新冠肺炎疫情擴散全球，湖北武漢的海鮮批發市場被指是爆發原點。港大微生物學系講座教授袁國勇接受英國傳媒訪問時表示，他早前到武漢調查時到過華南海鮮批發市場，見到市場已經完全清理好，已經沒什麼可看；他又稱，「犯罪現場」已被擾亂，無法確認導致人類受感染的病毒動物宿主，因此他懷疑官員曾經掩飾疫情，未有即時對外公佈信息。
另外，理工大學醫療科技及資訊學系副教授蕭傑恒的團隊，為近日本港出現的確診個案進行基因排序，發現本地個案與歐洲輸入個案的基因突變特徵相似，相信新一波疫情源頭，很大機會是外地輸入。蕭傑恒表示，疫情來自至少三條傳播鏈，如銅鑼灣禮頓山一名確診男子，與一名曾入住禮頓道酒店的哈薩克返港確診機師，病毒基因幾乎一樣，推論是機師這類獲豁免檢疫人士確診後，傳染本地居民。
另外，二十六個本地樣本中，有十九個病毒株是完全一樣，並分佈在不同地區，病毒株跟來自菲律賓和巴基斯坦的輸入個案非常接近，估計這兩個國家是導致本地爆發的源頭之一。