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개별학문의 소영역이나 모든 학문의 영역에서 한두 개의 대학원만이 중요한 연구센터가 되기는 어렵다. 규모의 경제와 규모의 불경제가 존재할 가능성이 있다. 예를 들어 물리학이나 생물학 또는 화학에서 모든 기초 공통의 경우 한두 개의 대학이 가장 우수할 수 있으나, 물리학이나 생물학 또는 화학 등과 같은 모든 기초 공통 학문 분야의 경우 한두 개의 대학이 가장 우수할 수는 있으나, 한 대학원에 모든 세부 전공영역에 걸쳐 교수 규모나 대학원생의 수 등을 밀집시키는 것은 매우 어렵다. 또한 학문적 다양성, 선의의 경쟁과 협력, 심화된 연구를 위해서도 일정한 수의 대학원 연구센터가 필요하다. 양질의 대학원 체제의 부재는 학생선발과 교육투자에 각종 특혜를 받는 특별히 우수한 대학원 중심 대학들의 설립을 요구하게 된다(예, 기존의 과학중심대학과 최근 제기되고 있는 전남의 한전공대, 오송의 생명과학과학원, 세종의 정책대학원). 대학별로 학문의 세부전공에서 대학원 연구 특성화와 센터화가 필요하다. 센터는 교수진과 정규직 연구원(박사후연구원 등)을 기반으로 관련 분야의 지역의 다른 대학교수들과의 관련 분야 협력 연구를 위한 곳이자, 대학원 프로그램을 통한 학문후속세대 양성기관으로서 역할을 수행해야 한다. 지역 균형의 상징성을 가지고 실질적인 경쟁력과 잠재력을 가져왔던 전통적인 제조업 중심지역의 산업과 경제의 경쟁력을 뒷받침할 수 있는 대학원체제와 대학 내외의 연구소 체제를 갖추어야 한다. 또한 신산업지역에 대한 집중적인 혁신센터 형성을 위해 대학들이 집결된 지역에서 연구중심 체제를 구축해야 한다.
개별학문의 소영역 혹은 모든 학문의 영역에 소수의 대학원만이 중요 연구센터가 되기는 어려우며, 대학별로 학문의 세부전공에 대한 연구 특성화 및 센터화가 필요한 바, 지역 균형의 상징성을 가지고 경쟁력 및 잠재력을 가져왔던 전통적 제조업 중심지역의 산업/경제 경쟁력을 뒷받침할 대학원 및 연구소체제를 갖추고 신산업지역에 대한 집중적 혁신센터 형성을 위해 대학들이 집결된 지역에 연구중심 체제를 구축해야 할 것이다.