다형성 정도가 높은 ISSR marker 중에서 가장 효과적으로 품종식별 분자표지인자로 알려진 SSR marker가 개발된다면 수박 유통품종에 대해 더욱 세밀하게 유전적 근연관계를 추정할 수 있을 것이다.
<h2>품종간 유연관계 분석</h2> <p>ISSR marker를 이용하여 수박 18품종에 대한 유전적 유연 관계를 조사한 바, 공시품종의 전체 유사도 지수는 0.34~1.00의 범위로 나타났으며, 유사도 지수 0.42를 기준으로 할 때 18개 품종은 2개 그룹으로 뚜렷하게 구분되었다. 제 1그룹은 수박 유전자원 6품종과 국내 종묘회사에서 육성된 10개 품종이 포함되었으며, 제 2그룹에는 'PI189225'와 'PI1296341-FR'이 속하였고 이들 품종간의 유사도 지수는 0.70으로 나타나 유전적으로 큰 변이가 있는 것으로 분석되었다. 제 1 그룹에 포함된 외국 수집종들의 경우 유전적 유사도 지수가 0.75~0.96을 나타내어 이들 품종들의 유전적 변이는 비교적 큰 것으로 조사되었다. 그러나 국내에서 육성된 품종의 경우 유전적 유사도가 0.95~1.00 범위로 나타났으며, '지구촌'과 '금보', '하복꿀'외 4품종 및 '삼복꿀'과 '찬찬'은 이들 marker에 의해 구분이 되지 않을 정도로 유전적 유사도가 높았다. 그러나 수박의 형태가 원형인 '빛나', '지구촌', '금보'는 타원형계인 다른 품종들과 유전적 유사도 값 0.96에서 구분되었다. 따라서 본 연구에 다형성을 나타내는 ISSR marker 58개에 의해 수박의 과실 형태를 뚜렷하게 구분할 수 있음을 확인할 수 있었다.</p> <p>수박의 품종간 유전적 유연관계를 추정하는 데는 형태적 특성이나 DNA marker를 이용하는데, 형태적 특성의 경우 대부분의 조사형질이 환경의 영향을 많이 받는 양적 유전자이기 때문에 재배방법, 기상환경 등과 같은 요인에 의해 정확한 형질을 평가하기는 상당히 어려운 실정이다. 또한 박과 작물 대부분은 과형, 과색, 종자특성과 같은 형질만으로 유전자원의 평가 및 품종 특성을 분류하여 왔기 때문에 근연관계에 있는 품종의 특성조사에는 적합하지 않은 것으로 알려져있다. 그러나 DNA marker에 의한 분석방 법은 환경의 영향을 전혀 받지 않는 장점이 있으나 박과 작물인 수박의 경우 genome의 크기가 다른 작물에 비해 크기 때문에 다형성을 보이는 marker의 개발이 단순하지 않을 뿐만 아니라 근연관계에 있는 품종을 식별하기가 상당히 어려운 것으로 알려져 있다. 본 연구에서도 수박을 ISSR marker로 분석하였을 때 몇몇 외국 품종을 제외하고 국내 육성된 대부분 품종들의 유전적 유사도가 \( 95 \% \)이상 높게 나타나 수박 품종을 DNA marker로 분석하기에는 단순하지 않음을 확인할 수 있었고, 국내에서 육성된 수박 품종 육성에는 근연관계에 있는 계통을 양친으로 활용할 수 있음을 추정할 수 있었다.</p> <p>앞으로 본 연구에서 다형성 정도가 높게 나타난 ISSR marker 중에서 GA나 CT를 target repeat로 하여 품종식별에 가장 효과적인 분자표지인자로 알려진 SSR marker가 개발된다면 수박 유통품종에 대한 보다 세밀한 유전적 근연관계를 추정할 수 있을 것으로 사료된다</p>