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일반적으로 청년을 대상으로 하는 임금보조금은 주로 기업지원 방식으로 운영되는데, 간혹 개인지원 방식으로 도입된다 하더라도 그것의 지원대상은 근로장려세제(EITC)와 같이 저소득빈곤층이 되는 경우가 많다. 반면 개인지원 방식의 청년공제는 지원대상이 저소득빈곤층이 아닌 구직자 및 재직자 청년 일반으로 지원대상이 설정되었는데, 이는 국내에서 유독 높게 나타나는 대학진학률과 이에 따른 고학력자의 실업문제, 그리고 대-중견/중소기업 간 이중적 노동시장구조와 이에 따른 중견/중소기업의 인력부족을 해결하기 위한 방안으로 청년공제가 도입되었기 때문이다.
일반적인 청년 대상 임금보조금은 기업지원으로 저소득빈곤층이 대상이며, 청년공제는 구직자 및 재직자 청년 개인지원으로 인력부족을 해결하기 위한 방안이다.