主因為交通部委託陽明海運供給8個20英呎的冰櫃和電視台SNG車，並委託海盛航運公司的「山寶貳號」貨輪協助輸送，沒想到稍早出航前疑似擱淺，在問題排除後於4點10分出航。
不過，原定24日下晝3點運抵的冰櫃遲至晚間9點30分仍未運抵殯儀館。
罹難者眷屬認屍要先到殯儀館「菊島福園」思源堂以警方供給的遺體照片指認，才能夠看屍體，合適就能夠開立死亡證明領回屍體；如遺體難以辨識，則要等法醫比對DNA相符才能開立滅亡證實領回屍體。不外家眷抱怨澎湖的冰櫃底子不夠用，馬公市公所也許諾24日下戰書會從高雄運送50個冰櫃到澎湖。
由於澎湖夏日氣候酷熱，許多遇難者家眷怨冰櫃不敷用。
復興航空GE222班機23日晚間墜毀於澎湖西溪村，造成48人不幸遇難。本來估計24日下戰書3點左右運抵澎湖的冰櫃，因為運冰櫃貨輪擱淺又産生海上故障問題，到了24日晚間仍未運抵殯儀館。