본 연구에서는 대장균 트립토판 중합효소 \( \alpha \) 소단위체 \( ( \alpha \mathrm { TS } ) \)의 \( Y173F \) 치환이 다양한 단백질 돌연변이체의 응집을 억제하고 있음을 보여주며 \( P28L \) \( ( \alpha \mathrm { TS } ) \) 도 이와 비슷한 성질을 보이고 \( \mathrm { Pro } ^ { 28 } \)과 \( \mathrm { Tyr } ^ { 173 } \) 잔기는 도메인 간의 폴딩과정에도 영향을 미친다.
<h2>단백질의 트립신에 대한 민감도</h2> <p>\( a \)TS를 트립신으로 약하게 처리하면 188과189번 자리이후 추가적으로 70과71번 자리가 잘려 1-70, 71-188, 189-268으로 세 토막 나는 등 분해가 더 진행된다. 구조차이를 살피기 위해 트립신을 처리하고 크기배제 크로마토그라피 HPLC로 분석하였다(Fig. 5). 15 분 처리시 \( P28L \)은 많은 단백질이 잘려 작은 절편으로 전환된 데 비해, \( P28L \)/ \( Y173F \)는 거의 변화가 없음을 보여주고 있다. 이는 \( P28L \)는 188/189, 70/71 부분의 구조가 불안정해졌으며, \( P28L \)/ \( Y173F \)는 안정한 상태로 되돌아갔음을 나타낸다.</p> <h1>고 찰</h1> <p>본 연구에서는 대장균 트립토판 중합효소 \( \alpha \) 소단위체 \( ( \alpha \mathrm { TS } ) \) 에서 \( Y173F \)치환이 다양한 단백질 돌연변이체의 응집을 억제하고 있음을 보여주고 있다. 감소된 이차구조함량과 소수성 표면의 증대가 응집된 단백질의 특징으로 보고된 바 있다. \( P28L \) \( ( \alpha \mathrm { TS } ) \) 도 이와 비숫한 성질을 보여 준다. 규명된 야생형과 \( P28L \)/ \( Y173F \) 치환 \( \alpha \mathrm { TS } \) 의 X-ray 분자구조롤 살펴보면 \( \mathrm { Pro } ^ { 28 } \) 는 첫번째 \( \alpha \) 나선과 첫번째 \( \beta \) 병풍구조 사이의 연결 루프에 위치하며 TIM 배털의 전반적인 구조유지에 중요한 역할을 하는 것으로 보인다. 이 자리 Pro이 Leu으로 치환되면 이 잔기 주위의 부분 구조에 변화가 초래되고, 이것이 본 연구에서 관찰된 소수성 표면 증대롤 포함한 전반적인 구조 변화로 연결된 둣 하다. \( \mathrm { Tyr } ^ { 173 } \) 은 두 개 도메인사이에 소수성코어롤 차지하는 6 번째 \( \beta \) 병풍구조에 위치한다. 이 자리의 Tyr이 Phe으로 치환 되면서 소수성코어를 더 강화된 것으로 보인다. 한편 속도가 늦어진 폴딩 과정은 분자간 응집 가능성을 높일 수 있다. N도메인에 위치한 \( \mathrm { Pro } ^ { 28 } \) 와 \( \mathrm { Tyr } ^ { 173 } \) 잔기는 C 도메인과 상호작용하는 자리에 있음으로 도메인 간의 폴딩과정에도 영향을 미치리라 추정된다. 본 연구에서는 소수성 코아에 위치하는 \( \mathrm { Tyr } ^ { 173 } \) 잔기가 응집을 유도하는 여러 다른 잔기 자리롤 억제할 수 있음을 보여주었다. 이와 같이 단백질에는 단백질 응집을 보다 광범위하게 억제하는 잔기가 있을 가능성이 있다.</p>