原子科學研究所是清華在臺灣復校所設立的第一個教學單位。1955年中美兩國訂立原子和平用途協定，政府決定設立原子科學研究機構，由梅貽琦校長籌組清華大學研究院籌備委員會，勘定校址於新竹，創辦原子科學研究所，1956年招收第一屆研究生。
梅校長對於圖書館藏相當重視，日記中多處提到圖書的採購、進口與安置等事宜。短短二三年間，累積600多冊原子能相關的西文圖書，可說是清華在台最早的專業學術設備。而日記中持續出現，最令梅校長費心懸念的，就屬核子反應器(原子爐)的興建了。負責原子爐建築體設計與監造的張昌華先生是北京清華大學部第一屆校友(1928級!)。2001年接受校史同仁訪談時提到，原子爐的土木工程技術乃軍事不傳之密，老先生當年發揮老祖先「格物」精神，克服萬難，終於建造了經得起921地震考驗的核子反應器。這份精采的口述歷史全文已公佈於數位校史館網站。
1961年四月水池式原子爐首次臨界，標誌著國家科學發展的里程碑。只是梅貽琦校長此時已經積勞成疾，只能在台大醫院的病床上聆聽廣播報導，而後於次年辭世。梅校長半生歲月都在極為艱苦的條件下領導著清華，「梅」也成了清華的代號。今年適逢清華與交大兩校「梅竹賽」四十週年盛會，本期館訊又以原子科學為主題，便與大家分享有關梅校長的校史故事。