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 또한, 집중발생지역은 중앙에서 전문가를 파견하여 현장조사를 추진하게 되며, 농식품부, 검역본부(역학조사), 지자체, 농협 등 유관기관간 협력체계도 강화하게 된다.
< 긴급 현장조사 >
 (충주지역) 오염지점이 될 수 있는 충주지역은 빠른 대응을 위해서 68명의 전문인력을 투입하여 사과․배 전체 농장에 대한 조사를 추진하고 있다.
  농업경영체에 등록된 충주지역 사과․배 재배농가는 2,455농가 1,355ha
 5월 27일부터 29일까지 3개 읍면 569개 농장 243ha를 대상으로 1차 조사한 결과 54개 농장에서 의심증상이 확인되었고, 6월 5일까지는 농가의 협조를 얻어 충주지역 전체 농장을 조사할 계획이고, 조사결과 확진농가는 지침에 따라 신속히 방제를 해나갈 계획이다.
 (영주 등 발생우려지역) 이번에 처음 의심신고가 접수된 영주시와 인근지역인 문경, 예천, 봉화 등 경북의 사과 주산지 농장에 대해 5월 30일부터 인력 28명을 투입하여 신속하게 조사하고 있다.
 한편, 처음 발생한 익산은 발생지점에서 100m 이내에는 과원이 없고, 2km 반경 8 농장에 대해서 긴급 조사를 마쳤으며 추가로 5km 반경 13 농장에 대해서 예찰을 실시하고 있다.
 (전국 예찰) 또한, 6월 8일부터 19일까지 특별관리구역(9개시군) 등 전국의 사과․배 농장을 대상으로 예찰을 실시할 계획이다.
  특별관리구역(9) : 아산, 공주, 청주, 괴산, 문경, 예천, 영주, 봉화, 세종
< 현장 방제수요 반영 >
 (확진절차 간소화) 충주와 같이 발생이 많은 지역은 현행 확진절차를 간소화하기로 하였다.

처음 의심 신고가 접수된 영주시와 인근 지역에 대해 인력을 투입하여 신속하게 조사하고 있다.