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학교에는 이러한 수준별 이동 수업으로도 대응하기 어려운 학생들이 있다. 중학교 수준의 교과내용을 이해하기 힘든 정도의 지적 능력을 지닌 학생들이 그들이다. 김 교사(수학)는 저성취 학생들을 학습부진과 학습지진으로 나누는데 수준별 수업은 학습부진 학생을 위해서는 도움이 되지만 학습지진 학생을 대응하기는 어렵다고 한다. 학습부진 학생은 그동안 학습한 양이 부족해서 성취 수준이 낮더라도 학생에게 맞는 방법과 속도로 가르치면 중학교에서 제시하는 기초 수준을 이해할 수 있다. 학습지진 학생은 유전적 요인 등에 의해 중학교 수준 중에서도 기초 수준의 내용을 이해하기 어렵고 일상의 의사소통에도 어려움이 있는 경우에 해당한다. 앞에서 학업성취 수준이 낮은 사례로 살펴본 학생들 중에 덕원과 용수는 김 교사가 보기에 학습부진인지 지진인지 판단하기 어려운 경계선에 있고 승현은 학습지진에 속한다. 학습부진의 경우에는 일정 수준의 지적 호기심도 있고 현재 낮은 수준이더라도 학습동기를 끌어올릴 수 있도록 애쓸 수 있으나 경계선에 있거나 학습지진의 경우는 수준별 수업만으로는 대응이 어렵고 더 전문적인 대응이 필요하다고 본다.
학습부진 학생은 학생에게 적합한 방법으로 가르치면 중학교 수준의 학습이 가능하다. 그러나 학습지진 학생은 중학교 기초 수준의 내용 파악이 힘들며 일상에서의 의사소통에 곤란함이 있는 경우이기에 보다 더 상세한 대응책이 요구된다. 