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한편 거절결정불복심판의 경우 특허청 심사관의 잘못을 특허심판원에서 바로잡는 것임에도 특허법 제165조 제3항에 의하여 모든 비용을 청구인이 부담하여야 하는데, 이것이 더 시급히 해결되어야 할 문제라는 지적도 있었는데, 권리범위확인심판 및 통상실시권허여심판 등과 함께 거절결정불복심판은 조금 다른 비용부담원칙이 적용되어야 하는 심판 유형임이 분명한 것으로 보인다. 심판비용을 전액 청구인이 부담하는 것이 당연히 옳을 것으로 생각되는 심판유형은 정정심판 등 소수에 불과하고, 그 밖의 다른 심판유형에서의 바람직한 비용분담 구조에 대하여는 추가 연구가 필요할 것이나, 심판유형을 구분하지 않고 무효심판의 경우에 적용될 기준만을 설정하여 달라는 착수 전 요청에 따라 이 부분은 이 글의 연구범위에서 배제하도록 한다.
심판비용을 전액 청구인이 부담하는 거절결정불복심판은 바람직한 비용분담 구조에 대해 추가 연구가 필요한 유형 중 하나이다.