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 16세기 중반 유럽 세력과 최초로 조우한 일본은 누구보다 이 생면부지의 이방인들을 호의적으로 대하였다. 포르투갈인들의 입장에서 보면 1543년 다네가시마(種字島)에 최초로 발을 내디딘 이래 일본처럼 교역의 물꼬가 순조롭게 트인 곳은 없었다. 일본에 도달하기 전에 거쳐 온 인도, 동남아, 중국 등지에서 적대적 환경 속에서 어렵사리 교역의 문을 두드려야만 했던 포르투갈인들에게 먼저 적극적으로 교역의 문을 열고 자신들을 대하는 일본은 신비하고도 특별한 존재였다.
 에도 막부가 1634년 나가사키에 데지마(出島)라는 인공섬을 만들어 네덜란드 상관을 이전하고, 쇄국정책의 기조하에 데지마를 유럽과의 교역 창구로 열어 두었다는 것은 널리 알려진 사실이다. 이 데지마에 설치된 상관(商館)이 팩토리에 해당하는 시설이다. 네덜란드인들로서는 격리된 협소한 장소에 팩토리를 두는 것이 성에 차지는 않았지만, 워낙 일본과의 교역이 가져다주는 이익이 막대하였기에 거액의 사용료를 내면서까지 데지마에 팩토리를 19세기 중반까지 유지하였다. 데지마라는 인공섬의 조성 경위도 흥미롭지만, 사실 더욱 흥미로운 것은 일본인들이 데지마 조성 이전인 16세기 중반부터 17세기 초반에 걸쳐 당시 접근해 온 유럽인들에 대해 보인 인식과 태도였다. 
 포르투갈과 일본 사이에 가장 먼저 교역이 이루어진 곳은 히라도(平戶)이다. 히라도의 영주 마쓰라 다카노부(松浦隆信)는 1550년 예수회 선교사 루이스 프로이스의 히라도 체재와 선교를 허용하는 대가로 포르투갈 상선의 입항을 유치한다. 마쓰라가 기대한 대로 포르투갈인들과의 무역은 히라도에 큰 경제적 이득을 가져다주었다. 그러나 기독교 포교로 인한 불교도들과의 마찰로 교회가 불타고 거래 분쟁으로 포르투갈인들이 살상되는 사태가 발생하자 포르투갈인들은 1562년 입항지를 인근 요코세우라(横瀬浦)로 옮겨 버린다.

포르투갈인들은 인도, 중국 등지에서 어렵게 교역의 문을 두드렸는데 16세기에 유럽 세력과 최초로 조우한 일본은 포르투갈인들에게 호의적이고 먼저 적극적으로 교역의 문을 열었다.