파산채권은 파산선고 전에 발생한 채권으로 파산채권의 신고, 조사, 확정 후 배당이라는 파산절차에 의하지 아니하고는 그 만족을 얻을 수 없다. 재단채권은 원칙적으로 파산선고 후에 발생한 채권으로 파산절차에 의하지 아니하고 수시로 변제하고 파산채권보다 먼저 변제한다. 재단채권자는 직접 파산관재인에게 변제를 요구할 수 있고 파산관재인을 상대로 이행소송을 제기할 수도 있다. 파산선고 전에 발생한 재단채권 역시 마찬가지이다. 파산채권과 본래적 의미의 재단채권은 원래 그 성격과 행사방법 및 법률효과를 달리하고 있어 서로 충돌이 생길 여지가 별로 없었다. 즉 파산채권은 파산선고 전에 생긴 채권으로 파산절차에서 배당을 받게 되고 재단채권은 파산선고 후에 발생한 채권으로 파산관재인에 의하여 수시로 변제를 받게 되므로 각자 그 원래의 원리에 따라 운영되면 되는 것이었다. 그러나 법에서 조세채권을 비롯한 정책적 재단채권을 규정함에 따라 파산채권과 재단채권의 충돌, 법해석상의 난점 등의 문제가 발생하게 되었다.
채권이 파산전에 발생하면 파산채권이다. 재단채권의 경우 파산절차에 따르지 않고 먼저 변제할 수 있으며 재단채권자는 직접 대상자에게 변제를 요구하고 소송을 걸 수 있다. 그러나 법에서 새로 정책적 재단채권을 규정하면서 여러 문제가 발생하게 되었다.