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 참근교대제를 설명하기 위해서는 에도시대의 통치구조에 대한 이해가 필요하다. 에도막부의 통치는 쇼군과 다이묘 간의 주종(主從)관계를 기초로 한다. 다이묘는 쇼군으로부터 봉토를 하사받아 그 토지와 부속된 인민에 대한 행정권, 입법권, 사법권을 망라하는 통치권을 행사한다. 쇼군은 이러한 다이묘들로부터 충성과 군역(軍役), 그리고 막부가 시행하는 공공사업의 분담 의무(이를 ‘천하보청(天下普請)’이라 한다)를 부과하고 필요시 다이묘의 지위를 박탈할 수 있는 권위를 확보함으로써 일본 전역을 통치한다. 이러한 지방분권적 요소와 중앙집권적 요소가 혼재하는 이중구조의 통치 체제를 막번(幕藩) 체제라 한다.
 막번 체제의 특징 중에 눈에 띄는 것은 중앙의 막부가 기본적으로 각 번에 대해 조세권을 행사하지 않았다는 것이다. 번주는 관할 지역에서 징수한 세금에 대한 전적인 통제권을 행사한다. 이것이 각 다이묘들이 누리는 자치권의 핵심이었다. 중앙의 권위가 밑바닥으로 추락한 전국시대에 형성된 기득권의 형태로 인정되기는 하였으나, 감시의 눈에 한계가 있는 원격지에서 독립된 재정권을 행사하며 부(富)를 축적하는 다이묘는 쇼군에게는 잠재적 위협이었다.
 이러한 다이묘들의 세력 확장을 견제하기 위해 에도의 쇼군이 내민 회심의 카드가 참근교대이다. 참근교대로 인해 전국의 모든 다이묘는 원칙적으로 처자를 에도에 남겨둔 채 1년을 단위로 에도와 번을 오가며 생활해야 했다. 참근교대에 저항하면 바로 다이묘의 지위가 박탈(이를 ‘お家取り潰し-오이에토리쓰부시’라 한다)된다.

이러한 지방분권적 요소와 중앙집권적 요소가 혼재하는 이중구조의 통치 체제를 막번(幕藩) 체제라 한다. 막번 체제의 특징 중에 눈에 띄는 것은 중앙의 막부가 기본적으로 각 번에 대해 조세권을 행사하지 않았다는 것이다.