다양성지수를 확인하기 위하여 Shannon's diversity index \( \left (H ^ {\prime } \right ) \)를 적용하였고, 내생균류의 다양성 분석을 위해 균주들의 목과 속을 확인하였고, 내생균류의 다양성지수를 각 식물군에 대해서 분석했다. 연구에서는 균류들간의 계통수를 작성하여 분리 동정된 내생진균류의 계통학적 유연관계 확인하고자 했으며 부안갯벌에 자생하는 염생식물들의 뿌리에서 동정 및 분리된 내생진균류의 다양성 확인을 위해 Shannon's diversity index를 적용했다.
<h2>내생균류의 유연관계 및 다양성 분석</h2> <p>염생식물로부터 분리된 내생균류의 염기서열을 ClustalX program을 사용하여 다중정렬을 수행하였고, Lasergene 7 program과 BioEdit program을 사용하여 염기서열을 정리 및 확인하였다. 내생균류의 유연관계 분석은 MEGA 4.1 program, neighbor-joining (NJ) 방법으로 분석하였다. 그리고 내생균류의 동정을 위하여 rDNA-ITS 영역의 염기서열을 NCBI의 blastn 으로 확인하였다. 또, 내생균류의 다양성 분석을 위하여 균주들의 목(Order)과 속(Genus)을 확인하였고, 다양성지수를 확인하기 위하여 Shannon's diversity index \( \left (H ^ {\prime } \right ) \)를 적용하였고, 각 식물군에 대한 내생균류의 다양성지수를 분석하였다.</p> <h1>결과</h1> <h2>내생균류의 동정 및 계통학적 유연관계</h2> <p>부안갯벌에 자생하고 있는 2종류(7개체)의 염생식물로부터 형태학적으로 다른 내생균류 87종을 분리 및 선발하였다. 선발된 내생균류는 염생식물 SJI로부터 9주, SJII 로부터 16주, SMI 으로부터 16주, SJIII으로부터 7주, SMII로부터 17주, SMIII 로부터 12주 및 SJIV로부터 7주를 동정하였으며, NCBI의 GenBANK로부터 모든 내생균류에 대하여 accession number [JX041013-JX041051] 를 제공받았다.</p> <p>내생균류의 계통분석은 SJI에서 자낭균문(Ascomycota), Eurotiales목에 속하는 Penicillium 속과 Hypocreales목에 속하는 Gibberella속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속과 분류체계가 명확하지 않은 Incertae sedis에 속하는 Macrophoma속이 확인되었다. SJII에서는 자낭균문, Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Dothideales목에 속하는 Aureobasidium속과 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속, Aspergillus속이 확인되었고, Hypocreales목에 속하는 Hypocrea속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Pleosporales속이 확인되었다.</p> <p>SMI에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Eurotiales목에 속하는 Aspergillus속, Penicillium속 및 Talaromyces속이 확인되었고, Pleosporales 목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales 속이 확인되었다. SJIII에서는 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과, Hypocreales 목에 속하는 Fusarium 속이 확인되었고, Pleosporales 목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales속이 확인되었다. SMII에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporium 속과 Eurotiales목에 속하는 Eupenicillium속과 Pleosporales 목에 속하는 Alternaria 속, Phoma속, Peyronellaea속, Pleospora속이 확인되었고, 분류체계가 명확하지 않은 Macrophoma속이 확인되었으며, 담자균문(Basidiomycota)의 Agaricales목에 속하는 Schizophyllum속이 확인되었다. SMIII에서는 Dothideales목에 속하는 Aureobasidium 속과 Eurotiales목에 속하는 Aspergillus속이 확인되었고, Hypocreales목에 속하는 Fusarium 속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Lewia속, 그리고 Pleosporales속이 확인되었다. SJIV에서는 Capnodiales목에 속하는 Cladosporium속과 Eurotiales목에 속하는 Penicillium속과 Pleosporales목에 속하는 Alternaria속, Phoma속, Pleosporales속이 확인되었으며, 분류체계가 명확하지 않은 Pseudeurotium속이 확인되었다. 본 연구에서 분리 동정된 내생진균류의 계통학적 유연관계를 확인하기 위하여 균류들간의 계통수를 작성하였다.</p> <h2>내생진균류의 다양성지수 분석</h2> <p>부안갯벌에 자생하는 염생식물들의 뿌리로부터 분리 및 동정된 내생진균류의 다양성을 확인하기 위하여 Shannon's diversity index를 적용하였다. 그리고 내생진균은 SJI에서 6속 5종, SJII에서 7속 9종, SMI에서 7속 12종, SJIII에서 5속 5종, SMII에서 8속 9종, SMIII에서 9속 7종, SJIV에서 6속 6종에 해당하는 내생균류들을 확인하였고, 분리된 균류들의 목과 속에 대한 구성비 \(( \%) \)를 나타내었다. 그리고 부안갯벌에 자생하는 염생식물에 따른 내생진균류의 다양성 지수는 SJI (1.735), SJII (1.787), SMI (1.717), SJIII (1.550), SMII (1.840), SMIII (2.095), SJIV (1.748)로 확인되었다.</p>