조선시대의 대표적인 교육기관이며 지역 문화를 대표했던 서원은 ‘선현 존경과 후진 장학’이라는 정신에서 시작됐다. 많은 사람이 알고 있는 교육의 기능뿐만아니라 선배 유학자들을 기리고 제사하는 사당의 기능을 담당했다. 묵계서원 역시 응계(凝溪) 옥고(玉沽, 1382~1436) 선생과 보백당(寶白堂) 김계행(金係行, 1431~1517) 선생의 뜻을 기리고자 조선 숙종 13년(1687년)에 창건했다. 특히 김계행 선생은 조선 중기의 문신으로 대사간과 대사헌, 부제학 등의 요직을 지닌 인물이다. 그는 “우리 집에는 보물이 없다. 보물이 있다면 오직 청백(淸白)뿐이다.”라는 유훈을 남길 만큼, 청백리의 대표적인 인물로 존경받는다.
조선시대 교육과 사당 기능을 담당했던 서원은 선현 존경과 후진 장학 정신에서 시작됐으며, 숙종 13년에는 청백리의 대표적 인물인 김계행선생과 옥고선생의 뜻을 기리고자 묵계서원을 창건했다.