조선어학회 사건은 선생에 의하여 발단되었다. 그 자세한 경위는 따로 기술될 것이므로 간략히 쓰겠다.
1942년 여름 함경남도 함흥에 있는 영생여자고등보통학교 학생 박영희님의 일기장에서 발단된 사건에서 그 학생에게 민족정신을 일깨워 준 선생을 찾아본 결과 정태진 선생을 지목하여 조선어학회에서 '조선말 큰사전' 편찬 중이던 선생을 붙잡아 가서 조사하여 보니 별 혐의를 찾을 수 없었다. 음흉한 왜경은 선생이 일하고 있는 조선어학회를 독립단체로 몰고 그 사전 편찬 사업이 불온한 동기에서 시작되어 배일 감정과 독립사상을 불러일으킨다고 트집 잡아 1942년 10월 1일부터 조선어학회 관련자 33명을 함경남도 홍원경찰서로 잡아들이고 음으로 양으로 도운 인사 48명을 증인으로 심문하였고 2년에 걸친 악랄한 고문 끝에 16명을 기소하였던바 예심에서 12명이 정식재판에 회부되어 5명은 실형이 선고되고 7명은 집행유예로 풀려  났는데 이들 중 선생은 1945년 7월 1일 만기로 출옥하였고 나머지 네 분은 상고를 하고 기다리다가 8월 17일 조국 해방으로 자유의 몸이 되었다.
이상이 조선어학회 사건의 줄거리인데 선생은 조선어학회 사건의 도화선이 된 셈이다. 자신이 이 일 때문에 동지들에게 미안한 마음을 끝까지 지녔음은 이미 말하였다. 그런데 왜경은 선생과 그 밖의 조선어학회 회원과를 철저히 따로 떼어놓아 그들이 만난 때는 잡혀 들어간 지 근 2년이 지나 예심이 끝날 무렵이었다고 한다. 왜경이 이들을 처벌하기 위하여 얼마나 악랄하게 허위 날조를 하였는지, 그래서 이 학자들을 얼마나 괴롭혔는지 알 만하다. 특기할 일은 광복 후 이 사건에 관련된 분들의 회고담이 많이 나왔는데 선생을 원망하거나 탓한 분이 없고 출옥 후에는 서로 협심하여 국어 교육과 사전 편찬에 온 힘을 다한 것으로 보아 이 분들의 고결한 정신과 동지애가 우러러 보인다. 선생 자신은 자기가 당한 일에 별로 말씀이 없었던 것도 선생의 심회나 인격을 엿보는 단서가 된다.
조선어학회 사건'은 영생여자고등보통학교 학생 박영희의 일기장을 통해 민족정신을 일깨워 준 자로 정태진 선생이 지목당하고, 선생이 잡혀가 조사를 받던 중 조선어학회 관련자라는 것이 드러나 조선어학회 관련자들을 체포해 일어난 사건이다. 33명이 체포되어 선생 포함 5명이 실형을 받았다. 그러나 이 일에 대해 선생은 미안함을 가졌으나 동지들은 선생을 원망하지 않았고 선생 자신도 자신의 옥고에 대해 따로 말한 바가 별로 없었다.