依據「教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準」（下稱免稅標準）第2條第4項規定，經主管機關查明同意之使用計畫支出項目、金額或期間有須變更之情形者，最遲應於原使用計畫期間屆滿之次日起算3個月內，檢附變更後使用計畫送主管機關查明同意；變更前、後之使用計畫所定結餘款用於與創設目的有關活動支出之期間，合計仍以4年為限。
財政部南區國稅局臺東分局舉例說明，某社福團體104年度支出比未達60%，核定後結餘經費金額計792,641元，遂按免稅標準第1項第8款第2目規定編列結餘經費使用計畫，預計分別於105及106年度支用737,672元及54,969元，並經目的事業主管機關查明同意。惟嗣後發現部分活動無法按原申請計畫支列，是應於107年3月31日前檢附變更後之使用計畫經目的事業主管機關查明同意，且變更後使用計畫之最後一年度不得超過108年。事涉相關機關團體權益，籲請特別注意。