公衛學院發展，朝四大方向推進：
公共衛生的發展必須從公衛歷史角度著手，從早前的熱帶醫學研究所，1950年代改成公共衛生研究所；1972年成立公共衛生學系；1993年從醫學院獨立成為公共衛生學院。變化過程中，公衛學院與醫學院、醫院的關係，都分而不離；在教學、研究、服務上的關係，也是密不可分。
20世紀，公衛學院對臺灣公共衛生改善，公衛行政上有具體重大的貢獻。與世界各國，透過高等公共衛生教育研究培養的公共衛生人力、知識，對全球公衛問題的改善貢獻良多。到了21世紀，公共衛生問題轉變為全球衛生的問題，許多議題需要全球共同努力，才能解決。未來公衛教學、研究，必須關照到臺灣以外的其他區域，特別是政府目前倡導南向政策，未來公衛研究方向、教材，必須涵蓋這些區域。
公衛學院已經通過美國公衛教育委員會之認證，且成為美國公共衛生學院暨學程學會之成員。這些國際組織的核心，在於關懷社區，主動參與，未來的公共衛生必須是社區化的。未來，公衛學院課程上將強調，前往健康不平等的社區，到利害關係人、衛生單位、環保單位、公司行號等地點，實地教學與研究。
公共衛生必須對國家重大政策有所貢獻，研究所得之科學知識，必須整理成可以影響國家政策的力量。這要透過不斷倡議和立法行政的遊說，把科學根據的知識用於可以促進國民健康的政策上。