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이와 병행하여 시민단체와 지방자치단체 등이 외국인의 일본사회에의 적응을 지원하는 활동이 활발하게 이루어졌다. 다수의 외국인을 포함하고 있는 지역/지방에서 지방자치단체 독자의 지원조직이 형성되어왔다. 그러나 주지하는 바와 같이, 외국인문제는 지방자치단체 레벨에서만 다루어질 수 있는 것이 아니다. 지방자치단체는 중앙정부에 각종 요청을 하게 되었고, 이런 가운데 지방자치단체 간의 연계조직 형성이 자연스럽게 논의되기에 이르렀다. 2001년에 뉴커머가 다수 거주하는 지방자치정부와 국제교류협회로 구성된 외국인집주도시회의(外國人集 住都市會議)가 설립된 것은 지방자치단체 간의 연계조직의 일환으로 형성된 것이었다. 동 회의에서는 외국인 주민과 관련한 시책이나 활동상황에 대한 정보교환과 함께 수장회의를 열어 국가와 현 및 관계기관에 제언함으로써 각 지역에서 현재화하는 다양한 문제의 해결을 위해 연계하고자 하였다. 일본에서의 이주자 통합정책의 분수령이 된 2004년 10월의 도요타(豊田)선언은 외국인집주도시회의의 수장회의에서 채택된 것이었다.
일본의 지방자치단체에서는 외국인의 적응을 지원하기 위해 활동하면서 중앙정부에도 각종 요청을 하였다. 그러면서 지방자치단체 간의 연계조직 형성이 논의되었다. 이 일환으로 설립된 외국인집주도시회의는 정보 교환과 다양한 문제 해결의 역할을 하였다.