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그러나, 무엇보다 조닝의 운영에 있어 건축국의 역할이 매우 중요하다. 건축국은 조닝과 건축법(Building Code) 준수여부를 확인하여 건축허가라는 행정행위를 통해 조닝을 집행(enforcement)하는 역할을 수행하게 되며, 조닝 위반 시 이에 대한 시정을 명령할 수 있고 ‘환경규제위원회(Environmental Control Board)’와 ‘법률국(LawDepartment)’과 함께 법원에 기소할 수 있는 권한도 가지고 있다. 특히, 신축되는 건물이 조닝 규정을 그대로 준수하고 있다면 ‘권리적 개발(as-of-right)'로서 도시계획위원회를 거치지 않고 건축국에서 바로 건축허가가 발급된다.
건축국은 조닝 운영에서 주요한 역할을 담당하는데, 건축허가라는 행정행위로써 조닝을 집행하며, 조닝 위반 시 시정 명령, 법원 기소가 가능하다.