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연구 결과 다음과 같은 최종 평가항목 개선방안이 도출되었다. 평가항목 개발의 기본방향은 첫째, 공통과 선택 부문으로 평가항목의 이원화, 둘째, 평가항목 구성 및 활용의 표준화, 셋째, 평가방식의 유연화 등이다. 이에 따라 평가항목이 공통과 선택부문으로 나뉘고 선택부문에는 교육, 연구, 산학 등 3개 하위 부문으로 세분화 된다. 공통부문은 30개, 선택 중 교육부문은 17개, 연구 부문은 19개, 산학부문은 20개 평가항목으로 구성된다. 고등교육 재정지원사업의 유형에 따라 공통항목과 선택항목을 조합하여 평가준거로 활용할 수 있으며, 사업의 유형이 확대되면 새로운 선택항목의 개발이 추가될 수 있다. 여러 부처의 다양한 사업들이 참고할 수 있도록 평가준거 구성 및 활용방법은 최소한의 표준화 방안을 제안했으나 항목별 평가방법과 항목별 세부 평가항목 개발은 사업별 자율의 여지를 남겨놓았다. 즉, 평가항목별로 정량, 정성 또는 정량과 정성을 병용하여 평가할 수 있는데 어떤 방법을 활용할 것이지, 그리고 항목별로 세부 평가항목을 어떻게 세분화 할 것인지 등은 사업의 특성 및 여건에 따라 융통성 있게 대응할 수 있다.
평가항목 개발의 기본방향은 평가항목의 이원화/표준화/유연화이다. 이에 따라 평가항목은 공통과 선택부문으로 나뉘고 하위 부문으로 더 세분화 된다. 또한 사업의 유형에 따라 선택항목이 추가될 수 있으며 평가항목별로 어떤 방법을 활용하고 세분화할 것인지에 대한 융통성 있는 대응이 필요하다.