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2004년도 기금 결산 분석반된다고 유권해석을 내린 바 있다. 그러나 2005년 3월 관련 법률 개정안이 국회를 통과함으로써 국제교류기금으로 재외동포재단을 지원할 수 있는 법률적 근거가 마련되었다.
 현재 외교통상부는 동 기금을 대체할 ‘국제교류협력증진기금’ 신설을 추진 하고 있으며 그 이유는 크게 두 가지로서 첫째, 재외동포재단 지원을 위한 재원마련, 그리고 둘째는 기금의 직접적 운용·관리를 통하여 보다 다양한 목적의 외교활동에 동 기금을 활용하기 위한 것으로 보인다. 
 즉, ‘국제교류협력증진기금법(안)’의 골자는 현재 한국국제교류재단이 관리·운영하는 국제교류기금을 폐지하고 그 재원(기존 적립금 포함)을 외교통상부가 직접 관리하는 신설 기금으로 이관하여, 국제협력의 증진, 해외 긴급재난 구호, 한국국제교류재단 및 재외동포재단에 대한 출연 또는 보조 등 다양한 외교 목적에 두루 사용한다는 것이다. 그러나 동 기금 설치를 위한 법안(공청회안)은 몇 가지 문제점을 안고 있 다. 
첫째, 기금은 예산회계법에 규정된 예산총계주의 원칙, 즉 국가의 모든 수입과 지출은 예산안에 계상되어야 한다는 원칙의 중대한 예외이다. 따라서 기금의 설치는 특정한 목적을 위하여 특정한 자금을 운용할 필요가 있을 때로 한정하고 있음에도 불구하고 동 기금의 설치목적이 국제협력의 증진이라는 ‘일반적 국가과제 수행’이라는 점에서, 포괄적이고 자의적으로 기금의 용도를 확대, 적용할 수 있는 여지를 허용하고 있다.
2004년도 기금 결산 분석반 된다고 유권해석을 내렸었으나 관련 법률 개정안이 2005년 3월 국회를 통과하면서 국제교류기금으로 재외동포재단을 지원할 수 있는 근거가 마련됐다.