發表文章及專書共計907篇，包括學術期刊文章306篇，國內外學術會議發表計295篇，及專業技術及推廣期刊文章發表計306篇，其中「土壤與肥料」專書發行第九版，已有中文、英文、韓文、馬來文等四種版本。
本研究室的研究領域包括：土壤環境生化及微生物、生物肥料、有機質肥料與介質、土壤與植物關係、土壤與環境等，主要研究項目包括如下：
本研究室分離、純化及篩選台灣本土有益微生物，包括固氮菌、根瘤菌、溶磷菌、固氮溶磷菌、菌根菌等，進行菌種機制功能及生理生化特色之研究，進而親緣分析及鑑別新菌種。菌種對作物之功能測定，包括生物分析及土壤試驗，進行作物生長及養分含量增進之效應研究。學術上，進行菌種溶磷機制及基因之研究，及非豆科與根瘤菌共生固氮之研究。
本研究室研究土壤中的腐植質之作用及功能分析，土壤碳蓄存加速之研究，有機廢棄物再生快速處理技術製成有機質肥料之研究。
本研究室利用土壤微生物之技術，進行研究解決土壤及環境的毒物質(如：連作障礙)、臭味、有機廢棄物、鹽鹼土、農藥及油污染等問題。
研究本研究室發現之新菌種特殊功能及代謝，如胡蘿蔔素zeaxanthin及氧化還原電位等。