哈佛大學設有商學院、哈佛學院、繼續教育學部、牙科學院、設計學院、神學院、教育學院、工程和應用科學院、肯尼迪政治學院、文理研究生院、法學院、醫學院、公共衛生學院和拉德克利夫學院。其中哈佛學院、文理研究生院、工程和應用科學院和繼續教育學部共同組成了文理學院。 哈佛大學開設有眾多的本科、碩士和博士專業，如非洲研究、人類學、數學、物理、考古學、建筑、天文學、生物科學、商業、化學、計算機科學、戲劇、經濟學、工程學、英語、歐洲研究、政治學、歷史、語言學、音樂、神經生物學、海洋學、哲學、心理學、梵文和印度學、社會學、統計學等。哈佛大學擁有世界學術界公認的最好的商學院、法學系、醫學院和人文科學，此外數學、法學、教育、生物、物理、歷史等科系在全美的排名也處在前幾位。