피조개 체내의 미생물 균주를 용혈활성으로 분리하여 16S rDNA를 증폭하고, BLAST search를 통해 GeneBank과 EzTaxon server를 이용하여 염기서열 간의 유사도를 분석하여 62종 marine 배지, 81종 R2A 배지로 분리·동정하였다. 각 배지별로 모두 배양이 가능한 미생물과 특정 균주의 경우 하나의 배지에서만 배양이 가능함을 확인하였다. 강진만 퇴적물, 진해만 퇴적물,강진만 피조개 샘플 내 균주의 유사도는 평균 98.5% 이상이었다. 그러나 진해만 피조개 샘플에서 분리한 균체의 분석결과는 95.4%로 낮았다. 이는 지역에 따른 피조개내의 미생물 균총이 다르고, 같은 지역의 퇴적물이라도 미생물 균총의 구성이 다를 수 있음을 알 수 있었다.
<p>용혈활성으로써 선별, 분리된 균주는 같은 종의 균주로 중복되는 경우도 많았지만 최종적으로 marine 배지에서는 62 종, 그리고 R2A 배지에서는 81 종이 분리, 동정 되었다. 또한 Bacillus spp. (19 sp.), Brevibacterium sp. (1 sp.), Lysinibacillus spp. (4 sp.), Paenibacillus sp. (1 sp.), Pseudamonas sp. (1 sp.)와 같이 marine과 R2A 배지 두 군데에서 모두 배양이 가능한 미생물이 있는가 하면, Gitricaccus sp. (1 sp.), Exiguobacterium sp. (1 sp.), Loktanella sp. (1 sp.), Pantoea sp. (1 sp.), Paracoccus sp. (1 sp.), Photobacterium spp. (6 sp.), Planomicrobium sp. (1 sp.), Psychrobacter sp. (1 sp.), Shewanella spp. (3 sp.),Thalassamonas sp. (1 sp.), 그리고 Vibrio spp. (4 sp.)는 marine 배지에서만, Brevibacillus sp. (1 sp.), Brevundimonas sp. (1 sp.), Massilia spp. (3 sp.), Naxibacter sp. (1 sp.), Paenisporosarcina sp. (1 sp.), Staphylococcus spp. (2 sp.), 그리고 Viridibacillus sp. (1 sp.)는 R2A 배지에서만 배양되어, 특정 균주의 경우 두 배지 중 하나의 배지에서만 배양이 가능함을 알 수 있었다.</p> <h2>피조개 체내에서 분리한 균주의 다양성</h2> <p>용혈활성을 보이는 균주의 chromosomal DNA를 분리하여 약 \( 1.5 \mathrm { ~kb } \) 의 길이의 16S rDNA를 증폭하였고, 증폭산물의 염기 서열분석 작업 후 NCBI의 BLAST search를 이용한 GeneBank 와 EzTaxon server \( 2.1 \) 사이트를 이용하여 염기서열 간의 유사도를 분석, 유사도가 가장 높은 type strain 균주로 분류 하였다. 1,052개의 모든 균주 샘플을 분석하였으며 근연종과의 평균 유사도는 \( 98 \% \) 이상으로 밝혀졌다. 강진만 퇴적물, 진해만 퇴적물, 그리고 강진만 피조개 샘플 내 균주의 유사도는 평균 \( 98.5 \% \) 이상 나왔으나 진해만 피조개 샘플에서 분리한 균체의 분석결과는 \( 95.4 \% \) 로써 다른 표본보다 많이 낮은 서열 유사도를 알 수 있었다. 이는 지역에 따른 피조개내의 미생물 균총이 다르며, 같은 지역의 퇴적물과 피조개내에서도 미생물 균총이 많은 차이가 있음을 알 수 있었으며, 추후 다양한 미생물학적 실험을 수행한다면 새로운 종을 발견할 수 있을 것으로 생각된다.</p> <p>피조개 체내에서 분리한 균주는 두 지역의 해저 퇴적물에서 획득한 균주보다 적은 수의 균주 및 다양성을 보였다. 강진만에서 채취한 피조개 내에는 2 목 2 과 7 속 20 종으로 Bacillus spp. (8 sp.), Gitricoccus sp. (1 sp.), Massilia spp. (6 sp.), Photobacterium sp. (1 sp.), Planomicrobium sp. (1 sp.), Pseudamonas sp. (1 sp.), 그리고 Vibrio spp. (2 sp.)가 존재하였으며, 진해만의 경우 2목 2과 2속 15종으로 Bacillus spp. (14 sp.)와 Brevundimonas sp. (1 sp.), 단 2 genera로써 존재하여 강진만에서 수집한 피조개보다 매우 적은 수의 속이 존재하며 다양성도 매우 낮음을 알 수 있었다(Table 2). 특이하게도 강진만과 진해만의 피조개 내에는 다수의 Bacillus species \( (7 \mathrm { sp } \).)가 존재함을 알 수 있었으며, 강진만 피조개 내에서만 Bacillus sp. (1 sp.), Citricoccus sp (1 sp.), Massilia spp. (6 sp.), Photobacterium sp. (1 sp.), Planomicrobium sp. (1 sp.), Pseudamonas sp. (1 sp.), 그리고 Vibrio spp. (2 sp.)가 존재하였으며 진해만 피조개에는 강진만 샘플에 존재하지 않는 Bacillus spp. (6 sp.)와 Brevundimonas sp. (1 sp.)가 존재하였다.강진만 피조개 내에서는 퇴적물에 존재하지 않는 Citricoccus alkalitolerans, Massilia aerilata, Massilia jequensis, Massilia suwonensis, Planomicrobium okeanokoites, 그리고 Vibrio comitans가 분리되었으며, 진해만 피조개 내에는 Bacillus caahuilensis와 Brevundimonas vesicularis이 특이하게 존재하였다. 이러한 균주는 대기, 전복의 내장, 호수, 그리고 해수 등에서 존재함이 보고되어 해저 퇴적물이 아닌 강진만 또는 진해만의 해수 내에 지역 특이적으로 존재하는 균주가 피조개의 여과섭식으로 인하여 체내에 존재하는 것으로 생각된다.</p>