澎湖南海遊客服務中心位於澎湖縣馬公市光復里1鄰新營路25號，馬公港灣的西北側，距離馬公機場約9公哩，開車約25分鐘可達，是澎湖旅遊交通的中心轉運站，想要前往七美、望安、虎井、桶盤、將軍嶼、花嶼等南海主要離島旅遊，必須在此搭船前往，除了有數家快艇業者營運至各景點之外，也有來回於南海相關各島嶼間較為經濟的的交通船。期內除了各家業者的服務中心外，還有寬敞的候船室、物品寄放室、育嬰室、簡單生活用品及食品的販賣部，甚至室外亦設有可方便遊客沖洗掉自海邊帶回滿滿沙礫的腳丫沖洗台等設施。並附設有大型免費停車場，可供停放遊覽車或小客車，旁邊的特產中心亦有提供餐飲及便當販售之服務。