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 그때 이미 노스트라다무스는 점성학에 뛰어난 재능을 보였는데 점성학은 그의 동료 친구들과의 주요 토론주제이기도 했다. 노스트라다무스 전기(傳記)에 따르면 그는 이미 지구가 태양 주위를 돌고 있다는 코페르니쿠스의 이론을 갈릴레오보다도 먼저 믿고 있었다고 한다.
 노스트라다무스가 9살일 때 그의 가족은 유대교에서 가톨릭교로 종교를 바꿔야만 했다. 그의 부모는 종교를 바꾸는 것에 그리 근심하지 않았지만 아들이 유대인이라는 사실 때문에 주위의 비난을 받을까 걱정했다고 한다. 그의 부모가 그를 1522년 몽펠리에 대학으로 약학을 공부시키기 위해 보낸 것도 그런 우려에서였다고 한다.
 노스트라다무스는 석사학위를 쉽게 땄고 약사 자격증을 받자 시골로 내려가 페스트에 걸린 사람들을 치료하기로 했다. 페스트 치료에 4년간 전념하다 박사학위를 마무리짓기 위해 몽펠리에 대학으로 돌아왔다. 노스트라다무스의 치료법은 당시 사람들에게 이단(異端)으로 비쳐 마음고생이 심했다고 한다.
 그럼에도 그의 능력을 의심한 이는 없었고 노스트라다무스는 박사학위를 취득했다. 그는 몽펠리에에서 1년간 교수생활을 했지만 새 이론, 즉 주사를 놓은 후 환자를 출혈시키는 것을 금지한다든지 하는 방법들이 문제를 일으켰다. 주위 사람들은 그의 능력을 믿었지만 한편으론 ‘유대인’이었던 그에 대한 의심을 거두지 않았다.
 젊은 시절 그의 황금기는 툴루즈에서 생활할 때였다. 그는 유럽에서 에라스무스에 버금가는 철학자로 평가받던 줄리우스 시저 스캘리거의 편지를 받고 너무나 감동한 나머지 아겐에 있는 그의 집에서 머물렀고 1534년에 아름다운 소녀와 결혼했다. 그녀의 이름은 전해지지 않지만 둘 사이에서는 1남1녀가 태어났다.

노스트라다무스는 페스트에 걸린 사람들을 치료하기로 했으나 사람들에게 이단으로 비쳤고 주사를 놓은 후 출혈시키는 것을 금지한다는 방법들이 문제를 일으켰다.