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2004년 정부혁신지방분권위원회와 전자정부 구현 및 안전성 관련 법 제정비 수행기관인 한국전산원은 6차례 이상의 분야별 토론회를 개최하며 개인정보보호 기본법안의 제정 필요성 및 주요 내용을 검토하였다. 이후 같은 해 연말 당정 협의를 거쳐 여당의 의원입법방식으로 법안을 제출하였다. 이 법안은 공공과 민간을 포괄하여 적용하는 개인정보 보호 원칙, 실효성을 담보하는 수단, 개인정보 보호 기구의 설치 등을 핵심적 내용으로 하였다. 당초 법안에서는 개인정보보호 기구를 국가인권위원회의 특별위원회로 설치하기로 하고 2005년 국회공청회를 거쳐 입법 발의 되었으나 법안 심사를 앞두고 2005년 4월 국가인권위원회가 개인정보보호위원회가 별도로 설치되는 것이 타당하다는 의견을 표명함에 따라 제출한 법안을 철회하고 수정안을 마련하였다.
한국전산원은 개인정보보호 기본법안의 제정 필요성의 법안을 제출하였지만  2005년 개인정보보호위원회가 설치됨으로 법안의 수정안을 재구축하였다.