1941年〈美日太平洋戰爭〉開始，結果，日本1945年戰敗，日本被美國征服，美國是日本的唯一征服者，美國並沒有與中華民國在軍事上合作，實施對日本本土或台灣的武裝攻擊，台灣是戰後被日本依照條約所放棄的領土，台灣屬於法理上的「交戰國佔領」，日本則是因「被征服而割讓」日本領土台灣，依照《國際法》的規定，被割讓的領土必須有「和平條約」簽署完成後，才算合法而且有效。
雖然在1943年有〈開羅宣言〉以及1945年的〈波次坦宣言〉的「政治主張」，表明戰後可以將台灣交給中國，但是要注意的是，沒有正式條約明文規定，這種單純的「宣言」是沒有法理效力的，因此，作為美軍統帥的麥克阿瑟才會以台灣、澎湖居民大都是華裔血統，又因為有「政治主張」，包括1943年〈開羅宣言〉和1945年〈波次坦宣言〉，麥帥的〈一般命令第一號命令〉文件可以了解，美國是以「主要佔領權」國身分，發出命令，委託中華民國以「次要佔領權」國身分，先行佔領台灣，等待戰後「和平條約」作最後決定，不幸的是中華民國等不到戰後簽署和平條約，在1949年10月1日，被中華人民共和國以軍事武力消滅，中華民國失去其領土，逃到「佔領地」的台灣，變成「流亡政府」也失去代表中國的合法身分，當然更別提執行“宣言”的「政治主張」。而中華人民共和國根本沒有參加二次大戰，對於「台灣主權」的歸屬根本無說話餘地，同時值得注意的是「佔領不移轉主權」的《國際法》規定。
二次大戰期間，整個亞洲地區分成「太平洋戰區」與「中國戰區」，台灣是屬於「太平洋戰區」，由美國單獨實施武裝攻擊，這一點是非常重要，因為根據《戰爭法》可以確定誰是「主要佔領權」國，果不期然，美國在和平條約中被確定為亞洲地區的「主要佔領權」國，但是，《舊金山和平條約》卻沒有把台灣、澎湖的主權作移交的動作，因此，只要「主要佔領權」國沒有移交的動作，台灣、澎湖就會繼續處於「佔領狀態」，而這只是一種「暫時狀態」，法理上沒有時間長短的限制。
雖然《舊金山和平條約》，於1952年4月28日生效，日本由於本土沒有割讓問題，所以和平條約生效後，美軍立刻宣佈撤退日本佔領，恢復「日本主權」；台灣因為有「割讓」問題，所以「佔領」仍然繼續存在，這一點有部分學者誤解，看1853年「美國最高法院」對〈美墨戰〉後的加利佛尼亞的判例，說明和平條約生效後，並不表示「軍事佔領」就結束。1949年因為中國共產黨的武裝政變成功，中華民國被消滅，剩餘份子逃難至被佔領中的台灣，成為「流亡政府」，此時美國依然承認該流亡中的中華民國代表中國之合法政府，直到1978年底；美國總統與國務卿很明顯並不著急處理台灣問題，當時國際間對誰能代表合法中國？爭議很多，美國企圖等待決定以後，才處理台灣問題的態度非常清楚。
1971年《聯合國》，將政府流亡中的中華民國驅逐出去，而以中華人民共和國代表中國合法政府，美國外交政策大幅改變，在1972年2月28日，美國與中華人民共和國簽定〈上海公報〉，“認知”中華人民共和國為兩岸中國人同意的唯一中國合法政府，台灣是中國的一部分，對於這種情況，部分台灣學者有所誤區與誤解，以為美國有權力將台灣交給代表中國的中華人民共和國，事實上，完全胡說八道，美國至今沒有任何官方文件，承認台灣是中國一部分，而且根據美國‧參議院所通過的法律，台灣是不折不扣的「美國列島區第一類未合併的領土」，歸屬美國‧資源委員會所管轄，除非得到台灣人民同意，否則中國對台灣的領土野心，只是鏡中花而已；美國企圖將台灣安排在與中國的「合併軌道」上，將不會得到台灣人民的支持，台灣人民反而可以依照《美國憲法》規定將台灣建立成自己的國家。
台灣是因為被征服而割讓的領土，當進入「交戰國佔領」時期，被「主要佔領權」國美國，委託蔣介石之中華民國軍隊代為管理，以美國而言，台灣是因條約而被割讓，成為美國管轄的新獲得領土，因此台灣的預設值（default status），根據美國法律立刻成為美國「未合併領土」，由美國「軍事政府」管理，屬於「軍事政府」的“民政管理體系”，目前仍然繼續由流亡中的中華民國代為管理。