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더불어 과학 심화 과목과 관련해서도 좀 더 학교 현장의 운영 실태를 파악할 필요가 있다. 학교 현장에 따르면 대체로 많은 일반계 고등학교에서 화학 II와 생물 II를 제공하고 있으며 이에 따라 대부분의 고등학교 이과 학생들은 II과목으로 화학이나 생물 중 하나를 선택한다고 알려져 있다. 따라서 자연계열 분석에서 물리 II 과목만이 통계적으로 유의한 결과에 대해 논의해 보자면, 물리 II 과목을 추가적으로 제공하는 고등학교는 다른 일반계 고등학교와 달리 교사 충원이 유용하다거나 학교의 사정이 나을 수 있으며, 결과적으로 물리 II 과목 변수가 학교 풍토 및 환경을 대변하는 변인(proxy variable) 역할을 할 수도 있다고 본다. 이러한 맥락에서도 앞서 언급하였듯이 선행연구를 통해 수학과 과학 선택중심 교육과정 운영 실태에 관한 사례 연구를 좀 더 면밀히 분석할 필요가 있다. 특히 저자들은 논의 및 제언에서 물리 II 과목을 대학수학능력시험과 연관지어 논의하고, 고교 교육과정, 수능, 대학교육의 연계를 강조하였는데, 이에 대한 해석은 좀 더 조심스럽게 다루어야 할 필요가 있다고 본다.
많은 일반계 고등학교에 비해 물리2 과목을 추가 제공하는 고등학교는 사정이 나은 학교의 경우이다. 물리2 과목 변수가 학교를 대변하는 변인 역할일 수도 있으므로 선행연구를 통해 수학과 과학 선택중심 교육과정 운영 실태에 관한 사례 연구의 세밀한 분석이 필요하다.