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공식적으로 컨설팅 감사가 적용되었던 사례는 2007년 정부합동감사의 경우이다. 이때에는 지방세에 대한 컨설팅 감사에 의하여 4000억 원의 묻혀진 지방세를 찾아냈다고 하는 결과보고를 한 바 있다(행정안전부 정부합동감사 결과보고서, 2007). 그 당시 감사대상이 아닌 경남도를 비롯한 5개 광역시․도(경남․전남․광주․대구․강원)가 자발적으로 컨설팅 감사를 요청하여 시행하기도 하였다. 당시 지방세 컨설팅 감사는 공평과세의 비전과 함께 탈루·은닉세원 발굴과 과세자료 정비, 납세의무자 권익 보호에 그 목적을 두고 전산분석기법 매뉴얼에 따라 지방자치단체에 대하여 전산분석자료 등을 제공하고, 피감사기관에서는 이를 확인․조사하는 쌍방향적, 상호협력형 감사방식을 시도한 사례였다.
2007년 정부합동감사는 지방세에 대한 컨설팅 감사가 지방자치단체에 대한 전산분석 자료를 제공하면 피감사기관에서 이를 확인하고 조사하는 쌍방향적, 상호협력적 감사방식을 시도한 첫 사례이다.