(一)進口生醫產業原料(如細胞株、免疫細胞、臨床檢體、毒化物等)之通關，應檢附輸入許可文件。進口人於進口前預先向簽審主管機關(農業委員會、衛生福利部、行政院環境保護署等)申請輸入許可文件，詳情請參考生醫產業原料進口報關作業流程流程圖。辦理進口申報時，將所取得輸入許可證號碼(14碼)，填入進口報單欄位，海關電腦系統會將報單內容及輸入許可證號碼，透過關港貿單一窗口，傳送至簽審主管機關進行單證比對，比對相符，即可進行徵稅放行作業。
(二)為加速生技原料通關作業，貨物進口前可先向海關申請稅則預先審核，詳細情形請參閱本署網站「稅則稅率查詢/稅則預審相關資料」，並向貨品主管機關申辦輸入許可文件；海關與各簽審機關均設有聯絡窗口，貨物通關時，如遇有簽審問題，可透過該單一窗口即時解決通關問題，有關單一窗口聯絡資訊，可至本署網站「貨物通關服務/電話傳真語音服務/各機關與海關業務有關之聯絡人及電話」下載；如對進口生醫原料之稅則有疑問，可逕洽稅則諮詢窗口(附件(docx檔案))。