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디지털 자료의 수집 또는 압수수색과 관련하여서는 몇 가지 문제점이 도출되고 있다. 디지털증거의 특수성인 저장매체에 단기간 저장을 하거나 은닉, 삭제, 변조 등을 고려한 압수수색 방법은 규정되어 있지 않기 때문에, (1) IT기술의 발전으로 정보를 원격지나 분산해서 저장하고 처리할 수 있는 기법인 그리드 컴퓨팅(Grid Computing)이나 클라우딩 컴퓨팅(Cloud Computing), 빅데이터(Big Data) 와 같은 새로운 정보처리기술이 활용되는 경우 저장매체의 물리적 소재를 확정하기 곤란하다.  (2) 디지털증거 압수수색 등 강제처분을 함에 있어 가이드라인이 현재까지는 없다는 것과 해외 클라우 드데이터센터에 혐의자의 중요한 정보가 저장되어 있을 경우 증거수집을 어떻게 할 것인지, 정보가 저장되어 있다고 가정하더라도 그 정보가 저장되어 있는 국가와의 형사사법 관할 문제를 어떻게 풀어낼 것이지가 문제가 될 수도 있다.
(1) 새 기술이 활용될 경우 저장매체의 물리적 소재를 확정하기 힘들다. (2) 강제처분 시의 가이드라인이 없으며 해외 클라우드 데이터에 혐의자의 정보가 있을 경우 증거수집 문제와 형사사법 관할 문제를 어떻게 해결할지 등의 문제점이 나오고 있다.