本院係民國89年國立嘉義技術學院與國立嘉義師範學院整併為國立嘉義大學時所新設之學院，教育理念乃在發掘每一位學生的潛能，教導成為德術兼備的專業管理人才，使其先天之秉賦與後天之努力，得以發揮最大效用，對社會以至對人類帶來正面的貢獻；教學首要目標強調以「學生學習效果」為中心，重視培養學生獨立思考與獨立判斷的能力，建立學生寬廣的視野與服務的人生觀。
89學年度設有企業管理學系、應用經濟學系、事業經營學系（90學年度更名為生物事業管理學系）、管理研究所碩士班；90學年度成立行銷與流通管理研究所碩士班、管理研究所碩士在職專班；91學年度成立休閒事業管理研究所碩士班；92學年度成立資訊管理學系、管理研究所博士班、管理學院碩士在職專班（管理研究所碩士在職專班調整）；93學年度成立資訊管理學系碩士班；94學年度管理研究所博士班分組招生（分為「一般管理組」及「休閒事業管理組」）、休閒事業管理研究所碩士班分組招生（分為「商業休閒組」及「遊憩資源管理組」）。
95學年度成立應用經濟學系碩士班、生物事業管理學系碩士班；97學年度成立休閒事業管理研究所博士班、財務金融學系；98學年度休閒事業管理研究所更名為觀光休閒管理研究所；99學年度成立管理學院學士學位學程，行銷與流通管理研究所與原理工學院運輸與物流工程研究所整併更名為行銷與運籌研究所；100學年度成立外籍生全英文授課觀光暨管理碩士學位學程；101學年度行銷與運籌研究所與管理學院學士學位學程整併更名為行銷與運籌學系(含研究所)；103學年度行銷與運籌學系運籌組併入企業管理學系；104學年度觀光休閒管理研究所與行銷與運籌學系整併更名為行銷與觀光管理學系；107學年度應用經濟學系碩士班停招；108學年度成立財務金融學系碩士班。
為提昇競爭力，在歷任院長周逸衡教授（89.02.01-92.07.31）、吳秉思教授（92.08.01-93.01.31）、蔡渭水教授（93.02.01-93.07.31代理）、黃柏農教授（93.08.01-95.07.31）、蔡渭水教授（95.08.01-98.07.31）、劉豐榮教授（98.08.01-99.01.31代理）、黃宗成教授（99.02.01-104.01.31）、艾　群教授（104.02.01-104.04.30代理）及李鴻文教授（104.05.01-104.07.31代理、104.08.01-迄今）努力整合校內外相關資源，承接委託研究及個案輔導診斷服務。管理學院之發展特色，不僅建構學生核心能力，在理論基礎與實務應用上，創造就業競爭優勢；再則整合學院豐沛資源，在教師教學與課程規劃上，跨系支援發揮綜效；最後強化產學合作能量，在專業輔導與產業創新上，善盡大學社會責任。長期以來努力實踐以管理專業知識服務社會，已在產業建立起實務導向之領導地位。