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둘째, 인권영향평가 제도의 성공적 도입을 위해서는 인권영향평가를 실질화할 수 있는 통합적 제도디자인이 필요하다는 점이다. 지금까지 시행된 인권영향평가는 성공적으로 실시된 몇 가지 사례를 제외하고는 일부 인권담당자나 인권조직의 수많은 업무 중 하나로 인식되어 고립화되기 쉬운 구조에 노출되었다. 인권영향평가가 단순히 제도적 시행과 규범적 장식의 차원에 머무르지 않기 위해서는 국가 조직 전반의 인권 지향성을 향상시킬 수 있도록 해야 한다. 이를 위해서는 인권영향평가가 조직 내 인권정책 및 인권교육과 유기적으로 결합하여 환류할 수 있는 제도가 선행되어야 한다. 다시 말해 인권영향평가가 고립적 내부조직의 부수적 업무로 분장되는 것이 아니라, 실질적으로 법령이나 정책, 사업의 헌법적 정합성을 확보하고 장기적으로 행정의 합리성과 효율성을 추구할 수 있는 중요 도구라는 점을 정책적·교육적으로 환기할 수 있어야 한다. 수원시에서 모범적으로 실시하고 있는 것처럼 인권영향평가가 다시 담당부서로 환류하여 재평가되는 체계는 충분히 고려할만 하다.
인권영향평가가 성공하려면 통합적 제도디자인이 필요하다. 현행 평가는 단순한 시행과 규범적 장식에 머물렀으나 향후 조직 전반의 인권 지향성을 높이고 평가와 정책·교육의 유기적 결합이 필요하다. 수원시 사례와 같이 인권영향평가가 담당부서를 통해 재평가되는 체계는 긍정적이다.