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 재판부는 미국의 원폭투하를 국제법 위반으로 판단하였지만, 이에 대한 일본 정부의 속내는 복잡하였다. 일본 정부가 대외적으로 표명한 입장은 여러 차례 변화하였다. 
 1945년 8월 원폭투하 직후 일본 외무성은 다음과 같은 외교적 항의서한을 미국에 발송하였다.
 “교전자는 적을 타격하기 위한 수단의 선택에 있어 무제한의 권리를 향유하는 것은 아니다. 이는 국제법의 확고한 원칙이다. 따라서 우리는 불필요한 고통을 야기하는 무기, 발사체, 물질을 도입해서는 안 된다. 이는 〈육전규칙에 관한 헤이그협약〉의 부속서에 명시되어 있다. (중략) 미국이 이번에 사용한 폭탄의 무차별성과 잔인성은 독가스나 동종 무기를 훨씬 능가하며, 이러한 무기의 사용은 이러한 특성으로 인해 금지된다. 미국은 국제법과 인도(人道)의 근본적 원칙을 무시하였으며 제국의 도시에 대해 무차별적 폭격을 가하였고 이는 수많은 어린이, 여성, 노인들의 살상과 수많은 사원, 학교, 병원, 민간 거주지의 파괴로 이어졌다. 그럼에도 불구하고, 미국은 무차별성과 잔인성에 있어 기존의 어떤 무기도 월등히 능가하는 새로운 폭탄을 사용하였다. 그러한 무기의 사용은 인류문화에 반(反)하는 새로운 유형의 범죄이다.”
 히로히토 천황도 항복담화에서 “적은 그 힘을 알 수 없는 새롭고 잔인한 무기를 사용하기 시작하였다. 우리가 싸움을 계속한다면 일본의 완전한 멸망에 봉착하게 될 것이며 이는 동시에 인류 문명의 종말로 이어지게 될 것이다”라고 언급하면서 원폭이 ‘인류 문명의 종말’을 초래할 수 있는 반인륜적 무기라고 주장하였다.

재판부는 미국의 원폭투하를 국제법 위반으로 판단하였지만, 이에 대한 일본 정부의 속내는 복잡하였다. 일본 정부가 대외적으로 표명한 입장은 여러 차례 변화하였다. 1945년 8월 원폭투하 직후 일본 외무성은 다음과 같은 외교적 항의서한을 미국에 발송하였다.