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그 결과 2016회계연도 8,170억원의 세계잉여금이 발생하였고, 2018년도에는 공공자금관리기금으로 7조 3,451억원(교통시설특별회계 전체 세출예산안의 40.2%)을 전출할 계획이다. 
이와 같은 세출 대비 과다한 세입은 특별회계의 효율성 저하 문제를 유발할 수 있으므로, 교통시설특별회계의 합리적 활용방안 등을 종합적으로 검토할 필요가 있다. 
2018년도 예산안 총괄분석 둘째, 교통수요예측과 실제 이용량 간에 큰 차이가 발생하고 있음에도 불구하고 수요예측 재조사가 이루어지지 않고 있으므로, 수요예측 재조사의 실효성을 제고할 수 있는 방안을 마련할 필요가 있다.
최근 10년간 개통된 15개 철도구간의 2014~2016년 이용률을 살펴보면, 11개 구간이 한 차례도 수요예측치의 70%를 넘지 못한 것으로 나타나고 있다. 
총사업비 관리지침은 설계 중 수요예측치가 최초 예측치 대비 30% 이상 감소하면 수요예측 재조사를 시행하도록 규정하고 있으나, 최근 10년(2007~2016년)간 철도부문은 단 1건의 수요예측 재조사도 시행되지 않았다. 
따라서 수요예측 재조사의 실효성을 제고하기 위한 제도적 보완책이 강구될 필요가 있다.
셋째, 신공항건설 사업과 관련하여, 울릉도 소형공항 건설 사업은 총사업비에 대한 면밀한 점검이 이루어질 필요가 있으며, 국립공원계획 변경을 전제로 편성된 흑산도 소형공항 건설사업에 대해서는 집행 가능성이 검토되어야 하고, 김해신공항제주 제 2공항에 대해서는 주민 갈등 해소방안 마련이 필요하다.
교통수요예측과 실제 간에는 큰 차이가 발생하고 있음에도 수요예측 재조사가 이루어지지 않고 있어 수요예측 재조사의 실효성을 제고할 수 있는 방안을 마련할 필요가 있다.