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중학교에서 2013년부터 시범적으로 실시되고 있는 자유학기제는 교육과정 자율화의 면에서 주목할 만한 정책적 시도이다. 자율적인 교육내용 재구성의 걸림돌로 간주되었던 평가를 유보하고 한 학기동안 자유롭게 운영할 수 있기 때문이다. 연구학교 교사들은 이 학기를 잘 운영하기 위하여 공동의 교육계획안을 작성하고 교과를 통합하거나 팀티칭을 시도하는 등의 노력을 기울이며 종전에 해 보지 않았던 고민을 하며 전문성을 쌓고 있다고 볼 수 있다. 이러한 노력으로 자유학기제 기간 중 수업 참여도는 높은 편이다(최상덕･이상은, 2014: 10-11). 그러나 한 학기만 시도하고 다른 학기는 종래 방식대로 운영한다면 학생들의 학업 참여 효과는 지속되기 어려울 것이다.
2013년부터 실시한 중학교의 자유학기제는 학기를 잘 운영하기 위해 교사들 공동의 교육계획안을  만들고 여러 노력을 기울여 전문성을 쌓고 있다. 이에 자유학기제 기간의 수업참여도는 높은 편이다. 