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국립과학관 건설은 과학기술에 대한 국민적 이해와 지지기반의 확보를 위해서 중요한 사업이나, 그 계획의 수립과 추진 과정에서 면밀한 검토와 적극적인 추진이 이루어지지 못하여 일정이 지연되는 등 관련 예산의 효율적 집행에 어려움을 겪고 있다. 그러나, 국립과학관 건설을 위한 효율적 방안 수립연구 2단계 자료의 경우에는 국립과학관 건설 과정에서 겪은 시행착오를 바탕으로 관련 인허가 절차 등을 정리함으로써, 유사한 사업에서 똑같은 시행착오를 겪지 않도록 정보를 제공하고 있다.과학기술부를 비롯한 정부의 각 부처에서는 각종 건설사업을 추진함에 있어서 국립과학관 건설과 유사한 시행착오가 많이 발생하고 있는데, 동 사례를 참조하여 예산 집행시기의 적절한 예측이 이루어지도록 노력할 필요가 있으며, 적극적인 사업 추진으로 예산 낭비가 없도록 하여야 할 것이다. 원자력연구개발기금은 원자력의 선진국 위치확보를 통한 에너지원의 안정적 공급, 관련 사업의 경쟁력 향상 및 국민 삶의 질 향상을 도모하기 위하여 수행하는 원자력연구개발사업에 소요되는 재원을 충당하기 위하여 설치되었다. 원자력연구개발기금은 원자력법 제10조의3에 의하여 설치되었으며, 동법 제10조의5에서는 원자력연구개발사업, 원자력연구개발사업 수행에 필요한 연구개발 기자재 및 장비 지원사업, 원자력관련 인력양성사업, 기타 대통령령이 정 하는 원자력연구개발사업과 관련되는 사업에 기금을 사용하도록 정의하고 있다.
국립과학관 건설은 과학기술에 대한 국민적 이해와 지지기반의 확보를 위해서 중요한 사업이나, 그 계획의 수립과 추진 과정에서 면밀한 검토와 적극적인 추진이 이루어지지 못하여 일정이 지연되는 등 관련 예산의 효율적 집행에 어려움을 겪고 있다.