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한편, 원자력을 안전하게 이용하기 위해서는 무엇보다 안전규제의 독립이 요구되고, 국제원자력기구(IAEA)의 기본안전원칙 및 ｢원자력안전에 관한 협약｣ 등에서도 원자력안전기관은 그 책임을 다하기 위해서 원자력진흥조직이나 기구와 효과적으로 독립되어야 한다고 규정하고 있으며, 이에 따라 원안위법 제정이유에서는 원안위의 설치 목적으로서 “원자력의 안전규제체제와 원자력이용 및 진흥체제를 효과적으로 분리함으로써 국제규범을 이행함은 물론, 원자력 안전규제의 독립성을 확보하여 원자력의 생산과 이용에 따른 방사선재해로부터 국민을 보호하고 공공의 안전과 환경보전에 이바지하기 위함”임을 제시하고 있다.
원자력을 안정적으로 활용하기 위해서는 안전규제의 독립이 우선되어야 하는데, 원자력 관련 협약에서 원자력 안전기관은 책임을 다하기 위해 효과적인 독립 규정을 명시해 두고 있다.