2008年11月，台北市政府表示，由於牽涉到古蹟保存和位於河川行水區的問題，兒童樂園計畫在2011年遷移至士林區基隆河新生地，與台北市立天文科學教育館、國立台灣科學教育館、美崙公園等設施相鄰。台北市政府也再次宣布，已經選定美崙公園、台北市立天文科學教育館、國立台灣科學教育館旁邊約5公頃基地，斥資新台幣20億元興建「兒童新樂園」。在臺北市立兒童育樂中心遷往士林之後，圓山舊址因位於圓山遺址及行水區，會移交臺北市政府文化局作為圓山文化園區。
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