日前，臺“司法院”正副院長被提名人謝文定、林錦芳向蔡英文表示退出提名，蔡被迫同意並重新考慮提名人選。這意味著蔡上臺之後最重要的人事提名案遭遇遲礙。臺當局發言人及民進黨“立法院”黨團總召柯建銘均表示，“這段時間外界對兩名被提名人的批評排山倒海”，對兩人的最後選擇予以肯定和尊重。台灣新當局近期在人事方面頻頻出包，已經影響到執政聲譽和威信。
“司法院”負責人的提名一向敏感，一旦提名通過後，未來島內涉及司法問題都將以其作出的司法裁決為準，島內任何政治權力機構都無權干涉。因此，作為台灣新當局負責人，蔡英文勢必慎重思考提名人選，提選符合自己政治理念的人。由於這樣的人選易和蔡有裙帶關係，可能在司法審判中難以保持公平中立，所以引發在野黨的反彈。
同時，民進黨掌權後，諸多權位都已分贓完畢，僅剩“司法院”是主要的肥缺，不少競選時為蔡鞍前馬後的人士都盯著這塊“肉”，但蔡所提人選卻並未在競選時出力太多，導致不少民進黨內部對此頗有異議。故在外界輿論全力批評這一提名人選時，黨內也沒有人願意出面為蔡的提名背書。一向被視作民進黨側翼的政黨“時代力量”，其“立法院”黨團總召徐永明也批稱，該黨一開始就對謝文定、林錦芳不適任提出質疑，鋻於這次引發的爭議，要求蔡下次提名應與社運組織、司法改革派做好溝通，不要倉促上馬。
除了“司法院”的人事，前不久蔡英文剛剛任命江春男赴新加坡任職“代表”，卻在赴新當天晚上酒駕被查，引發輿論譁然，強烈要求撤換。蔡一度固執己見，不願換人，難耐輿論譴責壓力，直到綠營學者都開口批評，江春男自動請辭，蔡才不得不下臺階讓江走人。但因為沒有在第一時間對此事作出應對，臺當局的做法再次遭到質疑。另據島內媒體披露，鋻於民進黨上臺僅三個月，人事問題已經頻頻出包，“行政院長”林全有意對部分“部會”負責人進行微調。然而，民進黨是靠派系打天下，選後卻分贓不均，各派頗有微詞，現在最想扳倒的對象恰恰是林全。
目前看，連續的人事問題已經衝擊到蔡英文的執政權威，也影響到外界對其執政能力的評價。島內輿論指出，蔡蔡上任後民調一再下滑，用人屢出狀況，充分暴露了其執政經歷不足、經驗稚嫩的缺陷，蔡執政信賴度將大大降低。同時，人事問題已經牽動民進黨內部的權力鬥爭，蔡的人事佈局基本接近尾聲後，黨內各派系的不滿聲音逐步浮現，如果蔡不能儘快調整，勢必埋下日後政治鬥爭的隱患，成為內部裂痕擴大的導火索。更突出的問題是，人事不順將導致臺當局的施政政策遇到更多挑戰，更難提振島內經濟民生低迷的狀況，民眾寄望新當局改變經濟整體大環境的期待恐將遙遙無期。