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본 연구에서는 형사보상제도와 관련된 국내외 단행본과 논문 및 보고서를 중심으로한 문헌연구를 주된 방법으로 택하였다. 또한 외국 전문가와의 워크숍 및 심층적인 자문을 통해서 외국의 입법례 및 제도 운영현황을 검토하였고, 이를 토대로 시사점 및 그 활용방안 등을 도출하였다. 나아가 형사사법학계와 실무계의 전문가 및 유관부처 공무원들과도 워크숍과 자문회의를 개최하였다. 형사보상제도 전반에 대해 고찰하는 제2장에서는 입법자료와 현행 법률 규정이 분석되었고, 제3장에서는 영국, 미국, 독일, 프랑스, 일본의 입법연혁 자료와 입법례가 검토되었는데, 국가별 운영현황을 파악하기 위해 공식 통계자료를 살펴보았고, 형사보상업무를 담당하는 유관기관의 인터넷 홈페이지 등도 활용되었다. 한편 제4장에서는 현행 형사보상제도의 운영현황을 고찰하기 위해 우선 해당 기관의 통계자료를 수집하여 분석하였다. 형사보상의 청구 및 처리 현황(법원), 형사보상금의 지급 현황(검찰)에 있어 각각 법원행정처 기획조정실 및 전산정보관리국, 대검찰청 공판송무부 등으로부터 통계자료를 제공받아 활용하였다. 또한 형사보상의 결정 및 지급 사례는 형사보상 지연이자 청구소송으로 범위를 한정하여 판결문, 소송기록, 보도자료 등을 분석하였으며, 관련자 대면 및 면접조사를 실시하였다. 마지막으로 무죄재판서 게재제도의 경우 게재 현황을 검토하는 데 있어서 이와 유사한 제도인 무죄판결 공시제도와 비교하였다. 제5장에서는 형사보상제도의 개선방안 모색 및 입법론적 제언을 위해 최신 입법 동향을 분석하였는바, ｢형사보상법｣이 전면개정된 2011년 5월 23일 이후에 발의된 관련 법률안들을 모두 검토하였다. 또한 현행 제도의 개선방안을 모색하기 위해 유관기관의 보도자료와 언론기사 등도 폭넓게 참조하였다.
이 연구는 형사보상제도에 관한 국내외 문헌을 중심으로 이루어졌다. 외국 전문가, 형사사법학과 실무계 전문가의 자문 또한 받았다. 2장에서는 입법자료와 현행 법률 규정을 분석하였으며, 3장에서는 선진국의 입법연혁 데이터와 입법례에 대한 내용이 있다. 4장에는 법원과 검찰의 통계자료를 바탕으로 현행 형사보상제도를 분석했다. 5장에서는 전면개정된 형사보상법을 참고해 형사보상제도의 개선방안을 제시했다.