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 에볼라도 생물학무기로 사용될 가능성을 배제할 수 없다. 이와 관련, 《워싱턴포스트》는 옛 소련이 냉전시대인 1970년대 말부터 에볼라 바이러스를 생물학무기로 개발하기 위해 비밀리에 연구해 왔다면서 러시아도 이 연구를 계속해 왔다고 보도했다(10월 24일자). 옛 소련의 비밀 군사시설에서 진행된 에볼라 바이러스 연구는 백신을 비롯해 전염성이 훨씬 강한 변종 에볼라 바이러스의 개발과 에볼라 바이러스 유전자의 복제 시도 등도 포함됐다. 이 연구들은 모두 성과를 내지 못했고, 옛 소련이 해체된 1991년 에볼라 바이러스의 무기화 연구는 공식 중단됐다. 하지만 1991년 이후에도 적어도 네 곳의 비밀 연구시설에서 에볼라 바이러스를 비롯한 병원체 연구가 계속됐고, 1996년과 2004년에는 연구원이 감염 사고로 목숨을 잃는 일도 있었다.
 미국도 육군 전염병연구소(USAMRIID)에서 에볼라 바이러스를 연구해 온 것으로 추정된다. 캐나다 제약사인 테크미라사는 지난 2010년 보스턴대학 전염병연구소 및 미국 육군 전염병 연구소와 공동으로 진행한 실험에서 유전자제어기술을 활용해 영장류를 에볼라로부터 보호하는 데 성공했다는 보고서를 영국 의학전문지 《랜싯》에 실은 적이 있다. 테크미라사는 현재 에볼라 치료약 ‘TKM-에볼라’를 개발 중이다. 미국 국방부는 ‘TKM-에볼라’ 개발에 1억4000만 달러를 지원한 것으로 알려졌다. 에볼라에 감염된 환자들에 투여돼 효과를 본 실험용 치료제 지맵(ZMapp)의 개발사인 미국 맵바이오제약도 국방부 산하 국방위협감소국(DTRA)과 연구를 공동으로 해온 것으로 알려졌다.

워싱턴 포스트는 에볼라가 생물학무기로 사용될 가능성과 관련해 1970년대 말부터 에볼라 바이러스를 생물학무기로 개발하기 위한 연구를 해왔다고 했다.