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변조 문제를 실질적 진정성립의 문제로 본다면 개정 전 제313조 제1항에 의할 때 작성자의 진술로 진정성립이 입증되어야 하나, 진정성의 문제로 본다면 입증 방법에 제한이 없다는 차이가 있었다. 개정법에 의하더라도 실질적 진정성립의 문제로 본다면 작성자가 진정성립을 인정하지 않는 경우 ‘객관적 방법’으로 입증하여야 한다는 제한이 부과된다는 점에서 여전히 약간의 차이가 남아있다. 변조여부를 목격자 증언 등으로 입증하는 것을 금지할 이유도 없고, 물증에서의 비조작성과 같은 다른 진정성 요건이 입증방법에 제한이 없다는 점을 고려하면 변조여부도 입증방법에 제한이 없다고 보아야 할 것으로 생각된다.
변조 문제를 실질적 진정성립의 문제로 볼 경우, 객관적 방법으로 입증해야 한다는 제한이 주어진다. 변조 여부를 목격자 증언으로 입증하는 것도 막을 이유가 없는 것이다.