Datasets:
id
stringlengths 1
4
| tokens
sequence | ner_tags
sequence |
---|---|---|
0 | [
"Varón",
"de",
"77",
"años",
"de",
"edad",
",",
"sin",
"antecedentes",
"de",
"interés",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
1 | [
"Consulta",
"por",
"enrojecimiento",
"de",
"la",
"piel",
"en",
"tercio",
"superior",
"del",
"tórax",
"y",
"parte",
"proximal",
"de",
"ambos",
"miembros",
"junto",
"con",
"debilidad",
"muscular",
"proximal",
"en",
"brazos",
"y",
"piernas",
",",
"eritema",
"en",
"heliotropo",
"en",
"párpados",
"y",
"pápulas",
"violáceas",
"en",
"los",
"nudillos",
"de",
"ambas",
"manos",
",",
"de",
"un",
"mes",
"de",
"evolución",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
2 | [
"Se",
"realiza",
"analítica",
"destacando",
"creatinkinasa",
"736",
"UI",
",",
"LDH",
"545",
"UI",
",",
"urea",
"63",
"mg",
"/",
"dl",
",",
"CA",
"19.9",
"64,1",
"U",
"/",
"ml",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
7,
0,
0,
0,
0,
0
] |
3 | [
"Electromiograma",
":",
"Hallazgos",
"compatibles",
"con",
"proceso",
"miopático",
"inflamatorio",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
4 | [
"Biopsia",
"muscular",
":",
"Cambios",
"inflamatorios",
"compatibles",
"con",
"dermatomiositis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
5 | [
"Con",
"el",
"diagnóstico",
"de",
"dermatomiositis",
"se",
"inicia",
"tratamiento",
"con",
"prednisona",
"60",
"mg",
"/",
"día",
"y",
"estudio",
":",
"TAC",
"toracoabdominal",
":",
"Masa",
"pancreática",
"de",
"6",
"cm",
"y",
"lesiones",
"hipodensas",
"hepáticas",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
6 | [
"Punción-biopsia",
"hepática",
":",
"Adenocarcinoma",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0
] |
7 | [
"Se",
"remite",
"a",
"Oncología",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0
] |
8 | [
"Tras",
"8",
"semanas",
"de",
"corticoides",
",",
"sin",
"mejoría",
"de",
"las",
"lesiones",
"cutáneas",
"ni",
"de",
"la",
"debilidad",
"muscular",
",",
"y",
"ante",
"el",
"diagnóstico",
"de",
"adenocarcinoma",
"pancreático",
"en",
"estadio",
"IVB",
"por",
"metástasis",
"hepáticas",
"comenzamos",
"tratamiento",
"con",
"gemcitabina",
"1250",
"mg",
"/",
"m2",
"días",
"1",
"y",
"8",
"cada",
"21",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
9 | [
"Tras",
"2",
"ciclos",
"de",
"tratamiento",
"se",
"documenta",
"resolución",
"completa",
"de",
"las",
"lesiones",
"cutáneas",
",",
"normalización",
"de",
"las",
"enzimas",
"musculares",
"y",
"recuperación",
"de",
"la",
"fuerza",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
10 | [
"Actualmente",
"el",
"paciente",
"se",
"mantiene",
"asintomático",
"tras",
"6",
"ciclos",
"de",
"tratamiento",
"y",
"con",
"respuesta",
"menor",
"del",
"50%",
"de",
"su",
"enfermedad",
"de",
"base",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
11 | [
"Mujer",
"de",
"24",
"años",
"de",
"edad",
",",
"drogadicta",
",",
"HIV",
"negativo",
",",
"con",
"historia",
"desde",
"hace",
"9",
"meses",
"de",
"infiltrados",
"nodulares",
"pulmonares",
"con",
"diagnóstico",
"clínico",
"de",
"posible",
"granulomatosis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
12 | [
"Debutó",
"hace",
"1",
"mes",
"con",
"fiebre",
"y",
"dolor",
"abdominal",
"por",
"masa",
"anexial",
"derecha",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
13 | [
"En",
"la",
"exploración",
"se",
"vió",
"una",
"masa",
"ovárica",
"derecha",
"de",
"12",
"cm",
",",
"junto",
"a",
"otra",
"en",
"meso",
"de",
"colon",
"transverso",
"de",
"2",
"cm",
"que",
"se",
"extirparon",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
14 | [
"Simultáneamente",
"la",
"paciente",
"refería",
"una",
"tumoración",
"en",
"muslo",
"derecho",
"de",
"4",
"cm",
",",
