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둘째, 고등교육 혁신을 위해 중앙 정부와 지방 정부 간 역할과 기능의 분담 및 협업체제를 구축해야 할 것이다. 고등교육의 발전이 국가경쟁력을 창출하기 위해서는 대학이 속한 지역사회 발전을 먼저 거쳐야 한다. 현재 산학협력을 통해 지역의 다양한 대학들 성과를 창출하고 있고 이를 지원하는 대표적인 산학협력 선도대학(LINC) 육성사업의 규모가 점점 확대되는 점 등이 대학의 지역경제 발전에 미치는 영향력을 증명한다. 이러한 점에 비추어 보면 고등교육의 혁신은 지역발전과 지역 사회 혁신에 동력이 되므로 중앙정부의 노력만으로 대학을 지원하는 방식도 개선될 필요가 있다. 각 지자체에서는 소속 대학의 발전과 혁신을 위해 적극 지원해야 하는데 그동안 지자체의 고등교육 지원은 전체 고등교육 지원예산의 약 2.3% 내외를 넘지 못하고 있는 상황이다. 따라서 고등교육이 사회 수요에 맞춰 좀 더 혁신적으로 기능하기 위해서는 중앙정부와 지자체 간 역할 분담을 통해 지원의 효율성도 제고하고 혁신 방향 및 방안의 적합성도 제고할 수 있을 것이다.
고등교육의 혁신은 지역발전과 지역 사회 혁신에 동력이 되므로 사회 수요에 맞춰 좀 더 혁신적으로 작용하기 위해서 중앙정부와 지자체 간 역할 분담과 협업체제를 통해 지원의 효율성을 높이고 혁신 방향 및 방안의 적합성도 높일 수 있다.