Chromosomal deletion syndromes result from deletion of parts of chromosomes. Depending on the location, size, and whom the deletion is inherited from, there are a few known different variations of chromosome deletions. Chromosomal deletion syndromes typically involve larger deletions that are visible using karyotyping techniques. Smaller deletions result in Microdeletion syndrome, which are detected using fluorescence in situ hybridization (FISH)

Examples of chromosomal deletion syndromes include 5p-Deletion (cri du chat syndrome), 4p-Deletion (Wolf–Hirschhorn syndrome), Prader–Willi syndrome, and Angelman syndrome.

The chromosomal basis of Cri du chat syndrome consists of a deletion of the most terminal portion of the short arm of chromosome 5. 5p deletions, whether terminal or interstitial, occur at different breakpoints; the chromosomal basis generally consists of a deletion on the short arm of chromosome 5. The variability seen among individuals may be attributed to the differences in their genotypes. With an incidence of 1 in 15,000 to 1 in 50,000 live births, it is suggested to be one of the most common contiguous gene deletion disorders. 5p deletions are most common de novo occurrences, which are paternal in origin in 80–90% of cases, possibly arising from chromosome breakage during gamete formation in males.

Some examples of the possible dysmorphic features include: downslanting palpebral fissures, broad nasal bridge, microcephaly, low-set ears, preauricular tags, round faces, short neck, micrognathia, and dental malocclusionhypertelorism, epicanthal folds, downturned corners of the mouth. There is no specific correlation found between size of deletion and severity of clinical features because the results vary so widely.

The chromosomal basis of Wolf-Hirschhorn syndrome (WHS) consists of a deletion of the most terminal portion of the short arm of chromosome 4. The deleted segment of reported individuals represent about one half of the p arm, occurring distal to the bands 4p15.1-p15.2. The proximal boundary of the WHSCR was defined by a 1.9 megabase terminal deletion of 4p16.3. This allele includes the proposed candidate genes LEMT1 and WHSC1. This was identified by two individuals that exhibited all 4 components of the core WHS phenotype, which allowed scientists to trace the loci of the deleted genes. Many reports are particularly striking in the appearance of the craniofacial structure (prominent forehead, hypertelorism, the wide bridge of the nose continuing to the forehead) which has led to the descriptive term “Greek warrior helmet appearance".

There is wide evidence that the WHS core phenotype (growth delay, intellectual disability, seizures, and distinctive craniofacial features) is due to haploinsufficiency of several closely linked genes as opposed to a single gene. Related genes that impact variation include:

WHSC1 spans a 90-kb genomic region, two-thirds of which maps in the telomeric end of the WHCR; WHSC1 may play a significant role in normal development. Its deletion likely contributes to the WHS phenotype. However, variation in severity and phenotype of WHS suggests possible roles for genes that lie proximally and distally to the WHSCR.
WHSC2 (also known as NELF-A) is involved in multiple aspects of mRNA processing and the cell cycle
SLBP, a gene encoding Stem Loop Binding Protein, resides telomeric to WHSC2, and plays a crucial role in regulating histone synthesis and availability during S phase.
LETM1 has initially been proposed as a candidate gene for seizures; it functions in ion exchange with potential roles in cell signaling and energy production.
FGFRL1, encoding a putative fibroblast growth factor decoy receptor, has been implicated in the craniofacial phenotype and potentially other skeletal features, and short stature of WHS.
CPLX1 has lately been suggested as a potential candidate gene for epilepsy in WHS.

Prader–Willi (PWS) and Angelman syndrome (AS) are distinct neurogenetic disorders caused by chromosomal deletions, uniparental disomy or loss of the imprinted gene expression in the 15q11-q13 region. Whether an individual exhibits PWS or AS depends on if there is a lack of the paternally expressed gene to contribute to the region.[citation needed]

PWS is frequently found to be the reason for secondary obesity due to early onset hyperphagia - the abnormal increase in appetite for consumption of food. There are known three molecular causes of Prader–Willi syndrome development. One of them consists in micro-deletions of the chromosome region 15q11–q13. 70% of patients present a 5–7-Mb de novo deletion in the proximal region of the paternal chromosome 15. The second frequent genetic abnormality (~ 25–30% of cases) is maternal uniparental disomy of chromosome 15. The mechanism is due to maternal meiotic non-disjunction followed by mitotic loss of the paternal chromosome 15 after fertilization. The third cause for PWS is the disruption of the imprinting process on the paternally inherited chromosome 15 (epigenetic phenomena). This disruption is present in approximately 2–5% of affected individuals. Less than 20% of individuals with an imprinting defect are found to have a very small deletion in the PWS imprinting centre region, located at the 5′ end of the SNRPN gene.

