인플루엔자바이러스 A/H1가 가진 N-linked glycosylation site는 여러 백신주와 같은 양상을 보이나 A/Busan/J128/2008분리주의만 NAP가 NAS로 바뀌어 8개의 glycosylation site를 가지고 있음을 알 수 있다. 한편 인플루엔자바이러스 A/H3은 약 150개의 NNS가 DNS로 바뀌어 glycosylation site를 10개 가지고 있었다. 인플루엔자바이러스 B는 2007년과 2008년 분리주가 2008~2009년 절기 백신주인 B/Florida/4/2006와와 상당히 비슷한 아미노산배열을 나타냄을 확인했다.
<h2>분리된 인플루엔자 바이러스의 HA 아미노산 분석</h2> <p>인플루엔자바이러스 A/H1의 N-linked glycosylation site는 14(NNS), 27(NVT), 58(NCS), 91(NGT), 129(NHT), 163(NLS), 290(NSS)에서 모든 백신주와 동일하였으나 A/Busan/J128/2008분리주의 경우 272번째 부위의 NAP가 NAS 로 치환되어 있어 백신주를 포함한 대부분의 분리주가 7개의 glycosylation site를 가지는 것에 반해 8 개의 glycosylation site를 가지고 있었다. Kim 등[11]이 발표한 2002년 국내 인플루엔자 분리주와 비교해 보면 A/Seoul/15/2002 외의 모든 분리주는 7개의 glycosylation sites를 가져 비슷한 양상을 보였으며, conserved receptor binding sites도 모두 보존이 잘 되어 있었다. H1에는 항체와 결합하는 두 개의 strain-specific 부위(Sa and Sb와 common-antigenic 부위Ca and Cb가 존재하는데, 분리주에서는 백신주와의 비교 시 5곳에서 아미노산 치환이 관찰 되었다. Ca site 중 Asn (N)/Lys (K)-171, Glu (E)/Lys (K)-173에서 1개의 분리주와 2개의 분리주가 다른 양상을 보였고 Sb site 중 Lys (K)/Met (M)-192, Ala (A)/Thr (T)-193, Thr (T)/Lys (K)-197에서 모든 분리주가 백신주와는 다른 양상을 보였다.</p> <p>인플루엔자바이러스 A/H3의 경우, N-linked glycosylation sites는 15개의 분리주에서 NST), 22(NGT), 38(NAT), 63(NCT), 122(NES), 126(NWT), 133(NGT), 144(NNS), 165(NVT), 246(NST), 285(NGS)인 11개의 위치에서 2008~2009 절기의 백신주와 동일하였으며, A/Busan/F128/07분리주의 경우는 144부위의 NNS가 DNS로 치환되어 10개의 glycosylation site를 가지고 있었다. 2006~2007년 타이완에서 분리된 A/H3의 경우도 11개의 부위에서 모두 같은 양상을 보였으며 치환된 아미노산은 없었다[7]. 5개의 conserved receptor binding sites는 모두 보존이 잘 되어 있었으며 A/H3의 항원 부위인 A, B, C, D, E 중 A 부위의 lle (I)/Lys (K)-140, Arg (R)/Gly (G)-143, Asn (N)/Asp (D)-144, B 부위의 Leu (L)/Ser (S)-157, Lys (K)/Arg (R)-158, E 부위의 Asn (N)/Lys (K), Gln(Q)-173 아미노산 변화가 관찰 되었으며 C와 D부위에서는 아미노산 변화가 관찰되지 않았다.</p> <p>인플루엔자바이러스 B의 경우, HA가 Victoria lineage인 2주의 분리주를 제외하고는 2007년과 2008년 분리주 모두 2008~2009년 절기 백신주인 B/Florida/4/2006와와 유사한 아미노산배열을 나타내었다. 항원형 결정에 중요한 역할을 하는 N-linked glycosylation sites는 Victoria lineage와 Yamagata lineage에서 모두 4부분을 가지고 있었다. 이 4부분은 25(NVT), 59(NCT), 145(NAT), 197(NKT)에 위치하고 있었으며 Victoria lineage인 2개의 분리주와 B/Malaysia/2506/2004는 145와 197 위치에서의 아미노산 배열이 NVT와 NET이었을 뿐 site의 수는 4개로 동일하였다. 그러나 2008 2009 절기 백신주인 Florida/4/2006은 Asn (N)/Asp (D)-197로 변환되어 3개의 glycosylation site를 가지고 있어 본 연구의 분리주들과는 다른 양상을 보였다. Conserved receptor binding sites인 Phe (F)-95, Trp (W)-158, His (H)-191, Try (Y)-202 (B/ Yamagata/16/88 numbering)는 치환되지 않고 잘 보존되어 있었다(Fig. 6, 7)[15]. B의 항원부위인 120 loop, 150 loop, 160 loop, 190 helix 중에서 120 loop에서는 분리주와 백신주 (B/Florida/4/2006) 모두 아미노산이 일치하였고, 190 helix는 분리주에서 모두 같은 아미노산을 가졌으나 백신주인 B/ Florida/4/06과 비교 시 분리주와 1개의 아미노산에서 Lys (K)/Asp (D)-196 치환을 보였다. 150 loop에서는 4개의 분리주에서 Ser (S)/lle (I)-150 치환이 나타났으며, 160 loop에서는 150 loop에서 치환이 나타났던 분리주에서만 Asn (N)/Try (Y)-165 치환이 나타났다.</p>