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황우석을 절대적 존재로 떠받드는 사회 분위기는 사이버 공간에서 고조되었다. PD수첩이 배아줄기세포 연구 중 불법 거래된 난자와 연구원의 난자가 사용되었다는 의혹을 제기하자, 각 포털사이트 게시판에는 PD수첩을 비난하고 황우석을 지지하는 글들이 폭주하였고, 황우석의 팬클럽 회원 수도 폭발적으로 증가하였다. 이성적으로 볼 때 황우석의 연구윤리 의혹이 불거진 시점부터 그에 대한 지지는 가라앉아야 하지만, 국익 담론이 들끓으면서 회원 수가 증가하는 역설적인 현상이 벌어졌다. 1만 명 정도였던 황우석 팬클럽 회원 수는 PD수첩 방영을 계기로 6만 명을 넘었고, 2006년 1월 서울대가 황우석 등 관련자들을 징계위원회에 회부할 무렵에는 약 12만 명에 달하였다. PD수첩 방영 당일 MBC 홈페이지에는 4000여 개의 비난 글이 게시되었다.
PD수첩이 불법 난자 사용 의혹을 제기하자 비난 글이 폭주했다. 국익 담론이 퍼지며 서울대 징계위원회의 조사 당시 팬클럽 회원 수는 12배 가까이 증가했다. 비이성적인 현상 속 지지 분위기는 사이버 공간에서 무르익었다.