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모성보호급여는 일하는 여성의 일 ․ 가정 양립을 지원함으로써 저출산 문제를 완화할 수 있으며, 정부는 이러한 모성보호급여에 대해 국가, 기업, 근로자가 분담해야 한다는 취지에서, 고용보험기금 사업으로 추진하되 국고에서 일정부분 지원하게 된 것이다. 사실 모성보호급여가 고용보험기금에서 추진된 가장 큰 이유는 2001년 당시 실업급여계 고용보험 재정기준선 전망과 과제정의 지속적인 당기수지 흑자와 적립금의 급증으로 재원이 풍부하다고 여겨진 점이 가장 크다고 할 수 있다. 그러나 고용보험제도가 성숙되어 지원대상 확대 및 지원수준이 상향조정되면서  실업급여계정 재정에 커다란 부담을 초래하는 문제를 야기하고 있다. 또한 모성보호급여에 대한 국고부담 규모가 도입 초기 규모 수준인 100억원에 머물고 있어 지출 규모가 증가함에 따라 고용보험기금 부담이 커지고 있다. 국고지원 규모가 현행대로 유지된다면 2015년에는 모성보호급여가 6,018억원으로 증가하고 국고지원이 차지하는 비중은 1.7%로 하락하여, 동 급여의 대부분이 고용보험기금에서 지출된다는 것을 알 수 있다. 특히, 육아휴직급여 확대와 육아기 근로시간단축 급여가 도입될 경우, 2015년 모성보호급여는 7,661억원으로 증가하고 국고지원이 차지하는 비중은 1.3%로 하락할 것이다.
실업급여계 고용보험 재정기준선 전망과 과제정의 지속적인 당기수지 흑자와 적립금의 급증으로 재원이 풍부하다고 여겨져 고용보험기금에서 모성보호급여가 추진됐다.