BianQue-1.0 / README.md
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- text: 病人:我最近感觉全身疲惫。\n医生:是劳累了,还是熬夜了?\n病人:这周都在熬夜赶论文\n医生:
- text: 病人:我最近感觉全身疲惫。\n医生:
- text: 病人:我感觉自己好像发烧了,怎么办?\n医生:
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- zh
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# 扁鹊-1.0:通过混合指令和多轮医生问询数据集的微调,提高医疗聊天模型的“问”能力
## 简介
**扁鹊-1.0(BianQue-1.0)**是一个经过指令与多轮问询对话联合微调的医疗对话大模型。我们经过调研发现,在医疗领域,往往医生需要通过多轮问询才能进行决策,这并不是单纯的“指令-回复”模式。用户在咨询医生时,往往不会在最初就把完整的情况告知医生,因此医生需要不断进行询问,最后才能进行诊断并给出合理的建议。基于此,我们构建了**扁鹊-1.0(BianQue-1.0)**,拟在**强化AI系统的问询能力**,从而达到模拟医生问诊的过程。我们把这种能力定义为“望闻问切”当中的“问”。
综合考虑当前中文语言模型架构、参数量以及所需要的算力,我们采用了[ClueAI/ChatYuan-large-v2](https://huggingface.co/ClueAI/ChatYuan-large-v2)作为基准模型,在8张 NVIDIA RTX 4090显卡上微调了1个epoch得到**扁鹊-1.0(BianQue-1.0)**,用于训练的**中文医疗问答指令与多轮问询对话混合数据集**包含了超过900万条样本,这花费了大约16天的时间完成一个epoch的训练。
我们将计划围绕扁鹊模型的“望闻问切”能力,结合医学专家知识、多模态技术、多生理信号计算等,进行多个版本的模型迭代研究。
扁鹊(BianQue)模型欢迎你的贡献!我们鼓励你在 [BianQue GitHub](https://github.com/scutcyr/BianQue) 页面报告问题、贡献 PR 并参与讨论。我们期待与更多的高校、医院、研究实验室、公司等进行合作,共同开展下一代扁鹊模型研究。对于此类需求(以及其他不适合在 GitHub 上提出的需求),请直接发送电子邮件至 [[email protected]](mailto:[email protected])。
## 训练数据
我们结合当前开源的中文医疗问答数据集([MedDialog-CN](https://github.com/UCSD-AI4H/Medical-Dialogue-System)、[IMCS-V2](https://github.com/lemuria-wchen/imcs21)、[CHIP-MDCFNPC](https://tianchi.aliyun.com/dataset/95414)、[MedDG](https://tianchi.aliyun.com/dataset/95414)、[cMedQA2](https://github.com/zhangsheng93/cMedQA2)、[Chinese-medical-dialogue-data](https://github.com/Toyhom/Chinese-medical-dialogue-data)),以及自建的指令数据集,通过进一步的数据清洗,构建了一个大于900万条样本的**中文医疗问答指令与多轮问询对话混合数据集**,数据集的平均轮数为3,最大轮数达到218,数据格式为:
```data
input: "病人:六岁宝宝拉大便都是一个礼拜或者10天才一次正常吗,要去医院检查什么项目\n医生:您好\n病人:六岁宝宝拉大便都是一个礼拜或者10天才一次正常吗,要去医院检查什么项目\n医生:宝宝之前大便什么样呢?多久一次呢\n病人:一般都是一个礼拜,最近这几个月都是10多天\n医生:大便干吗?\n病人:每次10多天拉的很多\n医生:"
target: "成形还是不成形呢?孩子吃饭怎么样呢?"
```
训练数据当中混合了大量target文本为**医生问询的内容**而非直接的建议,这将有助于提升AI模型的问询能力。
## 模型“问”能力示例
“望闻问切”四诊法由扁鹊发明。“四诊法”(望、闻、问、切),是中医诊病的基本方法。其中,“问”的能力可以被建模到语言模型当中。我们把AI模型的“问”能力定义为:
**“问”能力**:AI模型能够根据病人输入的信息,结合医学知识来进行**恰当的问询**,并且结合进一步的问询得到的病人的信息,给出“合适的诊断或建议”。“问”的过程通常是一个多轮对话过程。
以下是一个简单的例子:
* **例子1**
用户:我最近感觉全身疲惫
扁鹊-1.0:是劳累了,还是熬夜了?
