또한 비정부단체(Non-Government Organization: NGO)는 자국 내에서 인권침해가 발생하고 있는지 여부를 조사, 확인하고, 피해자를 대신하여 혹은 그들과 함께 피해를 구제하기 위하여 노력하며, 이런 과정에서 다른 나라의 NGO와 연대하여 국제사회에 알리고, 인권문제를 다루는 국제인권기구에 진정하기도 하고, 또한 재발 방지를 위한 국내적, 국제적인 제도적 장치를 제안하기도 하는 등 국제인권의 보호와 증진에서 NGO는 매우 중요한 역할을 하고 있다. 일례로 아세안 각국의 시민사회단체는 이미 아세안인권기구 설치의 근거규정을 아세안헌장에 두는 과정에서 시민사회단체의 적극적인 참여가 있었다. 1995년부터 NGO들은 아세안내에 정부 간 인권위원회를 설립하는 것을 목표로 하여 정부기관, 의회, 및 학계의 대표들과 함께 아세안인권기구 실무그룹을 창설했었다. 아시아시민사회연대회의(Solidarity for Asian People's Advocacy: SAPA)는 아세안헌장의 기초과정에 부응해 아세안옹호운동과 실천행동의 집단적 활동들을 조정하기 위한 아세안실무그룹(Working Group on ASEAN)을 창설하기로 결정했다.
비정부단체는 자국 내에서의 인권침해 여부를 조사, 확인하고, 그 피해를 구제하기 위해 노력하며 다른 나라의 NGO와 연대하여 국제인권기구에 진정하기도 하고, 제도적 장치를 제안하기도 하는 등 중요한 역할을 하고 있다.