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모형의 설정이 최선의 것인지 알 수 없다는 것에 대해서는 통계학적 가정도 크게 다르지는 않기는 하지만 통계학적 방법론은 이론적 타당성 외에도 신뢰구간을 이용한 다양한 테스트 방법을 동원할 수 있다. 또한 통계학에서는 비모수적인 통계적 방법론의 발달로 모수적인 방법의 자의성을 벗어나고자 하고 있다. 하지만 시스템 다이내믹스는 이론적 타당성 외에는 모형의 설정 자체를 테스트할 수 있는 방법이 없다. 과거 데이터에 대한 설명력이 모형의 타당성을 보여줄 수는 있지만 타당하지 않은 모형일지라도 과거 데이터에 대한 설명력은 높을 수 있다. 따라서 모형의 세부적인 설정들을 정당화하기 위한 다른 방법론의 개발이 필요하다.
통계학적 방법론은 다양한 테스트를 동원할 수 있고 통계학에서는 모수적인 방법의 자의성을 벗어나고자 하고 있다. 모형의 세부적인 설정을 정당화할 방법론의 개발이 필요하다.