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한편, 본 연구에서는 고정효과 모형과 1차 차분모형을 실증분석 함에 있어 분석기간(1985년~2013년)을 교토의정서가 채택된 1997년을 기준으로 전기와 후기로 구분하고 전 후기의 추정 결과를 상호 비교해 보았다. 이처럼 교토의정서를 기점으로 이전과 이후를 비교한 이유는 분석 대상 국가들이 교토의정서 하에서 온실가스 감축의무를 지기 때문에 이 시기를 전후로 에너지 효율 R&D 및 에너지효율향상투자에 있어서 양적 질적인 차이가 나타날 가능성이 크며, 이로 인해 정부의 R&D 투자 효과에도 구조적 변화가 관찰될 수 있기 때문이다. 물론 구조적 변화가 발생할 것으로 여겨지는 시점은 다소 논란의 여지가 있는 것이 사실이다. UN 기후변화협약이 체결된 시점, 교토의정서가 발효된 시점 등 여러 시점을 고려될 수 있을 것이다. 전체 분석 대상 기간 중 통계적으로 구조적 변화가 가장 크게 나타난 시점을 찾아내고 이를 전후로 분석하는 것이 가장 이상적이겠지만 이는 추후 연구과제로 남겨두고 여기서는 교토의정서 체결 전후로 투자 효과에 차이가 존재하는지에 대해서만 다루기로 한다.
분석 대상 국가들이 온실가스 감축 의무를 지는 1997년 교토의정서 이전과 이후의 효과를 비교 분석했다. 이 시기를 전후로 에너지 효율 R&D 및 에너지효율향상투자의 양적, 질적인 차이가 날 가능성이 크며 정부의 R&D 투자 효과에도 구조적 변화가 관찰될 수 있기 때문이다.