高職院校“文化育人”的口號已叫喊了多年，但效果一直不夠理想。除了社會負面影響、發展壓力在身、工科教育背景、缺乏人文教育的經驗和人才儲備等因素外，在認知、主體和工作方法上存在的“錯位”現象，也加劇了高職人文教育的“效果損耗”。
高校建立黨政兩套體系本是為了發揮兩種管理資源的優勢，但一直以來，高校形成了“黨政分開”、一個抓思想一個管業務的工作習慣；加上高職院校行政領導在校企合作、專業建設、雙師隊伍乃至基本建設等“發展難題”上壓力在身，十分忙碌，這就導致高職院校開始重視文化育人後，這項工作自然演變成由黨委主管的宣傳、工會、學工等部門為主，通過技能文化節、社團活動、志願者服務、暑期實踐等第二、三課堂，把活動搞得轟轟烈烈、熱熱鬧鬧。
與此同時，行政系統在制訂人才培養計劃、分析教學質量、完善教學考核工作時，基本上還是就專業談專業，就技能談技能，沒有把對學生綜合素質的培養目標、教學設計和考核指標列入議程，導致課多面廣、與就業關係密切、對學生影響較大的專業課程，少有文化育人的自覺和相關內容的融入。
與之相應，在各類文化育人的研究、論壇會議上，忙碌其中的主要是黨委系統宣傳、學工、團學、工會、思政、總支等部門及人員，和第一課堂關係緊密的行政分管領導、專業負責人等很少現身。
如此“分工”帶來的問題：一是占據絕對優勢課時和“第一課堂”地位的專業課，忽略了文化育人的最大載體和施教平臺；二是“第一課堂”都不重視“專業與素質”的結合，二、三課堂的活動效果難免游離於專業之外，出現就文化談文化、就活動搞活動的“兩張皮”現象；三是由於“分工”太開沒有實現“勁往一處使”，容易導致分管第一課堂與分管第二、三課堂領導在時間、精力、場地以及資金方面的認識分歧和行動掣肘。
目前，高校思想文化教育的效果普遍不理想，除了社會負面因素影響外，高校人文社科、思想政治課教師生活“圈子”太小，脫離火熱的生產生活實際，滿足“三點一線”的安穩生活也是一個重要原因。“高大上”的思想教育內容，和麵臨就業競爭壓力、希望掌握就業本領的學生心理缺乏互動，講課宏大敘事不貼人氣、遠離社會不接地氣，口無遮攔不傳導正氣，使得學生難以樹立起對核心價值觀的“主心骨”認知；走向社會後，那些“正確的”思想教育內容，很容易在多樣、現實的社會問題面前風流雲散。
高校的黨組織以及黨委管理的組織、宣傳、工會、學團等職能部門，承擔著把執政黨的政治意圖具體落實到高校基層單位的政治使命。中央、省、市關於政治、經濟、文化、社會和生態“五位一體”政策精神的傳遞，以及上級部門頻繁多樣的各類任務和考核，使得高校黨組織很容易處在疲於應付、滿足完成“規定動作”的狀態上，至於這些“學習”、“活動”和“上報材料”在多大程度和學校的中心工作相關，容易出現思考較少辦法不多的情況。
當前高校黨建工作存在的主要問題，不是重視不重視的問題，而是方法適應不適應的問題，是黨建與業務工作“兩張皮”現象能不能有效解決的問題。解決黨建工作方法問題的著力點，就是要探索解決好黨建工作和中心工作的“結合點”，提高黨建工作的滲透力、說服力和貢獻度。
從杭州職業技術學院的實踐來看，一是在思想和體制上理順關係，在校黨委提出的文化育人問題上，黨、政班子不僅要“同心”，互相支持，而且要“共事”，共同擔當。二是把文化育人工作的重點，放在教工“師德師風”、學生“職業素養”這兩個與隊伍建設、技能培養密切相關的中心工作基點上。三是引導二、三課堂的素質教育“貼近”技能教育。目前看來，學校已經走出了一條高職院校文化育人的有效道路。