마지막으로 개인 및 법인의 ECJ에의 제소권에 관한 문제이다. 기본권헌장에 의거하여 개인 및 법인이 ECJ에 제소할 권리를 가지는가의 문제는 동헌장에 대해 법적 효과를 인정하는 경우에 상당히 중요한 의미가 있다. EU법 체제에서는 EC(법적 주체)에 대한 개인의 제소는 상당히 제한적이다. 즉, 자연인 또는 법인은 원칙적으로 “직접적이고도 개별적으로 관련된 행위”에 대하여 ECJ에 제소할 권리를 행사할 수 있다(구 EC조약 제230조 4단. 유럽미래회의와 실무단에서는 이 문제에 대해 심도깊게 논의하지는 않았다. 다만, 유럽헌법조약의 최종안을 확정하는 과정에서 정부간 회의는 “기본권헌장의 해석을 위한 수단으로 작성된 해설은 연합 및 회원국의 법원에 의해 충분히 고려된다”는 조항(유럽헌법조약 제II-112조 7항)을 새롭게 추가하였다. 하지만 기본권헌장에 의거한 개인의 제소권 유무는 직접 명시되지 않고 있어 다소 모호한 상태로 남아있어 논쟁의 여지를 남기고 있다.
EU법 체제에서는개인과 법인이 ECJ에 제소할 권리을 인정하고 있으나 유럽헌법조약의 최종안을 확정하는 과정에서 기본권헌장에 의거한 개인의 제소권 유무는 불분명한 상태다.