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중소기업에 여성 근로자에 대한 의존도가 계속 증가함에 반해, 여성 근로자에 대한 기업 내 차별 역시 증가하고 있다. 우리나라 노동시장의 이중구조화가 더욱 심화되고 있으며 여성 근로자가 주로 노동시장의 주변근로자로 이차노동시장에 종사하고 있다는 사실은 중소기업 종사 여성 근로자에 대한 기업 내 차별 및 인권침해와 관련된 쟁점이 폭넓게 형성되어 있다는 사실로부터도 간접적으로 알 수 있다. 기업 내 여성인권과 관련된 최근 연구자료를 분석해보면, 기업 내 여성에 대한 차별적 대우 및 인권침해와 관련된 쟁점은 크게 3가지 정도로 정리된다. 특히 중소기업의 경우에 이러한 쟁점이 크게 부각되고 있다. 기업 내 여성에 대한 차별 및 인권과 관련된 쟁점을 구체적으로 살펴보면, ① 고용형태 상의 차별, ② 임금 및 근로조건 상의 차별, ③ 경력단절 등으로 구분해 볼 수 있다.
기업에 여성 노동자의 인권침해와 차별은 갈수록 늘어나고 있다. 이는 고용형태의 차별, 급여 및  근무조건의 차별, 경력의 절단으로 나누어 볼 수 있다.