"localizada",
"en",
"profundidad",
"del",
"tejido",
"celular",
"subcutaneo"
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
15 | [
"El",
"tumor",
"ovárico",
"y",
"el",
"nódulo",
"mesentérico",
"presentaban",
"una",
"superficie",
"externa",
"lobulada",
",",
"cuya",
"superficie",
"de",
"sección",
"mostraba",
"areas",
"sólidas",
"y",
"quísticas",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
16 | [
"En",
"el",
"ovario",
",",
"las",
"células",
"presentaban",
"predominantemente",
"una",
"morfología",
"epitelioide",
"con",
"nucleolo",
"prominente",
"y",
"patrón",
"de",
"crecimiento",
"difuso",
"con",
"pequeñas",
"espacios",
"quísticos",
"o",
"seudofoliculos",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
17 | [
"En",
"el",
"nódulo",
"mesentérico",
"predominaba",
"una",
"morfología",
"fusocelular",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
18 | [
"Se",
"observaban",
"areas",
"alternativas",
"hipercelulares",
"e",
"hipocelulares",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
19 | [
"Existian",
"extensas",
"y",
"frecuentes",
"areas",
"de",
"necrosis",
"geográfica",
"con",
"tendencia",
"a",
"preservar",
"aquellas",
"células",
"tumorales",
"que",
"rodeaban",
"a",
"los",
"vasos",
"resultando",
"en",
"un",
"patrón",
"periteliomatoso",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
20 | [
"A",
"mayor",
"aumento",
",",
"las",
"células",
"tumorales",
"fusiformes",
"mostraban",
"nucleo",
"oval",
"y",
"nucleolo",
"no",
"prominente",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
21 | [
"Se",
"observaban",
"más",
"de",
"10-20",
"mitosis",
"por",
"10",
"campos",
"de",
"gran",
"aumento",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
22 | [
"Inmunofenotípicamente",
"el",
"tumor",
"expresó",
"vimentina",
",",
"S-100",
",",
"HMB-45",
"y",
"actina",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
3,
0,
3,
0
] |
23 | [
"La",
"tinción",
"para",
"S-100",
"era",
"intensa",
"y",
"difusa",
"."
] | [
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0
] |
24 | [
"El",
"tumor",
"no",
"expresaba",
"marcadores",
"epiteliales",
"ni",
"otros",
"marcadores",
"como",
"CD",
"117",
",",
"CD",
"68",
",",
"CD",
"99",
",",
"colágeno",
"IV",
",",
"receptores",
"de",
"estrógenos",
",",
"receptores",
"de",
"progesterona",
"e",
"inhibina",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
7,
0,
3,
7,
0,
3,
7,
0,
3,
7,
0,
3,
7,
7,
0,
3,
7,
7,
0,
3,
0
] |
25 | [
"El",
"tumor",
"del",
"muslo",
"extirpado",
"posteriormente",
"no",
"tenía",
"relación",
"con",
"la",
"epidermis",
"e",
"histológicamente",
"era",
"superponible",
"al",
"tumor",
"ovárico",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
26 | [
"La",
"distribución",
"de",
"los",
"nódulos",
"tumorales",
",",
"la",
"combinación",
"de",
"patrones",
"histológicos",
"y",
"el",
"perfil",
"inmunohistoquímico",
"fué",
"consistente",
"con",
"el",
"diagnóstico",
"de",
"melanoma",
"maligno",
"metastásico",
",",
"originado",
"sobre",
"un",
"tumor",
"primario",
"de",
"origen",
"desconocido",
"ya",
"que",
"la",
"paciente",
"fue",
"explorada",
"y",
"no",
"se",
"encontró",
"ninguna",
"lesión",
"pigmentada",
"preocupante",
"ni",
"existian",
"datos",
"de",
"regresión",
"de",
"una",
"de",
"ellas",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
27 | [
"Se",
"instauró",
"el",
"tratamiento",
"con",
"quimioterapia",
"(",
"Cisplatino",
",",
"Interleukina",
"II",
",",
"Dacarbacina",
"e",
"Interferon",
"alfa",
")",
"y",
"3",
"meses",
"más",
"tarde",
",",
"la",
"paciente",
"falleció",
"desarrollando",
"metástasis",
"abdominales",
"multiples",
",",
"entre",
"ellas",
"masa",
"ovárica",
"contralateral",
"de",
"13",
"cm",
",",
"adenopatias",
"retroperitoneales",
"y",
"metástasis",
