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정부가 제출한 기금운용계획안에서는 2조 6,124억원이 계산되어 있었으나, 국회는 5,000억원을 증액하여 확정하였다. 
그런데 실제 수입액은 계획보다 9,121억원 적은 2조 2,003억원에 그쳤다. 
2006년에도 계획 2조 672억원보다 2,452억원 적은 1조 8,218억원이 수입된 바 있다.
매각수입 내역은 우리금융지주 보통주 매각대금 9,168억원, 신한금융지주 보통주 매각대금 1조 1,148억원, 신한금융지주 상환우선주 매각대금 1,685억원, 제주은행 보통주 장내 매각대금 1.6억원이다 2007년도에 매각이 계획되었던 공적자금상환기금법 제 7조 재계산제도 금융위원회는 기금설치 후 매 5년이 경과한 날이 속하는 연도에 예금보험기금채권상환기금 및 부실채권정리기금의 자산과 부채를 실사하여야 한다. 
다만 금융위원회가 필요하다고 인정하는 때에는 수시로 실사할 수 있다.
금융위원회는 제 1항에 따라 실사한 결과 필요하다고 인정하는 경우에는 기획재정부장관과 협의하여 예금보험기금, 채권상환기금 및 부실채권정리기금, 채무의 변경 등 조치를 하여야 한다.
금융위원회는 제 2항의 규정에 의한 조치를 하는 경우 제 4조 제 2항 제 1호의 규정에 의한 기금 출연금과 예금자보호법 제 30조의 3의 규정에 의한 예금보험기금채권상환특별기여금으로 조성하는 자금 간의 비율 등을 감안하도록 노력하여야 한다.
정부가 제출한 기금운용계획안에서는 2조 6124억원이 계산되어 있었으나 증액하여 확정하였고 실제 수입액은 계획보다 적었다.