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대만 통치에 대한 방침이 아직 정해지지 않았던 1896년 1월 대만사무국 위원으로 취임한 하라 다카시(原敬)는 이토 히로부미(伊藤博文) 수상에게 ｢대만 문제 2안｣이라는 의견서를 제출한다. 하라는 이 의견서에 ‘첫째, 대만을 식민지 혹은 콜로니로 간주하는 안’과 ‘둘째, 대만은 내지와 제도가 다르나 식민지가 아닌 일본의 연장으로 간주하는 안’ 두 개의 선택지를 제시하였다. 그리고 하라는 독일의 알사스·로렌 지배, 프랑스의 알제리 지배를 모델로 삼아 두 번째 안을 채택해야 한다고 주장했다. 그러나 메이지 정부는 대만 총독에게 법적 효력을 가진 명령의 제정권을 주는 ｢대만에 시행할 법률에 관한 법률안｣을 제출했고, 제국의회가 3년 시한부로 이것을 통과시켰다. 이로써 대만은 ‘내지’의 일부가 되지 못하고 식민지로 분리되었다. 이어 1898년 대만 총독에 취임한 고다마 겐타로(兒玉源太郎)와 민정국장 고토 신페이(後藤新平)는 대만을 당연히 식민지로 간주하여 정책을 마련하였다. 이후 1905년 제국의회에서도 대만을 ‘내지’의 연장으로 보는가 그렇지 않은가는 논의의 중심이 되었고, 가쓰라 다로 수상은 “물론 식민지입니다. 내지와 동일할 수는 없다고 생각합니다”라고 대답했다. 앞서하라 다카시가 식민지 통치 사상을 ‘내지 연장 주의’에 두었다면, 하라 이후의 총독과 관리들은 차별을 수단으로 하는 ‘식민지주의’ 통치를 염두에 두었다고 할 수 있다.
1896년 하라 다카시는 1안 식민지안 2안 내지연장안을 검토한 '대만 문제 2안'을 제출했다. '대만에 시행할 법률에 관한 법률안'이 통과되며 대만은 식민지로 분리되었다. 1898년 식민지로 간주하여 정책을 수립하였다. 1905년 가쓰라 수상은 '식민지입니다' 라고 대답했다. 하라이후 차별을 수단으로 하는 '식민지주의'를 기반으로 통치했다.