"subcutaneas",
"múltiples",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
3,
7,
0,
2,
0,
3,
7,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
28 | [
"Se",
"trata",
"de",
"un",
"varón",
"de",
"59",
"años",
",",
"diagnosticado",
"de",
"carcinoma",
"escamoso",
"de",
"laringe",
"T2N2b",
",",
"que",
"se",
"trató",
"inicialmente",
"con",
"tres",
"ciclos",
"de",
"quimioterapia",
"sin",
"remisión",
",",
"por",
"lo",
"que",
"tres",
"meses",
"después",
"se",
"realizó",
"una",
"laringectomía",
"supraglótica",
",",
"con",
"vaciamiento",
"radical",
"incompleto",
"modificado",
"del",
"lado",
"izquierdo",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
29 | [
"La",
"anatomía",
"patológica",
"demostró",
"un",
"carcinoma",
"escamoso",
"infiltrante",
"en",
"hemiepiglotis",
"izquierda",
"con",
"8",
"de",
"11",
"ganglios",
"linfáticos",
"positivos",
"de",
"la",
"cadena",
"yugular",
"interna",
",",
"subdigástricos",
"y",
"supraclaviculares",
"izquierdos",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
30 | [
"Posteriormente",
"recibió",
"quimioterapia",
"y",
"radioterapia",
"sobre",
"supraglotis",
"e",
"hipofaringe",
"y",
"áreas",
"ganglionares",
"bilaterales",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
31 | [
"Nueve",
"meses",
"después",
"de",
"la",
"cirugía",
"consultó",
"por",
"cefalea",
"de",
"tres",
"semanas",
"de",
"evolución",
"asociada",
"a",
"diplopia",
"binocular",
"y",
"visión",
"borrosa",
"del",
"ojo",
"derecho",
",",
"evidenciándose",
"oftalmoparesia",
"del",
"III",
",",
"IV",
"y",
"VI",
"pares",
"craneales",
"derechos",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
32 | [
"Una",
"resonancia",
"magnética",
"(",
"RM",
")",
"cerebral",
"mostró",
"una",
"masa",
"en",
"la",
"porción",
"posterior",
"y",
"lateral",
"del",
"seno",
"cavernoso",
"derecho",
",",
"con",
"protusión",
"hacia",
"la",
"cisterna",
"prepontina",
",",
"bien",
"delimitada",
",",
"con",
"captación",
"homogénea",
"de",
"gadolinio",
"y",
"unas",
"dimensiones",
"de",
"11x14,4x12,2",
"mm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
33 | [
"En",
"la",
"ventana",
"ósea",
"de",
"la",
"TAC",
"no",
"se",
"observaron",
"ni",
"lesiones",
"líticas",
"ni",
"invasión",
"del",
"ala",
"o",
"seno",
"esfenoidal",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
34 | [
"La",
"TAC",
"toraco-abdomino-pélvica",
"fue",
"negativa",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
35 | [
"El",
"diagnóstico",
"diferencial",
"radiológico",
"fue",
"de",
"schwannoma",
",",
"meningioma",
"o",
"metástasis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
36 | [
"Se",
"realizó",
"una",
"biopsia",
"abierta",
"con",
"abordaje",
"transilviano",
"a",
"la",
"pared",
"lateral",
"del",
"seno",
"cavernoso",
"donde",
"se",
"observó",
"la",
"invasión",
"tumoral",
"del",
"espacio",
"intradural",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
37 | [
"El",
"resultado",
"anatomopatológico",
"fue",
"de",
"carcinoma",
"escamoso",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
38 | [
"Posteriormente",
"se",
"administró",
"radioterapia",
"a",
"titulo",
"paliativo",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
39 | [
"Tres",
"semanas",
"después",
"de",
"la",
"cirugía",
"el",
"paciente",
"consultó",
"por",
"dolor",
"dorsal",
"sin",
"clínica",
"neurológica",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
40 | [
"Un",
"estudio",
"de",
"RM",
"de",
"raquis",
"mostró",
"lesiones",
"focales",
"en",
"los",
"cuerpos",
"D4",
",",
"D6",
"y",
"D10",
"sospechosas",
"de",
"implantes",
"metastásicos",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
41 | [
"Con",
"el",
"tratamiento",
"radioterápico",
"se",
"alivió",
"la",
"cefalea",
",",
"pero",
