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또한 근로자대표제도가 실질적인 제도로 기능하기 위해서는 근로자대표가 체결한 합의의 효력을 명문화하는 동시에, 근로자대표와 사용자 간에 체결된 합의와 단체교섭 또는 단체협약의 관계를 어떻게 설정할 것인지에 대한 신중한 고민이 필요하다. 이와 관련해서는 근로자대표와의 관계에서 노동조합의 우위성이 보장될 수 있도록 할 필요가 있다. 법률에 의해 인정되는 근로자대표와 달리 노동조합은 헌법상 보장되는 노동3권의 주체이다. 이를 위해서는 단체교섭을 사업 또는 사업장 단위에 묶어 두고 있는 교섭창구단일화제도를 개선함으로써 초기업단위 교섭 및 협약이 체결될 수 있도록 하는 한편, 단체교섭 또는 단체협약의 대상이 되는 사항에 대하여는 근로자대표보다 노동조합의 우위를 인정하는 명시적인 규정을 마련할 필요가 있다.
근로자 대표제도가 실질적인 제도로 기능하기 위해서는 교섭창구 단일화 제도를 개선해, 초기업 단위 교섭 및 협약이 체결될 수 있도록 만들고 노동조합의 우위를 인정하는 명시적인 규정을 마련해야 한다.