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박근혜 정부 출범 이후 부처 간 협업이 강조되면서 다양한 협업조직이 설치되어 운영되고 있다. 그러나 정부조직법은 각 부처 단위로 조직을 설치하고 예산을 배정하도록 되어 있어 협업조직이 설치되더라도 하나의 법인격으로 인정받지 못하고 있다. 이에 협업조직의 장은 실제 공문을 발송할 수 없는 허울뿐인 직책에 불과하다. 결국 협업조직은 부처단위에서 배정된 공무원들이 물리적으로 결합되어 있는 형태이며 소속 부처에 보고하는 체제를 따른다. 물론 협업조직은 스스로의 업무계획조차 세울 수 없다. 이러한 문제점을 해결하기 위해서는 기존 정부조직법, 국가재정법에서 규율하고 있는 부처 간 칸막이 해소가 필요가 필요하다.
박근혜 정부 다양한 협업조직이 운영되었지만 정부조직법은 부처 단위 업무를 수행하므로 협업조직은 예산 및 업무 계획 조차 세울 수 없다. 이에 정부조직법, 국가재정법 개선이 필요하다.