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문제는 각 구성요소들이 분절적으로 추진되어 혁신의 성과로 집약되고 있지 못하다는 점이다. 대학은 논문과 특허를 양산하는 데 집중하고, 기술이전을 통한 사업화는 미흡하다. 지식창출을 위한 투자확대로 지역별로 일정 정도 지식생태계가 만들어지고 있으나 비즈니스생태계와의 연계를 통한 혁신의 확산과 활용은 여전히 미흡한 것이다. 지역중소기업을 대상으로 한 기술개발지원도 큰 폭으로 증가하여 지역기업의 기술개발 활동과 투자도 상당 수준에 달하고 있다. 그러나 기업들의 혁신활동도 비즈니스생태계 내에서 폐쇄형으로 추진되어 전체 혁신생태계와 유기적으로 연계되고 있지 못하다. 기술중개기능을 담당하는 지역기술센터는 정부로부터 지원 받은 장비운용에 집중하고 있다. 이를 통해 기업이 저렴한 비용으로 고가의 시험분석·시제품 제작 장비를 활용할 수 있도록 함으로써 단기적 성과는 있지만 신제품개발 및 기업과의 공동기술개발이나 계약연구와 같은 전반적 기술역량을 늘리는 데는 한계가 많다.
상호 연계적으로 혁신의 성과로 집약되어야 한다. 대학은 기술이전을 통한 사업화 보충, 지식창출의 투자확대를 비즈니스생태계와의 연계를 통해 활용, 지역중소기업의 기술개발지원도 전체 혁신생태계와 연계, 지역기술센터도 신제품개발 등 기술역량을 늘려야 한다.