Bacteriodetes에 속하는 세균은 26개의 분리균이 14속 14종으로 부분동정 되었으며, 2008년 4월 시료에서는 9개의 Bacteriodetes에 속하는 종 중에 4종이 신종이었으나, 신속으로 동정될 수 있다고 추정된다. 독도의 해양은 인간에 의한 오염에서 비교적 거리가 먼 보존된 환경이기 때문에 해양이 타지역과는 아주 다른 환경조건을 가지고 있다. 그러므로 미생물의 군집분포 또한 한국의 다른 해수환경과는 상당히 다른 양상의 군집분포를 보이며 아주 다양한 신종후보로 동정된 균주의 분포가 높았다. 타지역의 해수와 생기는 온도 차이도 다른 세균 분포의 원인으로 보여진다.
<p>Bacteriodetes에 속하는 세균은 26개의 분리균이 14속 14종으로 부분동정 되었다. Bacteriodetes에 속하는 균은 대부분 호기성이며 그람 음성균으로 complex macromolecule을 분해할 수 있는 능력을 가지는 균이 다수 알려져 있다. 7개의 분리균이 Cellulophaga 속으로 동정되어 가장 우점속을 차지하고 있었고, 그 다음 Maribacter 속이 5개가 분리되었다.</p> <p>2008년 4월 시료에서 분리된 udc421은 2006년 윤 등에 의해 독도 바닷물에서 분리한 Flavobacteriaceae과의 Polaribacter dokdonensis와 \( 96.3 \% \) 의 상동성을 가지고 있었는데, 독도에서 분리한 Polaribacter속의 또 다른 종으로 동정될 수 있다고 추정되었다. 2008년 6월 동도 연안 바닷물에서 분리한 다른 5개의 분리균은 2005년 윤 등에 의해 분리된 독도의 바닷물에서 분리된 Maribacter dokdonensis와 각각 \( 98.7 \sim 99.7\% \)의 비교적 높은 상동성을 보이고 있었다.</p> <p>Bacteridetes로 분류된 26개의 분리균 중 16S rRNA 염기서열 상동성이 \( 98.5\% \) 미만인 분리균은 8개로 약 \( 31\% \)의 분리균이 새로운 종이 될 가능성을 가진 균주로 추정되었다. 2008년 4월 시료에서는 9개의 Bacteriodetes에 속하는 종 중에 4종(약 \( 44\% \))이 신종이나 신속으로 동정될 수있다고 추정되기 때문에, 2008년 6월 시료보다 다양성도 높았고, 신종이나 신속의 가능성을 가진 균주의 비율도 높았다.</p> <p>2007년 9월 시료와 2008년 6월 시료에서는 low G+C Gram positive bacteria도 몇 종류가 분리되었다. 균의 다양성을 보면 육안으로 볼 때 다르다고 분리했지만, 실제로 중복으로 분리되는 경우도 있었다. 하지만 종 분포의 다양성은 매우 높았다. 분리균의 종 분포를 보면 2007년 9월에 분리한 균들이 2008년 4월이나 6월에 분리한 균과 차이가 많았다. 이는 해수온도의 차이 때문에 세균 분포가 다를 수 있다고 추정할 수 있었다. 그리고 분리균의 종을 살펴보면 지리적으로 가까이 위치한 한국의 다른 해안가나 독도에서 분리된 균들과 염기서열 상동성이 높은 균들이 다른 지역에서 분리한 균보다는 많은 비율을 차지하고 있었다.</p> <p>전체 염기서열이 분석된 분리균 163개 중 16S rRNA 염기서열이 기존 세균의 염기서열과 상동성을 비교했을 때, \( 98.5\% \) 이하인 균주는 gamma-proteobacteria 14개, alpha-proteobacteria 14개, Bacteriodetes 8개로 전체 36개(약 \( 22\% \))의 분리균이 새로운 종이 될 가능성을 가진 균주로 추정되었고, alpha-proteobacteria로 분류된 분리균이 새로운 종으로 분류될 가능성이 가장 높았다. 이 결과는 전 등에 의해 연구된 독도 식물근권에서 분리한 포자형성세균과 질소고정세균의 신종 가능성을 가진 균주의 비율인 \( 20\% \)보다 약간 높았다.</p> <h2>독도 해양세균의 계통분석학적 다양성</h2> <p>염기서열이 분석된 분리균 163종 중 16S rRNA 유전자 염기서열의 거의 전체가 분석된 107종을 대상으로 각각의 분리균을 크게 gamma-proteobacteria와 alpha-, epsilon-prteobacteria와 Bacteriodetes 그룹으로 분류한 뒤 계통수를 작성하였다. Fig. 3A는 가장 많이 분리된 gamma-proteo-bacteria의 phylogenetic tree를 보여준다. Vibrionaceae과, Shewanellaceae과와 Altermonadaceae과가 다수를 차지하고 있었고, 그 외에 10과와 19속에 속하는 다양한 세균이 분리되었다. Fig. 3B는 alpha-proteobacteria와 epsilon-proteo-bacteria의 phylogenetic tree를 보여준다. Alpha-proteobacteria의 대부분이 Rhodobacteriaceae과에 속했고, 한 종의 Sphingomonadaceae과에 속하는 세균이 분리되었다. Epsilon-proteobacteria는 한 종이 분리되었지만, 각각의 상동성이 낮아서 다른 종으로 분리될 수 있다. Fig. 3C는 Bacteriodetes의 phylogenetic tree를 보여주고 있다. 대부분 Flavobacteriaceae과에 속했고 그 외에 Flammeovirgaceae과, Cyclobacteriaceae과와 Flexibacteriaceae과에 속하는 다양한 세균이 분리되었다. 독도의 해수에서 분리한 균은 gamma-, alpha-, epsilon-proteobacteria, Bacteriodetes, low G+C Gram positive bacteria 등 5개의 계통으로 나누어졌다. 그 중에 gamma-proteobacteria에 속하는 균이 약 \( 58 \% \)를 차지하고 있었고, high G+C Gram positive bacteria는 분리되지 않았다. 이전에 한국의 해수환경인 제주 문섬의 세균군집 조사에서는 high G+C Gram positive bacteria가 약 \( 59 \% \)가 분리되었고, 그 다음으로는 alpha-proteobacteria가 분리되었다는 결과와는 큰 차이를 보이고 있었다. 독도 미생물의 군집분포는 한국의 다른 해수환경과는 상당히 다른 양상의 군집분포를 보이고 있었고, 매우 다양한 미생물이 분포하고 있으면서, 신종후보로 동정된 균주의 분포가 높았다. 이는 독도의 해양이 비교적 다른 환경조건을 가지고 있으며, 동시에 인간에 의한 오염이 비교적 적도록 잘 보존된 환경이기 때문이라고 추정할 수 있다.</p>