2006年第二次參與一軍春訓，爭取固定先發右外野手的名額，雖然最後以失敗作終（關鍵代打），但是首次被列入開幕一軍。2006年於首次的WBC世界棒球經典賽代表台灣參賽，擔任第四棒。2006年3月31日，擔任該年球季開幕戰，阪神虎隊與讀賣巨人隊之戰的先發右外野手。2007年開季與另一競爭者濱中治被設定為雙先發右外野手，但直到4月7日才首次先發，首打席便擊出陽春全壘打。同年，林威助因左肩受傷，加上亞洲職棒大賽與世界盃撞期，球團希望他以阪神的比賽為優先，故婉拒參加世界盃。
其他日職球團或電視轉播員不知林威助是台灣出身，有時會將他的姓名唸作「Hayashi Isuke」；NHK轉播員阿部涉和富士電視台轉播員渡邊和洋，皆曾如此。林威助在其他球隊，例如廣島、巨人等隊主場出賽時，則被稱為「Lin選手」。因為「林」在日本也屬常見的姓氏，作為日本人的姓氏時，「林」字唸作「hayashi（はやし）」；「威助」二字碰巧也可作為日本男子名，唸作「Isuke（いすけ）」。只有知道林威助是外國人者，才會依漢語發音，將他的姓名唸作「Lin Ueitsu（リン・ウェイツゥ）」。
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