根據『南瀛采風』:善化區在荷蘭時代叫『目加溜灣社』，因在灣里溪旁，故清朝時稱臺南府安平縣灣裡街，設『巡司』統轄。日治時期，實施民政，改為『臺南 縣灣裡辦務署』。1897年編入大目降辦務署，改為『灣裡辦務之署』，1899年實施街庄區制度，分善化里東區及西區，設區長統轄。1920年實施地方制 度，西區合併為『善化庄』，置庄役場，1940年升格為善化街，設街役場，1945年二次世界大戰後改為『善化鎮』。 2010年12月25日升格改為臺南市善化區。
根據『善化市都市計畫通盤檢討報告書』:善化舊名灣裡，大正九年（1920年）改稱為 善化庄，昭和十五年（1940年）升格為善化街，二次世界大戰後改制為善化鎮。2010年12月25日縣市改制直轄市升格改為善化區。善化早於鄭成功時代 即以半農半兵之開拓政策與先民在平埔族為交易商人漸集於此，逐漸發展成鄉街經濟中心，昭和十一年（1936年）實施市區改正，擴展交通路線並於昭和十六年 （1941年）樹立都市計畫。二次世界大戰後政府旋即訂定善化都市計畫，於民國四十五年核定實施至今。
根據『臺灣鄉土之旅』:善化區原稱『灣裡街』。為西拉雅 平埔族目加溜灣之『大武壟社』(番俗六考作『大壟社』) 。十七世紀初受荷人教化，明末漢人入墾後，向大內鄉頭社村遷移。明鄭時期稱『善化里』。清乾隆年間時復稱『灣裡街』，由漳州人胡楚等人渡海來此，繼續開 發。康熙五十六年(一七一七年)撰修的諸羅縣志載『灣裡溪街、灣裡社街，俱屬善化里』，故街市大量形成可能在清康熙末葉期間，日治時代，因騎在明鄭隸屬 『善化里』、清領末期分為善化里東、西堡，故改稱『善化庄』。
根據『三級古蹟善化慶安宮』:在西元1629年荷蘭人伐目加溜灣社(即今善化)後，於西元1636年在此開設『荷語教習所』(一稱天主教堂) 傳授荷語(新港語)，並掘『荷蘭井』供飲用水用，現本廟牌樓前留有『荷蘭井』之遺跡可資佐證。