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재원조달 관련한 문제점은 다음과 같다. 첫째 민자사업의 출자자가 대부분 건설회사 위주로 구성되어 있어 시공, SOC이윤을 주목적으로 하는 건설사의 속성으로 인해 건설단계에서의 효율을 기대하기 어려운 문제점이 있다. 즉 투자자들인 건설사들은 프로젝트 순이익 흐름에 기반을 두지 않고 시공을 통한 투자비 회수에 초점을 둠으로써 기대수익률 구조의 왜곡을초래하고 있다. 이로 인해 초기투자비의 과다지출로 인한 운영단계에서의 현금흐름.의 안정성을 저해할 수 있다. 둘째 민간투자를 위한 금융제공 및 재원조달은 소수의 국내 시중은행 차입에 의존하는 독과점의 구조를 띠고 있어 민간의 창의와 재원조달의 유연성 및 효율적 추진에 걸림돌이 되고 있다는 점이다. 현재 소수 금융기관에 의한 독과점적 차입금.융 구조로 인해 사업특성에 맞는 다양한 금융조달방식이 모색되지 못하고 금융조건도 금융기관의 일방적 일률적 기준에 따라 결정되는 폐단이 발생되고 있다 금융기관의 참여형태의 경우에도 한국산업은행이 주요사업에 대한 주간사 은행으로 참여 하고 있으며 몇몇 시중은행이 일부 사업에서 주간사 은행으로 참여하고 있는 실정이다. 그러나 제 금융권의 기관들은 그 참여도가 매우 미미한 형편이다 결과적으로 금융기관이 사업자에 대하여 일방적인 구매력을 가지고 있으며 서비스에 있어서도 경쟁력이 없고 차별화를 이루지 못하는 실정이다.
재원조달은 민자사업 출자자가 건설회사 위주로 구성되어 있어 SOC 이윤과 시공을 목적으로 하는 건설사의 속성으로 인해 건설단계에서 효율을 기대하기 어렵다.