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국가인재DB 3차 고도화 사업은 정부 조직의 변화와 제도 정비에 따라 기존 시스템의 한계점을 보완하기 위해 2016년에 추진되었다. 이 시기에는 국가인재DB 국민추천제 등 신규 업무가 추가됨에 따라 시스템의 최적화가 필요했고, 사용자의 요구에 맞는 인물정보를 제공하여 맞춤형 인재 추천을 지원해야 했다. 기존의 단순 정보제공으로는 개방형 직위, 현장전문가 및 여성인재 발굴 등 분야별 인재 발굴에 한계가 있었기 때문이다. 그밖에도 기존장비 노후화 및 새로운 IT 환경에 발맞춰 국가인재DB 역시 선제적인 대응이 필요했다. 특히 웹 표준 준수, 외부 사용자의 불편사항 개선 등 내·외부 홈페이지를 사용자 중심으로 변환할 필요가 있었다.
2016년 추진된 국가인재DB 3차 고도화 작업은 맞춤형 인재 추천을 지원하는 등 정부조직의 변화와 제도 정비에 따라 국가인재DB를 대응하는 차원의 변화였다.