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동법에서는 해양생태계의 보전·관리 및 지속가능한 이용과 해양생물다양성의 보전 등에 관한 해양생태계의 보전 및 관리의 기본원칙을 정하고 있으며(제3조), 해양생물다양성의 보전 및 지속가능한 이용을 위해 해양생물다양성 보전대책을 수립하여야 하며(제38조), 해양생태계의 훼손방지 및 해양생물다양성의 보전을 위하여 포획이 금지되거나 제한된 해양동물(가공품 포함)을 외국으로부터 수입 또는 반입하는 경우 및 보호대상 해양생물(파생물·가공품 등 포함)을 수출·수입·반출 또는 반입하는 경우, 그 밖에 해양생태계 및 해양생물자원의 보전 및 관리와 지속가능한 이용에 상당한 지장이 우려되는 경우에 대해서 허가 및 승인을 받도록 하고 있는(제42조) 등 해양생물자원의 보존과 지속가능한 이용에 관한 규정을 두고 있다.
동법은 해양생물자원의 보존과 규정에 관해 제3조는 해양생태계의 보존과 관리의 기본원칙을, 제38조는 보전대책 수립을, 제42조는 생태계 훼손과 보호 그리고 수출·수입·반출 등에 관한 사항을 규정하고 있다. 