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그동안 우리나라 정부조직에 대한 건강진단은 국민 삶의 질 개선 차원에서 기능강화 분야(교육·사회복지·치안·환경 등)에 대한 개별부처 조직진단은 효과적으로 이루어져왔으나, 상대적으로 다수 부처 간 연계기능 분야 그리고 기능쇠퇴 분야에 대한 인력감축 및 전환배치 등을 위한 정부조직 진단 및 기능 재설계 관련 추진성과는 미흡했던 것으로 판단된다. 특히나 정부 부처 간 연계·중복기능에 대한 치유 성격의 조직진단 성과도 부처 간 이해관계로 인하여 기능 조정 내지는 재설계와 같은 문제해결 및 처방의 효과 또한 미미한 수준에 그치기도 하였다. 한편 우리나라 행정수요 변화와 연관하여 주요 선진국가의 정부기능 설계 및 조직운영 실태 등을 벤치마킹 할 수 있는 국가 간 정부조직 비교 정밀진단의 결과를 우리나라 정부운영에 실용적으로 반영하려는 노력도 다소 부족했던 것으로 파악된다. 결과적으로 정부조직 건강진단의 핵심은 행정환경 변화 및 국민 수요변화에 대한 심층 분석과 이와 연관된 선진국 정부개혁 및 행정혁신의 관련 사례분석 결과 등을 접목함으로써, 당면 문제해결을 위한 정부 역할 그리고 바람직한 정부 기능 재설계에 대한 선제적 대응을 근간으로 하고 있는 것이다.
한국 정부조직은 다수 부처들의 연계나 기능쇠퇴로 인한 조직개편이 미흡한 편이었다. 각 부처 간 이해관계로 문제해결 및 처방의 효과는 부각되지 않았는데 주요 선진국 벤치마킹 노력이 부족했다고 본다. 행정환경 변화와 국민 수요변화 분석, 선진국 사례분석 결과를 겸하는 게 문제해결에 기본이다.