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감사원은 2015년 10월 “지방교육청 재정운용실태” 감사 결과 소규모학교는 효율적인 교육재정 운용의 효율성을 저해하고, 2011년 및 2012년에 적정규모 학교로 통폐합된 충청북도 소재 ◩☆중학교 등 27개 학교의 경우 소규모학교로 인해 발생하는 심각한 시설 노후화, 복식학급 운영 및 상치교사 배치, 부족한 방과후학교 프로그램 및 또래집단과의 사회성 형성 부족 등의 문제점은 감소하고, 국가수준 학업성취도가 향상되는 등 교육의 질이 높아진 것으로 나타나, 소규모학교 통폐합의 적극적인 추진을 위해 실효성 있는 소규모학교 통폐합 기준 및 유인을 마련하도록 교육부에 통보하였다.
2015년 지방교육청 재정운영실태 감사에서 소규모학교 통폐합의 결과 시설 노후화, 학교 관리 인원 부족 등의 문제가 감소했으며 교육의 질이 높아진 것으로 나타났다.