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통계별로 전체 자영업체 수가 상당히 다르다. 이는 조사대상의 차이에 주로 연유하는 것으로 보인다. 국세통계에서는 해당 기간 중에 사업체 ‘등록’이 된 적이 있는 모든 사업체가 대상이다. 경제활동인구조사와 전국 사업체조사는 사업체 등록여부와 상관없이 조사하지만, 조사시점에 사업을 영위하는 사업체만 조사대상이다. 전국사업체조사에서는 노점이 조사대상에서 제외된다. 등록된 사업체만을 대상으로 하면 국세통계에 집계되는 사업체 수가 가장 많고, 그 다음이 경제활동인구조사이며, 전국사업체조사로 계산한 사업체 수가 가장 적을 것으로 예상된다. 국세통계가 경제활동인구조사보다 많은 이유는 부업으로 활동하는 자영업은 경제활동인구조사에 집계되지 않으며, 한 사람이 여러 사업체를 운영할 경우 경제활동인구조사에는 한 번만 집계되기 때문이다. 이론적으로 경제활동인구조사와 전국사업체조사의 차이는 노점의 포함 여부인데, 경제활동인구조사에서 노점을 제외하더라도 전국사업체조사보다 훨씬 많다.
국세통계는 해당 기간 사업체 등록을 한 자 대상으로 통계를 내고, 경제활동인구조사와 전국 사업체조사는 사업을 진행하고 있는 자 대상으로 통계를 낸다. 하지만 전국 사업체조사는 노점을 제외한다. 대상자가 국세통계 경제활동인구조사 전국 사업체 조사 순으로 많다.