用户:这周都在熬夜赶论文
扁鹊-1.0:嗯,熬夜容易引起各种不适,如头晕、乏力、失眠、多梦等,多休息,可以口服谷维素、维生素B1和安神补脑液,避免熬夜。
* **例子2**
用户:我最近经常失眠
扁鹊-1.0:失眠多久了?
用户:两周了
扁鹊-1.0:睡眠怎么样?
用户:上床几小时才睡得着
扁鹊-1.0:可以口服一些药物
用户:有具体推荐吗
扁鹊-1.0:需要先检查一下
用户:那我需要做什么检查?
扁鹊-1.0:心电图
## 使用方法
```python
import os
from transformers import T5Tokenizer, T5ForConditionalGeneration, AutoTokenizer
import torch
device = torch.device("cuda" if torch.cuda.is_available() else "cpu")
tokenizer = T5Tokenizer.from_pretrained("scutcyr/BianQue-1.0")
model = T5ForConditionalGeneration.from_pretrained("scutcyr/BianQue-1.0")
def preprocess(text):
text = text.replace("\n", "\\n").replace("\t", "\\t")
return text
def postprocess(text):
return text.replace("\\n", "\n").replace("\\t", "\t")
def answer(user_history, bot_history, sample=True, top_p=1, temperature=0.7):
'''sample:是否抽样。生成任务,可以设置为True;
top_p:0-1之间,生成的内容越多样
max_new_tokens=512 lost...'''
if len(bot_history)>0:
context = "\n".join([f"病人:{user_history[i]}\n医生:{bot_history[i]}" for i in range(len(bot_history))])
input_text = context + "\n病人:" + user_history[-1] + "\n医生:"
else:
input_text = "病人:" + user_history[-1] + "\n医生:"
return "我是利用人工智能技术,结合大数据训练得到的智能医疗问答模型扁鹊,你可以向我提问。"
input_text = preprocess(input_text)
print(input_text)
encoding = tokenizer(text=input_text, truncation=True, padding=True, max_length=768, return_tensors="pt").to(device)
if not sample:
out = model.generate(**encoding, return_dict_in_generate=True, output_scores=False, max_new_tokens=512, num_beams=1, length_penalty=0.6)
else:
out = model.generate(**encoding, return_dict_in_generate=True, output_scores=False, max_new_tokens=512, do_sample=True, top_p=top_p, temperature=temperature, no_repeat_ngram_size=3)
out_text = tokenizer.batch_decode(out["sequences"], skip_special_tokens=True)
print('医生: '+postprocess(out_text[0]))
return postprocess(out_text[0])
answer_text = answer(user_history=["你好!",
"我最近经常失眠",
"两周了",
"上床几小时才睡得着"],
bot_history=["我是利用人工智能技术,结合大数据训练得到的智能医疗问答模型扁鹊,你可以向我提问。",
"失眠多久了?",
"睡眠怎么样?"])
```
## 声明
**扁鹊-1.0(BianQue-1.0)**当前仅经过1个epoch的训练,尽管模型具备了一定的医疗问询能力,但其仍然存在以下局限:
* 训练数据来源于开源数据集以及互联网,尽管我们采用了严格的数据清洗流程,数据集当中仍然不可避免地存在大量噪声,这会使得部分回复产生错误;
* 医生“问询”是一项复杂的能力,这是非医生群体所不具备的,当前的模型对于模拟“医生问询”过程是通过大量样本学习得到的,因此在问询过程当中,有可能出现一些奇异的提问风格。换一句话来说,当前版本的模型强化了“问”的能力,但是“望”、“闻”、“切”的能力仍待进一步研究!
## 引用
```bib
@article{chen2023bianque1,
title={BianQue-1.0: Improving the "Question" Ability of Medical Chat Model through finetuning with Hybrid Instructions and Multi-turn Doctor QA Datasets},
author={Yirong Chen and Zhenyu Wang and Xiaofen Xing and Zhipei Xu and Kai Fang and Sihang Li and Junhong Wang and Xiangmin Xu},
year={2023},
url={https://github.com/scutcyr/BianQue}
}
```