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다음으로 의료산업 육성과 관련된 문제가 있다. 의료산업 육성은 영리병원을 통한 서비스산업 육성과 의료기기, 바이오, 제약 등의 제품산업 육성의 두 가지 측면이 있다. 현재 영리병원설립에 대해서는 기획재정부와 보험회사를 중심으로 필요성을 제기하고 있다. 특히 일부 전문가들은 민영병원의 설립이 특정회사의 의료산업전략과 연계되어 있어 이에 대한 우려들을 많이 표명했다. 반대로 보건복지부의 의견은 불안정한 상황에서 영리병원설립은 잘못하면 국내 공적 의료시스템을 무너뜨릴 수 있다라는 의견을 표명하고 있다. 또한 제품산업에 대해서는 보건복지부가 상대적으로 지식경제부보다 의료산업과 같은 제품산업 육성능력 부분에 있어 어느 정도 미약약하다라는 약점이 있어 정책 논의에서 약간 밀리는 상황이다.
의료산업 육성은 서비스산업과 제품산업의 두 가지 측면이 존재한다. 서비스산업은 영리병원의 설립과 공적 의료시스템 사이에서 갈등이 있고, 제품산업은 육성능력의 미약으로 정책 논의에서 밀리고 있다.