분리된 9개 균주의 16 S rRNA 유전자 염기서열에 대해 BLAST 검색, 비교한 결과, 분리된 균주는 2개의 속(genus)으로 분류되었고, 근권 세균으로 추정한 JRS-1, -2, -3, -4, -5 균주와 근면 혹은 내생 세균으로 추정한 JRL-1, -4 균주는 Vibrio 속으로 확인되었고, 근면 혹은 내생 세균으로 추정한 JRL-2와 JRL-3 균주는 Bacillus 속으로 확인되었다. 앞서 각 단계적으로 분리된 균주를 근권 세균군(JRS 군), 근면 또는 내생세균군(JRL 군)으로 추정할 수 있다.
<h2>계통학적 분석</h2> <p>분리된 \( 9 \)개 균주의 \(16 \)S rRNA 유전자 염기서열에 대해 BLAST 검색, 비교한 결과, 분리된 균주는 \(2 \)개의 속(genus)으로 분류되었다. 근권 세균으로 추정한 JRS- \(1 \), - \(2 \), - \(3 \), - \(4 \), - \(5 \) 균주와 근면 혹은 내생 세균으로 추정한 JRL- \(1 \), - \(4 \) 균주는 Vibrio 속으로 확인되었고, 근면 혹은 내생 세균으로 추정한 JRL- \(2 \)와 JRL- \(3 \)균주는 Bacillus 속으로 확인되었다.</p> <p>SILVA database에 정렬한 \( 16 \mathrm { ~S } \) rRNA 유전자 염기서열의 neighbor-joining 계통수(phylogenetic tree)는, Vibrio 속에 속하는 균주 JRS- \(1 \), JRS- \(2 \), JRS- \(3 \), JRS- \(4 \), JRS- \(5 \), JRL- \(1 \), JRL- \(4 \)에 대해 하나의 계통수를 작성하였고(Fig. \(2 \)), Bacillus 속에 속하는 균주 JRL- \(2 \), - \(3 \)에 대해서 하나의 계통수를 작성하였다.(Fig \(3 \)). 각 계통수에서 JRS- \(1 \), JRS- \(3 \), JRS- \(5 \) 균주는 Vibrio neocaledonicus와 가장 가까운 이웃을 이루고 있는 것을 확인할 수 있었고, JRS- \(2 \), JRS- \(4 \), JRL- \(1 \), JRL- \(4 \) 균주는 Vibrio variabilis와 가장 가까운 이웃을 이루고 있는 것을 확인하였다(Fig. \(2 \)). 균주 JRL- \(2 \)는 Bacillus anthracis와, JRL- \(3 \)은 Bacillus marisflavi와 가장 가까운 이웃을 이루고 있는 것을 확인하였다(Fig. \(3 \)). \(9 \) 균주의 \( 16 \mathrm { ~S } \) rRNA 유전자 염기서열은 GenBank accession number \( \mathrm { KY } 750302- \mathrm { KY } 750310 \) 로 등록되었다.</p> <p>앞서 각 단계적으로 분리된 균주를 근권 세균군(JRS 군), 근면 또는 내생세균군(JRL 군)으로 추정하였다. Gond 등( \(2015 \))에 따르면 Bacillus는 토양과 식물 내부에서 모두 분리 될 수 있다고 보고하였고, 따라서 계통분석을 통해 확인된 Bacillus 속인 JRL- \(2 \)와 JRL- \(3 \)에 대해서는 근면세균인지 내생세균인지에 대한 명확한 구분은 어렵다. 그러나 JRL- \(2 \)와 JRL- \(3 \)이 Bacillus 속이라는 점과 JRL- \(1 \), JRL- \(4 \)가 JRS 균주들과 같은 Vibrio 속(genus)이나 다른 종을 나타냄에 따라, JRL 균주들은 근면 혹은 내생 세균, JRS 균주들은 근권 세균으로 분리 되었다고 할 수 있다.</p>