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온라인수업의 추진 체제는 교육부, 시 도교육청, 학교, 교육연구기관인 한국교육개발원과 한국교육학술정보원으로 구성되었다. 교육부는 국가적 온라인수업 정책 수립과 중앙 차원의 법 제도적, 재정적 지원의 역할을 담당한다. 시 도교육청은 국가적 온라인수업 정책을 토대로 시 도교육청별 상황 및 여건에 따른 세부적인 운영계획을 수립하고 실제적인 운영을 관리하는 역할을 가지고 있다. 학교는 실질적인 온라인수업 운영의 주체라고 할 수 있으며 온라인수업 신청 안내, 학교 차원 또는 학생의 요구에 따른 온라인수업 개설 승인, 온라인수업 이수 평가 등의 역할이 주어진다. 또한 온라인수업에 있어서 교육연구기관인 한국교육개발원과 한국교육학술정보원의 역할이 부각된다고 할 수 있다. 교육연구기관의 역할 중 가장 핵심적인 것은 교육부-시 도교육청-학교 간에 위치하여 온라인수업 정책 수립으로부터 운영 및 지원에 관한 제반 사항에 관여하게 된다. 온라인수업 운영 초기에는 한국교육학술정보원의 주관 기관의 역할을 수행하였으나, 2013년부터는 방송중 고의 방송 정보통신을 통한 수업 등을 위탁 받은 한국교육개발원이 주관 기관의 역할을 수행하고 있다.
온라인수업의 체제는 교육부, 시 도교육청, 학교, 한국교육개발원과 한국교육학술정보원이다. 각 기관의 역할이 있는데, 온라인수업의 주관기관은 교육부-학교 간 정책수립과 운영 및 지원에 관한 모든 것을 관여한다. 초기에 온라인수업의 주관은 한국교육학술정보원이었으나 2013년부터 한국교육개발원이 맡고 있다.