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연구 개발 문제해결과정에 관련된 부문들 간의 관계를 상호 유기적으로 작동하는 문제해결시스템으로 발전시키면 다음 그림으로 나타낼 수 있다. 즉, 정부연구 개발 사업 추진을 통해 이루어지는 연구 개발 활동이 문제해결을 중심으로 이루어지고 이러한 활동은 사업관리체계에 의해서 관리통제된다. 즉, 문제정의와 해결방법 등이 기획과정을 통해 이루어지고 그 성과는 평가를 통해 통제된다. 그리고 이러한 사업관리체계는 상위 지배구조인 예산배분관리제도에 의해서 직접적으로 지배되며 국가전략 및 연구 개발전략, 연구 개발정책방향에 의해서도 영향을 받는다. 그리고 문제해결 활동이 이루어지는 연구장의 환경 및 역량도 연구 개발을 통한 문제해결과정과 성과창출에 중요한 관련성을 갖는다. 또한 이러한 시스템적 관계 속에서 문제해결을 위한 자원투입활동과 문제해결 활동이 이루어지고 활동결과인 성과가 창출되고 그 결과는 투입과 과정단계에 다시 피드백된다.
문제정의와 해결방법등이 기획과정을 통해 이루어지고 그 성과가 평가를 통해 통제되는 사업관리체계는 예산배분관리제도, 국가런략 등에 의해 영향을 받는다. 이런 관계 속에서 문제해셜 활동이 이루어지고 그 결과는 과정에 피드백된다.