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의료기관에 대한 재정적 지원을 위한 예산 확보 방안으로 현재 시행 중인 의료질평가지원금제도를 정비하는 것을 고려할 수 있다. 선택진료비개편 방안의 일부로 건강보험재정으로 ‘의료 질’ 평가에 기반을 두고 의료기관에 경제적 인센티브를 제공하는 ‘의료질평가지원금제도’를 2015년부터 도입하여 의료 질 향상을 통한 환자안전을 제고하고자 하였으나 현재의 제도는 절대적인 질적 기준을 제시하는 대신 상대평가 방식으로 의료기관을 평가하고 있어 평가한 등급의 차이가 실제 질적 차이인지는 판단하기 어렵다(채유미, 2016, p.12). 외국은 질 향상 달성 점수와 성과향상 점수를 반영하여 인센티브를 지급하는 방식인 데 비하여 국내의 제도는 질 향상 노력에 대한 보상 차원의 인센티브라고 보기 어렵다. 따라서 의료기관들이 지속적으로 질 관리에 노력을 기울이도록 유도하기 위해 의료기관들의 질 관리 노력에 대하여 보상할 수 있도록 의료질평가지원금제도의 평가 방식을 재구성해야 한다.
의료기관 재정지원을 위한 예산 확보 방법으로 의료질평가지원금제도를 재정비하는 방법이 있다. 현재 시행 중인 제도는 절대적 질적 기준이라기 보다는 상대평가에 가깝다. 따라서 의료기관들의 의료 질 관리에 대한 보상을 위해 평가 방식을 재구성해야 할 필요가 있다.