우리나라의 양돈업에서는 분자유전학적인 기법을 이용한 돼지의 품종구별은 KIT과 MC1R을 이용해서 많은 연구들이 이루어져 있다. 인간을 포함한 포유류의 계통유전학적, 진화학적 유연관계의 분석에 있어서 mtDNA는 유용한 표지인자로서 사용되고 있어 본 연구는 돼지의 품종별로 11-bp 중복현상의 분포 양상을 파악하고, 이와 연관하여 품종특이적인 DNA marker의 개발을 위한 기초 자료를 제공하고자 수행하였다.
<h1>서 론</h1> <p>우리나라의 양돈업에서는 품종 간의 교잡을 통하여 육질 및 생장형질 등 우수한 비육돈의 생산을 위해 노력하고 있으며, 이에 Landrace, Large White 및 Duroc 등 순종들을 사용하고 있다. 생산체계의 신뢰성을 유지하기 위해서는 순수한 순종혈통을 유지하고 공급할 수 있는 기반이 정착되어야 하며, 순종선발에 있어서 기존의 표현형에 근거한 선발보다 더욱 정확하고 신뢰성 높은 선발방법의 개발 및 활용이 절실히 필요한 실정이다. 또한 생산지에서 사육되고 있는 돼지의 품종들은 외형상으로 확인이 가능한데 반해 도체 후의 정확한 판별이 불가능하다는 약점을 이용하여 발생하는 일부 부정유통사례의 방지를 위해서도 표현형적 판별과 병행하여 유전자형을 이용한 유전적 표지인자의 개발이 시급하다.</p> <p>분자유전학적인 기법을 이용한 돼지의 품종구별은 KIT과 MC1R을 이용해서 많은 연구들이 이루어져 있다. KIT 내부의 유전자형에 근거하여 유색품종과 백색품종을 구별할 수 있다고 보고되어 있으며, MC1R의 분석을 통해서 각각의 품종들이 5개의 유전자형에 속함이 밝혀졌다. 그러나 품종구별을 위해서 이 두 유전자를 제외한 접근은 거의 전무한 실정이다.</p> <p>인간을 포함한 포유류의 계통유전학적, 진화학적 유연관계의 분석에 있어서 mitochondrial DNA (mtDNA)는 유용한 표지인자로서 사용되고 있다. MtDNA는 특이적으로 모계유전형태를 보이고, 재조합 현상이 발생하지 않으며, 핵 DNA보다 10배 이상 높은 염기변이율을 보인다. 특히, D-loop 부위는 mtDNA 내부의 다른 부위에 비해서 더욱 높은 염기변이율을 나타낸다. 이런 이유에 근거하여 mtDNA는 DNA다형성에 근거한 종간의 분석뿐 아니라 종내 계통 및 개체간 식별에도 유용하게 사용되고 있다.</p> <p>돼지의 mtDNA D-loop 지역 내에는 특징적인 두 부위가 존재한다. 첫째는 10-bp (TACACGTGCG)가 반복되는 tan-dem repeat region으로서, 돼지뿐만 아니라 말, 사슴, 상어등 다양한 종에서 보고가 되어 있지만, 특징적으로 돼지에서는 14 회에서 29회까지의 반복수가 개체 내에서 다양하게 나타나는 heteroplasmy 현상으로 보고되어 있다. 둘째는 11-bp (TAAAACACTTA)가 중복되는 부위로서, 이 중복현상은 일본재래돼지인 Satsuma에서 최초로 보고되었 으며, 그 후 Duroc 품종에서도 보고되었다. 하지만, 이 두 품종을 제외한 다른 품종에서는 밝혀져 있지 않을 뿐 만 아니라, 여러 돼지의 품종별 분포양상 역시 보고되어 있지 않다.</p> <p>따라서 본 연구는 돼지의 품종별로 11-bp 중복현상의 분포 양상을 파악하고, 이와 연관하여 품종특이적인 DNA marker의 개발을 위한 기초 자료를 제공하고자 수행하였다.</p>