꿀풀목 식물들의 분류는 현재에도 진행형에 있으며, 2009년 12월 초에 꿀풀목에 속하는 식물들 중 18S rRNA의 염기서열이 완전히 또는 거의 완전히 밚혀져 있는 식물들은 겨우 62종에 불과하였다. 이에 본 연구는 아직 18S rRNA의 염기서열이 알려져 있지 않고 대한민국에서 흔히 발견되는 꽃며느리밥풀, 나도송이풀, 물칭개나물, 외풀, 주름잎을 확보하여 그 genomic DNA를 추출하고 18S rRNA의 염기서열 등을 밝혀 Genbak에 등록하였으며, 이렇게 얻은 염기서열들을 서로 비교하여 엽록체 DNA의 염기서열에 의한 분류체계와 비교해보았다.
<h1>서 론</h1> <p>현삼과(Scrophulariaceae)는 19세기부터 존재하던 분류군으로서 꿀풀목(Lamiales)에 속하며, 전세계에 걸쳐 널리 분포하는 식물들을 포함하고 있다[4,10]. 그러나 현삼과를 정의하는 명확한 특징이 없었기 때문에 이 분류군에 속하는 식물들간의 상관관계에 대해 오래전부터 의문이 제기되어 왔다[10]. 이 분류군에 속하는 식물들의 엽록체 유전자들(rbcL, ndhF 및rps2)의 염기서열을 비교하여 분자유전학적으로 분석하려는 시도가 1990년대에 시작되었는데, 그 결과 종래에 현삼과로 분류되어왔던 식물들을 여러 개의 서로 다른 과로 다시 분류해야 한다는 의견들이 제시되어서 수용되었다[3,9,10]. 이 중에서 국내에 널리 분포되어있는 꽃며느리밥풀 (Melampyrum roseum)과 나도송이풀(Phtheirospermum japonicum)은 열당과 (Orobanchaceae)로 옮겨졌고, 물칭개나물(Pseudolysimachionundulata)은 질경이과(Plantagianaceae)로 옮겨졌으며, 주름잎(Mazus pumilus)은 파리풀과(Phrymaceae)로 재분류되었고,외풀(Lindernia crustacea))은 외풀과(Linderniaceae)로 재분류되었으며[13],지황은 현재 속하는 과(family)가 모호한 상태이다. 그러나 주름잎을 파리풀과로 분류하는 것과 외풀을 외풀과로 분류하는 것에 대해서 나중에 의문이 제기되어 있는 상 태이기 때문에 종래에 현삼과로 분류되었던 꿀풀목 식물들의 분류는 아직도 진행형이라고 볼 수 있다[12]. 생명체들의 진화적 차이 및 서로간의 상관관계를 비교하기 위해서는 현재 원핵생물들은 16S rRNA의 염기서열, 그리고</p> <p>진핵생물의 경우에는 \( 18 \mathrm { ~S } \) rRA의 염기서열을 많이 비교하고 있다[2,11]. 또한 종 단위 또는 그 이하의 세분류를 위해서는 ITS1과 ITS2의 염기서열을 사용하기도 한다[7,8]. 그리고 엽록체 DNA의 염기서열을 사용하기도 하는데, 이 경우는 ITS 염기서열보다는 더 큰 단위의 분류에 사용 된다[8]. 현재 현삼과 또는 연관된 과의 식물들 중에서 18S rRNA의 염기서열이 알려져 있는 것들은 스수에 불과하다. 본 연구자가 2009년 12월 초에 GenBank에서 조사를 해 본 결과, 꿀풀목에 속하는 식물들 중에서 18S rRNA의 염기서열이 완전히 또는 거의 완전히 밚혀져 있는 식물들은 겨우 62 종에 불과했다. 이는 현재까지 알려져 있는 꿀풀목 식물들 11,000 여 종의 \( 1 \% \) 에도 훨씬 못 미치는 수치이다. 따라서 본 연구에서는 아직까지 18S rRNA의 염기서열이 알려져 있지 않고, 우리나라에서 흔하게 발견되는 자생식물들 중에서 종래에는 현삼과에 속했었으나 현재에는 여러 개의 다른 과로 재분류된 꽃며느리밥풀(Melampyrmroseum), 나도송이풀(Phtheirospermum japonicum), 물칭개나물(Pseudolysimachion undulata), 외풀(Lindernia crustacea) 그리고주름잎(Mazus pumilus)을 확보하여 그 genomic DNA를 추출 하고,18S rRNA 유전자 및 ITS1의 염기서열을 밝혀서 이를 GenBank에 등록하였다(accession numbers GU359046, GU359047, GU359048, GU359049, GU359050, respectively). 이렇게 얻어진 염기서열들을 서로 비교해서 엽록체 DNA의 염기서열에 의한 분류체계와 비교해 보았다.</p>