要保護USB記憶棒（下稱USB手指）內的資料，最簡單的方法，是將檔案壓縮並加上密碼。市場上亦有一些內置硬件加密的USB手指，透過軟件作為操控介面，為USB手指內的資料加密。最近，Toshiba就宣佈推出內置AES 256-bit軍用級加密標準的USB手指，分別有4GB（PFU004D-1BEK）、8GB（PFU008D-1BEK）、16GB（PFU016D-1BEK）及32GB（FU032D-1BEK）型號可供選擇。
Toshiba Encrypted USB Flash Drive加密USB手指，與市面上其他具備加密功能的USB手指不同之處，是內置一個微型鍵盤以及充電池，使用手指之前，只要先鍵入正確密碼，再插入電腦上，USB手指就能自動解鎖；而當USB手指從電腦上拔出，儲存在USB手指上的資料便會自動鎖上。同時，USB手指亦針對胡亂撞密碼的機制，只要連續10次輸入錯誤密碼，手指內的資料便會完全清洗及無法復原。
Toshiba Encrypted USB Flash Drive 4GB、8GB、16GB及32GB的網上售價分別為60、90、120及180美元。