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한반도의 평화통일을 위해서는 중장기의 남북통합 종합계획이 필요하다. 통일정책연구실은 이를 위해 <통일 이후 통합 방안> <신통일대계> <통일과정에서 발생가능한 범죄 유형분석 및 대응방안> <전환기 남북관계 발전전략>을 다년도 연구과제로 추진하고 있다. 또한 통일정책연구실에서는 통일은 결국 사람의 통합으로 완성된다는 점을 중시하여 <남북통합에 대한 국민의식조사> 연구를 통해 통일에 대한 국민들의 의식변화 추이를 면밀하게 분석하고 있다. 아울러 통일정책연구실은 통일문제에 있어 북한 핵문제와 한·미동맹 역시 중요하다는 점을 인식하여 <확장억지의 신뢰성 제고를 위한 한미협력방안 연구> 과제를 수행하고 있다. 이상과 같은 연구과제 수행을 위해 통일정책연구실은 남북관계, 국제관계, 한미동맹, 군사·안보, 통일관계법, 사회학, 심리학, 여론조사 전문가들로 구성되어 있으며, 학제 간 연구 강화 차원에서 연구인력의 다변화를 위해 노력하고 있다.
통일정책연구실은 남북통일을 위해 다양한 중장기 프로젝트를 기획하고 있다. 통일 과정에서 발생할 수 있는 다양한 문제들과 국민 의식변화, 핵문제, 한·미 동맹 등의 과제를 해결하기 위해 다양한 분야의 전문가들과 함께 노력중이다.