이같은 일본영화산업의 침체를 조금씩 극복시켜 나간 것은 극장용 애니메이션의 부흥이다. 애니메이션의 부흥은 다시 일본에서 전통적으로 인기를 구가하고 있던 페이퍼 만화의 강세와 관계가 있다. 2차 대전 이후, 베이비붐 세대는 일본식 ‘망가(漫畵)’에 열광했고 일본의 전설적 삽화작가 데즈카 오사무의 등장과 함께 만화는 ‘스토리 만화’ 또는 코믹한 삽화로 발전했다. 만화는 <쇼넨 매거진>, <쇼넨 선데이>, <쇼넨 점프> 등의 만화잡지와 더불어 성공을 거두다가 1980년대부터 애니메이션과 비디오 게임 시장에 침투해 들어갔다.  이윽고 1997년 애니메이션 <에반게리온>과 <원령공주>가 대대적으로 흥행하면서 다른 애니메이션 영화들까지 더불어 효과를 보고 있다. <원령공주>는 1,200만명 이상의 관객을 동원하며 일본영화 역사상 최고 흥행기록을 세웠고 침체된 영화시장에 활력으로 작용하고 있다. <원령공주>의 성공은 <바람계곡의 나우시카>(1984), <반딧불의 묘>(1988), <헤이세이 너구리 전쟁 폼포코>(1994), <붉은 돼지>(1992) 등 이전 작품들의 재흥행을 몰고 왔으며 이들 작품의 계속되는 해외 진출은 일본영화 시장 총 수익의 1/3이라는 지대한 몫을 차지하고 있다.
애니메이션의 부흥은 일본영화산업의 침체를 조금씩 극복시켜 나갔다. 이는 페이퍼 만화의 강세와 관계가 있다. 2차대전 이후 베이비붐 세대가 만화에 열광하면서, 1980년대부터 만화는 애니메이션과 비디오 게임 시장으로까지 범위를 넓혀나갔고 이윽고  <에반게리온>과 <원령공주>가 흥행하며 다른 애니메이션 영화까지 흥행하게 되었다.