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입법자는 기본권을 제한하는 경우에도 입법목적 실현에 적합한 여러 수단 중에서 되도록 기본권을 최소로 침해하는 수단을 선택해야 한다. 양심적 병역거부자로 하여금 비군사적 성격의 공익적 업무에 종사하게 함으로써 병역의무의 이행에 갈음하도록 하는 대체복무제는 국방의 의무와 양심의 자유의 보장 사이에 발생하는 헌법적 가치의 충돌 문제를 해결하는 유력한 수단으로 오래전부터 제시되어 왔다. 이러한 대체복무제는 군사훈련을 수반하는 병역의무를 일률적으로 부과하는 것에 비하여 양심의 자유를 덜 제한하는 수단임이 명백하므로, 이하에서는 대체복무제를 도입할 경우 현재의 병역 종류 조항과 동등하게 입법목적을 달성할 수 있는지에 관하여 검토한다.
대체복무제는 헌법 가치의 충돌을 해결하는수단이다. 이는 양심의 자유를 덜 제한하는 방법이므로, 대체복무제를 실시할 경우 병역 종류 조항과 동일하게 목적을 달성할 수 있는지 조사한다.