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혁신클러스터의 핵심이 산학연 협력시스템의 구축이라고 볼 때 산학연 협력 연구개발 시스템 구축 지원은 산업단지 혁신클러스터 ODA 사업의 핵심분야라고 할 수 있다. 주동주 외(2012)는 이 사업의 내용으로 산학연 협력시스템을 위한 제도 구축, 이를 위한 관련 시스템 관리 전문인력의 양성을 위한 교육과 인적교류 지원, 이러한 혁신클러스터 관리기관이 입주할 시설 건립, 핵심 기술개발센터에 대한 연구기자재 지원 등을 제시하고 세부 사업으로 대학 내 산학협력단 및 기술이전과 사업화를 위한 전담부서 설치, 학교기업제도 도입 방안을 전수하고, 산학협력 중심대학 육성 프로그램의 설계, 대학의 계약학과 운영 및 맞춤형 산업인력 양성 강화 프로그램의 구축, 대학교수, 연구원의 창업시 휴직 또는 기업임원 겸직 허용 제도 구축에 대한 기초적인 틀과 방안을 전수하는 것을 제안하고 있다. 이 분야 ODA를 수행할 핵심역량도 마찬가지로 관련 정책기관 및 집행기관의 전문성에 있다고 할 수 있다. 산학연협력 관련 전문기관으로 한국산업기술평가관리원, 한국산업기술진흥원, 중소기업기술정보진흥원, 한국산학연합회 등을 들 수 있으며, 산학연협력 관련 단체로는 산학연협력총연합회, 대학기술이전협회, 대학산업기술지원단, 한국산업기술진흥협회, 한국과학창의재단, 산학협력단장협의회, 한국기술출연기관장협의회 등을 들 수 있다. 이러한 기관들 외에도 산학연협력을 수행하고 있는 각 대학의 산학협력단과 대학의 연구소 등도 해당 업종의 산업단지 혁신클러스터 개발 ODA에 활용될 수 있는 기관들이다.
산학연 협력시스템 구축이 핵심인 혁신클러스터 사업의 일환으로 주동주 외는 사업 관련 제도의 기초를 마련하고 방안을 알리는 것을 제안한다.  해당 분야의 ODA 수행의 중심은 관련 정책과 집행을 맡는 기관의 전문성이 큰 몫을 차지하며, 이러한 기관 외에도 대학 산학협력단이나 대학 연구소 등이 있다.