目前憑據國際民航公約劃定，會慢會在二十八天內會有初步陳說，正常的話三到四個月內會發失事實資料呈文。
飛航安全查詢拜訪委員會履行長王興中表示，昨日共有十一名飛安會成員前去澎湖進行查詢拜訪，並會針對天氣狀態做蒐集，但失事當下的氣候狀況是不是影響到航班，必需要做全盤考量並看黑盒子內的資料才能夠做判定；但因為飛機撞擊氣力蠻大的，兩個黑盒子事實上有蠻嚴重的毀傷，可能需要花點時間做乾燥等處置懲罰再掏出來，但願裡面資料沒有被損毀。
對於復興航空澎湖空難事件，昨（二十四）日下晝機上兩個黑盒子已由飛安會人員，於下晝三點四十五分帶回台灣解讀。民航局副局長李萬里幾回再三強調，塔台只是提供其時天色環境及相關資料給機長，並指導至固定位置準備下降；是不是降落或最先下降後能可否順利落地，或是下降到一半需要重飛都是機長必需決議的，因為飛機是機長在駕駛。
對於外界質疑當時大雷雨且能見度只有八百呎，為何要讓飛機下降，李萬里指出，由於天空上的雲是一向再移動，可能前一架飛機順遂降落，但隨後雲層就移動蓋住本來下降點；機場塔台的工作只是將飛機影導致定點準備下降，起頭降落後到最後距離跑道三百三十海哩要做出重飛或降落的位置時，是要由機長依據現場是不是能看見跑道等情況來做決議。