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 1894년 동학혁명이 일어나자 조선은 내정(內政)개혁을 담당할 군국기무처(軍國機務處)를 설치하고 영의정 김홍집으로 하여금 개혁을 단행하게 하였다. 이 개혁내각에 어윤중은 탁지부(度支部)의 대신(기획재정부장관)에 임명된다. 내각은 오랫동안 조선사회의 폐단으로 지목되어 왔던 여러 제도 및 관습에 대해 대대적인 개혁을 단행하였다.
 재정·경제부문의 개혁은 어윤중이 중심이 되어 단행했다. 우선 국가재정을 하나로 통합하기 위해 조세수납을 탁지부로 일원화했다. ‘신식화폐장정’을 의결하여 은본위제(銀本位制)를 채택하는 한편, 종래의 물납세제(物納稅制)를 금납제(金納制)로 대체하고, 전국적으로 도량형(度量衡)을 통일시켰다. 그리고 과거부터 자신이 건의해 온 비리와 수탈로 얼룩진 조세개혁안을 시행했다.
 어윤중의 긴축정책과 조세개혁을 세간에서는 어윤중을 ‘전(田)조림(성씨 魚의 중간 부분인 田를 따서 붙인 별명)’이라고 부르면서 응원했다. 어윤중은 고종과 민비의 요청도 법에 어긋나면 이를 단호하게 거절했다. 일본 측이 300만원의 차관을 일본화폐로 주려고 했지만, 어윤중은 은(銀)이 아니면 받지 않겠다며 거절했다.
 황현의 《매천야록》은 어윤중의 이러한 태도에 관한 일화를 전하고 있다. 고종이 자신의 마음에 들지 않는 군부대신 조희연을 물러나게 하려고 하자 대신들이 반대했다. 고종이 화를 참지 못하고 “대신 하나도 물리치지 못한다면 어찌 임금 노릇을 할 수 있단 말인가?”라면서 옥새를 집어던졌다.

동학혁명이 일어나자 조선은 내정 개혁을 담당할 군국기무처를 설치하고 영의정 김 씨로 하여금 개혁을 단행하게 하며 여러 제도 및 관습에 대해 대대적인 개혁을 단행했다.