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정부의 재정지원이 대부분 평가를 통해 이루어지고 있으나, 평가 지표를 둘러싼 비판이 거세게 일고 있다는 점에서 평가 체제를 개선해야 할 것이다. 재정지원사업에서 가장 공통적으로 활용되는 지표들은 취업률, 전임교원 확보율, 장학금 지급률, 학생충원율, 교육비 환원률 등이다. 이러한 지표들은 정부 재정지원의 수혜자격을 결정하는 선정평가에 활용되는 지표이자 해당 재정지원 사업 수혜 이후에 나타내는 성과를 대표하는 지표이기도 하다. 그러나 이러한 지표들이 대학의 전반적인 운영을 대표할 수는 있지만 대학이 궁극적으로 창의 인재를 얼마만큼 육성했으며 그것을 위하여 얼마만큼 노력했는지 확인하기에는 미흡한 실정이다.
배타성이 계약상에 암묵적으로 이미 존재하는 경우 그 사실을 명확히 기재하는 것이 필요하다.