KRAS PRIMERS AND PROBESThe present invention provides oligonucleotide primers or probes for the detection of a mutation of the KRAS gene. The invention also provides a method for detecting a mutation in the KRAS gene using the oligonucleotide primers or probes disclosed therein. Furthermore, the present invention encompasses a method for predicting the sensitivity of a tumor in a patient to epidermal growth factor receptor-directed chemotherapy, comprising obtaining DNA from the tumor; and determining whether there is a mutation in codon 12 and/or a mutation in codon 13 in exon 2 of the KRAS gene in the DNA using a method utilizing at least one of the oligonucleotide primers and/or probes of the present invention.An oligonucleotide selected from:(a) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofGTCAAGGCACTCTTGCCTAAGT (SEQ ID NO: l) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(b) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofGGCCTGCTGAAAATGACTGA (SEQ ID NO:2) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(c) a labeled oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence of 6FAM-CAACTACCACAAGTTT (SEQ ID NO:3) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(d) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofAGGCACTCTTGCCTCCGT (SEQ ID NO:4) or an oligonucleotide substantially identical thereto; (e) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofGCCTGCTGAAAATGACTGAATAT (SEQ ID NO:5) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(f) a labeled oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence of6FAM-CTCCAACTACCACAAGTT (SEQ ID NO: 6) or an oligonucleotide substantially identical thereto; (g) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofCTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTAA (SEQ ID NO: 7) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(h) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTTT (SEQ ID NO: 8) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(i) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTAT (SEQ ID NO: 9) or an oligonucleotide substantially identical thereto; (j) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofTATAAACTTGTGGTAGTTGGAGGTGT (SEQ ID NO: 10) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(k) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofTGAAGATGTACCTATGGTCCTAGTAGGA (SEQ ID NO: 11) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(1) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofGTCCTGAGCCTGTTTTGTGTCTA (SEQ ID NO: 12) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(m) a labeled oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence of 6FAM-TAGAAGGCAAATC AC A (SEQ ID NO : 13) or an oligonucleotide substantially identical thereto; (n) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGATA (SEQ ID NO: 14) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(o) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGGTC (SEQ ID NO: 15) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(p) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGTTT (SEQ ID NO: 16) or an oligonucleotide substantially identical thereto; (q) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofAAACTTGTGGTAGTTGGAGCAGA (SEQ ID NO: 17) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(r) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofAACTTGTGGTAGTTGGAGCAGC (SEQ ID NO: 18) or an oligonucleotide substantially identical thereto;(s) an oligonucleotide consisting of a nucleotide sequence ofCACAAAATGATTCTGAATTAGCTGTATC (SEQ ID NO: 19) or an oligonucleotide substantially identical thereto; and(t) a labeled oligonucleotide consisting of 6FAM-TCAAGGCACTCTTGCCT (SEQ ID NO:20) or an oligonucleotide substantially identical thereto.
ＫＲＡＳ 프라이머 및 프로브본 발명은 KRAS 유전자의 변이를 검출하기 위한 올리고뉴클레오티드 프라이머 또는 프로브를 제공한다. 본 발명은 본 명세서에 개시된 올리고뉴클레오티드 프라이머 또는 프로브를 사용하여 KRAS 유전자에서 변이를 검출하기 위한 방법을 제공한다. 더욱이 본 발명은 표피 성장 인자 수용체 지정된 화학요법제에 대한 환자의 종양의 감수성을 예측하기 위한 방법을 포함하고 상기 방법은 종양으로부터 DNA를 얻는 단계; 및 본 발명의 올리고뉴클레오티드 프라이머 및/또는 프로브 중 적어도 하나를 이용하는 방법을 사용하여 DNA에서 KRAS 유전자의 엑손 2에서 코돈 12의 변이 및/또는 코돈 13의 변이가 있는지 여부를 측정하는 단계를 포함한다.(a) GTCAAGGCACTCTTGCCTAAGT (서열번호:1)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드; (b) GGCCTGCTGAAAATGACTGA (서열번호:2)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(c) 6FAM-CAACTACCACAAGTTT (서열번호:3)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 표지된 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드; (d) AGGCACTCTTGCCTCCGT (서열번호:4)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(e) GCCTGCTGAAAATGACTGAATAT (서열번호:5)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드; (f) 6FAM-CTCCAACTACCACAAGTT (서열번호: 6)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 표지된 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(g) CTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTAA (서열번호: 7)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(h) AATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTTT (서열번호: 8)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(i) GAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTAT (서열번호: 9)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(j) TATAAACTTGTGGTAGTTGGAGGTGT (서열번호: 10)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드; (k) TGAAGATGTACCTATGGTCCTAGTAGGA (서열번호: 11)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(l) GTCCTGAGCCTGTTTTGTGTCTA (서열번호: 12)로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(m) 6FAM-TAGAAGGCAAATCACA (서열번호: 13)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 표지된 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(n) TGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGATA (서열번호:14)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(o) AATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGGTC (서열번호:15)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(p) TGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGTTT (서열번호:16)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(q) AAACTTGTGGTAGTTGGAGCAGA (서열번호:17)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(r) AACTTGTGGTAGTTGGAGCAGC (서열번호:18)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드;(s) CACAAAATGATTCTGAATTAGCTGTATC (서열번호:19)의 뉴클레오티드 서열로 이루어진 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드; 및(t) 6FAM-TCAAGGCACTCTTGCCT (서열번호:20)로 이루어진 표지된 올리고뉴클레오티드 또는 이와 실질적으로 동일한 올리고뉴클레오티드에서 선택된 올리고뉴클레오티드.