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이러한 대학R&D의 특징은 대학 및 학과 특성화, 인력양성, R&D 등의 다양한 목적을 함께 가지고 있다고 할 수 있다. 그러나 이 중 대학 및 학과 특성화와 관련된 사업은 R&D라기보다는 고등교육재정지원 및 교육 인프라 관련 사업으로 보는 것이 타당하다. 즉, 다양한 목적을 가지는 대학R&D사업들에 대해서는 R&D 사업 유무를 판단하는 작업이 필요하며 이러한 관점에서 대학R&D는 대학 및 학과 특성화보다는 인력양성과 R&D의 특성에 집중하는 것이 타당하다. 특히 대학 R&D의 대부분은 기초연구에 해당하며, 기초연구의 대부분이 대학에서 이루어지므로 대학R&D와 기초 연구를 분리하여 생각하기 어려운 측면 존재한다.
대학R&D는 대학 및 학과 특성화보다는 인력양성과 R&D에 집중하는 것이 적절하다. 특히 연구 대부분은 기초연구에 해당하므로, 대학R&D와 기초 연구의 분리는 어렵다.