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그러나 이명박 정부는 출범 직후인 2008년 2월에 국무조정실과 국무총리비서실을 국무총리실로 통합하면서 결과적으로 정책조정기능을 약화시켰다(유종상･하민철, 2010: 346~347). 같은 해 7월에 국무총리실의 정책조정기능을 다시 복원시켰지만 그 기능은 여전히 취약했다. 박근혜 정부는 출범 직후부터 국무조정실과 국무총리비서실을 분리하여 국무조정실의 정책조정기능을 회복시키려 하였으나 박 박대통령의 국정운영 스타일로 인해 이전만큼 강하지 못한 상태이다. 결국 국무총리의 정책조정 역할은 제도화되지 못하고 대통령의 성격 및 국정운영 스타일 등에 따라 강화되기도 하고 또는 약화되기도 했다는 것을 알 수 있다.
이명박 정부는 국무총리실의 정책조정기능을 약화시켰다. 박근혜 정부는 이를 회복시키려 하였으나 이전의 수준에 미치지 못 했다. 국무총리의 정책조정 역할이 대통령의 영향력 아래에 있었다.