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 1628년 인질을 태운 야효에의 주인선과 란선(蘭船)이 무사히 나가사키에 도착하면서 타이오완 사건은 큰 탈 없이 종료되는 듯하였으나, 갑자기 사태가 이상한 방향으로 흐르기 시작한다. 야효에는 신변에 위협을 느껴 자기방어 차원에서 인질을 잡은 것이고 나가사키에 도착하면 인질을 풀어주기로 약속한 터였다. 그러나 이들을 맞은 스에쓰구는 인질을 석방하기는커녕 다른 VOC 선원들까지 잡아 옥에 가두고 그들이 타고 온 배를 억류하는 한편, 히라도(平戶) 번주를 설득하여 히라도에 개설된 VOC 상관(商館)을 폐쇄해 버린다. 네덜란드 자유상인의 개인 무역은 허용하면서도 VOC 선박·인원의 히라도 활동을 금지하는 VOC 제재 조치였다.
 사실 야효에의 선단에는 400명이 넘는 병력과 대량의 뎃포(鐵砲·조총)가 적재되어 있었다. 기회를 보아 VOC를 공격하는 것이 당초 임무였으나, 그에 실패하고 인질을 잡아 돌아온 것일 수 있다. 만약 그렇다면 스에쓰구가 입항한 VOC 선박을 억류하고 선원을 구금한 것은 어쩌면 계획 변경에 불과한 것일 수도 있다.
 나가사키와 히라도의 상황을 보고 받은 바타비아가 대일(對日) 교역 단절의 위기를 맞아 직접 나서면서 타이오완 사건은 전면적인 외교문제로 비화한다. 총독 쿤은 일단 불상사의 책임을 물어 노위츠를 바타비아로 소환하는 한편, 인질 구출 및 무역 재개를 위해 일본에 특사를 파견한다. 쿤은 특사 빌렘 얀센(Willem Janssen)에게 최대한 일본인들을 존중하는 태도를 보이고 절대 도발하지 않도록 주의를 주는 한편, 일본이 타이완의 영유권(領有權)과 무역 독점권을 주장할 경우 총독에게 보고하겠다는 정도로 대응하고 귀환할 것을 지시한다. VOC와 스에쓰구 중 누가 쇼군을 자기편으로 만드느냐의 싸움이었다. 

일본에 특사를 파견한 총독 쿤은 일본이 타이완의 영유권과 무역 독점권을 주장할 경우 총독에게 보고하겠다는 정도로 대응하고 귀환할 것을 지시한다.