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Q방법론을 통한 연구는 다음과 같은 절차에 의해 수행된다. 우선 피험자들을대상으로 수행하는 설문 문항인 Q표본(Q진술문)을 구성한다. 다음으로 설문의 대상자인 P표본을 선정한다. 모수 추정에 기반한 R방법론과는 다르게 Q방법론에서의 P표본의 수는 특별한 제한을 받지 않지만, 보편적 사고를 전제로 연구 목적에 충분히 관련되어 있는 사람을 선정해야 한다. 또한, Q분류의 방법을 결정하는 데, 진술문의 수에 따라 적절한 Q분류의 형태와 점수 배분을 결정한다(조경훈, 2017). 이후 Q진술문을 P표본에게 부여하여 각각의 진술문에 점수를 부여 하게 끔 하고, 점수가 부여된 자료를 수집･종합 후 상관 관계 분석, 요인 분석 등의 계량적 방법을 적용하여 인간 내면의 주관적 속성에 따른 현상을 체계적이고 엄밀하게 분석한다.
Q방법론의 연구 수행 절차는 설문에 사용될 Q진술문을 작성, 설문에 참여할 P표본을 선정, 진술문 수에 따른 Q분류 방법 결정, 설문 실시, 계량적 방법을 통한 설문 자료 분석으로 이어진다.