등록제 전환 이후 1990년대 중반까지는 여행사 과당 경쟁 문제가 주요 이슈로 등장하였다. 당시 교통부는 과당경쟁 때는 여행사 등록을 중지 또는 취소하는 강력한 정책을 취하였으며, 업체 난립과 서비스 저하를 막기 위해 등록기준을 강화하기도 하였다. 건전관광 이슈가 부각되면서 는 여행사의 책무를 강화하거나 해외 건전 상품을 개발하는 정책도 실시하였다. 한편, 정부의 규제 중심의 여행업 정책은 관광산업 진흥에 제동을 걸고 있다는 비판적 주장이 제기되기도 하였다. 이는 1992년 관광산업이 소비성 서비스 산업에서 제외면서 부분적으로 완화되었다.
등록제 전환후 여행사 과당 경쟁문제 발생시 정부는 등록기준 강화 등 강력정책을 취했다. 여행업 대상 규제는 관광산업이 소비성 서비스 산업에서 빠지며 일부 완화됐다.