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 이후 국방부와 SPDC에서 요직을 거친 그는 2004년 당시 권력서열 3위이자 총리인 킨 윤 장군의 친위쿠데타가 실패하면서 대대적인 숙청과정에 권력서열 4위의 자리에 올라섰다. 킨 윤 장군은 SPDC 제1서기와 국가정보국장을 지낸 온건파였다.
 킨 윤 장군의 후임으로 강경파인 소윈 장군이 총리직을 맡았지만 2007년 백혈병으로 사망했다. 소윈 전 총리는 1988년 민주화 시위를 가장 잔악하게 진압했고, 2003년 수치 여사를 암살하려는 음모를 꾸미기도 했던 강경파였다.
 탄 슈웨의 지명으로 후임 총리가 된 세인은 군정의 ‘얼굴마담’으로서 국제회의에 참석하는 등 활발한 대외활동을 해 왔다. 군정 이후를 대비하던 탄 슈웨 등 군부 지도자들도 부패라든지 민주화 시위 유혈진압과 인권유린 등과는 무관했던 세인을 민정의 대통령으로 낙점했다. 특히 그가 대통령이 된 가장 중요한 이유는 군정 체제와 군부 지도자들에게 위협이 될 만한 권력기반이 없기 때문이었다.
 미얀마 군은 육·해·공 3군으로 편성되어 있으며 통합군 체제이다. 총 병력은 45만5000명이다. 육군의 병력은 43만명이고, 14개 지역사령부, 10개 경보병사단, 10개 기갑단, 10개 야포단이 있다. 탱크 800대, 장갑차 324대, 야포 270문 등을 보유하고 있다. 해군 병력은 1만6000명이고, 5개 해군지역사령부가 있다. 프리깃함 8척, 소형 연안경비정 등 함정 150척을 보유하고 있다. 공군 병력은 9000명이고, 10개 비행기지가 있다. MIG-29 전투기 32대, F-7 전투기 58대, A-5 지상군 지원전투기 36대 등 항공기 280대, 헬기 70대 등을 보유하고 있다.

군부 지도자들로부터 세인이 민정의 대통령으로 낙점된 이유는 군정 체제 등에 위협이 될 만한 권력기반이 없기 때문이다.