皈依並不是說世間的東西不要，如醫生、貿易等，而是將這些作為我們存活的幫助條件，但絕不是以這個為主。如果跟佛法有矛盾衝突的地方，一定得要採取佛法的概念，不再照世間的方法，譬如醫生叫你吃藥，你一定聽他的，假定你吃素，他叫你吃肉，那你不聽他，假如你還沒有持齋，那另當別論。如果信得過三寶，凡是跟三寶不相應的、違背的所有種種，自然而然就會拿掉，邪勝解漸漸輕微，乃至永遠滅盡。現在我們在學習當中，的確很多見解對三寶並不認識，起心動念仍在惡法邪解當中，所以要隨時警惕自己，不要隨便看了點書，聽見一些什麼，就隨便開口，應該依善知識勤學，如理思惟觀察，慢慢深進，弄清楚應該怎麼做，盡形壽不離依止。
皈依以後，從此行為就正，因為行正，將來感得的果一定美妙，得入「正至善士數」中，也會得佛及如法行持者，乃至於對聖教淨信的諸天所愛戀歡喜。平常我們常說不要得罪人，修學佛法之後，很多概念行為，跟世俗是有不一樣的地方，碰到兩者不能同時善巧處理的時候，「顧全了不得罪人，卻得罪了佛菩薩」；或是「不得罪菩薩諸天，要得罪人」，你願意取哪一個？世間最長不過百年，儘管會得罪人，但成就皈依使諸佛菩薩歡喜，這個概念非常重要。
阿底峽尊者及寂靜論師判別內外道的差別，都以皈依為根據；皈依了以後正式進入佛門，叫內道，在沒有捨棄之前就算是佛弟子。皈依最主要的是得皈依體，就是對於三寶從內心深處一心一意的皈投依靠。我們反省一下自己遭遇痛苦的一般反應，受到一點點的委屈，或被人家埋怨了幾聲，不是當面跟他辯、跟他吵，就是在背後嘀咕；或是稍微有點病痛，趕快求神問卜、找醫生買藥吃；世間一般常態如此，修學佛法以後，了解這不是究竟，要脫苦，只有如理皈依三寶，把苦從根拔起，這才是圓滿解決之道。
真正皈依了以後，不是浮浮泛泛的，行相上是學佛，實際上所學的卻跟佛了不相干。如理的皈依，是當苦現起時，不管遭到什麼事情，自然而然只有一心念佛，跟佛訴冤，思惟到一切法的現起都有它的前因後果，知道被埋怨了是自己的錯，是以前種下的惡因，今天還了他，無債一身輕。如果生了病，知道世間本來一無可取，病是死因，趕快多念幾聲皈依，到極樂世界可以品位高升。
靠著思惟，從內心深處接受三寶、至心皈投依靠，自然很多事情隨時起心動念，有一個特別「依體起用」的狀態，會依著三寶告訴我們的方式作為行事的準則，如此一定能得大好處。