在台北簽署的海運直航、平日包大陸貨運機、直接通郵、食品安全四協議，兩岸空運直航、海運直航和直接通郵2008年12月15日正式啓動。這標志著兩岸“三通”基本實現，是兩岸關系發展取得的重大進展。
一年來，閩台之間的客貨運直航、郵政直航取得了顯著成效，達到了海空並進、人貨並舉、多點直航的目標。
今年1至11月，兩岸直航集裝箱吞吐量達140萬標箱，其中閩台直航集裝箱吞吐量爲47。59萬標箱，占兩岸直航集裝箱吞吐量近40%。1至11月，閩台之小三通間海空運載旅客量已達140。2萬人次，居大陸各省市之首。
福建是大陸最早與台灣直航的省份，早在上世紀90年代就成功運作三種海上通航模式：一是福州港、廈門港與台灣高雄港間海上集裝箱班輪試點直航(台方稱境外航運中心定點直航)；二是兩岸三地彎靠運輸；三是福建沿海地區與金門、馬祖、澎湖間客貨直航。
2008年12月15日，福州、廈門、物流公司泉州港啓動了與台灣本島的海上貨運直航。今年以來，甯德、松下、秀嶼、肖厝、漳州港也先後實現了與台灣本島的貨運直航。至2009年11月底，8個對台直航港口已完成對台貨物吞吐量2100。05萬噸，集裝箱吞吐量47。59萬標箱。