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현재 검찰과 경찰이라는 두 개의 수사기관이 수직적 상하관계로 규정되어 있기 때문에 생기는 문제들이 적지 않다. 일단 경찰이 검찰을 견제하는 역할을 전혀 하지 못한다. 예컨대 검사가 저지르는 범죄를 경찰이 수사하지 못한다. 검사도 범죄를 저지른다는 것은 상식이고 사실이다. 온 나라를 시끄럽게 했던 검사의 대형비리만 해도 부지기수다. 2010년 부산지검의 ‘스폰서 검사’ 사건, 2010년 서울중앙지검의 ‘그랜저 검사’ 사건, 박근혜 정부 초기 법무부차관이 연루된 성접대 사건, 2016년 주식을 상납 받아 120억원의 재산을 일군 것으로 드러난 진경준 전검사장 사건, 2016년 전관예우로 수백억을 벌어들인 것으로 드러난 홍만표 전검사장 사건, 박근혜 정권 권력남용과 비리의 주역 중 한 명으로 현재 수사대상에 올라 있는 우병우 전민정수석 사건 등이 좋은 예이다. 어떤 의미에서는 검사처럼 막강한 권한을 갖고 있는 사람이 저지르는 범죄가 훨씬 더 죄질이 나쁘고 사회나 피해자에게 미치는 악영향이 크다. 그러나 검사들이 관련된 부패사건은 대부분 검찰의 셀프수사에 의해 유야무야 되거나 축소·왜곡되어 사건의 전모가 잘 드러나지 않는다. 검찰은 경찰관의 비리와 부패를 단속하고 사법처리하지만, 수직적 상하관계 때문에 경찰이 검사의 비리를 수사하거나 사법처리하는 일은 일어나지 않는다. 아예 영장청구단계에서부터 검찰은 검사비리와 관련된 경찰의 영장청구를 기각하기 일쑤이다. 검찰이 다른 외부기관의 통제를 거절하면서 검사의 비리는 오로지 동료 검사에 의해서만 적발되고 수사대상이 된다. 하지만 팔은 언제나 안쪽으로 굽는다는 원칙에 따라 한 식구끼리 제대로 된 수사가 진행되는 경우는 거의 없다.
현재 검찰과 경찰이 상하관계 있기에 생기는 문제로 먼저, 경찰이 검찰 견제를 잘 하지 못한다. 검찰은 경찰관의 비리와 부패를 단속하고 사법처리하지만, 수직적 상하관계 때문에 경찰이 검사의 비리를 수사하거나 사법처리하는 일은 일어나지 않는다.  검찰이 다른 외부기관의 통제를 거절하면서 검사의 비리는 오로지 동료 검사에 의해서만 적발되고 수사대상이 되지만 수사가 제대로 진행되는 경우는 거의 없다.