"desarrolló",
"una",
"oftalmoplejía",
",",
"conservando",
"únicamente",
"la",
"abducción",
"del",
"ojo",
"derecho",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
42 | [
"El",
"paciente",
"falleció",
"nueve",
"meses",
"tras",
"el",
"diagnóstico",
"de",
"la",
"metástasis",
"en",
"el",
"seno",
"cavernoso",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
43 | [
"Paciente",
"de",
"62",
"años",
"de",
"edad",
",",
"consulta",
"por",
"presentar",
"dolor",
"en",
"hemiescroto",
"derecho",
"de",
"tres",
"meses",
"de",
"evolución",
",",
"al",
"examen",
"físico",
"se",
"constata",
"varicocele",
"derecho",
"grado",
"IV",
",",
"palpándose",
"además",
"voluminosa",
"masa",
"a",
"nivel",
"del",
"área",
"renal",
"derecha",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
44 | [
"Se",
"realiza",
"ecografía",
"abdominal",
"que",
"informa",
"masa",
"heterogénea",
"de",
"10",
"cm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
45 | [
"aproximadamente",
"en",
"riñón",
"derecho",
",",
"riñón",
"izquierdo",
"sin",
"hallazgos",
"patológicos",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
46 | [
"Se",
"complementa",
"con",
"tomografía",
"axial",
"computada",
"de",
"abdomen",
"y",
"pelvis",
"con",
"contraste",
"endovenoso",
"donde",
"se",
"evidencia",
"una",
"formación",
"renal",
"derecha",
"heterogénea",
"de",
"110",
"x",
"120",
"mm",
"de",
"diámetro",
",",
"no",
"se",
"observan",
"adenomegalias",
"retroperitoneales",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
47 | [
"Difícil",
"evaluación",
"del",
"pedículo",
"renal",
"derecho",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
48 | [
"Se",
"solicita",
"resonancia",
"magnética",
"que",
"confirma",
"la",
"formación",
"heterogénea",
"renal",
"derecha",
"en",
"polo",
"superior",
"de",
"12",
"cm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
49 | [
"de",
"diámetro",
"mayor",
",",
"sin",
"compromiso",
"de",
"vena",
"renal",
"ni",
"de",
"la",
"vena",
"cava",
"inferior",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
50 | [
"Se",
"realiza",
"una",
"nefrectomía",
"radical",
"derecha",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
51 | [
"Buena",
"evolución",
",",
"se",
"externa",
"al",
"quinto",
"día",
"postoperatorio",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
52 | [
"La",
"anatomía",
"patológica",
"revela",
":",
"Tumor",
"maligno",
"indiferenciado",
"de",
"estirpe",
"a",
"diferenciar",
"por",
"inmunohistoquímica",
"(",
"IHQ",
")",
".."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
53 | [
"Tamaño",
"tumoral",
"13",
"cm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0
] |
54 | [
"Invasión",
"local",
":",
"el",
"tumor",
"se",
"extiende",
"a",
"través",
"de",
"la",
"cápsula",
"renal",
",",
"provocando",
"infiltración",
"focal",
"de",
"la",
"grasa",
"perisuprarenal",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
55 | [
"Hilio",
"renal",
"libre",
"de",
"lesión",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
56 | [
"Embolias",
"vasculares",
"presentes",
",",
"márgenes",
"quirúrgicos",
"libres",
"de",
"lesión",
"tumoral",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
57 | [
"Riñón",
"no",
"neoplásico",
":",
"pielonefritis",
"crónica",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
58 | [
"Arterio",
"y",
"arteriolonefroesclerosis",
"y",
"quiste",
"de",
"retención",
"de",
"4",
"cm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
59 | [
"de",
"diámetro",
"mayor",
"."
] | [
0,
0,
0,
0
] |
60 | [
"Glándula",
"suprarrenal",
"libre",
"de",
"lesión",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
61 | [
"IHQ",
":",
"WT1",
"+",
"+",
"+",
",",
"CD",
"117",
"+",
"+",
"+",
",",
"CD56",
"+",
"+",
"+",
",",
"P53",
"-",
"."
