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러시아 측의 제안에 따라 1987년 협정의 틀 안에서 수산 생물자원에 대한 불법, 비보고, 비규제 어업 방지문제(IUU)에 대한 협력도 이루어지고 있다. 제23차 북-러 어업협력 공동위원회 총회(2009년 11월 27일~12월 2일 평양에서 개최)에서 2009년에 러시아 측의 수산 자원 양식 기관(틴로센터, 연방국립 연해지방 수산 생물자원 및 조업국), 수산 과학연구소와 북한(북한 동해 수산 과학연구소, 북한 동해 연안생물자원 연구소)은 연구 협력을 지속해왔다고 평가하였다. 즉, 동년 5월에 북한에서 북한 연어 공장 작업 환경 조사를 위한 양측 전문가 회의가 열렸고, 11월에는 연방 국립 연해지방 수산 생물자원 및 조업국 랴자노프스크 연어 공장이 가을 백연어 수정란 10만개를 북측에 전달하였다. 또한 22차 북-러 어업협력 공동위원회 총회의 합의에 따라 할당된 쿼터 범위 내에서 2척의 북한 어선이 러시아 경제수역에서 조업을 하였다.
러시아의 제안으로 수산자원에 대한 불법어업에 대한 협력이 이루어지고 북-러 어업협력 공동위원회 총회에서 러시아의 수산 자원 양식 기관, 수산 과학연구소와 북한은 연구 협력을 유지해왔다고 평가하고 할당된 쿼터 범위에서 북한 어선이 조업을 하였다. 