33개의 Alpha-proteobacteria 분리균이 동정되었으며, 이 중 31개는 Rhodobacteriaceae과에, 2개는 Sphingomonadaceae과에 속했다. 그 중 42%의 분리균은 새로운 종의 가능성이 있는 것으로 판명되었다. Epsilon-proteobacteria는 주로 동물의 소화관이나 극한 환경인 심해저 화산 열수구에서 발견됨을 확인하였다.
<p>Alpha-proteobacteria는 17속에 속하는 22종 33개의 분리균이 부분 동정되었다. Alpha-proteobacteria는 31개의 분리균이 Rhodobacteriaceae과에 속했고, 2개의 분리균이 Sphingomonadaceae과에 속했다. 이 결과는 바닷물로부터 분리한 alpha-proteobacter 는 Rhodobacteriaceae과와 Sphingomonadaceae과가 우점을 차지하고 있다는 다른 지역의 분석 결과와 일치하는 분포를 보이고 있다. Rhodobacteriaceae과와 Sphingomonadaceae과 모두 해양 Roseobacter 계통(alpha-3 subclass)에 속하는데, Roseobacter 계통은 특히 해양의 해안가와 극지방의 해양에서 배양할 수 미생물 중 약 \( 25 \%\) 를 차지한다고 알려져 있다. 독도의 해안가에서 배양되는 미생물의 군집에서 분리된 alpha-proteobacteria는 모두 Roseobacter 계통으로 전체 염기서열 분석된 분리균의 약 \( 20 \%\)(33/163)를 차지하고 있었다. Roseobacter 계통은 호기성 비산소성 광합성을 담당하고, 온실 가스인 일산화탄소의 산화를 할 수 있어서 지구의 탄소와 황 순환에 중요한 역할을 하고 있다고 한다. Alpha-proteobacteria는 10종이 분리된 Phaeobacter 속이 우점속을 차지하고 있었고 나머지 분리균들은 특별히 우점속을 차지하지 않았고 다양한 alpha-proteobacteria에 속하는 분리균들이 동정되었다. 분리균 2007년 9월 시료에서 분리된 udc336과 udc337은 Sulfitobacter pontiacus로 동정되었는데, Sulfitobacter pontiacus는 아황산염과 일산화탄소를 산화 할 수 있고, 방향족 화합물을 분해 할 수 있는 roseobacter 계통에 속하는 균주로 알려졌다. 2008년 4월 시료에서는 아황산염의 산화능력이 있고, 바다 양식에서 독성을 가지는 세균에 항균활성이 있다고 보고된 Phaeobacter 속이 우점속을 차지하고 있었다. 2008년 6월 시료에서는 가장 많은 17개의 alpha-proteobacteria가 분리되었다.</p> <p>Alpha-proteobacteria로 분류된 33개의 분리균 중 16S rRNA 염기서열 상동성이 \( 98.5 \% \) 미만인 분리균은 14 개로 약 \( 42 \% \) 의 분리균이 새로운 종이 될 가능성을 가진 균주로 추정되었다. 이 결과는 gamma-proteobacteria로 분류된 분리균보다 훨씬 새로운 종으로 동정될 가능성이 높았다.</p> <p>Epsilon-proteobacteria는 주로 동물의 소화관에서 분리 동정되고 있고 환경에서 분리되는 epsilon-proteobacteria는 대부분 심해저 화산 열수구나 냉용수 같은 극한 환경에서 다수 분포하고 있음이 알려져 있다. 우리나라 제주 해안 바닷물에서 미생물군집 분포의 다양성을 조사했을 때도 epsilon-proteobacteria는 분리되지 않았다. 2007년 9월 시료와 4월 시료에서 Campylobacteraceae과에 속하는 미산소성이고 질소고정능력을 가지는 세균인 Arcobacter nitrofigilis와 16S rRNA 염기서열 상동성이 \( 94.6 \sim 95.7 \% \)인 4개가 분리되었지만 분리종간에 상동성은 \( 94 \sim 98\% \)로 각각이 새로운 종이 될 가능성이 있다고 추정되었다. Arcobacter nitrofigilis는 Vandamme 등에 의해 형태적 생화학적 특성에 따라 Campylobacter nitrofigilis에서 학명이 바뀐 세균으로 식물 뿌리에 분리된 세균이다. 이전까지 독도에서 분리되어서 새로운 종으로 등록된 미생물 중에 epsilon-proteobacteria에 속하는 종은 없었기 때문에 다양한 생리화학적 조사를 통하여 잠재적인 새로운 종으로 분리할 수 있었다.</p>