<commit_before>
.. _vegetation:

#################################
Bepaling vegetatie ``vegetation``
#################################

Output
======

NICHE Vlaanderen levert als finaal resultaat een uitspraak over het al dan niet aanwezig zijn van potenties voor elk van de vegetatietypen voor elke rastercel binnen het studiegebied. Het is een binair oordeel: wel of geen potentie. Voor elk vegetatietype bestaat het eindresultaat dus uit een raster met waarde 0 (potentie) of 1 (geen potentie).

.. _vegetation_princ:

Principe
========

De uitspraak over wel of geen potentie is het resultaat van een aftoetsing van de afzonderlijke invoerlagen, inclusief de :doc:`trofie- <trofie>` en :doc:`zuurgraad <zuur>` als intermediaire modelresultaten, aan de standplaatsvereisten (referentiewaarden) van elk van de vegetatietypen. Die standplaatsvereisten zitten gebundeld in de zgn. `referentietabel <https://github.com/inbo/niche_vlaanderen/blob/master/niche_vlaanderen/system_tables/niche_vegetation.csv>`_. Op :doc:`deze pagina <vegetatie_reftabel>` wordt de opbouw van deze tabel en het principe van aftoetsing nader uitgelegd.

De standplaatsvereisten zitten vervat in 7 variabelen:

.. csv-table:: Standplaatsvereisten uit referentietabel
    :header-rows: 1

    Variabele, full model, simple model
    :ref:`Bodemtype <soil_code>`, X, X
    :doc:`Trofiegraad <trofie>`, X, 
    :doc:`Zuurgraad <zuur>`, X, 
    :ref:`Gemiddeld laagste grondwaterstand <mlw>`, X, X
    :ref:`Gemiddeld hoogste grondwaterstand <mhw>`, X, X
    :ref:`Aftoetsing potenties aan beheer <management_vegetation>`, ( X ), 
    :ref:`Aftoetsing potenties aan overstromingsregime <inundation_vegetation>`, ( X ), 

De potenties voor vegetatie-ontwikkeling kunnen op twee manieren worden berekend: 

- Enerzijds door het *volledige NICHE Vlaanderen model* (:doc:`full model <getting_started>`) te gebruiken, waarbij de berekende zuurgraad en trofie, het bodemtype en de gemiddelde laagste en hoogste grondwaterstanden mee de potenties bepalen;
- Anderzijds door een *afgeslankte/vereenvoudigde versie* (:ref:`simple model <simple>`) van NICHE Vlaanderen te gebruiken, waarbij enkel een aftoetsing aan de referentiewaarden gebeurt voor het bodemtype en de gemiddelde laagste en hoogste grondwaterstanden ter bepaling van de potenties.

De aftoetsing aan beheer en overstromingsregime is optioneel in het volledige NICHE Vlaanderen model, en gebeurt niet in het vereenvoudigde model.

.. _vegetation_input:

Invoergegevens
==============

- :ref:`Bodemtype <soil_code>`
- :doc:`Trofiegraad <trofie>`
- :doc:`Zuurgraad <zuur>`
- :ref:`Gemiddeld laagste grondwaterstand <mlw>` (min-max)
- :ref:`Gemiddeld hoogste grondwaterstand <mhw>` (min-max)
- :ref:`Aftoetsing potenties aan beheer <management_vegetation>`
- :ref:`Aftoetsing potenties aan overstromingsregime <inundation_vegetation>`

Zie ook bovenstaande tabel.

.. _vegetation_impl:

Implementatie in ``niche_vlaanderen``
=================================================

Voorbeeld volledig model<commit_msg>Update vegetatie.rst<commit_after>
.. _vegetation:

#################################
Bepaling vegetatie ``vegetation``
#################################

Output
======

NICHE Vlaanderen levert als finaal resultaat een uitspraak over het al dan niet aanwezig zijn van potenties voor elk van de vegetatietypen voor elke rastercel binnen het studiegebied. Het is een binair oordeel: wel of geen potentie. Voor elk vegetatietype bestaat het eindresultaat dus uit een raster met waarde 0 (potentie) of 1 (geen potentie).

