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근대문화유산 조사사업과 비지정 건조물문화재 일제조사사업에서는 조사대상의 분류체계 기준이 마련되었는데, 근대문화유산 조사사업의 경우 지역별 특성과 상황을 고려하여 일부 지자체에서 분류체계 기준을 조정하여 진행하였다. 근대문화유산 조사사업은 대분류로 건축물, 산업구조물, 생활문화유산, 역사유산, 인물유적 5가지로 구분하고, 중분류로 건축물은 용도별로 하고 나머지는 주요 유형별로 구분하였는데, 건축물 중분류에서는 경상남도와 제주도가 일부 용도를 추가하였으며, 산업구조물의 경우 제주도와 부산에서 분류체계를 조정하였다. 특히 부산의 경우 산업구조물에 기존 중분류 외에 철도시설, 수도시설, 항만시설, 군시설 등을 추가하였다.
근대문화유산 조사사업에서는 조사대상에 있어서 5가지의 대분류와 건축 용도별 중분류를 두고 나머지는 주요한 유형에 따라 구분하였다.