CHARACTERIZING A GLATIRAMER ACETATE RELATED DRUG PRODUCTThe present invention provides a process for characterizing a glatiramer acetate related drug substance or drug product comprising the steps of: a) obtaining a batch of the glatiramer acetate related drug substance or drug product; b) immunizing a mammal with a predetermined amount of a glatiramer acetate related drug substance or drug product; c) preparing a culture of cells from the mammal of step b) at a predetermined time after immunization; d) incubating cells from the culture of step c) with a predetermined amount of the glatiramer acetate drug related substance or drug product of step a); and e) determining the level of expression of at least one gene disclosed herein or determining the level of biological activity of the cells of step c) as disclosed herein, thereby characterizing the glatiramer acetate related drug substance or drug product of step a).A process for characterizing a glatiramer acetate related drug substance or drug product comprising the steps of:a) obtaining a batch of the glatiramer acetate related drug substance or drug product;b) immunizing a mammal with a predetermined amount of a glatiramer acetate related drug substance or drug product;c) preparing a culture of cells from the mammal of step b) at a predetermined time after immunization;d) incubating cells from the culture of step c) with a predetermined amount of the glatiramer acetate drug related substance or drug product of step a) ; ande) determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of genes regulated by glatiramer acetate drug substance or drug product in Gene Expression Omnibus accession number GSE40566; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of Ecml, Presl, Pdlim4, Gpr83, Ifng, 1124, LOC100046608 , Gm590, Gprll4, Tmie, Rasgrpl, Myo6, Pfkp, Uspl8, Arl4c, Als2cl, 2810410P22Rik, Arl5a, Gbp2, Rasgrpl, Ankrd37, Tpil, 4930583Hl4Rik, Ifit3, LOC667370, Klhdcl, Cd247, Igfbp4, 0as2, Bclllb, Fscnl, Ctsg, Mpo, Prtn3 , Lyzs, Emrl, Chi311, Anxa3 , Hp, Lyz2, Lyz, Ferll3, Sirpa, Cd63, Clec4n, Clec4d, EG433016, Stfal, Chi313 Ngp, S100a8, S100a9, Clecsf9, Saa3, 5033414K04Rik, Slc7all, Slpi, Cdl4, Fpr2 , Fcgr3, F10, Gpnmb, Tgfbi, Mmpl4, Slcllal, C3, Gpr84, Acta2, Lcn2, Hmoxl, Tpsabl, Ccl4, 112, Inhba, Cxcll, Serpinb2, Uppl, Gprl09a, Gp38, Illb, Cxcl2, Ilia, Ccl3, 6720418B0lRik, 5830496LllRik, Cd8bl , Fcgrt, LOC385615 and Scml4; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of CD40, CD86, GA A3 , HLA-DMA, HLA-DMB, ICOS, IFNG, IFNGR2 , IL2, IL13, IL4 , IL18, IL12RB1, IL17A, IL17F, IL18R1, IL2RA, IL2RG, IL4R, IL6R, TBX21, TGFBR2 , TNF , FOXP3 , ILlORB, KLRDl, CD69, LTB, CD83, PRF1, CAMK2D, LTA, FSCNl , TLR7 , CSF2 , CCR7 , FASLG, ILIA, CCL5 , CD8B, CXCL10, TLR2 , CCL4 , TLR7 , IGHAl , IL24, S0CS1, OAS1, JAKl , PTPN2 , IFITMl, IFI35, STAT2 , BCL2, MVD, FDPS, SQLE, NSDHL, DHCR24, Acat2/Acat3, MSMOl , LSS, CYP51A1, NFKBIE, PIK3R1, PPP3CC , CD3D, IL2RB, PTEN, CD3G, ICOS, CAM 2D, NFA 5 , LAT, I K, H2-M2, FASLG, LIF, IGHAl, PRKACB, SGKl , MAPKll, TSC22D3, JUN, FKBP5 , ADRB2 , MAP3K1, MAPK12, POU2F1, SMARCA2 , CDKNlA, TGFB3 , HSP90AA1, DHCR24, CCR5, and CXCL9 ; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of Foxp3 , 112, Ilia, Illb, C3 , S100a8, S100a9, Cxcl2, Cxcl3, Ccl4, Ccl3 and Cdl4; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of the genes presented in Table 8; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of the genes presented in Table 10; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of FoxP3, GPR83, CD14 , TLR2 , IFNG, CD40 and ILlB; determining the level of expression of at least one gene selected from the group consisting of the genes presented in Table 12; or determining gene set enrichment analysis for genes associated with at least one cell type selected from the group consisting of FoxP3+ CD4+ T cells, CD4+ T cells CD8+ T cells, gamma delta T cells, natural killer T cells, CD4+ CD8+ T cells, macrophage cells, monocyte cells stromal cells, multi-lineage progenitor cells, dendritic cells, fibroblastic reticular cells, fibroblasts and granulocytes,thereby characterizing the glatiramer acetate related drug substance or drug product of step a) .
