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전통적인 논리 실증주의에 기반한 R방법론에서는 주로 가설 연역적 방법이 사용된다. 이는 연구자가 가설 또는 이론을 먼저 생성하고 난 후 이를 귀납적인 방법으로 검증해 나가는 것이다. 이와는 다르게 Q방법론은 주어진 가설을 검증하는 것이 아니라 관찰을 통해 가설을 만들어가는 가설 추론 적인 방법이다. 이는 객관적 과학을 지향하던 연구 방법으로는 파악하기 힘든 인간의 주관적 영역에대한 반응을 객관적으로 측정해 보고자 하는 것이다. 구체적으로 특정 대상이나현상에 대한 개인의 주관적 견해를 담고 있는 Q진술문에 대한 피험자들의 응답 과정을 통해 이들 간의 유사점과 상이점을 밝히는 데 초점을 두고 있다.
가설 연역적 방법인 R방법론과 달리, Q방법론은 관찰에서 시작하여 가설 설정으로 이어지는 가설 추론적 방법이다. 이는 Q진술문에 대한 응답을 통해 인간의 주관적인 견해를 측정한다.