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혁신생태계를 구축하고자 하는 궁극적 목적은 글로벌 경쟁환경 속에서 지속가능한 지역산업의 경쟁우위를 확보하고 지역기업들의 비즈니스생태계를 활력있게 유지하기 위한 것이다. 지역의 산업기술 혁신생태계는 과학기술정책 및 지역산업 육성을 위한 다양한 전략 및 정책수단이 비즈니스생태계가 작동하는 일정 지역 혹은 클러스터를 중심으로 유기적으로 결합되고 효율적으로 운영되어야만 시너지 창출이 가능함을 강조하는 것이다. 이를 위해서는 지식생태계의 육성 지원, 산학연 연계 강화, 네트워크 허브 및 중개 기능 강화, 대기업과 중소기업의 상생발전 등에 관한 일련의 주요 전략과 시책이 개별적/분절적으로 추진되지 않고 일정 지역의 특정산업(혹은 클러스터) 육성을 대상으로 통합적으로 구상되고 실행될 수 있어야 한다.
지역의 산업기술 혁신생태계는 일정 지역 또는 클러스터를 중심으로 유기적 결합 및 효율적 운영으로 시너지를 창출한다. 따라서 주요 전략과 시책의 올바른 추진과 일정 지역의 특정산업 구상과 육성이 실행되어야한다.