Leipheimer, yang menempati urutan teratas keseluruhan ketika usai perlombaan tahapan ketiga Rabu, memimpin 49 detik di depan pembalap Inggris, David Millar, pada akhir perlombaan itu.
Leipheimer, who seized the overall lead after Wednesday's third stage, had taken a 49-second lead over Briton David Millar into the final stage.