會議指出，要分類指導各地做好疫情防控工作。湖北省和武漢市疫情防控事關全局。湖北省要把疫情防控工作作為當前頭等大事，採取更嚴格的措施，內防擴散、外防輸出，對所有患者進行集中隔離救治，對所有密切接觸人員採取居家醫學管理，對進出武漢人員實行嚴格管控，堅決防止疫情擴散。要切實保障湖北省和武漢市各種物資供應，確保人民群眾正常基本生活。其他所有省份要加強對流動人員的疫情監測和防控，嚴格隔離確診患者，對疑似病例和密切接觸者要按醫學要求進行隔離和檢查。各市縣鄉（鎮）要保持高度警惕，做好應急預案和應對準備，必要時立即啟動。各地要減少春節期間大型公眾活動，儘量避免人員大規模聚集。
會議強調，要全力以赴救治感染患者。要按照“集中患者、集中專家、集中資源、集中救治”的原則，將重症病例集中到綜合力量強的定點醫療機構進行救治，及時收治所有確診病人。要儘快充實醫療救治隊伍力量，把地方和軍隊醫療資源統籌起來，合理使用，形成合力。要不斷完善診療方案，堅持中西醫結合，儘快明確診療程序、有效治療藥物、重症病人的搶救措施。要加強患者醫療救治費用保障，確保患者得到及時救治，決不能因費用問題耽誤患者救治。要關心和保護好廣大醫療衛生人員，做好防護設備配置、防護措施落實。
會議強調，要及時準確、公開透明發佈疫情，回應境內外關切。要加強輿論引導，加強有關政策措施宣傳解讀工作，增強群眾自我防病意識和社會信心。要及時向世界衛生組織有關國家和地區組織及港澳台地區通報疫情信息，加強合作、全力應對，共同維護地區和全球衛生安全。