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 노태우 정부는 1988년 3월 31일 새마을운동 중앙본부 비리와 관련해 전두환의 친동생 전경환이 구속된 것을 시작으로 6월 13일 전두환 일가 비리 조사에 착수했다. 이후 5공 청산작업이 1989년 12월 31일 전두환 국회 증언에 이르기까지 약 2년간 계속됐다.
 1988년 6월 27일에 구성된 국회 ‘5공 비리 특별위원회’는 7월 23일 4당 간사회의를 열고 산하에 4개의 소위원회를 둬 분야별 비리를 조사했다. ‘일해재단 청문회’는 1988년 11월 4일부터 5차례에 걸쳐 진행됐는데 장세동 전(前) 안기부장과 정주영 현대그룹 명예회장 등을 증인으로 소환해 기금모금의 강제성과 정경유착의 실태를 폭로했다. ‘광주민주화운동 청문회’는 11월 18일부터 광주학살 피해자를 비롯한 김대중, 이희성, 정호용 등 65명의 증인을 출석시켜 6차례에 걸쳐 진행됐다. 청문회는 5·17 비상계엄 확대조치의 불법성, 공수부대의 과잉진압 등은 입증했으나, 공수부대 지휘책임과 발포책임자 등은 밝히지 못했다. ‘언론청문회’는 11월 21일부터 5차례에 걸쳐 진행됐는데 언론인 숙청, 언론통폐합 등 신군부의 언론 장악 음모에서 비롯된 것임이 뚜렷이 드러났다.
 5공 비리 사건은 수사를 통해 전경환을 비롯해 전두환 대통령의 친·인척 10명과 장세동 전 안기부장, 이학봉 전 대통령민정수석비서관 등 모두 47명이 구속되고 29명이 불구속되는 것으로 종결됐다. 여론이 극도로 악화하자, 전두환은 11월 23일 대국민 사과문을 발표, 정치자금 139억원과 연희동 사저 등을 국가에 헌납한다고 밝히고 백담사에 은둔했다.

노태우 정부는 1988년 3월 31일 새마을운동 중앙본부 비리와 관련해 전두환의 친동생 전경환이 구속된 것을 시작으로 6월 13일 전두환 일가 비리 조사에 착수했다. 이후 5공 청산작업이 1989년 12월 31일 전두환 국회 증언에 이르기까지 약 2년간 계속됐다.