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최종적으로 분석에 포함된 학생 및 학교수준 변수들은 학생배경, 학교배경 및 학교유형 변수로 구분하여 <표 2>에 제시하였다. 학생배경변수 중 부모학력은 TIMSS의 부모 학력변수(BCDGEDUP)를 활용하여 초졸 6년, 중졸 9년 등 실제 교육연한으로 환산하였으며, 가정의 교육자원은 TIMSS의 Home Educational Resources(BSBGHER)을 활용하였다. 이는 척도화된 합성점수이므로 원척도 그대로 사용하였다. 사교육시간은 중학교 2학년～중학교 3학년 사이의 사교육에 관한 정보를 사용해야 하므로 NAEA2011의 학습지 및 사설 인터넷 강의 활용시간(s20) 및 학원강의 및 과외수업 시간(s21)을 활용하여 총 사교육 시간을 구성하였다. 학교배경변수인 평균부모학력, 평균 교육자원 및 평균 사교육시간은 앞서 제시한 학생 배경 변수를 학교별로 평균한 값을 사용하였으며, 기초생활수급학생비율은 1단위가 10%가 되도록 조정하였고, 학교규모는 총 학생수를 100명 단위로 나타낸 값을 사용하였다. 학교유형변수로 지역규모(대도시, 중소도시, 읍면도서), 학교성별(남학교, 여학교, 공학) 및 설립유형(국공립, 사립)을 사용하였다. 학교유형에 해당하는 변수는 추가적 자료수집 없이 현재 공시 체체 하에서 활용 가능한 변수이므로 대안의 탐색에 있어 주요한 고려대상이 될 것이다.
최종 분석에 포함된 학생 및 학교 수준 변수들은 부모 학력과 가정의 교육 자원, 사교육 시간으로 이루어진 학생배경변수와 그 값들의 평균값으로 이루어진 학교배경변수, 지역 규모, 학교 성별 및 설립유형으로 이루어진 학교유형변수로 구분했다.