國內高中畢業學生申請前往大陸就讀大學的人數連年增多，今年多所高中更是暴增好幾倍，台北市建國中學校長徐建國和桃園市武陵高中校長林清波等明星高中校長，為畢業生寫推薦信並發表相關言論後，竟然接到教育部、調查局等單位關切電話。此舉不免被質疑是把「敵我意識」帶入兩岸教育界。
武陵高中是桃園的高中第一志願，今年多達47人申請中國的大學，為去年的5倍，其中還有可以直接保送台大物理系的學生，但仍選擇參加學測，申請北京大學元培學院。林清波指出，國教署得知武陵申請大陸大學的人數暴增後，就受到部會簡訊「關切」，甚至有調查局長官來訪，希望他能以學校的立場說明突然暴增的原因，林清波則回應，學校並無倡導及鼓勵，寫推薦信只屬被動滿足學生需求，至於目前的教育環境人才拔河是趨勢，與其圍堵，高層該做的是找出對策。
林清波也強調，政府應該強化教育能量，吸引及培育代代人才，大學教育更是要努力，因為人才是屬於世界的；看到孩子去申請國外的學校，好比去美國、英國、加拿大、新加坡等國家讀書，其道理跟去大陸讀書是一樣，若把大陸當成政治實體來看，就會因為政治敏感，而覺得是敵對關係，人才應是拉回，而不是推出，主政者心態必須要改變。
建國中學校長徐建國也說，這幾年台生赴陸就讀人數逐漸增加，今年又比去年成長速度更甚，確實也有比較多學生請他寫推薦信，以港、美、中國等居多，今年他寫的推薦信中，申請赴香港約30多人，中國70多人，美國因部分是透過網路及書面推薦，故請他推薦的學生較少，僅不到10人。學校也接到部會兩次來電關切，被問及有無鼓勵或勸學生去或不去國外就讀，當時因校長徐建國人不在，是由秘書代接後事後經轉述得知。校方在電話中回應，學生若要申請赴國外就讀，程序並不會經過學校，所以學校也不會這麼做。
至於被問及是哪個「中央部會單位」來電，徐建國略帶迴避地說，不是教育部、陸委會也不是調查站，據了解是專門監督行政機關的單位。對於這兩通電話的來意，徐建國表示，關心當然是可以的，要分析原因為何也是好事，但是如果對學校的行政處理有不信任的情況，當然就比較不好了。他認為辦學最重要的事情是把學生照顧好，讓他們未來能就讀合適的大學，至於學生與家長要如何想如何做，實在不適合過多干預。
而台南女中校長鄭文儀表示，也有被詢問到，但他認為應該只是了解，並沒有這麼嚴重；台南一中校長張添唐也說，學校的立場純粹就是為學生生涯輔導，只要學生有意願出國念書，都很樂意幫忙寫推薦信，他也表示目前已為35名有意赴大陸讀書的學子寫推薦信。
教育部次長姚立德則回應，確實有科長跟林清波等人接觸並瞭解狀況，他也提到，高中畢業生到世界各地優秀大學就讀，有助於代表台灣在未來與世界競爭，一部分的學生選擇到同文同種的中國讀書無可厚非，但是人數如果突然增加許多就需要重視，國教署基於權責所在，還是應進一步瞭解詳細情況，至於其他單位的情形，則無從得知。