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이러한 노력에 더하여 WMD 및 관련 물자의 해상운송 자체를 불법화시키기 위한 차원에서 2005년 10월 14일 SUA 협약의 개정 의정서를 채택하였다. 2011년 10월 현재 12개국이 비준하였으며, 2010년 7월 28일 정식으로 발효되었다. SUA 협약은 원래 해상테러행위를 억제하기 위한 반테러 성격의 협약(1988년 SUA)이었으나 개정을 통해 ‘WMD 비확산 협약’으로 그 성격이 변경되었다고 볼 수 있다. 동 개정 협약은 해상에서 국제법상 금지된 WMD 및 관련 물자의 운송을 불법화한 최초의 조약으로서 불법운송에 대한 관련자 처벌, 승선, 검색 권한을 규정하고 있어서, PSI의 해상차단을 한 차원 강화한 것으로 평가받고 있다. 동 협약에 따르면 의심 선박에 대하여 협약당사국이 사전에 승선 및 검색 승인을 선박국적국에 요청해야 하며, 선박국적국은 해당 요청을 수락, 거부, 공동검색 또는 자체검색 등 4가지 조치 중에서 택일하는 조치를 취해야 한다. 그럼에도 동 협약은 공해나 배타적 경제수역과 같은 수역에서 협약당사국의 승선검색을 규정하고 있어, ‘공해 항행자유의 원칙’이나 ‘공해에서의 선박관할권 행사의 선적국주의’와 같은 전통 국제법 질서에 대한 중대한 예외로서의 쟁점이 부각되고 있다.
WMD와 관련 물자의 해상운송을 막기 위해 2005년 SUA 협약을 체결했다. 협약에 의해, 의심 선박은 협약당사국이 사전에 검색 승인을 받아야 하고, 4가지 조치 중 하나를 취해야 한다. 그럼에도 본 협약은 공해같은 수역에서의 승선검색을 규정하여, 전통 국제법 질서에 대한 큰 예외로서 쟁점이 되고 있다.