在臺大攻讀學士時期，葉雲旗全心全意投入學習和研究，常常在實驗室奮戰到深夜。「一般人對農業化學系會有先入為主的觀念，好像跟農業扯上關係，就很落伍。」事實上，葉雲旗認為臺大農化系在第二次大戰期間就已經擁有很好的實驗室，設備及課程都相當先進，這個時期的學習也替葉雲旗打下絕佳的科學基礎和研究實力。「我和太太也是在這時候認識，而後結為連理的」，雖然葉雲旗的太太是河洛人，岳父是杜聰明醫師的得意門生鄭傳對醫師，在族群和身世背景的差異下，葉雲旗的好學上進還是讓他力排「河洛女兒要嫁入客家人家」的反對聲浪，在親友祝福之下找到一生的伴侶。