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공공기관을 공기업, 준정부기관 기타 공공기관으로 나누어 4년간(2013-2016)의 추이를 살펴보면 고졸 채용인원과 비율은 2013년에 17,483명 중 2,064명(11.8%), 2014년에 17,744명 중 1,787명(10.1%), 2015년에 19,161명 중 1,774명(9.3%) 그리고 2016년에는 21,016명 중 1,946명(9.3%)으로 나타났다<표 6 참조>. 공공기관의 고졸 채용 현황도 공공부문과 마찬가지로 전년대비 전체 채용인원은 늘어나고 있으나 고졸 채용 비율은 현저히 줄고 있다. 공공기관 고졸 채용의 인원 및 비율을 늘리기 위해서 직종별 고졸 적합직무 발굴 및 직업계고 전형 신설유도가 필요하며, 공공기관의 청년고용 의무화를 실시하고 이에 따른 고졸 고용 최소 비율을 20% 수준으로 준수할 필요가 있다. 또한 관계부처는 유관기관 및 산하 기관이 고졸 적합 의무를 발굴하여 고졸 채용을 확대하도록 권고하고 경영평가 항목에 반영할 필요가 있겠다.
공공기관의 고졸채용인원 비율을 살펴보면 전체 채용인원은 늘었지만, 고졸 채용 비율은 현저히 줄고 있다. 고졸 채용 비율을 높이기 위해서는 새로운 전형이 필요하고, 고졸 고용 비율 의무화를 시행하고, 경영평가에 반영할 필요가 있다.