저예산 순수창작 애니메이션 제작지원 사업은 기존의 영화진흥위원회 저예산․예술영화 지원사업에서 분리된 것으로 이 사업의 취지와 맥을 같이 한다. 저예산․예술영화 지원사업의 실질적인 함의는 시장논리에 의해 거부당하는 영화들을 지원하여 균형 있는 영상문화의 발전을 도모하고 영화 문화의 다양성을 보존하겠다는 철학을 바탕으로 한다. 이러한 정책은 산업이 안정적으로 기능하고 시장기능이 활성화되는 속에서 오히려 영상문화의 다양성이 실종되는 등 작금의 실사영화계에 나타난 부작용을 완화하기 위한 대안 사업의 성격을 갖는다. 장편 애니메이션 제작지원 사업이 이 사업 속에서 실시되어 온 이유는 아직 본격적인 산업궤도에 진입하지 못해 자생성이 없는 마이너 장르인 애니메이션 산업의 보호가 예술영화 지원사업의 취지인 다양성 보호라는 취지에 부합하기 때문이다. 상업성 위주의 작품이든, 미학적 완성도가 높은 작품이든 완성작 자체가 제대로 만들어질 기회를 갖지 못하고 시장에서 긍정적으로 검증받아 볼 기회조차 없었던 애니메이션 산업에 대해서는 일단 많은 장편애니메이션이 제작될 수 있는 환경을 만들어줄 필요가 있다.
저예산·예술영화 지원사업은 시장논리에 맞지 않는 영화들을 지원하여 영화 문화의 다양성을 보존하겠다는 철학을 바탕으로 하며, 저예산 순수창작 애니메이션 제작지원 사업도 이런 다양성 보호라는 취지에 부합한다.