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 한편, 별도의 예비비를 편성하여 운용하는 특별회계의 집행율이 현저히 낮은 점을 감안할 때, 향후에는 특별회계 예비비를 따로 편성할 필요 없이 특별회계에서 예비비가 필요한 부분이 발생할 경우에는 일반회계 예비비를 전입 받아 사용하도록 하는 방안을 강구해 볼 필요도 있을 것임.제 2 부  분야별 분석  39VI. 2005년도 총액계상예산사업 결산분석 총액계상예산(Lump Sum Budgeting)이란 예산편성단계에서 세부적으로 우선순위를 정하기 어려운 경우, 예산을 편성할 때에는 예산의 내역을 구체적으로 한정하지 않고 지출의 용도를 포괄적으로 설정하여 총액만을 정하고, 예산을 집행할 때에 실수요를 바탕으로 내역을 정하도록 하는 제도임. 2005년도 총액계상예산사업은 7개 부처에서 총 3조 2,761억원의 예산이 편성되어 이 중 3조 2,434억원이 집행되었으며 97.4%의 비교적 높은 집행률을 보였음. 농림부, 산업자원부, 과학기술부는 100%의 집행률을 보였으나 해양수산부는 88%로 가장 낮은 집행률을 보였음. 세부사업에 있어서는 건설교통부의 하천편입토지보상사업(94.9%), 해양수산부의 항만시설 유지보수 사업(88%), 과학기술부의 원자력연구개발사업(79.7%), 국방부의 편제장비 보강사업(91.4%) 등이 낮은 실집행률을 보였음. 1998년에 17개 사업, 총 4조 5,237억원이었던 총액계상예산사업은 2001년 49개 사업, 총 9조 3,346억원까지 증가했다가 2002년부터 감소하기 시작하여 2006년 현재 16개 사업에 총 3조 2,376억원이 편성되었음.
특별회계의 집행율이 현저히 낮아 예비비가 필요한 부분이 발생할 경우 일반회계 예비비를 전입 받아 사용하는 방안을 강구해 볼 필요가 있다. 