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소상공인지원센터는 외환위기가 야기한 실업문제를 완화하기 위한 임시조직이 아니라 전체 사업체의 88.9%를 차지하고 있는 소상공인들을 지원하는 항구조직이다. 따라서 소상공인지원센터는 항구조직에 걸맞게 조직을 체계화하고 상담사들의 신분도 컨설턴트의 지위에 상응하도록 안정화하고 격상시킬 필요가 있다. 소상공인지원센터의 사업성과를 높이기 위해서 중소기업청이 적극적으로 나서서 상담사 신분 안정 대책을 제시해야 정상이다. 그러나 국회가 수년 동안 여러 차례 이 문제를 지적했던 사안이므로 중소기업청은 이에 대한 대책을 시급히 마련할 필요가 있다. 소상공인지원센터는 2000년 소기업및소상공인지원을위한특별조치법 개정으로 법적 지위를 확보했지만 시행규칙도 마련되지 않고 훈령에만 근거하여 운영되고 있어, 소상공인 지원 전담기관으로 발전할 수 있는 조직체계 확립이 미흡한 실정이다. 업종별⋅계층별 지원프로그램을 개발하고 상담사를 교육하고 소상공인 교육 프로그램을 개발하는 역할을 하는 중앙센터는 전문성을 갖춘 우수인력을 확보할 수 있도록 소상공인진흥원이나 공단체제로 개편하는 것을 검토할 필요가 있다.
따라서 소상공인지원센터는 항구조직에 걸맞게 조직을 체계화하고 상담사들의 신분도 컨설턴트의 지위에 상응하도록 안정화하고 격상시킬 필요가 있다.