FreeFileSyn 的主要特色如下：
根據日期或位元組的大小進行檔案的比對和同步。
可對任意數目的檔案進行同步。
子資料夾亦可同步，包括空的資料夾。
支援網路資料夾的比對和同步。
使用者介面僅顯示必要的功能，不會出現一些雜七雜八的選單或圖示。
以拖放方式選取資料夾。
自動儲存上次的設定和螢幕設定。
雙擊檔案可在檔案總管中顯示該檔案。
支援右鍵功能表。
支援複製和貼上來匯出檔案一覽表。
根據檔名、大小、日期進行檔案的排序。
直接在主視窗刪除暫存檔及不必要的檔案。
支援 4GB 以上的檔案。
顯示統計資料：總檔案大小、根據目前設定所要進行移動的位元組大小。
其他許多實用的檔案管理功能。
注意：程式安裝並啟動後，介面為簡體中文，請從「進階」→「語言」選取正體中文。