쌀 소비의 감소와 풍년, 수입 증가로 인한 재고량 증가로 쌀 산업의 가격 안정이 어려운 상황에서, 1990년대부터 유전적 배경이 유사한 자포니카 품종으로 벼 품종을 육성해 왔다. 이로 인해 최근 육성된 벼 품종들은 유전적 근연성이 가까운 것으로 보인다. 분자표지인자를 활용한 유전자 지도 작성, 내 재해성과 관련된 유전자의 mapping, 유용 형질을 가진 개체의 간접 선반 등 다양한 연구결과가 보고되었으나, 고품질 벼 품종의 품종식별에 활용된 사례는 아직 부족하다. 분자표지인자에 의한 벼 품종 식별 방법이 구명되면 보급종의 순도를 높이는 데 도움이 될 것이다.
<h1>서 론</h1> <p>우리나라의 쌀 산업은 쌀 소비의 지속적인 감소와 연속된 풍년 및 수입증가로 인한 공급확대로 재고량이 매년 증가하고 있기 때문에 가격이 안정적이지 못하다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여 생산자와 소비자가 선호하는 고품질 벼 품종을 개발하고 이에 대한 재배법과 수확 후 관리기술을 확립하는것이 선결과제라고 할 수 있다. 이에 따라 1990년대부터 고품질을 가진 벼 품종을 육성하기 위하여 유전적 배경이 유사한 자포니카 품종을 교배모본으로 하여 여러 가지 품종 들이 육성되어 오기 있기 때문에 근래에 육성된 벼 품종은 유전적 근연관계가 가까운 것으로 추정되고 있다.</p> <p>벼 품종의 유전적 근연관계나 품종 판별에 RAPD, AFLP,SSR 등과 같은 PCR-based marker가 활용되고 있는데, RAPD나 AFLP 분석 방법은 분석의 재현성과 비용뿐만 아니라 marker의 특성이 dominant 형태를 나타내기 때문에 이용에 제한요소가 되고 있다. 그러나 SSR 분석 방법은 식물체 genome상에 존재하는 단순반복 열기서열의 반복횟수의 차이로 인해 다형성이 나타나며, 기존에 개발된 marker보다 다형성 정도가 아주 높고 marker가 co-dominant한 상태를 나타내기 때문에 검정 계통의 heterozygous 여부를 선게 확인할 수 있는 등과 같은 장점이 있다. 실제로 국제신품종 보호연맹 (UPOV)내의 분자생물학 실무 작업반 (BMT) 내에서도 품종식물에 SSR marker가 가장 효과적임을 제안한 바 있다.</p> <p>벼의 경으 SSR marker를 이용하여 유전자 지도 작성, 내 재해성과 관련된 유전자의 mapping, DNA marker에 의한 유용 형질을 가진 개체의 간접 선반 (marker-assisted se-lection), 유전적 유연관계 분석, 품종판별 등과 같은 분야에 다양한 연구결과가 보고되고 있다. 버 품종간 유전적 유연관계 유연관계 분석 및 품종식별에 SSR marker의 이용에 대한 연구가 보고되고 있는데, 국내에서는 자포니카 벼 품종의 다양성과 농업형질과의 연관분석과 벼 품종의 육성 계보의 추정 등에 대한 연구를 수행한 바 있고, 외국에서는 벼 1대 잡종 품증의 순도 검정, 향미 품종의 구별성, 균일성, 안정성의 판단에 SSR의 환용 가능성을 제시하고 있다. 그러나 최근 보급되고 있는 우리나라의 고품질벼 품종을 내상으로 하여 분자표지인자를 활용하여 품종간 유전적 유연관계 분석이나 품종식별에 활용한 예는 거의 없는실정이다. 한편, 분자표지인자에 의해 최근 육성된 벼 품종 식별 방법이 구체적으로 구명된다면 보급종의 순도를 높일 수 있을 뿐만 아니라 분쟁 발생시 이를 조정하는 보조자료로 활용 될 수 있을 것이다.</p>