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현재의 표시과목별 기본이수과목 중에는 과목 간의 배타성과 포괄성, 전공 학문 내에서의 중요도, 학계에서 일반적으로 사용하는 용어 등 여러 관점에서 볼 때 개선이 필요한 것으로 지적되고 있다. 기본이수과목은 대학에서의 교육과정 운영, 그에 따른 대학에서의 교수 채용에 중요한 영향을 미치기 때문에 기본이수과목 결정에 특정 교수나 학과의 영향력이 편파적으로 개입할 가능성을 배제할 수 없다. 이 때문에 표시과목별 기본이수과목을 개정할 때에는 다양한 의견을 수렴하되 관련 학회의 종합된 의견을 우선적으로 반영하는 절차를 마련하는 것이 필요하다.
표시과목별 기본이수과목의 개선은 영향력이 개입될 가능성이 존재하기 때문에, 여러 의견을 모으되 관련 학회의 의견을 우선 반영하는 절차가 마련되어야 한다.