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이처럼 고구려 고고학 연구에서 북한지역의 자료는 절대적인 의미를 지니지만, 조사의 수준이 낮고, 발굴 보고서의 내용이 간략하고 상세한 서술이 이루어져 있지 않아 관련 연구에는 많은 어려움이 있다. 하지만 역사고고학 분야 중 고조선이나 낙랑군에 비해 고구려고고학이 남북한 학계간의 시각 차이가 상대적으로 작은 편이어서, 향후 학술교류를 통해 공동 조사와 연구가 가능한 분야로 보인다. 현재 고구려 고고학에서 북한지역의 고고학과 관련된 대표적인 논쟁점으로 ① 고구려의 도성, ② 고구려토기의 기원, ③ 고구려 벽화고분의 계보 등을 들 수 있다.
고구려 고고학 연구는  북한지역이라는 한계때문에 많은 어려움이 있지만,  남북간 학계간의 시각차이가 작기때문에 공동 조사와 연구가 가능할 것으로 보인다.