우리나라의 지자체 정부 설립 문화재단의 대표이사는 공모의 형태로 선정되지만 최종적으로 해당 지자체장인 시장 혹은 도지사가 임명하는 것이 관례로 정착되어 있다. 따라서 전반적으로 재단의 운영 방향은 재단을 설립한 지자체의 문화정책의 방향과 그 궤도를 함께하게 된다. 또한 국내 지역문화재단의 경우, 사실상 재정적으로는 지자체 정부에 전적으로 의존하고 있어 전문가 직원이 활동을 하고는 있지만 전체 틀이나 운영 전반에서 지자체 공무원들의 간섭을 받고 있는 것이 현실이다. 즉, 지역문화재단이 재단을 설립한 해당 지자체로부터 전문화한 영역에서 독립성을 확보하지 못한다면, 지자체가 별도로 지역문화재단을 설립하여 운영하는 것은 지역민을 위한 전문적인 문화행정을 구현하는 것이라기보다 해당 지자체의 문화행정 업무를 재단에 떠넘기는 행정편의주의에 그칠 가능성이 크다. 현재 지자체 설립재단이 자체 자율성과 독립성을 얼마나 발휘할 수 있는가의 문제는 사실상 지자체의 단체장과 재단 대표이사의 관계, 이사회 구성원의 면면, 지자체 공무원들이 재단을 바라보는 태도 전반, 지자체 담당 공무원의 마인드 등에 의해 영향을 받는다(김경욱, 2007).
현재 지자체 설립재단이 자체 자율성과 독립성을 얼마나 발휘할 수 있는가의 문제는 다음 요소들에 의해 영향을 받는다. 지자체의 단체장과 재단 대표이사의 관계, 이사회 구성원의 면면, 지자체 공무원들이 재단을 바라보는 태도 전반, 지자체 담당 공무원의 마인드 등이 그것이다.