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이렇게 찾은 학습모듈을 선택하고 적용 교과목을 선정하는 작업을 해야 했다. 그러나 학습모듈을 아무거나 선택하면 안 되는 이유는 앞서도 이야기했지만 학습모듈의 내용이 실무 수행 중심이기 때문에 어느 정도 이론과 기초를 알고 있어야 학습모듈의 내용을 가지고 수업이 가능하기 때문이다. 그러기 위해서는 어떻게 해야 할까를 고민하게 되었다. 이를 해결하기 위해 NCS 기반 고교 교육과정의 취지와 편성 방법에 따라 인력 양성 유형과 각 학교의 현재 2009개정 교육과정의 전문교과 구성 등을 살펴보고 그 시사점과 정보 교과 관련 학습모듈 분석 내용을 토대로 현 교육과정에서 가정 적합하게 적용해 볼 수 있는 학습모듈과 적용할 교과목을 선정하였다.
학습모듈을 선택 및 적용되는 교과목 선정 작업에서 이론과 기초가 선행이 돼야 수업이 가능한데, 해결 방법으로 NCS나 2009개정 교육과정 시사점과 같은 각종 분석내용을 토대로 선별하였다.