이후 2004년에는 국립경주박물관 서쪽에 있었을 것으로 추정되는 춘양교와 함께 사적 제457호로 지정되었으며, 2008년 5월 복원공사에 착공하여 2018년 10월 완료하였다. 조사 성과를 토대로 월정교의 형태는 먼저 네 개의 배 모양 교각 위에 돌로 만든 다리를 놓고, 거기에 기와를 덮은 건물을 얹은 누교로 추정하였다. 다리 입구 양쪽에는 돌로 만든 사자, 팔각기둥과 그것을 받치는 받침석 등도 세워졌을 것으로 보았다. 이러한 결과를 토대로 복원연구를 진행하여 교각의 형태를 설계한 후 현재의 모습으로 복원하였다. 그러나 김극기의 시에 ‘무지개다리虹橋’라는 표현에 주목하여 당시 월정교가 무지개다리의 형식이었을 것으로 보기도 한다.
2004년에 월정교는 춘양교와 함께 사적 제457호로 지정되고, 조사성과를 토대로 본래의 모습을 추정하여 복원공사를 진행해 현재의 모습으로 복원했다.