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그런데 한편, MOSS 협의 중 미일 관계는 오히려 악화되었다. 85 년 초 미국 의회에서는 MOSS 협의의 지지 부진과 대미 자동차 수출 규제의 연장을 계기로 대일 보복 결의가 가결되었으며, 거의 300 개에 가까운 보호주의 법안이 제출되었던 것이다. 그러나 이러한 상황에서도, 양국은 합의 사항을 점검하기 위하여 계속 회합을 가졌으며, 86 년 6 월에는 수송기기 (자동차 부품)가 MOSS 협의의 대상이 되고, 동년 12 월에는 슈퍼/컴퓨터 문제도 추가되었다. 수송기기에 대해서는 양국이 87 년 8 월 대일 접근 개선책을 최종 보고 서로서 정리하고, 슈퍼/컴퓨터에 대해서는 일본 정부가 정부 수요 물자 조달에 있어서 미국 기업의 참가를 보장하기 위하여 투명성과 공평성을 확보하는 도입 절차를 마련, 실시하게 됨으로써 타결되었던 것이다.
MOSS 협의 중에서도 양국의 경제마찰이 진행되고 있었다. 그 중에 수송기기와 슈퍼/컴퓨터는 MOSS 협의가 지지부진한 문제이다. 양국은 수차례의 회합함으로써 이 두 부분에 대해 타결하였다.