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 과학원은 연구사를 길러 내기 위해 교육기관을 직접 운영한다. 바로 평양국방대학과 룡성약전공업대학이다.
 평양국방대학은 원래 자강도 강계시 석현동에 있었다. 당시 교명은 강계공업대학이었다.
 강계에서 평양으로 학교를 옮긴 계기는 ‘강계26호공장 폭발 사건’이었다. 1990년 11월 29일, 강계26호공장(강계뜨락또르공장)이 폭발했을 때, 김일성은 “나라에 하나밖에 없는 외아들 대학인데, 이전에 민족보위상을 하였던 김창봉이 비밀을 보장한다고 하면서 강계에 대학을 세웠다”고 하면서, “평양의 제2자연과학원 옆으로 대학을 옮기라. 그래야 나도 자주 대학에 나가 볼 수 있다”고 했다고 한다. 1992년부터 1997년까지 5년간 군대 4개 여단과 국방대학 재학생들이 동원돼 지금의 위치인 평양시 룡성구역에 대학 건물과 기숙사, 주택을 지었다.
 평양국방대학에는 6개 학부가 있다. ▲1학부: 로켓 공학부 ▲2학부: 전자공학부 ▲3학부: 금속공학부 ▲4학부: 장갑기계학부 ▲5학부: 화학학부 ▲6학부: 레이다학부 등이다. 6학년 과정까지 있는데, 예비과를 합치면 총 7년제 기관이다.
 평양국방대학은 대학인 동시에 군복무기관이기도 하다. 3000여 명의 재학생들은 학생 연대로 편성되어 있다. 각 학부가 대대, 각 학년이 중대, 각조가 소대다. 학생들은 군관복을 입고 생활한다. 견장에는 노란 바탕에 빨간 별이 있으며 별 가운데 부분에 ‘학’ 자가 쓰여 있다. 

과학원이 연구사를 길러 내기 위해 운영하는 교육기관 중 평양국방대학은 강계26호공장 폭발 사건으로 인해 자강도 강계시에서 평양으로 옮기게 되었다.