台灣評鑑協會長久以來為落實大專校院系所品保功能，持續協助大專校院建立品質改善機制，已陸續規劃出符合學校需求的「專業學門教育認證」及「大專校院教學品保服務」等系所品質保證專業服務。
「專業學門教育認證」之特色，係輔導系所建立自我改善機制，並以永續運作為前提，加入專家諮詢，協助系所建立完整脈絡之品保循環。「大專校院教學品保服務」則著重在定期協助系所檢視現有運作機制，以及學生學習成效是否按系所設定目標發展。