法鼓山慈善基金會秘書長果器法師默示，期望能透過法師與義工的陪同關懷與虔敬禱告，讓受難者感觸感染到佛法慈悲而安甯的氣力，進而撫慰創傷的心靈。後續將會配合相關單位放置，在澎湖及高雄進行關切，寄望透過佛法的氣力，為社會人心帶來安甯。
除了慈濟第一時間抵達外，宗教集團法鼓山也於24日晚間抵達澎湖，並前去殯儀館「菊島福園」伴隨家族為罹難者誦念經號。
宗教整體陸續抵達澎湖，藉由頌經、念經、心理輔導等體例，寬慰遇難者家屬。