피조개의 유전적 다양성을 위해 제한효소와 RFLP 등으로 DNA 단편을 조사하고 그에 대한 marker를 개발해야한다.
<p>피조개, Scapharca broughtonii Schrenck는 돌조개과(Arcidac)에 속하며 한국뿐만 아니라 중국, 일본 내만에 주로 서식하는 종으로, 우라나라 조개류 양식산업 중 굴과 더불어 매우 중요한 유용수산생물이며 오렌 양식역사를 가지고 있다. 그러나 인구증가와 산업화의 발달로 피조개 양식어장이 오염되고 연작으로 인한 생산량 감소로 많은 어려움에 당면해 있다. 더욱 큰 문제는 피조개 인공종묘생산 기술개발로 경제적으로 대량생산을 할 수 있으나, 유전학석으로 보면 동일한 모패 유전자형의 유입으로 집단 내의 유전자 다양도가 떨어지고 점차 유전적 열성화로 진행될 수 있다. 그러나 여기에 관한 기초 유전학적 연구는 양식기술 연구에 비하여 많이 미약하다. 최근, 국내산 피조개의 유전자 다양도 지수가 중국산에 비하여 떨어지는 이유를 인공양식에 의한 inbreeding으로 설명하고 있다. 앞으로 우리나라 연안에 서식하고 있는 피조개의 유전적 양상은 지리적 격리에도 불구하고 natural hybridization보다 artifical hybridization으로 집단내의 유전자 다양도가 떨이지고, 집단과 집단 간의 유전자 거리도 낮아 질 가능성도 많다. 따라서 피조개의 제반형질에 관한 유전현상 규명과 유전자원의 수집, 분류 및 평가의 중요성이 대두될 수 있고, 품종육성을 위한 중요형질의 선발 기술에 대한 사항도 주요 관심사항으로 떠오를 수 있다. 가장 기본적인 사항으로 분류의 객관성과 정확성을 기하기 위하여 이 분야의 새로운 방법을 개발 이용하는 것이 중요한 사항이다.</p> <p>RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)는 제한효소로 절단 부위의 위치를 변화시켜 유전자의 삽입, 결실, 재배열 등의 변화를 알 수 있기 때문에 동물이나 식물 유전학에 유용한 정보를 제공하고 있다. 또한 유전자의 발현부분(exon)뿐만 아니라 비발현 부위(intron)와 근접부위(flanking region)의 변화를 알 수 있다. 특히 DNA 염기서열상 자연 돌연변이에 의한 염기 하나의 차이로도 유전자 변이를 식별할 수 있다. 이러한 RFLP 장점을 이용하여 부패균의 신속한 확인, 누에 마커 개발, 한우의 유전자형 변이, 인삼 DNA 분석 등 다양한 분야에 적용하고 있다. Lee et al.은 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)에 의한 DNA 절편으로 중국산과 한국산과의 유전적 차이점을 조사한 바 있고, Lee and Kim도 미토콘드리아의 cytochrome c oxidase subunit I(COI) 부위를 증폭시켜 RFLP로 S.broughtonii와 형태적으로 매우 유사한 S. satowi Dunker, S. subcrenata Lische 종 구분에 매우 유용한 도구라고 언급한 바 있다.</p> <p>RFLP 분석 시 probe 선발이 선행되어야 하는 제한 때문에 최근에는 특정부위를 증폭시켜 제한효소를 이용하여 DNA단편 양상을 조사하고 있다. 미토콘드리아 DNA(mtDNA)는 핵 DNA보다 진화속도가 빠르고 모계유전 특성 때문에 유전학적 계통연구에 밚이 사용되고 있는 관계로, 이 실험에서도 mtDNA의 16S rRNA gene을 여러 제한효소로 절단하여 그 양상을 조사하여 한국산과 중국산 피조개의 species-specific molecular marker을 개발하는 것이다. 피조개의 종내(intra-species)와 종간(inter-species)의 mtDNA 다형 현상 분석을 통한 계통유전학적 유연관계를 분석하고, 차후 유전적 열성화를 대비한 품종개량을 위한 열성 유전자를 분리 및 품종 다양성을 검토하기 위한 기초연구의 일환으로 genome DNA의 특성을 조사할 수 있는 marker 개발이 필수적이므로 이에 관한 연구를 수행하였다.</p>