惟城巴機場快線發生交通意外的次數較頻繁，加上近年新路線開辦，使其車隊供應較緊張，間中就會出現一兩次「E車（普通巴士）行走A線」的情況。至於城巴A10線，由於該線班次較疏落、港島總站遠離停泊城巴機場快線車輛的柴灣車廠，故當出現巴士故障或交通意外之時，經常會臨時抽調港島的普通巴士行走。 在2016年，因城巴機場快線車輛數量不足，經常出現「降級服務」，受到乘客和區議員的批評；此情況初時主要出現於A10線，原因是該線專用的猛獅NL262（1560-1569）於2016年4月提早退役（全新訂購的Enviro500 MMC Facelift 12.8米（6800-6811）延至同年12月才正式投入服務），因此該線長期派出丹尼士三叉戟 12米（2209-2285）及 Enviro500 MMC 12米（8507-8536）行走，直至城巴高層在區議會投訴後以行政指令要求只可使用豪華巴士行走，此現象蔓延至A12線，再加上2016年間各條城巴機場快線先後獲批准使用12.8米巴士（除A10線），令降級情況擴至所有路線；至同年底及翌年上述豪華版新車（6800-6811及額外加訂的6812-6836）投入服務才有所改善。