牛津學堂這所著名的中西合璧建築，為馬偕博士所設計、督工，不僅充分表現馬偕博士一向追求的中西文化交融理想，也反映了當時的時代、社會背景。其建築形式採台灣傳統四合院大厝，兩進兩護龍的格局，正門前有傳統民居「凹壽」的前廊，而前檐卻有西式「女兒牆」的作法，左右兩廂護龍也是西式圓拱形「雨 披」的門窗和百葉窗。屋頂雖是傳統台灣紅瓦斜屋頂，卻有西式的氣窗，並冠有西式教堂的小帽尖(Pinnale)，而小帽尖又是中國尖塔的造型。正身與兩廂 護龍之山牆也有傳統廟宇的泥塑鵝頭飾，但圖飾卻是西式的波浪與船錨。
牛津學堂的建材、磚、福杉來自福建廈門，三合土則以蒸熟的糯米加石灰、烏糖汁搗製而成的台灣傳統建材，與馬偕博士合作的匠師，據傳是當時淡水著名的土水師 洪仔泉。 牛津學堂百餘年來，是台灣神學院、淡江中學、真理大學的搖籃地，也曾做為教室、宿舍、圖書館、禮拜堂，今日則是史蹟館，建築體也經歷多次修葦，目前第二進 屋舍已拆除、中庭也加建、門窗也修改不復舊觀，但大抵仍保持原建面貌，以至被政府指定為二級古蹟，堪稱是台灣近代史上的重要建築。