1,303종 이상의 생물에서 발견되는 보존적 유전자인 orthologs는 COGs의 형태로 파악되었다. 1,309종의 원핵생물에서 발견된 4,877개의 COGs 중에서 199종 이하의 원핵생물에서 발견된 보존적 COGs는 2,249개로 전체의 약 46.1%를 차지했다. 반면, 1,300종 이상의 원핵생물에서 발견된 보존적 COGs는 전체의 0.8%인 39개로 나타났다. 또한, COGs 개수가 가장 적은 Candidatus Nasuia deltocephalinicola NAS-ALF와 가장 많은 Metakosakonia MRY16-398에서는 보존적인 COGs의 비율이 각각 약 25.77%와 1.27%였다.
<h2>보존적 유전자에서 유래한 단백질의 보존성</h2> <p>1,303 종 이상에 공통적으로 존재하는 COGs로 보존적 유전자인 orthologs를 파악하였다. 분석대상 원핵생물에 공통적인 COGs 가 나타내는 distance value의 평균과 표준편차로 각 보존적 단백질의 보존성을 분석하였다.</p> <h1>결과 및 고찰</h1> <h2>보존적 유전자의 분포</h2> <p>원핵생물의 분류단위별로 보유하는 보존적 유전자인 orthologs에서 유래한 COGs의 개수를 파악하였다. 분류 단위별의 평균은 497.86개(Mollicutes 문)~1,642.90개(Cyanobacteria 문) 사이였고, 각 원핵생물별로 97~2,281개의 보존적 유전자를 가졌다(자료미제시). Table 1에 원핵생물의 종의 수에 따른 보존적 COGs의 개수를 나타내었다. 1,309종의 원핵생물에 4,877개의 COGs가 존재하는데 199종 이하의 원핵생물에 분포하는 보존적 COGs가 2,249로 전체 4,877개의 \( 46.1 \% \)였고, 1,300종 이상의 원핵생물에 전체 COGs의 \( 0.8 \% \)인 39개의 COG가 보존적이었다. 종의 수가 증가함에 따라 보존적 COGs 의 개수가 감소하였다.</p> <p>1,309종의 원핵생물을 대상으로 보존적 COGs를 파악한 후, 1,303종 이상의 원핵생물에 보존적인 COGs의 종류와 각 COG에 속하는 단백질의 수를 Table 2에 나타내었다. 1,303종 이상의 세균에 보존적인 COGs는 29개였다. 보존적 COGs의 수는 43종과 66종의 미생물에서 각각 72개와 62개였고, 711개의 원핵 생물에서 1개였다. 본 연구에서는 1,309종의 원핵생물에서 1개의 보존적 COG가 파악되었다. 29개의 보존적 COGs를 모두 보유한 원핵생물은 1,239종이었고, 50종이 28개, 11종이 27개, 6종이 26개, 2종이 25개, 1종이 24개를 가졌다(자료미제시). 전체 COGs 개수가 97개로 가장 적은 Candidatus Nasuia deltocephalinicola NAS-ALF와 2,281개로 가장 많은 Metakosakonia MRY16-398는 1,303종 이상에 보존적인 COGs가 각각 25개와 29개로, 전체 COG 개수 대비 \( 25.77 \% \)와 \( 1.27 \% \) 였다.</p> <p>1,303종 이상의 원핵생물에 보존적인 각 COG를 구성하는 단백질의 수를 원핵생물의 수로 나눈 비율은 COG 0008 (Glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase)이 2.008, COG0480 (Translation elongation factor EF-G, a GTPase)이 1.610으로 높았고, 리보솜을 형성하는 각 COG들은 거의 원핵생물 한 종에 단백질 하나였다. 각 원 핵생물당 하나의 단백질을 갖는 COG는 COG0096, COG0090, COG0092, COG0185, COG0256, COG0081이었다. 1,308종의 원핵생물에 공통적인 COG0049와 COG0051은 각각 \( \alpha \)-Proteobacteria 강의 Methylocystis sp.SC2와 \( \delta \)-Proteobacteria 강의 Desulfovibrio vulgaris Hil-denborough에만 없었다.</p> <p>원핵생물 711개 연구에서 COG0080 (Ribosomal protein L11)이 모든 원핵생물에 분포하고 COG0100 (Ribosomal protein S11)은 703개의 원핵생물에 분포하였는데, 본 연구에서는 COG0100이 1,309종에 그리고 COG0080은 1,306종에 분포하였다. 이것은 COG 자료의 최신 업데이트에서 동일한 종의 원핵생물은 하나만 남기는 과정에서 COG0100이 없는 원핵생물들이 제거된 결과 등으로 판단되었다.</p>