整個廢水專責人員的訓練課程，可分為法規、理論與實務操作三大部分。先藉由基礎理論的解釋與法規的闡述，來了解廢水處理的概念，然後再進一步地學習廢水處理須具備的基本水質分析能力，並以實驗印證理論。
在課堂中，強調各種廢水處理的方法，例如現在常應用於各廠中的物理處理、化學處理、生物處理的方法及一些管制措施，在教材中都有深入淺出的介紹，另外，此訓練課程亦針對微生物學與水化學方面的知識多加描述，以增加對學科基礎的概念，使得學習更為精進充實。再加上，對水處理後續所產生的污泥處理，及對工廠內之改善措施與操作維護亦多有著墨，讓實際在廠務工作上之工程師有依循的準則。而數據統計分析更讓廢水處理中的水質數據說話，使得廢水處理的工作進行的更加順暢。
水污染防治法規的課程包括了水污染防治法、水污染防治施行細則、放流水標準、地面水體分類及水質標準、事業水污染防治措施管理辦法、環境保護專責單位或人員設置及管理辦法，除了對法規條文的講述之外，還對基本的法義與用語多做解釋，並知道如何找到最新的法規或相關的法規、辦法，使我們在實際碰到相關問題時能夠瞭解法規條文的真諦，及尋求如何解決的辦法。水污染防治許可申報及實務，將許可申報的意義、流程與表格都詳細的規範，並期待此申報能夠切實執行，以充分控制水污染程度。
水處理從方法上大致可分為物理處理、化學處理和生物處理，在教材內容上概述各處理單元，強調理論與實際應用並重，除能了解各處理方法的理論外，亦有實際應用的例子可供參考，對於各項處理方法的優缺點亦多有描述，可供比較，同時也能提供在實際應用上作適當的選擇參考。而處理單元所產生的污泥問題，也在污泥處理中提供污泥處理的流程與所遇到的問題對策，對於實際操作上有很大的幫助。
廠內改善措施，由進料、製程、管末處理…等等過程，進行減廢與污染預防的措施，使得產品品質提升、生產效率提高、污染防治完善。廢水收集及處理系統，簡述廢水收集系統的材料、設置、原則…，與處理系統的處理程度、操作與管理、處理程序之選擇…，並輔以主要事業廢水處理程序的例子加以說明，使整個概念與實際應用相結合。廢水處理廠操作與維護，結合了物理、化學及生物處理單元的操作項目與維護方法，教材中針對各處理方法，提出應該要注意的事項與其操作異常的情況，且對於維護管理方面詳加描述，可說是新手的操作指南。
水及廢水化學，將廢水處理中常見之化學反應，提綱挈領地提出，讓大家對於基礎的理論有一番了解。而環境微生物學，更讓生物指標及生物處理的方式更顯的有意義。另外，總量管制概論，提及其總量分配的原則與方法，可作為污染預防及管制的手段之一。
廢水水質分析及實習，除了教材內所提及的標準檢驗方式外，還針對BOD、COD、DO、ADMI、AA…等項目實際分析，以培養檢驗分析的能力。再加上數據統計分析能力之養成，使得各項數據都有其代表的意義，並能察覺其異常之處。
上完甲級廢水課程後，除了能增進理論基礎與實作的技能，最重要的是能窺見實際的廢水操作流程與管理維護的方法，並能在此訓練中，得到廢水處理相關的異常情況與其解決對策，讓廢水處理不再是疑難雜症。相信對從事廢水處理工作的人員，無疑地是一大幫助。