要在香港經營非專營巴士、私家巴士、公共小巴及學校私家小巴業務，營辦商必須事先向運輸署申請「客運營業證」，及為提供服務的車輛申請「客運營業證證明書」。客運營業證授權持證人營運車輛提供載客服務，而客運營業證證明書則簽發予根據客運營業證營運的車輛。
其他19座位或以下之私家小型巴士並不需要領取客運營業證，例如新巴車隊編號SV52的三菱Rosa小巴[2]、只供內部職員乘搭的12座位小巴、個別屋苑只供居民乘搭的16座小巴等。
運輸署根據《道路交通條例》第28條就客運營業證的申請作出決定時，除須顧及認為與該申請有關的其他事宜外，亦須顧及以下事宜：
申請人擬提供的服務的標準。
運輸署會在發證時施加條件，包括車輛數目與類型、車輛的可行用途、和營運詳情等，以規管持證人屬下車輛的營運。持證人有責任遵守該等發牌條件，運輸署可在諮詢持證人和給予三個月預先通知後，隨時更改發牌條件。
客運營業證有效期最長為5年，持證人可申請續期，每次續期不得超過五年，申請或續期之費用為$396。學校私家小巴的客運營業證則由1999年10月1日開始簽發，由實施當日起以行政方式逐年豁免其費用，直至2015年9月1日正式以立法形式免除收費[3]。目前首次批出的新客運營業證有效期為一年，非專營巴士隨後一般會獲續期兩年，學校私家小巴則每年續期。署方亦有權根據《道路交通條例》第29條拒絕發放客運營業證，也可拒絕就任何不屬或行將不屬申請人所擁有的車輛發出客運營業證。
此外，車輛必須在車頭擋風玻璃的左面張貼由運輸署簽發的客運營業證證明書，以及按照道路交通（公共服務車輛）規例附表2第2號圖形所示客運營業證號碼的字牌，展示在車尾。
運輸署會對未經批准營辦的服務發出警告信，要求持證人遞交書面解釋及停止營辦未經批准的服務。如有證據顯示，該項未經批准營辦的服務可能構成《道路交通條例》或《公共巴士服務條例》所訂的罪行，運輸署可發出傳票，並把有關個案轉介予香港警務處作出檢控。除此之外，運輸署可根據《道路交通條例》，就任何違反客運營業證制度下發牌條件的事項進行研訊。如個案證明屬實，持證人會被暫時吊銷或取消營業證。如持證人不接納有關決定，可申請交由交通審裁處覆檢有關決定 。