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아래의 문제흐름분석(PCA) 에서는 ‘썩는 것을 방지하기 때문’의 단계에서 ‘썩는다’는 단어에 집중하였다. 썩는 이유는 ‘온도가 올라가기 때문’이다. 온도가 올라가는 이유는 무엇일까? 전문가는 ‘발아열’때문이라고 할 것이다. 하지만 인간의 언어가 곧 생각이라는 사실을 떠올리면서, 온도가 올라가는 이유로 ‘열이 발생하기 때문에’를전개하고, 다음으로 그 열이 발생하는 이유로는 ‘발아하기 때문’이라고 쪼개어 보자. 아래 그림의 문제흐름분석(PCA)와 같이 실용적인 해결책의 방향이 나오는 시발점이 된다. ‘발아하면서 열이 발생하지 않는 방법’은 어떤 의미가 있을까? 발아하면서 열이 발생하지 않을 수는 없으므로 이를 무시할 수 있지만, 조금만 더 생각해보면 ‘발아하면서 열이 적게 발생하는 방법’을 생각해 볼 수 있다. 25도가 넘어서도 쉽게 썩지 않는 방법보다는 발아하면서 열이 적게 발생하는 유전자 변이가 훨씬 쉬울 것이다. 이러한 전개를 바탕으로 중앙연구소에서는 곧 바로 연구 주제가 바뀌었다. 지구상에 존재하는 식물 중에서 열이 적게 발생하는 종을 찾아 그 유전자를 분석해서 유전자 변이를 연구하는 방향으로 연구 주제를 변경한 것이다. ‘콩을 원료로 사용하면서 발아하지 않는 방법’은 어떤 의미가 있을까? 근본원인분석(RCA)에서 말이 되는 논리로 전개했다면 문제흐름분석(PCA)에서 나오는 방향은 대개 의미를 가진다. ‘콩을 원료로 사용하면서 발아하지 않는다’라는 표현을 통해서 ‘발아하는 공간과 재배하는 공간’을 분리하면 어떨까? 물을 집중적으로 많이 사용하는 공간과 그렇지 않은 공간으로 분리하는 것이다.
근본원인분석(RCA)에서 문제의 근본원인을 찾기 위해 말이 되는 논리로 전개했다면, 문제흐름분석(PCA)에서는 문제 해결방안을 찾기 위해 흐름의 방향을 분석하는 의미가 있다. 중앙연구소에서는 썩는 이유가 발아열 때문인 것에서 출발해, 식물 가운데 발아열이 적게 발생하는 종의 유전자를 분석해 유전자 변이를 연구하는 방향으로 연구주제를 변경했다.