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JICA는 연구 기능을 강화하기 위한 목적으로 2008년 신JICA 출범과 함께 산하 연구기관인 JICA 연구소(JICA Research Institute)를 설립하였으며, 교육개발협력 정책 및 사업에 있어서 일본 내의 고등교육기관 및 연구 기관과 함께 JICA 연구소를 활용하고 있다. JICA 연구소에서 연구하고 있는 주요 영역 중 교육분야는 특별히 명시되어 있지 않지만, 교육분야 전문 인력이 존재하며 다양한 교육개발협력 관련 연구를 지속적으로 수행하고 있다. 또한 JICA 연구소는 일본 자국민뿐만 아니라 연구자, 원조 사업 수행 기관, 정부 기관, 민간 부문 회사와 NGO들과 같은 국제 커뮤니티와 활발한 교류 및 협업을 목표로 하고 있다.
JICA 연구소는 연구 기능의 강화를 위해 설립되었다. 이를 통해 일본 내 타기관과 함께 교육개발을 진행하며, 다양한 교육분야에 대한 연구를 수행하고 있다. 국제적 교류도 목표로 하고 있다. 