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모든 사람이 아는 바와 같이 정부와 공공에 의한 과학기술 거버넌스에서 연구계의 위상과 역할을 중대한 부분을 점하고 있다. 정부나 공공부문이 동원하는 연구개발 투자에서 무려 40% 내외를 점하고 있다. 연구계, 즉 과학기술 국책연구소를 제외하고 우리 과학기술 거버넌스의 현재를 설명하는 것은 대단히 힘들다. 그런데 그 기능이나 역할, 그리고 위상이 뭔가 확실하지 않고 상식적인 정당성을 부여하는 데 한계가 있다.바로 이런 거버넌스 문제가 앞서 언급한 과학기술 거버넌스의 난맥상을 설명하는 출발점이다. 개념에서부터 모호한 '기초‧원천기술'에 연구개발 역량이 집중하고 있다. 그렇다고 대학과 산업 생산 사이에 명백한 중간자 역할이나 가능이 확립되지 않았다.과학기술 거버넌스를 연구계를 제외하고 새로이 재편하는 자체가 당장 불가능하다.그렇다면 연구계의 중간자 역할을 명확하게 하고 활성화 하는 자체가 과학기술 거버넌스를 혁신하는 거의 유일한 길이다. 이런 중간자로서의 연구계를 확립할 수 없다면 연구계를 제외한 과학기술 거버넌스를 고민하고 그 혁신을 추진하되 전환과 이전에서 발생할 사회적 비용을 최소화 할 수 있는 논의를 시작해야 한다.
과학기술 거버넌스는 기능이나 역할, 위상이 불확실하고 상식적인 정당성을 부여하는 데 한계가 있다. 그리하여 연구계를 제외하고 새롭게 재편하는 자체가 불가능함으로  과학기술 거버넌스를 혁신하기 위해서는 연구계의 중간자 역할을 명확하게 하고 활성화하는 것이 유일한 길이다.