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형집행정지는 ‘형 집행 중의 수형자’에게 ‘건강상의 이유’로 외부병원 치료를 위해 검사의 지휘 하에 일시적으로 형 집행을 정지하는 것인데 비해 구속집행정지는 ‘수사 또는 재판 중 구속된 사람’에게 ‘상당한 이유’가 있는 때 검사 또는 법원의 결정에 의해 일시적으로 구속의 집행을 정지한다(형사소송법 제101조, 제209조). 한편, 형집행정지가 형집행정지 종료 후 재수감되어 잔형이 집행되는 것과 달리, 가석방은 수형자의 석방 후 가석방기간이 경과하면 형 집행이 종료된 것으로 보고(형법 제76조 제1항), 사면은 ‘수사 또는 재판 중인 사람’의 범죄에 대해서는 공소권을 상실(일반사면)시키고 ‘형 집행 중인 수형자’의 경우는 형선고의 효력을 상실(일반사면)시키거나 형의 집행을 면제(특별사면)한다(사면법 제5조 제1항 제1호, 제2호).
구속집행정지는 검사 또는 법원의 결정으로 '수사 또는 재판 중 구속된 사람’에게 상당한 이유가 있는 때, 형집행정지는 검사의 지휘 하에 '형 집행 중의 수형자'에게 건강상의 이유로 일시적으로 정지한다.