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 국방부조사본부는 작년 육군 28사단 소속 윤모 일병 폭행 사망 사건 때 곤욕을 치렀다. 윤 일병 사망 직후 28사단 헌병대로부터 수사보고를 받았지만 이를 국방장관에게 제대로 보고하지 않았다는 이유에서다. 
 고현주 수사관(공군 소령)은 “윤 일병 사망 사건과 같은 불미스러운 일이 더 이상 군내에서 발생하지 않도록 예방 조치를 강화하고 있고, 유사 사건이 발생할 경우 일벌백계 차원에서 엄단하고 있다”고 밝혔다.
 윤 일병 사건 이후 국방부는 군 인권교육체계 수립, 국방인권모니터단 운영 등을 반영한 ‘군 인권업무 훈령’을 전면 개정했다. 군 인권업무 훈령의 주요 내용으로는 국방인권협의회 운영 근거 마련, 대대급 이상 부대 인권교관 임명, 사단급 이상 부대 인권상담관 임명 등이 있다.
 국방부조사본부는 작년 12월 기존의 병영생활고충·군범죄 신고전화였던 ‘국방헬프콜’을 ‘국방헬프콜센터’로 확대·개편했다. 관리자와 상담관을 증원하고, 전화회선도 늘려 365일 24시간 체제로 바꿨다. 윤 일병 사건 이후 상담·신고 전화가 하루 평균 100여 건으로 늘어났다고 한다. 정선모 국방헬프콜센터장의 말이다.
 “우리 병영도 많이 변해야 하고, 현재 많이 변하고 있다고 생각합니다. 그러나 국민이 더욱 신뢰하는 열린 병영이 되기 위해서는 소통, 즉 상담창구의 활성화가 무엇보다도 필요합니다. 군 특성상 병사들이 자신의 지휘계통을 통해 애로사항을 호소하기란 결코 쉬운 일이 아닙니다. 그런 차원에서 국방헬프콜을 ‘국방헬프콜센터’로 확대·개편한 것입니다. 국방헬프콜센터에서는 각 부대 지휘관과 연계해 병사들의 실질적인 고충을 해결하는 데 도움을 주고자 노력하고 있습니다. 지난 5월 1일부터는 현역 장병뿐만 아니라 사회복무요원(공익근무요원)에 대한 심리·정서 상담도 맡고 있습니다.”

국방부 조사본부는 국방헬프콜센터의 관리자와 상담관을 증원하고, 전화회선을 늘려 365일 24시간 체제로 바꿨다.