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 김대중 정부 시절, 검찰은 널뛰기를 거듭했다.
 DJ 정부에서 검찰총장은 총 5명. 검찰총장 임기 보장이 제도화된 이후 유일하게 박순용 총장만이 임기를 채웠다. 총장의 평균 재임 기간은 약 13.8개월. 2년의 임기가 보장되었음에도 임기를 못 채웠다.
 노무현 정부에서 검찰총장은 4명이었다. 법무부 장관이 당시 김종빈 총장에게 국가보안법 위반 혐의를 받고 있던 강정구 동국대 교수를 불구속 수사하라는 지휘권 발동에 불만을 품고 6개월 만에 사퇴한 것을 제외하고 검찰총장들은 모두 2년 임기를 채웠다.
 김대중·노무현 정부 10년간 검찰은 좌충우돌의 모습을 보여주었다. DJ 정부 초기 검찰은 정치인 사정수사와 관련, 야당 총재를 겨냥해 직격탄을 날리는 등 정치권과 직접 맞서는 모습을 여러번 연출했다. 국회가 비리 정치인들에 대한 체포동의안 처리를 지연시키기 위해 방탄국회를 열자, “미치겠다”느니 하는 말을 국민과 언론을 상대로 흘렸다. 그러나 이런 모습 하나하나가 결국은 검찰총장이 검찰의 사령탑이 아니라 정치권 수사의 첨병 또는 소총수로 나서는 듯한 모습으로 국민에게 비쳤던 것도 사실이다.
 사실 DJ가 대통령에 당선되자 당시 여당(국민회의)과 대통령직인수위원회에 전 정권 비리 제보가 봇물처럼 밀려들었다고 한다. 청와대 민원실, 대검 범죄정보관리과, 감사원, 국세청, 경찰청, 안기부, 은행감독원, 증권감독원 등도 예외가 아니었다. 이 같은 비리 가운데 사법처리가 가능한 범죄정보들은 차곡차곡 검찰로 넘겨져 수사 대상이 됐다.

DJ 정부에서 검찰총장은 총 5명으로 박 총장만이 유일하게 임기를 채웠다. 