中科臺中園區於2017年5月18日與水保局簽訂國內第一個大型開發之水土保持示範區合作協議，中科與水保局籌設之全國首例水土保持示範區，將結合園區廠商台積電、友達、康寧、巨大公司等共同參與推廣，可提供訪客更豐富的參訪內容，結合學術理論與實務應用，促進土地合理利用，減免因開發而造成災害，落實水土資源保育永續理念。
2003年中科落腳於大度山臺中縣、市交界的西屯及大雅地區，開發當時就已將山坡地水土保持的安全納入考量，非常注重園區開發的水土保持規劃與施作，並結合生態工法設計與施工。同時也考量周邊居民及園區進駐人員休憩需要，將滯洪池設計為兼具休閒運動公園及營造濕地生態景緻，目前臺中園區共設置10座大型滯洪池，面積達52公頃，滯洪容量超過法規規定50年洪水頻率的設計標準，大幅提高保護標準來到200年洪水頻率，可提供園區及下游地區嚴密的保護。
二林園區自2008年11月獲行政院核定籌設開發計畫，最終在2018年5月23日通過二階環評，並於9月17日舉辦「中科二林園區開發工程與進駐廠商聯合動土典禮」。在開發過程中，由於外界有許多不同之意見，因此二林園區在2015年進行更嚴格的二階環評，以消弭長期以來與環保團體及當地民眾的疑慮，且由引進產業以光電(面板)為主產業之目標，轉型為以精密機械為主之產業園區，並排除引進面板、晶片及LED製造業，除放流水量由每日12萬噸降為2萬噸外，更加嚴管制放流水質，例如銅濃度標準為0.15mg/L，為國家放流水標準(3mg/L)的1/20，對環境負荷已大幅減輕。
環保與經濟的兩難及土地正義的衝突是臺灣近年來面臨的困境，本局於協調過程中，積極傾聽民意，把希望留在原地的居民，朝原址保留努力外，農地部分則以地換地，集中整理在相思寮聚落旁一塊2公頃左右方整農地，另外也承諾整修農田灌溉水路、新闢道路，現在這些工程都已經完成。中科在兼顧大環境變化、經濟發展、農工需求、環境友善及地方心聲，朝向低用水、低排放之新世代二林園區，可以兼顧鄉親居住權益及農耕需求，創造經濟發展與農業共存共容，共創多贏之先例及典範。
目前第一期17家進駐廠商約能創造6,000個工作機會，未來二林園區結合中部地區大度山黃金縱谷精密機械產業聚落向南延伸，藉精密製造優勢發展智慧機械產業，將有助於擴大產業群聚效應，繁榮彰化地區並引領臺灣智慧機械產業發展。