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同濟大學海洋與地球科學學院成立于2002年，其前身是創建于1975年的海洋地質與地球物理系。1982年恢復學位制后，獲得全國首批海洋地質碩士學位授予權，1983年成為當時國內高校中唯一的海洋地質學博士點。1991年批準設立海洋科學博士后流動站。1996、1998年先后獲準設立應用地球物理碩士點和固體地球物理學博士點，2004-2006年先后獲得礦產普查與勘探、構造地質學、第四紀地質學、物理海洋學、海洋化學、海洋生物學等碩士點，現共計有九個碩士點，五個博士點。學院下設海洋地質系和地球物理系，擁有海洋科學和地球物理學兩個一級學科博士授權點。
學院海洋地質學科得到國家“九五”和“十五”“211”工程支持和教育部“教育振興行動計劃（985）”支持，2000年被評為上海市“重中之重”學科，2002年被評為國家重點學科，2006年建成海洋地質國家重點實驗室；擁有以中科院院士汪品先教授為帶頭人的優秀學科梯隊，現有中科院院士一人，“千人計劃”特聘教授一人，教育部長江學者特聘教授兩人，國家杰出青年基金獲得者三人，教育部跨世紀與新世紀人才計劃入選者多人，“同濟特聘”教授多人；學院現有教授34名，其中博士生導師30名；副教授14名；另有講座教授兩名，均為博士生導師。