그런데 정치, 외교 안보, 행정, 법제, 경제, 사회 문화 통합연구는 상호 밀접하게 관련되어 있음에도 불구하고 각 영역별로 독자적으로 연구가 수행되고 있는 문제점이 있다. 이 영역 내의 하위부문 연구도 통합적 종합적 차원에서 연구가 이루어지지 못하고 있는 문제점을 드러내고 있다. 특히 여러 세부적인 분야로 구분되는 경제(화폐 금융, 재정 조세, 노동 임금, 산업 인프라, 농업 토지, 동북아경제통합)와 사회 문화(교육, 학술, 복지, 환경, 예술, 언어, 문화유산, 언론 통신, 체육, 관광) 분야의 경우에 이 같은 현상이 두드러졌다. 법제 분야의 경우에도 국내법과 국제법 간의 긴밀하고 유기적인 협력연구가 이루어지지 못하고 있는 것으로 평가된다. 연구의 편향성도 문제로 지적할 수 있다. 일부 주제의 경우에는 연구가 반복, 재생산되는가하면 일부 주제의 경우에는, 예를 들어 국제통상규범의 통합과 같이 연구의 필요성에도 불구하고 연구가 이루어지지 않고 있다.
정치, 외교, 안보, 행정, 법제, 경제, 사회 문화 통합연구는 상호 밀접하게 관련되어 있으며 그 필요성에도 불구하고, 각 영역과 영역 내 하위부문이 통합적 종합적 차원에서 연구가 이루어지지 않고 독자적으로 연구되고 있다.