AS is a severe debilitating neurodevelopmental disorder characterized by mental retardation, speech impairment, seizures, motor dysfunction, and a high prevalence of autism. The paternal origin of the genetic material that is affected in the syndrome is important because the particular region of chromosome 15 involved is subject to parent-of-origin imprinting, meaning that for a number of genes in this region, only one copy of the gene is expressed while the other is silenced through imprinting. For the genes affected in PWS, it is the maternal copy that is usually imprinted (and thus is silenced), while the mutated paternal copy is not functional.
염색체 결실 증후군은 염색체의 일부가 결실되어 발생합니다. 염색체 결실의 위치, 크기, 누구로부터 유전되었는지에 따라 염색체 결실에는 몇 가지 알려진 다양한 변형이 있습니다. 염색체 결실 증후군은 일반적으로 핵형 분석 기술을 사용하여 볼 수 있는 더 큰 결실을 수반합니다. 더 작은 결실은 미세 결실 증후군을 초래하며, 이는 형광 현장 혼성화(FISH)를 사용하여 검출됩니다.

염색체 결실 증후군의 예로는 5p 결실(크리 뒤 샤 증후군), 4p 결실(울프-허쉬혼 증후군), 프라더-윌리 증후군, 엔젤만 증후군 등이 있습니다.

크리 뒤 샤 증후군의 염색체적 기초는 염색체 5번의 짧은 팔의 가장 말단 부분이 결실된 것입니다. 5p 결실은 말단이든 간질이든 서로 다른 중단점에서 발생하며, 염색체적 기초는 일반적으로 5번 염색체의 짧은 팔에 결실이 있는 것으로 구성됩니다. 개인 간에 나타나는 다양성은 유전자형의 차이에 기인할 수 있습니다. 발생률은 15,000명 중 1명에서 50,000명 중 1명으로, 가장 흔한 연속 유전자 결실 장애 중 하나로 알려져 있습니다. 5p 결실은 가장 흔한 신규 발생이며, 80~90%의 경우 부계에서 기인하며, 남성의 생식세포 형성 중 염색체 파손으로 인해 발생할 가능성이 있습니다.

가능한 기형적 특징의 몇 가지 예로는 경사진 구개열, 넓은 콧대, 소두증, 낮은 귀, 전이개, 둥근 얼굴, 짧은 목, 소두증, 치아 부정교합, 상안검 주름, 입꼬리가 내려간 입꼬리 등이 있습니다. 결과는 매우 다양하기 때문에 삭제 크기와 임상적 특징의 심각도 사이에는 특별한 상관관계가 발견되지 않았습니다.

울프-허쉬혼 증후군(WHS)의 염색체적 기초는 염색체 4번의 짧은 팔의 가장 말단 부분이 결실된 것으로 구성됩니다. 보고된 개인의 삭제된 세그먼트는 4p15.1-p15.2 밴드의 원위에서 발생하는 p 암의 약 절반을 나타냅니다. WHSCR의 근위 경계는 4p16.3의 1.9 메가베이스 말단 결실에 의해 정의되었습니다. 이 대립 유전자는 제안 된 후보 유전자 LEMT1 및 WHSC1을 포함합니다. 이는 핵심 WHS 표현형의 4가지 구성 요소를 모두 나타내는 두 개인에 의해 확인되었으며, 이를 통해 과학자들은 삭제된 유전자의 유전자좌를 추적할 수 있었습니다. 특히 두개안면 구조(두드러진 이마, 과전두증, 이마까지 이어지는 넓은 콧대)가 눈에 띄어 "그리스 전사 투구 모양"이라는 표현이 생겨났다는 보고가 많았습니다.

