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무상원조는 한국국제협력단, 유상원조는 대외경제협력기금이 담당하고 있음. 
양 기관은 개발도상국의 발전 및 상호교류의 증진이란 설립목적은 동일하나, 구체적인 실행방안과 운영방침에는 차이가 있음.
이러한 구체적인 접근방식의 차이는 원조의 효율성을 저하시킬 수도 있음. 
따라서 공적개발원조의 원칙, 목적, 중점방향 등에 대해 정부차원의 기본정책의 수립이 필요할 것으로 보임. 
공적개발원조에 대한 효율성 제고 문제 일관된 원조정책의 시행, 전문성 제고, 그리고 사후관리 및 평가가 원조의 효율성을 제고시킬 수 있음. 
또한 중장기적으로 중점지원 국가정부와 공동으로 국별 원조계획을 수립하는 것이 필요함. 
유 ․ 무상 원조 주관부처간 원활한 의견교환을 위한 정기적인 정책협의의 강화도 필요함. 
다자간 원조전략 수립의 필요성 주요 선진국에서는 다자간 원조와 양자간 원조의 연계 강화를 통해 원조의 효율성을 제고하고 있음. 
그러나 우리나라는 현재 다자간 원조전략에 대한 인식이 부족해 보임. 
2004년도 세입 ․ 세출 결산 분석 우리나라의 이익과 원조의 효과를 동시에 확보하기 위한 논리를 개발하고 이해당사국과의 연대를 강화하는 등 다양한 전략을 강구할 필요가 있음. 
산업육성 및 해외진출 정책의 활성화 방안 주요 선진국에서는 양허성 수출신용제도를 통해 자국기업의 수출 및 해외진출을 지원하고 있음. 
그러나 우리나라는 현재 이러한 제도가 없어 우리 기업이 수주경쟁력을 확보하는데 어려움이 있음.
대외경제협력기금과 한국국제협력단은 개발도상국의 발전 및 상호 교류의 증진이라는 설립 목적은 동일하지만 구체적인 운영 방침과 실행방안에는 차이가 있다.