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서이종(2013)은 연구윤리 위반의 폐해와 부작용을 개인적, 학문공동체적, 그리고 국가적 차원으로 나누어 설명하고 있다. 개인적 차원에서 연구윤리 위반은 연구자 개인에게 부도덕한 사람이라 는 오명과 위신추락을 가져온다. 그 연구자가 속한 학문공동체는 불필요한 실험이나 조사를 반복해야하며 이는 시간 및 자원낭비를 초래한다. 이러한 위반사례가 반복되다보면 해당 학문공동체에 대한 사회적 평판은 부정적일 수밖에 없다. 마찬가지로 연구윤리 위반은 국가적인 차원에서도 커다란 손실을 가져올 수 있다. 부정행위나 인권침해로 얻어진 연구결과는 국가 간의 갈등을 불러올 수도 있으며 세계 학계는 해당 국가 소속의 다른 연구자들의 후속연구에도 의심의 눈초리를 보낼 수 있다.
연구윤리 위반은 개인에게는 부도덕성과 위신추락을, 학문공동체에는시간과 자원의 낭비를 초래한다.  부정행위나 인권 침해로 얻어진 결과는 국가간의 갈등을, 해당국가 소속의 후속연구도 의심을 갖게한다.