春訓營裡納瓦贏得了留在紅襪小聯盟系統的機會，他被分配到了紅襪隊的高階1A 球隊，蘭開斯特噴射鷹隊，領取每個月1,100美金的薪水。
轉入正式小聯盟系統的納瓦適應並不順利，納瓦在蘭開斯特的前11個打數都未能擊出安打，前24打數只有2支安打。當納瓦在一次打帶跑的戰術執行下敲出第一支安打，總教練艾普森（Chad Epperson）開玩笑的詢問納瓦是否要保留這顆球作為紀念。
度過了開季的不順遂，納瓦又再次的把握住機會，開始在1A 層級裡展現自己的打擊實力，也逐漸從替補晉升為固定先發。總計在86場比賽裡，納瓦打出了0.341/0.424/0.523，攻擊指數0.948的佳績，同時敲出了10支全壘打與59分打點，也贏得了聯盟打擊王頭銜。
隔年納瓦原本被安排由2A 出發，但春訓的腿傷讓納瓦只能留在西岸的家中養傷。這個球季紅襪隊將高階1A 球隊由西岸的蘭開斯特移往東岸的塞倫，傷癒後納瓦就降回塞倫紅襪隊（Salem Red Sox）出發。儘管納瓦只出賽了29場，但他還是打出 0.339/0.434/0.495，攻擊指數0.930的成績。在球季尾聲紅襪隊將納瓦升上了2A 波特蘭海狗隊（Portland Sea Dog）。在32場比賽裡，納瓦延續在高階1A 的打擊狀況，0.364/0.479/0.568與1.047的攻擊指數，保送25次在12次三振搭配下更是耀眼。顯示更成熟的2A 投手依舊無法阻擋納瓦的全方為打擊能力。
但由於納瓦的年紀遠比其他正常的1A 、2A 球員都要來得大，同時過去資歷實在不夠顯赫，讓包括Baseball American、Soxprospects.com等小聯盟媒體都未曾將納瓦列入潛力新秀名單中。
由於納瓦在2A 的優異成績，讓他在2010年的春訓營中獲得在大聯盟熱身賽的出賽機會，也讓納瓦成為這個球季優先遞補入大聯盟的可能球員之一。
除了防守，納瓦在春訓營裡也加強自己的打擊技巧，特別是身為左右開弓的打者，如何保持在本來板兩側都能有穩定的表現是納瓦強化的重點。在春訓中的分組對抗賽裡，納瓦將紅襪隊先發投手雷基（John Lackey）的來球給轟出全壘打牆外，過去兩個球季穩定的成績與春訓的表現，讓納瓦在新球季裡跨過2A 直接挑戰更高等級，從3A 的普塔基特紅襪隊出發。
普塔基特紅襪隊的打擊教練培瑞（Gerald Perry）在納瓦的大聯盟路佔了很重要的地位。當大多數紅襪隊教練還沒將納瓦與大聯盟做出連結時，培瑞率先向總教練羅夫洛（Torey Lovullo）提出這個想法。這個想法由培瑞、羅夫洛逐漸擴散到農場總管韓森，讓納瓦成為紅襪農場裡外野的明日之星。