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제III조 2항은 “내국세”(internal tax)뿐 아니라 “그 밖의 내국과징금”(internal chargesof any kind)을 언급하고 있다. 반면 제II조2항 (a)호는 국내 “내국세”에 상당하는 수준의 국경세조정이 가능하다고만 규정하고 있을 뿐 “내국과징금”은 언급하고 있지 않다. 그렇다면 내국과징금에 대해서도 수입 국경세조정이 가능한가? 일부 학자는US—Superfund 사건 패널이 내국과징금에 대해서도 수입 국경세 조정을 허용하였다고 판단하였던 바 있다. 패널은 의무불이행에 대한 징벌세(penalty tax)에 대해 수입 국경세 조정이 가능하다고 보았는데, 이러한 징벌세가 제III조 2항의 “내국과징금”에 해당된다는 주장이다. 또한 위 패널 판단에 의존하지 않더라도, 전술하였듯 수입 국경세 조정은 궁극적으로 제III조 2항의 적용을 받는 재정적 성격의 국내조치이므로 제III조 2항이 적용되는 일반적인 내국과세의 경우와 마찬가지로 내국세 뿐 아니라 내국과징금까지도 적용 가능하다고 생각된다.
제3조 2항은 내국세와 내국과징금을 언급하고 있지만, 제2조 2항 (a)호는 내국과징금을 언급하지 않는다. US-Superfund 사건 패널은 내국과징금도 수입 국경세 조정이 된다고 판단하며, 징벌세도 내국과징금에 포함된다고 말한다.