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연구원은 설립 초기 복숭아의 맛과 향 개선, 야채주스 개발 등 과실류 분야의 소득 증진을 위한 연구개발에 매진하였다. 이후에는 양송이 가공기술 개발과 저산성 식품통조림 살균조건 규명 등의 연구를 통해 양송이 통조림 제품의 수출에 크게 기여하였다. 폴리에틸렌 필름 포장에 의한 단감 장기 저장법을 개발해 영남 지역 단감 생산 농가의 소득을 3~6억 원 증가시키는 성과를 거두었으며, 사과 양조식초 개발 연구틀 통해 양조식초 사업을 태동시키기도 하였다. 식량 절약과 식생활 개선을 위한 보리가공 연구도 주목할 만한 활동이었다. 보리의 영양가를 보존하면서 소비를 늘릴 수 있도록 보리 후레이크를 개발하여 민간기업에 전수하였고 보리를 이용한 청량음료 개발 성과를 거두었기 때문이다. 연구소는 밤 저장 및 가공 이용법을 연구해 밤초코ㆍ밤후레이크ㆍ밤당과 등 다양한 제품 개발에도 기여하였다. 특히 가공밤의 변색방지 연구결과는 특허 6886호와 7743호로 각각 등록되기도 하였다.
초기의 연구원은 과실류 분야 연구개발에 집중하였고, 이후에는 양송이 가공기술, 저산성 식품통조림 살균조건, 단감 장기 저장법, 사과 양조식초 개발 연구, 보리가공 연구, 밤 저장 및 가공 이용법 연구 등을 진행해 다양한 분야의 소득을 크게 높였다.