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토지매수에 어려움이 가중되었고, 부처간 상이한 정책추진으로 사업의 효과성도 떨어지고 있는 실정이다. 이러한 문제점을 해결하기 위해 비록 한강수계 상수원 수질개선 및 주민지원 등에 관한 법률 의 개정을 통하여 수 변구역관리계획의 수립·시행을 의무화하였으나 아직 수변녹지를 조성하기 위,한 체계적 기법이 만들어져 있지 못하고 부처간 그리고 중앙, 지방정부간 상반된 정책추진을 조율할 장치도 마련되어 있지 않으며 무엇보다도 현행 토지매,수방식을 전환할 대안을 수립해 놓고 있지 않아 중·장기적 수변구역 관리계획이 수립되어도 그 실효성에 의문이 제기된다. 토지매수 및 수변녹지관리사업이 효과성을 갖기 위해서는 우선 토지매수 우선권 선정기준을 마련하고 중요성을 갖는 토지의 매수를 촉진하기 위한 방식들이 정비되어야 할 것이며 수질을 보전하고 수생태 복원에 기여할 수 있는 수변녹지조성기법의 개발이 따라야 할것이다. 
이와 관련하여 개발권양도제 등 대안적 방법이고 (Transferable Development Right)려될 필요가 있다.
토지매수가 어려워지고 부처간 정책추진으로 사업의 효과성도 떨어지자 토지매수 우선권 선정기준을 마련하고 수변녹지조성기법의 개발에 따라야 한다.