진도 쌍계사에 소장되어 있는 목조석가여래삼존상의 목조대좌는 <조성발원문>에 의해 좌대의 시주자(文信元 兩主, 權得精 兩主, 朴㖯伊)가 밝혀져 있어 삼존상과 동시대에 만들어졌을 가능성이 높고, 절대연대를 가진 대좌라면그 역사적 가치는 높다. 더욱이 3기의 대좌의 하층부를 이루는 팔각연엽대좌의 경우 상중하대의 수 미좌형식을 가지고 있으며, 가운데부분이 방형으로 뚫려 있어 목재의 통기성이나 통풍을 용이하게 하여 원형을 유지하기에 적합한 구조여서, 목조 대좌가 목조 불 상의 보존성을 높이기 위한 장치를 가지고 있다는 점에서 학술적 가치가 있는 편이다.
진도 쌍계사에 소장되어 있는 목조석가여래삼존상의 목조대좌는 목조 불상의 보존성을 높이기 위한 장치를 갖고 있다는 점에서 학술적 가치가 있고 역사적 가치도 높다.