有關國軍雄三飛彈誤射事件，國安局4日報告指出，大陸國台辦就該事件的表態是「借題發揮」，有意把該事件與兩岸關係以及政府未接受「九二共識」掛鉤，趁勢對台施壓。對此，大陸涉台學者受訪憂心指出，國安局此舉分明是卸責，也顯見蔡政府迄今仍不願面對兩岸問題，雙方若持續中斷聯繫，未來擦槍走火的誤判事件只會更多。
針對國安局的說法，北京清華大學台研院副院長巫永平表示，這很明顯是國安局為淡化該事件的不當處置及轉移蔡政府對國軍管束不當進行卸責，但始終未就事件發生的本質，也就是兩岸溝通聯繫機制的中斷進行檢討。
至於該報告指陸方刻意渲染台海不安情勢，巫永平認為，蔡英文政府上台後不願承認「九二共識」，兩岸溝通聯繫機制隨即中斷，這是不爭的事實，就蔡英文政府對該事件發生的表態，顯然還不願正面處理兩岸關係，恢復雙邊溝通聯繫機制。
巫永平指出，該事件的發生，凸顯兩岸關係目前所面臨的癥結點，就是沒有溝通聯繫機制，加上媒體擴大報導的效應，一旦未來再有類似擦槍走火的事件發生，對兩岸關係將會是非常危險的事情。
面對兩岸至今仍無法恢復溝通聯繫機制的困境，廈門大學台研院長劉國深也憂心地說，兩岸沒有互信真的很危險；就雄三飛彈事件的發生，他認為大家在沒有事實依據的情況下進行過度揣測，引起兩岸民眾不必要的緊張。
劉國深表示，就雄三事件的發生後續及媒體報導內容觀察，反而是台灣內部大量藉題發揮，過度的揣測與猜想，連帶引起大陸媒體及輿論的跟風討論。