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기획재정부는 경영평가 결과에 따라 경영컨설팅을 실시함에 있어서 현재처럼 D 등급 이하를 받은 기관을 중심으로 하되 제한된 시간 내에 이루어지는 단기적인 컨설팅이 아닌 중․장기적 안목에서 컨설팅을 받은 공기업의 경영개선이 이루어질 수 있도록 실질적인 컨설팅 방안을 검토할 필요가 있다. 공공기관 경영평가 제도는 공기업ㆍ준정부기관의 공공성 및 경영효율성을 높이고, 경영개선이 필요한 사항에 대해 전문적인 컨설팅을 제공함으로써 궁극적으로 대국민서비스 개선을 목적으로  하고 있다. 공공기관 경영실적평가의 최종 목적은 공공기관이 제공하는 대국민서비스의 질을 제고하는 것이므로 단순히 평가결과에 따른 인센티브를 제공하는 것에 그치는 것이 아니라 향후 성과를 제고할 수 있는 컨설팅 기능이 중요하다. 즉, 67기관이 가지는 공익적 성격을 고려하면 이미 진행된 사업의 성과에 대한 사후 평가보다는 향후 더 좋은 서비스를 제공하도록 유도하고 조정하는 컨설팅 기능에 초점을 맞추어야 한다는 것이다. 또한 평가결과의 활용도를 확보하기 위해서는 우선 평가위원의 지적사항 및 개선사항 등의 평가결과가 기관이 현실에 적합할 뿐만 아니라 수용할만한 적실성을 가진 것이어야 한다. 그러나 현재 경영실적평가 이후의 컨설팅은 시간적 제약, 평가단의 전문성 부족 등으로 인해 컨설팅 기능을 제공하기에 한계가 있으며, 실제 컨설팅 보고서에서 알 수 있는 것처럼 컨설팅의 주요 내용은 피상적이고 추상적인 내용 중심으로 이루어지고 있는 실정이다.
공공기관 경영 평가 제도는 경영개선이 필요한 사항에 대해 전문적인 컨설팅을 제공함으로써 대국민 서비스 개선을 목표로 하고 있다.