抗生素會干擾孩子的腸胃微生物生態系統，會減少了有益的腸胃微生物數量，改變了養份的吸收和新陳代謝。這有可能引起糖尿病前期，是二型糖尿病的早期高危階段。
糖尿病前期，體內的血糖水平會比正常高，不過未高至要被介定為糖尿病。而這會令人有高風險，發展成二型糖尿病、心臟病和中風。
有糖尿病前期的人士，會有30%的人在五年內，發展出二型糖尿病，除非調整生活習慣而改善了健康。
測試中，有糖尿病前期情況的參與者的糞便樣本中，都有較少的瘤胃球菌 (Ruminococcus)，它可以滋養腸胃中的益菌。數量下降就會影響腸胃平衡，科學家更認為這會引致糖尿病前期。
作比較的健康測試者，三歲以下時，都很少服用抗生素，而且也有較好家族的健康歷史。專家認為，抗生素應該認真監管，真正需要才處方和服用。
專家說：”腸胃微生物是很精巧的 ‘器官’，但經常被醫學界忽略了。它們可以製造維他命、賀爾蒙和微量營養素，和腸胃中的神經系統互動，影響腸胃的免疫回應。”
研究建議，益生元（一種不能消化的纖維，可以滋養有益的微生物）及益生菌（有益的微生物），可以幫助重新平衡腸胃中的細菌生態。
這或許可以防止出現糖尿病前期，及其發展為糖尿病。