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예를 들어, 지난 메르스 사태에서 메르스 대응의 주관기관(감염병 대응)은 분명히 보건복지부였으나, 국민들은 국민안전처가 중요한 역할을 해야 한다고 기대했다. 그러나 실제 상황에서 국민안전처는 전문성도 부족하고 실제 주관기관인 보건복지부와의 관계 문제로 인하여 전면에 나서지 못했다. 이에 따라 국민안전처가 실제로 국민의 안전을 위해 무엇을 했냐는 비판을 받기도 했다. 국민안전처의 업무 분장에 대한 충돌은 감염병 뿐만 아니라 다양한 분야에서 지속적으로 발생하고 있다. 이는 특히 다양한 분야의 부처별 안전관리 업무와 관련된다. 이와 함께 북한의 국지도발 문제나 테러에 대한 대응 문제에 있어서는 재난안전관리의 대상과 범위가 국방의 문제와 구분이 어렵게 되곤 한다. 예를 들어 2010년 천안함 침몰과 2009년 북한 황강댐 방류로 인한 사망사고 발생 등은 재난안전관리와 국방의 문제가 복합된 것으로 볼 수 있다.
2010년 천안함 침몰과 2009년 북한 황강댐 방류로 인한 사망사고 발생 등은 재난안전관리와 국방의 문제가 복합된 것으로 볼 수 있다.