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동법 제65조는 감염병 관련 시･도가 부담할 경비를 규정하고 있다. 즉, 시･도가 부담할 경비는 한센병의 예방 및 진료 업무를 수행하는 법인 또는 단체에 대한 지원 경비의 일부, 시･도지사가 지정한 감염병관리기관의 감염병관리시설의 설치･운영에 드는 경비, 시･도지사가 설치한 격리소･요양소 또는 진료소 및 같은 조에 따라 지정된 감염병관리기관의 감염병관리시설 설치･운영에 드는 경비, 시･도지사가 지정한 접촉자 격리시설의 설치･운영에 드는 경비, 내국인 감염병환자등의 입원치료, 조사, 진찰 등에 드는 경비, 이 법이 규정하고 있는 건강진단, 예방접종 등에 드는 경비, 교통 차단으로 생업이 어려운 자에 대한 ｢국민기초생활 보장법｣제2조 제6호에 따른 최저보장수준 지원, 시･도지사가 의료인･의료업자･의료관계요원 등을 동원하는 데 드는 수당･치료비 또는 조제료, 감염병 관련 식수 공급에 드는 경비, 시･도지사가 의료인 등을 방역업무에 종사하게 하는 데 드는 수당 등 경비, 검역위원의 배치에 드는 경비, 그 밖에 이 법에 따라 시･도가 실시하는 감염병 예방 사무에 필요한 경비 등이다.
동법 제65조에서는 감염병과 관련해 시,도가 부담해야되는 경비에 대해서 규정하고 있는데 시,도지사가 지정하거나 그에 준하는 업무를 수행하는 단체의 운영에 드는 경비와 국민기초생활 보장법에 의거해 생업이 어려운 자를 포함 의료계 종사자들을 포함한 방역업무 종사자들에 대한 경비를 포함하고 있다.