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둘째, 중소도시 및 읍면지역의 방과 후 학교 프로그램과 가정학습 보완 프로그램을 지원한다. 중소도시 및 읍면지역은 방과 후 학교를 활성화하려고 해도 적합한 강사를 구하기도 어렵고 양질의 프로그램을 시도하기도 어려운 실정이다. 방과 후 학교의 비 과외 학습활동이 학력 향상에 의미 있는 영향을 미치고 있다는 연구 결과에 비추어보면, 이와 같은 요소들이 대도시와 농산어촌 간의 성취 향상에서의 차이를 만들어내는 주요 요인으로 작용하고 있을 가능성이 크다. 이와 같은 학력 격차를 해소할 수 있기 위해서는 한편으로는 정부 차원에서 농산어촌 학교의 방과 후 학교 운영을 직접적으로 지원하는 시스템을 갖추고, 다른 한편으로는 민간 방과 후 학교 프로그램이 농산어촌 학교에 참여할 수 있도록 지역의 교육지원청을 중심으로 공동 운영하는 방안을 모색해 볼 수 있을 것이다. 또한 중소도시 및 읍면지역의 학생들이 대도시 학생에 비해 학습에 어려움을 겪는 이유는 학교 과제 수행, 학습 진척 상황 확인, 학습준비물 지원, 학습문제의 상담 등과 같은 가정에서의 교육지원 기능이 부족하기 때문일 수 있다. 따라서 학교를 포함한 지역 기관의 자원을 활용하여 이러한 학습 지원 기능을 보완해줄 수 있도록 한다.
대도시와 농산어촌 간의 학력격차를 줄이기 위해서는 구인난 등으로 양질의 프로그램을 시도하기 어려운 상황에 처한 농산어촌 지역의 방과 후 학교를 지원해야한다. 이를 위해서는 정부차원의 방과 후 학교 직접지원과 지역 교육청 중심으로 민간 프로그램 참여와 해당 지역 가정의 교육지원 기능에 대한 보완이 필요하다.