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혁신도시의 입지특성을 토대로 기존도시(대도시, 중소도시, 도심)뿐만 아니라 기업도시, 경제자유구역, 산업단지 등과 연계 협력을 토대로 광역권 내 발전거점으로서 역량을 강화할 필요가 있다. 예를 들어, 부산, 대구, 울산 혁신도시(대도시 입지형)는 자생적 발전역량이 상대적으로 높은 지역으로 도심재생(부산: 구도심 재생, 울산: 구도심 재생, 대구: 첨단의료복합단지) 등 기존 개발계획과 혁신도시를 연계하여 시너지 효과를 창출할 수 있다. 자립적 발전 역량이 상대적으로 부족한 김천, 전주·완주, 원주, 진주, 서귀포 등 중소도시 입지형 혁신도시는 인근 도시와 기능특화 및 연계협력(김천: 구미산단과 연계, 전주·완주: 익산·군산·새만금과 연계, 원주: 기업도시와 연계, 진주: 사천항공산업단지와 연계, 서귀포: 관광·휴양단지와 연계)을 효과적으로 추진한다면 부족한 발전역량의 확충에 큰 도움이 될 것이다. 중소도시 간 연계·협력을 통해 지역의 발전역량과 경쟁력을 강화한 대표적 해외 사례로 네덜란드의 란스타드 지역을 들 수 있는데, 이 지역은 암스테르담(금융기능), 로테르담(항만기능), 헤이그(국제정치기능), 유트레히트(R&D기능) 4개 도시가 기능특화와 연계를 통해 국제적인 경쟁력을 확보한 것으로 평가받고 있다.
혁신도시의 입지특성을 토대로 기존도시 뿐만 아니라 기업도시, 산업단지 등과 연계 협력을 토대로 광역권 내 발전거점으로서 역량을 강화할 필요가 있다. 예를 들어, 자립적 발전 역량이 부족한 중소도시 입지형 혁신도시는 인근 도시와 기능특화 및 연계협력을 효과적으로 추진한다면 부족한 발전역량의 확충에 큰 도움이 될 것이다.