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2008년 이후에는 남북한이 정치⋅군사 문제로 갈등을 겪으면서 자연히 농업분야의 교류협력도 활발하지 못하게 되었다. 현재 대부분의 남북협력이 중단된 상황이다. 이 같은 상황 가운데 농업분야의 논의는 정부의 대북 정책에 대한 실효성 논쟁으로 이어졌다. 그러나 뚜렷한 해답을 찾지 못한 채 과거 남북협력에 대한 회고와 반성을 주제로 다양한 논의가 있었으나 이념적 갈등만 증폭되었다. 북한 연구자들은 남북한 사이의 정치.군사적인 관계를 떠나 대북 인도적 지원은 계속될 필요가 있다는 점에 대해서는 서로 공감하였다. 농업개발협력에 대해서도 지속돼야 한다는 의견이 우세 하였으나 천안함 사건에 대한 북한의 태도 변화가 없는 상황에서 일방적으로 지원을 하는 것은 문제가 있다는 점도 지적하였다. 학자들의 대체적인 논의방향은 향후 남북관계가 개선될 것에 대비하여 바람직한 농업분야 협력방향을 찾는 연구가 많았다(권태진[2008a; 2008b; 2009a; 2009b]; 권태 진 외[2008; 2009b; 2010; 2012a; 2012b]; 김수암[2009]; 김영훈 외 [2009a; 2009b; 2012a; 2013b]; 석현덕[2014]; 제성호[2009]; 한국농촌경제연구원[2012]).
'08년 이후 남북한은 농업분야의 교류가 줄어 현재 대부분 중단된 상태로 이에 대한 논의는 실효성 논쟁으로 이어졌으나 이념적 갈등만 부각됐다. 대북 인도적지원 필요성은 북한연구자들과 공감대를 형성했으나 천안함 사건의 태도 변화 없는 상황에서 일방적 지원은 문제가 있다. 학자들은 대부분 향후 개선시에 대비한 협력방향을 찾는다.