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근로소득 비과세제도의 혜택이 역진적이라는 점도 이 제도에 대해 부정적으로 평가하는 요인 중의 하나라고 할 수 있다. 국세청이 집계하는 비과세 소득 신고자는 2015년에 192만명으로 근로소득세 신고자 1,733만명의 11.1%를 차지하였다. 그런데 총급여 상위 10%에 해당하는 경우만 보면, 21.8%가 비과세 소득을 신고하였다. 특히 국외근로수당 비과세의 경우, 이 항목 비과세 신고자 중 총급여가 상위 10%에 해당하는 고소득자가 차지하는 비중이 41%였으며, 연구활동비 비과세의 경우에는 이 비율이 34.2%였다. 이러한 수치들은 일부 비과세 항목의 혜택이 상당히 역진적이라는 점을 보여준다.
근로소득 비과세제도를 분석해보면 신고자들의 대부분은 고소득자로 나타났다. 국외근로수당 비과세의 상위 10% 중에도 고소득자들이 많았다. 이는 비과세의 역진적 효과를 보여준다. 