台灣藍綠吵翻天，但兩岸照樣互動交流。海基、海協兩會正在廣州番禺舉行第四次經濟合作例會；林中森二度訪陸，到南京和台商座談，協調解決春節返台航班不足、機票降價，並促成兩岸早設常駐機構。台北會談最精彩，紅藍綠三黨學者為兩岸互信認同激烈論辯，雙方自制相互尊重，精彩收場，令人刮目相看。吳釗燮用民調證明中共打壓台灣、意圖併吞，傷害雙方情感，使得兩岸認同下降，台灣人心更遠離中國。大陸學者並未迴避，希望逐步解決。
會談，國民共三黨數十位學者參與，重量級人物齊聚台北，紅藍綠色彩繽紛，針鋒相對，不論陳述意見、宣示立場、促求改變、提出建議，大多直言無隱，毫無避諱，尤其紅綠首度交鋒，撞擊出相當驚人的強烈火花。過去民共兩黨少有這樣的交流，雖無共識，但三方各說各話，透過傾聽彼此理解，至少能夠避免誤判或錯誤解讀對方。
民共兩黨歧見很深，不論國際空間、中華民國政治定位、民意解讀、未來發展，幾乎全無交集，期望透過學界會談獲得認同、達成共識、增加互信、藉此找到答案，那也太過天真不務實，兩岸政黨還不到建立互信的時候，但各種交流早已不計其數，像台北會談這樣的互動，只是民共學者彼此試探、摸索的第一步，未來還要溝通交流，增進理解，這樣民共可以避免誤判對方，也不致彼此錯誤解讀。
民間對話涵蓋各種層面，有專業、也有政黨立場的學者，才能傳遞思想知識，紅綠藍彼此激盪，希望兩岸和平發展，也算一種共識。至於民進黨未來和大陸交流的關鍵，要看是否修改台獨黨綱，不主張台獨、認同一個中國，中國就會跟這樣的政黨交流合作，所以現在什麼都談不上。
吳釗燮痛批中國的新版護照納入台灣、在國際上打壓台灣、用一中框架為門檻阻擾台灣進入國際組織、把台灣改成中國台灣或中國台灣省，有些甚至搶旗子、飆髒話，傷害台灣人民的感情，兩岸關係雖變好，卻也抵銷了大陸的善意，因此民調認同自己是中國人的台灣人，持續降低。吳釗燮引用ＴＶＢＳ民調，六成支持台獨，不到兩成支持統一，台灣人選總統、選國會，政府發新台幣、發護照、發簽證，在領土內行使管轄權，國家獨立存在，台灣未來只有台灣人民才能決定。希望在座中國人士認真看待，讓兩岸正確繼續往前走。
大陸學者余克禮說，這些問題大陸並未迴避，一直想解決。至於兩岸關係的民調，有些解讀因素被忽略，包括台灣部分政黨、媒體向民眾灌輸兩岸交往越多，貧富差越大，使台灣人的感受與看法脫節。因為過去雙方活在虛幻的敵意中，如今彼此心理變化還需要時間。
紅綠兩派學者砲口相向，彼此責難互轟，綠營游盈隆認為中國只有民主、自由化，才能增進兩岸認同與互信，否則無法消除分歧。游建議立即釋放劉曉波、劉霞夫婦、平反六四。大陸學者群情激憤，指稱這是強人所難。至於民主自由化，涉及大陸法律體系，等於整體推翻。大陸追求民主化的方法不同，若照搬西式模式，變成俄羅斯、菲律賓，未必對台灣有好處。北大教授徐博東說，台灣認同問題，是政黨競爭造成，民進黨主張台獨誤導台灣人向獨走，國民黨拿香跟拜、一中原則也就不斷後退，這是誤導台灣人的國族認同。