在年輕而具自信的布思羅伊德的帶領下，沃特福德昂然返回英超。俱樂部在2005年3月決定讓這名前利茲聯教練執教，當時的確惹來不少質疑，但他最終順利引領球隊通過附加賽後重返超聯。
在2005/06賽季以第3名完成英冠聯賽，排名僅次於雷丁及謝菲爾德聯，沃特福德在附加賽先將水晶宮淘汰，再在決賽中以3-0輕取利茲聯，獲得升級資格。隊中關鍵球員包括以21粒進球成為該季英冠神射手的馬龍．金，及從非聯賽組別球隊加盟，但表現大獲讚賞的中後衛德梅里。
1993年，沃特福德重建維卡列治球場為全座位球場，為球隊發展的一大里程碑，不過到1999年才首次升上英超作賽。他們在英超的首個賽季開局非常理想，分別作客擊敗利物浦，及於主場戰勝切爾西，當時的主教練格雷厄姆．泰勒更兩度打破俱樂部轉會費紀錄，簽下伍特及赫爾庫森。不過其後成績卻下滑，在聖誕節後更跌至榜末位置，4月尾前已篤定降級。前切爾西球星維亞利在其後一季接任主帥一職，更籤入8名新球員，不過球隊表現一般，主教練席位也由盧因頓代替。雖然在盃賽偶有佳作，但聯賽成績卻停滯不前。直到布思羅伊德上任後，他簽入馬龍．金代替轉會富勒姆的赫爾庫森，其進球更助球隊再次回到頂級聯賽。
1898年西赫茨合併了沃特福德聖瑪莉，創立了沃特福德足球會。今次收購證明是正確的決定，1903/04賽季他們取得不敗的成績，到1920年時沃特福德更正式升上足球聯賽。1922年他們移進維卡列治球場作賽，在第一次世界大戰後期的12年間，分別有9名主教練上任。
1959年，沃特福德將球隊的顏色轉為黑色及金色，其後一季，球隊名將霍爾頓打進了42球，創下俱樂部紀錄。1969年，他們首次升級至乙組，不過到1975年他們卻再次跌落丁組。自從其後艾爾頓約翰爵士成為俱樂部主席後，替球隊注入不少資金，而前鋒布利斯特、主教練格雷厄姆．泰勒及中場巴恩斯也在其後數年相繼加盟，沃特福德終在1982年首次晉身甲組，更在後來獲得歐洲聯盟杯及足總盃決賽資格。
不過格雷厄姆．泰勒在1987年辭職後，由巴西特帶領，球隊卻跌回乙組。艾爾頓約翰在1987年將其股份售予佩奇治，改任終生榮譽會長。1997年，艾爾頓約翰再次收購俱樂部，1999年再由格雷厄姆．泰勒帶領球隊首次晉身超聯，不過球隊在其後一季降級，艾爾頓約翰在2002年再次離任。2006年，他們在附加賽決賽擊敗利茲聯，再一次重返英超。