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셋째, 정치·군사적 이슈를 둘러싼 대립과 갈등이 환경을 비롯한 연성이슈에 관한 남북협력에도 부정적 영향을 미쳤다. 예컨대 천안함 사건으로 인한 이명박 정부의 5·24 조치로 당국 간 환경협력의 가능성이 사라진 것은 물론 민간단체들이 소규모로 진행 중이던 묘목지원, 양묘장 조성, 나무 심기, 솔잎혹파리 방제사업 등도 중단되었다. 박근혜 정부의 적극적인 환경협력 관련 제안들도 5·24 조치를 유지하는 가운데 이루어졌기 때문에 북한의 호응을 이끌어낼 가능성이 매우 낮았다. 또, 북한의 비참한 현실을 지적하고 탈북자들이 자유와 행복을 위해 목숨을 걸고 국경을 넘고 있다고 하면서 남북협력을 제안한 드레스덴 선언을 북한은 모욕으로 받아들였기 때문에 이와 관련된 그린 데탕트는 전혀 논의되지 못하였다
천안함 사건에 대한 대처 이후 환경협력을 비롯한 각종 제안이 묵살되며 남북협력도 요원해졌다.