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정부업무평가제도에 대한 구조적 차원과 인지적 측면의 효과성을 비교 분석한 결과 현재의 평가제도가 지닌 몇 가지 다음과 같은 특징적인 측면들이 도출되었다. 본 연구의 첫 번째 질문 중 하나는 성과관리제도의 특성을 고려하여 정부업무평가제도가 정부 사업의 성과 제도(효과성), 정부 업무 운영 과정의 효율성 확보(능률성), 그리고 정부업무에 대한 대내외적인 책임성 강화(책임성)에 실질적으로 기여하고 있는지 여부이다. 정부업무평가제도가 지닌 다양한 측면을 고려할 때 2006년 제정된 정부업무평가제도는 최근 10여 년 동안 제도 개선이 지속적으로 이루어져 온 것으로 평가할 수 있다. 전문가 자문을 통해 정부업무평가제도가 법 제정 당시의 취지를 적절하게 반영하고 있는지 여부에 대해서 대부분 긍정적인 평가를 내리고 있다는 점에서 이를 확인할 수 있다.
본 연구는 정부업무평가제도가 정부 사업의 효과성, 능률성, 책임성에 실질 기여 했는지 비교 분석했다. 정부업무평가제도는 최근 10년간 제도를 개선했고, 전문가들은 법 제정 당시 취지를 잘 반영한다며 긍정적으로 평가했다.