7개의 exon에서 발견된 염기서열은 남미 자생의 A 알파 3 mating locus의 Y3와 96% 이상의 homology를 나타내며, AR, HD, BR, 그리고 Ser에서 각각 약 97%, 99%, 97%, 95%의 높은 homology를 보였다. 다만, A 알파 mating allele gene의 Y1, Y4, Y5, Y6-region들과는 41-49%의 낮은 homology를 보였다. 특히, homeodomain motif는 약 98%의 homology를 나타내어 높은 유전적 보존성을 확인했다. 이는 남미와 북 미에서 자생하는 같은 mating allele type 간에 염기서열에서 상당히 높은 형태의 유전적 보존이 이루어지고 있음을 나타낸다. 추가로, homeodomain은 Drosophila의 antennapedia protein 및 Ustilago maydis의 mating-type polypeptide (bE2 & bW) 등에서도 비슷한 구조를 가지는 것으로 알려져 있다.
<p>7개의 exon에서의 염기서열은 남미자생의 1-71 \( \mathrm { A } \alpha 3 \) mating locus의 Y3에 대하여 거의 \( 96 \% \) 이상에 이르는 ho-mology를 나타내었으며, 부분적으로 AR (acidic rich region) 에서 약 \( 97 \%, \mathrm { HD } \) (homeodomain)에서는 약 \( 99 \%, \mathrm { BR } \) (basic rich region)에서 약 \( 97 \% \), 그리고 Ser (serine rich regon)에서 약 \( 95 \% \) 의 높은 homology를 나타내어 지역간에 유전자상의 큰 변화는 나타나지 않는 것으로 확인되었다. 또한 Fig. 2 에서는 blast program을 이용한 tra:slated polypeptide sequence결과를 나타내었으며 이를 자생지가 다른 남미산 S. commune \( \mathrm { A } \alpha 3 \) mating locus내의 Y-region을 비롯하여 다른 \( \mathrm { A } \alpha \) alleles내의 Y-region과 비교 분석한 결과이다. Table 3에서의 homology 분석결과를 삽펴보면 남미산 \( \mathrm { A } \alpha \) 3의 Y3-region과는 약 \(97 \% \)의 높은 homology를 나타내고 있지만 그 외 \( \mathrm { A } \alpha \) mating allele gene, 즉 \( \mathrm { Y } 1 \) , \( \mathrm { Y } 4 \)-region, \( \mathrm { Y } 5 \) -region, \( \mathrm { Y } 6 \)-region과는 \(41 \sim 49 \% \)의 낮은 homology로 mating activity에 관여하.고 있는 것으로 나타났다. 특히 mating에 있어 transcription regulator로 알려진 homeodomain motif에서는 야 \( 98 \% \) 의 homology가 나타남으로서 Z-region 의 \(74 \% \)에 비하여 지역간에 상당히 높은 유전적 보존성이 확인되었다. 또한 남미의 \( \mathrm { Y } 3 \) 와는 \( \mathrm { AR } \) 에서 \( 97 \%, \mathrm { BR } \) 에서 \( 100 \% \) 그리고 Ser에서도 \( 98 \% \) 의 상당히 높은 homology를 지니고 있음도 확인하했다(Table 3). 이러한 결과는 남미와 북미에 자생하는 같은 mating allele type간 에 염기서열에 있어 상당히 높은 형태의 유전적 보존이 이루어지고 있음을 추측할 수 있으며, 특히 homeodomain motif에서는 \( \mathrm { Y } 1 \) 을 비롯한 다른 mating allele gene과도 \( 85 \% \) 이상의 높은 homology를 나타내었으며 그 외 \( \mathrm { AR } , \mathrm { BR } \), Ser 부위에서는 \( 10 \sim 50 \% \) 에 이르는 낮은 비율로 나타났다. 특히 결정된 염기서열중에서 homeodomain은 helix-turn-helix 형태의 배열에 관련된 구조들은 Drosophila의 antennapedia protein에서 그리고 Ustilago maydis의 mating-type polypeptide (bE2 \& bW) 등에서도 비슷하게 나타나고 있는 것으로 알려져 있다.</p>