] | [
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
3,
7,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0
] |
62 | [
"Diagnóstico",
":",
"Nefroblastoma",
"(",
"Tumor",
"de",
"Wilms",
")",
",",
"estadío",
"II",
"de",
"la",
"clasificación",
"de",
"la",
"NWTS",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
63 | [
"La",
"TC",
"al",
"mes",
"postoperatorio",
"evidencia",
"recidiva",
"tumoral",
"a",
"nivel",
"del",
"lecho",
"de",
"la",
"nefrectomía",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
64 | [
"Inicia",
"esquema",
"de",
"quimioterapia",
"con",
"vincristina",
",",
"dactinomicina",
"y",
"doxorubicina",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
2,
0,
2,
0
] |
65 | [
"Presenta",
"durante",
"el",
"curso",
"de",
"la",
"quimioterapia",
"un",
"cuadro",
"de",
"neumonía",
"con",
"deterioro",
"del",
"estado",
"general",
",",
"sepsis",
"y",
"meses",
"de",
"la",
"nefrectomía",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
66 | [
"Se",
"trata",
"de",
"paciente",
"masculino",
"de",
"38",
"años",
"de",
"edad",
",",
"que",
"refiere",
"limitación",
"de",
"la",
"abertura",
"oral",
"que",
"ha",
"notado",
"que",
"se",
"inició",
"a",
"los",
"18",
"años",
"y",
"ha",
"venido",
"progresando",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
67 | [
"Totalmente",
"asintomático",
",",
"condiciona",
"ya",
"dificultad",
"para",
"alimentarse",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
68 | [
"Además",
",",
"cursa",
"con",
"diferentes",
"focos",
"cariosos",
"intraorales",
"que",
"los",
"dentistas",
"que",
"ha",
"visitado",
"le",
"han",
"declarado",
"imposibles",
"de",
"tratar",
"por",
"la",
"reducida",
"abertura",
"oral",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
69 | [
"El",
"paciente",
"refiere",
"múltiples",
"tratamientos",
"con",
"diferentes",
"especialistas",
"intentando",
"mejorar",
"dicha",
"abertura",
"oral",
",",
"con",
"terapias",
"físicas",
"y",
"ejercicios",
"mandibulares",
",",
"los",
"cuales",
"han",
"sido",
"totalmente",
"ineficaces",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
70 | [
"Para",
"el",
"momento",
"en",
"el",
"que",
"se",
"realiza",
"la",
"primera",
"exploración",
"el",
"paciente",
"presenta",
"una",
"abertura",
"oral",
"máxima",
"de",
"16",
"mm",
",",
"la",
"cual",
"al",
"forzarla",
"no",
"se",
"modifica",
",",
"el",
"paciente",
"cuenta",
"con",
"una",
"radiografía",
"panorámica",
"y",
"tomografía",
"computarizada",
"en",
"las",
"que",
"se",
"observa",
"una",
"evidente",
"elongación",
"de",
"los",
"procesos",
"coronoideos",
"por",
"encima",
"del",
"nivel",
"del",
"arco",
"cigomático",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
71 | [
"Una",
"vez",
"diagnosticado",
"como",
"HPC",
",",
"se",
"decide",
"realizar",
"la",
"coronoidectomía",
"bilateral",
"por",
"medio",
"de",
"un",
"abordaje",
"intraoral",
",",
"cursando",
"dentro",
"del",
"transoperatorio",
"con",
"una",
"abertura",
"oral",
"máxima",
"de",
"40",
"mm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
72 | [
"Una",
"vez",
"pasado",
"los",
"3",
"días",
"postoperado",
"se",
"inician",
"las",
"terapias",
"físicas",
"con",
"ejercicios",
"de",
"abertura",
"oral",
"y",
"apoyo",
"con",
"abatelenguas",
",",
"cursando",
"con",
"buena",
"evolución",
"durante",
"la",
"primera",
"semana",
"(",
"21",
"mm",
"de",
"abertura",
"oral",
"máxima",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
73 | [
"Posteriormente",
"presenta",
"una",
"disminución",
"de",
"la",
"abertura",
"oral",
"siendo",
"crítica",
"(",
"6",
"mm",
"de",
"abertura",
"oral",
"máxima",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
74 | [
"Se",
"decide",
"el",
"uso",
"de",
"aparatología",
"ortopédica",
"funcional",
",",
"con",
"el",
"uso",
"del",
"Spring-Bite",
",",
"con",
"un",
"intervalo",
"de",
"10",
"min",
"de",
"4",
"a",
"5",
"veces",
"al",
"día",
",",
"con",
"lo",
"que",
"se",
"obtiene",
"una",
"abertura",
"oral",
"de",
"30",
"mm",
"a",
"los",
"30",
"días",
"de",
"su",
"uso",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
75 | [
"El",
