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 선군을 주창하고 몇 년이 흘렀다. 군 내부에서 선군에 반대하는 목소리가 나오기 시작했다. 이른바 ‘군부파’다. 군부파의 주장은 이랬다. 
 “선군이라는 미명 아래 병사들이 건설현장 인부로 동원되고 있다. 10년을 복무해도 총 한 번 제대로 쏴 보기는커녕 삽질만 하다 제대하는 병사도 있다. 이래서야 전투력에 문제가 안 생기겠는가. 군인이라면 전투력을 높이기 위해 훈련을 해야지, 왜 노역에 동원돼야 하나.” 
 선군파와 군부파의 갈등은 점점 심해졌다. 양 파벌의 면면을 보면 이렇다.
 선군파의 우두머리는 당시 총정치국장이던 조명록 차수, 총참모장이었던 김영춘, 조직부국장이었던 김정각 등이었다. 군부파의 주요 인사는 당시 인민무력부장이었던 김일철, 2군단장이었던 김격식, 작전국장이었던 리명수였다. 
 여기에서 한 가지 살펴봐야 할 것이 군 수뇌부의 직제 구조다. 오진우가 인민무력부장(한국의 국방부 장관에 해당)으로 있을 때는 인민무력부장이 군부의 핵심인 총정치국, 총참모부, 인민무력부를 모두 통솔하며 군과 군내 당 정치사업 분야의 수장 노릇을 했다. 
 1995년 오진우가 암으로 사망한 후 변화가 생겼다. 최광이 인민무력부장으로, 조명록이 총정치국장으로 취임하면서 권력이 둘로 갈라졌다.
 최광이 죽고 난 후인 1998년, 군 권력구조는 크게 변화했다. 총참모부가 인민무력부에서 독립해 나왔다. 기존의 작전국이나 정찰국 등 전투부서와 군단들에 대한 통수권은 총참모장에게 넘어갔다. 이로써 총참모부와 총정치국, 인민무력부가 병렬적인 구조로 국방위원회의 통제를 받게 됐다. 인민무력부장의 권한이 전보다 현저히 줄어들면서 군부파는 심하게 반발했다. 

선군파의 우두머리는 당시 총정치국장이던 조명록 차수, 총참모장이었던 김영춘, 조직부국장이었던 김정각 등이었다. 군부파의 주요 인사는 당시 인민무력부장이었던 김일철, 2군단장이었던 김격식, 작전국장이었던 리명수였다.