MS marker는 게놈 전체에 분포하며 유전적 다양성이 높아 다양성 및 유연관계 분석에 널리 사용되고 있으며, 이 유전자형 분석은 개체 식별 및 친자확인을 위한 주요 방법으로 채택되었다. 또한, 국민소득 상승으로 축산물 소비에서는 재래종에 대한 선호도가 증가하고 있다. 따라서 이 연구에서는 토종닭 순계 집단과 토종닭 실용계, 외래품종을 대상으로 MS marker의 유전다양성을 분석하여 유전적 특성을 파악하고, 이를 기반으로 원산지 추적 시스템의 개발에 활용하기 위해 연구를 수행했다.
<h1>서 론</h1> <p>최근 조류인플루엔자 발생과 광우병 등과 같이 축산물 안전성에 대하여 국민적 관심이 어느 때보다 높아지면서 외래종보다는 재래종의 선호도가 높아지고 있다. 또한 근래에 오면서 국민소득과 생활수준의 향상으로 축산물 소비에 있어서도 기호에 맞고 양보다는 질을 찾는 성향이 높아지면서 재래종에 대한 선호도가 증가되고 있다. 이와 함께 토종닭에 대한 관심이 높아지고 증가되는 수요를 위해 사육수가 크게 늘어나고 있는 추세이다. 이러한 수요증가와 함께 재래가축에 대한 유전자원의 관심과 이를 활용한 종자산업의 중요성이 부각되었다. 이에 농촌진흥청 축산과학원은 토종닭 품종의 순수성 확립과 이를 이용한 실용화 및 산업화를 위한 연구가 추진되게 되어 토종닭 순계(Pure Line, PL) 3계통(적갈색, 황갈색 그리고 흑색)의 복원과 토종닭 실용계(Commercial Chicken, CC)을 개발하여 농가에 보급하고 있다. 또한 여러 가지 용어로 불리는 토종닭에 대한 통일된 정의가 필요함에 따라 대표 용어로 토종닭으로 통일하기로 하였으며, 연구보고, 논문 등 학술적 용어로 원종에 대해서는 한국 재래닭(Korean native chicken)의 용어를 사용하여도 무방하도록 하였다. 그러나 토종닭에 대한 이러한 연구와 관심에도 불구하고 국내 토종닭 산업이 자리 잡기에는 아직도 많은 문제점을 안고 있는 것이 사실이다. 토종닭으로 둔갑하여 유통되고 있는 백세미 대닭은 토종닭 유통시장을 더욱 혼탁하게 만들어 이를 타계하기 위한 여러 노력들이 진행되고 있다. 대가축의 경우 유통의 투명성과 체계적인 혈통관리 및 질병차단을 위하여 고유숫자가 기입된 귀표를 활용하여 개체의 식별에 이용하고 있으며 최근 전자칩 등을 통해 개체의 고유정보를 데이터화 하여 유통과정과 연계시키는 다양한 시스템이 시도되고 있다. 또한 귀표의 탈락이나 의도적인 위◦변조의 가능성으로 인해 개체의 진위여부 검증 문제를 해결하기 위해 DNA를 활용한 개체식별이 농림수산식품부 주관으로 2007년부터 한우를 대상으로 시행 되었다. 또한 돼지의 경우도 그 시행이 진행된 것은 아니지만 Microsatellite (MS) marker를 활용한 개체식별 및 원산지추적시스템에 관한 연구가 활발히 진행되고 있는 실정이다. MS marker는 게놈 전반에 걸쳐 분포하는 특성을 가지고 있으며 유전적 다양성이 높아 집단 또는 개체 간 유전적 유연관계 및 다양성을 분석하는데 널리 활용되고 있다. 개체 식별 및 친자확인을 위한 유전자 감식 방법으로 MS marker의 유전자형 분석은 현재 가장 보편화된 분석방법으로 채택되고 있다.</p> <p>닭의 경우 소와 돼지에 비해 사육환경이나 유통과정에 많은 차이가 있어 소나 돼지에서 연구가 진행된 개체식별 및 원산지추적 시스템을 응용 하기에는 다소 많은 어려움이 있는 것이 사실이다. 따라서 집단 또는 품종에 따른 유전적 특성을 구명하여 이를 이용한 원산지추적 시스템의 연구가 필요할 것으로 사료된다. 또한 토종닭의 경우 특정 순계집단에서 생산된 종계를 활용하여 실용계를 생산하기 때문에 종계집단의 유전특성 및 유전적 구조을 활용 한다면 원산지추적 시스템 개발을 위한 접근이 가능할 것으로 사료된다. 따라서 본 연구는 국내에서 복원된 토종닭 순계 집단과 토종닭 실용계 및 외래품종을 대상으로 MS marker의 유전다양성을 분석하여 유전적 특성을 파악하고 이를 활용한 원산지추적 시스템 개발에 기초자료로 활용하고자 실시하였다.</p>