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교사와 행정가 중에는 보통교과의 주된 목적은 직업기초능력을 제고하기 위한 것이라고 생각하는 경우도 있었다. 교육과정 상에 특성화고등학교의 보통교과 목적을 별도로 제시하고 있지 않은 것이 이러한 오해를 야기했다. 고등학교 직업교육에서 직업기초능력은 역량을 강조한 일련의 흐름 속에서 강조되고 있지만, 그것들이 어떠한 기제를 통해서 학습되고, 발현되는가에 대한 충분한 이해가 없이, 보통교과교육의 목표를 직업기초능력의 제고로 대치하는 것은 문제이다. 보통교과가 직업기초능력 교육으로 대체되는 과정에서 고등학교 교육을 통해서 학생들의 잠재력이 극대화될 수 있도록 교육 내용이 구성되는 대신, 쉽고 일상적인 내용으로 교육과정이 대치될 가능성이 있기 때문이다.
교사와 행정가가 보통교과의 목적을 직업기초능력을 제고하기 위한것으로  오해하여 학생들의 잠재력을 극대화시키는 구성 대신 쉽고 일상적인 내용으로 대치될 가능성이 있다.