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과정단계의 영향요인은 제도 내적 요인으로서 비용분석의 범위와 방법, 표준화된 측정방식 등이 있는데, 현재 직접비용과 직접편익만을 대상으로 비용상쇄가 이루어질 경우 기업과 소상공인의 실질적인 규제부담을 완화하는데에는 일정한 한계가 있을 것으로 분석되었다. 금융분야 규제사례 등에서 나타나듯이 피규제자에게 가장 큰 부담요인이 무엇인지를 조사하여 비용분석의 범위와 내용에 대한 합리적 조정을 통해 규제비용관리제의 효과성을 제고할 수 있을 것으로 판단된다. 한편 경직적으로 제시되어 있는 비용분석의 내용과 표준화된 측정방식도 담당 공무원의 혼란을 가중시킴에 따라 효과성 저해요인으로 분석되었다.
금융분야 규제사례에서 보듯 피규제자의 가장 큰 부담요인을 조사하여 비용분석의 범위와 내용에 대한 합리적 조정으로 규제비용관리제의 효과성을 높일 수 있을 것이다.