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먼저 보호의무자에 의한 입원이나 지방자치단체장에 의한 입원절차에 따라 정신질환자를 입원 등을 시키고 있는 정신의료기관등의 장은 입원 등을 시킨 즉시 입원 등을 한 사람에게 입원 등의 사유 및 제46 조에 따른 입원적합성심사위원회에 의하여 입원적합성심사를 받을 수 있다는 사실을 구두 및 서면으로 알리고, 입원 등을 한 사람의 대면조사 신청 의사를 구두 및 서면으로 확인하여야 한다(동법 제45조 제1 항). 그리고 입원 등을 한 날부터 3일 이내에 입원적합성심사위원회에 입원 등을 한 사람의 인적사항, 입 원일자, 진단명, 입원 필요성, 대면조사 신청 여부 및 그 밖에 대통령령으로 정하는 사항을 신고하여야 한다(제2항). 입원적합성심사위원회의 위원장은 입원 등을 입원심사소위원회에 회부하여야 하고, 입원 등을 한 사람이 피후견인인 경우에는 관할 가정법원에 입원 사실 등을 통지하여야 한다(동법 제47조 제1 항). 입원심사소위원회는 회부된 입원 등의 적합 또는 부적합 여부를 심사하여 그 심사 결과를 입원적합 성심사위원회의 위원장에게 보고하고(제2항), 입원적합성심사위원회의 위원장은 최초로 입원 등을 한 날부터 1개월 이내에 정신의료기관등의 장에게 입원 등의 적합 또는 부적합 여부를 서면으로 통지하여야 한다(제3항). 정신의료기관등의 장은 입원 등의 부적합 통지를 받은 경우에는 해당 입원 등을 한 사람을 지체 없이 퇴원 등을 시켜야 한다(제4항). 입원적합성심사위원회의 위원장은 입원심사소위원회에 회부하기 전에 입원 등을 한 사람이 대면조사를 신청하거나 입원 등의 적합성이 의심되는 등 대통령령으로 정하는 사유가 있는 경우에는 직권으로 그 국립정신병원 등의 소속 직원(조사원)에게 해당 정신의료기관등을 출입하여 입원 등을 한 사람을 직접 면담하고 입원 등의 적합성, 퇴원 등의 필요성 여부를 조사하게 할 수 있다(제48조 제1항).
동법 제 45조, 47조, 48조에 따라 정신의료기관등의 장은 입원 등을 시킨 즉시 입원 등을 한 사람에게 사유와 입원적합성심사를 가능성을 알리고, 의사를 확인하여야 한다. 입원적합성심사위원회의 위원장은 입원심사소위원회에 회부하여 받은 심사 결과를 서면 통지해야 한다. 부적합 통지를 받은 경우에는 지체 없이 퇴원 등을 시켜야 한다. 입원적합성심사위원회의 위원장은 국립정신병원 등의 소속 직원에게 입원 등을 한 사람을 면담하고 적합성 여부를 조사하게 할 수 있다.