1998年開始注意到八掌溪口與急水溪口這兩河口間，在每年四月初至五月期間，有鳳頭燕鷗過境停棲。起初僅數隻到來，而後數十隻，在四月中旬高達300~400隻為最大量，一直到五月出又下降至數十隻群，到六月份大都飛離，明顯是春過境鳥，在全年其他月份僅偶爾記錄到一兩隻。
因常拿出此討食的畫面來作解說，因而對此隻鳥印象特別深。去年（2000）8月7日從新聞報導看到梁皆得先生在馬祖所拍攝到的「黑嘴端鳳頭燕鷗」繁殖的畫面時，才驚覺此鳥曾經在八掌溪口看過並且拍到過。於是將片子一一調出來看過。在幾張片子中有一隻此種鳥，樣子極似電視及報紙所刊載的。嘴黃色，尖端明顯一段黑色。有點黑色鳳頭，但額頭頂一大片白，似禿頭。這些特徵在當時看到時就留意到，卻被其討食的行為所誤導，認為一隻年輕的一齡亞成鳥，而其形態又似鳳頭燕鷗，因此草草的認定為鳳頭燕鷗的亞成鳥，其他特徵並未留意有何不同。直到暴發這瀕臨絕種的鳥在馬祖被發現繁殖時，才有機會仔細區分黑嘴端鳳頭燕鷗與鳳頭燕鷗的差異。
除上述嘴與頭頂不同外，黑嘴端鳳頭燕鷗的體被羽色淡淡的灰，較鳳頭燕鷗的灰黑色雪白多了。另停棲時，黑嘴端鳳頭燕鷗的翼尖約與尾等長而鳳頭燕鷗翼尖明顯較尾長，這些都是可辨識的特徵。