예술영화관을 자체 수입만으로 독자적으로 운영한다는 것은 현재의 시장 상황에서 사실상 불가능하다. 외화 개봉작을 놓고 볼 때, 수입사 입장에서는 극장 개봉결과 손실분을 2차 윈도우인 부가판권에서 손익보전을 받아왔으나 이제는 예술영화들의 부가판권에 대한 거래 자체가 성사되지 않고 있는 실정이다. 최근 들어 지속적으로 감소하고 있는 비디오 시장 매출과 예술영화의 비디오 판권 구매 기피 현상은 예술영화의 개봉 진행 및 손익문제에 가장 치명적인 요인 중 하나라고 할 수 있다. 2002년부터 시작된 영화진흥위원회의 예술영화관 운영지원금은 예술영화관 운영의 적자폭 손실 보존에 일정 정도 유의미한 역할을 하고 있다.  하이퍼텍나다의 경우, 2003년 영화진흥위원회로부터 받은 지원금은 7,200만원으로 연간 자체 프로그램 구입비(연간 1억원～1억 5천만 원)로 사용하고 있다.
현재 예술영화관을 자체 수입만으로 운영한다는 것은 예술영화 매출의 감소와 비디오 판권 구매 기피 현상 때문에 힘들다. 영화진흥위원회의 지원금이 예술영화관 운영을 유지하고 있다.