不過，盡管科學數據庫的發展已有一定基礎，相比頂尖的發達國家，中國科學數據庫的數據來源、數據管理和數據服務還存在較大差距。首先是數據來源，科技部基礎研究司司長葉玉江就表示：“此次《辦法》出臺的重要背景是有一批科學家反映我國科學數據流失嚴重。”這是因為在制度層面，我們存在較大紕漏。例如，在此之前，即便是國內政府基金支持下的科研計劃，對申請者的數據公開和上交的要求都不是必要選項。反觀國外的許多期刊或學術會議，在提交論文的同時都會要求提交科研數據。
大數據時代，對于企業來說，數據流比現金流還重要。“數據是信息時代的石油”，對于科研工作者來說，沒有數據就沒辦法開展科研工作。統一、完善的數據平臺，將會給科研工作者以巨大的幫助。一定意義上，歐美、日本等的科學技術不斷進步，一個重要前提就是他們的科學數據管理十分規范，所能提供給學者的數據服務非常優質。