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실제 역대 총리 중 김대중 대통령과 연합정권을 구축했기 때문에 정치적 지분을 가지고 있었던 김종필 총리, 분권형 국정운영시스템 구축하면서 자신의 권한을 스스로 제한한 노무현 대통령으로 인해 ‘실세 총리’라고 불렸던 이해찬 총리를 제외하고는 실질적인 행정각부 통할권을 행사한 국무총리는 없었다. 김종필 총리가 실질적인 행정각부 통할권을 행사할 수 있었던 것은 대통령 선거 전 소위 ‘DJP 연합’ 및 합의 내용이 선거 후에도 이어졌기 때문이다. 또한 이해찬 총리의 경우도 대통령이 국무총리와의 역할분담 원칙을 지키려 했기 때문이다. 우리나라 헌정사에서 예외적으로 국무총리의 행정각부 통할권이 실제로 행사될 수 있었던 것은 헌법규정 때문이 아니라 대통령과 국무총리의 정치적 합의 또는 대통령의 국무총리제 변화 의지에 의한 것이었다.
몇몇을 제외하고 역대 총리등 중 실질적 권한을 행사한 국무총리는 없었는데, 김종필 총리와 이해찬 총리가 통할권을 행사할 수 있던 것은 헌법규정때문이 아니라 대통령과의 정치적 합의 또는 대통령의 의지에 의한 것이었다.