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 아관파천으로 친러 정권이 수립되었으나 조선의 경제는 여전히 일본이 독점적으로 지배하고 있었다. 또한 러시아도 삼국간섭 후 1896년 동청철도(東淸鐵道)의 부설권을 획득한 데 이어 1898년 여순(旅順)과 대련(大連)을 조차하고 해군 근거지를 계획했다. 러·일 양국은 긴장이 고조되는 가운데 만주와 조선 문제에 관해 협상했다. 일본은 조선을 자국의 보호령으로 하는 대신, 만주에서 러시아의 우월권은 인정한다는 입장인 반면, 러시아는 만주를 일본의 세력 범위에서 제외시키고, 조선에서의 일본의 군사활동 제한 및 39도 이북의 중립지대 설정을 주장하였다.
 러시아와의 타협 여지가 없어지자 삼국간섭의 경험이 있는 일본은 해양세력 영국과 미국에 접근했고 이들은 러시아의 남하를 저지하기 위해 일본을 적극 지원하면서 만주에 대한 러시아의 기득권을 부정했다. 1904년 일본군은 서울에 진주해 한반도를 전쟁물자 보급기지로 삼고, 1905년 리바우(Libau)항을 떠나 아프리카 남단을 돌아오느라 전력이 떨어진 발틱함대를 대마도해전에서 격파했다.
 그러나 전쟁이 장기화하면서 양측 모두 종전을 서둘러야만 할 입장이었다. 당시 일본군은 막대한 재정 부담을 지고 있었고, 러시아는 1905년 1월 노동자들 시위에 군인이 발포하면서 ‘피의 일요일’(제1차 러시아혁명) 사건이 일어났다. 러·일 양국은 미국 시어도어 루스벨트(Theodore Roosevelt) 대통령의 평화제의를 수락했고, 포츠머스(Portsmouth)에서 강화회담이 열렸다. 일본은 한국에 대한 일본의 자유처분권과 만주에서의 러시아군 철수 그리고 요동반도의 조차권 등을 요구했다.

러·일 양국은 미국 루스벨트 대통령의 평화제의를 수락했고 포츠머스에서 강화회담이 열렸는데 일본은 한국에 대한 일본의 자유처분권과 만주에서의 러시아군 철수를 요구했다.