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 그러나 이러한 일본 정부의 입장은 시모다 재판 이후 180도 바뀌게 된다. 피폭 피해자로부터 국가배상의 청구를 받은 일본 정부는 피고의 입장에서 재판 당시 다음과 같이 항변하였다.
 “객관적으로 보았을 때, 히로시마와 나가사키에 투하된 원폭이 국제법을 위반하였는가에 대해서는 누구도 결정을 내릴 수 없다. 더구나 핵무기 사용 금지에 관한 국제적 합의가 아직 형성되지 않았음에 비추어 볼 때, 원폭투하를 섣불리 위법행위라고 단정 지을 수 없다. (중략) 국제법의 관점에서 전쟁은 근본적으로 적을 항복시키기 위해 필요한 모든 수단을 사용할 수 있는 상황이다. 중세 이래 국제법에 따르면, 해당 시점에 채택된 관습법과 조약이 부과한 조건을 준수한다는 전제하에, 전투원은 전쟁의 특별한 목적 달성을 위해 적을 타격하기 위한 수단을 선택할 수 있다.”
 일본의 이러한 입장 변화는 세 가지 측면에서 비롯되었다. 첫째 요시다(吉田) 총리를 비롯한 전후 수습 내각의 ‘어차피 진 전쟁 구질구질하게 굴지 말고 깨끗하게 승복하는 것이 일본의 정신’이라는 무사도(武士道)적 가치관, 둘째 전후 일본 복구 및 미·일 동맹체제 강화가 최우선의 당면과제인 만큼 미국과의 전쟁행위 관련 쟁송으로 미·일관계에 부담이 되는 것을 봉쇄하기 위한 체제적 필요성, 셋째 미국의 전쟁범죄 추궁을 위하여 당시 존재하지 않았던 국제규범 위반을 들먹일 경우 그러한 추궁이 고스란히 일본에 돌아올 수 있다는 쌍방행위자로서의 고려 등이 그것이다.

피폭 피해자로부터 국가배상 청구를 받은 일본 정부는 객관적으로 히로시마와 나가사키에 투하된 원폭이 국제법을 위반하였는가에 대해서 누구도 결정을 내릴 수 없다고 항변하였다.