일본의 애니메이션 제작에 있어 또 하나의 특이한 사항은 경쟁 제작회사간 전략적 제휴의 일반화이다. 일본의 애니메이션 제작사는 각 회사별로 경쟁우위를 확보하고 있는 분야가 있으며, 각기 나름대로의 특징을 가지고 있다. 예를 들어 TMS엔터테인먼트는 촬영이나 편집 능력, 도에이나 텔레콤 애니메이션은 원동화 제작 능력, SUNRISE는 기획능력이 뛰어나다. 이처럼 서로의 상이한 장점을 인정하여 서로 협력할 수 있는 부분은 서로 협력하여 제작을 하기 때문에 완성도를 일정 수준으로 유지할 수 있다.  한국은 원청 기업과 하청 기업이 철저하게 주종의 관계로만 형성되어 있지만 일본은 협력기업을 제작의 일부를 의뢰한 분야의 전문적인 역량을 갖고 있는 기업으로서 파트너 관계로 인식한다. 이러한 인식의 바탕이 경쟁기업과도 기능별 제휴를 할 수 있는 마인드를 갖게 하는 것이다. 즉, 일본 하청의 특징은 원화제작, 편집, 촬영 등 각 분야별로 우월한 역량을 지닌 경쟁관계에 있는 다른 애니메이션 제작사에게 의뢰하기도 한다. pre-production과 post-production의 주요 제작과정에서 일부를 다른 경쟁 애니메이션 제작사에게 의뢰하는 것은 하청으로 인식하기 보다 전략적 제휴로 인식한다는 것이다. 그래서 대부분 하청이라고 하면 [그림 2-12]에서 보는 바와 같이 원화와 원화 사이를 잇는 사이그림을 그리는 동화부터 트레스 작업, 채색 등을 외부 기업으로 하여금 제작하도록 하는 것을 의미한다. 이 분야에 대한 하청은 주로 일본의 중소 애니메이션 제작업체나 한국과 중국, 필리핀 등의 애니메이션 제작사에게 의뢰하여 제작비를 절감하는 차원에서 이루어진다.
일본의 애니메이션 제작사들은 각 회사별로 경쟁우위를 확보하고 있는 분야가 있어,  서로 협력할 수 있는 부분은 협력하여 제작을 한다. 즉, 각 분야별로 우월한 역량을 지닌 경쟁관계에 있는 다른 애니메이션 제작사에게 하청을 의뢰하는데, 이를 하청으로 인식하기 보다는 전략적 제휴로 인식한다.