결국 그는 신분이 보장되지 않는 신고선수(프로야구에서 구단의 지명을 받지 못해 계약금 없이 프로팀에 입단한 선수)로 LG에 입단했다. 2008년 6월, 그는 1군에서 한 타석에 들어서 삼진을 당하고 물러난 뒤 결국 그해 8월 LG에 서 방출됐다. 갈 곳 없는 그가 선택할 수 있는 것은 현 역입대뿐이었다. 육군 소총수로 군에 입대한 그는 야구에 대한 꿈을 포기하지 않았다. 그는 경계근무를 서면서도 자신이 타격, 주루, 수비하는 모습을 머릿속에 상상하며 ‘이미지 트레이닝’을 했고, 왜소한 체격을 보완하기 위 해 웨이트 트레이닝에 더욱 힘썼다. 전역후 넥센의 신고선수로 다시 프로 무대를 밟은 그는 2014년 시즌에서 새로운 타격 폼으로‘안타 제조기’로 거듭났고 사상 최초 200안타를 돌파하며 전설을 썼다. 그리고 2014 프로야구 MVP, 최우수 신인선수 및 타격 3관왕(안타, 타율, 득점)을 달성했고, 이 어 시즌 최고의 선수에게 주어지는 영예의  대상까지 수상했다. 손에 못이 박히도록 배트를 휘두르고 이를 악물고 뛰고 또 뛰며 이룬 결실이었다. 불운을 탓하고 어려운 상황을 비관했다면, 최고의 타자 서건창은 없었을 것이다.
2008년 LG에서 방출된 서건창은 입대 후에도 야구에 대한 꿈을 포기하지 않은 덕에 다시 넥센의 신고선수로서 2014년 시즌을 타격 3관왕 달성과 더불어 대상 수상으로 빛낼 수 있게 되었다.