2001년까지 문화학교 서울, 서울시네마테크, 서울퀴어아카이브는 각기 서로 다른 방식으로 필름 영화제를 개최해왔다. 이들의 성과가 대외적으로 인정되는 분위기가 형성되었던 2001년 중반부터 시네마테크단체 대표들과 영화진흥위원회(이하 위원회) 사이에 이러한 행사들을 위해 안정적인 극장이 확보될 필요가 있다는 논의가 오고 가기 시작했다. 이 과정에서 한국시네마테크협의회(이하 협의회)가 결성되었고 협의회와 위원회 간의 논의 끝에 과실금으로 시네마테크전용관을 확보하고 시네마테크프로그램을 일부 지원하기로 하는 2002년 시네마테크사업안이 만들어졌다. 그러나 문화관광부는 사업의 성격이 한국영상자료원(이하 자료원)에 적합한 것이므로, 영화진흥위원회의 과실금으로 예산을 확보하되 사업의 시행주최를 자료원으로 할 것을 전제로 위원회의 예산을 승인했고 이로 인해 시네마테크전용관 사업은 사업주최인 자료원이 협의회에 운영업무를 위탁하는 형식으로 2002년 5월 10일 개관하였다.
여러 필름영화제를 위한 극장의 필요성에 따라, 한국시네마테크협의회가 결성되고, 여러 논의를 거쳐, 시네마테크전용관이 개관하였다.