본 연구는 부산에서 유행한 인플루엔자 바이러스의 HA와 NA 유전자의 계통수 분석을 실시하였다. 분석 결과, 인플루엔자 바이러스 A/H1N1의 HA 염기서열은 2008~2009 절기 백신주와 높은 유사성을 보였다. 또한, 인플루엔자 바이러스 B의 HA와 NA 유전자는 대부분 Yamagata lineage에 속하였다. 이러한 결과는 WHO가 2008~2009 절기를 위해 인플루엔자바이러스 A/H1N1, A/H3N2, B의 백신주를 모두 교체한 것과 연관이 있을 수 있으며, 전세계적으로 비슷한 형태의 인플루엔자바이러스가 유행하였음을 나타낸다.
<h2>염기서열 분석</h2> <p>원하는 사이즈에서 증폭된 DNA를 QIAquick PCR puification kit(QIAGEN, Germany)및 Gel extraction kit(COSMOGentech, Korea)를 이용하여 정제하였다. 이를 주형으로 하여 Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Perkin Elmer, USA)와 ABI Prism 3730XL Genetic Analyzer (Perkin Elmer, USA)를 이용해 염기서열을 분석하였다. 염기서열분석을 위한 primer는 HA 유전자의 경우 PCR에 사용한 primer를 사용 했고 NA 유전자는 특이적인 inner primer를 추가하여 분석하였다(Table 3). 확인된 염기서열은 DNASTAR(Madison, WI)를 이용하여 계통수를 작성하고 HA의 경우는 아미노산 분석까지 실시하였다. 2007~2008 절기의 경우 인플루엔자바이러스 검출율은 7배, 검출건수는 4배 증가하였으며 특히 다른 형에 비하여 인플루엔자바이러스 B형이 10배 정도 많이 검출 되었다. 이런 유행은 부산뿐만 아니라 전국에서도 같은 양상을 보였다.</p> <h2>분리된 인플루엔자바이러스의 염기서열 분석</h2> <p>부산에서 유행한 인플루엔자바이러스의 HA 유전자 중 변이가 심한 HA1 domain과 NA 유전자의 계통수 분석을 실시하였다. 인플루엔자바이러스 A/H1N1의 HA 염기서열의 경우 2008~2009 절기 백신주인 A/Brisbane/59/2007과는 \( 96.7 \% \sim 97.7 \% \) 의 유사성을 보였으며, 분리된 바이러스가 유행한 절기의 백신주인 A/Solomon Islands/3/2006 및 A/New Caledonia/20/99와는 각각 \( 96.5 \% \sim 97.3 \%, 95.6 \% \sim 96.6 \% \) 의 유사성을 보였다. 인플루엔자바이러스 A/H1N1의 NA염기서열의 경우, A/Brisbane/59/2007과는 \( 97.8 \% \)~ \( 98.5 \% \), A/Solomon Islands/3/2006과는 \( 96.7 \% \sim 97.6 \% \), A/New Caledonia/20/99와는 \( 96.8 \% \sim 97.7 \% \)의 유사성을 보여 2008~2009 절기의 백신주인 A/Brisbane/59/2007과 가장 유사성이 컸다.</p> <p>A/H3N2의 분리주 중 A/Busan/F54/2007은 HA와 NA 염기서열에서 이 바이러스가 유행한 절기의 백신 주인 A/ Wisconsin/67/2005와 유사주로 나타났고, 이 주를 제외한 모든 분리주는 HA 유전자에서는 2008~2009 절기 백신주인 A/Brisbane/10/2007과는 \( 98.4 \% \sim 99.7 \% \) 의 유사성을 보였으며 A/Wisconsin/67/2005와는 \( 96.5 \% \sim 97.5 \% \)의 유사성을 보였다. NA 유전자는 A/Brisbane/10/2007과는 \( 98.9 \% \sim 99.4 \% \), A/WIsconsin/67/2005와는 \( 98.0 \% \sim 98.6 \% \), A/California/7/2004와는 \( 98.3 \% \sim 98.9 \% \)의 유사성을 보여 A/ Brisbane/10/2007과 가장 큰 유사성을 보였으며 분리주들이 유행한 시기의 2006~2007 절기와 2007~2008 절기의 백신주인 A/Wisconsin/ 67/2005 와는 가장 큰 차이를 보였다.</p> <p>분리된 인플루엔자바이러스 B의 HA와 NA의 유전자 계통수를 비교해보면 2008년 2월과 4월 분리주 중 각 1주(A/ Busan/F261/2008, Busan/A65/2008)에서 HA는 Victoria lineage이면서 NA는 Yamagata lineage에 속하는 B/Malaysia /2506/2004(B reassortant lineage)와 유사하였다. 이 2건의 분리주를 제외하고는 HA와 NA 유전자 모두 Yamagata lineage에 속했다. 2008~2009 절기 백신주인 B/Florida/4/2006 (Yamagata lineage)과 \( 96.5 \% \sim 99.7 \% \)의 유사성을, 이 바이러스가 유행한 절기의 백신주인 B/Malaysia/2506/2004(B reassortant lineage)와는 \( 86.7 \% \sim 87.7 \% \) 의 유사성을 보여 B/ Florida/4/2006과 유사성이 큰 것으로 나타났다. 인플루엔자바이러스 B의 NA 유전자의 경우 reassortant lineage에 속하는 2주 분리주를 제외한 나머지 분리주에서 B/ Florida/4/2006과 \( 98.9 \% \sim 100 \% \)의 유사성을, 분리주 유행시기의 백신주인 B/Malaysia/2506/2004와는 \( 94.5 \% \sim 96.7 \% \)의 유사성을 나타내어 2008~2009 절기의 백신주와 더 큰 유사성을 보였다. 2006~2007 절기 및 2007~2008 절기에 분리되었던 인플루엔자 바이러스를 백신주와 비교해본 결과 이 분리주가 유행한 시기의 백신주보다 2008~2009 절기 백신에서 유사성이 높음 알 수 있었다. WHO에서 백신의 효능을 높이기 위하여 인플루엔자바이러스 A/H1N1, A/H3N2, B의 2008~2009 절기를 위한 백신주를 모두 교체한 것과 그 백신 주가 부산에서 분리된 인플루엔자바이러스와도 유사하여 전세계적으로도 비슷한 형태의 인플루엔자바이러스가 유행하였음을 알 수 있었다.</p>