475년 웅진으로 천도한 뒤 문주왕은 3년만에 살해되었고, 삼근왕도 재위 3년째에 갑자기 죽었다. 479년에 즉위한 동성왕은 왜국에서 태어나 자라다가 어린 나이에 갑자기 귀국한 사람이며 501년 살해당하였다. 뒤를 이어 40세에 즉위한 무령왕은 국정을 안정시켰다고 평가받는 인물이지만, 배다른 아우인 동성왕 암살에 관여했을 개연성이 있는 인물이다. 그리고 그 뒤를 이어 523년 성왕이 즉위하고 재위 16년째인 538년에 예전 동성왕이 추진했던 사비로의 천도 계획을 마침내 실행하였던 것이다. 이러한 일련의 정치 상황과 왕위 계승은 웅진도읍기의 국내 정세를 아직 안정적이라고 말하기 어렵게 하는 측면이 있다. 하물며 한강 유역을 장악한 고구려의 군사력이 금강 상류 청주 지역에까지 미치고 있는 상황에서 웅진성 바깥에 백제 왕궁을 둘 수 있었을지 의문이다. 아직 공산성 바깥에서는 왕궁시설로 볼 수 있는 유적이 한 곳도 발견되지 않았다.
웅진도읍기에 백제 왕들이 살해당하거나 급사한 사건들은 당시 백제 정세가 불안정적이었다고 볼 수 있고 고구려가 금강 상류까지 진출한 상황에서 웅진성 밖에 백제 왕궁을 둘 수 있었을지가 의문이며 아직까지 밖에서 왕궁시설 유적이 발견되지도 않았다.