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그러나 정부의 노력에도 불구하고 제도의 정착과 내실화를 기하기 위한 실질적인 지원 노력 및 산업안전보건에 대한 국민의 인식수준 제고, 참여확대에는 한계를 노정하였다.(노동부 2010:15) 특히, 산업계, 지역, 민간의 참여기회가 부족하고, 노동부･안전공단 위주의 사업추진은 재해예방 수혜사업장 확대 제한 및 다양한 사업전개에 있어 한계로 지적되었다(노동부 2010:4). 또한 재정･기술지원, 교육, 지도･점검 등 산재예방 사업이 체계적으로 연계되어 추진되지 못하여 시너지 효과가 미흡하고, 사업효율성도 떨어지게 되었다(노동부 2010:4).
정부는 제도 정착을 위한 여러 노력을 여러 방향으로 실시하였음에도 민간 참여의 부족 ,사업장 확대 제한, 미흡한 산재예방사업 추진 등 여러 문제를 갖고 있다.