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이러한 정부혁신의 성과에 관한 연구와 더불어 어떻게 하면 정부혁신의 당사자라고 할 수 있는 공무원 조직 내에서 보다 잘 기능하게 할 수 있는지에 대해서도 관심을 갖게 되었다. 박용성(2008)은 “정부조직의 내부혁신 수용성의 정도가 강할수록 혁신(변화)에 대한 순응(compliance)의 확보가 높은 것으로 나타났다. 즉, 혁신리더십과 추진과정에서의 민주성 등이 동시에 확보될 때 혁신동인에 대한 인지(recognition)와 혁신순응(compliance)이 확보된다는 것이다. 따라서 내재적 동인을 충분히 확보하여 이러한 추세가 외재적 동인으로 전환되어 그 힘이 전달되도록 유도하는 것이 중요”함을 밝혔다. 윤태범(2009)은 공공부문의 혁신은 관리혁신이 될 수밖에 없는 특성이 있기는 하나 궁극적으로는 자율혁신에 기반하여야 할 것이라고 한다. 따라서 공공부문의 혁신은 무엇보다도 자율적이고 지속적인 혁신이 가능하도록 하는 여건을 마련하는 데 중점을 두어야 할 것이라고 제언한다.
연구 결과들은 정부혁신이 공무원 조직 내에서 잘 기능하기 위해서는 혁신리더십과 추진과정의 민주성이 동시에 확보되어야 된다고 주장했고 공공부문의 혁신은 자율적, 지속적 혁신이 가능한 여건을 마련하는 데 중점을 두어야 한다고 제언했다.