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성 평등 지수를 구성하는 지표는 지수 산정을 통해 우리나라의 성 평등 수준과 추이, 그리고 각 분야별 성 평등 수준과 그 변동 요인을 파악함과 동시에 해당 지표와 관련된 각 행정부처의 정책을 점검하고 평가하는데 목적이 있다. 2013년도까지 발표되었던 국가 성 평등 지수의 지표들은 다음과 같은 과정을 통해 선정되었다. 먼저 2009년 한국 여성정책 연구원 연구결과에 의해 선정되었던 8개 분야, 21개 대표 지표에 대한 협의 결과, 연구 초안에 포함되었던 보건 분야의 대표 지표인 ‘성별 건강수명’ 지표의 경우 생산주기의 불규칙, 지표 값의 완전평등 수준 도달, 동 지표의 책임관리 행정부처의 요청에 따라 지표를 변경했다. 대체된 지표는 건강 관련 5개 지표 즉, 운동능력(Mobility), 자기관리(Self-care), 일상 활동(Usual activity), 통증/불편감(Pain/Disability), 그리고 불안과 우울(Anxiety and Depression)에 대한 주관적인 평가를 포괄하는 지표이면서 국제비교가 가능하며 매년 생산되는, ‘건강 관련 삶의 질(EQ-5D)’ 지표이다. 보건 분야의 또 다른 지표인 ‘주관적 건강 상태 평가 성별 격차’는 3년 주기로 생산되고, 동 지표의 책임관리 행정부 처가 대표 지표로 부적절한 것으로 지적함에 따라 상호 협의 아래 삭제했다.
성 평등 지수 구성 지표는 지수 산정을 통해 한국의 성 평등 수준과 그 추이, 분야별 성평등 수준 및 변동 요인을 파악해 이를 토대로 관련된 각 행정부처의 정책을 점검하고 평가하는데 그 목적을 두고 있다.