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수집된 모든 자료는 전사를 하였고, 동시에 코딩 및 주제 도출 작업을 병행하였다. 전사와 코딩, 그리 고 주제 발견은 분절된 형태로 작업이 이루어지는 독립된 활동이 아니라 유기적인 관점에서 동시에 통합적으로 이루어지는 작업이다. 또한, 연구자는 질적 자료가 누적되는 과정에서 이론 탐색, 연구자의 반성적 성찰, 그리고 질적 전문가의 검토가 입체적으로 반영될 수 있도록 하였다. 따라서 연구자의 판단으로 결정한 코드, 범주화, 그리고 주제일지라도 지속적으로 자료와 이론이 결합되고 연구자의 반성적 성찰이 관여하면서 수차례 반복적인 수정･보완 작업을 통해 주제가 만들어졌다. 초기에 생성한 162개의 코드를 바탕으로 범주화하여 최종적으로 부적응 학생의 문제행동 수정 프로젝트, 학교폭력 예방과 올바른 인성 기르기, 상호신뢰와 지원으로 유기적 협력공동체 구축, 또래학습･프로젝트 수업･체험학습의 효 과의 4개 주제를 도출하였다. 그리고 이 4개 주제는 실제 학교에서 실천한 사례가 드러날 수 있도록 구체적인 활동명과 결합함으로써 독자들과 효과적으로 공명할 수 있도록 하였다.
수집된 모든 자료는 전사, 코딩 및 주제 도출 작업을 병행하였고, 연구자는 그 과정에서 성찰과 검토의 입체적 반영을 통해 수차례 반복적 수정 보완 작업 거치며 주제를 만들었다. 이에 최종적으로 4개의 주제를 도출, 구체적인 활동명과 결합하여 독자들과 효과적으로 공명할 수 있도록 하였다.