COMPOSITIONS AND METHODS FOR DIAGNOSING LYME DISEASE AND FOR PREDICTING LYME DISEASE SPIROCHETE ELIMINATION AFTER TREATMENTCompositions and methods are provided for detection, diagnosis and prognosis of Lyme disease (LD), including a method for confirming Borrelia spp. infection by contacting, in vitro, whole blood samples from subjects suspected of having LD with synthetic peptides comprising T-cell epitope-containing regions derived from Borrelia proteins that are expressed at different stages of Lyme disease, and indirectly detecting LD-specific activated T-cells by determining production of a T-cell immune response indicator (e.g., interferon-[gamma]) in response to stimulation by the peptides. Also disclosedare methods for predicting elimination of LD spirochetes in LD patients who have undergone LD treatment, by exposing whole blood samples from such subjects to peptides comprising specific T-cell epitope regions of Borrelia proteins that are expressed at different stages of Lyme disease, and confirming a lack of Borrelia-specific activated T-cells in the samples by the absence of a detectable T-cell immune response indicator (e.g., interferon-[gamma]).A kind of composition of diagnosis or prognosis for lyme disease is selected from first chamber and second chamber：(i) first chamber, it includes：(a) 1,2,3,4 or 5 kind of separation flab peptides, respectively contain borellia t cell epitope, and selected from having seq id no:the flab peptides of amino acid sequence shown in 1-5 or with seq id no:amino acid sequence shown in 1-5 has at least the one or more variant of 80% amino acid sequence identity；(b) 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12 or 13 kind separation dbpb peptides, respectively contain borellia t cell table position, and selected from seq id no:the dbpb peptides of amino acid sequence shown in 6-18 or with seq id no:shown in 6-18 amino acid sequence have at least 80% amino acid sequence identity one or more variant；(c) 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12 or 13 kind separation p66 peptides, respectively contain borellia t cell table position, and selected from seq id no:the p66 peptides of amino acid sequence shown in 19-31 or with seq id no:shown in 19-31 amino acid sequence have at least 80% amino acid sequence identity one or more variant；with(d) 1 or 2 kind of separation ospc peptides, respectively contain borellia t cell epitope, and selected from having seq id no: the ospc peptides of amino acid sequence shown in 32-33 or with seq id no:amino acid sequence shown in 32-33 has at least 80% the one or more variant of amino acid sequence identity,wherein, the composition is contacting it with obtained from by the whole blood of the associated para-infectious object of borellia kind of lyme disease afterwards, the secondary ion vitro immunization response of t cell can be caused；with(ii) second chamber, it includes：(a) the flab peptides of 5 kinds of separation respectively contain borellia t cell epitope, and selected from seq id no:1-5 the flab peptides of shown amino acid sequence or with seq id no:amino acid sequence shown in 1-5 has at least 80% amino acid the one or more variant of sequence identity；(b) the dbpb peptides of 13 kinds of separation respectively contain borellia t cell epitope, and selected from seq id no:6- the dbpb peptides of amino acid sequence shown in 18 or with seq id no:amino acid sequence shown in 6-18 has at least 80% amino the one or more variant of the acid sequence phase same sex；(c) the p66 peptides of 13 kinds of separation respectively contain borellia t cell epitope, and selected from seq id no:19- the p66 peptides of amino acid sequence shown in 31 or with seq id no:amino acid sequence shown in 19-31 has at least 80% amino the one or more variant of the acid sequence phase same sex；with(d) the ospc peptides of 2 kinds of separation respectively contain borellia t cell epitope, and selected from seq id no:32- the ospc peptides of amino acid sequence shown in 33 or with seq id no:amino acid sequence shown in 32-33 has at least 80% ammonia the one or more variant of the base acid sequence phase same sex.
라임병을 진단하기 위한 및 치료 후 라임병 스피로헤타 제거를 예측하기 위한 조성물 및 방법LD를 갖고 있는 것으로 의심되는 대상체로부터의 전혈 샘플을 라임병의 상이한 단계에서 발현된 보렐리아 단백질로부터 유래된 T-세포 에피토프-함유 영역을 포함하는 합성 펩티드와 시험관내에서 접촉시키는 것, 및 펩티드에 의한 자극에 반응한 T-세포 면역 반응 지시자 (예를 들어, 인터페론-γ)의 생성을 결정함으로써 LD-특이적 활성화된 T-세포를 간접적으로 검출하는 것에 의해 보렐리아 종 감염을 확증하는 방법을 포함한, 라임병 (LD)의 검출, 진단 및 예후를 위한 조성물 및 방법이 제공된다. 또한 이러한 대상체로부터의 전혈 샘플을 라임병의 상이한 단계에서 발현된 보렐리아 단백질의 특이적 T-세포 에피토프 영역을 포함하는 펩티드에 노출시키는 것, 및 검출가능한 T-세포 면역 반응 지시자 (예를 들어, 인터페론-γ)의 부재에 의해 샘플에서 보렐리아-특이적 활성화된 T-세포의 결여를 확증하는 것에 의해, LD 치료를 겪었던 LD 환자에서 LD 스피로헤타의 제거를 예측하는 방법이 개시된다.하기 제1 조성물 및 제2 조성물로부터 선택된 라임병의 진단 또는 예후를 위한 조성물:(I) 하기를 포함하는 제1 조성물:(a) 각각이 보렐리아(Borrelia) T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 1-5에 제시된 아미노산 서열을 갖는 FlaB 펩티드로부터 선택된 1, 2, 3, 4, 또는 5개의 단리된 FlaB 펩티드, 또는 서열식별번호: 1-5에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체;(b) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 6-18에 제시된 아미노산 서열을 갖는 DbpB 펩티드로부터 선택된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 또는 13개의 단리된 DbpB 펩티드, 또는 서열식별번호: 6-18에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체;(c) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 19-31에 제시된 아미노산 서열을 갖는 p66 펩티드로부터 선택된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 또는 13개의 단리된 p66 펩티드, 또는 서열식별번호: 19-31에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체; 및(d) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 32-33에 제시된 아미노산 서열을 갖는 OspC 펩티드로부터 선택된 1 또는 2개의 단리된 OspC 펩티드, 또는 서열식별번호: 32-33에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체,여기서 조성물은, 라임병과 연관된 보렐리아 종으로 감염된 대상체로부터 수득된 전혈과 접촉된 후에, T-세포에 의한 2차 시험관내 면역 반응을 도출할 수 있음;(II) 하기를 포함하는 제2 조성물:(a) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 1-5에 제시된 아미노산 서열을 갖는 FlaB 펩티드로부터 선택된 5개의 단리된 FlaB 펩티드, 또는 서열식별번호: 1-5에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체;(b) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 6-18에 제시된 아미노산 서열을 갖는 DbpB 펩티드로부터 선택된 13개의 단리된 DbpB 펩티드, 또는 서열식별번호: 6-18에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체;(c) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 19-31에 제시된 아미노산 서열을 갖는 p66 펩티드로부터 선택된 13개의 단리된 p66 펩티드, 또는 서열식별번호: 19-31에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체; 및(d) 각각이 보렐리아 T-세포 에피토프를 포함하고 서열식별번호: 32-33에 제시된 아미노산 서열을 갖는 OspC 펩티드로부터 선택된 2개의 단리된 OspC 펩티드, 또는 서열식별번호: 32-33에 제시된 아미노산 서열과 적어도 80% 아미노산 서열 동일성을 갖는 그의 하나 이상의 변이체.