"uso",
"de",
"dicha",
"aparatología",
"se",
"continuó",
"por",
"6",
"meses",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
76 | [
"Varón",
"de",
"69",
"años",
",",
"bebedor",
"y",
"fumador",
"severo",
",",
"operado",
"en",
"1985",
"de",
"un",
"carcinoma",
"epidermoide",
"de",
"suelo",
"de",
"boca",
"y",
"lengua",
"realizándose",
"una",
"hemimandibulectomía",
"con",
"disección",
"radical",
"del",
"cuello",
"izquierdo",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
77 | [
"En",
"1996",
"se",
"procedió",
"a",
"la",
"reconstrucción",
"con",
"injerto",
"libre",
"de",
"cresta",
"iliaca",
"y",
"barra",
"de",
"titanio",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0
] |
78 | [
"En",
"1999",
"fue",
"sometido",
"a",
"una",
"laringuectomía",
"total",
"suprahioidea",
"por",
"un",
"nuevo",
"carcinoma",
"epidermoide",
"de",
"laringe",
"con",
"metástasis",
"supraclavicular",
"izquierda",
"(",
"T4N1M0",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
79 | [
"El",
"cierre",
"del",
"faringostoma",
"se",
"realizó",
"usando",
"un",
"colgajo",
"dermo-platismo-fascial",
"de",
"Herrmann",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
80 | [
"Posteriormente",
"recibió",
"tratamiento",
"radioterápico",
"con",
"cobalto-60",
"sobre",
"el",
"lecho",
"quirúrgico",
"y",
"las",
"cadenas",
"cervicales",
"supraclaviculares",
"bilaterales",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
81 | [
"En",
"julio",
"de",
"2006",
"presentó",
"una",
"recidiva",
"de",
"su",
"carcinoma",
"de",
"cavidad",
"oral",
",",
"tratada",
"quirúrgicamente",
"con",
"resección",
"del",
"muñón",
"de",
"base",
"de",
"lengua",
"y",
"reconstrucción",
"con",
"colgajo",
"miocutáneo",
"pectoral",
"izquierdo",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
82 | [
"En",
"noviembre",
"de",
"2006",
"ingresó",
"por",
"la",
"aparición",
"de",
"disfagia",
",",
"que",
"le",
"condicionaba",
"una",
"incapacidad",
"total",
"para",
"la",
"alimentación",
"oral",
"y",
"provocó",
"secundariamente",
"una",
"desnutrición",
"severa",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
83 | [
"Se",
"intentó",
"reiteradamente",
"la",
"colocación",
"una",
"sonda",
"nasogástrica",
",",
"sin",
"éxito",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
84 | [
"Se",
"realizó",
"una",
"nasofibroscopia",
"en",
"la",
"que",
"se",
"objetivó",
"una",
"estenosis",
"faringoesofágica",
"infranqueable",
"de",
"aspecto",
"benigno",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
85 | [
"Se",
"solicitó",
"entonces",
"una",
"endoscopia",
"oral",
"que",
"demostró",
"una",
"zona",
"estenótica",
"de",
"aspecto",
"fibroso",
"en",
"la",
"unión",
"faringoesofágica",
",",
"asociada",
"a",
"un",
"importante",
"crecimiento",
"piloso",
"en",
"la",
"faringe",
"por",
"inversión",
"de",
"la",
"piel",
"en",
"la",
"cirugía",
"previa",
",",
"pero",
"sin",
"datos",
"de",
"recidiva",
"tumoral",
"local",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
86 | [
"La",
"estenosis",
"esofágica",
"resultó",
"infranqueable",
"al",
"endoscopio",
",",
"por",
"lo",
"que",
"se",
"procedió",
"a",
"la",
"colocación",
"de",
"una",
"gastrostomía",
"quirúrgica",
"según",
"técnica",
"de",
"Witzel",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
87 | [
"Actualmente",
"el",
"paciente",
"mantiene",
"un",
"adecuado",
"estado",
"nutricional",
"y",
"no",
"existen",
"datos",
"de",
"nueva",
"recidiva",
"tumoral",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
88 | [
"Varón",
"de",
"20",
"años",
",",
"pescador",
",",
"sin",
"antecedentes",
"médicos",
"de",
"interés",
"que",
"presenta",
"dolor",
"y",
"tumefacción",
"en",
"el",
"dedo",
"índice",
"de",
"2",
"días",
"de",
"evolución",
",",
"tras",
"punción",
"con",
"una",
"espina",
"de",
"pescado",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
89 | [
"A",
"la",
"exploración",
"se",
"objetivan",
"los",
"cuatro",
"signos",
"de",
"Kanavel",
"(",
"hinchazón",
"simétrica",
"y",
"actitud",
"en",
"semiflexión",
"del",
"dedo",
",",
"dolor",
"a",
"la",
"palpación",
"sobre",
"el",
"trayecto",
