本學程包括必修課程及選修課程兩大部份(表一)。必修課程為(一)通識課程: 海洋科學概論、海洋環境概論、地球科學概論 (以上三科擇一)，(二)初階課程:物理海洋學、化學海洋學、海洋地質學、海洋生物學、海洋量測與實習(以上五科擇三)。選修課程包括海洋所各教學分組提供之U字頭課程。其他可抵免課程包括大氣科學系、地質科學系、生命科學院、工程科學及海洋工程學系等系所之相關課程(列如表一)，但全部抵免以二科六學分為限。
本學程應修總學分為二十學分以上，且必須符合本校學程設置準則第四條規定，即學生修習本學程科目學分，其中至少應有九學分不屬於學生主系、所、加修學系及輔系之必修科目。