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 최형섭은 1년 정도 연구소장을 하다 IAEA 연구비를 얻어 1963년 3월 캐나다로 떠났다. 원강(原鋼)에서 지르코늄을 추출하는 연구과제를 수행하기 위해서였다. 정낙은(鄭樂殷)의 천거로 후임자는 조용달(趙容達) 당시 삼성물산 동경사무소장을 임명했으나, 연구소 내 잡음과 통솔력 부재로 1년 만에 물러났다. 1964년 5월 최형섭이 캐나다에서 귀국하면서 다시 소장으로 부임했다.
 원자력계 인사들은 최형섭을 한국 원자력계의 내분을 잠재우고 행정적 기틀을 세운 인물로 기억한다. 그는 1966년 2월 초대 한국과학기술연구소(KIST) 소장으로 임명될 때까지 원자력연구소장으로 재직하면서 연구소를 원만하게 이끌었다. KIST 소장직에 있을 때 연구의 자율성과 연구 환경의 조성, 해외 인재 영입 등을 바탕으로 국내 과학기술 발전의 계기를 마련한 인물로 평가한다.
 그가 박정희(朴正熙) 대통령을 처음 안 것은 1965년 6월이었다. 이때 박 대통령이 존슨 미 대통령의 초청으로 미국을 방문하기 직전, 정부의 연구소장들을 청와대로 불러 만찬을 했다. 그때 오원선 원자력원장이 최형섭을 박 대통령에게 소개했다. 박 대통령은 최형섭을 눈여겨본 다음, 며칠 후 그를 청와대로 불렀다. 박 대통령은 경제기획원 장관, 상공부 장관 등 주요 경제 관료들이 배석한 자리에서, “우리나라 과학기술 진흥에 관해 최 박사의 의견을 말해달라”고 주문했다. 당시 박 대통령은 경제개발계획의 핵심적 역할을 수행할 KIST의 초대소장 자리에 최형섭을 미리 점찍어 놓았던 것이다.

원강에서 지르코늄을 추출하는 연구를 하기 위해 IAEA 연구비를 얻어 캐나다로 떠난 최 씨는 한국 원자력계의 내분을 잠재우고 행정적 기틀을 세운 인물로 기억된다.