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조사대상의 대표성을 높이기 위해 조사대상 시설을 종합지원센터, 자활시설, 재활‧요양 시설로 구분하고, 지역별, 성별, 노숙상태별 비중을 유지하기 위해 15개의 시설을 조사대 상으로 층화표집하였다. 전체 조사대상자 규모는 약 300사례로 기획하였는데, 그 중 남녀 성비는 약 9:1(여성 약 10%), 거리와 시설의 비중은 1:2(거리 노숙인 약 33%), 자활시설과 재활‧요양시설의 비중은 2:3(자활시설 약 40%)이 될 수 있도록 기획하였다. 지역별로는 가장 노숙인 많이 모여드는 서울 지역의 노숙인을 가장 많이 포함하였고, 종합지원센터가 있는 대전지역, 대구지역을 조사 대상으로 포함하였다. 그리고 종합지원센터가 없는 지역 중 한 곳인 전남지역을 조사대상으로 포함하여 중소도시 노숙인의 특성이 포함될 수 있 도록 하였다.
조사의 대표성 제고를 위해 표본은 15개 시설, 300사례, 남녀성비 9:1, 거리와 시설 비중 1:2,  자활과 요양 시설 비중 2:3 등로 충호 표집하고 지역적으로는 서울, 대전,대구, 전남지역등을 포함하였다.