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그러나 규제비용관리제의 적용대상 규제들의 비용을 살펴보면 직접비용으로 규정된 8가지 유형에 해당하지 않는 비용도 종종 발생되고 있는 점을 볼 수 있다. 대표적인 유형이 자본금 관련 규정인데, 사업의 허가요건중에 최소 자본 얼마이상을 요구하는 경우 해당 사업자에게는 이러한 자본금을 조달할 의무가 발생한다. 이러한 비용은 해당 비용을 자본금으로 묶어둠으로써 발생하는 기회비용으로도 해석이 가능하며, 다른 한편으로는 이러한 자본금을 조달하기 위한 금융비용으로도 해석이 가능하다. 이러한 자본금비용을 어느 쪽으로 해석하던지 간에 현재 직접비용으로 제시하고 있는 8개의 비용유형에는 포함되지 않는다는 사실이다.
적용대상 규제들의 비용을 살피면 직접비용으로 규정된 8가지에 해당하지 않은것들이 있는데 대표적으로 자본금 관련 규정이다. 이는 사업의 허가요건에 최소 자본에 대한 의무가 발생한다.