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함평농민항쟁은 몇 가지 의미를 갖는다. 우선 조정의 대응 방법이 달라지는 전환점이 되었다는 점이다. 진주항쟁 이후 온건한 방법으로 대처하던 조정은 함평항쟁 이후에는 극단적인 방법으로 처형하기 시작했다. 
함평농민항쟁은 합법적으로 시작했고, 스스로 행정을 꾸려갔던 25일 동안 자치역량을 발휘하며 해방구를 만들어 냈다는 점도 눈여겨 볼만 한다. 이때 향교가 근거지가 되어 농민들의 역사와 함께 했다. 
어떻게 근거지가 될 수 있었던 것일까? 조선 후기에 들어오면서 향교는 교학적인 기능은 쇠퇴하고 대신 지역사회의 여론을 수렴하고 기강을 유지하는 사회 교화의 기능이 더욱 부각된다. 그러다보니 향교가 농민들에게 봉건적 모순을 자각하게 만들었다는 해석도 가능하다. 봉건사회의 억압을 받으며 어떠한 사회적, 신분적 모순을 의식 못한 채 살아왔던 농민들이 점차 사회적 모순에 눈을 떴다는 말이기도 하다. 
함평농민항쟁은 조정의 대응 방식을 변화시켰고, 향교를 근거지로 삼아 25일간 행정지를 자치했다. 향교는 조선 후기가 되면서 교학적 기능 보다는 교화의 기능이 강죄 되었다. 항교는 농민들에게 봉건, 신분, 사회적 모순을 깨닫게 만들었다. 