"tendinoso",
"flexor",
"del",
"segundo",
"dedo",
"y",
"dolor",
"con",
"la",
"extensión",
"pasiva",
"del",
"dedo",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
90 | [
"Ecográficamente",
"se",
"observó",
"un",
"área",
"hipoecogénica",
"alrededor",
"del",
"tendón",
"flexor",
"del",
"dedo",
"índice",
"y",
"una",
"marcada",
"hipervascularización",
"sinovial",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
91 | [
"En",
"la",
"exploración",
"quirúrgica",
"se",
"evacuó",
"una",
"pequeña",
"cantidad",
"de",
"pus",
"dentro",
"de",
"la",
"vaina",
"sinovial",
"mediante",
"un",
"drenaje",
"con",
"apertura",
"de",
"las",
"poleas",
"A1",
"y",
"A5",
"y",
"sistema",
"de",
"irrigación",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
92 | [
"Mujer",
"de",
"61",
"años",
"con",
"antecedentes",
"sistémicos",
"de",
"obesidad",
",",
"hipertensión",
"arterial",
",",
"fallo",
"renal",
"con",
"buen",
"control",
"en",
"la",
"actualidad",
"y",
"diabetes",
"mellitus",
"tipo",
"2",
"de",
"7",
"años",
"de",
"evolución",
"en",
"tratamiento",
"con",
"insulina",
"desde",
"hace",
"2",
"años",
"y",
"en",
"los",
"últimos",
"3",
"meses",
"se",
"asoció",
"rosiglitiazona",
"4",
"mg",
"día",
"(",
"Avandia",
"®",
",",
"Glaxosmithkline",
")",
"con",
"lo",
"que",
"se",
"consiguió",
"un",
"buen",
"control",
"glucémico",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
93 | [
"Como",
"antecedentes",
"oftalmológicos",
"destaca",
"un",
"edema",
"macular",
"bilateral",
"difuso",
"tratado",
"con",
"láser",
"seis",
"meses",
"antes",
"y",
"con",
"visiones",
"máximas",
"de",
"0,3",
"en",
"ojo",
"derecho",
"y",
"0,250",
"en",
"ojo",
"izquierdo",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
94 | [
"Acude",
"al",
"servicio",
"de",
"oftalmología",
"refiriendo",
"pérdida",
"de",
"visión",
"severa",
"que",
"le",
"impide",
"realizar",
"su",
"trabajo",
"diario",
"en",
"los",
"últimos",
"dos",
"meses",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
95 | [
"En",
"la",
"exploración",
"sistémica",
"destaca",
"un",
"aumento",
"de",
"peso",
"de",
"7",
"kilos",
"(",
"dato",
"informado",
"por",
"su",
"médico",
"de",
"Atención",
"Primaria",
")",
"con",
"edemas",
"periféricos",
"en",
"las",
"extremidades",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
96 | [
"La",
"agudeza",
"visual",
"es",
"de",
"0,05",
"en",
"ambos",
"ojos",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
97 | [
"En",
"el",
"fondo",
"de",
"ojo",
"se",
"observa",
"un",
"edema",
"macular",
"difuso",
"severo",
"bilateral",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
98 | [
"Debido",
"a",
"la",
"retención",
"generalizada",
"de",
"fluidos",
"se",
"realizó",
"una",
"exploración",
"sistémica",
",",
"descartando",
"patología",
"renal",
"y",
"/",
"o",
"cardíaca",
"estableciendo",
"la",
"asociación",
"con",
"la",
"rosiglitazona",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
2,
0
] |
99 | [
"Se",
"retiró",
"este",
"fármaco",
"y",
"a",
"los",
"dos",
"meses",
"la",
"paciente",
"había",
"perdido",
"5",
"kg",
"y",
"los",
"edemas",
"de",
"las",
"piernas",
"habían",
"desaparecido",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] |
PharmaCoNER
Dataset Description
Manually classified collection of Spanish clinical case studies.
- Homepage: zenodo
- Paper: PharmaCoNER: Pharmacological Substances, Compounds and proteins Named Entity Recognition track
- Point of Contact: [email protected]
Dataset Summary
Manually classified collection of clinical case studies derived from the Spanish Clinical Case Corpus (SPACCC), an open access electronic library that gathers Spanish medical publications from SciELO.
The PharmaCoNER corpus contains a total of 396,988 words and 1,000 clinical cases that have been randomly sampled into 3 subsets. The training set contains 500 clinical cases, while the development and test sets contain 250 clinical cases each. In terms of training examples, this translates to a total of 8129, 3787 and 3952 annotated sentences in each set. The original dataset is distributed in Brat format.
