페이고제도가 미국 연방의회의 과정과 구조 하에 제도화되었으므로 통치구조와 입법 및 예산과정이 다른 우리나라에 도입하는 것이 어렵다는 반론이 가능할 것이다. 먼저 미국은 예산안을 의회에서 편성하고 의결하나, 우리나라는 예산안을 행정부가 제출하고 의회는 예산을 삭감할 수만 있으며 새로운 항목의 신설을 중앙예산기관인 기재부의 동의를 받아야 한다. 또한 미국이 의무지출 대부분이 수권법안으로 의무지출은 별도의 지출법안을 구성하여 예산에 포함시킬 필요 없이 지출이 확정되나 우리나라의 경우 입법과 예산이 별도의 과정을 거쳐 확정된다는 특징이 있다.
미국과 달라 의회가 예산을 삭감할 수만 있고, 관련 새 항목 신설을 기재부 동의를 받아야 하는 등의 우리나라는 페이고제도 도입이 어렵다는 반론이 가능하다.