하지만 상표권 등을 통한 무형문화유산 및 전통문화표현물 보호에도 한계는 있다. 예컨대 상표제도는 전통문화표현물 보유자가 등록하지 않으면 타인의 방호적 사용을 막을 수 없다는 단점을 가지고 있다. 타인이 선점하는 경우, 전통문화 표현물 보유자는 제3자가 이미 등록한 상표에 대해서 독점적 사용권을 가지지 못 하게 된다. 또한 상표로 등록을 받기 위해서는 전통문화표현물이 상업적으로, 다시 말하여 상품과의 관계에서 사용되어져야만 하는데 전통문화표현물의 보호는 원하지만 상업적으로는 활용하기를 원치 않는 경우에는 상표제도가 적절한 보호 수단이 될 수 없다. 뿐만 아니라 무형문화유산 또는 전통문화표현물 보유자가 보호받기를 원하는 상표가 많은 경우에는 비용측면에서 부담이 될 수밖에 없다. 또한 상표, 증명표장, 단체표장 및 지리적표시제도 모두 무형의 무형문화유산이나 전통문화표현물은 보호할 수 없고 그것이 외부로 표출된 유형물만을 보호대상으로 한다는 점에서 한계를 가진다고 할 수 있다. 예컨대 전통문화표현물과 관련된 전통지식의 보호에 있어서는 미흡한 제도라고 할 수 있다. 그러나 이러한 여러 가 지 한계에도 불구하고 상표, 증명표장, 단체표장, 지리적표시 등은 무형문화유산 또는 전통문화표현물 보호에 있어서 신속하고, 실용적이고, 효과적인 해결책을 마련해 주고 있다. 왜냐하면 이들 제도는 현행 그대로 또는 약간의 수정만을 통하여 무형문화유산 또는 전통문화표현물의 보호를 꾀할 수 있으며, 보호기간의 제 약이 없다는 점에서 무형문화유산 또는 전통문화표현물 보유자들의 욕구와 기대에 부응할 수 있기 때문이다.
상표제도는 전통문화표현물 보유자가 등록하지 않으면 타인의 사용을 저지할 수 없고, 상업적 활용을 원치 않을 경우 적절한 보호수단이 되지 못하며, 상표 수가 많으면 비용적 부담이 있고 무형이 아닌 유형물만 보호대상으로 하므로 무형 및 전통문화표현물 보호에 한계가 있다. 그럼에도 이것이 효과적인 보호책이 되는 이유는 약간의 수정만으로 보호 효과를 발휘하며 보호기간의 제약이 없어 보유자들의 기대에 부응할 수 있기 때문이다.