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중소기업청의 2007년「창업보육사업 활성화 방안」은 창업보육센터를 산·학·연 중심축으로 육성하여“향후 5개 년 간 4만개의 신기술창업을 육성하며, 이에 따르는 고용창출 효과도 매우 크게 나타날 것”이라고 밝히고 있다. 이를 위해서 창업보육센터의 독립채산제 유도, 성공불제 표준모델 제시, 부실 창업보육센터 구조조정 등 다양한 세부 시책을 마련하였다. 또한, 2011년에 마련된 창업보육센터 활성화 방안은 창업보육센터를 선진형 3세대 플랫폼으로 재편한다는 목표를 수립하고, 센터 간 성과 경쟁을 유도하고, 센터의 관리 운영 인프라를 확충하는 등의 세부 시책을 마련하였다.
중소기업청의 활성화 방안에 따르면 창업보육센터를 중심으로 향후 4만개 신기술창업을 육성하기 위한 세부시책을 마련, 선진형 3세대 플랫폼 재편을 목표로 하였다.