Metinde, Alacakaranlık Diyarı'nın gerçek hükümdarı olarak Midna ortaya çıkar.
Usta Kılıcı kazandıktan sonra, Link onu kurt formunda tutan büyüden arındırılır, Gölge Kristalini elde eder. Şimdi her iki form arasında geçiş yapmak için kullanabilen Link, Midna tarafından Alacakaranlık Diyarı ile Hyrule arasındaki bilinen tek geçit olan Gerudo Çölü'nün derinliklerinde yer alan Alacakaranlık Ayna'ya yönlendiriliyor. Ancak, aynanın kırık olduğunu keşfediyorlar. Oradaki bilgeler, Zant'ın onu yok etmeye çalıştığını açıklıyor, ama sadece parçalara ayırmayı başardı. Sadece Twili'nin gerçek hükümdarı Alacakaranlık Ayna'sını tamamen yok edebilir. Bir asır önce Triforce'u çalmaya çalışan Gerudo lideri Ganondorf'u infaz ederken Alacakaranlık Diyarı'na sürgün etmek için kullandıklarını da ortaya çıkardılar. Castle Town'da buluştukları bir yeraltı direniş grubunun desteğiyle Link ve Midna, Ayna'nın kayıp parçalarını geri almak için yola çıktılar ve enfekte oldukları kişileri yendiler. Portal restore edildikten sonra Midna'nın Alacakaranlık Diyarı'nın gerçek hükümdarı olduğu ortaya çıktı. Zant onu şu anki haliyle lanetlediğinde gasp etti. Zant ile yüzleşmek, Link ve Midna, Zant'in Hyrule fethetmede Zant'in yardımını isteyen Ganondorf ile bir anlaşma yapmasıyla mümkün olduğunu öğrendi. Link Zant'ı yendikten sonra, Midna Erişmiş Gölgeler'i kurtarır, ancak Ganondorf'un ölümünün onu lanetten kurtarabileceğini öğrendikten sonra Zant'i yok eder. Hyrule dönersek, Link ve Midna Hyrule Kalesi'nde Ganondorf'u bulmak, cansız Zelda kafasının üstünde asılı. Ganondorf Zelda'nın bedenini ele geçirerek ve sonunda bir canavara dönüşerek Link savaşır, ancak Link onu yener ve Midna Zelda'yı diriltebilir.
Alacakaranlık Diyarı'nın gerçek hükümdarı olarak kim ortaya çıkar?