ADENO-ASSOCIATED VIRUS (AAV) CLADE F VECTOR AND USES THEREFORA recombinant adeno-associated virus (rAAV) vector comprising an AAVhu68 capsid produced in a production system comprising a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, or a sequence at least 75% identical thereto which encodes SEQ ID NO:2. The AAVhu68 capsid comprises subpopulations of highly deamidated asparagine residues in asparagine - glycine pairs in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. Also provided are compositions containing the rAAV and uses thereof. Additionally, rAAV having an engineered AAV capsid comprising at least one subpopulation of vpl or vp2 proteins having a Val at amino acid position 157 with reference to the AAVhu68 vpl numbering are provided.A recombinant adeno- associated virus (rAAV) which comprises: (A) an AAV68 capsid comprising one or more of:(1) AAV hu68 capsid proteins comprising: a heterogenous population of AAVhu68 vpl proteins selected from: vpl proteins produced by expression from a nucleic acid sequence which encodes the predicted amino acid sequence of 1 to 736 of SEQ ID NO:2, vpl proteins produced from SEQ ID NO: 1, or vpl proteins produced from a nucleic acid sequence at least 70% identical to SEQ ID NO: 1 which encodes the predicted amino acid sequence of 1 to 736 of SEQ ID NO:2, a heterogenous population of AAVhu68 vp2 proteins selected from: vp2 proteins produced by expression from a nucleic acid sequence which encodes the predicted amino acid sequence of at least about amino acids 138 to 736 of SEQ ID NO:2, vp2 proteins produced from a sequence comprising at least nucleotides 412 to 2211 of SEQ ID NO: 1, or vp2 proteins produced from a nucleic acid sequence at least 70% identical to at least nucleotides 412 to 2211 of SEQ ID NO: 1 which encodes the predicted amino acid sequence of at least about amino acids 138 to 736 of SEQ ID NO:2, a heterogenous population of AAVhu68 vp3 proteins selected from: vp3 produced by expression from a nucleic acid sequence which encodes the predicted amino acid sequence of at least about amino acids 203 to 736 of SEQ ID NO:2, vp3 proteins produced from a sequence comprising at least nucleotides 607 to 2211 of SEQ ID NO: 1, or vp3 proteins produced from a nucleic acid sequence at least 70% identical to at least nucleotides 607 to 2211 of SEQ ID NO: 1 which encodes the predicted amino acid sequence of at least about amino acids 203 to 736 of SEQ ID NO:2; and/or(2) AAV capsid proteins comprising a heterogenous population of vpl proteins, a heterogenous population of vp2 proteins optionally comprising a valine at position 157, and a heterogenous population of vp3 proteins, wherein at least asubpopulation of the vpl and vp2 proteins comprise a valine at position 157 and optionally further comprising a glutamic acid at position 67 based on the numbering of the vpl capsid of SEQ ID NO:2; and/or (3) a heterogenous population of vp 1 proteins which are the product of a nucleic acid sequence encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, a heterogenous population of vp2 proteins which are the product of a nucleic acid sequence encoding the amino acid sequence of at least about amino acids 138 to 736 of SEQ ID NO: 2, and a heterogenous population of vp3 proteins which are the product of a nucleic acid sequence encoding at least amino acids 203 to 736 of SEQ ID NO:2, wherein: the vpl, vp2 and vp3 proteins contain subpopulations with amino acid modifications comprising at least two highly deamidated asparagines (N) in asparagine - glycine pairs in SEQ ID NO: 2 and optionally further comprising subpopulations comprising other deamidated amino acids, wherein the deamidation results in an amino acid change; and(B) a vector genome in the AAVhu68 capsid, the vector genome comprising a nucleic acid molecule comprising AAV inverted terminal repeat sequences and a non-AAV nucleic acid sequence encoding a product operably linked to sequences which direct expression of the product in a host cell.
