한편, 작은도서관은 「법인세법」 시행령 제36조(지정기부금의 범위 등) 제1항 제1호 아목에 근거하여 기획재정부령이 정하는 지정기부금단체 중 ‘「도서관법」에 의하여 등록하거나 신고된 도서관 또는 작은도서관’에 해당되어 기부금심사위원회를 개최하지 않고 기부금을 접수 할 수 있었다. 그러나 법정기부금단체 및 지정기부금단체 제도 정비에 따라 해당 조항이 2018년 3월 21일자로 삭제됨으로 별도의 지정기간 없이 지정기부금단체로 인정되던 지정기부금단체등과 유사한 것으로서 기획재정부령으로 정하던 지정기부금단체는 2020년 12월 31일까지 지정기부금단체로 인정하되, 그 이후에는 심사를 거쳐 기획재정부장관이 지정·고시하도록 하도록  개정되었다. 즉, 작은도서관은 「법인세법」 시행령 제36조(지정기부금의 범위 등) 제1항 제1호 아목의 삭제에도 불구하고 2020년 12월 31일 까지 기존의 법률에 근거하여 기획재정부령이 정하는 지정기부금단체로 인정된다.
제도 정비에 따라 「법인세법」 시행령 제36조(지정기부금의 범위 등) 제1항 제1호 아목이 삭제되었으나 2020년 12월 31일까지 작은도서관은 기획재정부령이 정하는 지정기부금단체로 여전히 인정된다.