쇼각칸 캐릭터 기획실이 편성되기 전까지만 하더라도 쇼각칸의 캐릭터 사업은 각 편집부별로 각각의 입장에서 진행하여 왔다. 그 결과 작품이나 캐릭터의 인기가 있더라도 단행본 만화를 판매하는 사업으로 끝나는 경우가 적지 않았다. 1990년대 중반부터 미디어가 다양화되면서 단행본 만화의 판매 이외에 상품화나 영상화에 의해 수익을 창출할 수 있는 기능성이 갑자기 높아지기 시작했다.  특히, <포켓몬스터>와 관련된 비즈니스를 진행하는 동안에 캐릭터의 가치를 높이는 것이 비즈니스의 규모를 확대하고 그 결과로서 원작자도 회사도 수입을 제고할 수 있음을 알게 되어 이를 전담할 수 있는 부서의 필요성에 따라 새로 구성된 부서가 캐릭터 기획실이다.  쇼각칸 프로덕션의 캐릭터 기획실은 모기업인 쇼각칸 출판사의 각 편집부와 업무를 제휴하여 애니메이션 제작 대상 작품을 기획․제작한다. 일반적으로 출판사에서는 편집부가 하나의 사업부로서 수평적인 조직형태를 취하여 상호간의 라이벌 의식 때문에 업무제휴가 이루어지기가 어렵다. 캐릭터 기획실은 그런 편집 부서들간의 장벽을 해결하고 경직된 조직을 횡적으로 연결함으로써 각 부서마다 축적한 노하우 등 정보에 대한 유동성을 촉진시키는 것을 목적으로 한다. 캐릭터 기획실이나 애니메이션 기획실이 업무를 추진하는 방식은 매트릭스 조직에서 이루어지는 업무 형태로, 상호 연결되어 있는 각 편집부의 편집부원들이 평상시에는 각 편집부에서 실무를 진행하다가 캐릭터 기획실의 부서원으로서 1주일에 한 번의 회의를 갖고 다양한 캐릭터에 관한 각종 조정이나 새로운 마케팅을 기획하는 구조이다. 그리고 애니메이션 기획․제작과 캐릭터 개발 등의 프로젝트가 수행될 경우 그 사업이 일정 궤도에 오를 때까지 주로 캐릭터 기획실이나 애니메이션 기획실의 업무를 수행한다. 매출 배분에 있어서는 캐릭터 기획실과 편집부에서 반반씩 나누는 경우도 있고, 전부를 편집부의 매출로 하는 경우도 있다.
1990년대 중반 미디어가 활성화되자 캐릭터의 가치를 높이는 캐릭터 기획실 부서가 등장하였다. 캐릭터 기획실은 모기업인 쇼각칸 출판사의 편집부와 업무를 제휴하여 애니메이션 제작 대상 작품을 기획, 제작한다. 편집 부서 간 장벽을 허물고 조직을 횡적으로 연결함으로써 정보에 대한 유동성을 촉진하는 역할을 한다.