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R&D투자는 당장의 가시적인 성과보다는 그 효과가 장기간에 걸쳐 누적적으로 나타나는 것이므로 불확실한 경기상황, 무역규제 등 단기적인 사업성과에 민감할 수 밖에 없는 개별 기업체의 입장에서는 대규모 투자를 결정하는 것이 쉽지 않은 상황이다. 따라서 정부가 주도하는 식품분야의 R&D는 민간 기업이 수행하기 어려운 분야를 골라, 최소한 5년~10년 정도의 장기적인 시각을 가지고 수행하는 것이 바람직하다. 이 과정에서 식품기업의 능동적인 참여를 유도하는 것이 필요하며, 기술개발에 대한 사전 수요조사와 사후 성과 평가를 엄격히 실시하는 것이 매우 중요하다.
개별 기업은 대규모 투자를 결정하는 것이 어려운 상황이므로, 장기적 관점으로 식품기업의 적극적인 참여 유도와 기술개발에 대한 조사와 사후에도 평가 실시가 중요하다.