현재 한국의 시네마테크는 새로운 시작을 알리고 있다. 2000년에 들어서 서울아트시네마를 중심으로 한 비상업적인 방식의 예술영화 상영은 그간 놀라운 성과를 이뤄냈다. 하지만 90년대 이래 소모임으로 시작한 시네클럽을 근간으로 상업극장과는 다른 방식의 영화 상영과 배급을 꾀하고 있는 시네마테크는 작품의 컬렉션, 상영 및 배급 구조, 재정적 안정성 등 다양한 문제를 안고 있다. 또한 현재 한국의 독립 영화들은 무한한 가능성을 지니고 있음에도 불구하고, 주류 블록버스터 영화에 밀려, 제작은 물론 배급에서 고전을 겪고 있으며, 독립 영화에 대한 개념규정과 관련해 많은 논란이 제기되고 있다.
소모임 시네클럽으로부터 시작해 비상업적 방식으로 예술영화 상영을 해 온 시네마테크는 다양한 문제를 안고 있는데, 한국 독립영화들 또한 배급과 개념규정에서 많은 논란이 있다.