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둘째, 예산의 증가에 따라 양적 성과는 증가하고 있으나, 논문의 질적 수준을 고려한 투자 대비 성과는 오히려 감소하고 있다. 2009년부터 2013년까지 중견연구자지원 사업의 예산은 연평균 10.6%로 증가하였으며, 지원 과제수는 연평균 7.0% 증가하였다. 투입의 증가에 따라 논문과 특허 등 성과도 증가하고 있는데 SCI 논문은 연평균 5.0%, 비SCI 논문은 연평균 4.4% 증가하였다. 국내특허등록은 연평균 25.3%, 국외 특허등록은 연평균 22.9% 증가하였다. 그러나 논문의 질적 수준을 고려한 성과는 오히려 연평균 4.1% 감소하고 있다.
중견연구자 지원 예산 증가에 따라 논문과 특허 등 양적 성과는 증가했지만 예산 투입 대비 논문의 질적 수준은 감소하고 있다.