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호국지장사 대웅전에 모셔진 목조여래좌상은 전체적으로 조선시대의 전형적인 불상 양식을 따르고 있다. 불상의 내부에 봉안되어 있던 조성발원문 등의 복장물 대부분이 산일되어 현재 불상과 후령통, 저고리 등이 남아있으나, 조성발원문은 전하지 않는다.  목조여래좌상은 얼굴의 이목구비에서 풍기는 인상이나, 오른쪽 어깨와 하반신에 걸친 대의자락에 자연스러운 볼륨감이 표현된 점에서 임진왜란을 전후한 시기에 제작되었을 가능성이 높다. 불복장 유물인 후령통은 제작기법과 형태면에서 1639년에 제작한 수덕사 목조석가여래삼불좌상의 은제 후령통과 형태, 제작수법이 동일하여, 제작 시기를 1639년 전후로 추정이 가능하다. 따라서 후령통과 불상의 제작 시기가 유사하다.
호국지장사 대웅전에 있는 목조여래좌상은 조선시대의 불상의 양식을 따르고 있으며 얼굴의 이목구비 등을 보아 임진왜란 전후한 시기에 제작됐을 가능성이 높다.