셋째, 중앙아시아 정부는 이슬람 원리주의자들에 대한 탄압에 적극적으로 나섰다. 중앙아시아 내에서 다양한 이슬람 형태에 대한 해석이 있어왔다. 이슬람 사상의 스펙트럼 안에서는 두 가지 주요 요소가 있다. 첫째, 이슬람의 가치와 원칙들은 현대의 삶에 맞추어 재해석될 필요가 있다고 믿는 개혁주의이고, 둘째, 코란의 교훈과 예언자의 전통이 완전하고 문자 그대로 성취되기를 바라는 이슬람 원리주의이다. 이슬람 원리주의자들은 급진적 단체의 전형적인 행동 양식을 수행하고자한다. 그들은 세속 사회가 상당히 퇴폐적이라고 생각하고 있으며, 이러한 차원에서 세속 사회를 부정적인 시각으로 바라본다. 그들은 또한 사회의 지배엘리트들은 종교적 위선자이며, 이슬람을 거부하는 비신자들이며, 이들도 종교적 투쟁 대상이라고 간주한다. 이슬람 원리주의를 신봉하지 않는 이들을 군사적으로 공격한다면, 자신들은 천국에서 보상받는다는 신념을 가지고 있다.
이슬람 사상에는 이슬람의 가치와 원칙들을 현대에 맞게 재해석 해야 한다는 개혁주의와 코란의 전통과 원문 그대로의 성취를 바라는 원리주의자로 나누어진다. 이슬람 원리주의자들은 세속 사회를 부정적으로 보며 군사적 공격 등 급진적인 행동 양식을 보인다.