「我一定會找到金銀島！」大雄這麼對胖虎宣言後，就向哆啦A夢求救，使用道具「尋寶地圖」尋找金銀島。而地圖指示出來的位置，居然是太平洋上莫名冒出來的新島嶼……。
大雄一行人搭著名為「大雄奧拉號」的船前往金銀島，就在即將靠岸時，卻有海盜來襲！面對突然現身的敵人，大雄他們陷入一陣苦戰，此時靜香卻被抓到海盜船上了！
海盜們逃走後，大雄他們遇到了一名在海上漂流的少年「弗洛克」與機器鸚鵡「謎題」。弗洛克是從海盜船逃出來的機械工，而且知道金銀島隱藏的重要秘密！究竟大雄他們是否能夠從海盜手中救出靜香！？而沉眠於金銀島上的財寶究竟又有什麼秘密！？