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 일본뇌염의 진단은 분만모돈을 채혈해 항체음성이면 일본뇌염에 감염되지 않은 것이며 항체양성이면 감염을 의심할 수 있다. 그러나 가장 확실한 진단 방법은 유산 또는 사산된 새끼로부터 바이러스를 분리하는 것이다. 즉 유사산 태아의 뇌, 내장 또는 태반조직을 갈아서 젖먹이 마우스의 뇌에 접종하거나 조직배양세포에 접종해 바이러스를 분리한다. 일령이 50~70일 이상 된 태아는 항체생산 능력이 있기 때문에 사산 태아의 복수 또는 흉수액 등의 체액 중에서 항체 유무를 검사해 진단할 수 있다.치료약은 없으며 철저한 일본뇌염 백신 접종이 가장 효과적인 방법이다. 예방접종 시기는 뇌염모기가 발생하기 전 4월부터 6월 사이에 모돈에게 3~4주 간격으로  2회 일괄 접종한다. 경산돈과 웅돈도 매년 1회 예방접종을 해주는 것이 좋다. 유념할 사항은 모돈 갱신 계획을 살펴보고 도입할 후보돈의 수에 해당하는 백신 물량을 미리 확보해 두고 도입 시 백신 접종을 해주어야 한다. 돈사 내외를 깨끗이 청소하고 돈사 근처 수풀 또는 물웅덩이를 제거해 모기의 서식지를 없애고 주기적으로 소독을 실시해 위생관리를 철저히 해주어야 한다.제8장 돼지의 주요 질병  213돼지파보바이러스감염증(Parvovirus Infection)파보비리데(Parvoviridae)의 파보바이러스(Parvovirus)가 병원체다. 임신돈에 감염되어 유산, 사산, 흑자, 미라 변성, 불임 등을 일으키는 번식장애 질병이다.
일본뇌염의 진단은 분만모돈을 채혈해 항체음성이면 일본뇌염에 감염되지 않은 것이며 항체양성이면 감염을 의심할 수 있다. 그러나 가장 확실한 진단 방법은 유산 또는 사산된 새끼로부터 바이러스를 분리하는 것이다.