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그러나 판문점 선언을 통해 발표된 3개조 13개항의 합의사항 중 남북관계 발전 및 군사적 긴장완화 분야 9개항은 물론, 항구적 평화체제 분야에서도 불가침, 군사적 신뢰 구축 등 남북 양자 간 실천이 요구되는 의제들을 포함시킴으로써 남북관계의 전면적 개선 의지를 분명히 했다. 남북관계 발전과 북핵문제의 병행진전이라는 대북정책 추진전략을 구체화 한 동시에 남북관계가 비핵화 협상에서도 선도적 역할을 해야 한다는 사실을 분명히 한 것이다. 합의문 1조에서 자주통일과 민족자주의 원칙을 확인한 것도 남북관계 발전이 국제정세의 종속변수가 아니라 한반도 주변 국제질서를 이끌어가는 동력이 되어야 한다는 사실을 강조한 것이라고 볼 수 있다.
판문점 선언에서 남북 양자간 관계의 개선을 위한 의제들을 포함시키며 양국관계 발전과 북핵문제의 구체화로 비핵화 협상에서의 선도적 역할로의 필요성을 강조하였다.