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그러나 「클라우드 컴퓨팅법」 의 취지로 볼 때, 시행과정에서 법제 간 주관기관 간 조정의 필요성이 제기될 수 있다. 첫째, 관련부처 간 추진 방향의 상충이다. GIDC 주관기관인 행정자치부는 정보보안의 이유로 프라이빗 클라우드를 추진하고자 하는 반면, 「클라우드 컴퓨팅법」 소관 기관인 미래창조과학부는 산업 육성과 고용 창출 차원에서 공공기관의 민간클라우드 활용(제20조)을 적극 추진할 가능성이 매우 높아 보인다. 민간 서비스 활용이 산업 육성 차원에서 불가피하다 하더라도, MS, 구글, 아마존, IBM 등 글로벌 기업의 국내 클라우드 산업 진입을 적절히 차단할 수 있는 정치가 마련되지 않는 한 본래의 취지는 손상을 입을 것이다.
'클라우드 컴퓨팅법' 시행과정중 부처간 추진방항이 상충 조정이 필요하며, ,민간서비스활용이 산업육성에 불가피해도 글로벌기업의 국내 클라우드산업 진입을  차단할 장치가 마련되어야 할것이다.