The annotation of the entire set of entity mentions was carried out by domain experts. It includes the following 4 entity types: NORMALIZABLES, NO_NORMALIZABLES, PROTEINAS and UNCLEAR.
This dataset was designed for the PharmaCoNER task, sponsored by Plan-TL.
For further information, please visit the official website.
Supported Tasks
Named Entity Recognition (NER)
Languages
- Spanish (es)
Directory Structure
- README.md
- pharmaconer.py
- dev-set_1.1.conll
- test-set_1.1.conll
- train-set_1.1.conll
Dataset Structure
Data Instances
Three four-column files, one for each split.
Data Fields
Every file has four columns:
- 1st column: Word form or punctuation symbol
- 2nd column: Original BRAT file name
- 3rd column: Spans
- 4th column: IOB tag
Example
La S0004-06142006000900008-1 123_125 O paciente S0004-06142006000900008-1 126_134 O tenía S0004-06142006000900008-1 135_140 O antecedentes S0004-06142006000900008-1 141_153 O de S0004-06142006000900008-1 154_156 O hipotiroidismo S0004-06142006000900008-1 157_171 O , S0004-06142006000900008-1 171_172 O hipertensión S0004-06142006000900008-1 173_185 O arterial S0004-06142006000900008-1 186_194 O en S0004-06142006000900008-1 195_197 O tratamiento S0004-06142006000900008-1 198_209 O habitual S0004-06142006000900008-1 210_218 O con S0004-06142006000900008-1 219-222 O atenolol S0004-06142006000900008-1 223_231 B-NORMALIZABLES y S0004-06142006000900008-1 232_233 O enalapril S0004-06142006000900008-1 234_243 B-NORMALIZABLES
Data Splits
Split | Size |
---|---|
train |
8,129 |
dev |
3,787 |
test |
3,952 |
Dataset Creation
Curation Rationale
For compatibility with similar datasets in other languages, we followed as close as possible existing curation guidelines.
Source Data
Initial Data Collection and Normalization
Manually classified collection of clinical case report sections. The clinical cases were not restricted to a single medical discipline, covering a variety of medical disciplines, including oncology, urology, cardiology, pneumology or infectious diseases. This is key to cover a diverse set of chemicals and drugs.
Who are the source language producers?
Humans, there is no machine generated data.
Annotations
Annotation process
The annotation process of the PharmaCoNER corpus was inspired by previous annotation schemes and corpora used for the BioCreative CHEMDNER and GPRO tracks, translating the guidelines used for these tracks into Spanish and adapting them to the characteristics and needs of clinically oriented documents by modifying the annotation criteria and rules to cover medical information needs. This adaptation was carried out in collaboration with practicing physicians and medicinal chemistry experts. The adaptation, translation and refinement of the guidelines was done on a sample set of the SPACCC corpus and linked to an iterative process of annotation consistency analysis through interannotator agreement (IAA) studies until a high annotation quality in terms of IAA was reached.
Who are the annotators?
Practicing physicians and medicinal chemistry experts.
Personal and Sensitive Information
No personal or sensitive information included.
Considerations for Using the Data
Social Impact of Dataset
This corpus contributes to the development of medical language models in Spanish.
Discussion of Biases
[N/A]
Additional Information
Dataset Curators
Text Mining Unit (TeMU) at the Barcelona Supercomputing Center ([email protected]).
For further information, send an email to ([email protected]).
This work was funded by the Spanish State Secretariat for Digitalization and Artificial Intelligence (SEDIA) within the framework of the Plan-TL.
Licensing information
This work is licensed under CC Attribution 4.0 International License.
Copyright by the Spanish State Secretariat for Digitalization and Artificial Intelligence (SEDIA) (2022)
Citation Information
@inproceedings{,
title = "PharmaCoNER: Pharmacological Substances, Compounds and proteins Named Entity Recognition track",
author = "Gonzalez-Agirre, Aitor and
Marimon, Montserrat and
Intxaurrondo, Ander and
Rabal, Obdulia and
Villegas, Marta and
Krallinger, Martin",
booktitle = "Proceedings of The 5th Workshop on BioNLP Open Shared Tasks",
month = nov,
year = "2019",
address = "Hong Kong, China",
publisher = "Association for Computational Linguistics",
url = "https://aclanthology.org/D19-5701",
doi = "10.18653/v1/D19-5701",
pages = "1--10",
}
Contributions
[N/A]
- Downloads last month
- 260