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세 번째로, 데이터 보관의 문제점을 들 수 있다. 일부 보관 자료의 경우 코드북이 없는 자료도 존재한다. 데이터의 경우 코드북이 존재하지 않으면 설문과 데이터 연결이 쉽지 않다. 데이터의 보관(엑셀, spss)에서도 각 연도별로 다르게 코딩되어 있어서 연도별 파일을 종합하여 비교하는데 불편함을 주고 있다. 즉 코드북과 코딩을 일관성 있게 유지해야 한다. 한편 보관된 데이터의 경우 데이터클리닝이 이루어지지 않은 상태로 보관된 자료도 있다. 예를 들어 spss프로그램으로 보관된 자료의 경우, 결측값이 정의되지 않은 상태로 코딩되어 있어서 주의하지 않을 경우 통계분석에서 오류가 발생할 가능성도 있다.
세 번째로 데이터 보관의 문제점이다. 데이터는 코드북이 없으면 설문과 데이터 연결이 어렵고, 코딩이 다르면 이용에 불편함이 있으니 코드북과 코딩이 일관성 유지해야 한다.