WHS의 핵심 표현형(성장 지연, 지적 장애, 발작, 독특한 두개안면 특징)은 단일 유전자가 아닌 밀접하게 연결된 여러 유전자의 일배체성 결핍에 기인한다는 광범위한 증거가 있습니다. 변이에 영향을 미치는 관련 유전자는 다음과 같습니다:

WHSC1은 90kb 게놈 영역에 걸쳐 있으며, 이 중 3분의 2는 WHCR의 텔로미어 말단에 매핑되어 있으며, WHSC1은 정상 발달에 중요한 역할을 할 수 있습니다. 이 유전자의 결실은 WHS 표현형에 기여할 가능성이 높습니다. 그러나 WHS의 중증도 및 표현형의 변화는 WHSCR의 근위 및 원위에 있는 유전자의 역할 가능성을 시사합니다.
WHSC2(NELF-A라고도 함)는 mRNA 처리 및 세포주기의 여러 측면에 관여합니다.
줄기 고리 결합 단백질을 코딩하는 유전자 SLBP는 WHSC2의 텔로미어에 존재하며, S 단계에서 히스톤 합성 및 가용성을 조절하는 데 중요한 역할을 합니다.
LETM1은 처음에 발작의 후보 유전자로 제안되었으며, 세포 신호 및 에너지 생산에서 잠재적인 역할을 하는 이온 교환 기능을 합니다.
섬유아세포 성장인자 미끼 수용체를 코딩하는 FGFRL1은 두개안면 표현형 및 잠재적으로 다른 골격 특징과 WHS의 단신과 관련이 있는 것으로 알려져 있습니다.
CPLX1은 최근 WHS의 간질에 대한 잠재적 후보 유전자로 제안되었습니다.

프라더-윌리(PWS)와 엔젤만 증후군(AS)은 염색체 결실, 일가 이형성증 또는 15q11-q13 영역에 각인된 유전자 발현의 손실로 인해 발생하는 뚜렷한 신경 유전 질환입니다. 개인이 PWS 또는 AS를 나타내는지 여부는 해당 영역에 기여하는 부계 발현 유전자가 부족한지 여부에 따라 다릅니다.

PWS는 음식 섭취에 대한 식욕의 비정상적인 증가 인 조기 발병 과식증으로 인한 이차 비만의 원인으로 자주 발견됩니다. 프라더-윌리 증후군 발병의 분자적 원인은 세 가지로 알려져 있습니다. 그 중 하나는 염색체 영역 15q11-q13의 미세 결실입니다. 환자의 70%는 부계 염색체 15번의 근위 영역에서 5-7Mb의 신규 결실을 보입니다. 두 번째로 빈번한 유전적 이상(사례의 약 25~30%)은 15번 염색체의 모계 단일부모 이형성증입니다. 이 메커니즘은 수정 후 모체의 감수 분열 비분열에 이어 부계 염색체 15번의 유사 분열 손실로 인한 것입니다. PWS의 세 번째 원인은 부계로 유전된 15번 염색체의 각인 과정이 중단되는 것입니다(후성유전학적 현상). 이 장애는 영향을 받는 개인의 약 2~5%에서 나타납니다. 각인 결함이 있는 개인의 20% 미만은 SNRPN 유전자의 5′ 말단에 위치한 PWS 각인 중심 영역에 아주 작은 결실이 있는 것으로 밝혀졌습니다.

AS는 정신 지체, 언어 장애, 발작, 운동 기능 장애, 높은 자폐증 유병률을 특징으로 하는 심각한 쇠약성 신경 발달 장애입니다. 이 증후군에 영향을 미치는 유전 물질의 부계 기원이 중요한 이유는 관련된 염색체 15번의 특정 영역이 부모 기원 각인의 영향을 받기 때문에 이 영역의 여러 유전자에 대해 하나의 유전자 사본만 발현되고 다른 유전자는 각인을 통해 침묵되기 때문입니다. PWS에 영향을 받는 유전자의 경우 일반적으로 각인되는 것은 모계 사본이며(따라서 침묵됨), 돌연변이된 부계 사본은 기능하지 않습니다.