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시·도와 시·군·구 특수보육시책은 중앙정부 보육사업과의 연계가 미흡하여 전국적으로 그 성과를 기대하기 어렵다고 판단되므로, 중앙정부가 수립한 핵심 또는 중점사업의 경우는 지방정부 예산에 적극적으로 반영하도록 유도하고, 그 실적에 따른 재정지원 등 인센티브를 부여한다. 중앙과 지방정부간의 연계가 미흡한 대표적인 예로는 국공립어린이집 확충과 육아종합지원센터 확대부문을 들 수 있다. 이들 사업은 ‘제2차 중장기보육 기본계획’에 명시되나, 어린이집 확충과 육아종합지원센터 제공 부문의 지방비는 각각 33,446백원, 3,900백원에 불과하더. 또한 시·도 사업비 중 국공립어린이집 확충에 예산을 배정한 지역은 서울과 대구, 경기 지역에 한정된다. 이는 중앙정부가 지방정부의 국공립어린이집 확충을 유도한다고 밝힌 바 있음에도 불구하고, 구체적인 추진 전략이 미흡하여 그 성과를 기대하기 어려움을 말해준다. 그러므로 중앙정부의 보육정책 기조에 따라 우선순위가 높거나 핵심 과제로 설정한 사업은 시·도 특수보육시책에 반영되도록 하고, 그 실적을 관리하는 체계를 구축하여 실질적인 성과를 이룰 수 있도록 한다.
중앙정부의 보육정책 목표가 지방정부의 특수보육시책에 반영될 수 있도록 구체적인 추진전략을 마련해야 한다. 예를 들어, 지방정부가 중앙정부의 중점사업에 대해 핵심과제로 선정하여 예산에 반영하는 것을 실적으로 평가하여 재정지원 등의 인센티브를 부여하는 방법이 있다.