有「港版國安法」之稱的《中華人民共和國香港特別行政區維護國家安全法》已在6月30日深夜生效，香港警察7月1日證實，當天下午已經有民眾因違反「港版國安法」被捕。不過根據香港警察自己在臉書上的說明，這名「嫌犯」並非高舉港獨旗幟、也沒有宣揚分裂國家、顛覆政府，而是因為「形跡可疑」，被警察從背包裡搜出一面「香港獨立」旗，因此落網。
據香港媒體報導，7月1日上午9時許，中聯辦外已有一批防暴警員駐守，香港警方陸續派出水炮車與裝甲車到場戒備。至中午時分，開始有示威者在現場聚集，有人揮動美國國旗。下午1時後，銅鑼灣Sogo門外出現數百人聚集，警方在現場拉起封鎖線，並舉藍旗警告在場人士。立法會議員尹兆堅用擴音器喊話後遭到警方制止，雙方發生爭執，尹兆堅隨後被警察動用胡椒噴霧壓制，雙手被上索帶後以涉嫌「阻差辦公」被捕。香港警方表示，期間有人叫喊「香港獨立、唯一出路」的口號，已經涉嫌煽動或教唆他人分裂國家，有可能違反《港區國安法》。
不過在警方發布的違法證物照片中，可以看到「香港獨立」字樣前疑似有「不要」二個小字，「Hong Kong Independence」前也加上了「No to」。屆時進入司法程序可能會成為爭辯無罪的關鍵之一。
下午1時23分，警方推進至記利佐治街，前立法會議員李卓人與在場警員發生爭執，警方噴射胡椒噴霧拘散。德新街截查一名形跡可疑的男子，在其身上搜獲一幅寫有「香港獨立」字句的旗幟。該名男子涉嫌違反《中華人民共和國香港特別行政區維護國家安全法》被捕。香港警方強調，其他在現場集結的民眾也被警告「可能違反《公安條例》及《港區國安法》」。下午接近3時，警方於銅鑼灣東角道發現一名女子正在展示「香港獨立 Hong Kong Independence」的標語，該名女子也因涉嫌違反《港區國安法》遭到逮捕。
除了被香港警方證實的幾位被捕者之外，網路上也出現多名據稱因違反「港版國安法」被捕的案例。包括銅鑼灣登龍街有一名男子在背包裡搜出多面中華民國國旗，也因涉嫌違反「港版國安法」被帶走。此外，銅鑼灣地鐵站出口也有一名男子因為喊了一句「光復香港時代革命」，馬上被警方拉進封鎖線，同樣被上索帶遭到逮捕。
雖然網路流傳的被捕案例尚未得到警方證實，但美國有線電視新聞網（CNN）引述一位警界消息人士說法，稱6月30日「港版國安法」通過後，上頭已經要求警方逮捕「任何揮舞獨立旗幟或高喊獨立口號者」，就算只是被發現持有獨立旗幟，一樣都要被逮捕。CNN也指出，紀念回歸的7月1日是香港這一二十年來的重要抗議日，但今年是回歸後警方首次不允許抗議者舉行和平示威。香港《蘋果日報》則引用律師黃宇逸說法，表示被捕男子如果只是攜帶「香港獨立」旗幟，並未公開展示，實在難以構成相關罪行。