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타 제도와의 중복성 측면에서 살펴보면, 대기업이 본 기금에 출연하는 경우 본 조세특례 제도 외에도 여러 가지 조세혜택을 중복적으로 받게 된다. 법인세법 제24조에 따른 지정기부금 인정 및 조세특례제한법 제100조의32에 따른 투자상생협력 촉진을 위한 과세특례가 그것이다. 과세표준에 따라 다르지만, 한계 법인세율 25%를 적용받는 기업의 경우, 최대 95%까지 법인세 감면이 이론적으로 가능하다. 물론 최저한 세 적용 등으로 인해 실제 조세감면의 수준은 이보다 낮을 것으로 보이나, 기업들이 법인세 감면을 최대한 받을 수 있는 규모의 금액만을 출연한다면 불가능한 것은 아니며, 이에 대한 제도개선도 필요하다고 판단된다.
대기업이 본 기금에 출연하는 경우 받는 조세특례의 실제 감면 수준은 이론보다 낮으나 최대 법인세 감면 금액만을 출연하는것도 가능할 것이며 이에 대한 제도개선도 필요하다.