MRI METHOD USING PRISM ACQUISITION WITH MOTION CORRECTION FOR FINE STRUCTURE DATA ANALYSISA method of improving the data quality in spatial frequency spectra by acquiring a prism acquisition consisting of echo data that is one or more repetitions of a one-dimensional frequency encoded signal along the length of one or more prism volumes, placed within a sample of a structure to be studied, generating prism profiles from the echo data, and correcting for motion during the acquisition by calculating motion having occurred during the prism acquisition from assessment of the prism profiles for the multiple repetitions, or by indicating a region of sample of structure to be studied on a reference image, using this to segment a map of features in the prism profiles and shifting the location of this region to correct for motion having occurred between the acquisition of the reference image and the prism acquisition.In a Magnetic Resonance Imaging (MRI) System, a method for improving the quality of spatial frequency spectra generated from a prism acquisition consisting of echo data that is one or more repetitions of a one-dimensional frequency encoded signal along the length of one or more prism volumes, placed within a sample of a structure to be studied, comprising;a) gathering a prism acquisition consisting of one or more individual repetition of echo data from one or more prism volumes using one or more receiver coils in the Magnetic resonance Imaging (MRI) System;b) correcting for patient motion affecting the quality of the prism acquisition by:i) transforming the echo data gathered in (a) for each prism volume to calculate the variation of signal versus position, termed the prism profile, for each repetition for each receiver coil;ii) combining the prism profile from a selection of one or more of the receiver coils to produce a combined prism profile for each prism volume and each repetition;iii) combining the repetitions gathered into blocks of one or more overlapping or adjacent repetitions to produce a series of frames showing the prism profiles for the set of prisms volumes for each block, and using the change in prism profiles between frames to calculate the patient motion which has occurred during the prism acquisition;iv) using the calculation of patient motion in (iii) to determine whether the calculated motion is below a threshold value, and if so then calculating the spatial frequency spectra from the prism profiles, and if not then the dataset is discarded and indicated to be re-acquired;or:c) correcting for patient motion affecting the quality of the prism acquisition by: i) during the same study, acquiring a reference image of the sample of the structure to be studied, either prior to or following the prism acquisition in (a), which is Co- located with the prism acquisition in (a);ii) specifying one or more regions of the sample of the structure to be studied on the reference image acquired in (c)(i);iii) using a three-dimensional coordinate transform to translate the points specifying the regions in (c)(ii) from locations in the reference image tocorresponding locations in the prism volumes;iv) transforming the echo data gathered in (a) to calculate the signal versus position along each of the prism volumes for each