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공공하수처리시설의 운영비용을 반영한 오염물질별 제거 비용으로는 2005년 기준 294개소의 공공하수처리시설의 하수유입량은 18,320.0(천톤/일)이며, 하수처리운영비용은 약 5,111억원 수준이다. 오염물질별 실제유입수질과 실제 방류수질을 고려하여 유입오염부하량과 방류오염부하량을 구한 뒤 제거 오염부하량을 구하였다. 오염물질별로 연간 하수처리운영비용이 균등하게 배분된다는 가정을 하고 공공하수처리시설 운영비용을 반영한 오염물질별 제거 단위 비용(원/㎏)을 계산하면, BOD 162.8원, SS 283.7원, T-N 1,210.4원, T-P 9,103.9원이다.
공공하수처리시설의 오염물질별 제거 단위 비용(원/kg)은 2005년 기준 BOD 약 162원, SS 약 284원, T-N 약 1,210원, T-P 약 9,103원이다.