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지방자치단체는 넓은 의미의 국가행정의 일부로서 국민의 기본적 인권을 보호·증진할 국가의 의무를 분담하고 있다. 지방자치단체는 국민들과 더 가까운 곳에서 직접 접촉하고 직접 서비스를 담당하고 있다는 점에서 인권행정은 더욱 중요한 의미를 가지고 있다. 실제로 지방 자치단체는 사회복지, 보건, 교육, 주택, 식수, 치안, 세금 등 시민들의 생활과 밀접한 연관이 있는 서비스를 담당하고 있다. ‘인권행정’은 인권담당부서만의 과제가 아니라, 국민의 삶에 영향을 미치는 모든 행정부서에 적용되는 것이며, 어느 특정 행정행위에 적용되는 것이 아니라 행정의 전 단계에 걸쳐 적용되는 것이다. 인권행정을 하는 이유는 크게 두 가지로 설명할 수 있다. 먼저 행정의 정당성을 확보하기 위해서이다. 행정이 인권보호·보장에 근거할 때 행정의 정당성과 합법성을 확보할 수 있다는 것이다. 두 번째로는 행정의 효율성을 위해서이다. 인권을 염두에 두지 않고 추진되는 모든 행정은 결국 사후 분쟁(민원 제기, 인권위 진정, 법원 쟁송 등)으로 귀결되는데, 사후 분쟁화될 경우 그것을 수습하기 위한 행정자원의 낭비가 오히려 커질 수 있다. 사전에 인권을 충분히 고려하여 분쟁을 막는 것은 행정의 효율성 확보를 위해서도 중요하다.
지방자치단체는 국가행정의 일부로 인권보호/증진의 의무가 있으며, 국민들과 직접 접촉하기에 인권행정이 모든 부서와 행정에서 필수이다. 이는 인권을 보호하고 증진하여 행정의 정당성과 효율성을 확보하기 위한 것이다.