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셋째, 대입특위의 재량권의 한계와 역할의 모호성, 그리고 공론화위원회의 교육전문성의 부재는 근본적으로는 두 추진기구 기능의 완벽한 ‘분리’에 기인한 문제였다. 대입특위와 공론화위원회가 상호 소통하며 서로 보완적 역할을 할 수 있음에도 불구하고 두 기구는 “기계적”으로 분리되었다. 공론화 과정에서 교육전문가가 다수 포진해 있는 대입특위의 역할이 모호하다 보니 “공론화에 교육전문가가 한명도 없다”는 이야기가 나오기도 하였다. 시나리오 워크숍과 의제협의회 등의 과정에서 생길 수 있는 갈등을 적절히 조율하기 위해서 “중심을 잘 잡”는 일이 중요했는데 쉬운 일이 아니었다. 과정 전문가로서 갖는 한계였다고 볼 수 있다.
대입특위 재량권의 한계와 분명하지 않은 역할 및 공론화위원회의 취약한 교육전문성은 대입특위와 공론화위원회가 협력과 소통을 하지 않은 탓에 생겼다.