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 “현재 우리 과학자들의 국방과학 수준은 중졸 수준밖에 안 된다. 이제부터 과학자들에게 최우선적으로 연구사업을 지원하고 생활도 보장해 줄 테니 국방과학 분야에서 새로운 혁신을 일으켜 보라.”
 미사일 개발을 전폭적으로 지원하겠다고 선언한 셈이다. 제2자연과학원은 지금도 10월 25일을 과학원이 획기적으로 발전할 수 있었던 날로 기리고 있다. 김정일의 첫 현지지도일로 명명하고 창립절보다 더 크게 기념한다.
 김정일은 구체적인 지시도 내렸다.
 “우리는 반드시 전쟁을 통해 무력으로 조국을 통일해야 한다. 다가올 전쟁은 6·25때와는 다르다. 특히 전자전에 대비할 수 있도록 연구하면서, 해안포를 비롯한 모든 지상포들의 장거리포(주체포)에 미사일 개발연구 역량을 집중하라.”
 당시 제2자연과학원 전시관에는 70mm 주체포가 전시돼 있었다. 김정일은 “구경을 확대하고 서울을 직사로 쏠 수 있는 수준으로 (로켓과 미사일을) 개발하라”면서 “과학원이 가장 주되는 사업으로 끌고 나가야 할 것은 각종 미사일 개발”이라고 직접 과업을 지시했다.
 이후 166로켓트 공학연구소를 크게 확장했다. 산하에 있던 발동기실을 628연구소로 분리하고, 조직 전체가 미사일 개발연구에 총력을 집중하기 시작했다.
 김정일은 제2자연과학원에 있는 종합 사판(건물을 축소해 놓은 모형)을 보며 조직 이전 지시도 내렸다. 제2자연과학원을 국방과학의 특수 전초기지로 만들기 위해서는 비밀이 보장되어야 한다는 취지였다. 과학원 지구 안에 있는 다른 기관들을 모두 이전하라는 지시도 했다. 심지어 지구 안에 중앙방송국의 방송탑이 있었는데, 방송탑까지 다른 곳으로 옮겨야 했다.

김 씨는 반드시 전쟁을 통해 무력으로 통일을 해야 한다며 전자전에 대비할 수 있도록 연구하고 장거리포에 미사일 개발 연구 역량을 집중하라는 구체적인 지시도 내렸다.