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자유학기제가 앞으로 중학교 교육과정 운영 및 평가 방식에 지대한 영향을 미칠 것으로 예상된다면 고등학교에서는 성취평가제 도입이 학생평가 방식의 변화를 가져왔다. 2011년 ‘중등학교 학사관리 선진화 방안’의 주요 내용으로는 ‘서술형 평가, 수행평가의 질적 제고’, ‘성취평가제 도입’, ‘학교생활기록부 성적 기재방식 개선’을 들 수 있다(교육부, 2011). 성취평가제는 현행 상대평가 기반 과목별/학년 단위의 일률적인 9등급 석차 방식이 학생 간의 과도한 경쟁 및 학업 스트레스를 유발한다는 문제점에 공감하고, 2009 개정 교육과정의취지에 부합하도록 학사관리를 운영하기 위해 도입되었다. 따라서 고등학교 성취평가제는 “교과목별 성취기준 및 평가기준에 따라 학생의 학업성취 수준을 평가하고 성취도 (A-B-C-D-E-(F))”를 부여하기로 하고 이를 반영하고자 학교생활기록부 성적 기재 방식 또한 수정하기로 하였다(교육부, 2011, p.4). 2011년 교육부 발표 당시 성취평가제 반영을 위한 학교생활기록부 성적 변경안의 핵심은 9등급제 상대평가 석차 기제를 삭제하는 것으로, 2012-13년 시범적용을 거쳐 2014년도에 고등학교 보통교과에 성취평가제를 전면 도입하는 것이었다.
자유학기제가 중학교 교육과정 및 평가 방식에 영향을 주었다고 본다면 고등학교에선 성취평가제의 도입이 그러하였다. 성취 평가제는 현행 상대평가의 한계점을 극복하고 교육 과정의 취지에 맞춰 도입되었다. 9등급제의 상대 평가 기제를 삭제하여 2014년에 전면 도입하는 것이 주 계획안이었다.