中國首都北京自6月11日起，陸續通報多起疑似與當地食材批發市場有關的本土確診案例。北京疫情防控工作領導小組宣布，「北京已進入非常時期」，防止疫情反彈和蔓延的形勢十分嚴峻，疫情擴散風險很高，部分城區啟動「戰時機制」。疫情捲土重來，讓不久前才調降防疫等級，幾乎恢復到正常運作的北京民眾再度陷入恐慌緊張不安的情緒。
美國哈佛大學醫學院、波士頓公衛大學及波士頓兒童醫院的研究指出，從衛星影像分析，武肺病毒在武漢傳播開來的時間可能遠早於中國官方宣稱的2019年12月底。團隊分析發現醫院停車場自2019年8月起停車輛陡增，在12月達頂峰。同一時間，中國搜尋引擎百度上關於「咳嗽」和「腹瀉」的搜尋量也大增。
前英國軍情六處（MI6）處長迪爾羅（Richard Dearlove）於上週三（6 月 3 日）在英國《每日電訊報》的廣播訪問中宣稱他見到一份「重要的」新報告，內中顯示武漢肺炎病毒是中國科學家在實驗室所為，後來「意外」洩漏而導致當前的疫病大流行。
HIV病毒的共同發現人、2008年諾貝爾生醫獎得主蒙坦尼耶​​（Luc Montagnier）於4月16日表示，導致武漢肺炎的SARS-CoV-2病毒​可能是由中國​武漢的​實驗室意外流出​。當時​武漢的實驗室可能打算以冠狀病毒​攜載HIV病毒來測試愛滋疫苗​，但在2019年最後一季的某個時刻意外洩漏了病毒。
《彭博社》以及《紐約時報》分別在2020年4月1 和2日報導，美國中央情報局（CIA）至少從2月初開始就一直警告白宮，中國大大低估了武漢肺炎的疫情，而這也影響了美國對於抗疫資源編制與期程的預測模型。2名不願透露身份的官員表示，這份未公開報告得出的結論是，中國的數字是假的，而且中國政府未真實報導案件和死亡事件是故意的。