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1968년 12월 17일 윤치영 민주공화당 당의장 서리는 "조국근대화와 민족중흥의 과업을 위해선 강력한 대통령의 리더십이 필요하며, 이를 위해서 대통령 연임조항을 포함한 현행 헌법상의 문제점을 개정하는 것이 연구되어야 한다."고 주장하며 3선 개헌의 불씨를 지폈다. 1969년 1월 3일 당시에는 당시 이효상 국회의장이 "3선 개헌은 불가능한 것이라고 말할 수 없다."라고 주장하며 3선 개헌에 대한 의지를 더욱 노골화하였다.
결국 집권 여당이었던 민주공화당은 1969년 7월 28일 '3선 허용과 국회의원 각료 임명 허용'을 골자로 하는 제6차 헌법개정안을 확정한다. '3선 개헌안'은 9월 13일 본회의에 회부되었다. 야당인 신민당이 이에 극렬하게 저항하자 이효상 의장은 9월 15일 월요일에 헌법개정안을 처리하겠다며 산회를 선포한다. 그러나 민주공화당은 1969년 9월 14일 새벽 2시 30분 국회 제3별관에서 단독으로 3선 개헌안을 찬성 122표, 반대 0표로 통과시켰다. 그리고 개헌안은 10월 17일 국민투표에 회부되어 투표에 참여한 유권자의 65.1%의 찬성을 얻음으로써 가결되었다. 국민투표 과정에서 공화당은 대대적인 자금을 살포하였다. 국민투표가 끝난 후 공화당은 8471명의 지구당 요원들에게 찬성표의 비율에 따라 포상금을 지급하였다. 1952년 발췌개헌과 1954년 사사오입 개헌에 이어 민주주의를 파괴하는 최악의 개헌 사태가 반복된 것이다.
1969년 말 민주공화당 당의장 서리가 연임 조항 개정을 언급하는 등 점차 노골적으로 3선을 노리는 행보가 보였다. 3선 개헌안의 국회 투표는 야당의 반대를 피해 은밀히 이루어졌으며, 국민투표에서는 포상금 형태로 자금이 뿌려지며 과반수가 넘는 찬성이 나오게 되었다. 앞선 개헌들에 이어 민주주의를 파괴하는 사건이었다.