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본 연구에서 검토한 37편 중 종단 연구는 10편에 그쳤으며 단면 연구가 26편, 사례대조군 연구가 1편이었다. 단면 연구에서는 고용형태와 건강 사이의 연관성에서 시간적 선후관계를 파악하기 어렵기 때문에, 비정규직 고용형태가 건강을 악화시키는 것이 아니라 건강이 안 좋은 사람이 더 열악한 고용형태에 처할 수 있다는 역인과관계(reverse causation)의 가능성을 배제할 수 없다. 일부 단면 연구에서 역인과관계의 가능성과 단면데이터로 인한 건강한 노동자 효과(healthy worker effect)를 우려하고 있었다. 단면 연구에는 한국복지패널과 한국노동패널 자료 등 종단 데이터에서 단면 자료를 추출하여 분석한 논문도 3편 있었다. 이들 중 1편은 단면연구를 진행한 이유로 주요변수(사회적 지지) 문항이 1차년도에만 조사되었기 때문이라고 밝혔으나, 나머지 2편은 종단 데이터를 활용하여 단면 연구를 설계한 근거에 대해 구체적으로 설명하지 않고 있었다. 향후 진행되는 비정규직 고용과 건강 연구는 단면연구의 한계를 보완할 수 있는 종단 연구가 더 많이 시도되어야 하며, 종단연구의 설계 시 데이터의 한계를 보완하고 장점을 살릴 수 있는 연구설계가 고려되어야 한다.
단면 연구에서는 비정규직 고용형태의 연인과관계 가능성을 배재할 수 없다. 일부 연구에서는 건강한 노동자 효과를 우려하고 있었다. 향후 연구는 종단 연구가 더 많이 시도되어야 하며, 설계 시 한계를 보완하고 장점을 살릴 수 있는 연구설계가 고려되어야 한다.