.. _vegetation_princ:

Principe
========

De uitspraak over wel of geen potentie is het resultaat van een aftoetsing van de afzonderlijke invoerlagen, inclusief de :doc:`trofie- <trofie>` en :doc:`zuurgraad <zuur>` als intermediaire modelresultaten, aan de standplaatsvereisten (referentiewaarden) van elk van de vegetatietypen. Die standplaatsvereisten zitten gebundeld in de zgn. `referentietabel <https://github.com/inbo/niche_vlaanderen/blob/master/niche_vlaanderen/system_tables/niche_vegetation.csv>`_. Op :doc:`deze pagina <vegetatie_reftabel>` wordt de opbouw van deze tabel en het principe van aftoetsing nader uitgelegd.

De standplaatsvereisten zitten vervat in 7 variabelen:

.. csv-table:: Standplaatsvereisten uit referentietabel
    :header-rows: 1

    Variabele, full model, simple model
    :ref:`Bodemtype <soil_code>`, X, X
    :doc:`Trofiegraad <trofie>`, X, 
    :doc:`Zuurgraad <zuur>`, X, 
    :ref:`Gemiddeld laagste grondwaterstand <mlw>`, X, X
    :ref:`Gemiddeld hoogste grondwaterstand <mhw>`, X, X
    :ref:`Aftoetsing potenties aan beheer <management_vegetation>`, ( X ), 
    :ref:`Aftoetsing potenties aan overstromingsregime <inundation_vegetation>`, ( X ), 

De potenties voor vegetatie-ontwikkeling kunnen op twee manieren worden berekend: 

- Enerzijds door het *volledige NICHE Vlaanderen model* (`full model <https://inbo.github.io/niche_vlaanderen/getting_started.html#Running-a-full-Niche-model>`_) te gebruiken, waarbij de berekende zuurgraad en trofie, het bodemtype en de gemiddelde laagste en hoogste grondwaterstanden mee de potenties bepalen;
- Anderzijds door een *afgeslankte/vereenvoudigde versie* (:ref:`simple model <simple>`) van NICHE Vlaanderen te gebruiken, waarbij enkel een aftoetsing aan de referentiewaarden gebeurt voor het bodemtype en de gemiddelde laagste en hoogste grondwaterstanden ter bepaling van de potenties.

De aftoetsing aan beheer en overstromingsregime is optioneel in het volledige NICHE Vlaanderen model, en gebeurt niet in het vereenvoudigde model.

.. _vegetation_input:

Invoergegevens
==============

- :ref:`Bodemtype <soil_code>`
- :doc:`Trofiegraad <trofie>`
- :doc:`Zuurgraad <zuur>`
- :ref:`Gemiddeld laagste grondwaterstand <mlw>` (min-max)
- :ref:`Gemiddeld hoogste grondwaterstand <mhw>` (min-max)
- :ref:`Aftoetsing potenties aan beheer <management_vegetation>`
- :ref:`Aftoetsing potenties aan overstromingsregime <inundation_vegetation>`

Zie ook bovenstaande tabel.

.. _vegetation_impl:

Implementatie in ``niche_vlaanderen``
=================================================

Voorbeeld volledig model
{'fraction_non_alphanumeric': 0.12416707297253372, 'fraction_numerical': 0.001300178774581505, 'mean_word_length': 5.822616407982261, 'pattern_counts': {'":': 0, '<': 43, '<?xml version=': 0, '>': 43, 'https://': 3, 'lorem ipsum': 0, 'www.': 0, 'xml': 0}, 'pii_count': 0, 'substrings_counts': 0, 'word_list_counts': {'cursed_substrings.json': 0, 'profanity_word_list.json': 0, 'sexual_word_list.json': 0, 'zh_pornsignals.json': 0}}
{'dir': 'git-commits-cleaned', 'id': '2439478', 'n_tokens_mistral': 2225, 'n_tokens_neox': 2158, 'n_words': 628}