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사업 시행이 야기할 수 있는 잠재적인 건강영향을 정성적평가와 정량적평가로 실시한다. 정성적평가는 제안내용의 잠재적 건강영향을 검토하여 긍정적, 부정적 건강영향 종류, 정도, 가능성 등을 종합적으로 분석한다. 또한 건강결정요인별 인구집단에 미치는 영향을 분석한다. 정량적 평가에서는 대기오염물질 및 악취물질별 배출량 산정, 영향예상지역에서의 오염물질 농도 예측 (대기확산모델 이용), 대기오염물질별 C-R 함수를 이용하여 건강영향을 개략적으로 검토, 국내 역학조사 결과와의 비교 검토, 비발암성 물질의 경우 위해도 지수 산정, 발암성 물질의 경우 발암위해도 산정 등 계량적 평가를 수행한다.
긍정적, 부정적 영향을 종합적으로 분석하는 정성적평가와 물질별 영향을 전체적으로 검토하고 계량적으로 분석하는 정량적평가를 통해 발생 가능한 잠재적 건강영향을 파악할 수 있다.