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UR 협상 돌입 다음해인 1987년 2월 농수산물유통공사는 수급안정과 일부 품목의 판로 개척 차원에서 진행해오던 수출 업무의 방향성을 전면 혁신하였다. 수입 개방에 대비, 농수산업의 생산 기반 보호를 위한 전략적 차원으로 수출업무를 추진하기 시작한 것이다. 이를 위해 부족 농수산물의 수입 업무를 담당하던 무역과를 무역부로 확대 개편하고 해외 수출시장 개척, 민간수출 지원, 그리고 해외 정보의 분석 업무 등을 강화하도록 하였다. 이듬해인 1988년부터는 지엽적으로 추진하던 일부 과실류의 수출에서 벗어나 화훼, 김치, 버섯, 산채류 등 소량 다품목 제품을 수출전략 품목으로 발굴하여 시험 수출에 착수하였다. 유통공사는 이와 함께 1988년 1월 29일부터 2월 7일까지 독일 베를린에서 개최된 베를린 농업박람회에 최초로 참가하였다. 이는 우리 농수산물의 해외시장 개척을 위한 유통공사 해외 마케팅의 효시로 기록되고 있다. 1989년 2월에는 해외 무역정보 수집과 분석을 위한 전담부서를 설치하여 해외 수출품목의 타당성 조사, 해외 식품 산업의 모니터링, 무역 정보지 발간 등의 업무를 수행하기 시작했다.
UR 협상 이후 공사는 수출 업무의 방향성을 틀어 추진했다. 그 예로 무역과의 무역부로 확대, 해외 수출시장 개척, 민간수출 지원, 해외 정보의 분석 업무 강화 등이 있었고, 이후 새로운 제품을 시험 수출하고 외국 농업박람회에 참여하는 등의 노력을 해왔다.