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 2000년 4월 9일 있을 대선을 앞두고 원주민(인디오) 출신 야당 후보인 알레한드로 톨레도의 인기가 급상승했다. 톨레도는 구두닦이에서 미국 스탠퍼드대학 박사 학위를 따고 세계은행에서 근무한 입지전적 인물이었다. 후지모리의 장기집권과 독재, 공산 게릴라 진압 과정에서 발생한 인권 유린, 부정부패 등에 피로감을 느끼고 있던 페루 국민들, 특히 인디오들은 톨레도의 등장에 열광했다. 국제 선거감시단은 선거 유세 과정에서 각종 부정이 있었으며, 결선투표가 실시될 경우 후지모리가 3선 당선을 위해 부정선거를 감행할지도 모른다고 경고했다.
 대선 투표 직후 나온 출구조사 결과들은 ‘후지모리 당선’과 ‘톨레도 승리’를 점치는 것으로 엇갈렸다. 톨레도의 승리를 알리는 출구조사 결과에 이어 후지모리가 톨레도를 48.7% 대 41.0%로 눌렀다는 출구조사 결과가 나오자, 톨레도 지지자들은 ‘부정선거’ ‘독재 타도’를 외치며 거리로 나섰다. 톨레도는 “그들이 국민의 의지를 왜곡하려 든다면, 나는 앞장서서 우리의 권리를 지킬 것”이라고 말했다.
 결국 1차 투표 결과 후지모리는 49.87%를 획득해, 불과 2만여 표 차이로 과반수 획득에 실패했다. 후지모리 지지자들은 개표 결과가 나오기도 전에 국제사회가 선거 부정을 비판하고 나섰다고 볼멘소리를 냈지만, 각종 선거 감시 기구들은 후지모리 측이 선거인 명부 조작, 사전 대리 투표, 기표 용지의 타(他) 후보 이름 위에 밀랍 칠하기, 감시단의 개표 컴퓨터 접근 불허(不許), 공권력 동원 유권자 위협, 투표함 운송과 개표 지연 등 다양한 선거 부정을 저질렀다고 고발했다. 그야말로 부정선거의 백화점이었다. 제임스 루빈 미국 국무부 대변인은 최종 개표 결과가 나오기도 전에 “선거 부정의 확실한 증거가 있으며 결선투표를 기대한다”고 천명해, 미리 추가 개표 부정 가능성에 쐐기를 박았다.

2000년 대선을 앞두고 구두닦이에서 미국 스탠퍼드대학 박사 학위를 따고 세계은행에서 근무한 입지전적 인물인 톨레도의 인기가 급상승했다.