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대내외 행정환경의 변화는 투명한 공공 부문의 관리를 강조하고 있으며, 이에 따라 공공감사의 기능 및 역할에 대한 변화가 지속적으로 요구되고 있다. 우리나라는 1963년 감사원 설립 이후, 공공감사에 대한 제도 도입과 더불어 지속적인 변화를 추구해 왔다(감사연보, 1996-2011). 특히, 1999년 공공감사기준 이 제정됨에 따라서 공공 부문 감사 수행에 필요한 기본적인 사항이 마련되었다. 2003년 감사원은 국회감사청구제를 도입함과 동시에 감사 결과에 대한 전문 공개를 시행하는 감사행정의 혁신을 단행하였다. 2006년에는 한·중·일 감사원이 황사문제에 대한 국제합동감사를 실시하는 등 감사운영의 국제화를 추구하였다. 2007년에는 공공감사에 대한 관심이 학계 및 시민단체에서 강하게 등장하여 인터넷 혹은 시민옴부즈맨 제도 등을 통해 시민들이 감사활동에 참여할 수 있는 직접적인 계기를 마련하기도 하였다. 이처럼 정권별 공공감사제도의 방향은 역사적인 흐름에 의해 고착화되기보다는, 해당 시기 행정환경에 따른 국정철학이나 비전을 바탕으로 하고 있다. 특히, 정권별로 공공감사의 투명성과 책임성을 제고하기 위한 방향으로 여러 제도를 도입해 왔다.
우리나라는 감사원 설립 이후 정권별로 공공감사의 투명성과 책임성을 높이기 위한 정책 방향으로 여러 제도 도입과 함께 계속적인 변화를 추구했다. 정권별 공공감사제도는 각 정권의 행정 전반에 따른 국가 경영 이념이나 목표를 근간으로 하고 있다.