藥師琉璃光如來為了要救護一切眾生，除他的疾病痛苦，所以在光中說藥師咒。這一個咒，雖然沒有多少句，也沒有多少字，很短的，可是它的妙用是無窮無盡的。
雖然無窮無盡，你必須要有一種信心，專一其心來持誦它。無論哪一位醫生，如果一方面給人看病，一方面再用這個咒給他來加持，相信這個病痛很快就好了。那麼醫生就是以解除眾生的病苦為自己的責任，能有這樣的咒來幫助，這可以說是一個大醫王。所以做醫生的能把這個咒受持讀誦，那是最好的。
那不做醫生的呢？也可以受持讀誦。無論在什麼地方，你若遇著人有疾病，那麼給他一念，他都可以就好了。這個咒是譯音，所以沒有什麼講解，不需要講解。就一心持這個咒，它就有感應。
「南無薄伽伐帝。鞞殺社。窶嚕薜琉璃。缽喇婆。喝囉闍也。怛他揭多耶。阿囉喝帝。三藐三勃陀耶。怛姪他。唵。鞞殺逝。鞞殺逝。鞞殺社。三沒揭帝莎訶。」常常念這個咒，那個感應道交是不可思議的。
誦咒要漱口，沐浴清淨，把身心都清淨了，意念也清淨了。或者是把這個病人所吃的東西，或者他所服的藥品，或者用沒有蟲子的水，念這個灌頂真言一百零八遍，給這個病人來吃。喝了這種用〈藥師灌頂真言〉所加持的水，疾病就都消滅了，沒有了。
若有所求，也應該至心念誦這個咒。若是要求什麼的，也都可以像前邊這個念一百零八遍做為願。人所求什麼都會遂心滿願的。病痛也沒有了，也延年益壽了，應該死的也不死了，就這麼妙。
舉一例說明佛經就是藥方：
第二天，我給岳父喝的是豆漿。每喝一次水或豆漿，我都會念一百零八遍「藥師咒」。第三天，我做了一鍋山東柳葉面，岳父以前最愛吃。他已有一個星期沒嘗過鹽味了，我打算給岳父喝一點湯。當我問他時，他竟要我給他盛上點面葉兒。能喝水了，能不能吃麵啊？我很擔心，但又不能不讓他吃。因為始終就沒有將病情告訴過他，岳父還認為自己的病在好轉呢！我只好硬著頭皮給他盛上十幾片柳葉面，萬分懇切地求佛力加持。念過「藥師咒」後，又緊張了一回，岳父竟然順利地吃下去了。就這樣，能吃能喝的過了十幾天，老人家再沒受一點痛苦，終於安祥地走了。