未來他上任後最重要的工作有兩大區塊，一是核一、核二除役與停役的問題，二是核廢料存放問題。謝說，他的主要專長在機械、熱能和燃料電池，新政府要推動以再生能源和新能源來取代核能，這可能也是找他擔任原能會主委的主因，而不是沿用傳統找清大核工系人才。雖然台灣未來要推再生能源，但謝曉星認為，無論推哪種能源，要作為基載電力都有相當困難，以淨煤技術來說「我們就不看好」，因為這會面臨到溫室氣體排放的問題。風能雖然價格上可以做到與燃煤相抗衝，但以雲林為例，就面臨居民抗爭問題，要做離岸風力，技術上也要看能否突破；太陽能則需要很大的土地，這部分看能否朝向複合式，亦即下面種農作物，上方裝設太陽能板，但要做基載仍有困難，「如果沒辦法，那就只能用天然氣」。謝曉星強調「萬事起頭難」，既然新政府政策就是廢核，未來就得要朝這個方向去做，「而且非做不可」，他上任後會優先解決乾式儲存槽的問題，過去民眾反彈聲浪大，主要是對政府不信任，他會將決策過程透明化，開放讓全民參與和安全監督，並建立一套完整的SOP，讓民眾恢復信任。