Fig. 2는 피조개 종류에 관계없이 득량, 가막, 남해, 진해, 태안 및 중국 산둥반도에서 양식되는 피조개들이 거의 동일한 \( 720 \mathrm{bp} \) 크기의 단일 밴드를 나타내는 mtDNA의 16 S rRNA 영역을 PCR한 결과를 나타낸 것입니다. 일반적으로 mtDNA에 대한 PCR-RFLP는 계통유전학적 연구에서 많은 개체를 빠르게 분석할 수 있는 유용한 방법으로 알려져 있지만, polymorphism의 탐색에는 제한이 있다고 판단된다. 따라서 앞으로 지리적으로 격리된 피조개의 haplotype 빈도, 유전자 다양도, 유전자 거리, 유전자 이입 등을 조사하여 우리나라 피조개의 유전적 특성을 분석함으로써 양식 방법에 따른 유전자 흐름을 설명할 수 있는 기대가 크다.
<h1>결과 및 고찰</h1> <p>Fig. 2는 mtDNA의 16 S rRNA region을 PCR한 결과를 확인한 것으로, 득량, 가막, 남해, 진해, 태안 및 중국 산둥반도 에서 양식되는 피조개 모두가 거의 비숫한 \( 720 \mathrm{bp} \) 단일한 band률 보였다. PCR product를 HaeIII 처리시 득량, 가막, 태안산에서는 모두 restriction site를 갖지 않기 \( 700 \mathrm{bp} \) 에서 유사한 1개의 band가 나타났으나, 남해와 진해산의 절단 pattern은 \( 700 \mathrm{bp} \) 의 위치에서 다소 희미하지만, 늑량, 가막, 태안과는 상이한 fragment가 보였다. 또한 중국산도 \( 700 \mathrm{bp} \) 위치에선 한국산과는 구별이 식별될 수 있는 위치에서 절단이 나타났다. Hinfl는 다른 제한효소와 달리 1개의 절단부위를 인식하여 한국산에서는 모두 \( 275 \mathrm{bp} \) 단편이 보였으나, 중국산은 \( 700 \mathrm{bp} \) 단일 band만 나타났다. SPSS program을 이용하여 restriction type에 의해 작성된 한국산과 중국산의 유연관계는 거리가 25 로 나타났고, 한국산 내에서 도 득량, 가막, 태안은 남해과 진해와의 거리가 7 정도로 나타났다.</p> <p>일반적으로 mtDNA에 대한 PCR-RFLP는 많은 개체를 빠른 시간에 수행할 수 있어 계통유전학적 연구에 있어서 어느 정도 유용한 방법으로 생각되나 polymorphism의 탐색에는 한계가 있는 것으로 판단된다. 그러나 종은 molecular marker 만 있으면 종간 혹은 종내의 구분을 아주 손쉽고 간편하게 처리할 수 있다. 이 실험에서 보여준 피조개 mtDNA 의 16 S rRNA gene에 대한 HinfI 처리는 형태학적으로 거의 유사한 중국산과 한국산을 신속하게 동정할 수 있을 것으로 보여, 앞으로 DNA 염기서열을 분석 - 비교하는 방법을 대신할 수 있을 것으로 기대된다. 문제점은 16 S rRNA region은 8 종류의 제한효소를 사용해도 인식부위가 예상보다 매우 적어서 유전자 및 유전자형 빈도 양상이 거의 monomorphism에 가 깝기 때문에 \( 4 \mathrm{mer} \) 인식 제한효소 뿐만 아니라 사용 폭을 넓혀 \( 6 \mathrm{mer} \) 제한효소 등 여러 종류의 제한효소가 필요하다. 또한 target gene-을 cytochrome oxidase subunit complex (COI, II, III) 및 control region 등에 대해서도 시도하면 좀 더 좋은 결과가 있을 것으로 보인다.</p> <p>RAPD (Randdom Amplified Polymorphic DNA) 방법에 사용된 primer는 \( 10 \mathrm{mer} \) 이하일 뿐 만 아니라 PCR시 annealing temperature가 매우 낮아서 재현성에 문제가 있는 것으로 알려져 있다. 이러한 단점에도 불구하고 한국산과 중 국산 피조개에 대한 RAPD와 이 실험에서 사용된 PCR-RFLP 결과는 거의 유사하게 나타났다. 즉 한국산과 중국산 피조개는 형태적으로 거의 유사하지만, 유전적으로 구분된다는 점에서 RAPD나 RFLP 방법 모두 피조개 집단 구분에 좋은 tool로 판단된다. 이러한 유전적 차이를 지리적인 격리에 의한 고유의 지역개체군 형성으로 설명하고 있다. 이 실험을 통하여 종간 구분은 가능할지 몰라도, 종내의 차이를 밝히기 위해서는 PCR-RFLP 방법에 의한 제한효소로서는 어려움이 있는 것으로 판단되어, polymorphism을 밝히기 위해서는 DNA 염기서열에 의한 정밀 분석이 되어야 될 것 같다. 따라서 앞으로 지리적으로 격리된 피조개의 haplotype 빈도, 유전자 다양도, 유전자 거리, 유전자 이입 등을 조사하면 우리나라에 서식하는 피조개의 유전자 특성을 제시함으로써 양식에 따른 gene flow을 설명할 수 있을 것으로 기대된다.</p>