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한편, 현재 이원화되어 있는 성과관리체계의 통합적인 이해를 위하여 ｢국가재정법｣과 ｢정부업무평가 기본법｣과의 관계를 명확히 할 필요가 있다. ｢정부업무평가기본법｣ 제28조제2항은 “중앙행정기관의 장은 평가결과를 다음 연도의 예산요구시 반영하여야 한다”고 하고, 동조제3항은 “기획재정부장관은 평가결과를 중앙행정기관의 다음 연도 예산편성시 반영하여야 한다”고 하여 평가결과를 예산과 연계하려는 것을 보면, 여기서의 정부업무평가라는 것도 정책 등의 평가가 아닌 재정사업성과 평가의 측면에서만 본다면 ｢국가재정법｣ 상의 성과관리와 동일한 것이기 때문이다. 따라서 ｢국가재정법｣ 상의 성과계획서와 ｢정부업무평가 기본법｣ 제6조의 성과관리시행계획은 유사한 내용을 담고 있으므로 양자 간의 관계도 명확히 정립할 필요가 있다.
두가지로 나뉘어져 있는 성과관리의 이해를 위해 국가재정법과 정부업무평가 기본법의 관계를 정확히 알 필요가 있다. 국가재정법상 성과계획과 업무평가 기본법은 비슷한 내용을 담고 있어 양자의 구분을 명백히 해야한다.