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그러나 과거 생산 기능의 집적에 치중한 1960~80년대의 주요 산업단지의 경우 경제의 패러다임이 단순 생산 및 제조 중심에서 지식을 기반으로 하는 혁신주도형 경제로 전환되면서 새로운 변화에 충분하게 대응하지 못하는 등 한계를 보여주고 있었다. 특히 집적화된 기업은 존재하는 반면 R&D 활동이나 역량측면에서는 크게 개선된 모습을 보여주지 못했다. 또한 물류나 기업에 대한 서비스 측면에서도 새로운 변화에 대응하기 위한 자체 혁신 역량을 갖추지 못해 경쟁력을 잃고 있었다. 그 결과 많은 제조업체들이 해외로 공장을 이전하고 새로운 기업 유치에 어려움을 겪고 있었다. 배후시설의 노후화와 함께 교육 문화와 클러스터 간 연계도 충분하지 못해 고급인력의 산업단지 유치면에서도 경쟁력이 약화되고 있었다(조혜영, 2013)
단순 생산 및 제조 중심에서 지식을 기반으로 하는 혁신주도형 경제로 전환되면서 많은 제조업체들이 어려움을 겪고 있다.