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그러나 면담 조사 결과, 실제로 체육전담교사를 선정하는 데는 특별한 기준이 없고 많은 문제점을 갖고 있음이 파악되었다. 전담교사를 맡았을 경우 업무나 성과에 특별한 장점이 없고 오히려 평가에 불이익을 당할 수 있기 때문에 전반적으로 교사들은 체육전담교사를 기피하는 경향이 있고, 따라서 담임 업무에 신뢰가 낮은 분이나 학교에서 소외되는 분들이 체육전담교사로 배치되는 경우가 잦다고 한다. 시도 평가 항목에 학교의 체육전담교사 배치율이 고려되기 때문에 각 학교에서 많이 지정을 하고 있으나 실제로 전문성이나 질적 수준을 고려하기에는 매우 미흡한 상황으로 조사되었다.
체육전담교사에게는 평가 불이익이 있을 수 있기에 오히려 학교에서 소외되거나 담임에 적합하지 않은 분이 배치되는 경우가 많아 전문성이나 질적 수준이 갖춰져있지 않다.