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응급실손상환자심층조사는 손상자료를 체계적이고 지속적으로 수집하여 특정손상의 발생유형, 위험요인 등을 파악하고 나아가 손상 예방정책 수립 근거 마련에 활용 가능한 정보를 생산하기 위하여 진행되고 있다. 질병관리본부에서 주관하며 23개 참여병원에서 연중 응급실을 내원한 모든 손상환자를 대상으로 조사를 수행하고 있으며, 참여병원별로 운수사고, 머리척추손상, 자살/중독/추락/낙상, 취학 전 어린이손상으로 나누어 심층조사를 수행하고 있다. 조사방법은 참여병원 응급실에 내원한 손상환자에 대해 의료진 및 담당 코디네이터가 퇴실 및 퇴원까지 추적 관찰하여 면접조사 및 의무기록조사를 실시한다. 조사항목으로는 손상 기본정보(성별, 나이, 보험유형, 사회경제적 지표-입원 시에 직업, 학력, 소득조사 등), 손상 관련정보(내원일시, 손상 발생일시, 손상 발생장소, 손상시 활동, 음주관련 여부, 손상기전, 내원수단, 의도성 여부, 손상유발물질, 주증상, 활력징후 등), 손상결과정보(응급진료결과, 입원 후 결과, 중증도, 장애수준-교통손상 한정 등)이다.응급실손상환자심층조사는 2014년까지 응급실 손상환자 표본심층조사로 조사하였고, 2015년부터 응급실손상환자심층조사로 명칭이 변경되었다.
응급실손상환자심층조사는 질병관리본부에서 주관하며 손상자료를 체계적이고 지속적으로 수집하여 특정 손상의 발생유형과 위험요인 등을 파악하고 손상 예방정책 수립의 근거를 마련하는 데 활용 가능한 정보를 생산하기 위하여 진행되고 있다.