在一六○三年（明萬曆三十一年）呂宋華人二萬三千餘人遭受屠殺，又在一六三九年（明崇禎十二年）再次集體屠殺華人，明朝政府均視若無睹，任人宰割，也無力問罪。　鄭成功對在呂宋的西班牙人不滿，計劃遣使招降，如予拒絕，即派兵略取。　當時在呂宋的漢人有數十萬人，人數並不比台灣少，所以在一六六二年派使多明我會（Dominn kus）羅馬神父李科羅（Victorio Riccio）為代表，（李科羅在一六五四年自馬尼拉航抵廈門，蒙鄭成功特准，建立教堂，舉行公開禮拜。）攜有鄭成功對呂宋總督（Mararique de Lara）國書一份，威嚇呂宋當局，意要出兵協助呂宋華人。　「大明總統使國姓爺寄馬尼拉總督曼利克。特。喇喇之宣諭：
永曆十六年三月七日　國姓爺」 西班牙人見到國書（五月五日，陰曆三月十八日）後大驚，立即以施以集體屠殺在呂宋的華人，數以萬計。　事後西班牙人怕鄭成功攻擊，乃命使者隨李科羅來台灣乞和。　鄭成功知華人遭到集體屠殺後，大怒即時決定遣兵南征呂宋，但竟一病而歿，再來就是鄭氏王朝內的王位爭奪，無力攻菲。又滿清入主中國，向來無海權觀念，同時也視漢人為外人，決無加以援手之理，如此無人繼承鄭成功維護海外華人權益的遺志。在呂宋的華人又一次的遭受大規模集體屠殺。