명성황후 시해사건으로 철도부설권을 차지하지 못한 일본은 경인선 부설권을 획득하고자 모든 수단과 방법을 동원했다. 모어스는 이러한 일본의 매수공작에 견디다 못해 일본에게 부설권을 매각했다. 경인선 공사기간 30개월 중 약 80%의 공사가 진행된 상태에서 일어난 일이었다. 모어스에게 부설권을 매수한 일본은 1899년 4월 23일 인천에서 기공식을 다시 거행하고, 1899년 9월 18일 개통 시까지 5개월간 공사하였으나 당시 대홍수가 일어나 한강철교 부설이 늦어짐에 따라 공사가 완료된 구간인 한강 이 전 인천에서 노량진역까지만 임 시 개통을 하였다. 이때 발행된 <독립신문>에는‘철도 개업예식을 위해 인천에서 화륜거가 떠나 영등포(노량진)로 와서 내외 귀빈을 모시고 인천으로 향하는데 화륜거 구르는 소리는 우뢰와 같아 천지를 진동하고 기관차의 굴뚝 연기는 하늘로 솟아오르더라…’는 기사가 실렸다. 당시의 경인선에서 달리는 열차의 속도는 시속 22km로 인천에서 노량진역까지 1시간 30분이 소요됐다고 한다.
일본은 명성황후 시해사건으로 철도부설권을 차지하지 못하였고, 경인선 부설권을 얻기 위한 공작을 지속, 결국 공사 80%가 진행된 상태에서 매수하였다.