行政院農業委員會家畜衛生試驗所動物用藥品檢定分所化學藥品檢定研究系實驗室認正計 畫，於 87 年初收集相關資料，7 月起經請食品工業研究所輔導，確立施行大綱及方向，撰寫認證 相關軟體：實驗室品質手冊及其相關文件、儀器標準校正/操作程序、測試作業規範、實驗室紀錄表單及檢測紀錄，實驗室並據以配合進行檢驗業務及經內部稽核、外部稽核、模擬評鑑等程序後，於 88 年 6 月檢具資料向中華民國實驗室認證委員會提出認證申請。現申請案件獲受理後，正式報 名，經初訪並等候 88 年 11 月 18 日現場評鑑。
87 年 5 月行文食品工業研究所（食品所），循求給予實驗室認證之協助，5 月 29 日由該所傅 偉光博士及張惠淑小姐前來分所化檢系，先行瞭解本系業務。經建議本實驗室應先建立品質手冊， 利用文件化方式，以利追溯報告數據，同時亦需作內部稽核工作，追蹤整個系統是否已制度化管 理，是否具有成效。外部稽核方式，邀請具相關經驗之業務先進，針對特定項目或以大的方向來 進行評估，先將整個系統建立後，再經由分析細目來逐步進行完成，比如可以先從儀器之 SOP 開 始執行，分析方法盡可能以公定方法為依據，如以自行開發的方法，則須先作驗證後再送 CNLA 審查。為了使認證工作順利進行，先由各檢驗人員提出 4~5 個檢驗成分給予專家輔導，利用 HPLC 分析方法，與藥典雷同及檢驗頻率較高者為優先，並在往後一年中，編列三十萬元之經費請輔導 員來動物用藥品檢定分所輔導，以便輔導作業繼續進行，先通過輔導員之評估後，再提出申請。 經數次評估最後決定申請輔導內容以化學領域為主。