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“제주도가 ‘평화의 섬’이므로 군 기지를 건설해선 안되며 지금의 제주도는 군대와 전혀 무관한 곳이다.”라는 말은 현실적으로 타당하지 않기 때문이다. 이미 제주도에는 목포, 인천과 더불어 3대 해군 지역방어사령부로 유명한 제주방 어사령부가 설치되어 있고 고속정 편대를 비롯한 일부 연안전투함정이 활동하고 있다. 게다가 제주공항에는 역시 해군 소속의 P-3 ‘오라이언’ 해상초계기와 수퍼링스 대잠헬기를 보유한 1개 항공대가 배치된 상태다. 이처럼 제주도에는 이미 군사시설이 존재하고 있고, 현재 추진되는 1개 기동전단과 이를 구성하는 함대를 구비하게 될 제주해군기지는 그 연장선이라 할 수 있다. 따라서 단순히 군사시설이니까 안 된다는 주장은 지극히 일관성이 결여된 것임을 알 수 있다. 반대론자들의 “제주해군기지는 평화의 섬과 어긋난다.”라는 주장이 타당성을 얻으려면, 다음의 2가지 조건을 만족시켜야 한다. 첫째는 중국이나 일본을 비롯한 주변국가들과의 해양분쟁 가능성이 없는 가운데 유독 한국만 해군력을 증강 하는 경우이다. 둘째는 한국해군이 제주도에 배치하려는 군함들의 규모와 전투력이 주변국들보다 크게 우월해 한국의 일방적 도발에 의한 해양분쟁이 발생할 수 있는 경우이다. 하지만 이들 모두 현실과는 거리가 먼 이야기다.
제주도는 이미 군사시설이 제대로 갖추어진 곳으로 평화의 섬이라 군대와 무관하다는 말은 맞지 않다. 따라서 제주해군기지를 반대하려면 주변국과 해양분쟁 가능성이 없는데 한국만 해군력 증강, 주변국과 비교해 한국이 우월한 규모와 전투력으로 일방적 도발에 해양분쟁이 발생할 경우가 충족해야 하는데 현실과 거리가 멀다.