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추계는 개정안에 따른 소요 비용에서 현행법의 소요 비용을 차감하여 추가적인 소요비용을 산출하는 방식으로 하였는데, 주요 추계내역은 다음과 같다. 첫째, 연도별 예방접종 대상인구는 통계청의 장래인구 특별추계의 접종적기연령 해당 인구에 접종회수를 곱하여 산출하였다. 연도별 접종률은 예방접종등록 월간소식지에 수록된 접종률을 현재의 접종률로 보고, 법안 시행 후 매년 일정 비율로 접종률이 개선되어 2011년에 정책 목표인 95%가 달성되는 것으로 가정하였다. 연도별 예방접종 대상인구에 연도별 접종률을 곱하여 연도별 예방접종 대상 건수를 추정하였다. 병의원 대 보건소의 접종 분담률은 병의원 이용자 접종비 국가지원 시범사업의 결과인 9대1을 적용하였으며, 접종단가는 보건소 예방접종 백신 조달 단가와 국가필수예방접종 보장범위 확대 시범사업 대비 예방접종 수가 책정방안 개발 및 적용의 예방접종 수가 대안 중 사업 수행 시 실제 수가 상환 비에 가정 근접할 것으로 보이는 제2안을 적용하였다. 이상에서 추정한 연도별 예방접종 대상 건수에 병의원 대 보건소의 접종 분담비율대로 해당 접종 수가를 적용하여 개정안에 따른 소요비용 1조2,259억원을 산출하였다. 둘째, 현행법의 소요비용은 보건소 예방접종 약품비 예산이 매년 3%씩 증액되는 것으로 가정하여 1,520억원을 산출하였다. 개정안에 따른 소요 비용에서 현행법의 소요 비용을 차감한 결과 법안 시행 첫 해 1,729억원을 비롯하여 5년간 약 1조739억원의 추가적인 재정소요가 발생할 것으로 추정되었다.
연도별 예방접종 대상 인구를 접종 적기 연령 인구에 접종 회수를 곱하여 산출하였고 연도별 접종률은 월간 소식지에 수록된 접종률을 보고 95%가 달성되는 것으로 가정했다.