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2000년대 이후 도하개발아젠다(DDA)와 FTA 체결 등 쌀을 비롯한 농산물 시장 개방이 확대되면서 aT는 해외시장 개척 활동에 더욱 매진했다. 수출 물량 확대와 수출국 다변화를 통해 개방 위기를 한국 농업의 기회로 전환하기 위해서였다. 일본, 중국 등 거점 지역의 농업무역관의 수를 확대했으며 농식품의 브랜드화 전략과 현지 마케팅도 강화해 나갔다. 그 결과 우리나라는 2004년 농림축산물 수출 20억 달러(수산물 포함 34억 달러) 돌파라는 소중한 성과를 거두었다. 김치류 수출 역시 1억 달러를 돌파했으며 채소류 수출도 1억 2,700만 달러를 기록함으로써 aT의 수출진흥 정책이 농가 소득 증대와 수급안정에도 기여했다는 평가를 받기 시작했다. 2008년 정부의 농식품 산업 육성 정책에 따라 aT는 수출의 규모화와 조직화, 품질관리에 만전을 기해 나갔다. 특히 주요 시장인 중국과 일본 시장의 성과를 높이기 위해 냉장유통체제를 확대하는 등 수출시설지원을 강화했으며 국제박람회 참가와 대규모 수출상담회, 차별화된 해외 홍보 마케팅 활동을 꾸준히 이어갔다. 이 결과 2011년 한국 농식품 수출 실적은 77억 달러를 돌파하는 신기원을 열었다. 이는 10여 년간 30억 달러 선에서 정체되어있던 수출 실적을 단기간에 혁신적으로 끌어올린 성과였다. 더불어 시장 개방 정책의 여파로 국내 농업 붕괴를 우려하던 이들에게 농식품의 해외진출이 중요한 대안이었음을 증명하는 계기이기도 했다. 2012년 이후 aT는 농식품 수출 확대를 위해 기업들의 수출 애로사항을 해결하는 데 역량을 집중해 나갔다. 중국, 일본에 편중된 시장을 확대하기 위해 무슬림 국가의 허용 인증인 할랄(Halal)을 비롯해 국가별 고품질 인증(미국 FDA, 일본 JAS, 중국 위생허가) 취득을 위한 지원 사업을 적극 추진해 나갔다. 더불어 해외 대형 유통매장의 입점, 유기농 농식품 시장 진출지원 등 마케팅 활동을 활발히 수행하였다.
2000년대 이후 농산물 시장 개방으로 AT는 해외시장 지출에 집중했고 그 결과 농림축산물 수출 20억 달러의 성과를 나타냈다. AT의 수출진흥 정책이 농가 소득 증대와 수급안정에 기여했으며 정부의 농식품 산업 육성 정책에 따라 수출의 규모화와 조직화, 품질관리에 만전을 기했다. 이에 한국 농식품 수출 실적은 77억 달러의 신기록을 세웠다. 2012년 이후 AT는 기업들의 수출 애로사항을 해소하고 편중된 시장 확대를 위해 무슬림 국가의 할랄을 비롯해 국가별 고품질 인증 취득 사업을 추진했다.