법원은 항고의 절차에 준하여 재정신청사건을 심리하여 결정한다(법 262조 2항). 따라서 재정신청사건을 심리하는 경우에는 서면심리가 허용되며 구두변론에 의함을 요하지 아니하고(법 37조 2항), 또 공판심리절차가 아니므로 법정에서 심리함을 요하지도 않으며, 그 심리에 재정신청인이나 피의자를 참여시킬 것인가 여부는 법원의 재량에 속한다(규칙 24조 2항). 재정신청 사건의 심리는 특별한 사정이 없는 한 공개하지 않는다(법 262조 3항). 이는 재정신청의 남발을 방지하고, 특히 민사사건의 형사사건화 및 재정신청을 민사사건에 악용하는 것을 방지하기 위하여 신설된 규정이다. 법원은 필요한 때 증거조사를 할 수 있으므로(법 262조 2항) 참고인조사, 증인신문, 검증, 감정 등이 허용되며, 피의자신문도 증거를 조사하는 경우에 해당하므로 허용된다고 해석된다.
법원은 항고 절차에 준해 재정신청사건을 다루는데 서면심리가 허용되며 장소가 꼭 법정일 필요도 없고 재정신청인, 피의자 참여여부도 법원의 재량이다. 이는 남발을 방지하고 재정신청을 민사사건에 악용하는 것을 방지하기 위함이다.