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앞에서 언급한 바와 같이 산업단지 혁신클러스터 사업은 효과성을 확보하기 위해 개도국 정책당국의 참여와 개도국 산업발전 전략과의 조응이 필요하다. 또한 산업단지가 건설되기 위해서는 계획에서 준공까지 상당한 기간이 소요된다. 대규모 사업단지의 경우 수십 년에 걸쳐서 사업이 지속되기도 한다. 그리고 생산집적지의 클러스터가 혁신성이 작동하는 혁신클러스터로 거듭나기 위해서도 장시간이 소요된다. 우리나라의 경우 지역산업정책을 통하여 1990년대 중반 이후 지금까지 지역의 자생적인 혁신클러스터를 육성하기 위하여 정책적 노력을 기울이고 있지만, 여전히 지역산업의 취약성과 지역 중소기업의 경쟁력 부재가 문제가 되고 있다.
산업단지 클러스터 사업 효과성을 위해 개도국과의 협력이 필요하다. 우리나라는 지역산업의 취약성과 지역 중소기업 경쟁력 부재가 큰 문제점이다.