其畫以人物、佛道最負盛名,論者謂,在明末人物畫家中，丁雲鵬與陳洪綬、崔 子忠成鼎足之勢。早 年人物畫工整秀雅，晚期趨于沉著古樸，前後變化可從存世的《媛擋熊圖》及《三教圖》(均藏故宮博物院)中窺知一斑。山水畫也有一定造詣，在師法宋元基礎上,自具風格。早期雋秀,晚期古拙，以平整為法。亦能作蘭草，有《楚澤流芳圖》(故宮博物院)存世。後世流傳他的作品，有不少是偽作。而台北故宮博物院所藏錢選《盧同烹茶圖》實為丁雲鵬手筆。丁雲鵬生活于雕板、製墨業發達的徽州，還為書刊畫了不少插畫，對于新安木刻畫的發展起到了一定作用。
另外，《程氏墨苑》《方氏墨譜》中之圖繪大半出其手筆。