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 김원봉은 임정에서 한독당 일당(一黨) 체제를 깨는 투쟁을 벌였다. 그는 충칭에 있는 독립운동가만 의정원 의원으로 선출될 수 있게 한 임시약헌(臨時約憲), 의정원 의결 없이 발표한 1941년 11월의 〈건국강령〉, 그리고 폐쇄적인 국무위원 선임 등을 비판했다.
 한독당과 민혁당 간 협의는 지지부진했으나, 1943년 12월 카이로 선언에서 신탁통치 방침이 알려져 위기감이 고조되자 일약 합의를 보았다. 1944년 4월 국무위원직이 한독당 외에도 개방되어 김원봉이 군무부장(軍務部長)을 맡는 등 민혁당이 국무위원 14명 중 4명을 차지하게 되었다.
 그러나 김원봉은 실제 임정 정무에서 소외되었다. 중국 정부는 1943년 3월, 정당은 한독당, 군대는 이청천(李靑天)의 광복군을 원조한다고 결정했다. 김원봉은 광복군에 영향력을 행사할 수 없었다. 김원봉은 옛 조선의용대를 끌어들일 생각으로 저우언라이를 통해 옌안 조선독립동맹의 김두봉과 접촉하기도 했으나 거부당했다.
 대신 김원봉은 임시정부에 어깃장을 놓았다. 일찍이 임정 합류 전에 김원봉은 중국 정부의 광복군 승인을 극력 방해했다. 그 때문에 중국 정부의 승인은 광복군 창설 후 10개월 만에 나왔다.
 김원봉은 미국에 대해 임정 승인 외교를 펼치는 김구-이승만 팀에 대항해, 미국에서 이승만의 반대파로 적극 활동하던 한길수(韓吉洙)와 제휴했다. 한길수는 미국 국무부와 정계를 대상으로 미국이 임정 승인을 하지 않도록 열렬히 선전활동을 했다. 미국 국무부가 임정에 대해 갖고 있던 부정적 인식의 상당 부분은 한길수의 악선전 때문이었다(《방선주 저작집》 1, 649~653쪽).

김원봉이 군무부장을 맡는 등 민혁당이 국무위원 14명 중 4명을 차지했지만 실제 임정 정무에서 소외된 김원봉은 광복군에 영향력을 행사할 수 없었다.