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다만 ADIZ라는 공역이 국가 주권의 핵심 요소라고도 할 수 있는 안보와 밀접히 연관된다는데 난점이 있다. 즉, 만약 사전통보 없이 비행하는 식별 불가능한 항공기가 있을 경우 이에 대하여 규정상의 경고를 거친 뒤 군용기가 요격 등 대응조치를 하는 것이 배제되지 않을 가능성이 높다. 그런데 정규군에 의한 이러한 군사 행동은 일국의 주권 행사에 있어 핵심적인 부분으로 간주된다. 결국 영해 이원 상공에 ADIZ를 설정한 국가들이 해당 구역에 대하여 주권을 가진다고는 주장하지 않지만, 사실상 그러한 권리를 행사하는 것으로 귀결될 가능성도 있다. 이러한 측면에서 특히 영해 이원 상공에 설정된 ADIZ에서 국가가 행사할 수 있는 관할권의 범위 및 한계를 설정하는 것이 매우 중요한 문제로 대두된다.
ADIZ이라는 공역은 식별 항공기의 경우 요격 등 대응을 할 수 밖에 없는 구역으로 주권을 주장하지는 않지만 사실상 주권 행사로 간주되며 관할권 범위 및 한계 설정은 매우 중요하다.