통일인프라 및 거버넌스 구축연구는 통일의 종합적 연구가 필요하다는 인식이 확산된 계기가 되었다는 점에서 큰 의의를 부여할 수 있다. 그러나 남북관계 경색에 따라 통일인프라 연구는 답보 상태에 머물러있으며, 국제 차원에서의 거버넌스 구축연구도 미흡한 상황으로 평가된다. 다시 말해 통일기반 조성과 관련된 기존연구들의 경우, 통일인프라, 거버넌스 구축, 정책 네트워크, 통일재원 마련 등 주로 국내 차원의 내용을 다루고 있으며, 남북관계 차원과 국제차원에서의 접근은 상대적으로 부족한 상황이다. 또한 영역별로 보면 정치와 외교 안보 영역에서의 통일기반 조성에 치중하고 있는 경향을 보이고 있다. 법제도 분야 및 경제 분야 인프라 구축 연구가 일부 수행되어 있기는 하지만 정치 분야 연구에 비해 상대적으로 미흡하다. 특히 사회 문화, 교육, 보건을 비롯한 구체적인 분야의 인프라 및 거버넌스 구축은 본격적인 연구가 이루어지지 못하고 있는 상황이다. 인프라가 상호 연계 연관되어 있다는 점을 감안하면 종합적인 연구가 필요하다. 통일부 외에 모든 정부 부처가 참여해야 하며, 연구기관 역시 통일연구원을 비롯한 모든 국책기관이 협력체계를 구축하여야 한다.
현재 통일인프라 및 거버넌스 구축연구는 남북관계나 국제적인 차원에서의 접근이 부족하며, 사회 문화, 교육 등 구체적인 부분에서 본격적인 연구가 진행되지 못한다는 문제점이 있다. 이를 해결하기 위해서는 종합적인 연구가 필요하며, 또한 통일부, 통일연구원 외에도 모든 정부 부처와 국책기관이 함께해야 한다.