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마지막으로 제시할 수 있는 것이 평등의 원칙이다. 간략하게 말하면 “같은 것은 같게, 다른 것은 다르게”라는 문구로 정리될 수 있지만 실질적으로 평등 원칙은 가장 활용하기 어려운 판단 도구라고 할 수 있다. 헌법재판과정에서는 이러한 평등 원칙을 주로 자의금지 판단과 합리성 판단 등으로 세분화하여 운영하고 있는 것도 엄격한 평등 원칙을 모든 사안에 적용하는 것은 어려운 문제이기 때문이다. 하지만 앞서 언급한 바와 같이 인권영향평가를 통해 가장 핵심적으로 고려해야 하는 대상이 민주적 대표 과정에서 소외되기 쉬운 소수자라는 점에서 평등 원칙은 인권영향평가의 중요한 판단도구로 구성해야 할 것이다.
헌법재판과정에서 평등 원칙은 각각의 사안에 적용하기 어려운 원칙이다. 그러나 인권영향평가는 소수자를 핵심적으로 고려해야 하므로 오히려 평등 원칙이 중요한 판단도구이다.