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유전자원(genetic resources) 및 전통지식(traditional knowledge)131)의 지적재산권 보호문제는 생물다양성협약(CBD)에 따른 다 양한 유전자원, 혹은 토착 민족이나 특정지역사회가 오랫동안 간직해온 가치 있는전통지식을 저작권이나 특허권 등 지적재산권을 수단으로 보호하려는 것이다. 이런유전자원과 전통지식을 간직하여 온 개도국들이 오히려 지적재산권 보호를 요구한다는 점이 특색이다. 가령 특정 토착민족의 전통가요를 저작권법적으로 보호하거나, 특정 유전자원의 성질을 식물신품종으로 특허법의 법리에 흡사하게 보호하는 것이 논의되고 있다. 하지만 이런 유전자원은 인간이 만들었다고 보기 어렵고, 전통지식은 이미 누구나 자유롭게 활용하여 온공유자산(public domain)이라는 점 때문에 실제 지적재산권 혹은 그에 흡사한 보호가부여될 수 있을지에 관해 상당한 논란이 있다.
유전 자원과 전통지식의 지적재산권 보호 문제는 생물 다양성협약에 따른다. 유전 자원과 전통지식을 법리에 따라 보호하려고 하지만, 출처와 온 공유 자산에 대해 보호가 부여될 수 있을지에 관해 논란이 있다.