中醫全科學士學位課程目的是培育具備深厚中醫理論和基本生物醫學科學知識，掌握實際臨床診斷技能和具有開拓創造精神的中醫專業人才，適合香港地區中醫藥發展需求，並為香港市民提供優質中醫醫療服務。
課程宗旨是為學生提供有系統的專業培訓，為日後成為專業中醫師作好準備。課程內容通過香港中醫藥管理委員會之學術評審，畢業生可報考香港中醫執業資格試。
課程提供全面而有系統地學習傳統中醫理論及生物醫學科學知識，並由中醫藥學院及香港大學李嘉誠醫學院的教師講授。
學院提倡「早臨床、多臨床」，強化學生臨床技能訓練。臨床見習將安排於八所香港大學中醫藥學院臨床教研中心進行，在導師的指導下完成臨床見習及病案報告。另外，學生須按學院安排於國內著名中醫藥大學附屬教學醫院進行連續四十周的畢業實習。
在資深的教師指導下，學生可使用中醫臨床技能培訓中心及李嘉誠醫學院有關部門的教學設施，通過體驗式學習，強化學生臨床技能訓練。
學生於第一及第二年級須修讀大學核心課程， 有助學生透過不同角度深入思考及探索人類經驗。此外中醫課程亦提供一系列選修學科，有助深入探討中醫進階知識。
學生有機會在部份中醫及生物醫學科學科目進行實。另中醫藥學院亦成立多個科研小組，鼓勵學生課餘參加，以培養學生對科研的興趣。
所有大學核心課程及生物醫學科學課程均以英語授課。中醫課程、	中醫臨床見習、野外考察、中藥房見習及畢業實習等則以廣東話或普通話授課。
中醫全科學士學位課程為學生創造豐富多采的學習體驗，採用成果為本的學習，引入多種新穎的教學模式，包括問題為本學習模式及臨床病案討論。
課程重視理論結合實踐，鼓勵學生通過各種「體驗式」學習模式，	如臨床見習及國內實習，獲得更豐富多元的學習體驗，並增加實踐的機會。
中醫藥學院鼓勵學生在學習過程中多參與交流活動，擴闊個人視野及豐富學習經驗，由中醫藥學院安排之中醫本科交換生計劃便是為學生提供可貴的機會，參與計劃之學生將有機會在上海中醫藥大學進行為期一個暑期之交流學習。
此外，課程亦會安排學生到國內於野外環境中進行中草藥考察及在臨床教研中心的中藥房進行見習，以加強學生對中藥的應用知識。
持有中醫全科學士學位者可報考香港中醫執業資格試，取得合格後，便可成為註冊中醫。註冊中醫可選擇投身公私營中醫診所或私人執業，也可加入中醫藥企業、生物科技工業等機構研發中醫藥產品，或從事中醫藥有關行業之管理、推廣、營運和保險方面的工作。另外，	畢業生亦可選擇攻讀研究生課程或在大學從事中醫藥教育工作。
為表揚學業優秀的新生及在讀學生，學院透過院內及校外機構設立多個獎學金，一方面獎勵並肯定新生及在讀學生在學習方面的優秀表現，另一方面培育有志服務社會的人才投身中醫專業。
對象 ︰ 每年8位透過聯招入學並成績表現傑出的中醫全科學士一年級學生，成績最優異的學生如在其後的修學符合所需條件，此獎項將會繼續頒予該得獎人，最多為期六年。
不同於一般交換生計劃，除了解國內學習文化，結識新朋友，培養獨立能力，參與中醫本科交換計劃有助中醫學生了解國內中醫教育，加強中醫學生與國內中醫學生的交流，擴闊新一代中醫學生對中醫發展的視野。