원천징수법인세환급거부처분취소
구 법인세법(2010. 12. 30. 법률 제10423호로 개정되기 전의 것) 제93조 제9호 단서 후문은 외국법인이 특허권,실용신안권, 상표권, 디자인권 등 권리의 행사에 등록이 필요한 권리(이하 '특허권 등'이라 한다)를 국외에서 등록하였을 뿐 국내에서 등록하지 아니한 경우라도 특허권 등이 국내에서 제조·판매 등에 사용된 때에는 사용의 대가로 지급받는 소득을 국내원천소득으로 보도록 정하였으나,국제조세조정에 관한 법률 제28조는 "비거주자 또는 외국법인의 국내원천소득의 구분에 관하여는 소득세법 제119조 및 법인세법 제93조에도 불구하고조세조약이 우선하여 적용된다."고 규정하고 있으므로,국외에서 등록되었을 뿐 국내에는 등록되지 아니한 미국법인의 특허권 등이 국내에서 제조·판매 등에 사용된 경우 미국법인이 사용의 대가로 지급받는 소득을 국내원천소득으로 볼 것인지는 「대한민국과 미합중국간의 소득에 관한 조세의 이중과세 회피와 탈세방지 및 국제무역과 투자의 증진을 위한 협약」(이하 '한미조세협약'이라 한다)에 따라 판단하지 아니할 수 없다.그런데 한미조세협약 제6조 제3항,제14조 제4항은 특허권의 속지주의 원칙상 특허권자가 특허물건을 독점적으로 생산,사용, 양도, 대여, 수입 또는 전시하는 등의 특허실시에 관한 권리는 특허권이 등록된 국가의 영역 내에서만 효력이 미친다고 보아 미국법인이 국내에 특허권을 등록하여 국내에서 특허실시권을 가지는 경우에 그 특허실시권의 사용대가로 지급받는 소득만을 국내원천소득으로 정하였을 뿐이고,한미조세협약의 해석상 특허권이 등록된 국가 외에서는 특허권의 침해가 발생할 수 없어 이를 사용하거나 사용의 대가를 지급한다는 것을 관념할 수도 없다.따라서 미국법인이 특허권을 국외에서 등록하였을 뿐 국내에는 등록하지 아니한 경우에는 미국법인이 그와 관련하여 지급받는 소득은 그 사용의 대가가 될 수 없으므로 이를 국내원천소득으로 볼 수 없다.
국외에서 등록되었을 뿐 국내에는 등록되지 아니한 특허권 등이 국내 사용된 경우 이의 사용 대가인 소득을 국내원천소득으로 볼 것인지는 한미조세협약에 의해 결정되어야 하며 한미조세협약상 특허실시에 관한 권리는 국내에서만 유효하며 국내에 등록된 특허권 등의 사용대가인 소득만을 국내원천소득으로 정하였으므로 이 경우 미국법인이 지급받는 소득은 국내원천소득으로 인정될 수 없다.