「父啊！……你將這些事瞞住了智慧及明達的人，而啟示了給小孩子。」（路10：21）主耶穌基督不只一次地告訴我們，唯有如小孩般的謙遜才能體會主的愛。因為像白紙的小孩子，正等待我們為他們開啟多彩卻厚實的豐富人生，故在他們幼小的生命時期最適合信仰紮根的工作。而教會對小朋友的教育，從主日學的重視中顯現出來。士林堂主日學過去有永帶、瑞寧、嘉娜、欣南、昱蓉及美智等姊妹的投入；加上潘家駿神父邀請「天主教台北總教區教理推廣中心」的修女為堂區培養師資，使本堂的主日學得以持續陪伴小學階段的孩子們共同學習主的話語。
目前主日學由陳筑、莘華、金枝及怡如姊妹共同陪伴小朋友。我們以「天主教台北總教區教理推廣中心」製作的教材為主進行教學。小朋友已初步認識「七件聖事」、「聖體聖事」及「近代教會聖人」（德蕾莎姆姆、聖國柏、聖女小德蘭、聖瑪利亞‧葛瑞迪、聖董文學）等內容，2010年開始學習「十誡」。此外，我們會適時加入堂區及教會各節日的介紹、彌撒禮儀…..等課程，使信仰更貼近小朋友的生活。除了知識上的認識外，我們也透過歌唱、遊戲及勞作一起讚美天主，特別是美勞部分，迄今已同小朋友一起做過聖誕卡片、玫瑰念珠及復活蠟燭的再利用…..等等。
本堂主日學上課時間，配合小學每學期期間的每週日早上10：30進行，寒暑假休息(6月27日為本學期結業式)。目前成員以小學三、四年級的小朋友為主，但仍歡迎所有小學的小朋友加入，與我們一起認識愛我們的天主。