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제주해군기지가 미 해군을 위한 전초기지로 사용되기에는 가치가 그다지 크지 않다. 먼저 제주도는 MD 차원에서 미국 본토를 겨냥하는 북한, 중국의 대륙 간 탄도미사일(ICBM) 수준 장거리미사일에 대한 발사단계 요격(Boost Phase Interception)을 위한 이지스 방공구축함 배치지점으로는 적합하지 않다. 유사시 중국의 대만 침공을 막기 위해 미 해군이 항공모함 전단 등을 동원할 경우에도 이미 미군기지가 존재하는 오키나와(沖繩)의 입지조건이 훨씬 더 낫다고 볼 수 있는 것이다. 오키나와에서 대만까지의 거리가 약 330해리인 것에 비해 제주도와 대만의 거리는 무려 560해리나 되기 때문이다.
제주해군기지는 이지스 방공구축함 배치지점으로도 적합하지 않고 대만까지의 거리도 오키나와보다 멀어 미 해군을 위한 전초기지로 사용되기 어렵다.