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흔히『약사경(藥師經)』으로 불리는 『약사유리광여래본원공덕경』은 동방세계에 유리광국(琉璃光國)이라는 불국토를 건설하고, 12가지 큰 서원(誓願)을 세워 모든 중생의 질병을 치료할 것을 서원함으로서, 중생들의 질병을 치유하고 모든 재난을 제거하며 수명을 연장하는 약사여래의 공덕을 설파하고 있는 경전이다.백련사 소장 『약사유리광여래본원공덕경』은 당나라 현장이 번역한 것으로, 고려 초조본 대장경판으로 간행된 것으로 모두 16장이 연결되어 있다. 그리고 4장 7행의 13번째 글자 ‘경(竟)’자와 12장 22행의 12번째 글자 ‘경(敬)’자의 마지막 획이 탈락되어 있는데, 이는 중국 송나라 태조의 조부의 휘(諱)를 피한 결획(缺劃)이다. 표죽(褾竹)이나 뒤에 축을 달아 권자본 형식으로 장정을 갖추지 않은 것으로 보아 불상의 복장용으로 인출된 것으로 보인다.백련사 소장 『약사유리광여래본원공덕경』은 초쇄본은 아니지만 인쇄 정도가 대체로 선명하고 보관 상태도 양호한 편이다. 이 책과 동일한 인본(印本)이 하나는 보물로 지정되어 있고, 또 하나는 경상남도지정 유형문화재로 지정되어 있다. 초조본 대장경의 희귀성이라는 점에서 볼 때 서지학 및 대장경 연구에 귀중한 자료이다.
초조본 대장경이 희귀하기 때문에 백련사에 소장된 약사유리광여래본원공덕경은 서지학 및 대장경 연구에 귀중한 자료이다.