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 이스라엘 군부가 작전 계획을 수립하는 사이 치피 리브니 외무장관은 공격 이후의 외교적 대응 매뉴얼을 만들기 시작했다. 그는 공격 후 각국에서 “왜 공격한 것이냐”고 문의할 경우에 대비한 답변서를 만들었다. “우려해주는 것을 감사하게 생각한다. 시리아에는 무엇인가가 있었던 것 같다. 그러나 우리는 공식 대응을 삼가기로 했다. 다른 전화 통화가 예정돼 있어 이만 끊어야 할 것 같다. 우리 쪽에서 곧 찾아가 구체적인 내용을 설명하겠다.”
 리브니 장관은 법률 전문가들을 소집해 전쟁이 발발할 가능성에도 대비했다. 법률 전문가들은 유엔 안보리에 제출할 결의안을 미리 작성했다. 결의안에는 사건 경위와 이스라엘의 행동은 정당방위라는 점을 강조하는 내용이 담겼다. 시리아가 핵 비확산 조약을 어기고 불법적으로 핵무기 개발에 나선 것을 전 세계가 규탄해야 한다는 내용도 포함됐다.
 모사드와 아만은 심리학자와 정신분석가들을 불러 알아사드가 어떻게 나올지에 대해 토의했다. 가비 아슈케나지 이스라엘 방위군 참모총장은 알아사드가 보복에 나설 가능성은 50%로 내다봤다. 보복 여부는 이스라엘 정부와 정치인들이 모두 침묵을 지키는지에 달려 있다고 했다. 그는 각료회의에서 “침묵을 지키지 않는 사람은 발발하게 될 전쟁에 책임이 있는 사람”이라며 “우리는 알아사드가 거짓말할 수 있는 기회를 줘야 한다”고 했다.
 이스라엘의 딜레마는 몇 달간 지속됐다. 원자로를 폭격하면 시리아와의 참혹한 전쟁으로 이어질 수 있다는 고민, 폭격하지 않는다면 적국(敵國)이 핵무기를 갖게 된다는 고민이었다. 정책 결정권자로서는 쉽게 결정을 내릴 수 없는 문제였다.

원자로를 폭격하면 시리아의 참혹한 전쟁으로 이어질 수 있다는 고민과 폭격하지 않으면 적국이 핵무기를 갖게 된다는 고민 속에서 이스라엘의 딜레마는 몇 달간 지속됐다.