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 생활습관 교정만으로 치료가 되지 않고 증상이 심할 경우에는 약물치료도 고려해 보아야 하는데 여성호르몬, 자율신경 조정제, 정신안정제, 항우울제 등이 있다. 여성호르몬 보충요법은 폐경기 증상의 개선 효과가 높고, 골다공증 예방 및 치료 효과가 크고, 성기능 향상, 피부 노화 방지, 정신적 증상 개선 등 삶의 질 향상 효과가 크며 비용이 저렴하다는 등 많은 장점이 있다.
 호르몬 의존성 암(유방암, 자궁내막암) 발생 증가(유방암 26% 증가)와 심장병과 뇌혈관 질환 발생 위험이 약간 증가한다는 2002년 WHI 연구 결과 보고가 있은 후 사용을 꺼리는 사람이 많아졌다. 위의 사례에 나오는 J씨의 부인도 그 당시에 언론에 보도된 연구결과를 보고 여성호르몬 치료를 중단한 것으로 보인다.
 그러나 그 이후 몇 년에 걸쳐 WHI 연구를 다시 정밀 분석해 보니, 대상 환자들이 나이가 많고 비만해서 유방암의 고위험군에 해당하였기 때문에 그런 결과가 나타났다는 반론이 나왔다. 즉 대상 환자들을 나이별로 나누어서 분석해 보니 나이가 젊고 오랜 기간 사용하지 않은 그룹에서는 유방암의 증가가 없었고, 오히려 대장암의 감소 등 좋은 효과가 나타난 것으로 보고됐다.
 따라서 최근에는 여성호르몬 보충요법을 적극적으로 권하는 추세다. 백보 양보해서 WHI 연구 결과를 그대로 받아들인다 해도 유방암의 발생률을 높이는 위험성이 그리 높지 않다. 
 즉 여성호르몬을 복용하지 않은 여성들에서 유방암 발생률이 1000명당 3명인데 비해 여성호르몬을 5년 이상 복용한 여성들에서는 1000명당 3.8명으로 나타났다. 여성호르몬을 복용할 경우 1000명당 0.8명의 증가가 있을 뿐인 것이다. 발생률의 증가가 그리 높지 않다는 얘기다. 갱년기 증상 개선, 성기능 등 삶의 질 향상, 골다공증 예방 효과 등 득이 더 많기 때문에 고위험군에 속한 여성이 아니라면 유방암 검사를 정기적으로 실시하면서 사용하면 큰 문제가 없다.

여성호르몬 보충요법은 폐경기 증상의 개선 효과가 높고, 골다공증 예방 및 치료 효과가 크고, 성기능 향상, 피부 노화 방지, 정신적 증상 개선 등 삶의 질 향상 효과가 크며 비용이 저렴하다는 등 많은 장점이 있다. 따라서 최근에는 여성호르몬 보충요법을 적극적으로 권하는 추세다. 백보 양보해서 WHI 연구 결과를 그대로 받아들인다 해도 유방암의 발생률을 높이는 위험성이 그리 높지 않다.