工學院現有土木、機械、環工、化工、材料五個學系及精密工程、生醫工程二個研究所，另設置機械實習工廠、工程科技研發中心、金屬研發中心、智慧自動化暨精密機械研究中心等四個附屬單位；另於107年8月起成立電機資訊學院，原電機工程學系、光電工程研究所、通訊工程研究所與理學院資訊工程學系調整至該院。
本院各系所以教學與研究並重：教學方面採理論與實務相互配合，並以培育人才、促進國內外學術交流與合作為方針；研究方面則以創造提昇學術工程科技水準，促進產業技術發展，建立與中部科學園區及中台灣產業研發合作為宗旨。院內的重點發展科技分成可增加產值的精密機械、奈米與特殊物化材料、高分子工程、生醫工程等高科技工程，以及可減少損失的防災暨減振科技與環境保育等工程技術。本院各系所之教學研究圖書與儀器相當齊全且不斷更新，學生表現卓越，院內更推動執行多項跨校暨系所的教育改進計畫。本院教師致力於研究發展，成果卓越且已獲國內外學術界肯定；至107年度止有四位教授榮獲科技部傑出研究獎，每年平均每位教師發表3.01篇SCI及EI級論文，每年獲得研究及建教合作經費補助超過參億元。此外，本院各系所及附屬單位經常開設工程專業訓練班、講習班及國內外研討會，並招收工程人員至本院各研究所進修，成效斐然。