그러나, 한국은 영화가 완성된 이후에 국적 인정이 시행되므로, 촬영 과정에 있어서 필요한 혜택을 받지 못한다는데 문제가 있다. 물론, 한국에서는 자국영화에 대한 혜택이 스크린쿼터제 적용 외에는 거의 없다시피 하기 때문에 굳이 공동제작영화 또는 한국영화로 인정받는 것이 필요하다고 할 수는 없을 뿐더러, 지금과 같은 사후 신청방식은 사전 방식에 익숙한 해외투자자들이나 제작자들에게는 난점으로 작용할 수 있다. 또한, 신청시 제출 자료나 서류도 매우 미약하다.(부록 5 공동제작신고서 참조) 게다가 공동제작 영화로 제작하고자 하는 경우 사전에 신고해야하는 대상은 문화부장관으로 실질적으로 문화부인 반면, 제작 완료 후 그 영화의 국적을 인정받기 위해서 서류를 제출해야하는 곳은 영화진흥위원회이다. 결국 제작신고를 한 영화가 신고한 비율 및 여러 기준에 맞춰 영화를 제작하고 있는지 확인하거나 관리할 기관이 없다는 것도 중요한 문제 중 하나로 지적될 수 있다. 게다가 사전에 신고를 한다고 할지라도 국내 상황에서 신고를 통해 얻을 수 있는 혜택이 전혀 없다고 할 수 있다. 캐나다나 프랑스 등 자국영화로 인정받는 공동제작 영화들에 대한 혜택이 주어지는 국가들의 경우, 사전인정제를 채택함으로써 단순히 영화가 개봉되는 당시에 대한 혜택 뿐 아니라 영화의 개발, 촬영에 대한 편의 및 혜택도 주어지도록 하고 있다. 그리고, 이런 혜택이 주어질 수 있는 것은 공동제작 영화에 전담기구가 있어서 이 기구를 통해서 모든 수속 및 인정, 그리고 문제 해결 등이 가능하기 때문이다.
한국은 영화가 완성된 후에 국적 인정이 되므로 촬영 과정에서는 혜택을 받지 못하며, 사전 방식에 익숙한 해외투자자,제작자들에게는 난점으로 작용할 수 있다.  또, 공동제작하려고 해도 제대로 된 관리 기관이 없다고 볼 수 있다. 캐나다, 프랑스는 자국영화로 사전 인정 받으면 공동제작 영화 전담기구에 의해 개봉뿐만 아니라 영화의 개발, 촬영의 혜택이 있지만 한국은 혜택이 전혀 없다.