repetition for each receiver coil, and for eac prism volume to obtain the respective prism profile;v) smoothing the prism profiles by application of a spatial filter in order to reduce the noise;vi) calculating the presence of anatomical features in the prism profiles by generating a map of the prevalence of sharp boundaries and features present, termed the feature map;vii) using the points calculated in (iii) to perform a segmentation of the feature map calculated in (vi) within the specified region;viii) calculating the estimated shift of the segmented feature map in (vii) which minimizes the presence of anatomical features present in the segmented prism volumes, and using the estimated shift to spatially shift the segmented prism volumes to correct for motion, prior to generation of spatial frequency spectra from the prism acquisition echo data.
미세 구조 데이터 분석을 위해 움직임이 보정되는 프리즘 수집을 사용하는 MRI 방법하나 이상의 프리즘 볼륨들의 길이를 따른 1차원 주파수 인코딩된 신호의 하나 이상의 반복들인 에코 데이터로 구성된 프리즘 수집을 획득함으로써 공간 주파수 스펙트럼의 데이터 품질을 개선시키기 위한 방법으로서, 상기 하나 이상의 프리즘 볼륨들은 연구될 구조의 샘플 내에 위치하며, 상기 방법은 : 상기 에코 데이터로부터 프리즘 프로파일들을 생성하는 단계; 및 다수 반복들에 대한 상기 프리즘 프로파일들의 평가로부터 상기 프리즘 수집 동안 발생한 움직임을 산출함으로써, 또는 참조 이미지 상에 연구될 구조의 샘플의 영역을 표시하고 이를 사용하여 상기 프리즘 프로파일들 내의 피처들의 맵을 분할하고, 그리고 이러한 영역의 위치를 시프팅시켜서 상기 참조 이미지의 수집 및 상기 프리즘 수집 사이에 발생한 움직임을 보정함으로써, 상기 수집 동안의 움직임을 보정하는 단계를 포함하는 방법.자기 공명 이미징(Magnetic Resonance Imaging; MRI) 시스템에서, 하나 이상의 선택적으로-여기된 내부 볼륨들(프리즘 볼륨들)의 축을 따라 1차원 주파수 인코딩된 신호의 하나 이상의 반복들인, 미세하게-샘플링되고 공간적으로-인코딩된 자기 공명 에코 데이터로 구성된 프리즘 수집으로부터 생성된 공간 주파수 스펙트럼의 품질을 개선시키기 위한 방법으로서, 상기 하나 이상의 선택적으로-여기된 내부 볼륨들은 분석될 생물학적 조직 내의 물리적 위치이며, 상기 하나 이상의 선택적으로-여기된 내부 볼륨들로부터 에코 데이터가 생성되고, 상기 방법은 : a) 상기 자기 공명 이미징(MRI) 시스템에서 하나 이상의 수신기 코일들을 사용하여 하나 이상의 프리즘 볼륨들로부터의 에코 데이터의 하나 이상의 개별 반복들로 이루어진 프리즘 수집을 모으는 단계; b) 상기 프리즘 수집이 다수의 반복들로 구성된다면, 상기 프리즘 수집의 품질에 영향을 미치는 환자 움직임을 평가하는 단계로서, i) 각각의 수신기 코일에 대한 각각의 반복 동안의 위치 대비 신호의 변화(프리즘 프로파일이라고 함)를 계산하기 위해 각각의 프리즘 볼륨에 대해 (a)에서 모아진 에코 데이터를 변환하고; ii) 각각의 프리즘 볼륨 및 각각의 반복에 대해 합성된 프리즘 프로파일을 생성하기 위해 상기 수신기 코일들 중에서 선택된 하나 이상의 수신기 코일들로부터의 상기 프리즘 프로파일을 합성하고; iii) 하나 이상의 중첩 또는 인접 반복들의 블록들로 모아진 반복들을 결합하여, 각각의 블록 동안 상기 프리즘 볼륨들의 세트에 대한 프리즘 프로파일들을 나타내는 일련의 프레임들을 생성하고, 그리고 프레임들 간의 프리즘 프로파일들의 변화를 사용하여 상기 프리즘 수집 동안 발생한 환자 움직임을 계산하고; iv) iii) 에서의 환자 움직임의 계산을 사용하여 상기 계산된 움직임이 임계값 이하인지 여부를 판단하고, 상기 계산된 움직임이 임계값 이하라면 상기 프리즘 프로파일들로부터 상기 공간 주파수 스펙트럼을 계산하고, 그리고 상기 계산된 움직임이 임계값 이하가 아니라면, 데이터세트는 버려지고 재-획득되도록 표시됨으로써 환자 움직임을 평가하는 단계; 또는 c) 상기 프리즘 수집의 품질에 영향을 미치는 환자 움직임을 보정하는 단계로서, i) 동일한 연구 동안, a)에서의 프리즘 수집 이전에 또는 a)에서의 프리즘 수집 이후에, a)에서의 프리즘 수집과 동일 위치에 배치되는, 연구될 구조의 샘플의 참조 이미지를 획득하고; ii) c) i)에서 획득되는 참조 이미지 상에서 상기 연구될 구조의 샘플의 하나 이상의 영역들을 명시하고; iii) 3차원 좌표 변환을 사용하여 c)ii)에서의 영역들을 명시하는 포인트들을, 상기 참조 이미지 내 위치들로부터 상기 프리즘 볼륨들 내 대응 위치들로 변환하고; iv) 상기 각각의 프리즘 프로파일을 획득하기 위해, a)에서 모아진 상기 에코 데이터를 변환하여, 각각의 프리즘 볼륨에 대해, 각각의 수신기 코일에 대한 각각의 반복 동안의 상기 프리즘 볼륨들 각각에 따른 상기 위치 대비 신호를 계산하고; v) 노이즈를 감소시키기 위해 공간 필터를 적용하여 상기 프리즘 프로파일들을 평활화하며; vi) 존재하는 피처들 및 날카로운 경계들의 출현(prevalence)의 맵(피처 맵이라고 함)을 생성함으로써 상기 프리즘 프로파일들 내의 해부학적 피처들의 존재를 계산하고; vii) iii) 에서 계산된 포인트들을 사용하여, 상기 명시된 영역 내에서 vi)에서 계산된 상기 피처 맵의 분할을 수행하고; viii) 상기 프리즘 수집 에코 데이터로부터의 공간 주파수 스펙트럼 생성 이전에, 상기 분할된 프리즘 볼륨들에 존재하는 해부학적 피처들의 존재를 최소화하는 vii)의 상기 분할된 피처 맵의 추정된 시프트를 계산하고, 움직임을 보정하기 위해 상기 추정된 시프트를 사용하여 상기 분할된 프리즘 볼륨들을 공간적으로 시프트시킴으로써 환자 움직임을 보정하는 단계를 포함하는 방법.