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 황금양털을 가져올 때 메데이아가 벌였던 무용담은 이미 소문이 나 있었다. 대단한 마법사라는 소문을 이렇게 눈앞에서 분명하게 확인하니 그녀들이 믿지 않을 수 없었다. 그리고 드디어 아버지 펠리아스를 젊게 만드는 시술(?)에 들어간다. 그렇게 늙은 펠리아스는 목이 따인 채로 항아리에 담긴다. 하지만 그는 다시 젊어지지 않는다. 그 항아리에 담긴 것은 신비한 약물이 아니었으니 말이다. 그렇게 펠리아스는 죽고 드디어 왕국은 이아손에게 넘어간다.
 그럼 이후 메데이아는 어떻게 되었을까? 메데이아는 이아손의 아들 둘을 낳는다. 하지만 곧 이아손은 다른 여자에게로 눈을 돌린다. 이아손이 메데이아를 버리고 코린토스(Corinth)의 공주 글라우케(Glauce)와 결혼하려 한다.
 메데이아가 가만히 있을 리 없다. 분노한 메데이아는 남편의 새 결혼식 날 새 신부 글라우케의 옷에 독을 발라 그녀를 살해한다. 그리고 글라우케의 아버지인 코린토스 왕 크레온(Creon)도 죽게 만든다. 자신의 아들이자 이아손의 적자인 두 아들마저 죽여 버린다. 왕의 대를 끊어 버린 것이다.
 메데이아는 분노한 이아손을 피해 날개 달린 용이 끄는 수레를 타고 하늘로 날아올라 아테네로 가서 아이게우스 왕과 결혼한다. 그러나 아이게우스의 아들 영웅 테세우스가 돌아오자 다시 쫓겨나, 결국 그녀의 고향인 콜키스로 돌아간다. 돌아가서 자신이 배신했던 아버지가 그 일로 나라를 뺏겼다는 것을 알고는 다시 나라를 되찾게 한다. 메데이아의 최후가 어땠는지는 자세히 모른다. 다만 그녀가 자신이 왔던 ‘동쪽 나라’로 돌아갔다는 것뿐이다. 예전 중동아시아에 있던 ‘메디나’라는 나라의 이름이 그녀에게서 온 것도 이 때문이다.

남편 이아손의 신부를 살해한 메데이아는 아테네로 가 아이게우스 왕과 결혼했지만 테세우스가 돌아오자 다시 쫓겨나서 콜키스로 돌아갔다.