두 번째는 가람 중심부의 배치 양상과 변화를 파악하였다는 점이다. 분황사는 선덕여왕 3년(634) 창건 당시 신라 최초의 ‘품(品)’자형(字形) 일탑삼금당식(一 塔三金堂式) 가람으로 축조되었다. 그 후 세 번의 중건을 거치게 되는데, 8세기 중반 경인 1차 중건기에는 품자형 삼금당이 사라지고 평면 170평의 대형 단일 금당으로 통합되면서 일탑일금당식(一塔一金堂式)으로 바뀌게 된다. 1차 중건 금당이 몽고의 침입으로 소실된 후 일정한 공백기를 가지다가 13세기 후반 이후로부터 15세기 후반 사이의 어느 시점에 2차 중건 금당이 조성되었다. 그 후 임진왜란 및 정유재란을 거친 후 다시 10여 년의 공백기를 가지고 광해군 원년(1609)에 현재의 금당인 보광전(3차 중건 금당)을 조성하여 지금에 이르고 있는 것이다. 2·3차 중건을 거치면서는 금당의 면적이 축소되고 방향마저 남향에서 서향으로 변화되어 사세가 현격히 줄어드는 양상을 띠게 된다. 강당은 평지가람의 정형성에서 벗어나 한쪽으로 치우친 채 방향마저 어긋나게 건립하였는데, 지형을 비롯한 자연적 환경에 순응하여 건립한 산물로 판단된다. 단랑으로 밝혀진 동회랑의 전체 규모 및 금당 중건과의 관련성은 아직 밝히지 못하였다. 그러나 가람의 남북 중심선과 평행을 이루고 있는 것으로 보아 시기적으로는 아무리 늦어도 가람배치의 정형성에서 벗어난 2차 중건 금당보다는 빠른 시기에 건립된 것으로 판단된다.
가람 중심부의 배치 양상과 변화를 알게 되었다. 분황사는 선덕여왕 3년에 품자형 일탑삼금당식 가람으로 만들어진 후 8세기 중반, 13세기 후반~15세기 후반, 광해군 원년에 이루어진 세 번의 재건을 거치면서 현재의 금당인 보광전이 만들어졌으며 2·3차 중건을 거치면서 크기가 급격히 줄어들었다. 강당은 지형에 따라 한쪽으로 치우쳐 건립되었다.