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둘째, 보건복지부가 2013년부터 25개 응급의료기관을 선정하여 지원해 온“응급실 기반 자살시도자 사 후관리사업”을 정신과적 급성증상을 관리 할 수 있는 시스템으로 확대운영하고 전담인력을 확보하는 방안이다. “응급실 기반 자살시도자 사후관리사업”은 병원 응급실에 정신건강전문요원(구 정신보건전문 요원) 등 2명의 전문 인력을 배치하고 응급의학과와 정신건강의학과와 협력하여 자살 시도로 응급실을 내원한 사람들을 대상으로 상담과 사례관리 등 사후관리를 제공해 온 사업이다. 2018년 현재 총 52개 병 원에서 사업을 수행하고 있으며, 2017년까지 응급실에 내원한 자살시도자 12,264명을 대상으로 한 실태분석 결과를 공개하기도 하였다. 하지만 응급실기반 자살시도자 관리 사업은 표준화된 진료지침과 매뉴얼이 개발되지 않은 상태에서 사업이 시작되었고, 한시적으로 고용되어 응급실에 상주하며 사례를 관리하는 정신건강전문요원에 의존하고 있는 실정이어서 이로 인해 보다 지속적이고 체계적인 시스템에 대한 요구가 있어왔다. 특히, 응급실 자살시도자를 위한 진료만족도 조사에 의하면, 불친절한 의료진의 태도 (36.6%), 개방된 공간으로 인한 주위시선 부담(24,4%), 도움이 되지 않는 형식적인 상담(14.6%), 정신 의학 과 진료의 지나친 강요(12.2%)가 불만족 요인으로 나타났다(이주환, 2015). 이를 위한 제언으로는 자살시도자를 위해 응급실에 24시간 상주하는 정신보건전문요원을 통한 전문적인 사례관리가 필요하고, 주위 시선에 대한 부담을 줄이기 위해 응급실내에 개인적인 면담공간을 확보해야 한다고 하였다(인수현, 장서진, 2014).
보건복지부는 "응급실 기반 자살시도자 사후 관리사업"을 25개 응급 의료기관에서 시행중이다. 이는 응급실에 정신건강 전문 인력등이 병원의 전문인력과 협의하여 사후관리를 제공하는 것인데 좀더 체계적이고 전문화된 서비스 제공을 위해 표준화된 매뉴얼과 지침 개발, 정신건강전문요원의 24시간 상주 등의 요구가 있다.