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 1955년 문국진은 서울대의대를 졸업하면서 평양의과대와 서울대의대 스승인 장기려(張起呂) 박사를 찾아가 상의를 했다. 고(故) 장기려 박사는 경성의학전문을 졸업하고 평양의과대 교수와 평양도립병원장을 지내다 1950년 월남해 서울대의대 교수를 역임했다. 피란지 부산 영도에서 복음병원의 전신인 천막병원을 설립하고 부산 청십자병원장으로 근무하는 등 ‘한국의 슈바이처’로 존경받는 의사였다.
 외과 주임교수였던 장기려 박사는 문국진에게 “임자는 튼튼하니까 우리 외과에 들어오면 수술도 오래할 수 있고 대성할 거야”라며 외과로 올 것을 권했다. 그러나 문국진이 “법의학을 꼭 해야겠다”고 하자, “그건 학문도 아니다”라며 크게 화를 냈다. 스승의 독려를 기대했던 문국진 박사는 실망했다.
 —그때 기분이 어땠습니까.
 “퍽 섭섭했어요. 장기려 선생님이 무의촌(無醫村) 진료를 다니실 때 열심히 모시고 다녔거든. 그런데 법의학을 너무 폄하하시니까 마음이 아주 안 좋았어요. ‘민주국가에서 사람의 목숨보다 인권을 존중하는 게 문화인이라는데, 그렇다면 선생님은 종교밖에 모르시고 문화인이 아니신가’라고 속으로 생각했어요. 하지만 그대로 나는 결심을 밀고 나갔죠.”
 —졸업하고 갈 곳이 없어 막막했겠네요.
 “정말 막막한 거예요. 한국에 법의학과나 법의학교실이 있는 것도 아니고 그런 일을 하는 곳도 배울 곳도 없으니까. 한때는 일본으로 밀항이라도 해야 하나, 극단적인 생각을 꽤 심각하게 하기도 했지요.”

1955년 장 박사는 상의하러 온 문 씨에게 외과로 올 것을 권했으나 문 씨가 법의학을 해야겠다고 하자 그건 학문도 아니라며 크게 화를 냈다.