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또한 학교밖 지원센터, 청소년 상담 센터와 같은 타기관, 법원, 법무부, 보호관찰소, 보건복지부, 여성가족부, 지자체, 경찰 등 관련 기관과의 협조에 대한 인식도 조사되었다. 나열된 기관 중에서 가장 협조가 잘된다고 긍정적으로 응답한 기관은 법원(4.44)으로 88.9%가 그렇다고 응답한 반면 0.7%만이 그렇지 않다고 응답하였다. 이는 보호하는 소년사범들이 법원을 통해 배치되고 있으며, 판사나 법원 관계자가 정기적으로 시설을 방문하는 관례를 고려한다면 가장 협조가 잘되는 기관으로 긍정적으로 인식하 고 있음을 알 수 있다. 다음으로는 보호관찰소(4.36)으로 88.2%가 그렇다고 답변했다.이는 소년보호 처분에서 4.6호, 5.6호 병합처분이 이루어지므로, 시설에서 보호하는 소년사범이 보호관찰을 함께 받는 경우가 많음에 따라 보호관찰소와의 협력이 빈번하게 일어나는 결과라고 할 수 있겠다. 이외에 ‘학교밖 지원센터나 청소년 상담센터와 의 협력’(4.11), 6호 시설에 대한 예산을 배정해주는 지자체와는 3.93, 아동보호치료시 설을 관할하는 보건복지부와는 3.81, 법무부와는 3.77, 경찰과는 3.76 이었다. 가장 협조가 낮은 부서는 여성가족부로 3.19였으며, 대상자의 20%가 협조가 잘되지 않는다고 응답하였다
소년보호 사범들과 관련기관과의 협조에 대한 인식도에서 가장 협조가 잘되는 기관은 법원이고 다음으로 보호관찰소라 답하였으며,  이외에 '학교밖 지원센타나 청소년 상담센타와의 협력' 예산을 배정해주는 지자체로는 보건복지부, 법무부, 경찰이었으며 가장 협조가 안되는곳이 여성가족부였다.