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은행나무는 살아 있는 화석이라 할 만큼 오래된 나무로 우리나라, 일본, 중국 등지에 분포하고 있다. 우리나라에는 중국에서 유교와 불교가 전해질 때 같이 들어온 것으로 전해지고 있다. 가을 단풍이 매우 아름답고 병충해가 없으며 넓고 짙은 그늘을 제공한다는 장점이 있어 정자나무 또는 가로수로도 많이 심는다.  경주 동부동의 은행나무는 나이가 500년 정도로 추정되며, 높이는 19m, 둘레 6.66m이다. 자라나는 상태가 양호한 편이며, 또 한 그루의 은행나무가 30여 m의 거리를 두고 떨어져 있는데, 모두 암나무로서 결실량이 풍부하다. 이 나무의 유래는 알 수 없으나, 조선시대에 경주부 동헌을 지을 당시에 심은 것으로 추정하고 있다.
경주부 동헌을 지을 당시 심은 것으로 추정되는 동부동 은행나무의 유래는 알 수 없다.