Mudgo의 벼멸구 저항성 유전자는 도복과 관련된 유전자와 밀접한 연관이 있으며, 내염성과도 관련 있다. 따라서 SSR 마커 R208을 이용하여 일품벼와 상해향혈나 두 품종의 유전적 다양성과 벼멸구 저항성 유전자(Os-Bi1)와 양적 형질인 내염성과의 관련성을 조사하였다. 식물재료로는 유묘기의 일품벼와 상해향혈나의 잎을 사용하였고 건전한 잎에서 DNeasy Plant Mini kit로 추출 후 저장한 뒤 SSR 분석 및 PCR 증폭액을 통해 합성과정을 거쳐, 반응 후 PCR 증폭산물은 ethidium bromide 염색된 겔 상에서 전기영동 하였다.
<p>벼멸구 저항성과 다른 작물학적 형질과의 연관에 대해서 'Mudgo'의 벼멸구 저항성 유전자는 도복과 관련된 유전자와<밀접한 연관을 가지고 있으며, 도복은 유전적으로 환경의 영향을 많이 받는 양적 유전자(polygene)가 관여한다는 보고가 있었다. 이러한 양적 유전자는 유전적 및 환경적 요인이 결부되어 나타나는 내염성과도 관련 있는 것으로 보고 되어있다.</p> <p>따라서 양적 형질과 높은 상관관계가 있는 질적 형질이 있으면 이러한 질적 형질을 마커로 하여 조기에 양적 형질을 육종하는데 유용하게 이용 할 수 있으므로 본 연구에서는 벼멸구 저항성 SSR 마커인 R208을 이용하여 일품벼와 상해향혈나 두 품종의 유전적 다양성을 조사하였다. 또한, 이 SSR 마커와 높은 연관이 있는 질적 형질인 벼멸구 저항성 유전자 (Os-Bi1)와 양적 형질인 내염성과의 관련성을 조사하였다.</p> <h1>재료 및 방법</h1> <h2>SSR marker 분석</h2> <p>식물재료로는 유묘기의 일품벼와 상해향혈나의 잎을 사용하였다. DNA는 약 \( 0.1 \mathrm { ~g } \) 의 건전한 잎에서 DNeasy Plant Mini kit (Qiagen사, Chatsworth, CA, USA)를 이용해 추출한 후 Tris-EDTA 완충용액에 녹여 \( -20 ^ {\circ } \mathrm { C } \) 에 저장하였다. SSR 마커 분석을 위한 primer pair는 벼 게놈 프로젝트 연구 website (http://www.gramene.org/)에서 보고된 벼멸구 저항성 SSR 마커인 R208로부터 디자인되었다. SSR 분석은 PCR 증폭액 \( 25 \mu \mathrm { L } \) 에 \( 20 \mathrm { ng } \) 의 DNA, \( 5 \mu \mathrm { M } \mathrm { R } 208 \) primer, 1 \( X \) Reaction Buffer, dNTP \( 0.25 \mathrm { mM } \), Taq DNA Polymerase (Bioneer사, Daejeon, Korea) \( 0.5 \) U을 넣어 \( 94 ^ {\circ } \mathrm { C } \) 에서 5 분간 predenaturation을 하였고, denaturation은 \( 94 ^ {\circ } \mathrm { C } \) 에서 1분, annealing은 \( 48 ^ {\circ } \mathrm { C } \) 에서 1 분, polymerization은 \( 72 ^ {\circ } \mathrm { C } \) 에서 2 분 과정을 35 회 반복한 후 extention은 \( 72 ^ {\circ } \mathrm { C } \) 에서 5 분간 합성 과 정을 거혔다. 반응 후 PCR 증폭산물은 \( 2 \% \) ethidium bromide 염색된 겔 상에서 전기영동 하였다.</p>