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 일본에서 왜구에 대한 연구는 메이지유신 이래 본격적으로 진전되었다. 일본이 제국주의 기치를 들기 700여 년 전에 이미 한반도와 중국, 동남아 해역을 침구했던 왜구는 일본역사에서 가치 있는 존재였다. 왜구→임진왜란→일본제국으로 이어지는 일본의 대륙진출 역사를 개시한 선구자로서 찬양되어 마땅했다. 왜구는 자랑스런 일본인으로 각인되었다. 
 오늘날에도 왜구에 대한 일본인들의 긍지는 면면히 분출되고 있는데, 최근 서점가를 강타한 햐쿠타 나오키(百田尙樹)의 《해적이라고 불린 사나이》가 잘 말해 주고 있다. 석유재벌 이데미쓰 사조(出光佐三)를 국제 석유자본에 맞서 전후 폐허가 된 일본을 재건한 영웅으로 찬양하면서 그를 ‘해적’으로 부른 것이다. 이 소설은 아베 신조(安倍晋三) 총리가 페이스북에서 강력하게 추천하면서 더욱 유명세를 타고 있다.
 그렇지만, 왜구는 약탈, 살상, 방화, 납치를 자행했던 집단인 만큼 당시 일본의 무로마치 막부정부에도 용납될 수 없었던 불법적인 존재였다. 더구나 오늘날 전시약탈이 국제범죄로 확고히 정착된 마당에 역사적으로 수백 년간 집요하게 인접국을 침략하여 약탈을 자행했던 왜구는 평화, 선진적인 이미지를 뒤집어쓴 오늘날의 일본인들에게 대외적으로는 부담스럽고 곤란한 존재임에 틀림없다. 
 이러한 분위기와 맞아떨어졌는지, 1980년대부터 일본인 학자들의 왜구 재해석이 쏟아지기 시작했다. 사실상 왜구에 대한 기록은 피해국인 고려와 조선, 중국에는 상당히 남아 있지만 일본에는 거의 존재하지 않는다. 정치적 목적이 없었던 약탈자들이 기록을 남길 리 없었기 때문이다. 왜구에 관한 자료공백은 학자들의 역사 재해석을 용이하게 해 주었다.

일본에는 왜구에 대한 기록이 거의 존재하지 않아 일본인 학자들의 역사 재해석을 용이하게 했다.