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 김종직이 사림파(士林派)의 중시조로 꼽히는 것은 그가 세조 이후 여러 요직을 거쳤을 뿐 아니라 일두 정여창, 한훤당 김굉필, 이목, 권경유, 김안국, 김정국, 김일손 등의 제자를 뒀기 때문이다. 김굉필의 제자가 정암 조광조였으니 김종직과 조광조는 손제자 관계가 된다. 그런 그는 훗날 글 하나 때문에 부관참시를 당했다.
 김종직은 세조에게 중용됐지만 내심 수양대군 시절 조카 단종을 폐위한 데 대해 반감을 가지고 있었다. 그래서 지은 게 조의제문(弔義帝文)이다. 김종직은 단종과 세조의 관계를 초 의제와 항우에 비유했다. 우리가 잘 아는 유방의 한(漢)과 항우의 초(楚)가 천하의 패권을 다투던 초한쟁패기 이전 항우는 조카를 살해하고 왕이 됐다.
 조의제문의 원문은 대략 이런 내용이다.
 “정축(1457년) 10월 어느 날에 나는 밀성(密城)으로부터 경산(京山)으로 향하여 답계역(踏溪驛)에서 자는데, 꿈에 신(神)이 칠장(七章)의 의복을 입고 헌칠한 모양으로 와서 스스로 말하기를 ‘나는 초(楚)나라 회왕(懷王) 손심(孫心)인데, 서초패왕(西楚霸王)에게 살해되어 빈강(郴江)에 잠겼다’ 하고 문득 보이지 아니하였다. 나는 꿈을 깨어 놀라며 생각하기를 ‘회왕은 남초(南楚) 사람이요, 나는 동이(東夷) 사람으로 지역의 거리가 만여 리가 될 뿐이 아니며 세대의 선후도 역시 천 년이 훨씬 넘는데, 꿈속에 와서 감응하니, 이것이 무슨 상서일까? 또 역사를 상고해 보아도 강에 잠겼다는 말은 없으니, 정녕 항우(項羽)가 사람을 시켜서 비밀리에 쳐 죽이고 그 시체를 물에 던진 것일까? 이는 알 수 없는 일이다’ 하고, 드디어 문장을 지어 조문한다. 

김종직은 세조에 중용됐지만 조카 단종을 폐위한 데 대해 반감을 가지고 있어서 조의제문을 지었다.