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김영삼 정부 하에서 특히 논란의 대상이 되었던 것은 금융실명제이다. 부정축재 자금과 부동산 투기자금의 세탁절차였던 가명계정·차명계정이 허용되어 비리의 온상을 이루었던 금융제도·금융정책을 시정하기 위하여 실시된 금융실명제는 논란이 많았던 정책이다. 과거에도 여러 번 시도 되었으나 반대가 많아 실현되지 못한 금융실명제를 김영삼 대통령은 각계의 반대를 무릅쓰고 단행했다. 비밀이 샌다면 급속도로 자본이 빠져나가 하루아침에 우리 경제에 심대한 타격을 줄 수 있다고 생각한 김영삼 대통령은 이경식 부총리에게 절대비밀을 지킬 것을 엄명하여 이경식 부총리와 홍재형 재무장관이 대통령 비서실장도 모르는 상황에서 작업을 진행하여 1993년 8월 12일 금융실명제를 발표했다. 전술한 바와 같이 찬성 측은 금융실명제가 비리의 온상인 금융제도·금융정책을 시정하기 위하여 반드시 실천에 옮겨져 야 한다고 주장했으나 정·재계에서는 금융실명제가 원활한 돈의 흐름을 저해한다고 주장했다. 이와 같이 금융실명제에 관해서는 논란이 많았으나 오늘날과 같이 금융질서가 다소간에나마 투명해진 것은 금융실명제 덕분이라는 주장에 일리가 있다고 할 수 있을 것이다.
김영삼 정부 하에서  금융실명제는 논란의 대상이었다. 찬성 측은 가명계정·차명계정이 허용되어 비리의 온상인 금융제도 및 정책시정을 위해 필요하다고 주장했으나 정·재계에서는 오히려 원활한 돈의 흐름을 저해한다고 주장했다. 하지만 오늘날 금융질서가 투명해진 것은 금융실명제 덕분이라는 주장은 일리가 있다.