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학교 프로그램 신설 및 인가는 신설 희망학교 제안서 제출 및 자격심사를 통해 이루어진다. 자격심사기준표(Order of Merit List(OMR) Criteria)는 유치 희망지역의 실업률 및 문맹률 수준과 학생 참여 희망 여부, 프로그램에 대한 학교의 자발성 등을 평가하는 지표를 종합 점수화하여 평가하게 되어 있다. 이러한 지표 합산결과 높은 득점의 학교 순으로 학군사령부에서 프로그램을 인가한다. 현재 미국에서는 이 프로그램을 유치하기 위해 대기하는 학교가 무려 250개나 될 정 도로 선호도가 높다. J-ROTC 프로그램을 유치하는 학교에는 관련 예산이 지원 된다. 가장 많이 소요되는 예산 항목은 주로 생도 유니폼과 교관 급여, 그리고 장비 사용 등이며 미 육군의 경우 연방정부에서 신설하는 학교에 대해 지원하는 예산은 연간 약 13만 불 정도 되는 것으로 나타나 있다.
J-ROTC 프로그램 신설은 희망학교의 제안서 제출과 학군사령부의 자격심사를 거쳐서 진행된다. 자격심사기준표에 해당 학교를 평가하는 지표를 점수화하여 평가하게 되고 점수가 높은 학교에게 프로그램이 인가되면서 관련 예산도 지원된다.