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마지막으로 사회복지사업의 지방 이양과 함께 지방정부의 특수시책에 의한 지방정부 자체의 보육사업 내용 또한 증가하였다. 국고 지원사업은 보육료 지원이 거의 대부분을 차지하며, 보육료 외에 다양한 측면의 지원은 대부분 지방정부 사업에 의해 지원되고 있다. 한국보육진흥원의 분석 결과 나타난 것처럼 2016-2017년 기준 보육아동 1인당 71만 7천원의 비용이 지방정부 특수보육시책에 의해 지원되고 있다. 그러나 문제는 지방정부 특수보육시책 사업은 사업여부 자체에서도 지역 간 격차가 존재하지만, 동일 항목에 대한 지원 사업이 존재하는 경우에도 지원대상이나 지원 액수 규모에서 지역 간 격차가 매우 크다는 데에 있다. 적지 않은 비용이 지방정부의 특수보육시책사업에 의해 지역 간 격차가 심화되는 채로 지원되는 것이 맞는지, 재고가 필요하다.
지방정부 특수보육시책 사업은 사업여부 자체 및 동일항목에서의 지원대상이나 지원 액수 규모에서 지역 간 격차가 매우 크므로 이에 대한 재고가 필요하다.