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현재 종합적인 지식재산 관리시스템을 구축하여 활용하고 있는 대학, 공공(연)의 비율은 38.9%(39.9%)인 것으로 조사되었다([그림 3.8]). 기관 유형별로는 정부출연(연)이 94.1%(94.1%)로 가장 높고, 사립대학이 28.2%(29.1%)로 가장 낮았다. 이를 세분화하여 살펴보면 발명신고에서부터 출원, 중간사건, 등록, 유지, 포기 등과 관련된 행정적 절차와 특허비용, 관련정보 등을 관리하는 시스템을 구축하고 있는 비율이 15.8%(16.2%)로 나타났고, 특허 등의 출원․등록 과정과 목록 등을 업적평가 등 인사관리, 연구 과제관리 시스템, 기술이전 시스템과 연동하여 종합적으로 관리하고 있는 비율은 23.1%(23.8%)로 나타났다.
대학과 공공(연)의 대략 40% 정도가 특허출원 관련 종합적인 지식재산 관리시스템을 갖추고 있고, 정부출연(연)이 가장 높고, 사립대학이 가장 낮았다.