‘EU 기본권청’의 공식명칭은 ‘European Union Agency for Fundamental Rights’이지만 통상 ‘Fundamental Rights Agency’으로 쓰고, ‘FRA’라고 약칭하여 부른다.  초기 논의 과정에서 ‘인권청’(Human Rights Agency: HRA)이란 용어가 사용되기도 하였다. 이를테면, 유럽이사회는 2003년 12월 13일 브뤼셀 유럽이사회 의장 성명서와 2004년 12월 4일-5일 유럽이사회 의장 성명서에 부속된 ‘자유, 안전 및 사법의 강화에 관한 헤이그 프로그램’(Hague Programme on the strengthening of Freedom, Security and Justice)에서 ‘HRA’를 언급한 바 있다. 그러나 이는 모두 FRA가 공식 발족하기 이전이고, 발족 이후에는 FRA가 공식 명칭으로 사용되고 있다.
‘EU 기본권청’의 공식명칭은 ‘European Union Agency for Fundamental Rights’이지만 ‘FRA’라고 칭한다. 초기에 ‘인권청’(HRA) 이란 명칭이 쓰였으나 공식 발족 후 FRA가 공식 명칭이 되었다.