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 선조의 즉위와 함께 조선 역사에서 처음으로 적통(嫡統)이 아닌 임금이 탄생했다. 명종(明宗)은 세자(世子)가 일찍 죽고 후사(後嗣)를 얻지 못했기 때문이다. 결국 위로 거슬러 올라가 중종과 창빈 안씨 사이에서 난 덕흥군의 아들 이균을 신왕으로 삼았다. 후궁의 아들도 아닌, 후궁의 손자가 임금에 오를 때부터 약군(弱君)은 예정된 것이었다. 그는 연산군과는 반대로 눈 밝기는 하지만 굳세지가 못했다[明而不剛].
 선조 1년(1568년) 4월 11일 즉위하자마자 기묘사화로 죽은 조광조에게 벼슬과 시호(諡號)를 추증(追贈)하는 교서(敎書)를 내렸다. 사림, 즉 주자학도들의 복권(復權)을 알리는 신호탄이었다. 여기서 벌써 선조 자신이 국시라는 말을 쓰고 있다.
 “이번 즉위한 처음을 당하여 국시를 정하지 않을 수 없고 선비의 풍습을 바로잡지 않을 수 없다. 이는 곧 선왕의 뜻을 잇고 일을 계승하는 일로서 세상의 도를 옮기는 것은 이 한 일에 달렸다. 이에 큰 벼슬과 아름다운 시호를 추증하여 사림의 나아갈 방향을 밝히고 백성의 큰 소망에 보답할 것이니, 이를 이조에 내리라.” 
 앞서 우리는 국시 못지않게 중요한 것이 공론이라고 했다. 선조 3년(1570년) 5월 18일 옥당(玉堂·홍문관)에서 올린 차자에 이 둘의 관계가 분명하게 드러난다.
 “삼가 생각건대 한때의 국시는 어지럽힐 수 있어도 만세의 공론은 없앨 수 없으며 한때 사람들의 말은 막을 수가 있어도 만세 사람들의 마음은 속이기가 어렵습니다. 그러므로 옛부터 국시가 한때 전도(顚倒)되었더라도 반드시 없어지지 않는 공론에 의해 정해지게 되는 것입니다.”

명종(明宗)은 세자(世子)가 일찍 죽고 후사(後嗣)를 얻지 못했기 때문이다. 선조의 즉위와 함께 조선 역사에서 처음으로 적통(嫡統)이 아닌 임금이 탄생했다.