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융합기술 연구팀은 과제 중심의 유연한 팀, 개방형 조직으로 운영되어야 한다. 연구원 간의 원활한 의사소통을 위해 원칙적으로 한 팀으로 이루어져야 하며, 과제 중심으로 팀이 구성되었다가 종료 후 해체되는 유연성이 있어야 한다. 학제 중심 또는 프로젝트 기반의 연구팀과는 별도의 관리가 필요하며, 위험 요소로부터 자유로운 개방형 조직으로 운영되어야 한다. 개방형 조직으로의 구성 방안은 연구에 참여하는 다분야 전문가 집단을 이끌어 갈 수 있는 리더를 공모·영입하거나, 외부 아이디어나 인력을 적극적으로 활용․ 영입 하는 것이 전제되어야 한다.
융합기술 연구팀은 다분야 전문가 집단이 주 구성원이므로 아이디어와 인력을 적극적으로 활용할 수 있는 것이 전제가 된 과제 중심의 개방형 조직이 되어야 한다.