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 빈 라덴 제거 이후 미국이 테러와의 전략을 수정한 것처럼 알 카에다도 지하드(聖戰)의 의지를 다시 한 번 다짐하면서 새로운 전략을 모색하고 있다. 
 알 카에다는 지난 6월 16일 빈 라덴이 사망한 지 46일 만에 제2인자였던 아이만 알 자와히리(59)를 새로운 지도자로 선출했다. 
 이집트 출신인 알 자와히리는 그동안 알 카에다의 모든 작전을 총괄해 왔다. 빈 라덴보다 더욱 강경한 인물인 알 자와히리는 뛰어난 전략가이자 이론가이다. 빈 라덴과 함께 알 카에다를 만들었던 알 자와히리는 최소한의 희생으로 최대의 타격을 입힐 수 있는 자살공격에 집중해야 한다고 주장하는 등 과격한 투쟁을 선호해 왔다. 외과 의사였던 알 자와히리는 지난 1998년부터 아프간에서 빈 라덴과 함께 투쟁해 왔다. 그의 목에는 현상금 2500만 달러가 걸려 있으며, 이집트에서 각종 테러 관련 혐의로 결석재판을 통해 사형(死刑)을 선고받은 상태이다. 
 알 카에다는 성명을 통해 “알 자와히리는 침략자인 미국과 이스라엘, 그들을 지지하는 모든 세력에 대해 성전을 수행할 것”이라면서 “알 자와히리의 지도력으로 새 시대가 열리길 기도한다”고 밝혔다. 알 자와히리는 “미국에 대한 지하드는 지도자(빈 라덴)의 죽음과 함께 멈추지 않는다”면서 앞으로 투쟁을 계속할 것이라고 다짐했다. 
 알 카에다는 알 자와히리의 말처럼 ‘제2의 9·11테러’를 모의하고 있을 가능성이 있다. 미국 대테러 기관들은 알 카에다가 상당히 약화되기는 했지만 새로운 테러 수법과 무기를 개발하고 있기 때문에 여전히 가공할 테러를 자행할 가능성이 있다고 보고 있다. 최악의 경우, 알 카에다가 항공기와 열차를 이용해 핵을 비롯해 대량살상무기를 폭파시킬 수도 있다. 오바마 대통령도 “알 카에다가 핵무기를 획득한다면, 이를 사용하는 데 아무런 양심의 가책을 느끼지 않을 것”이라고 경고한 바 있다. 미국이 그동안 파키스탄 정부에 핵무기에 대한 철저한 관리를 요청해 온 것도 만에 하나의 가능성을 막기 위한 것이다. 

알 카에다는 라덴이 사망하자 라덴보다 더욱 강경한 인물이며 전략가이자 이론가인 2인자 아이만 알 자와히리를 새로운 지도자로 선출했다.