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해방 이후 수의방역을 담당하는 행정 및 연구조직의 설치, 수의사 양성제도의 실시에도 불구하고, 북한 내 수의방역 현실은 여전히 해결해야 할 문제점들이 산적해 있었다. 1948년 이후 새로 조직된 국영목장들에서 발병한 일부 가축전염병으로 상당한 고충을 경험하였으며, 전후 국영목장이 증가하면서 관리부실에 따른 가축폐사 등의 문제가 증가하였다. 1958년 이후 ‘사회주의 개조’의 일환으로 농업의 협동화가 상당히 진척된데 따른 것이다. 즉, 기존의 개인사육 방식이 국영목장에 의한 집단사육 방식으로 빠르게 전환되면서 수의방역정책에도 변화가 수반되었다. 1953년 8월 17일에 채택된 ｢국가 농업 및 목축업 강화발전 대책에 관한 내각결정 집행정형에 대하여(내각결정 제103호)｣와 1954년 6월에 축산기술자 협의회에서 김일성의 교시는 당시 수의방역정책의 특징을 잘 나타내고 있다. 이후 북한 당국은 1959년 당중앙위원회 6월 전원회의에서 제시된 ‘축산업발전을 위하여 제시한 과업’을 통하여 집단사육 방식의 축산업에서 가축방역의 중요성을 부각하고 있음은 주목할 만하다.
수의사 양성제도의 실시에도 불구하고, 북한의 수의방역 현실은 여전히 해결해야 할 문제들이 많고, 기존 개인사육에서 국영목장에 의한 사육으로 바뀌면서 수의방역정책에도 급격한 변화가 뒤따랐다.