桃捷公司今年2月，在鄭文燦市長指示下，超前部署、超前執行新冠肺炎疫情相關防疫作為，已於3月17日全線車站佈設紅外線熱像測溫儀，啟動監測發燒旅客機制，如有測得體溫超過37.5度之旅客，經耳溫複測若超過38度將不得搭乘捷運，形成全面新冠肺炎防疫防護網。4月2日清明連假將至，鄭市長關心南來北往返鄉、出遊旅客乘車環境安全，今(28)日特別至桃園交通重要樞紐「桃捷A18高鐵桃園站」及「高鐵桃園站」視察車站防疫措施。除親自體驗、了解紅外線熱像測溫儀運作現況，也慰問站內商家因疫情衝擊產生之影響。
新冠肺炎疫情嚴峻，適逢清明連假，鄭市長勉勵桃捷與高鐵攜手讓防疫更加嚴謹，鄭市長表示，4月1號開始台鐵、高鐵、機捷乘客都必須配合體溫量測，發燒38度以上的旅客不得搭乘大眾運輸工具。這個政策機捷已於3月17號在全線的21個車站都佈建好，也經過多次演練，該怎麼篩檢、該怎麼進行場站的消毒，都已經有完整的準備，4月1號政策上路沒有任何問題。鄭市長也說，經過他視察高鐵桃園站和機場捷運的A18車站，兩邊的體溫篩檢機器都很完備，防疫作業也相當充分、周延，沒有影響到乘客入站的效率，鄭市長也呼籲，清明連假期間請搭乘大眾運輸工具的旅客全程戴口罩，確保自己和運務人員的安全。
因應清明連假將有大量返鄉、出遊人潮，桃捷公司已有全線紅外線熱像測溫儀築起全面防護網，並確實執行測得體溫異常旅客3步驟：1.確認體溫異常是否為其他物品造成；2.若非其他物品造成，站長會將體溫異常旅客帶至體溫複測區進行耳溫複測；3.耳溫超過38度，不得搭乘捷運，並引導該旅客搭乘租賃車、防疫計程車，或請親友接送並儘速就醫。除此之外，也再強化車站防疫作為，從4月1日開始，將全線執行-要求搭乘機捷旅客全程配戴口罩，保護自己也保護他人，更提醒，車站服務處皆提供75%酒精讓旅客消毒。面對清明連假期間，桃捷公司已全面強化相關防疫工作，力求在疫情關鍵期間保護旅客，也防護員工。
桃園機場捷運為機場聯外重要交通工具，受新冠肺炎疫情影響，中央流行疫情指揮中心對入境旅客進行管制，同時呼籲國人少出國減少染疫風險，直接影響桃園機場運量，3月21日至今桃機出入境旅客已減少90%以上，連帶讓機場捷運運量也減少50%。桃捷公司經過審慎評估，在節省營運成本及兼顧通勤族需求之下，將從4月6日至6月14日調整直達車班距，上下班尖峰時間仍維持15分鐘班距，平日早上9點至下午5點以及下午7點至晚上10點，調整班距為每30分鐘一班，假日直達車班距一律調整30分鐘一班，普通車則維持原有時刻表不變，讓通勤旅客影響降到最低。新冠肺炎疫情期間，桃捷公司除加強車站、車廂以及員工防疫工作，也務實規畫營運資源調度，希望提供旅客安心、安全的乘車服務。