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사용후핵연료는 핵연료물질･방사성동위원소 및 원자핵분열생성물(原子核分裂生成物)과 함께 방사성물질에 해당한다. 사용후핵연료처리사업을 하려는 자는 법 제35조제2항 본문의 전단에 따라 지정을 받으려면 사업소마다 총리령으로 정하는 바에 따라 지정신청서를 작성하여 주무부장관에게 제출하여야 한다(영제61조제1항). 사용후핵연료의 처리･처분에 관하여 필요한 사항은 과학기술정보통신부장관과 산업통상자원부장관이 위원회 및 관계 부처의 장과 협의하여 ｢원자력 진흥법｣ 제3조에 따른 원자력진흥위원회의 심의･의결을 거쳐 결정한다(법 제35조제4항). 사용후핵연료의 처리･처분은 행정청의 판단에 맡겨져 있다.
영제61조 제1항에 따르면 사용후핵연료처리사업을 하려는 자는 신청서를 써서 주무부장관에게 내야 한다. 사용후핵연료 처리에 대한 사항은 원자력진흥위원회를 거쳐 정한다.