學校現有一級學科博士學位授權點8個（生物學、基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、藥學、特種醫學、護理學）、二級學科博士學位授權點54個、3個交叉學科博士學位授權點（臨床醫學工程、人文醫學、健康政策管理）；一級學科碩士學位授權點12個、二級學科碩士學位授權點67個；博士后科研流動站7個，學位授權點已覆蓋醫學、理學、工學、管理學、法學、教育學和文學等7個學科門類；擁有3個國家重點學科、1個國家重點培育學科、29個國家臨床重點專科、2個江蘇省一級學科重點學科、3個江蘇省一級學科重點培育學科。在全國第四輪學科評估中，我校公共衛生與預防醫學在全國54所參評高校中獲評A+等級。臨床醫學、分子生物學與遺傳學、生物學與生物化學、神經科學與行為學、藥理學和毒理學、免疫學、社會科學總論7個學科進入ESI全球排名前1%，其中，臨床醫學學科進入ESI全球排名前1‰。基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、藥學、護理學等6個學科立項為江蘇高校優勢學科建設工程三期項目。