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 일본의 잠수함은 설계상 많은 문제점을 노출했다. 2인승 A형 잠수정은 대양에서 운용하기에 항속거리가 짧았을 뿐만 아니라 잠망경 노출 높이가 낮아 파도 속에서 선체가 돌출되거나 파도에 가려 표적을 관측할 수 없었다.
 기본적으로 전기·통신 기술이 미국에 뒤떨어져 음탐기, 레이더, 사격통제장치, 통신기 등의 성능은 미국 잠수함에 비해 상대가 되지 않았다. 심지어 에어컨과 습기제거제가 없어 열대 해역의 경우 일본 잠수함 승조원들은 섭씨 37도 이상의 실내에서 탈진상태로 지내야 했다.
 그러나 일본 잠수함이 사용한 어뢰의 성능만은 세계 최고 수준이었다. 당시 일본이 사용한 어뢰는 속도, 주행거리, 폭약 성능이 우수해 전 세계 어뢰 가운데 가장 신뢰도가 높았다. 그러나 우수한 어뢰 성능에도 불구, 잠수함 운용 전략과 전술의 실패로 잠수함들은 제대로 실력을 발휘할 수 없었다.
 막다른 골목에 몰린 일본은 하늘에서는 자살특공대 ‘가미카제’를, 수중에서는 ‘가이텐(回天)’을 운용했다. 미국을 상대로 정상적인 작전을 펼칠 항공기와 수상함 전력이 턱없이 부족했기 때문이다. 잠수함 부대는 잠수정과 어뢰의 특성을 살린 자살병기로 2명이 조종해 표적에 돌진하는 ‘인간어뢰’였다.
 레이테만 해전에서 가미카제 특공대가 미 항공모함에 타격을 가하자, 일본은 혼슈 부근 오쓰섬(大津島) 가이텐 비밀기지에서 훈련 중인 장교들을 1944년 11월 8일 처음으로 12척의 가이텐에 올려 미 구축함 접근을 시도했으나, 1척만이 미 유조선 USS 미시시네와를 격침시키고 나머지는 침몰 또는 좌초하고 말았다.

설계상 많은 문제점을 노출한 일본의 2인승 A형 잠수정은 잠망경 노출 높이가 낮아 파도 속에서 선체가 돌출되거나 파도에 가려 표적을 관측할 수 없었다.