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 다음으로 의료기관의 지속적인 융자 지원금 추가 지원 요구를 반영하여 경영상 어려움을 겪고 있는 의료기관이 유동자금을 확보할 수 있도록 3차 추가경정예산 등을 통해 현재 4,000억 원 규모인 의료기관 융자 지원금을 추가 마련하도록 노력할 예정이다.
  연 2.15% 변동금리, 특별재난지역은 연 1.9% 고정금리
 5월 7일 기준 총 1,581개 의료기관에게 1,370억 원을 대출했으며, 6월 초까지 4,000억 원 전액의 융자 지원을 완료하기 위해 예산 전액을 은행에 배정해 둔 상황이다.
  이 중 감염병전담병원은 9개소, 135억 원 융자 신청
 그간 정부는 코로나 19 대응을 위해 수고하는 의료기관 지원을 강화하기 위해 건강보험 수가를 인상하고 행정편의를 제고하기 위한 노력을 지속해 왔다. 
 중환자 치료에 필요한 음압격리병상을 충분히 확보하기 위해 코로나19 환자 음압격리실과 중환자실 수가를 3월 23일 인상했으며 3월 24일부터는 국민안심병원 감염예방관리료 격리관리료 요양병원과 정신병원 폐쇄병동의 입원환자 감염예방관리료(입원일당 1,150원)를 적용해 왔다.
  코로나19 환자에 대한 중환자실 내 음압격리실 관리료 100% 인상 음압격리실 입원료 20% 인상 중환자실 입원료 6~10% 인상
 아울러 선별진료소 인력 파견 등으로 인력시설이 변동되더라도 변경 신고를 유예하며, 각종 수가 산정에 종전(‘19년 4분기) 인력시설 현황을 적용하고 의료기관 현지조사와 적정성 평가 등도 연기하도록 하였다.

정부는 코로나 19 대응을 위해 수고하는 의료기관 지원을 강화하기 위해 노력했고 코로나19 환자 음압격리실과 중환자실 수가를 인상했다.