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본 연구는 다음과 같은 한계점을 가지고 있다. 분석에 이용한 한국 복지패널이 2006년부터 시작된 관계로 초저출산 현상 이전에 기혼여성의 노동시장 참여 여부 및 참여 형태 가 출산 이행에 미치는 영향력과 비교할 수 없었다. 앞으로 한국 복지패널 실시 기간이 늘어나면 출산율 추이에 따른 기간별 영향력을 비교 분석하는 것은 매우 의미가 있을 것이다. 한편, 한국사회에서는 임신이나 출산으로 인하여 여성들이 노동시장에서 이탈하는 경향이 높다. 이러한 상황은 출산 이행에 대한 노동시장 참여의 부정적 효과를 더욱 크게 추정할 개연성을 갖는다. 본 연구에서는 여성의 노동시장 참여 여부를 출산이 발생한 해의 전년도 기준으로 분석하였으므로, 임신 기간 동안 노동시장에 참여하였으나 출산 전 노동시장에서 이탈한 여성들을 분리해내지 못하였다는 한계가 있다. 따라서 추후 연구들은 출산 전 노동시장 이탈 시기 등을 세밀하게 하여 모형을 보다 정교화하여 분석을 수행할 필요가 있다. 다음으로 일-가정 양립제도 활용 가능성을 간접적으로 가늠해볼 수 있는 직장형태(공공기관, 민간기관 등)나 직장 규모 등을 반영하고자 하였으나, 취업여성의 노동시장 참여 형태를 지나치게 세분화할 경우 사례수를 충분히 확보하지 못하여 이들 특성까지는 반영하지 못하였다는 한계점이 있다. 차후 연구에서는 이와 같은 직장 요인까지도 고려하는 등 취업여성의 노동시장 참여 특성을 세밀화하여 살펴보는 것 이 필요할 것이다.
본 연구는 초저출산 현상 이전에 기혼여성의 노동시장 참여 여부 및 형태가 출산 이행에 미치는 영향력과 비교할 수 없었고, 임신 기간 동안 노동을 하고 있었으나 출산 직전 노동시장에서 이탈한 여성들을 분리해 내지 못했다 점 등  다양한 상황과 형태를 반영하지 못한  한계점으로 지적되고 있는데, 이는 추후 연구에서 세밀화 하여 살펴봄이 필요할 것이다.