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 이것은 중종의 심기를 건드린 것이었다. 중종이 원한 것은 왕권강화지 또 다른 신권(臣權) 세상을 노리는 사림의 집권은 아니기 때문이다.
 그러나 조광조는 브레이크가 망가진 기관차였다. 마침내 같은 해 10월 대사헌 조광조가 칼을 뽑았다. 대사간 이성동과 함께 위훈(僞勳) 삭제를 요구하고 나선 것이다. ‘반정(反正) 3훈(박원종·성희안·유순종)’은 세상을 떠났지만 정국공신(靖國功臣) 명단에 오른 가짜 공신들이 중앙권력을 여전히 장악하고 있었다. 게다가 정국공신 1등에 올랐던 홍경주는 살아 있었다.
 중종은 훈구(勳舊)와 사림의 상호견제와 균형을 통해 왕권을 강화하려 했는지 모른다. 조광조는 이 점을 과소평가했다. 내친김에 훈구의 뿌리를 통째로 뽑아버리려 했다. 훈구의 격렬한 반발에도 불구하고 마침내 조광조는 11월 일곱 차례의 주청을 통해 위훈 삭제를 관철했다. 2등, 3등 공신 일부와 4등 공신 전원이 훈작(勳爵)을 삭탈당했다. 전체의 4분의 3에 달하는 76인의 훈작이 날아갔다. 당위(當爲)에도 불구하고 그것은 반동(反動)을 부르기에 충분했다.
 훈구의 전횡도 싫었지만 사림의 독선에도 중종은 넌덜머리를 내기 시작했다. 위훈 삭제가 이뤄진 지 불과 4일 만에 훈구파는 대대적인 반격에 나선다. 중종의 생각이 반(反)사림으로 돌고 있음을 간파한 두 사람이 있었다. 남곤과 심정이다.
 남곤은 묘하게도 김종직의 문인으로서 그 뿌리로 보자면 사림파였다. 심정은 정국공신 3등에 녹훈되었다가 위훈 삭제를 당해 훈작과 토지, 노비를 하루아침에 빼앗긴 주인공이었다. 두 사람은 중종의 후궁인 희빈 홍씨의 아버지이기도 한 정국공신 1등 홍경주를 찾아갔고 홍경주도 두 사람의 사림제거론에 쉽게 동의했다.

중종이 사림의 독선에 넌덜머리를 내기 시작하자 남곤과 심정은 중종의 생각이 반사림으로 돌고 있음을 간파했다.