개체 식별을 위하여 최고로 적절한 유전자 표지를 설정하기 위하여 대상집단에서 나타난 이형접합도와 각 좌위별 대립유전자 출현빈도가 극단으로 치우치지 않고 고른 분포를 보이는 것이 가장 중요하다. 국내외적으로 친자 확인을 위한 유전자포지로서의 사용이 권장되고 있는 marker들은 특정 품종 집단에서 활용이 용이하며, 국제적으로 통용되는 유전 표지의 일부분은 표준 유전양상의 비교를 위해 제주마에서 활용이 필요하다. 따라서 개체식별이 높은 유전표지의 추가 발굴과 이들의 활용이 매우 중요하다.
<p>개체 식별을 위한 최적의 유전자표지의 설정을 위해서 분석 대상 집단에서 나타난 이형접합도 뿐만 아니라 각 좌위별 대립 유전자 출현빈도가 극단으로 치우치지 않고 고른 분포를 보이는 것이 가장 바람직하다. 그러나 대부분의 유전표지의 대립유전자 발현 특성은 유전집단(품종)에 따라 매우 다양하게 나타나고 있다. 특히 국내외적으로 친자 확인을 위한 유전자포지로서의 사용이 권장되고 있는 몇몇 marker는 특정 품종 집단에서 활용이 용이한 것으로 나타나고 있다. 따라서 국제적으로 통용되는 유전 표지의 일부분은 표준 유전양상의 비교를 위해 제주마에서 활용이 필요하지만 개체식별이 높은 유전표지의 추가 발굴 및 이들의 활용이 매우 중요한 것으로 생각된다.</p> <p>Table 3에서는 분석 대상이 5 품종에 대한 관련 유전자 표지들에 대한 marker로서 유용성올 판단하기 위해 이형접합도 및 다형성 정보량(PIC)을 제시하였다. ATH5 좌위와 HMS7의 경우 다른 도입 4품종에서 비교적 다양성이 높은 것으로 추정되었지만 제주마 집단에서는 매우 낮은 다양성을 보였다. 즉 LEX33 좌위의 내립 유전자들이 발현 빈도가 극단적인 양상을 보이고 있으며 출현된 대립 유전자의 겅우도 매우 제한적인 것으로 나타났다. 이러한 양상은 CA425에서도 유사한 경향은 보이고 있으며 품종별로 유전자 포지 좌위들에 대한 대립 유전자들의 발현 독성이 상이한 것을 알 수 있었다. 따라서 개체 식별 체계에 활용될 수 있는 유전자 표지는 품종 특이 발현 양상의 분석에 근거를 고려하여 선정하는 것이 바람직 할 것으로 생각된다.</p> <p>2000년 국제 동물유전학회 말 분과위원회에서 9개의 mi-crosatcllite DNA marker를 국제최소검사항목으로 지정한 microsatellite 좌위들 중 3종에 대한 대립 유전자 출현 양상을 각 품종별로 비교하였다. 즉 분석대상 유전표지별 집단 간 대립유전자 발현양상을 비교해보면 특이한 집단별 품종특이성을 발견할 수 있었다. ATH5 좌위에 대한 품종별 대립유전자 발현 특성을 보면 전체 8종의 대립유전자가 나타났다. 외래종 말의 대표적 품종인 THO에서는 158 대립 유전자의 발현 빈도가 0.42로 매우 높은 출현 양상을 보였으며 몽고마종에서는 0.44, 미국원산의 QUA종에서는 비교품종에서 가장 높은 대립 유전자 출현 양상인 0.55, 제주교잡마에서는 0.17로 분석되었다. 반면에 제주마 집단에서는 0.085의 출현빈도를 보였다. 그러나 제주마 집단에서 가장 높은 출현빈도를 보이고 있는 152 대립유전자의 경우 제주교잡마(제주마과더러브렛교잡) 종에서는 0.09, MONG에서는 0.06, QUA에서는 0.05를 보였으며 대표적 외래품종말인 THO에서는 나타나지 않는 것으로 분석되었다. 또한 집단 내 대립유전자 발현이 극단적 발현 양상을 보이는 몇몇 유전표지(MS)가 존재하였다. CA425의 경우 분석대상 품종모두에서 11 종의 발현 대립 유전자중 244 대립유전자의 발현빈도가 0.40 이상을 보이는 것으로 나타났다. ATH5의 경우를 보면 전체품종집단을 기준으로 보면 8종의 대립유전자가 발현된 것으로 분석되었는데 제주마 집단에서는 5종만이 출현됩을 확인하였으며 이중 134 대립유전자의 경우 발현빈도가 \( 50 \% \) 를 나타낸 반면 QUA 집단에서는 발현되지 않았으며 THO에서는 0.01, JRH에서는 0.11, MONG에서는 0.18로 나타났다. 다른 4품종집단에서 발현이 확인된 136 대립유전자의 경우 제주마 집단에서는 전혀 발현되지 않는 것으로 분석되었다. 이러한 결과를 통해보면 품종발현 특이성이 존재하는 유전자표지들을 활용할 경우 제주마나 기타 외래종 품종집단에 대한 개체별 품종식변의 가능성이 존재함을 알 수 있었다.</p>