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 또한 전국종목별연합회 활성화를 위한 지도사업으로 전국연합회 결성 종목의 시도연합회 확대 결성 유도, 전국연합회 사무처직원 실무교육 실시, 전국연합회에 대한 업무지도 강화 등을 시행하고 있다. 특히 신규 동호인클럽 결성 확대를 위해 국민 참여도가 높은 종목, 향후 동호인 확산이 충분히 예상되는 종목, 자연친화 및 극기 종목, 레저스포츠를 확대 지원하여 육성해 나가고 있다.   이 사업의 지속적 운영으로 생활체육 동호인조직의 중심체인 전국종목별연합회가 행․재정적인 측면에서 크게 발전해온 것은 사실이다. 그러나 아직까지 우리나라의 동호인클럽이나 종목별연합회는 선진국의 스포츠클럽과 비교해 볼 때 자생력이 미흡하고 그 역할과 기능도 매우 미약한 실정이다. 한편 전국종목별연합회 육성 사업은 2003년부터 동호인 행사 지원 사업으로 통합되어 운영되고 있다. 2. 생활체육대회 개최 1) 종목별 동호인 행사 지원(종목별 생활체육대회 개최)  체육활동 참여자에게 자신의 기량을 스스로 확인할 수 있는 기회를 제공하고 자신의 수준과 비슷한 사람들과 경쟁을 통해 만족스러운 경험을 갖도록 하는 것은 지속적인 참여 유인책으로 매우 효과적이다. 이러한 맥락에서 종목별 동호인 행사 지원은 생활체육의 지속적 참여를 격려하는 강력한 동기부여 사업이 되고 있다. 종목별 동호인 행사 지원 사업은 전국 종목별 동호인 행사를 지원하여 체육의 생활화 운동 확산을 도모하고 종목별 동호인 대회를 내실 있게 운영함으로써 동호인이 참여하는 권위 있는 전국 대회로 육성하고자 하는 것이 목적이다.
전국종목별연합회 활성화를 위한 지도사업인 전국종목별연합회 육성사업은 신규 동호인 클럽 결성 확대를 위해 레저스포츠 등을 지원하여 육성해 나가고 있다.