Louis Pasteur'ün beş çocuğu vardı. Üç tanesi çocukken tifodan öldü.
Pasteur, 1849'da Marie Pasteur (kızlık soyadı Laurent) ile evlendi. O, Strasbourg Üniversitesi rektörünün kızıydı ve Pasteur'ün bilimsel asistanıydı. Birlikte beş çocukları oldu ve bunlardan üçü çocukken öldü.[184] En büyük kızları Jeanne 1850'de doğdu. 1859'da Arbois yatılı okulundayken 9 yaşında tifodan öldü. 1865'te 2 yaşındaki Camille karaciğer tümöründen öldü. Cécile'i yatılı okuldan eve getirmeye karar verdikten kısa bir süre sonra, ancak o da 23 Mayıs 1866'da 12 yaşında tifodan öldü. Yalnızca Jean Baptiste (d. 1851) ve Marie Louise (d. 1858) yetişkinliğe kadar hayatta kaldı. Jean Baptiste, Fransa ve Prusya arasındaki Fransa-Prusya Savaşı'nda asker olacaktı.[185]
Louis Pasteur'ün kaç çocuğu vardı ve kaç tanesi tifodan öldü?