국토안보부는 크게 여섯가지 업무를 담당하도록 구상되었다. (1) 정보 수집과 경고 (Intelligence and Warning) (2) 국경 및 수송 안전 (Border And Transportation Security) (3) 국내의 테러방지 활동 (Domestic Counterterrorism) (4) 주요 시설 및 자원 보호 (Protecting Critical Infrastructure and Key Assets) (5) 테러로 인한 대참사 억제 (Defending Catastrophic Terrorism) (6) 위급 상황에 대한 대비 및 대응 (Emergency Preparedness and Response) 처음 세가지 업무는 기본적으로 테러 공격을 억제하는 것과 관련되어 있고, 다음 2가지 업무는 테러 공격에 대한 미국의 취약성을 감소시키는 것과 관련되어 있다. 마지막 업무는 일단 테러 공격으로 피해를 입게 된 경우 피해를 최소화하고 복구하는 것과 관련되어 있다. 두 번째 업무는 국경 순찰과 운송과 관련된 모든 부서들--이민국(Immigration and Naturalization Service), 관세청(Custom Service), 해안경비대(Coast Guard), 동식물검역소, 그리고 운송보안청(Transfortation Security Service)--를 국토안보부로 이전 통합하는 내용을 담고 있다.
국토안보부는 테러 공격을 억제하는 것과 관련된 정보 수집과 경고, 국경 및 수송 안전, 국내의 테러방지 활동, 테러 공격에 대한 미국의 취약성을 감소시키는 것과 관련된  주요 시설 및 자원 보호, 테러로 인한 대참사 억제, 일단 테러 공격으로 피해를 입게 된 경우 피해를 최소화하고 복구하는 것과 관련된 위급 상황에 대한 대비 및 대응으로 여섯 가지 업무를 담당한다.