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이와 같은 고찰 결과로부터 도출할 수 있는 정책적 시사점은 다음과 같다. 우선, 배출권 거래제 편입 기준선을 마련할 때 업종별 특성과 생산성 수준 등을 종합적으로 고려하여 부문별로 차별화하는 것이 필요하다. 거래제 편입 기준선 근처의 기업들 입장에서는 업종별·기업별 차이를 무시한 규제로 인해 규제진입에 대한 선호도가 서로 다를 수밖에 없으며, 이로 인해 일부업종에서 상대적으로 큰 규제 편입 지체효과가 발생하게 된다. 이는 단일한 규제 기준선을 적용할 경우 각 업종별로 에너지를 활용하는 기술이 다르다는 사실을 반영하지 못하는 한계가 있기 때문이다. 따라서 배출권거래제 편입 기준선 및 무상할당량 산정시 업종별 기술특성과 생산성 등을 충분히 감안한 형태로 조정이 있어야 할 것이다. 또한 모든 업종을 망라하는 방향으로 제도를 확대·추진하는 것보다는 배출권거래제 편입에 덜 민감한 업종을 중심으로 선별하여 점진적으로 시행하는 것이 바람직할 것이다.
단일한 규제 기준선을 적용할 경우, 각 업종별로 에너지를 활용하는 기술이 다르다는 사실을 반영하지 못한다. 따라서 배출권 거래제 편입 기준선을 마련할 때는 업종별 특성과 생산성 수준 등을 종합적으로 고려하여 부문별로 차별화해야 한다.