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학교체육에 관련된 안건들은 여러 입장이 포함될 수 있어 관련 기관 간의 협력이 요구된다. 우리나라에서 학교체육은 교육부, 문화체육관광부 등의 분산된 부처에서 정책 운영업무를 담당, 주관하고 있다. 정책의 안정적인 시행과 발전적 지속가능성을 위하여 운영과 재원의 확보는 필수적이라고 할 수 있기에 각 부처나 기관은 각각 요구되는 역할을 수행하고 있다. 학교체육과 관련하여 주무행정기관은 교육부의 인성체육예술교육과라고할 수 있지만, 문화체육관광부, 보건복지부, 여성부 등 여러 부처의 관련 협력이 요구되는 경우가 많다. 또한 대한체육회나 산하 경기연맹, 국민생활체육협의회 등과 같은 체육계와 한국교원총연합회나 전국체육교사협의회 등의 교사 단체, 한국교육과정평가원이나 한국스포츠개발원 등의 체육 연구 기관 및 관련 학회도 각자의 위치에서 학교체육의 활성화나 교육 효과 제고를 위한 협의체 역할을 할 필요가 있다.
국내 학교체육은 교육부, 문화체육관광부 등 분산 되어 정책을 주관하므로 이 기관의 협력이 요구 된다. 또한 체육계나 전국 체육교사단체 등 관련 학회도 각 위치에서 학교체육 활성화나 교육 효과에 대한 협의체 역할을 해야한다.