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 이에 중앙재난안전대책본부는 감염병 전담 의료기관을 대상으로 손실보상 신속 지급 융자지원 확대 건강보험 특별 재정지원 등을 추진하기로 결정하였다.
 먼저 감염병전담병원의 운영상 어려움을 해소하기 위해 당초 6월 예정이었던 손실보상 2차 개산급 지급을 5월로 앞당겨 실시하고, 매월 개산급을 산정하여 조속한 재정지원을 추진할 방침이다.
  감염병예방법에 따라 병상확보 조치이행 또는 폐쇄업무정지 이행에 따른 미사용 병상 손실 지급
  개산급(槪算給) : 지급액이 확정되지 않은 금액을 어림셈으로 계산하는 방법
 1차 개산급(4.9.)은 ‘빈 병상 손실분’에 대해서만 지급하였으나, 2차 개산급 지급 시에는 빈 병상 손실뿐 아니라 ‘환자치료 병상에서 발생한 손실분’까지 지급범위를 확대하기로 하였다  
   병원급 의료기관 146개소 대상, 총 7,000억 원 중 1,020억 원 지급 
 또한 금융기관 메디컬론 이용 등으로 건강보험 선지급 대상에서 제외되어 온 의료기관 중 감염병전담의료기관 및 환자 경유로 일시 폐쇄된 기관에 대해서는,
  전년도 동월 건강보험 급여를 우선 지급(‘20.3~6월)하고 사후에 정산(’20.7~12월)하는 제도
  (선지급 현황) 총 5,039개 기관 1조7602억 원 지원 완료 (5.7일 기준) 
 ‘건강보험 특별 재정지원(약 2,000억 원)’을 실시하여 5월 중 전년도 동월 급여비 전액을 우선 지급하고 사후에 정산할 예정이다.
 이와 함께 선지급 미신청 공공병원(지방의료원 등) 전체에 선지급 신청을 개별 안내하여 운영이 어려운 기관이 적극적으로 선지급 제도를 활용할 수 있도록 할 방침이다.

중앙재난안전대책본부는 감염병전담병원을 대상으로 손실보상을 신속 지급하고 매달 개산급을 산정해 조속한 재정지원을 추진하기로 했다.