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법률안의 내용과 체계･형식･자구는 밀접한 관계가 있고 결합하여 하나의 완결된 법률을 구성하기 때문에 체계심사는 어느 정도 내용의 변화를 수반할 수밖에 없다는 점이 강조되기도 한다(윤정식, 2011). 결국 법률안의 합헌성 판단 권한을 법제사법위원회의 체계심사 권한의 하나로 인정하는 종래의 해석 하에서는 결국 법률안 소관의 위원회와 별도로 법제사법위원회가 법률안 전반에 대한 제2심을 허용하는 결과를 초래하는데, 이는 국회법 자체에서 법제사법위원회의 소관 사항으로 합헌성 심사권한이 규정되고 있지 않고 있는 상황으로 이러한 점이 현재의 갈등을 야기하는 근본 원인이라는 본다(박종현, 2011).
법률안의 내용과 체계･형식･자구는 연관되어 있기 때문에, 체계심사는 내용을 바꿀 수밖에 없다. 종래의 해석에 합헌성 심사권한이 규정되지 않은 것이 갈등의 근본 원인이라는 것이다.