한개마을이 국가지정문화재로 지정된 것은 2007년 12월 31일로 비교적 늦은 시기에 지정되었는데 가옥의 틀은 그대로 남아 있었지만 원형을 갖춘 초가집이 3동 뿐이었다. 게다가 초가집으로 건립된 가옥들도 지정당시에는 대부분 지붕이 변형되어 있었다. 이후 전통마을로서의 면모를 갖추기 위한 정비사업을 시작하면서부터 부딪힌 문제가 지붕이 변형된 가옥의 초가집 환원에 대한 반감이었다. 마을 주민들은 변형, 퇴락된 가옥의 보수에는 찬성하지만 초가집으로의 환원에는 대부분 반대하였다. 여기에는 여러 이유들이 있겠지만 양반의 집인 기와집과 머슴, 노비가 사는 초가집이라는 과거로부터 내려온 신분제의 잔상이 큰 영향을 미쳤을 것이다. 아울러 짚이라는 재료의 특성에 따라 매년 이루어질 초가이엉잇기에 대한 부담, 거주하기에 불편한 낮고 좁은 작은 집의 규모 등에 대한 염려도 무시할 수 없었다.
한개마을이 국가지정문화재로 지정될 때는 초가집의 지붕이 대부분 변형돼 전통마을 정비사업의 시작과 함께 초가집으로의 환원이 필요했으나, 노비가 사는 집이라는 과거의 잔상이나 관리 및 거주의 불편함 때문인지 마을주민 대부분이 반대했다.