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 청와대 중심의 국정운영은 그것이 가져다준 순기능보다 폐단이 더 컸다. 그러므로 그동안 비대해진 대통령비서실의 규모를 축소하고 기능도 본래의 비서 기능에 국한하도록 개혁해야 한다. 대통령비서실이 직접 각 부처의 정책결정 과정에 개입하는 것을 막고 그 기능을 각 부처로 돌려줘야 한다. 이러한 ‘장관 중심의 국정운영 방식’은 행정부의 자율성과 책임성을 강화시켜 줄 것이다. 그 결과 행정의 독창성과 반응성이 높아짐으로써 대통령의 국정운영은 그만큼 성공할 가능성이 커질 것이다.
 박근혜 당선자는 장기적인 시각에서 대통령비서실을 대통령 보좌, 그리고 정책 기획과 조정만을 담당하도록 그 기능과 조직을 축소시키는 것이 바람직하다. 대통령은 청와대에 집중된 권한을 국무총리를 중심으로 각 부처 장관에게 과감하게 위임하여 장관이 정책추진의 실질적인 권한을 갖고 책임을 지는 내각 중심의 국정운영 구조를 마련해야 한다.
 이를 위해서는 무엇보다도 장관 임기가 현행 약 1년에서 좀 더 길어져 최소한 약 2년 정도로 늘어나야 한다. 다행히 2005년 인사청문회 도입으로 그러한 기반은 만들어지고 있는 것 같다.
 나아가 국정운영은 대통령 혼자서 하는 것이 아니고 대통령의 보좌진과 행정부 그리고 여당 등으로 구성된, 책임을 공유하는 체계적인 ‘국정운영팀’을 통해서 해야 한다.
 내각과 정당이 긴밀한 관계를 유지하면서 ‘책임정부’를 구현할 수 있도록 해당 분야에 오랜 의정 경험이 있는 국회의원 출신의 장관을 다수 임명하여 그들의 임기를 최대한 보장해 주어야 한다. 이렇게 하면 현행 5년 단임 대통령제의 약점인 대통령의 레임덕을 줄일 수 있으며, 당과 정부가 국정운영의 결과에 공동으로 책임지는 정치문화도 만들 수 있다.

청와대 중심의 국정운영은 순기능보다 폐단이 크므로 장관 중심의 국정운영 방식을 통해 대통령비서실의 규모를 축소하고 행정부의 자율성과 책임성을 강화해야 한다.