글라티라머 아세테이트 관련 완제의 특성조사본 발명은 하기 단계를 포함하는, 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제의 특성조사 공정을 제공한다: a) 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제의 배치를 얻는 단계; b) 사전결정된 양의 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제로 포유동물을 면역시키는 단계; c) 면역화 후 사전결정된 시간에 단계 b)의 포유동물로부터의 세포 배양물을 준비하는 단계; d) 사전결정된 양의 단계 a)의 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제를 단계 c)의 배양물로부터의 세포와 인큐베이션하는 단계; 및 e) 본 명세서에 개시된 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나 본 명세서에 개시된 단계 c)의 세포의 생물학적 활성 수준을 결정함에 의해, 단계 a)의 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제의 특성을 조사하는 단계.하기 단계를 포함하는, 글라티라머 아세테이트 관련 원제(drug substance) 또는 완제(drug product)의 특성조사 (characterizing) 공정: a) 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제의 배치를 얻는 단계; b) 사전결정된 양의 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제로 포유동물을 면역시키는 단계 ;c) 면역화 후 사전결정된 시간에 단계 b)의 포유동물로부터의 세포 배양물을 준비하는 단계; d) 사전결정된 양의 단계 a)의 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제를 단계 c)의 배양물로부터의 세포와 인큐베이션하는 단계; 및e) 유전자 발현 옴니버스 수탁 번호(Gene Expression Omnibus accession number) GSE40566에서 글라티라머 아세테이트 원제 또는 완제에 의해 조절되는 유전자로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; Ecm1, Pres1, Pdlim4, Gpr83, Ifng, Il24, LOC100046608, Gm590, Gpr114, Tmie, Rasgrp1, Myo6, Pfkp, Usp18, Arl4c, Als2cl, 2810410P22Rik, Arl5a, Gbp2, Rasgrp1, Ankrd37, Tpi1, 4930583H14Rik, Ifit3, LOC667370, Klhdc1, Cd247, Igfbp4, Oas2, Bcl11b, Fscn1, Ctsg, Mpo, Prtn3, Lyzs, Emr1, Chi3l1, Anxa3, Hp, Lyz2, Lyz, Fer1l3, Sirpa, Cd63, Clec4n, Clec4d, EG433016, Stfa1, Chi3l3 Ngp, S100a8, S100a9, Clecsf9, Saa3, 5033414K04Rik, Slc7a11, Slpi, Cd14, Fpr2, Fcgr3, F10, Gpnmb, Tgfbi, Mmp14, Slc11a1, C3, Gpr84, Acta2, Lcn2, Hmox1, Tpsab1, Ccl4, Il2, Inhba, Cxcl1, Serpinb2, Upp1, Gpr109a, Gp38, Il1b, Cxcl2, Il1a, Ccl3, 6720418B01Rik, 5830496L11Rik, Cd8b1, Fcgrt, LOC385615 및 Scml4로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; CD40, CD86, GATA3, HLA-DMA, HLA-DMB, ICOS, IFNG, IFNGR2, IL2, IL13, IL4, IL18, IL12RB1, IL17A, IL17F, IL18R1, IL2RA, IL2RG, IL4R, IL6R, TBX21, TGFBR2, TNF, FOXP3, IL10RB, KLRD1, CD69, LTB, CD83, PRF1, CAMK2D, LTA, FSCN1, TLR7, CSF2, CCR7, FASLG, IL1A, CCL5, CD8B, CXCL10, TLR2, CCL4, TLR7, IGHA1, IL24, SOCS1, OAS1, JAK1, PTPN2, IFITM1, IFI35, STAT2, BCL2, MVD, FDPS, SQLE, NSDHL, DHCR24, Acat2/Acat3, MSMO1, LSS, CYP51A1, NFKBIE, PIK3R1, PPP3CC, CD3D, IL2RB, PTEN, CD3G, ICOS, CAMK2D, NFAT5, LAT, ITK, H2-M2, FASLG, LIF, IGHA1, PRKACB, SGK1, MAPK11, TSC22D3, JUN, FKBP5, ADRB2, MAP3K1, MAPK12, POU2F1, SMARCA2, CDKN1A, TGFB3, HSP90AA1, DHCR24, CCR5, 및 CXCL9로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; Foxp3, Il2, Il1a, Il1b, C3, S100a8, S100a9, Cxcl2, Cxcl3, Ccl4, Ccl3 및 Cd14로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; 표 8에 제시된 유전자로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; 표 10에 제시된 유전자로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; FoxP3, GPR83, CD14, TLR2, IFNG, CD40 및 IL1B로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; 표 12에 제시된 유전자로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 유전자의 발현 수준을 결정하거나; 또는 FoxP3+ CD4+ T 세포, CD4+ T 세포 CD8+ T 세포, 감마 델타 T 세포, 자연 살해 T 세포, CD4+ CD8+ T 세포, 대식 세포, 단핵구 세포 간질 세포(monocyte cells stromal cell), 다중-계통 전구세포, 수지상 세포, 섬유모 망상세포, 섬유아세포 및 과립구로 구성된 그룹 중에서 선택되는 적어도 하나의 세포 유형과 연계된 유전자에 대한 유전자 집합 농축도 분석(gene set enrichment analysis)을 결정함에 의해, 단계 a)의 글라티라머 아세테이트 관련 원제 또는 완제의 특성을 조사하는 단계.