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성폭력상담소의 주요 업무는 성폭력 피해에 대한 신고를 받거나 관련 피해 상담을 지원하고 성폭력으로 인하여 정상적인 가정생활 혹은 사회생활이 곤란한 경우 긴급보호하며 피해자의 질병치료와 건강관리를 위한 의료기관에 인도하는 등의 의료지원 뿐 아니라 피해자에 대한 수사기관 및 법정 동행, 가해자에 대한 고소와 피해배상청구 등 사법처리 절차 지원 등이며 성폭력 피해자 보호시설의 임무는 성폭력상담소 지원 내용과 크게 다르지 않지만 보호시설이기 때문에 성폭력 피해자의 임시보호가 포함되며 그 외에도 자립자활교육의 시행과 취업정보 제공 등이 있다. 아래의 표에서 나타나듯이 성폭력상담소 및 보호시설 피해자 지원 유형과 내용을 보면 심리 및 정서적 지원이 50% 이상을 차지하고 있고 그 다음으로 수사 및 법적지원, 의료적 지원, 시설입소 연계 등의 순이었다.
성폭력상담소는 피해자들의 신고를 받고 , 상담을하여 심리적 안정을 지원하는 역할을 주로 하고 수사와 법적처리지원,의료지원,시설 입소 연결등의 업무를 한다.  보호시설에서는 자립할 수 있는 교육과 취업정보 등을 알려준다.