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혁신학교는 2006년 당시 교육인적자원부에서 교육격차 해소를 위해 공영형 혁신학교를 도입하면서 등장하기 시작하였다. 그러나 혁신학교에 대한 본격적인 관심은 주민직선 교육감 선거에서 당선된 진보 성향 교육감들에 의하여 주도되고 있다(김민웅･임용순, 2013). 우리나라에서의 혁신학교는 2009년 경기 도교육감이 단위학교 개혁과 학교문화의 변화를 통해 공교육 개선 정책의 일환으로 처음으로 실시한 정 책으로써, 이를 통해 비민주적인 학교 경영, 관료 지향적 교사 문화, 표피적인 지식 전달 중심의 수업 관행이라는 기존의 교육 현장에서 제기되었던 주요 문제점들을 해결하고자 시도하였다(경기도교육청, 2012).
혁신학교는 교육격차 해소를 위해 교육인적자원부에서 2006년에 도입했으나 그 후에는 진보 성향 교육감들에 의하여 주되되고 있다.