棒布局，過程從成立決策小組、拔擢新的專業經理人、成立信託基金到轉變由長庚醫院持股組合。2002年4月，王永慶在臺塑集團總管理處下成立「五人決策小組」。2003年，王瑞華進入此決策小組，臺塑集團集體領導團隊變成「六人決策小組」，成員有楊兆麟、王瑞華、王文淵、王文潮、吳欽仁、李志村六人，做為集團接班的過渡平台。其中王文淵與王文潮是王永慶弟弟王永在的兒子。2006年6月王瑞瑜加入六人決策小組，成為「七人決策小組」。2006年6月5日王永慶以90歲高齡正式宣佈交棒，由其胞弟王永在的長子王文淵擔任集團行政中心總裁，王永慶女兒王瑞華出任集團行政中心副總裁，台塑集團正式步入第二代經營。