아데노-연관 바이러스(AAV) 클레이드 F 벡터 및 이의 용도서열번호 1의 뉴클레오타이드 서열, 또는 서열번호 2를 암호화하는 이와 적어도 75% 동일한 서열을 포함하는 생산 시스템에서 생산된 AAVhu68 캡시드를 포함하는 재조합 아데노-연관 바이러스(rAAV) 벡터. 상기 AAVhu68 캡시드는 서열번호 2의 아미노산 서열에서 아스파라긴-글리신 쌍에서 고도로 탈아마이드화된 아스파라긴 잔기의 하위집단을 포함한다. 또한 상기 rAAV를 함유하는 조성물 및 이의 용도가 또한 제공된다. 추가로, AAVhu68 vp1 넘버링과 관련하여 157번 아미노산 위치에서 Val을 갖는 vp1 또는 vp2 단백질의 적어도 하나의 하위집단을 포함하는 조작된 AAV 캡시드를 갖는 rAAV가 제공된다.재조합 아데노-연관 바이러스(recombinant adeno-associated virus: rAAV)로서, (A) 하기 (1) 내지 중 (3) 중 하나 이상을 포함하는 AAV68 캡시드: (1) 서열번호 2의 1 내지 736의 예측된 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열로부터의 발현에 의해서 생산된 vp1 단백질, 서열번호 1로부터 생산된 vp1 단백질 또는 서열번호 2의 1 내지 736의 예측된 아미노산 서열을 암호화하는 서열번호 1과 적어도 70% 동일한 핵산 서열로부터 생산된 vp1 단백질로부터 선택된 AAVhu68 vp1 단백질의 이종 집단, 서열번호 2의 적어도 약 아미노산 138 내지 736의 예측된 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열로부터의 발현에 의해서 생산된 vp2 단백질, 서열번호 1의 적어도 뉴클레오타이드 412 내지 2211을 포함하는 서열로부터 생산된 vp2 단백질 또는 서열번호 2의 적어도 약 아미노산 138 내지 736의 예측된 아미노산 서열을 암호화하는 서열번호 1의 적어도 뉴클레오타이드 412 내지 2211과 적어도 70% 동일한 핵산 서열로부터 생산된 vp2 단백질로부터 선택된 AAVhu68 vp2 단백질의 이종 집단, 서열번호 2의 적어도 약 아미노산 203 내지 736의 예측된 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열로부터의 발현에 의해서 생산된 vp3, 서열번호 1의 적어도 뉴클레오타이드 607 내지 2211을 포함하는 서열로부터 생산된 vp3 단백질 또는 서열번호 2의 적어도 약 아미노산 203 내지 736의 예측된 아미노산 서열을 암호화하는 서열번호 1의 적어도 뉴클레오타이드 607 내지 2211과 적어도 70% 동일한 핵산 서열로부터 생산된 vp3 단백질로부터 선택된 AAVhu68 vp3 단백질의 이종 집단 을 포함하는, AAV hu68 캡시드 단백질, 및/또는 (2) vp1 단백질의 이종 집단, 선택적으로 157번 위치에 발린을 포함하는 vp2 단백질의 이종 집단, 및 vp3 단백질의 이종 집단을 포함하는 AAV 캡시드 단백질로서, 적어도 상기 vp1 단백질 및 vp2 단백질의 하위집단은 서열번호 2의 vp1 캡시드의 넘버링을 기준으로 157번 위치에서 발린을 포함하고, 선택적으로 67번 위치에서 글루탐산을 추가로 포함하는, 상기 AAV 캡시드 단백질; 및/또는 (3) 서열번호 2의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열의 산물인 vp1 단백질의 이종 집단, 서열번호 2의 적어도 약 아미노산 138 내지 736의 아미노산 서열을 암호화하는 핵산 서열의 산물인 vp2 단백질의 이종 집단 및 서열번호 2의 적어도 아미노산 203 내지 736을 암호화하는 핵산 서열의 산물인 vp3 단백질의 이종 집단으로서, 상기 vp1 단백질, vp2 단백질 및 vp3 단백질은 서열번호 2에서 아스파라긴-글리신 쌍 내에 적어도 2개의 고도로 탈아마이드화된(deamidated) 아스파라긴(N)을 포함하는 아미노산 변형을 갖는 하위 집단을 함유하고, 선택적으로 추가로 다른 탈아마이드화된 아미노산을 포함하는 하위집단을 포함하되, 상기 탈아마이드화는 아미노산 변화를 초래하는, 상기 vp1 단백질의 이종 집단, 상기 vp2 단백질의 이종 집단 및 상기 vp3 단백질의 이종 집단; 및 (B) 상기 AAVhu68 캡시드 내의 벡터 게놈으로서, 상기 벡터 게놈은 AAV 반전 말단 반복부(inverted terminal repeat) 서열 및 숙주 세포에서 산물의 발현을 지시하는 서열에 작동 가능하게 연결된 산물을 암호화하는 비-AAV 핵산 서열을 포함하는 핵산 분자를 포함하는, 벡터 게놈을 포함하는, 재조합 아데노-연관 바이러스(rAAV)