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 2월 21일, 서울중앙지검은 “노무현 전 대통령이 제2차 남북정상회담에서 NLL을 주장하지 않겠다고 말했다”는 정문헌 새누리당 의원의 발언을 “허위로 보기 어렵다”고 결론을 내렸다. 5월 21일 서울고검 형사부도 같은 결론을 내렸다. 민주당은 추가 법적 대응을 하지 않았다. 그렇게 ‘제1차 NLL 대화록 논란’은 사그라지는 듯했다.
 그런데 박영선 민주당 의원이 다시 논란을 일으켰다. 그는 6월 17일 국회 법사위 전체회의에서 “NLL 논란은 국정원의 시나리오였다”는 취지의 의혹을 제기했다. ‘NLL 대화록 논란’ 2라운드가 시작된 것이다.
 이에 서상기 의원은 6월 19일 “노무현 전 대통령의 NLL 발언 관련 국정조사를 하자”고 제안했다. 또 20일에는 “국정원이 제공한 발췌록을 통해 노무현 전 대통령이 NLL을 포기하는 취지의 발언을 한 것을 확인했다”며 “야당이 그동안 국민에게 거짓말을 한 것에 응분의 대가를 받아야 한다”고 주장했다.
 민주당은 ‘국면전환용’이라며 반발했다. 박영선 의원은 6월 21일 자신의 트위터에 “하늘을 가리려고 허공에 폭탄을 터뜨린다고 국정원 선거개입 사건이 가려지겠느냐”고 적었다.
 문재인 의원도 같은 날 긴급 성명을 내고 “국정원 바로 세우기가 왜 절실한 과제인지 더욱 분명해졌다”며 “‘10·4 남북정상회담 대화록’을 공개할 것을 제의한다”고 밝혔다. 이는 기존 입장을 번복한 것이다. 그는 작년 10월 27일 《중앙일보》와의 인터뷰에서 “대화록 공개는 외교 근간을 무너뜨리는 행위”라고 했었다.

문 의원도 국정원 바로 세우기가 왜 절실한 과제인지 더욱 분명해졌다며 10·4 남북정상회담 대화록을 공개할 것을 제의한다면서 기존 입장을 번복했다.