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연구개발 측면에서는 기초과학 및 혁신기술 역량 저하, R&D 과제 중복 및 수주경쟁, 경직된 관리, 실패에 대한 두려움으로 혁신적 연구개발 부족을 우리나라 R&D의 핵심 문제로 인식하고 진단하고 있었다. 이러한 문제인식 아래, 여러 제도개선을 통한 국가 R&D 효율화 정책을 제시하였다. 먼저, 융합혁신 컨트롤 타워로서 ‘혁신부총리’를 임명하여, 정부연구개발 및 산업진흥의 방향성을 정립하고 부처간 업무 중복성을 조정코자 하였다. 또한 정부 R&D 구조조정을 통해 자율적이고 도전적인 연구환경 조성을 공약했다. 이 밖에도, PBS 제도개선, 공공연구 효율성 제고, 연구원 역량 제고를 공약했다. 나아가 산업기술개발은 민간이, 중장기 기초원천기술개발은 정부가 주도해야 한다고 강조하였다
연구개발 측면의 문제점을 인식하고 있으며, 제도를 개선하고 컨트롤타워를 마련하는등 보다 나은 환경 조성을 공약했다. 또한 중장기 원천기술 개발에 대한 정부 주도 필요성을 강조했다.