본 논문은 붉은 털 원숭이의 cDNA 라이브러리를 통해 발견한 R54 전사체를 비교 분석한 결과, 인간과 달리 7번 엑손이 존재하는 것을 확인하였다. 또한 RT-PCR을 통해 인간의 조직에서는 \( (150 \mathrm { bp } ) \)의 전사체를 발견했고, 인간 DNA에서 reference sequence로 등록되어 있는 것과는 달리 L2A 서열이 존재하는 길이 \( (324 \mathrm { bp } ) \)의 전사체가 몇몇의 조직에서 발현되는 것을 확인했다.
<h1>결과 및 고찰</h1> <p>붉은 털 원숭이의 뇌 유래의 cDNA 라이브러리를 통해 발견된 R54 전사체를 인간과 침팬지의 등록된 mRNA 서열 alignmnent를 통하여 비교 분석하였다. 원숭이에서는 인간의 4번 엑손이 존재하지 않은 반면에 LINE 가운데 오래된 패밀리 가운데 하나인 L2A의 엑손화 현상으로 인하여, 인간에서는 존재 하지 않는 7번 엑손이 붉은 털 원숭이 R54 전사체에서 발견 되었다(Fig. 1).</p> <p>붉은 털 원숭이에서 L2A서열을 가진 R54 전사체와 L2A 서열이 존재하지 않는 인간의 전사체의 발현 양상을 비교하기 위하여, 붉은 털 원숭이의 6번과 8번 엑손에 해당하는 영역에서 프라이머(Table 1)를 디자인하여 인간과 붉은 털 원숭이의 조직에서RT-PCR을 수행하였다. 그 결과 인간의 조직에서는 L2A의 서열이 빠진 길이 \( (150 \mathrm { bp } ) \)의 전사체가 전 조직에서 발현하였으며(Fig. 2A), 특히 흥미롭게도, 인간 DNA에서 reference sequence로 등록되어 있는 것과는 달리 L2A 서열이 존재하는 길이 \( (324 \mathrm { bp } ) \)의 전사체가 몇몇의 조직 (Kidney, Liver, Fetal liver, Placenta, Prostate, Salivery gland, SK-muacle, Spinal cord, Thymus, and Thyroid gland) 특이적으로 발현되는 것을 확인하였다. 또한 붉은 털 원숭이 조직에서의 발현을 비교해 본 결과 전 조직에서 발현하며, 몇몇의 조직에서는 강하게 발현하는 것을 확인할 수 있었다(Fig. 2B). 그러므로, 붉은 털 원숭이를 비롯한 인간의 \(CCDC94 \) 유전자의 경우, 붉은 털 원숭이의 7번 엑손에 해당하는 영역의 L2A의 삽입은 L2A의 내부의 서열에 의해 alternative splicing을 야기하여 대체 전사체가 조직 특이적인 발현을 야기하는 것으로 추측된다(Fig. 3).</p> <p>EST (Expressed Sequence Tags)와 cDNA와 genomic DNAs의 비교분석은 cassette exon을 포함한 alternative splicing을 예상할 수 있다. 인간과 마우스 사이에서 잘 보존되어 있지 않은 alternatively spliced exons이 나타날 확률이 잘 보존된 alternatively spliced exons이 나타날 확률보다 세 배 더 높은 것으로 보고 되고 있으며, 불규칙한 splicing으로 부터 형성된 잘 보존되어 있지 않은 대부분의 alternative spliced exons은 기능을 하지 않는 것으로 보이나 그들의 진화적인 역할은 중요함에 틀림없다. 새로운 스플라이싱 전사체는 각 조직에 있어 긍정적인 효과(positive effect)를 가져올 수 있으며 진화 과정 동안 고정된다. 예를 들면 \( ADA R B 1 \) 유전자의 Alu유래의 exon은 진화과정 동안 인트론에 삽입되어 새로운 alternative spliced exon으로 고정되었다. 이러한 엑손들은 새로운 단백질을 생성하기 위한 driving force로 작용하여, 진화과정 동안 종 분화를 촉진하는 역할을 할 수 있다. 따라서, 유전자의 암호화 서열 영역(coding sequence region)에서의 이러한 이벤트는 진화 과정 동안의 조직 특이성과 같은 다른 기능들에 있어서의 다양성의 획득뿐만 아니라, 도메인의 변화에 따른 유전자 기능에 영향을 미칠 수 있다. 더불어 이러한 이벤트에 따른 기능의 변화는 때때로 질병 및 위 유전자화(psuedogenization)를 야기할 수도 있다.</p>