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최근 고등학교 정규 수업시간에 교과서가 아닌 EBS 수능 연계교재가 주로 사용되고, 연계 교재의 문제풀이 비중이 높아지는 등 수업 파행에 대한 우려의 목소리가 높다. 이는 정부 에서 2011학년도부터 학생과 학부모들이 정부의 쉬운 수능정책을 체감하여 사교육비를 줄 일 수 있도록 EBS 수능교재에서 실제 수능 문제를 70% 연계하여 출제하겠다는 ‘수능-EBS 연계 정책’의 영향이라고 볼 수 있다. 이로 인해 학생들의 학습 및 교사의 수업 방식, 수업 분위기 등에서 여러 변화가 나타나고 있다(길혜지, 2014; 김현정 외, 2014). 예컨대, 교사를 대상으로 한 설문조사 결과(김현정 외, 2014)에 따르면 수능-EBS 연계 정책 이전에는 EBS 수능 연계교재 이용 비중이 정규 수업의 25.4%, 방과후학교 수업의 41.1%를 차지한 반면에,  이후에는 정규 수업의 63.0%, 방과후학교 수업의 82.9%를 차지하는 등 학교 수업에서 그 활용이 크게 확대된 것으로 나타났다. 정부에서도 이러한 상황에 주목하여 수능-EBS 연계 정책에 대한 변화를 예고하고 있다. 학생들의 핵심역량 함양을 목표로 2015 개정교육과정이 도입됨에 따라 새로운 교육과정과 연계한 대입제도 개선이 요구되며, 문재인정부의 절대평 가 기조를 담은 수능 개편안 발표를 앞두고 교육 당사자들로부터 수능-EBS 연계방식 개선에 대한 요구가 강하게 제기되고 있기 때문이다. 교육부 역시 수능-EBS 연계 정책에 대한 공청 회 등 의견수렴 절차를 거쳐 연계율을 축소하겠다는 입장을 보이기도 하였다(한겨례, 2017.8.31.일자 기사).
EBS 교재에서 실제 수능 문제를 70% 연계하여 출제하겠다는 ‘수능-EBS연계 정책’의 영향으로, 고등학교 수업시간에 교과서 대신 EBS 수능 연계교재를 사용하는 비중이 커진 것으로 나타났다.  수업 파행에 대한 우려가 커지자 교육부는 공청회 등을 거쳐 연계율을 축소하겠다는 입장을 보이기도 했다.