또한 일본의 애니메이션은 <미키마우스>와 같은 짤막한 해프닝 위주의 단편애니메이션 모음이나 <라이온 킹>, <인어공주>, <알라딘>, <노틀담의 꼽추>, <포카혼타스>와 같은 세계적으로 알려진 동화나 설화를 소재로 한 디즈니 애니메이션과 달리, 다양한 소재와 현실성 있는 작품의 주제로 이루어진 스토리 애니메이션이라는 점이다.  즉, 디즈니 작품보다 더 선정적이고 자극적인 화면으로 시청자들의 눈길을 사로잡는 경우가 많아 비판을 받는 반면에, 자연파괴 및 환경오염의 고발, 인간소외 문제, 반전평화 의식 등 세계 인류가 공감할 수 있는 보편적 메시지나 사상이 담긴 작품을 성공적으로 제작․배급하기도 한다. 소재에 있어서도 스포츠, 경제, 정치, 요리, 설화나 동화 등 매우 광범위하게 다루어져, 애니메이션을 즐기는 계층을 확대시킬 수 있는 능력을 가진 것도 일본 애니메이션의 장점이다.  이처럼 줄거리와 메시지가 독창적이며 선명한 작품이 많이 창작될 수 있는 이유는 세계 만화 출판량의 60%를 점유할 만큼 방대한 만화출판시장 인프라와 콘텐츠간의 치열한 경쟁구도가 조성됐기 때문이다.
일본 애니메이션은 동화나 설화를 다루는 디즈니와는 달리, 현실성 있는 주제를 다룬다. 즉, 디즈니 작품보다 자극적이라는 이유로 지판를 받는 반면에, 사상이 담긴 작품을 만들기도 한다. 다양한 소재로 모든 계층이 즐길 수 있다. 이처럼 다양한 작품 창작의 배경에는 치열한 콘텐츠 경쟁이 있다.