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 MD/PhD 프로그램이란, 의과대학생 중에 우수한 학생들을 가려서 1~2년간의 의학공부 후 기초과학을 익히며 PhD를 마치게 한 뒤 임상의학 교육을 받도록 하는 과정이다. MD/PhD를 마치려면 최소 7년이 걸리는 만큼 학자금과 생활비, 연구비용을 국가에서 부담해야 한다는 제안까지 했다. 2009년부터 1년 반 정도 양육 과정을 시행하여 전국 규모의 심포지엄과 세미나를 통하여 의사과학자 양육을 성공적으로 실시하였다. 그러나 지원 학생 수가 많지 않은데다 의학전문대학원(의전원) 신설 등 의학교육 제도의 변화로 인하여 국가 지원이 중단되었다.
 “아쉬운 일이죠. 그래도 그때 함께한 학생 중에 교수 된 이들이 많고, 그들이 의사과학자가 필요하다는 인식을 하고 있다는 점이 현재의 수확입니다. 또 의과대학이 없던 KAIST에서 ‘의학 공부한 사람들 오라, 우리가 의사과학자가 되게 해주겠다’고 제안하여 한때 의과대학 졸업생과 전문의를 마친 인재들이 KAIST에 많이 갔어요.”
 2017년 교육부에서 임인경 교수에게 ‘의전원에 MD/PhD 프로그램을 넣으면 어떻겠느냐’며 조언을 요청해왔다.
 “일반대학 4년에 의전원 4년, 군대까지 다녀와야 하니 기간이 너무 길어 의과대학에서 의전원으로 전환하지 않으려고 했어요. 의전원 지원에 유리하도록 MD/PhD 프로그램을 이용하는 걸로는 근본적인 해결책이 아니라고 생각해서 반대했죠. 인재를 양성하려면 근본 목적과 취지를 살려서 제대로 해야 합니다. 교육은 100년을 바라보고 꾸준히 해야 하는데, 참으로 아쉽다는 말 외에는 할 말이 없습니다. MD/PhD 프로그램을 1년 반만 실시한 후 아무런 설명도 이유도 없이 폐지하고, 의학계에서 그렇게 반대하는 의전원 제도를 강행했다가 없애게 되었잖아요.”

MD/PhD 프로그램이란 의과대학생 중에 우수한 학생들을 가려서 PhD를 마치게 한 뒤 임상의학 교육을 받도록 하는 과정이며 MD/PhD를 마치려면 최소 7년이 걸린다.