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당초 2000년 7월 1일 시행될 예정이었으나 1개월의 계도기간을 거쳐 8월 1일부터 본격 시행된 의약분업에 대해 이후로도 의료계의 반발이 계속되었다. 그러나 의료계의 장기 휴폐업에 따른 국민 여론 악화로 의료계와 약계는 조속한 해결노력이 필요함을 인식하고, 2000년 11월 11일 의약분업을 둘러싼 현안들을 해결할 수 있는 기본 틀을 담은 의약정 합의를 도출하였다.증시 폭락과 기업구조조정2000년 개장일인 1월 4일 증권거래소의 종합주가지수는 1,059.04로 국제통화기금(IMF)관리체제 이후 가장 높은 수준에서 출발했으나 연말에는 연초대비 52.4% 하락한 504.62를 기록하였다. 코스닥지수는 2000년 3월 10일 사상 최고치인 283.44를 기록하였으나 연말에는 81.4%가 폭락한 52.58에 지나지 않았다.주식시장이 크게 위축된 원인은 1999년 대우사태가 발생한 뒤 이의 수습과 2000년 413총선 등 정치일정의 영향을 받은 데다 금융구조조정과 비교해 상대적으로 기업구조조정이 부진하였던데 있었다. 이 과정에서 현대그룹의 2세 경영인 간 갈등은 재벌의 전근대적 지배구조 개선의 필요성을 제기하였으며, 정부는 11월 3일 52개 기업을 청산 등의 방법으로 퇴출시키고 287개 부실징후기업 가운데 회생 가능성이 있는 것으로 판정된 97개 기업에 대해서는 주채권은행이 책임지고 정상화시키기로 하는 획기적 기업구조조정을 단행하였다.
의료계와 약계는 의료계의 장기 휴폐업에 따른 국민 여론 악화를 해결하기 위한 의약정 합의를 도출하였다.