첫째, 회계, 개정, 위원회 등 명칭이 변경되었다. 즉, 지역발전특별회계는 국가균형발전특별회계로, 생활기반계획는 지역자율계정으로, 경제발전계정은 지역지원계정으로, 지역발전위원회･기획단은 국가균형발전위원회 기획단으로 변경되었다. 둘째, 국가균형발전특별회계 예산 편성 과정상 국가균형발전위원회 의견제시 역할이 강화되었다. 셋째, 변경된 국가균형발전특별회계 예산 편성 절차는 다음과 같다. 지자체는 매년 4월 30일까지 예산신청서를 중앙행정기관과 균형위에 제출, 중앙행정기관은 지자체의 예산신청서 및 균형위의 의견을 기초로 작성한 예산요구서를 5월 31일까지 기획재정부에 제출, 균형위는 균특회계의 예산편성에 관한 의견을 5월 31일까지 기재부 및 과학기술정보통신부에 통보, 기재부 및 과기정통부는 균형위의 의견을 감안하여 예산을 편성 및 조정･배분하는 것으로 조정되었다. 넷째, 포괄보조 세부사업이 추가되었다. 2018년 예산 편성시 타 회계로부터 이관된 (국토부)지방하천정비, 공공형택시지원, (농식품부)농촌형교통모델, (문체부)지역문화행사지원, (해수부)수산물 안전검사체계구축 등 5개 세부사업, 사회적 가치 관련 ‘지역사회 활성화기반 조성’ 사업이 신설되었다. 다섯째, 지자체 사업선택 자율성이 보장되었다. 문화･체육시설 건립 관련 문화체육관광부 설립타당성 사전평가 대상사업을 관련 법령에 명시된 경우로 한정하였다. 변경 전에 공립박물관, 공립미술관, 문예회관, 지방문화원 및 공공도서관 등은 공립박물관, 공립미술관으로 변경되었다. 이외 균형위 평가 하위(미흡) 사업 구조조정 방식이 개선되었고, 포괄보조사업 전용 제도가 개선되었다.
첫째로 회계, 개정, 위원회 등에서 국가균형발전, 지역자율, 지역지원 등의 용어 중심으로 명칭이 바뀌었다.  둘째, 국가균형발전 특별예산 편성시 국가균형발전위원회의 의견 제시가 강화되었다. 셋째, 특별예산 편성 절차가 조정되었다. 넷째, 다른 정부 부처의 포괄보조 세부사업이 이관되었다. 다섯째, 문체부의 사전평가 대상과 기능의 축소로 지자체의 사업 선택 자율성이  생겼다.