GNUM08120 균주는 A.macleodii \( \mathrm { DSM } 6062 ^ {\mathrm { T } } \)의 아종으로 판된되어, Alteromonas macleodii subsp.GNUM08120라는 이름이 붙여졌다. GNUM08120은 glucose 또는 starch로 성장했지만 sucrose로는 성장하지 못했다. GNUM08120에서 생성된 agarase는 한천만 제공되었을 때 가장 높은 활성을 보이고, 균주의 성장이 stationary phase에 진입하면 생산량이 증가하고 mid-stationary phase부터 생산량이 감소했다. 이는 배지 내 탄소원의 존재에 의해 단백질 생합성이 억제되는 것으로 사료된다.
<h2>DNA-DNA hybridization 분석</h2> <p>GNUM08120 균주와 16S rRNA 유전자 염기서열 및 계통발생적 연관성이 높은 균주들과의 DNA 연관성 조사 결과, A.macleodii \( \mathrm { DSM } 6062 ^ {\mathrm { T } } \) 와 \( 80.06 \% \) 의 hybridization 값을 보였다(Fig. 3B). 일반적으로 DNA-DNA hybridization 값이 \(70- 90 \% \) 일 때 새로운 아종(subspecies)로 간주되며, 그 값이 \( 90 \% \) 이상일 때는 같은 종으로 간주되고, \( 70 \% \) 이하일 때는 다른 종으로 간주된다. 이 기준으로부터 \( 80.06 \% \) 라는 DNA hybridization 값은 GNUM08120 균주가 A.macleodii \( \mathrm { DSM } 6062 ^ {\mathrm { T } } \)와 같은 종(species)으로 분류될 뿐만 아니라 아종(subspecies)으로 분류되는 값에 해당된다. A. marina \( \mathrm { SW }-47 ^ {\mathrm { T } } \) 및 A. simiduii \( \mathrm { BCRC } 17572 ^ {\mathrm { T } } \) 에 대해서는 DNA-DNA hybridization 값이 각각 \( 74.18 \% \) 와 \( 35.29 \% \) 로 측정되었다. 이 값들은 다른 종으로 구분할 수 있는 \( 70 \% \) 의 cut-off 값과 유사하거나 매우 낮은 값으로 이들 두 균주들은 GNUM08120 균주와 다른 종으로 판단되었다. 본 연구에서 수행된 16S rRNA 유전자 염기서열분석과 계통 수 및 DNA-DNA hybridization 분석의 결과들로부터 GNUM08120 균주는 A.macleodii \( \mathrm { DSM } 6062 ^ {\mathrm { T } } \)의 아종으로 분류가 가능하다. 따라서 본 논문에서는 GNUM08120균주를 Alteromonas macleodii subsp.GNUM08120으로 명명하였다.</p> <h2>세포성장 및 agarase 생산 특성</h2> <p>GNUM08120 균주의 성장은 탄소원으로 한천 뿐만 아니라 glucose 또는 starch가 제공되었을 때 성장이 증가된 반면, sucrose가 제공되었을 때는 별다른 성장의 증가 효과가 관찰되지 않았다(Fig. 4A). GNUM08120 균주가 세포 외부로 생산하는 agarase는 한천만 제공된 배지에서 가장 높은 활성이 관찰되었는데, 균주 성장곡선의 stationary phase에 진입하는 시기에 생산되어 mid-stationary phase부터 급격히 생산량이 줄어 들었다(Fig. 4B). 또한 한천 이외의 배지내 다른 탄소원이 제공된 배지에서는 agarase 활성이 약하게 관찰되었는데, 이는 배지내 glucose (monosaccharide), sucrose (disaccharide), starch (polysaccharide) 등에 의해서 carbon catabolite repression (CCR)을 받는 것으로 사료된다. 일반적으로 CCR은 glucose 등과 같은 탄소원의 존재 시 단백질 생합성이 억제되는 현상을 일컫는다. Streptomyces속의 균주들의 경우에는 효소, 항생제, 생리활성물질 등의 생산이 CCR에 의해서 영향을 받는 것으로 알려져 있는데, Streptomyces coelicolor와 Streptomyces griseus에서는 glucose kinase에 의해서 매개되는 것으로 보고되어 있다. 특히, S.coelicolor가 세포외부로 생산하는 \( \beta \)-agarase(DagA)는 glucose에 의해서 생합성이 억제 된다고 보고되어 있다.</p>