申請進入生態保護區從事環境教育活動者,請使用墾丁國家公園生態保護區環境教育語音申請暨查詢系統，鍵入申請地點，進入日期(進入日期以申請日起六週內為限)。進入人數，連絡電話及身份證字號等資料，即可完成申請。另為顧及幼童安全七歲以下兒童不准進入，但因特殊理由需要,必須由家長陪同並至管理站出具切結書後始可進入。進入生態保護區從事環境教育活動人員，每日核准人數以四百人為原則。管理處得依區內生態環境狀況及經營管理上的需要，酌情調整核准進入之人數。並得視生態保護區內的生態環境狀況每年定期關閉一至二個月停止環境教育活動，並實施保育養護工作.關閉起迄日期,管理處事先公佈。為減輕活動人員對生態環境的衝擊及便利區內各項設施的維護，每週二關閉一天停止受理申請。
南仁山生態保護區活動範圍以管制站至南仁湖畔沿線步道,進入時間為上午八點至下午三點，離開時間為下午五點三十分。經獲准進入生態保護區進行環境教育活動人員，需先至管理處聽簡介及注意事項，方可進入生態保護區。經許可進入生態保護區之人員憑身份證件，向管理站換領出入證配帶於胸前，並應隨時接受國家公園警察及管理人員之查核。