財政部臺北國稅局表示，近來接獲營業人詢問，進口生鮮水產品有經海關代徵營業稅，銷售時是否開立應稅統一發票？
該局說明，未經加工之生鮮、農、林、漁、牧產物、副產物屬免徵營業稅之貨物。銷售免稅貨物及勞務之營業人，應依加值型及非加值型營業稅法(以下簡稱營業稅法)第8條第2項規定申請核准放棄適用免稅，始得開立應稅統一發票交付買受人；倘營業人未依前揭規定申請核准放棄適用免稅，而開立應稅統一發票交付買受人，該應稅統一發票雖於開立當期申報應稅銷售額，惟於報繳當年度最後一期營業稅時，仍應將誤開立應稅統一發票之銷售額列入免稅銷售額，於年終計算調整當年度不得扣抵比例，就其已多扣抵之進項稅額，補繳營業稅。
該局舉例說明，甲公司經營生鮮水產品批發，未申請放棄免徵營業稅，107年除了向漁民購買漁獲，也有進口大閘蟹，公司向漁民購買的漁獲免營業稅，銷售時開立免稅統一發票，而銷售進口大閘蟹時，因為進口時已由海關代徵營業稅，就依銷售額50萬元開立應稅統一發票。該開立應稅統一發票銷售額50萬元雖於開立當期已申報營業稅，但在申報107年11-12月期營業稅時，仍應列入免稅銷售額，於年終計算調整當年度不得扣抵比例，就其多扣抵之進項稅額，補繳營業稅。
該局呼籲，銷售免稅貨物或勞務之營業人，如要開立應稅統一發票，應依營業稅法第8條第2項規定，向所在地稽徵機關申請放棄免稅，如未經申請誤開應稅統一發票，亦未將誤開立之應稅發票列入免稅銷售額計算調整不得扣抵比例者，應儘速依規定自動補報補繳所漏稅額，以免受罰。