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조합원입주권과 관련하여서는 1세대 1주택 비과세 적용 여부가 주로 문제된다. 1세대 1주택에 대한 양도소득세 비과세란 주택의 양도 당시를 기준으로 하여 1세대가 국내에 1주택만을 소유하다가 이를 양도한 경우로서 일정한 요건을 충족하는 경우 양도소득세를 비과세하는 것을 의미한다. 1세대 1주택의 양도로 인하여 발생하는 소득에 대하여 양도소득세를 비과세하는 이유는 주택은 국민의 주거생활의 기초가 되는 것이기 때문에 1세대가 국내에 1개의 주택을 소유하다가 양도하는 것이 양도소득을 획득하거나 투기목적으로 일시적으로 거주하거나 소유하다가 양도하는 것이 아니라고 볼 수 있는 일정한 경우에는 그 양도소득에 대하여 소득세를 부과하지 아니함으로써 국민의 주거생활의 안정과 거주이전의 자유를 세법에서 보장하고자 함이다.
1세대 1주택 비과세 적용 여부는 투기나 일시적 거주가 아니라고 보는 경우 양도소득에 대한 소득세를 부과하지 않는다. 이는 주거생활 안정과 거주이전의 자유를 보장하는 것이다.