정유재란 종전 이후에도 남원읍성은 남원지역의 치소성(治所成)으로서 그 역할을 계속 하였으며, 일제강점기에 작성된 지적도(1916)상에는 남원읍성의 일곽이 잘 나타나 있지만, 이후 전라선 철도의 가설과 성곽의 무분별한 해체, 근현대의 도시개발 사업 속에서 그 옛 모습은 대부분 멸실되었다. 현재는 북쪽 일부 옛 성의 모습을 보존하고 발굴조사 및 복원 사업 등을 추진하고 있다. 현재 남원읍성의 지리적 위치는 북위 35°24′46.6″, 동경127°23′4.2″있으며 해발고도 93m로 남원시가지의 하부에 대부분 묻힌 것으로 추정하며 우리나라 성곽에서 찾아보기 힘든 네모반듯한 성벽 경계구성과 내부직선 구성 등에 대한 학술적 가치가 높아 사적 제 298호로 지정(1982.11.3.)되었고 북·서벽 일부 복원 등을 지속적으로 진행하고 있다.
남원지역의 치소성이었던 남원읍성은 네모반듯한 성벽 경계구성과 내부직성 구성 등 학술적 가치가 높아 사적 제298호로 지정되었으며, 현재 북·서벽 일부 복원 작업이 진행되고 있다.