先講外觀上的不同，神社係有鳥居，而寺院則只有佛像跟一些墓碑。
喺神社入口，基本都有鳥居，用作區分神靈嘅世界和人世間嘅建築。
係寺院，有和尚，尼姑等信仰佛教嘅修行者、還放置有佛像，如：釋迦如來、聖觀世音菩薩等很多類佛像。這些大家都不能在神社找到架！
神社係屬神道，而寺院係屬佛教。
神道起源日本；信仰中不但包括日本不同嘅神靈，更包括自然萬物（如：山、林、石等）。對於同時信仰不同物件或人物嘅日本人來說，這完全是沒有違和感的；因日本人相信萬物都有它嘅靈、神靈是無處不在架。多神主義係日本獨特文化之一。