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대학특성화의 필요성에 공감하고 이를 위한 재정지원이 대학교육 경쟁력 강화에 기여할 것이라는 기대를 갖기도 하지만 개별 대학의 운영방식에 미치는 파급력도 크기 때문에 선정과 중간 평가에 있어 공정성과 엄정성을 기반으로 한 합리적인 의사결정이 이루어져야 한다. 또한 산업수요에 부응하는 대학의 역할을 이끌어내기 위해 재정지원 사업이 다양화되는 과정에서 사업 간 관계의 체계화 요구도 증대되고 있다. 학령인구 감소 등으로 대학의 재정지원 사업 의존도가 깊어지는 상황에서 사업간 재구조화를 통한 고등교육의 방향성 제시가 필요하다. 대학의 기본역량과 지역산업 기여를 중심으로 교육부 및 타 부처의 재정지원 사업을 모두 포함하여 개편하는 중·장기 대학특성화 재정 지원방안이 모색되어야 할 것이다.
재정지원은 선정과 평가에 공정성·엄정성으로 합리적으로 결정되어야 한다. 재정지원 사업 간 체계화와 재구조화를 통해 고등교육의 방향성을 제시하고, 중·장기 대학특성화 재정 지원방안을 모색해야 한다.