13종 중 5종 이상의 품종별 대립유전자 발현 양상이 품종에 따라 매우 다르며 일부는 극단적인 발현 특성을 보이는 분석 결과는 유전적 구조 및 조성의 큰 차이를 반증하고, 개체 식별에 있어 특정 품종에 대한 대립 유전자의 발현 빈도를 고려한 유전 표지 좌위의 선정의 필요성을 드러낸다. 비극단적인 출현 빈도 양상의 유전 표지와 개체 식변에 용이한 수준의 대립 유전자를 발현시키는 제주마 9종의 유전 표지를 실험한 결과, 더 많은 종류의 유전 표지를 분석하면 서로 다른 개체가 동일한 유전자형을 나타낼 확률 값인 개체 식별력은 줄지만, 최적의 개체 식별 시스템의 설정을 위해서는 개체 식별력이 높은 개별 유전 표지를 최적화해 설정해야 함을 발견하였다.
<p>또 다른 품종특이성 유전표지 HTG4의 경우 매우 특이한 대립유전자 발현양상을 알 수 있다. 전체 8종의 대립유전자 중 제주마 집단에서는 단 4종류만이 발현되었다. 또한 132 좌위의 경우 분석대상 5품종집단에서 가장 높은 대립유전자 발현양상을 보였으며(JNH: 0.41, QUA: 0.46, JRH: 0.58, MONG: 0.58, THO: 0.34) 136대립유전자 좌위는 JNH와 THO 품종집단에서는 발현이 확인되지 않은 반면에 QUA에서 매우 높은 0.23을 보였으며 다른 두 품종집단에서는 매우 낮은 발현빈도를 보였다.</p> <p>분석에 사용된 13 종중 5종이상이 품종별 대립유전자 발현 양상이 품종에 따라 매우 상이하며 일부 대립유전자들은 극단적인 발현특성을 보였으며 이는 유전적 구조 및 조성이 매우 다르다는 것을 반증하는 결과라고 생각된다. 분석 대상 좌위의 출현빈도는 분석에 공시된 품종별로 매우 상이한 출현 양상을 보인다는 [13]이 보고한 결과와 대체적으로 유사한 경향치를 보이고 있다. 따라서 개체 식별을 위해서는 특정 품종에 대한 대립 유전자의 발현 빈도를 고려한 micro-satellite 좌위의 선정이 매우 중요할 것으로 보인다. 이러한 품종 다양성을 나타내는 유전자표지(MS)를 사용할 경우 개체식별을 위한 분자마커로써 중요한 수단을 제공함은 물론 집단 내 개체별 품종식변을 가능하게 하는 보다 정확한 분자 표지로써의 가능성을 제공할 수 있다는 점에서 매우 중요한 계기를 제공할 수 있을 것으로 생각된다.</p> <p>제주마 집단에서 비교직 유전 표지의 출현빈도 양상이 극단적으로 치우치지 않으며 개체 식변에 용이한 수준의 대립 유전자를 발현시키는 9종의 유전 표지를 대상으로 개변 유전 표지의 개체 식별력 및 누적 개체 식별럭을 제시하였다. 이러한 개체 식별력의 추정 통계량은 혈연관계가 없는 서로 다른 개체가 동일한 유전자형을 나타내지 않은 확률을 나타내고 있으며 이는 서로 다른 개체가 동일한 유전자형을 나타낼 확률 추정치와 비교하였다. 5종의 좌위를 사용할 경우 서로 다른 개체가 동일한 유전자형을 나타낼 확률 추정치는 \( 0.53 \times 10 ^ { -5 } \) 이었으며 8종일 경우 \( 0.40 \times 10 ^ { -8 } \), 분석에 제시된 총 9종의 좌위를 동일성 검정을 위한 개체 식별 시스템에 활용할 경우 \( 0.44 \times 10 ^ { -9 } \) 의 짝확률 값이 추정되었다. 이는 말의 집단내 개체별 유전다형에 의한 유전 포지(microsatellite)를 활용한 짝확률 값을 가가 \( 0.72 \times 10 ^ { -6 } \) (5종), \( 0.75 \times 10 ^ { -11 } \) (8종) 및 \( 0.50 \times 10 ^ { -13 } \) (11종)으로 보고한 결과와 비교해 보면 다소 식별력이 낮은 것을 볼 수가 있다. 이는 출현되는 대립 유전자수가 분석 대상 집단마다 상이함에 따라 나타날 수 있으며 가능한 유효 대립유전자가 다양하게 발현되는 유전 표지를 선정할 경우 개체 식별력이 증가될 수 있을 것으로 생각된다. 번식에 사용되는 암말의 수가 제한되어 비교적 유전적 다양성이 낮은 것으로 평가되고 있는 제주마 집단에서 9종의 유전 표지를 할용 할 경우 \( 0.44 \times 10 ^ { -9 } \) 의 개체를 식별할 수 있다는 결과를 제시하고 있다. 결국 더 많은 종류의 유전 표지를 분석에 활용할 경우 개체 식별력 즉 서로 다른 개체가 동일한 유전자형을 나타낼 확률 값이 적어지지만 최적의 개체 식별 시스템의 설정을 위해서는 개체 식별럭이 높은 개별 유전 포지를 최적화하여 설정하는 것이 바람직하다. 본 연구는 9종을 사용할 경우 제주마 집단을 전제로 할 때 비교적 합리적인 개체 식별 시스템이 설정될 것으로 에측된다.</p>