歐盟執委會前貿易顧問Stephen Adams表示，FTA與歐盟會員根本上的不同點在於FTA為一種在簽約國間獨立存在之協定。若英歐均堅持在雙方協定中堅持自主權，將對英國所要求之貨品及金融服務業互相承認造成限制。 FTA通常具有仲裁機制，可對違約方進行製裁，但並無權利迫使雙方遵守協定。相較之下，歐洲法庭有權強制歐盟會員國遵守共同法規。
英國政府近期公佈之脫歐衝擊報告中顯示，在以FTA取代現行歐盟會員權利下，受衝擊最大產業將為化工業、汽車業、零售及批發服務業。而英國受衝擊最大之地區將為上述產業密集區，其中包括英格蘭東北區。英國Sussex大學英國貿易政策研究中心(UKTPO)曾模擬在FTA下，其所增加之非關稅障礙為英國製造業所帶來的影響。對歐盟出口較少之業者(如起司與意大利麵製造商)，很可能因此得到更多的保護，但出口歐盟密集之高科技業，如汽車與航空製造業則可能遭受損失。倫敦經濟學院也在一項研究報告中強調，倫敦部分地區與英國東南部之金融及商業服務業密集地區，預期將受到脫歐所帶來之關稅及非關稅障礙增加最嚴重之打擊。
由於愛爾蘭與英國貿易關係緊密，若與英國間之貿易障礙增加，愛爾蘭將成為歐盟會員國中受脫歐影響最大之國家。荷蘭智庫CPB 荷蘭經濟政策分析局(CPB Netherlands Bureau for Economic Policy Analysis) 預期愛爾蘭經濟所受之衝擊將與英國一樣大。 CPB也表示，金融服務貿易對國家經濟相較重要之國家，包括馬爾他、塞浦路斯及盧森堡，也將受到嚴重打擊。根據Bertelsmann Stiftung分析，歐盟最大經濟體德國，由於其汽車製造業仰賴英國供應商，也將因此受到嚴重影響。
幾乎所有公開的預測都表明，在FTA下英國經濟產出將低於脫歐前。其國內生產總值累計損失估計將由2030年的相對低點0.6%上升至7.8%。證據顯示，消除貿易壁壘通常會導致貿易量增加，使大多數經濟學家推論在英國與歐盟間僅存FTA的情況下，雙邊貿易將較現況減少。英國國家經濟社會研究院(National Institute of Economic and Social Research, NIESR)預估，在FTA下，英國GDP在2030年前將降低1.9-2.3%。由於歐盟與英國之貿易佔歐盟國民所得較英國小，因此採行FTA對歐盟之經濟影響預期將較英國小。