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이제까지 공공기관 임금체계 논의는 주로 일반직원을 대상으로 하였다. 일반직원의 획일적 이고 일률적인 임금결정방식에 문제의식이 있었고 이를 해결하기 위하여 임금차등에 초점을 맞춘 임금체계 개편을 모색하였기 때문에 당연한 선택이었다고 볼 수 있다. 하지만 좀 더 넓게 본다면 공공기관에는 일반직원뿐만 아니라 별정직, 특정직, 또는 전문직이라 불리는 비일반직 원도 존재한다. 대상을 확대하면 그 동안 잘 논의되지 않던 현행 공공기관 인력관리 실태가 보이는데, 바로 대부분의 공공기관들이 일반직원과 비일반직원을 구분하는 이원적 인사관리 방식을 취하고 있다는 점이다.
공공기관 임금체계 논의는 주로 일반직원이 대상인데 임금결정상의 문제를 해결하기 위해서였다. 비일반직 직원의 경우 다른 인사관리  방식이 적용되는 경우도 있다.