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특별검사의 수사대상은 한나라당 대통령후보 이명박이 관여한 의혹을 받고 있는 BBK 주가조작 사건 등 증권거래법 위반 사건, 공금 횡령 등 특정범죄가중처벌 등에 관한 법률 위반 사건, (주)다스의 지분 96%인 시가 930억 원 상당의 재산 누락신고 등 공직자윤리법 위반 사건, 같은 내용의 공직선거법상 허위재산신고 사건 및 위 사건과 관련한 검찰의 피의자 회유 협박 등 편파 왜곡 수사 및 축소발표 의혹과 그 배후에 관련된 의혹사건이다.국회의장은 이 법 시행일부터 2일 이내에 대통령에게 특별검사 임명을 서면으로 요청하고, 대통령은 임명요청을 받은 날부터 2일 이내에 대법원장에게 후보자추천을 서면으로 의뢰하고, 대법원장은 의뢰서를 받은 날부터 3일 이내에 10년 이상 법원조직법 제42조제1항제1호의 직에 있던 변호사 중에서 2인의 특별검사후보자를 대통령에게 서면으로 추천하여야 하고, 대통령은 특별검사후보자추천서를 받은 때에는 추천서를 받은 날부터 3일 이내에 추천후보자 중에서 1인을 특별검사로 임명한다.특별검사는 정치적으로 중립을 지키고 독립하여 그 직무를 수행하여야 한다.특별검사는 제2조의 사건과 관련된 수사와 공소제기 여부의 결정 및 공소유지를 담당하며, 제2조의 사건과 관련되지 아니하는 자를 소환조사할 수 없으며, 특별검사는 그 직무를 수행함에 있어서 필요한 경우에는 대검찰청, 경찰청 등 관계 기관의 장에게 제2조의 사건과 관련된 사건의 수사기록 및 증거 등 자료의 제출, 수사활동의 지원 등 수사협조를 요청할 수 있으며, 그 직무를 수행함에 있어서 필요한 경우에는 대검찰청, 경찰청 등 관계 기관의 장에게 소속 공무원의 파견근무와 이에 관련되는 지원을 요청할 수 있다.
특별검사의 수사대상은 증권거래법 위반 사건, 공직자윤리법 위반 사건 등의 사건이며 국회의장은 특별검사 임명을 서면으로 요청하고 대통령은 추천후보자 중 1인을 특별검사로 임명한다.