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차등보육료 지원사업은 보육시설을 이용하는 아동을 대상으로 보육비용을 지원하여 오던 사업으로서, 정부는 ’09년 무상보육료 지원대상을 종전 차상위(최저생계비의 120% 수준)에서 소득하위 50%(시설 이용아동 누적비율을 기준으로 볼 때 도시근로자평균소득 약 65%)까지 확대할 계획이다.
보육시설 미이용아동 양육지원사업은 차등보육료 등 정부지원이 보육시설 이용아동에게 집중되어 온 점을 극복하고자 ‘09년 신규 도입하는 사업으로서, 보육시설을 이용하지 아니하는 아동 중 차상위(최저생계비의 120% 수준) 가구의 아동까지 월 10만원의 양육수당을 지급할 계획이다.
그러나 두 사업의 내용을 비교하면 보육시설 이용여부에 따라 지원의 불형평성이 여전히 존재하고 있다는 지적이다.
보고서는 양육수당은 차등보육료에 비하여 지급단가가 최소 7분의 1 수준이고, 지원대상은 차등보육료와 달리 만 2~4세 아동이 지원대상에서 제외되는 외에, 만 0~1세 아동 중 3층(도시근로자 평균소득 50%) ~ 4층 중간(도시근로자 평균소득 65%)에 해당하는 소득계층도 지원대상에서 제외되고 있다고 지적했다. 
특히, 0~1세 아동 중 3층(도시근로자 평균소득 50%) ~ 4층 중간(도시근로자 평균소득 65%)에 해당하는 소득계층의 경우 소득수준이 같음에도 불구하고 보육시설을 이용하면 무상보육의 대상이 되나 보육시설을 이용하지 아니하면 전혀 지원을 받지 못하는 상황이 벌어지게 된다는 것이다.

정부는 2009년 무상보육료 지원 대상을 소득 하위 50%까지 확대할 계획이며 보육 시설 미이용 아동 양육지원 사업을 도입해 월 10만 원의 양육수당을 지급할 계획이다.