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국가기반시설 중에 에너지 관련 공기업의 평가 체계 개편이 필요하다는 지적도 있다. 비용절감, 효율성 제고 등 단기 성과위주보다, 기관의 설립목적에 따른 고유 목적사업을 얼마나 잘 수행했는지 위주로 평가할 필요가 있다. 기관별 특성에 맞는 평가를 실시할 필요가 있으며, 기존의 공기업 평가 체계에 매트릭스 체계의 평가를 통해 안전의 지표를 포함시킬 필요가 있다. 이때 공통지표와 특성지표로 구분하여 기관별 특성을 반영하는 체계의 도입도 고려할 수 있다. 특히 에너지 관련 공공기관의 경우 안전 관련 지표와 비중 확대가 필요하다. 주요 사업의 지표에 포함시켜야 기관 별로 안전에 관한 지표를 포함시켜야 한다. 그리고 현행의 리더십, 경영효율화, 주요 사업에 매트릭스 개념으로 안전과 관련한 일정한 평가 항목을 포함시키도록 한다.
에너지 관련 공기업의 평가 체계가 기관 설립목적에 따른 고유 목적사업을 얼마나 잘 수행했는지 위주로 평가하도록 개편되어야 한다. 기존 공기업 평가 체계에 매트릭스 체계의 평가를 통해 안전 지표를 포함시킬 필요가 있다.