전래하는 판본을 토대로 추정하면 고려시대에는 삼장문선에 대한 기록과 전래본이 없으므로, 그 전래와 간행여부에 대해 정확히 알 수 없다. 다만 이른 판본으로 고려 충혜왕 2(1341)년 이후 고려가 원나라가 아닌 명나라로 과거 응시생을 파견하기 시작한 공민왕 19(1370)년 사이에 서적원활자로 간행한 것으로 추정되는 초간본, 고려의 서적원활자에 보자를 넣어 조선 태종 3(1403)년부터 세종 2(1420)년 사이에 간행한 것으로 추정되는 활자본, 세종 3(1421)년부터 세종 16(1434)년 사이에 간행한 것으로 추정되는 경자자본, 단종 2(1454)년 밀양에서 간행한 경자자복각본 등이 알려져 있다.
고려시대의 삼장문선에 대해서 정확히 알 수 없지만 충혜왕 2년에 간행된 것으로 보이는 초간본이 남아있고, 조선시대 때도 활자본, 경자자본 등이 간행되었다. 