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연구 방법에 있어 본 논문은 문헌 연구(documentary research)에 집중한다. “문헌 연구는 이론을 중심으로 가설을 제시하는 연역적 방법보다 자료 수집을 선행한 후 연구 문제와 범주를 제기하는 귀납적 방법이 요구된다. 이러한 방법은 명백히 존재하는 자료에 근거하여 내용을 구성하기 때문에 작위적으로 사실을 왜곡하거나 통제하는 위험성에 대해 거리를 둘 수 있다.” 본 연구를 수행함에 있어 1차 자료를 최대한 수집한 후 활용하며, 그 중심에는 비밀 해제된 자료들이 중요한 역할을 하게 된다. 그리고 최후 연구 질문에 대한 해답을 도출한다(Platt, 1981, pp. 31-52). 글의 구성은 다음과 같다. 우선 Ⅰ장은 서론 부분으로 문제 제기, 연구 목적, 기존 연구 검토, 연구 방법을 소개하며 본론으로 진입한다. Ⅱ장에서는 박정희 정부에 있어 핵미사일 개발의 배경으로 작용한 북한의 위협과 주한미군 철수 문제를 중점적으로 기술한다. Ⅲ장에서는 세 가지 합리적 추론을 제시하며 박정희 정부의 핵미사일 개발에 대한 관점을 명확하게 밝힐 것이다. Ⅳ장에서는 박정희 정부의 핵미사일 개발에 따른 한미동맹 간 갈등이 심화되는 양상을 서술한다. Ⅴ장에서는 심화된 한미동맹의 갈등이 완화되는 과정의 실체를 분석한다. 끝으로 Ⅵ장에서는 본 연구의 결과를 명백히 하고 함의를 전하며 논문을 마무리한다.
본 논문은 문헌 연구에 집중해 1장에서는 서론을 작성하고, 2장에서는 북한의 위협과 주한미군 철수, 3장에서는 박정희 정부의 핵미사일 개발 관점, 4장에서는 한미동맹 간 갈등 심화 양상, 5장에서는 갈등 완화 과정을 중심으로 작성한 후, 6장에서 연구 결과를 명백히 하고자 한다.