법인의 설립 및 임원의 취임승인 등에 대한 검토가 끝나면 허가여부를 결정하고 이를 신청인에게 통보한다. 이 때 허가증은 현행 법령상 달리 서식을 정하고 있지 않으므로 여성가족부 소관 비영리법인의 설립 및 감독에 관한 규칙의 허가증을 준용하여 교부한다. 이 때 비영리법인과 마찬가지로 정관과 임원명단, 재산목록, 상근임·직원의 정수 등 허가·승인사항을 허가절차의 직인으로 간인(間印)하여 함께 교부한다. 다만, 간인은 행정절차간소화 경향에 따라 생략할 수 있다. 만약 허가조건을 부여하는 경우에는 허가공문에 함께 병기할 수 있으나 가급적 허가증의 이면(裏面) 또는 별지에 작성하여 교부한다. 법인허가시 조건으로 붙일 수 있는 사항은 공익법인의 설립·운영에 관한 법률 시행령 제6조에 규정되어 있으나 이를 조건으로 부여하거나 다른 조건을 추가로 부여하는 것 등은 허가권자가 법인의 활동내용이나 규모, 구성원, 지역적 특성 등을 고려하여 결정할 사항이지만 타법에 저촉될 소지가 있거나 과도한 조건을 부여하는 일이 없도록 유의한다.
법인의 설립 및 임원의 취임승인 등에 대한 검토가 끝나면 허가여부를 결정하고 이를 신청인에게 통보하는데, 허가증은 여성가족부 소관 비영리법인의 설립 및 감독에 관한 규칙의 허가증을 준용하여 교부한다.