埔里鎮平埔族群包含了巴宰、噶哈巫、道卡斯、巴布薩、巴瀑拉、洪安雅族，於1820年（清道光元年）左右遷徙移入今天的埔里盆地，「埔里」這地名便有學者解釋，是許多平「埔」各社最集中的鄉「里」，因鄰近山區為賽德克族、泰雅族、布農族生活場域，平埔族群聚落位置，成了漢人與高山族群間的緩衝。
從崎下往愛蘭台地行駛，可見到巴宰族群馬賽克拼貼，上面拼著Auran、Alisai兩字，埔里「愛蘭里」，舊稱「烏牛欄」，即平埔族巴宰族的「烏牛欄（Auran）社」（原居於台中豐原）移居於此，有住在水邊的意思；Alisai音近阿里史，或又稱Lalusai則有兔子很多的狩獵場或是竹筍集散地意涵。
埔里還有「房里」地名，也是原本在苗栗苑里的道卡斯族的「房里社」族人遷居於此而得名，根據文史工作者調查，泰雅族早期居住埔里，由於西部平埔族人移入，迫使部分族人往更山區遷移，埔里的「守城份」便是以前泰雅族人居住地稱Slna Lucos，是洗衣之意；而埔里的「史港坑」，泰雅族稱Vare Valu，是芭蕉之意；另有「蜈蚣崙」，係泰雅族叫Pocao Larot，是食雞之意。
而有些地名係根據地形，如牛相觸係因鄰近二山呈現對峙狀，猶如兩牛牛角碰觸；牛眠山則因山形近似眠牛之貌故名，至於愛蘭台地從國道六號愛蘭交流道遠眺，就像是一艘陸地上的船，有埔里船山之名。對於埔里地區平埔文化研究深入的文史工作者簡史朗表示，樂見聚落居民為地名正名，如此才能與傳統歷史文化產生聯結，對文化傳承有正面意義。