돌돔 SL cDNA의 염기서열을 분석한 결과 총 1636bp로 다른 어류의 SL signal peptide와 유사하며 mature protein 204-209aa 범위에 해당한다.
<h1>결과 및 고찰</h1> <h2>돌돔SL cDNA 서열 분석</h2> <p>합성된 first-strand cDNA를 주형으로 SL-F와 \( \mathrm{d}(\mathrm{T})_{18} \) primer를 이용하여 3' 말단 cDNA를 PCR 증폭한 결과, 약 \( 1180 \mathrm{bp} \) 가 증폭되었다 (Clone 1). 3'에 dG oligo를 붙인 first strand CDNA를 SL-R과 \( \mathrm{d}(\mathrm{C})_{18}\) primer로 PCR 증폭시 약 \( 480 \mathrm{bp} \) 의 5' 말단 cDNA가 증폭되었다 (Clone 2). 이들의 염기서열을 분석한 결과, clone 1 은 \( 267 \mathrm{bp} \) 의 SL coding region과 \( 915 \mathrm{bp} \) 의 3'-untranslated region (UTR)을 갖고 있으며, clone 2 는 \( 26 \mathrm{bp} \) 의 5'-UTR과 signal peptide 염기서열을 포함하는 \( 458 \mathrm{bp}\) 의 SL coding region 서열을 갖고 있다. 이 clone 1과 2에 기초하여 분석된 돌돔 SL의 cDNA 염기서열과 아미노산 서열을 Fig. 1에 나타내었다.</p> <p>돌돔 SL cDNA의 염기서열은 \( 1636 \mathrm{bp}\) 로 확인되었다. 돌돔 SL은 \( 25 \mathrm{bp} \) 의 5'-UTR, SL prehormone을 암호화하는 \( 693 \mathrm{bp} \) 의 ORF와 \( 865 \mathrm{bp}\) 의 3'-UTR로 구성되어 있다. 돌돔 SL은 24개의 aa로 구성되어 있는 signal peptide와 207개의 aa인 mature protein으로 되어 있다. 돌돔 SL의 polyad-enylation signal sequence는 poly(A) tail에서 상위 \( 15 \mathrm{bp} \) 에 위치하고 있으며, 그 서열은 진핵생물에서 보고되괴 있는 consensus sequence인 AATAAA와 동일하다. ORF에 기초한 돌돔 SL의 분자량과 등전점은 약 26775Da과 5.6으로 예측되었다 (Expert protein analysis system-proteomics server from the Swiss Institute of Bioinformatics). 또한, 돌돔 SL 아미노산 서열에서 단백질의 이황화 결합에 관여하는 7개의 시스템인 (Cys \( ^{5} \), Cys \( ^{15} \), Cys \( ^{42} \), Cys \( ^{65} \), Cys \( ^{181} \), \( \mathrm{Cys}^{198} \) 과 \( \mathrm{Cys}^{206}\) )과 단백질의 탄수화물 결합에 관여하는 두개의 putative \( \mathrm{N} \) - glycosylation site를 \( \mathrm{Asn}^{121} \) 과 \( \operatorname{Asn}^{153} \) 아미노산 잔기에서 확인하였다.</p> <p>돌돔 SL cDNA는 총 \( 1636 \mathrm{bp} \) 로 전체 염기서열의 약 \( 53 \% \) 에 해당하는 긴 3'-UTR과 짧은 5'-UTR을 갖고 있으며, 231 개의 아미노산을 암호화하는 SL prehormone의 \( 24 \mathrm{aa} \) signal peptide는 아미노산 소수성에 기초하여 결정되었는데 이는 현재까지 알려진 어류의 SL signal peptide에 -유사성을 갖고 있다. 또한, \( 207 \mathrm{aa}\) 으로 구성된 mature protein도 보고되어진 어류 SL의 mature protein 204에서 209 aa 범위에 포함되고 있다.</p>