‧1988年以後，蘇聯瀕臨瓦解，亞美尼亞和亞塞拜然對「納哥爾諾-卡拉巴赫」的歸屬問題又重起爭執，1989~1994年間雙方發生了所謂的「卡拉巴赫戰爭」。蘇聯正式瓦解是1991年，該年「納哥爾諾-卡拉巴赫」宣布從亞塞拜然獨立，但國際間並不承認，1992年戰鬥趨於激烈。由於血緣關係，土耳其支持亞塞拜然，伊朗則由於同屬伊斯蘭教什葉派的關係，也支持亞塞拜然；然而亞美尼亞的背後有俄羅斯的撐腰，最後，亞美尼亞獲得勝利，占領了「納哥爾諾-卡拉巴赫」全境外還占領了亞塞拜然的許多領土，亞塞拜然人都遭驅離。這場戰爭造成了三萬人的死亡。