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앞에서 든 사례와 같이 국무총리가 실질적인 행정각부 통할권을 행사할 수 있다고 생각했던 김영삼 정부의 이회창 총리는 통상 안보와 대외문제에 대한 관계부처간의 의견조정을 위해 설치되었던 통일안보조정회의에 국무총리가 배제되는 것에 불만을 갖고 이 문제를 대통령과의 주례회동에서 제기하는 등 통상 대통령 고유의 업무라고 알려진 외교, 안보문제에 대해서도 관여하려 하였으며, 실제 관련 부처의 보고를 요구하기도 하였다(이재원, 2007: 269-270). 그러나 김영삼 대통령은 이회창 총리의 요구를 수용할 수 없었고, 이를 계기로 대통령과 국무총리 간 심각한 갈등이 발생하여 결국 이회창 총리가 조기 사임하였던 것이다.
이회창 국무총리는 통일안보조정회의 참여를 원했고  외교, 안보문제에 대해 관여하려 했으며 관련 부처의 보고를 요구하기도  하였다.  이를 계기로 이회창 총리가 조기 사임하였다.