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정부예산관리제도는 보다 효율적인 예산관리를 통해 보다 나은 성과창출을 목표로 제도혁신이 이루어져왔다. 초기의 제도는 투입 중심 예산관리제도로서 투입규모를 결정하는 과정에 예산관리가 집중되었고 투입된 이후의 성과 등에 대한 관리는 거의 이루어지지 않았다. 이러한 투입 중심 예산관리제도의 문제를 개선하기 위해 2000년대 접어들어 성과 중심 예산관리제도가 도입되어 현재 운영되고 있다. 성과 중심 예산관리제도는 모든 재정관리분야에 적용되고 있으며 투입보다는 성과창출에 예산관리의 노력을 집중하고 이를 통해 예산의 효율성을 높이기 위한 것이다. 그런데 선진국의 경우 성과 중심 예산관리제도가 성과중심운영이라는 긍정적인 효과는 있지만 세세한 성과지표 적용으로 정책목적과의 연관성이 부족하고 계량화된 지표 사용으로 정책을 정형화시키는 위험이 있는 것으로 지적되고 있다.
2000년대 이후 모든 재정관리분야에 성과 중심 예산관리제도가 적용되어 예산의 효율성을 꾀하고 있다. 그러나 선진국에서 성과 중심 예산관리제도의 긍정적인 효과와 함께 위험성이 지적되고 있다.