埔里的南港溪是埔里唯一尚未水泥化的溪流，近年來因淤積與水患問題，政府預計分三階段在台北搬家南港溪流興建高達3公尺的河堤，現今第一段興建的河堤已讓附近生態改變，未來還要興建至埔里盆地最東端的出口，勢必造成環境的改變。
經過居民一年多以來的調查，附近台北搬家公司河岸有很多的鳥種，同一時間最多有的鳥種大概有50多種，也有三種保育種，像紅尾伯勞、台灣八哥 ，這附近有出現過菱角鳥。如此多的鳥類證明，這裡場域適合這些生物棲息。此外河川內也有保育類動物，當然也有像台灣白魚、埔里中華爬岩鰍，這些都是保育類還有蝦姑、石賓還有蝦子、螃蟹。許多居住於此地的居民兒時都有到溪流戲水的回憶。