國民黨獲勝的縣市，包括：北縣、桃園、基隆、竹縣、竹市、苗栗、中縣、中市、花蓮、並且「光復」了北縣、宜蘭、南投、彰化、嘉市。民進黨則保住嘉縣、南縣、南市、高縣、屏東，並將雲林由藍變綠。
另外，金門、連江分別為同屬泛藍的新黨李柱烽、親民黨的陳雪生當選。台東無黨籍的吳俊立雖然在選前因司法問題纏身，但仍贏得選戰。
這次選舉結果不少縣市「變天」，包括民進黨已執政24年的宜蘭縣，這次升起藍旗；號稱「民主聖地」的嘉市，也被藍軍翻盤了；南投、彰化則是被國民黨再次拿回來。奪回民進黨掌握16年的台北縣，被國民黨視為此役最大的勝利。
蘇治芬贏了雲林縣，勉強為民進黨挽回一點顏面，但南台灣除了嘉義市，仍是綠軍天下，北藍南綠的現象更加明顯。