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전술하였듯 이번에 신설된 특별협의절차는 장기간˙고비용이 요구되는 WTO분쟁해결절차에의 정식 제소 이전에 회원국 간의 특정무역현안을 효과적으로 해결할 수 있는 대체적 분쟁해결수단을 추가 신설한 것이라는 점, 단순히 양자 간에 협의가 이루어지는 DSU 협의절차와 는 달리 중립적인 ‘협의주재자’의 의견 및 제안을 들을 수 있는 기회가 주어진다는 점,  특별협의절차는 기존의 ‘특정무역 현안에 관한 SPS위원회에서의 다자간 논의’ 방식과 ‘WTO에의 법적 제소’가 각각 가지지 못하는 특징을 모두 갖춤으로써 양자 사이에서 공백을 메우는 역할을 해낼 수 있다는 점, 기존에 시행되어 오던 협의절차에는 없었던, 당사국들과 SPS위원회 의장이 따라야 할 구체적인 절차를 명문화하여 협의절차의 예측가능성과 투명성을 제고하였다는 점, 특별협의에서 다뤄진 내용은 당사국이 원하는 경우 비공개가 원칙이므로 해당 SPS사안이 공식적으로 분쟁화되기 이전까지 그 구체적 내용이 다른 회원국들에게 노출되는 것을 꺼리는 회원국에게 특히 효과적인 소통의 창구가 될 수 있다는 점에서 의미가 크다. 또한 SPS사안에 관해 당사국 간에 기술․ 과학적 정보를 교환하고 논의하는 데에도 위원회에서의 다자적 논의보다 상대적으로 유연하고 자유로울 수 있다는 면에서 유효하다.
신설된 특별협의 절차는 WTO 분쟁해결절차의 기존 한계를 극복하여 효과적인 소통의 창구가 될 수 있고, SPS 사안에 관해서도 당사국 간에 정보를 교환하고 논의하는 대에 자유로울 수 있다는 점에서 유효하다.