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둘째, 교육과정 및 수업 면에서, 미들스쿨은 고등학교의 축소판이나 고등학교 모방에서 탈피하여 청소년 전기 아동들이 초등학교 또는 고등학교로 유연하게 연계되도록 지원할 것을 강조하였다. 구체적으로 미들스쿨에서는 선택 교과를 허용하고, 두 개 이상의 교과 내용이 통합된 수업을 제공하며, 학생들이 교과별로 이동하기보다는 교사들이 팀으로 학생들을 지도하고, 교사 상담을 주기적으로 실시할 것을 강조하였다. 교사 팀은 교사와 25명의 학생으로 구성되는 학급담임 집단(homeroom groups)으로 수학, 과학, 사회, 언어 분야 교사 등 4명의 교사들이 교육과정을 함께 계획하고 100명의 학생들을 교육하는 체제이다. 미들스쿨 운동가들은 팀 단위(wing unit), 학교 내 학교(school within school)와 같이 소규모 학습환경이 청소년 전기 아동의 교육에 보다 부합한다고 보았다. 미들스쿨 개혁 운동이 추진되는 1970-80년대 동안 핵심 교육과정, 교사 조언자, 탐구활동, 협동학습 등 새로운 개념들이 등장하였다. 전반적으로 주니어하이스쿨은 교과중심으로 세분화된 미니 고등학교로 인식되는 반면, 미들스쿨은 통합된 교육과정, 팀 운영, 교사 상담 프로그램을 포함하는 학생 중심 학교로 간주되었다.
선택 교과를 허용하고,교사 상담을 주기적으로 실시하는 식으로 미들스쿨은 아동들이 초등학교나 고등학교에 연계될 수 있도록 지원해야 한다고 강조했다. 1970-80년대의 주니어하이스쿨은 교과중심의 미니 고등학교로, 미들스쿨은 교사 상담 프로그램 등을 포함한 학생 중심 학교로 여겨졌다.