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국회는 2005년도 결산 심사결과 농촌진흥청은 높은 수준의 인력을 확보하고 있음에도 불구하고 세계적 품질의 품종 연구성과는 매우 미흡한 것으로 보인다고 지적하였다. 
그리고 연구인력 및 연구결과의 활용도를 향상시킬 수 있는 방안의 제도개선을 요구하였다.
농촌진흥청은 국회의 연구결과 활용 미흡에 대한 시정요구에 대하여 농업생산현장의 기술수요자와 긴밀한 협의체제 유지 및 적용기술에 대한 환류시스템을 구축하였고 농가현장의 기술수요를 반영할 수 있는 상시(feed back), 기술수요조사 시스템을 구축 완료하였다는 조치결과를 제출하였다.
농촌진흥청의 농업과학기술개발사업 연구 성과는 영농활용 시책건의 품종, 등록 산업재산권 농자재등록 등의 실용화 연구성과와 논문발표 및 연구자료, 발간 등이 학술성과로 도출되어 활용되고 있다.
최근 5년간 농촌진흥청에서는 표[13] 에서 보는 것과 같이 총 3,644개의 연구과제를 수행하여 5,083건의 실용화 연구성과를 도출하고 11,268건의 연구 논문 발표 및 각종 학술자료 발간 등의 학술성과를 올렸다.
국회는 2005년도 결산 결과 농촌진흥청의 품종 연구성과가 미흡하다고 지적하였고 연구인력의 활용도를 향상시킬 수 있는 방안의 제도 개선을 요구했다.